5CZGA

Crystal structure analysis of hypothetical bromodomain tb427.10.7420 from trypanosoma brucei in complex with bromosporine
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
GMSKNERDTSFNKNGCLVFVSRLWDLDKLGMFHHPVSAEELPDYHTVIKRPVDLSSIRDGIEKGTYATDVDVQNDVARMITNALEYNAKGSTWYQEAMSFRKTYLDLARQSGLVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Gene regulation
molecule keywords Hypothetical Bromodomain
publication title Crystal Structure Analysis of hypothetical bromodomain from Trypanosoma brucei
rcsb
source organism Trypanosoma brucei gambiense (strain mhom/ci/86/dal972)
total genus 38
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5czgA00
3HMEA 4C67A 4YYIA 4HXNA 3DWYA 3S91A 2R0SA 4CURA 4O72A 3U5JA 4YYGA 4ALHA 4LZRA 5F3AA 4UYGA 4MEOA 4A9HA 4YY4A 5EQ1A 5FB0A 4NYXA 5DYUA 2I7KA 2I8NA 5DYCA 5E74A 4UITA 4E96A 3O37A 3LQIA 3HMFA 4Z1QA 3SVGA 5FG6A 5A5QA 5DYXA 5FFVA 4QSXA 5LVQA 2R0VA 5HCLA 5A82A 4QSRA 4MR4A 5I7YA 4YABA 5I89A 4LC2A 4QSTA 4YC9A 4AKNA 3IU5A 4QC3A 5ACYA 5E3DA 4TT6A 4RVRA 4QZSA 4UYFA 3JVMA 4YH4A 5F2PA 5HRWA 4HBWA 5HEMA 5HLSA 4J0SA 4BW4A 4QY4A 5CGPA 5D0CA 3DAIA 5LKUA 5A83A 5CQ7A 4NUEA 4NR4A 4LRGA 5A7CA 2YEMA 1WUGA 4HXKA 5II1A 3FKMX 3P1CA 2LSPB 2OUOA 4YYMA 4PTBA 4IOOA 5E73A 4UIUA 2WP2A 4XY9A 4LZSA 4HBYA 4MR3A 5KHMA 4O71A 5EWVA 2L85A 5F36A 5H85A 4QEUA 4YK0A 4MENA 4QC1A 5COIA 3MUKA 4QUTA 5LKTA 5L99A 4C66A 2KTBB 4F3IA 4HXPA 4N4HA 3O34A 4UIXA 5E0RA 4IORA 5LJ0A 3O33A 5D3SA 4MR6A 2E7OA 2RI7A 4CUTA 4QYDA 1F68A 4OGJA 4UIZA 3MQMA 1X0JA 3IU6A 2YELA 5CUEA 5E9IA 5EPBA 5H1VA 3RCWA 3ONIA 3G0JA 5CUGA 5D26A 4QB3A 4BHWA 5I88A 4UIWA 4KV4A 3UVYA 5DBMA 4GPJA 4TYLA 5BT3A 5D3NA 4PCEA 3NXBA 5IGMA 4PCIA 5KTUA 4A9LA 5A5OA 2NXBA 5CTLA 3LXJA 5DX4A 5EWHA 5HJCA 5L8TA 5F61A 3Q2FA 3U5MA 3MULA 5BT5A 2G4AA 4PS5A 4Z6HA 5K29A 4O7FA 5CRMA 2H60A 5IGLA 3HMHA 4NS5A 5EWCA 4XYAA 3UW9A 5I7XA 4CFKA 3QZVA 4QSPA 4CUQA 3MB3A 4NR8A 5CZGA 2RNXA 4LDFA 5ENGA 4YBSA 5DYAA 3G0LA 4O76A 4HBVA 5HELA 4CUPA 5DLXA 3UVXA 4NQMA 5DKCA 4WHWA 5ENEA 4O75A 4FLPA 4Q0OA 5FE8A 1WUMA 3O35A 2DKWA 4A9MA 5CQ6A 4ZC9A 3TLPA 5II2A 4A9IA 1ZS5A 3ZYUA 5ETDA 4YYNA 4TT4A 4QSUA 2DVVA 5CUBA 4ALGA 3UV2A 3K2JA 4NRCA 5I83A 4KV1A 4XUBA 5EP7A 1JM4B 4J0RA 4BW2A 5D25A 5I40A 5CQ8A 4QR4A 2RFJA 5C87A 4A9FA 3P1FA 4NRBA 5CY9A 5J0DA 4QSVA 2R10A 4NQNA 5BT4A 3QZTA 3SVFA 4NXJA 5DKHA 4BJXA 5A81A 3UVWA 5D3LA 5C4QA 5FE7A 4BW3A 5CRZA 5FG5A 2E7NA 3LJWA 3QZSA 5CQ3A 4LYWA 4CLBA 5LUUA 4LR6A 4YH3A 4NR7A 5FH8A 5L8UA 4CL9A 3UVDA 2RNYA 4NR5A 4IR3A 5L97A 5F1LA 1E6IA 2D82A 5KTWA 5HQ6A 3Q2EA 3JVJA 5HENA 3S92A 4XY8A 5F25A 5I80A 4Z1SA 5LJ1A 2YEKA 4LYSA 5EV9A 5CQ4A 4WHUA 5H1TA 5AMEA 1EQFA 5CFWA 5FB1A 4TS8A 5ENJA 4UYHA 5DFBA 5E9LA 4NRAA 5DY7A 4O77A 5DLZA 5LVRA 5E9VA 5FG4A 5HFQA 2YYNA 3D7CA 4PY6A 4Q0NA 5G4RA 4LYIA 4O7CA 5C8GA 5FE3A 5CU8A 5EI4A 4BW1A 4UYFB 5H1UA 2F6JA 3MXFA 5ENIA 5FDZA 5DW2A 5HRXA 5CUAA 4YY6A 3I3JA 4YAXA 4N4GA 2GRCA 4QYLA 5E9KA 5IIDA 2RS9B 4XUAA 5DFCA 3JVKA 4O70A 4N3WA 4YBTA 4UIYA 4QSQA 5L98A 4QEWA 5C7NA 5D3RA 3UV5A 4A9KA 5IGKA 5D3PA 5FE9A 5D7XA 5EGUA 5IBNA 5LKXA 5EPRA 2R0YA 5FFYA 4TZ2A 5EA1A 5CPEA 5EU1A 5TB6A 5CUCA 5AMFA 5I1QA 4YBMA 5ETBA 4CUUA 5D3HA 5LJ2A 5FFWA 2YQDA 4QR5A 5CS8A 3AADA 2DVQA 5A5NA 5CQTA 4O74A 4YYDA 5FE0A 5E9MA 5EVAA 5I29A 5ENHA 5ENFA 5CQ5A 4UYEA 3MB4A 5ENBA 5E9YA 5EM3A 5F5ZA 5DFDA 5EWDA 4X2IA 5FE4A 3AQAA 5HRVA 4NUCA 5F60A 5HM0A 2YW5A 4A9OA 4HXOA 5D3TA 5JI8A 4IOQA 4MEQA 4OUFA 4QSWA 4TT2A 2F6NA 3U5PA 5ENCA 4O78A 4MEPA 2D9EA 4YYHA 5IGNA 2E3KA 4YYKA 4A9EA 4Y03A 5C85A 4IR4A 4QSSA 2DWWA 4LZ2A 5FE1A 3U5LA 5C89A 5KU3A 4O7AA 2DATA 2N9GA 4TU4A 5FE5A 4PKLA 4CUSA 4ZQLA 3LQJA 5AD3A 4TQNA 4UYDA 2DVRA 5F1HA 4QBMA 4TU6A 5FE2A 5TCMA 3GG3A 4A9NA 4HXRA 4NYWA 5A5SA 3O36A 5FH7A 4NR9A 5LKZA 5KTXA 4WIVA 4UIVA 5E3GA 3JVLA 5F62A 4YATA 4YADA 5E7DA 5AD2A 4ZW1A 5FH6A 4J3IA 4CFLA 2OSSA 2WP1A 4YYJA 4KCXA 2OO1A 4HXSA 4Z93A 4OGIA 5D3JA 5DKDA 5FBXA 4N4IA 2RNWA 5EK9A 5EWWA 4QR3A 4HXLA 5JWMA 2FSAA 5EPSA 3P1EA 5EICA 5KO4A 4NR6A 5I86A 5D24A 3P1DA 5A5RA 3U5OA 5A85A 4IR6A 5CQAA 5IG6A 2YDWA 4NYVA 5G4SA 5HQ7A 5A5PA 4O7EA 4J1PA 4QNSA 3U5NA 4TTEA 5CP5A 3U5KA 4HBXA 4O7BA 5HFRA 5L96A 1JSPB 3SVHA 4HXMA 2DVSA 4IR5A 5CUDA 2L84A 2MJVB 4NUDA 5DW1A 4QUUA 2L5EA 5FE6A 4MR5A 5EISA 4A9JA 2RO1A 3UV4A 5HQ5A 1N72A 3P5OA 4QEVA 3LQHA 5F63A 4DONA 4TZ8A 4N4FA 4Z6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HMEA 4C67A 4YYIA 4HXNA 3DWYA 3S91A 2R0SA 4CURA 4O72A 3U5JA 4YYGA 4ALHA 4LZRA 1PUOA 5F3AA 4UYGA 4MEOA 4A9HA 4YY4A 5EQ1A 5FB0A 4NYXA 5DYUA 2I7KA 2I8NA 5DYCA 5E74A 4UITA 4E96A 3O37A 3LQIA 3HMFA 4Z1QA 3SVGA 5FG6A 5A5QA 5DYXA 5FFVA 4QSXA 5LVQA 2R0VA 5HCLA 5A82A 4QSRA 4MR4A 5I7YA 4YABA 5I89A 4LC2A 4QSTA 4YC9A 4AKGA 4AKNA 3IU5A 4QC3A 5ACYA 5E3DA 4TT6A 4RVRA 4QZSA 4UYFA 3JVMA 4YH4A 5F2PA 5HRWA 4HBWA 5HEMA 5HLSA 4J0SA 4BW4A 4QY4A 5CGPA 5D0CA 3DAIA 5LKUA 5A83A 5CQ7A 4NUEA 4NR4A 4LRGA 5A7CA 3ERRA 2YEMA 1WUGA 4HXKA 5II1A 3FKMX 3P1CA 2LSPB 2OUOA 4YYMA 4PTBA 4IOOA 5E73A 4UIUA 2WP2A 4XY9A 4LZSA 4HBYA 4MR3A 5KHMA 4O71A 4AKIA 5EWVA 4AKHA 2L85A 5F36A 5H85A 4QEUA 4YK0A 4MENA 4QC1A 5COIA 3MUKA 4QUTA 5LKTA 5L99A 4C66A 2KTBB 4F3IA 4HXPA 4N4HA 3O34A 4UIXA 5E0RA 4IORA 5LJ0A 3O33A 5D3SA 4MR6A 2E7OA 2RI7A 4CUTA 4QYDA 1F68A 4OGJA 4UIZA 3MQMA 1X0JA 3IU6A 2YELA 5CUEA 5E9IA 5EPBA 5H1VA 3RCWA 3ONIA 3G0JA 5CUGA 5D26A 4QB3A 4BHWA 2EJNA 5I88A 4UIWA 4KV4A 3UVYA 5DBMA 4GPJA 4TYLA 5BT3A 5D3NA 4PCEA 3NXBA 5IGMA 4PCIA 5KTUA 4A9LA 5A5OA 2NXBA 5CTLA 3LXJA 5DX4A 5EWHA 5HJCA 5L8TA 5F61A 3Q2FA 3U5MA 3MULA 5BT5A 2G4AA 4PS5A 4Z6HA 5K29A 4O7FA 5CRMA 2H60A 5IGLA 3HMHA 4NS5A 5EWCA 4XYAA 3UW9A 5I7XA 4CFKA 3QZVA 4QSPA 4CUQA 3MB3A 4NR8A 5CZGA 2RNXA 4AI6A 4LDFA 5ENGA 4YBSA 5DYAA 3G0LA 4O76A 4HBVA 5HELA 4CUPA 5DLXA 3UVXA 4NQMA 5DKCA 4WHWA 5ENEA 4O75A 4FLPA 4Q0OA 5FE8A 1WUMA 3O35A 2DKWA 4A9MA 5CQ6A 4ZC9A 3TLPA 5II2A 4A9IA 1ZS5A 3ZYUA 5ETDA 4YYNA 4TT4A 4QSUA 3VKGA 2DVVA 5CUBA 4ALGA 3UV2A 3K2JA 4NRCA 5I83A 4KV1A 4XUBA 5EP7A 1JM4B 4J0RA 4BW2A 5D25A 5I40A 5CQ8A 4QR4A 2RFJA 5C87A 4A9FA 3P1FA 4NRBA 5CY9A 5J0DA 4QSVA 2R10A 4NQNA 5BT4A 3QZTA 3SVFA 4NXJA 5DKHA 4BJXA 5A81A 3UVWA 5D3LA 5C4QA 5FE7A 4BW3A 5CRZA 5FG5A 2E7NA 3LJWA 3QZSA 5CQ3A 4LYWA 4CLBA 5LUUA 4LR6A 4YH3A 4NR7A 5FH8A 5L8UA 4CL9A 3UVDA 2RNYA 4NR5A 4IR3A 5L97A 5F1LA 1E6IA 2D82A 5KTWA 5HQ6A 3Q2EA 3JVJA 5HENA 3S92A 4XY8A 5F25A 5I80A 4Z1SA 5LJ1A 2YEKA 4LYSA 5EV9A 5CQ4A 4WHUA 5H1TA 5AMEA 1EQFA 5CFWA 5FB1A 4TS8A 5ENJA 4UYHA 5DFBA 5E9LA 4NRAA 5DY7A 4O77A 5DLZA 5LVRA 5E9VA 5FG4A 5HFQA 2YYNA 3D7CA 4PY6A 4Q0NA 5G4RA 4LYIA 4O7CA 5C8GA 5FE3A 5CU8A 5EI4A 4BW1A 4UYFB 5H1UA 2F6JA 3MXFA 5ENIA 5FDZA 5DW2A 5HRXA 5CUAA 4YY6A 3I3JA 4YAXA 4N4GA 2GRCA 4QYLA 5E9KA 5IIDA 2RS9B 4XUAA 5DFCA 3JVKA 4O70A 4N3WA 4YBTA 4UIYA 4QSQA 5L98A 4QEWA 5C7NA 5D3RA 3UV5A 4A9KA 5IGKA 5D3PA 5FE9A 5D7XA 5EGUA 5IBNA 5LKXA 5EPRA 2R0YA 5FFYA 4TZ2A 5EA1A 5CPEA 5EU1A 5TB6A 5CUCA 5AMFA 5I1QA 4YBMA 5ETBA 4CUUA 5D3HA 5LJ2A 1ZKRA 5FFWA 2YQDA 4QR5A 5CS8A 3AADA 2DVQA 5A5NA 5CQTA 4O74A 4YYDA 5FE0A 5E9MA 5EVAA 5I29A 5ENHA 5ENFA 5CQ5A 4UYEA 3MB4A 5ENBA 5E9YA 5EM3A 5F5ZA 5DFDA 5EWDA 4X2IA 5FE4A 3AQAA 5HRVA 4NUCA 5F60A 5HM0A 2YW5A 4A9OA 4HXOA 5D3TA 5JI8A 4IOQA 4MEQA 4OUFA 4QSWA 4TT2A 2F6NA 3U5PA 5ENCA 4O78A 4MEPA 2D9EA 4YYHA 5IGNA 2E3KA 4YYKA 4A9EA 4Y03A 5C85A 4IR4A 4QSSA 2DWWA 4LZ2A 5FE1A 3U5LA 5C89A 5KU3A 4O7AA 2DATA 2N9GA 4TU4A 5FE5A 4PKLA 4CUSA 4ZQLA 3LQJA 5AD3A 4TQNA 4UYDA 2DVRA 5F1HA 4QBMA 4TU6A 5FE2A 5TCMA 3GG3A 3D1DA 4A9NA 4HXRA 4NYWA 5A5SA 3O36A 5FH7A 4NR9A 5LKZA 5KTXA 4WIVA 4UIVA 5E3GA 3JVLA 5F62A 4YATA 4YADA 5E7DA 5AD2A 4ZW1A 5FH6A 4J3IA 4CFLA 2OSSA 2WP1A 4YYJA 4KCXA 2OO1A 4HXSA 4Z93A 4OGIA 5D3JA 5DKDA 5FBXA 4N4IA 2RNWA 5EK9A 5EWWA 4QR3A 4HXLA 5JWMA 2FSAA 5EPSA 3P1EA 5EICA 5KO4A 4NR6A 5I86A 3D1BA 5D24A 3P1DA 5A5RA 3U5OA 5A85A 4IR6A 5CQAA 5IG6A 2YDWA 4NYVA 5G4SA 5HQ7A 5A5PA 4O7EA 4J1PA 4QNSA 3U5NA 4TTEA 5CP5A 3VKHA 3U5KA 4HBXA 4O7BA 5HFRA 5L96A 1JSPB 3SVHA 4HXMA 2DVSA 4IR5A 5CUDA 2L84A 2MJVB 4NUDA 5DW1A 4QUUA 2L5EA 5FE6A 4MR5A 5EISA 4A9JA 2RO1A 3UV4A 5HQ5A 1N72A 3P5OA 4QEVA 3LQHA 5F63A 4DONA 4TZ8A 4N4FA 4Z6IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HME A;  4C67 A;  4YYI A;  4HXN A;  3DWY A;  3S91 A;  2R0S A;  4CUR A;  4O72 A;  3U5J A;  4YYG A;  4ALH A;  4LZR A;  5F3A A;  4UYG A;  4MEO A;  4A9H A;  4YY4 A;  5EQ1 A;  5FB0 A;  4NYX A;  5DYU A;  2I7K A;  2I8N A;  5DYC A;  5E74 A;  4UIT A;  4E96 A;  3O37 A;  3LQI A;  3HMF A;  4Z1Q A;  3SVG A;  5FG6 A;  5A5Q A;  5DYX A;  5FFV A;  4QSX A;  5LVQ A;  2R0V A;  5HCL A;  5A82 A;  4QSR A;  4MR4 A;  5I7Y A;  4YAB A;  5I89 A;  4LC2 A;  4QST A;  4YC9 A;  4AKN A;  3IU5 A;  4QC3 A;  5ACY A;  5E3D A;  4TT6 A;  4RVR A;  4QZS A;  4UYF A;  3JVM A;  4YH4 A;  5F2P A;  5HRW A;  4HBW A;  5HEM A;  5HLS A;  4J0S A;  4BW4 A;  4QY4 A;  5CGP A;  5D0C A;  3DAI A;  5LKU A;  5A83 A;  5CQ7 A;  4NUE A;  4NR4 A;  4LRG A;  5A7C A;  2YEM A;  1WUG A;  4HXK A;  5II1 A;  3FKM X;  3P1C A;  2LSP B;  2OUO A;  4YYM A;  4PTB A;  4IOO A;  5E73 A;  4UIU A;  2WP2 A;  4XY9 A;  4LZS A;  4HBY A;  4MR3 A;  5KHM A;  4O71 A;  5EWV A;  2L85 A;  5F36 A;  5H85 A;  4QEU A;  4YK0 A;  4MEN A;  4QC1 A;  5COI A;  3MUK A;  4QUT A;  5LKT A;  5L99 A; 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