1F68A

Nmr solution structure of the bromodomain from human gcn5
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
GDQLYTTLKNLLAQIKSHPSAWPFMEPVKKSEAPDYYEVIRFPIDLKTMTERLRSRYYVTRKLFVADLQRVIANCREYNPPDSEYCRCASALEKFFYFKLKEG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Solution structure and acetyl-lysine binding activity of the GCN5 bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HISTONE ACETYLTRANSFERASE
total genus 45
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2000-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1f68A00
4YYKA 5DFCA 3U5LA 5FE6A 4BW3A 3QZTA 5CQ3A 5CQ4A 2KTBB 4MR3A 4YYMA 5EWCA 5FB0A 4A9EA 5ETDA 5FG5A 2RFJA 3QZSA 5IGMA 4YH4A 5CUCA 1WUGA 4UYFA 5HELA 3MB3A 4WHWA 3SVFA 4CUSA 4IOQA 4IR6A 5DLXA 5IGLA 5I89A 5LUUA 4QYLA 5I1QA 5D3PA 5C7NA 5DYAA 5CQAA 4YH3A 5KTXA 5CPEA 4TS8A 4QYDA 4QSRA 5FG4A 3LQIA 5AMEA 3UV2A 3IU5A 4A9LA 3UVYA 4LR6A 5F61A 4C66A 4CUQA 5F36A 4A9NA 2E3KA 2RO1A 3IU6A 4KCXA 3HMFA 2DATA 2F6JA 4TZ2A 5A85A 4TT2A 5LJ2A 2R0SA 5HEMA 5HFQA 1ZS5A 3K2JA 5E0RA 4QR4A 2FSAA 4ZW1A 5C4QA 1F68A 4QC3A 4NQNA 2YQDA 4CUTA 2N9GA 3O33A 5FFVA 3HMEA 4UIUA 5DKHA 4BW4A 3UVXA 5EPSA 4NRAA 5EA1A 4Z1SA 5I80A 4TT4A 4NR7A 4HXLA 3O35A 3I3JA 5FFYA 4QB3A 4N4FA 5L8TA 4NUDA 3QZVA 4CUPA 3DWYA 3SVHA 5ENBA 5A5NA 4Z6HA 5CP5A 5FB1A 2R0VA 4RVRA 3SVGA 4A9IA 4ALGA 3ZYUA 2OSSA 3MXFA 5E9MA 5EICA 5F63A 3P1FA 4IOOA 4O75A 5A82A 4NR9A 5H1UA 4QY4A 4UIZA 4XUAA 5FFWA 2WP2A 5KHMA 5D25A 5J0DA 5EI4A 4J1PA 4IORA 3S92A 4PY6A 4YYDA 3HMHA 5CQ5A 4DONA 4MR6A 4QSSA 2RS9B 4XUBA 4QEVA 5EPBA 5F60A 5EM3A 5A7CA 4HXNA 2L84A 4BW2A 5CQ6A 4O78A 4N4HA 4QSWA 4QSUA 3O37A 5FE7A 3P1EA 5ENIA 4YBTA 5CUBA 4NR6A 2RNXA 1E6IA 2WP1A 4IR4A 4OGIA 5D0CA 4O7FA 4UIYA 4IR3A 3ONIA 5EWHA 5IGNA 5CGPA 5EWDA 4N4GA 5LKTA 4UYGA 3RCWA 5HCLA 3UV4A 2E7NA 5A5SA 4TTEA 4PCIA 5ETBA 5F62A 4OUFA 5DBMA 4O74A 5EV9A 3GG3A 4HXPA 4ZQLA 5LJ1A 4UIXA 5D3RA 4QNSA 4J0RA 4O7EA 1JSPB 5FE5A 5ENGA 4QR3A 5CUAA 4KV1A 2DVSA 5FE2A 2R10A 4CUUA 4MENA 3U5PA 5LKZA 4HXMA 5H1TA 4HXOA 4O7BA 5E9VA 4YYNA 2GRCA 4QC1A 5EP7A 4YBSA 4YYHA 5BT4A 5DFDA 5IG6A 2L85A 4O7CA 3MULA 3LJWA 5EWWA 5L97A 5C8GA 5ACYA 4UYFB 4CURA 1N72A 4UYHA 5CQ7A 5DY7A 4Z1QA 4HBXA 3P1CA 3U5KA 4TYLA 1X0JA 5EPRA 3TLPA 4QSXA 4IR5A 5D3NA 4NS5A 4O72A 5TCMA 5I7YA 5EISA 4HXRA 5AD3A 4MEOA 3JVJA 4ZC9A 5ENJA 3UVDA 5DFBA 3LQJA 5E3DA 3UW9A 1JM4B 4QUUA 5A81A 2D82A 5HRVA 5D3TA 4NYWA 5FBXA 4PTBA 4CFLA 3MB4A 4NYXA 5HJCA 5CUDA 5FH6A 4UIWA 4O71A 4A9OA 4BHWA 4HBYA 4NRCA 4WIVA 5ENFA 2E7OA 4MR4A 2D9EA 4YC9A 4Z93A 5I88A 2F6NA 5ENCA 4C67A 5KU3A 2G4AA 4A9KA 4F3IA 4MEPA 5CQTA 4KV4A 4CL9A 5L8UA 5FE3A 5L96A 4QSVA 5DYCA 5JI8A 4YYJA 4OGJA 4NQMA 4HXSA 3NXBA 5F2PA 3UVWA 3LXJA 5CFWA 5F25A 5TB6A 5I40A 5F1HA 5E7DA 5BT3A 5CTLA 4PKLA 2R0YA 5D24A 4HBVA 3S91A 4LYIA 4QSQA 5H85A 3MQMA 4BW1A 5CQ8A 2DWWA 4LRGA 4YBMA 5F3AA 4E96A 5LVRA 2DVQA 4Q0NA 4TT6A 2RNYA 4HXKA 5CUGA 5D3SA 4X2IA 5C89A 5II1A 4LZ2A 3D7CA 2H60A 2YW5A 3Q2EA 4N3WA 5COIA 4TZ8A 5FE4A 5EQ1A 5F5ZA 5CU8A 4NYVA 5K29A 2YDWA 3O36A 4QEWA 4YAXA 1WUMA 5CUEA 4BJXA 5DLZA 1EQFA 5FDZA 3FKMX 5DW1A 4HBWA 2DVRA 5CRZA 3G0JA 4YYGA 3DAIA 3LQHA 4TU4A 5F1LA 3JVKA 5LVQA 5C85A 2YYNA 4CLBA 5HRWA 5FH7A 5HLSA 4LZSA 4MEQA 5LKXA 4Q0OA 5EVAA 2MJVB 4YABA 2YEMA 5G4RA 3JVLA 2RI7A 4YY4A 5BT5A 5D7XA 5HQ5A 5A5RA 5KTWA 3P5OA 4O7AA 3JVMA 5EWVA 4YY6A 5HENA 2LSPB 5DKDA 5DX4A 4QEUA 4Y03A 4O70A 3U5MA 5E3GA 5IBNA 4PCEA 2I7KA 4A9FA 4XY9A 4LDFA 5E9KA 4TQNA 4NR8A 3P1DA 5AMFA 4NUEA 4TU6A 2OO1A 4LZRA 4QR5A 4UYEA 5KTUA 4ALHA 5HFRA 5CRMA 5HQ6A 5E73A 3U5JA 4LYWA 4O77A 4QBMA 3Q2FA 5I7XA 5II2A 5D3JA 5H1VA 5KO4A 4J0SA 5CY9A 5ENEA 4YATA 4XY8A 3MUKA 2I8NA 5CS8A 4NR5A 4A9JA 5C87A 4GPJA 5FH8A 4YK0A 4N4IA 5E74A 4NXJA 4J3IA 2NXBA 5L99A 5DYUA 5FG6A 4WHUA 4NRBA 4NUCA 5G4SA 5I29A 5DYXA 5E9LA 5EU1A 4MR5A 5I86A 5FE9A 4A9MA 5FE0A 4O76A 5HRXA 4QSTA 4CFKA 5HM0A 3UV5A 4LYSA 4QUTA 2DVVA 4Z6IA 5D3LA 4UITA 5A5OA 5I83A 5L98A 5AD2A 5FE8A 4YYIA 5LKUA 2YEKA 5E9YA 4UIVA 4UYDA 5D3HA 4AKNA 5A83A 5JWMA 5DW2A 3O34A 4QSPA 4XYAA 4PS5A 5A5PA 5IGKA 2RNWA 5E9IA 3G0LA 5DKCA 5ENHA 5HQ7A 3AQAA 3U5NA 5EGUA 2OUOA 2L5EA 4FLPA 3U5OA 4NR4A 5CZGA 4A9HA 5D26A 2DKWA 4LC2A 5A5QA 5IIDA 4QZSA 4YADA 3AADA 5EK9A 5LJ0A 2YELA 5FE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YYKA 5DFCA 3U5LA 5FE6A 4BW3A 3QZTA 5CQ3A 5CQ4A 2KTBB 4MR3A 4YYMA 5EWCA 5FB0A 4A9EA 5ETDA 5FG5A 2RFJA 3QZSA 5IGMA 4YH4A 5CUCA 1WUGA 4UYFA 5HELA 3MB3A 4WHWA 3SVFA 4CUSA 4IOQA 4IR6A 5DLXA 5IGLA 5I89A 5LUUA 4QYLA 5I1QA 5D3PA 5C7NA 5DYAA 5CQAA 4YH3A 5KTXA 5CPEA 4TS8A 4QYDA 4QSRA 5FG4A 3LQIA 5AMEA 3UV2A 3IU5A 4A9LA 3UVYA 4LR6A 4AKGA 5F61A 4C66A 4CUQA 5F36A 4A9NA 2E3KA 2RO1A 3IU6A 4KCXA 3HMFA 2DATA 2F6JA 4TZ2A 5A85A 4TT2A 5LJ2A 2R0SA 5HEMA 5HFQA 1ZS5A 3K2JA 5E0RA 4QR4A 2FSAA 4ZW1A 5C4QA 1F68A 4QC3A 4NQNA 2YQDA 4CUTA 2N9GA 3O33A 5FFVA 3HMEA 4UIUA 5DKHA 4BW4A 3UVXA 5EPSA 4NRAA 4AI6A 5EA1A 4Z1SA 5I80A 4TT4A 4NR7A 4HXLA 3O35A 3I3JA 5FFYA 4QB3A 4N4FA 5L8TA 4NUDA 3QZVA 4CUPA 3DWYA 3SVHA 5ENBA 5A5NA 4Z6HA 5CP5A 5FB1A 2R0VA 4RVRA 3SVGA 4A9IA 4ALGA 3ZYUA 2OSSA 3MXFA 5E9MA 5EICA 5F63A 3P1FA 4IOOA 4O75A 5A82A 4NR9A 5H1UA 4QY4A 4UIZA 4XUAA 5FFWA 2WP2A 5KHMA 5D25A 5J0DA 5EI4A 4J1PA 4IORA 3S92A 4PY6A 4YYDA 3HMHA 5CQ5A 4DONA 4MR6A 4QSSA 2RS9B 4XUBA 4QEVA 5EPBA 5F60A 5EM3A 5A7CA 4HXNA 2L84A 4BW2A 5CQ6A 4O78A 3D1BA 4N4HA 4QSWA 4QSUA 3O37A 5FE7A 3P1EA 5ENIA 4YBTA 5CUBA 2EJNA 4NR6A 2RNXA 1E6IA 2WP1A 4IR4A 4OGIA 5D0CA 4O7FA 4UIYA 4IR3A 3ONIA 5EWHA 5IGNA 5CGPA 5EWDA 4N4GA 5LKTA 4UYGA 3RCWA 5HCLA 3UV4A 2E7NA 5A5SA 4TTEA 4PCIA 5ETBA 5F62A 4OUFA 5DBMA 4O74A 5EV9A 3GG3A 4HXPA 4ZQLA 5LJ1A 4UIXA 5D3RA 4QNSA 4J0RA 4O7EA 4AKIA 1JSPB 5FE5A 5ENGA 4QR3A 5CUAA 4KV1A 2DVSA 5FE2A 2R10A 4CUUA 4MENA 3U5PA 5LKZA 4HXMA 5H1TA 4HXOA 4O7BA 5E9VA 4YYNA 2GRCA 4QC1A 5EP7A 4YBSA 4YYHA 5BT4A 5DFDA 5IG6A 2L85A 4O7CA 3MULA 3LJWA 5EWWA 5L97A 5C8GA 5ACYA 4UYFB 4CURA 1N72A 4UYHA 5CQ7A 5DY7A 4Z1QA 4HBXA 3P1CA 3U5KA 4TYLA 1X0JA 5EPRA 3D1DA 4QSXA 3TLPA 4IR5A 5D3NA 4NS5A 4O72A 5TCMA 5I7YA 5EISA 4HXRA 3ERRA 5AD3A 4MEOA 3JVJA 4ZC9A 5ENJA 3UVDA 5DFBA 3LQJA 5E3DA 3UW9A 1JM4B 4QUUA 5A81A 2D82A 5HRVA 5D3TA 4NYWA 5FBXA 4PTBA 4CFLA 3MB4A 4NYXA 5HJCA 5CUDA 5FH6A 4UIWA 4O71A 4A9OA 4BHWA 4HBYA 4NRCA 4WIVA 5ENFA 2E7OA 4MR4A 2D9EA 1ZKRA 4YC9A 4Z93A 5I88A 2F6NA 5ENCA 4C67A 5KU3A 2G4AA 4A9KA 4F3IA 4MEPA 5CQTA 4KV4A 4CL9A 5L8UA 5FE3A 5L96A 4QSVA 5DYCA 5JI8A 4YYJA 4OGJA 4NQMA 4HXSA 3NXBA 5F2PA 3UVWA 3LXJA 5CFWA 5F25A 5TB6A 5I40A 1PUOA 5F1HA 5E7DA 5BT3A 5CTLA 4PKLA 2R0YA 5D24A 4HBVA 3S91A 4LYIA 4QSQA 5H85A 3MQMA 4BW1A 5CQ8A 2DWWA 4LRGA 4YBMA 5F3AA 4E96A 5LVRA 2DVQA 4Q0NA 4TT6A 2RNYA 4HXKA 5CUGA 5D3SA 4X2IA 5C89A 5II1A 4LZ2A 3D7CA 2H60A 2YW5A 3Q2EA 4N3WA 5COIA 4TZ8A 5FE4A 5EQ1A 5F5ZA 5CU8A 4NYVA 5K29A 2YDWA 3O36A 4QEWA 4YAXA 1WUMA 5CUEA 4BJXA 5DLZA 1EQFA 5FDZA 3FKMX 5DW1A 4HBWA 2DVRA 5CRZA 3G0JA 4YYGA 3DAIA 3LQHA 4TU4A 5F1LA 3JVKA 5LVQA 5C85A 2YYNA 4CLBA 5HRWA 5FH7A 5HLSA 4LZSA 4MEQA 5LKXA 4Q0OA 5EVAA 2MJVB 4YABA 2YEMA 5G4RA 3JVLA 2RI7A 4YY4A 5BT5A 5D7XA 5HQ5A 5A5RA 3VKGA 5KTWA 3P5OA 4O7AA 3JVMA 5EWVA 4YY6A 5HENA 2LSPB 5DKDA 5DX4A 4QEUA 4Y03A 4O70A 3U5MA 4AKHA 5E3GA 5IBNA 4PCEA 2I7KA 4A9FA 4XY9A 4LDFA 5E9KA 4TQNA 4NR8A 3P1DA 5AMFA 4NUEA 4TU6A 2OO1A 4LZRA 4QR5A 4UYEA 5KTUA 4ALHA 5HFRA 5CRMA 5HQ6A 5E73A 3U5JA 4LYWA 4O77A 4QBMA 3Q2FA 5I7XA 5II2A 5D3JA 5H1VA 5KO4A 4J0SA 5CY9A 5ENEA 4YATA 4XY8A 3MUKA 2I8NA 5CS8A 4NR5A 4A9JA 5C87A 4GPJA 3VKHA 5FH8A 4YK0A 4N4IA 5E74A 4NXJA 4J3IA 2NXBA 5L99A 5DYUA 5FG6A 4WHUA 4NRBA 4NUCA 5G4SA 5I29A 5DYXA 5E9LA 5EU1A 4MR5A 5I86A 5FE9A 4A9MA 5FE0A 4O76A 5HRXA 4QSTA 4CFKA 5HM0A 3UV5A 4LYSA 4QUTA 2DVVA 4Z6IA 5D3LA 4UITA 5A5OA 5I83A 5L98A 5AD2A 5FE8A 4YYIA 5LKUA 2YEKA 5E9YA 4UIVA 4UYDA 5D3HA 4AKNA 5A83A 5JWMA 5DW2A 3O34A 4QSPA 4XYAA 4PS5A 5A5PA 5IGKA 2RNWA 5E9IA 3G0LA 5DKCA 5ENHA 5HQ7A 3AQAA 3U5NA 5EGUA 2OUOA 2L5EA 4FLPA 3U5OA 4NR4A 5CZGA 4A9HA 5D26A 2DKWA 4LC2A 5A5QA 5IIDA 4QZSA 4YADA 3AADA 5EK9A 5LJ0A 2YELA 5FE1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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