3P1DA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with n-methyl-2-pyrrolidone (nmp)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2010-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3p1dA00
4O7CA 4IR3A 5CUAA 5HQ5A 5EPBA 5D24A 5AD2A 4BW4A 4TYLA 4QEUA 4A9FA 2YW5A 2NXBA 4ALGA 4TT2A 1F68A 5A85A 2DATA 3D7CA 5FH7A 3P5OA 5AD3A 4NS5A 4FLPA 5CP5A 2YELA 4NUEA 4LYSA 4OGJA 4IR6A 2YDWA 5ENEA 5ENIA 4YC9A 5F3AA 4QNSA 3IU5A 4QEWA 4XUAA 5DLXA 5EWDA 4NYVA 4UYDA 4YYMA 4O78A 4IOOA 4KCXA 5LJ1A 5E9IA 4UIYA 2I8NA 3S91A 5D3TA 4F3IA 5E74A 5HFRA 4O77A 2YEKA 5HENA 4NYWA 3U5LA 5FH6A 5I7XA 4QC1A 5FE1A 2RNWA 3AQAA 5I40A 4WHUA 4HXSA 5F1HA 5ACYA 3LJWA 4LC2A 1WUMA 4QBMA 5IGLA 4TZ8A 1N72A 3Q2EA 4LR6A 5HEMA 4HXNA 5FE2A 3UVDA 2R0VA 4O7BA 4O72A 5I1QA 5ENFA 5H1UA 4UIWA 3HMHA 3UV4A 5CRZA 5IGNA 5D7XA 2KTBB 5FFWA 5HQ7A 3Q2FA 4QYLA 2I7KA 5ETBA 4QR3A 4YATA 5CQ8A 2E3KA 4UYEA 5CQ6A 5FE3A 5I86A 5CTLA 5D3PA 5CQTA 3U5MA 4XUBA 5I29A 3G0LA 4YBTA 4IR5A 4AKNA 2DVRA 4KV1A 5FDZA 5DKCA 4QSWA 2R0SA 3JVLA 4YY6A 2R10A 4LZRA 3FKMX 4YH3A 4A9MA 4YYJA 3IU6A 4LYIA 5CQ7A 5G4RA 2G4AA 5EV9A 3QZVA 5DFBA 2GRCA 3HMEA 3U5KA 3UW9A 5HFQA 4O74A 5ENBA 5H1TA 4N4FA 5CFWA 4X2IA 3UVWA 4MENA 4QB3A 5A5QA 5A5OA 4YYGA 5FBXA 5HLSA 4CUUA 4QSXA 4QSVA 4XY8A 3U5OA 4MEQA 3AADA 3ZYUA 5K29A 5LUUA 4QYDA 4WHWA 5CQ4A 5E9YA 5HRWA 4HXOA 3MQMA 2L85A 4PCEA 5IIDA 5IG6A 4YYDA 5LJ2A 4LRGA 4QEVA 2D9EA 3DAIA 3QZSA 5I89A 5ENGA 2F6NA 2FSAA 5DLZA 4NRCA 5F2PA 2DVSA 5DFCA 4IORA 4NXJA 4C67A 5F62A 3P1EA 4NQNA 2RS9B 5EPSA 5A81A 4J3IA 5G4SA 4BJXA 4NRBA 4NR6A 4TZ2A 3G0JA 3LXJA 4TS8A 4Z93A 5FG5A 5L97A 5CGPA 4Z1SA 4OUFA 4QSPA 2RO1A 5IGKA 5E73A 5EA1A 5EICA 4CFKA 5LVQA 4CLBA 3O34A 4YADA 5IGMA 4Q0OA 2DKWA 3JVMA 4TT4A 5DKHA 5A5SA 5C87A 5DFDA 4NYXA 4UITA 4IR4A 5A5NA 4ZW1A 5D3HA 3O35A 4UYFA 1X0JA 2WP1A 5E9MA 5A7CA 4J1PA 2OUOA 4TT6A 2E7NA 5CUGA 4N4IA 3TLPA 4HXMA 5FFVA 4A9LA 5FE7A 3U5NA 4HXPA 5II2A 5CZGA 4QSSA 3JVJA 5EU1A 4O71A 4ZC9A 5FH8A 4UIVA 5ENCA 5DKDA 5KO4A 4LDFA 4A9IA 4N4HA 5E0RA 5D3NA 4TU4A 5FE8A 4HXKA 5F60A 5TB6A 5CQAA 5BT5A 5I80A 3U5PA 3MUKA 5ENJA 4TTEA 5CPEA 5E9LA 5A82A 4HBYA 3NXBA 5E3GA 4N4GA 5D26A 5HCLA 2RNXA 4O7EA 2YYNA 4UYGA 4YYKA 5IBNA 2L5EA 5A5PA 4NR8A 4YAXA 4Q0NA 3LQJA 3S92A 5DYUA 1WUGA 4A9OA 4YY4A 4WIVA 5LKZA 4CUPA 5EGUA 5FE9A 4QY4A 5EPRA 4NR5A 4PTBA 4CFLA 4CL9A 4E96A 4QSRA 5DW2A 5EM3A 4N3WA 4HBVA 4Z1QA 5H85A 5HRVA 2RFJA 3MB3A 4OGIA 4BW3A 3MULA 4Z6HA 4PKLA 5C8GA 4PCIA 3UV2A 4NR4A 5L99A 1JM4B 5DYCA 3UVYA 5L8UA 3ONIA 5ETDA 5LJ0A 4QSUA 4YBMA 5L96A 5AMFA 4YBSA 4C66A 4NRAA 5F63A 5CUEA 5FG6A 2R0YA 5COIA 5KU3A 5DYXA 5I88A 5CUBA 4TQNA 3UVXA 3QZTA 5HM0A 4A9JA 5F36A 4UIXA 4CURA 5FE5A 3K2JA 4IOQA 3HMFA 4NUDA 4ALHA 3P1FA 4DONA 5EWHA 3MB4A 3GG3A 5CUDA 5EVAA 4BW2A 5DYAA 4PY6A 5CS8A 5F1LA 4A9NA 2F6JA 5FE6A 4QUTA 5CRMA 5EWWA 2MJVB 4Z6IA 4MEPA 4YYHA 1E6IA 5H1VA 5CU8A 2OO1A 5EI4A 4MEOA 5FB1A 4Y03A 5E9KA 5KTUA 5L8TA 4UYFB 4NQMA 4XY9A 4O7FA 5DW1A 4HBXA 5JWMA 5HQ6A 5ENHA 4RVRA 2RNYA 3LQHA 3I3JA 4A9EA 2OSSA 4O76A 5EWVA 3LQIA 2D82A 3P1DA 4YK0A 5EISA 4HBWA 5DY7A 3MXFA 5CY9A 4XYAA 4QSTA 4PS5A 2WP2A 5F5ZA 4NR7A 5F61A 3UV5A 5BT4A 5LVRA 4HXRA 4NR9A 5E9VA 4A9HA 3SVGA 4YYIA 4O7AA 4QR5A 5D0CA 5CUCA 5D3SA 4QR4A 4KV4A 2LSPB 4LYWA 4J0RA 4UIZA 4MR3A 4BHWA 5EWCA 5E3DA 5II1A 5D3JA 5FB0A 5LKXA 5EQ1A 3O37A 4QUUA 5C85A 4YABA 5BT3A 5EK9A 4YYNA 4QC3A 4ZQLA 5CQ5A 3JVKA 3O33A 5D3RA 5KTXA 5J0DA 4MR4A 5FE0A 4YH4A 3U5JA 5D25A 5C4QA 3DWYA 3SVFA 4QSQA 5I83A 4CUTA 5FE4A 3P1CA 4QZSA 5CQ3A 5L98A 1ZS5A 2H60A 5HELA 2DWWA 5DX4A 2L84A 4UYHA 4LZ2A 4MR6A 5FFYA 5F25A 5D3LA 4MR5A 4CUSA 5C89A 5HJCA 5TCMA 4BW1A 4NUCA 5HRXA 4HXLA 3RCWA 2RI7A 5LKUA 1JSPB 4O70A 5JI8A 2YQDA 5KTWA 2E7OA 1EQFA 4J0SA 5I7YA 5A5RA 4A9KA 3SVHA 2YEMA 5C7NA 4O75A 5A83A 2DVVA 5DBMA 5LKTA 5FG4A 4LZSA 4CUQA 2DVQA 5AMEA 5EP7A 5KHMA 3O36A 4GPJA 2N9GA 4TU6A 4UIUA 5E7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7CA 4IR3A 5CUAA 5HQ5A 5EPBA 5D24A 5AD2A 4BW4A 4TYLA 4QEUA 4A9FA 2YW5A 2NXBA 4ALGA 4TT2A 1F68A 5A85A 2DATA 3D7CA 5FH7A 3P5OA 5AD3A 4NS5A 4FLPA 5CP5A 2YELA 4NUEA 4LYSA 4OGJA 4IR6A 2YDWA 5ENEA 5ENIA 4YC9A 5F3AA 4QNSA 3IU5A 4QEWA 4XUAA 5DLXA 5EWDA 4NYVA 4UYDA 4YYMA 4O78A 4IOOA 4KCXA 5LJ1A 5E9IA 4UIYA 4AKHA 2I8NA 3S91A 5D3TA 4F3IA 5E74A 5HFRA 4O77A 2YEKA 5HENA 4NYWA 3U5LA 5FH6A 5I7XA 4QC1A 5FE1A 2RNWA 3AQAA 5I40A 4WHUA 4HXSA 5F1HA 5ACYA 3LJWA 4LC2A 3ERRA 1WUMA 4QBMA 5IGLA 4TZ8A 1N72A 3Q2EA 4LR6A 5HEMA 4HXNA 5FE2A 3UVDA 2R0VA 4O7BA 4O72A 5I1QA 5ENFA 5H1UA 4UIWA 3HMHA 3UV4A 5CRZA 5IGNA 5D7XA 2KTBB 5FFWA 5HQ7A 3Q2FA 4QYLA 2I7KA 5ETBA 4QR3A 4YATA 5CQ8A 2E3KA 4UYEA 5CQ6A 5FE3A 5I86A 5CTLA 5D3PA 5CQTA 3U5MA 4XUBA 5I29A 3G0LA 4YBTA 4IR5A 4AKNA 2DVRA 4KV1A 5FDZA 5DKCA 4QSWA 2R0SA 3JVLA 4YY6A 2R10A 4LZRA 3FKMX 4YH3A 4A9MA 4YYJA 3IU6A 4LYIA 5CQ7A 5G4RA 2G4AA 5EV9A 3QZVA 5DFBA 2GRCA 3HMEA 3U5KA 3UW9A 5HFQA 4O74A 5ENBA 5H1TA 4N4FA 5CFWA 4X2IA 3UVWA 4MENA 4QB3A 5A5QA 5A5OA 4YYGA 5FBXA 5HLSA 4CUUA 4QSXA 4QSVA 4XY8A 3U5OA 4MEQA 3AADA 3ZYUA 5K29A 5LUUA 4QYDA 4WHWA 5CQ4A 5E9YA 5HRWA 4HXOA 3MQMA 2L85A 4PCEA 5IIDA 5IG6A 4YYDA 5LJ2A 4LRGA 4QEVA 2D9EA 3DAIA 3QZSA 5I89A 5ENGA 2F6NA 2FSAA 5DLZA 4NRCA 5F2PA 2DVSA 5DFCA 4IORA 4NXJA 4C67A 5F62A 3P1EA 4NQNA 2RS9B 5EPSA 5A81A 4J3IA 5G4SA 4BJXA 4NRBA 3VKHA 4NR6A 4TZ2A 3G0JA 3LXJA 4TS8A 4Z93A 5FG5A 5L97A 5CGPA 4Z1SA 4OUFA 4QSPA 2RO1A 5IGKA 5E73A 5EA1A 5EICA 4CFKA 5LVQA 4CLBA 3O34A 4YADA 5IGMA 4Q0OA 2DKWA 3JVMA 4TT4A 5DKHA 5A5SA 5C87A 5DFDA 4NYXA 4UITA 2EJNA 4IR4A 5A5NA 4ZW1A 5D3HA 3O35A 4UYFA 1X0JA 2WP1A 5E9MA 5A7CA 4J1PA 2OUOA 4TT6A 2E7NA 5CUGA 4N4IA 3TLPA 4HXMA 5FFVA 4A9LA 5FE7A 4AKIA 3U5NA 4HXPA 5II2A 5CZGA 4QSSA 3JVJA 5EU1A 4O71A 4ZC9A 5FH8A 4UIVA 5ENCA 5DKDA 5KO4A 4LDFA 4A9IA 4N4HA 5E0RA 5D3NA 4TU4A 5FE8A 4HXKA 5F60A 4AI6A 5TB6A 5CQAA 5BT5A 5I80A 3VKGA 3U5PA 3MUKA 5ENJA 4TTEA 5CPEA 5E9LA 5A82A 4HBYA 3NXBA 5E3GA 4N4GA 5D26A 5HCLA 2RNXA 4O7EA 2YYNA 4UYGA 4YYKA 5IBNA 2L5EA 5A5PA 4NR8A 4YAXA 4Q0NA 3LQJA 3S92A 5DYUA 1WUGA 4A9OA 4YY4A 4WIVA 5LKZA 4CUPA 5EGUA 5FE9A 4QY4A 5EPRA 4NR5A 4PTBA 4CFLA 4CL9A 4E96A 4QSRA 5DW2A 5EM3A 4N3WA 4HBVA 3D1BA 4Z1QA 5H85A 5HRVA 2RFJA 3MB3A 4OGIA 4BW3A 3MULA 4Z6HA 4PKLA 5C8GA 4PCIA 3UV2A 4NR4A 5L99A 1JM4B 5DYCA 3UVYA 5L8UA 3ONIA 5ETDA 5LJ0A 4QSUA 4YBMA 5L96A 5AMFA 4YBSA 4C66A 4NRAA 5F63A 5CUEA 5FG6A 2R0YA 5COIA 5KU3A 5DYXA 5I88A 5CUBA 4TQNA 3D1DA 3UVXA 3QZTA 5HM0A 4A9JA 5F36A 4UIXA 4CURA 5FE5A 3K2JA 4IOQA 3HMFA 4NUDA 4ALHA 3P1FA 4DONA 5EWHA 3MB4A 3GG3A 5CUDA 5EVAA 4BW2A 5DYAA 4PY6A 5CS8A 5F1LA 4A9NA 2F6JA 5FE6A 4QUTA 5CRMA 5EWWA 2MJVB 4Z6IA 4MEPA 4YYHA 1PUOA 1E6IA 5H1VA 5CU8A 2OO1A 5EI4A 4MEOA 5FB1A 4Y03A 5E9KA 5KTUA 5L8TA 4UYFB 4NQMA 1ZKRA 4XY9A 4O7FA 5DW1A 4HBXA 5JWMA 5HQ6A 5ENHA 4RVRA 2RNYA 3LQHA 3I3JA 4A9EA 2OSSA 4O76A 5EWVA 3LQIA 2D82A 3P1DA 4YK0A 5EISA 4HBWA 5DY7A 3MXFA 5CY9A 4XYAA 4QSTA 4PS5A 2WP2A 5F5ZA 4NR7A 5F61A 3UV5A 5BT4A 5LVRA 4HXRA 4NR9A 5E9VA 4A9HA 3SVGA 4YYIA 4O7AA 4QR5A 5D0CA 5CUCA 5D3SA 4QR4A 4KV4A 2LSPB 4LYWA 4J0RA 4UIZA 4MR3A 4BHWA 5EWCA 5E3DA 5II1A 5D3JA 5FB0A 5LKXA 5EQ1A 3O37A 4QUUA 5C85A 4YABA 5BT3A 5EK9A 4YYNA 4QC3A 4ZQLA 5CQ5A 3JVKA 3O33A 5D3RA 5KTXA 5J0DA 4MR4A 5FE0A 4YH4A 3U5JA 5D25A 5C4QA 3DWYA 3SVFA 4QSQA 5I83A 4CUTA 5FE4A 3P1CA 4QZSA 5CQ3A 5L98A 1ZS5A 2H60A 5HELA 2DWWA 5DX4A 2L84A 4UYHA 4LZ2A 4MR6A 5FFYA 5F25A 5D3LA 4MR5A 4CUSA 5C89A 5HJCA 5TCMA 4BW1A 4NUCA 5HRXA 4HXLA 3RCWA 2RI7A 5LKUA 1JSPB 4O70A 5JI8A 2YQDA 5KTWA 2E7OA 1EQFA 4J0SA 5I7YA 5A5RA 4A9KA 3SVHA 2YEMA 5C7NA 4O75A 4AKGA 5A83A 2DVVA 5DBMA 5LKTA 5FG4A 4LZSA 4CUQA 2DVQA 5AMEA 5EP7A 5KHMA 3O36A 4GPJA 2N9GA 4TU6A 4UIUA 5E7DA
chains in the Genus database with same CATH topology
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