1N72A

Structure and ligand of a histone acetyltransferase bromodomain
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
MSKEPRDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLIDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords HISTONE ACETYLTRANSFERASE
publication title Structure and Ligand of a Histone Acetyltransferase Bromodomain
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 27
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2002-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1n72A00
5HRWA 3MULA 4CLBA 5K29A 2DKWA 4IOQA 5COIA 3D7CA 4QEVA 2R0SA 5EPRA 5E74A 3MB3A 3JVJA 5TCMA 4QSRA 4HXKA 4CUQA 4A9HA 4ZC9A 5CY9A 1WUGA 5DX4A 3O35A 2L84A 5D7XA 4QSWA 4YYMA 4HXPA 4YYKA 2DATA 5E9LA 5LVRA 3P1FA 4CFKA 5A83A 4NRBA 5FE9A 3G0JA 5CUGA 5CFWA 5EM3A 3IU5A 4IORA 5EA1A 4ALGA 4UITA 5EK9A 5FE8A 1EQFA 4QSUA 5E3GA 5DFCA 5A5SA 5DLZA 2DVSA 4A9OA 4F3IA 4NR5A 4N4FA 3NXBA 5EU1A 4UYFB 4BW2A 1JSPB 4J1PA 4NXJA 4BW1A 3P1CA 2E7NA 4NR4A 3U5LA 5F25A 4IOOA 4OUFA 3U5PA 3LJWA 5CGPA 5DW2A 4YC9A 5CUCA 2R0YA 5FB0A 5L99A 5F1HA 3U5KA 5F5ZA 3UVWA 4QSSA 4YBTA 5CUAA 4ZW1A 4YYJA 5IBNA 2I7KA 5ENBA 3I3JA 4QSXA 4YYDA 4Q0NA 3Q2FA 3P1EA 5D26A 4MR5A 2D9EA 5ETDA 4XY9A 4O70A 5AD3A 3QZVA 5HENA 2D82A 3JVMA 5CQAA 5II1A 5DLXA 2RO1A 5F62A 4MEQA 5FB1A 4ZQLA 2E7OA 5DFBA 5ACYA 3O33A 5D3TA 5HRVA 5L98A 4UIWA 3S92A 3U5JA 5FDZA 1N72A 4TS8A 2OUOA 5LKTA 5L8TA 5DYAA 4QUUA 3QZSA 5A5NA 3SVFA 4IR5A 4J0SA 4YBMA 4TU6A 5A5PA 4UYEA 4O75A 3Q2EA 4YATA 4HXOA 5CQ8A 5CZGA 5HQ5A 5IGLA 5EWVA 5HFRA 5ENHA 5EWDA 4UYHA 4J0RA 4NRAA 4UIUA 4BW3A 5E9VA 5F3AA 5FE6A 5FH7A 4PKLA 4Z93A 4NR6A 2R0VA 4J3IA 4BJXA 4QNSA 5H85A 4O7CA 1JM4B 5ETBA 4CUUA 2GRCA 5I29A 4XYAA 4QEUA 4Z6HA 4KCXA 5LKXA 3MQMA 4FLPA 4LZRA 4O71A 5D25A 5EWHA 5D3RA 4QY4A 5DY7A 5EQ1A 2MJVB 3TLPA 5CU8A 4YAXA 4IR6A 5HM0A 5KU3A 4LZSA 5CPEA 4QR3A 5EP7A 2YDWA 5ENCA 4WHWA 4HXMA 5DYCA 5I86A 4O76A 3U5NA 4QSVA 3JVKA 5C85A 4QC1A 5CUEA 5I83A 2RS9B 3DWYA 5AD2A 5CQ7A 3AQAA 4HXNA 4N4IA 4UIVA 5FE2A 3UVXA 1ZS5A 4ALHA 5FE0A 2YYNA 5G4SA 3UW9A 4QUTA 4UYFA 3SVHA 4HBVA 4O7EA 2DWWA 5D3LA 5CUBA 5LJ1A 4TU4A 3UV2A 4UIZA 5A81A 4A9EA 4TZ2A 4NQNA 3AADA 5H1UA 5CQTA 4NR9A 3ZYUA 2F6JA 4MR4A 4CFLA 2N9GA 4YY4A 4NR8A 4N4GA 4E96A 4MR6A 5KTWA 5ENIA 4Z6IA 4NS5A 5D3JA 5E3DA 5LJ0A 2RNWA 5G4RA 4QBMA 4TTEA 5D3PA 5ENFA 2KTBB 4Y03A 4A9FA 4YADA 5D24A 4IR3A 5D3HA 5DW1A 2I8NA 4BHWA 4OGJA 5KTXA 3MUKA 5A7CA 3HMHA 4KV4A 2WP2A 3P5OA 5E9YA 5I80A 4HBYA 3UVDA 4CUSA 4LYIA 5EWWA 5A85A 4C67A 5C8GA 5DKHA 5HELA 3P1DA 3RCWA 5I7YA 3LQJA 2DVRA 2OSSA 4YABA 5JWMA 5FE5A 4TT6A 5L8UA 4TZ8A 3HMEA 5FFYA 3UV5A 2RNYA 4UYDA 2WP1A 4MEOA 5DFDA 4YYNA 5CQ4A 4TT4A 5H1TA 3U5MA 4YYIA 4LYWA 4LDFA 5HLSA 5EI4A 2R10A 5JI8A 3G0LA 4A9IA 4RVRA 4PCEA 5E9MA 4A9KA 3GG3A 4NUEA 5A5RA 5I40A 4O74A 5H1VA 5FFWA 5C87A 5F1LA 4YY6A 4YH4A 3HMFA 4LRGA 3JVLA 1WUMA 5EPBA 4YBSA 5CQ5A 4O7AA 4C66A 4CUTA 5CP5A 5FE4A 5IIDA 5II2A 5LUUA 5IGNA 5EPSA 4PY6A 5LKUA 5FH8A 5CRMA 5KHMA 4NR7A 4YYHA 3U5OA 4XUBA 1E6IA 2L5EA 5E9KA 3FKMX 4O77A 4QSTA 4CURA 2F6NA 4UYGA 2E3KA 2YEMA 4QSQA 5EVAA 3LQHA 4Q0OA 5HCLA 5E9IA 4QR4A 4NUCA 5BT5A 3UVYA 4NYXA 5F36A 4HBWA 3O37A 5CTLA 4HXSA 5CRZA 5F63A 5I89A 4KV1A 4Z1QA 4OGIA 4NRCA 4O72A 5FH6A 5D3SA 5FE7A 5HQ7A 4O7BA 4LC2A 5BT4A 4QYDA 4A9NA 5EWCA 2NXBA 4X2IA 2YEKA 3S91A 2YQDA 5D0CA 2LSPB 4PTBA 4QR5A 5J0DA 4NYVA 5IGKA 5FE1A 5HJCA 5CS8A 3MXFA 5FFVA 4YH3A 4XY8A 4TYLA 5LVQA 2L85A 4TQNA 4IR4A 4QC3A 3IU6A 5IG6A 5CQ6A 5I1QA 4PCIA 5I7XA 2H60A 4MENA 5F60A 5A5QA 4QSPA 5DYXA 5A5OA 2OO1A 4CUPA 5E0RA 2RNXA 3MB4A 4PS5A 5DBMA 2YW5A 3ONIA 4N3WA 5A82A 5BT3A 4GPJA 5DKDA 4QEWA 5AMEA 4A9JA 5I88A 4LR6A 5HEMA 4HXRA 5HQ6A 5FG4A 4NYWA 5L96A 5E7DA 5CUDA 5FG6A 3LQIA 4UIXA 3O36A 5TB6A 4MR3A 5C89A 4QYLA 5D3NA 5FE3A 5C4QA 4QB3A 5DYUA 5F61A 4WHUA 2DVVA 5FG5A 4LYSA 4Z1SA 5DKCA 4YK0A 5ENEA 4NUDA 5KO4A 4NQMA 4DONA 3QZTA 5LKZA 5EV9A 3UV4A 4AKNA 5AMFA 2FSAA 3O34A 4UIYA 2RFJA 2G4AA 4WIVA 4BW4A 4A9MA 2DVQA 3K2JA 5C7NA 5IGMA 5EGUA 4LZ2A 5EISA 5EICA 4A9LA 4TT2A 4QZSA 5ENJA 5ENGA 5L97A 4O78A 5HRXA 5LJ2A 2YELA 3DAIA 4CL9A 1F68A 2RI7A 5HFQA 4HXLA 5FBXA 5E73A 3SVGA 5CQ3A 4O7FA 4N4HA 4YYGA 3LXJA 4HBXA 5KTUA 5F2PA 1X0JA 4MEPA 4XUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRWA 3MULA 4CLBA 5K29A 2DKWA 4IOQA 5COIA 3D7CA 4QEVA 2R0SA 5EPRA 5E74A 3MB3A 3JVJA 5TCMA 4QSRA 4HXKA 4CUQA 4A9HA 4ZC9A 5CY9A 1WUGA 5DX4A 3O35A 2L84A 5D7XA 4QSWA 4YYMA 4HXPA 4YYKA 2DATA 5E9LA 5LVRA 3P1FA 4CFKA 5A83A 4NRBA 5FE9A 3G0JA 5CUGA 5CFWA 5EM3A 3IU5A 4IORA 5EA1A 4ALGA 4UITA 5EK9A 5FE8A 1EQFA 4QSUA 5E3GA 5DFCA 5A5SA 5DLZA 2DVSA 4A9OA 4F3IA 4NR5A 4N4FA 3NXBA 5EU1A 4UYFB 4BW2A 1JSPB 4J1PA 4NXJA 4BW1A 3P1CA 2E7NA 4NR4A 3U5LA 5F25A 4IOOA 4OUFA 3U5PA 3LJWA 5CGPA 5DW2A 4YC9A 5CUCA 2R0YA 5FB0A 5L99A 5F1HA 3U5KA 5F5ZA 3UVWA 4QSSA 4YBTA 5CUAA 4ZW1A 4YYJA 5IBNA 2I7KA 5ENBA 3I3JA 4QSXA 4YYDA 4Q0NA 3Q2FA 3P1EA 5D26A 4MR5A 2D9EA 5ETDA 4XY9A 4O70A 5AD3A 3QZVA 5HENA 2D82A 3JVMA 5CQAA 5II1A 5DLXA 2RO1A 5F62A 4MEQA 5FB1A 4ZQLA 4AKGA 2E7OA 5DFBA 5ACYA 3O33A 5D3TA 5HRVA 5L98A 4UIWA 3S92A 3U5JA 5FDZA 1N72A 4TS8A 2OUOA 5LKTA 5L8TA 5DYAA 4QUUA 3QZSA 5A5NA 3SVFA 4IR5A 4J0SA 4YBMA 4TU6A 5A5PA 4UYEA 4O75A 3Q2EA 4YATA 4HXOA 5CQ8A 5CZGA 5HQ5A 5IGLA 5EWVA 5HFRA 5ENHA 5EWDA 4UYHA 4J0RA 4NRAA 4UIUA 4BW3A 5E9VA 5F3AA 5FE6A 5FH7A 4PKLA 4Z93A 4NR6A 2R0VA 4J3IA 4BJXA 4QNSA 5H85A 4O7CA 1JM4B 5ETBA 4CUUA 2GRCA 5I29A 4XYAA 4QEUA 4Z6HA 4KCXA 5LKXA 3MQMA 4FLPA 4LZRA 4O71A 5D25A 5EWHA 5D3RA 4QY4A 5DY7A 5EQ1A 2MJVB 3TLPA 5CU8A 4YAXA 4IR6A 5HM0A 5KU3A 4LZSA 5CPEA 4QR3A 5EP7A 2YDWA 5ENCA 4WHWA 4HXMA 5DYCA 5I86A 4O76A 3U5NA 4QSVA 3JVKA 5C85A 4QC1A 5CUEA 5I83A 2RS9B 3DWYA 5AD2A 5CQ7A 3AQAA 4HXNA 4N4IA 4UIVA 5FE2A 3UVXA 1ZS5A 4ALHA 5FE0A 2YYNA 5G4SA 3UW9A 4QUTA 4UYFA 3SVHA 4HBVA 4O7EA 2DWWA 5D3LA 5CUBA 5LJ1A 4TU4A 3UV2A 4UIZA 5A81A 4A9EA 1PUOA 4TZ2A 4NQNA 3AADA 5H1UA 5CQTA 4NR9A 3ZYUA 2F6JA 4MR4A 4CFLA 2N9GA 4YY4A 4NR8A 4N4GA 4E96A 4MR6A 5KTWA 5ENIA 4Z6IA 4NS5A 5D3JA 5E3DA 5LJ0A 2RNWA 5G4RA 4QBMA 4TTEA 5D3PA 5ENFA 2KTBB 4Y03A 4A9FA 4YADA 5D24A 4IR3A 5D3HA 5DW1A 2I8NA 4BHWA 4OGJA 5KTXA 3MUKA 5A7CA 3HMHA 4KV4A 2WP2A 3P5OA 5E9YA 5I80A 4HBYA 3UVDA 4CUSA 4LYIA 5EWWA 5A85A 4C67A 5C8GA 5DKHA 5HELA 3P1DA 3RCWA 5I7YA 3LQJA 2DVRA 2OSSA 4YABA 5JWMA 5FE5A 4TT6A 5L8UA 4TZ8A 3HMEA 5FFYA 3UV5A 2RNYA 4UYDA 2WP1A 4MEOA 5DFDA 4YYNA 5CQ4A 4TT4A 5H1TA 3U5MA 4YYIA 4LYWA 4LDFA 5HLSA 5EI4A 2R10A 5JI8A 3G0LA 4A9IA 4RVRA 4PCEA 5E9MA 4A9KA 3GG3A 4NUEA 5A5RA 5I40A 4O74A 4AI6A 5H1VA 5FFWA 5C87A 1ZKRA 5F1LA 4YY6A 4YH4A 3HMFA 4LRGA 3JVLA 1WUMA 5EPBA 4YBSA 5CQ5A 4O7AA 4C66A 4CUTA 5CP5A 5FE4A 5IIDA 5II2A 5LUUA 5IGNA 5EPSA 4PY6A 5LKUA 5FH8A 5CRMA 5KHMA 4NR7A 4YYHA 3U5OA 4XUBA 1E6IA 2L5EA 5E9KA 3FKMX 4O77A 4QSTA 4CURA 2F6NA 3D1BA 4UYGA 2E3KA 2YEMA 4QSQA 5EVAA 3LQHA 4Q0OA 5HCLA 5E9IA 4QR4A 4NUCA 5BT5A 3UVYA 4NYXA 5F36A 4HBWA 3O37A 5CTLA 4HXSA 5CRZA 5F63A 3VKHA 5I89A 3VKGA 4KV1A 4Z1QA 4OGIA 4NRCA 4O72A 5FH6A 5D3SA 5FE7A 5HQ7A 4O7BA 4LC2A 5BT4A 4QYDA 4A9NA 5EWCA 2NXBA 4X2IA 2YEKA 3S91A 2YQDA 5D0CA 2LSPB 4PTBA 4QR5A 5J0DA 4NYVA 5IGKA 5FE1A 5HJCA 5CS8A 3MXFA 5FFVA 4YH3A 4XY8A 4TYLA 5LVQA 2L85A 4TQNA 4IR4A 4QC3A 3IU6A 5IG6A 5CQ6A 5I1QA 4PCIA 5I7XA 2H60A 4MENA 5F60A 5A5QA 4QSPA 5DYXA 5A5OA 3ERRA 2OO1A 4CUPA 5E0RA 2RNXA 3MB4A 4PS5A 5DBMA 2YW5A 3ONIA 4N3WA 5A82A 5BT3A 4GPJA 5DKDA 4QEWA 5AMEA 4A9JA 5I88A 4AKIA 4LR6A 5HEMA 4HXRA 3D1DA 5HQ6A 5FG4A 4NYWA 5L96A 2EJNA 5E7DA 5CUDA 5FG6A 3LQIA 4UIXA 3O36A 5TB6A 4MR3A 5C89A 4QYLA 5D3NA 5FE3A 5C4QA 4QB3A 5DYUA 5F61A 4WHUA 2DVVA 5FG5A 4LYSA 4Z1SA 5DKCA 4YK0A 5ENEA 4NUDA 5KO4A 4NQMA 4DONA 3QZTA 5LKZA 5EV9A 3UV4A 4AKNA 5AMFA 2FSAA 3O34A 4UIYA 2RFJA 2G4AA 4WIVA 4BW4A 4A9MA 2DVQA 3K2JA 5C7NA 5IGMA 5EGUA 4LZ2A 5EISA 5EICA 4A9LA 4TT2A 4QZSA 5ENJA 5ENGA 5L97A 4O78A 5HRXA 5LJ2A 2YELA 3DAIA 4CL9A 1F68A 4AKHA 2RI7A 5HFQA 4HXLA 5FBXA 5E73A 3SVGA 5CQ3A 4O7FA 4N4HA 4YYGA 3LXJA 4HBXA 5KTUA 5F2PA 1X0JA 4MEPA 4XUAA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5HRW A;  3MUL A;  4CLB A;  5K29 A;  2DKW A;  4IOQ A;  5COI A;  3D7C A;  4QEV A;  2R0S A;  5EPR A;  5E74 A;  3MB3 A;  3JVJ A;  5TCM A;  4QSR A;  4HXK A;  4CUQ A;  4A9H A;  4ZC9 A;  5CY9 A;  1WUG A;  5DX4 A;  3O35 A;  2L84 A;  5D7X A;  4QSW A;  4YYM A;  4HXP A;  4YYK A;  2DAT A;  5E9L A;  5LVR A;  3P1F A;  4CFK A;  5A83 A;  4NRB A;  5FE9 A;  3G0J A;  5CUG A;  5CFW A;  5EM3 A;  3IU5 A;  4IOR A;  5EA1 A;  4ALG A;  4UIT A;  5EK9 A;  5FE8 A;  1EQF A;  4QSU A;  5E3G A;  5DFC A;  5A5S A;  5DLZ A;  2DVS A;  4A9O A;  4F3I A;  4NR5 A;  4N4F A;  3NXB A;  5EU1 A;  4UYF B;  4BW2 A;  1JSP B;  4J1P A;  4NXJ A;  4BW1 A;  3P1C A;  2E7N A;  4NR4 A;  3U5L A;  5F25 A;  4IOO A;  4OUF A;  3U5P A;  3LJW A;  5CGP A;  5DW2 A;  4YC9 A;  5CUC A;  2R0Y A;  5FB0 A;  5L99 A;  5F1H A;  3U5K A;  5F5Z A;  3UVW A;  4QSS A;  4YBT A;  5CUA A;  4ZW1 A;  4YYJ A;  5IBN A;  2I7K A;  5ENB A;  3I3J A;  4QSX A;  4YYD A;  4Q0N A;  3Q2F A;  3P1E A;  5D26 A;  4MR5 A;  2D9E A;  5ETD A;  4XY9 A;  4O70 A;  5AD3 A;  3QZV A;  5HEN A;  2D82 A; 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