5E73A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh47
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e73A00
5I7YA 4NQMA 5F61A 3QZSA 5FH8A 4TTEA 2YDWA 2RNYA 2DATA 5A5OA 4UIVA 3Q2FA 4O71A 5CQ7A 3ZYUA 4O74A 5D3SA 4O7EA 5E0RA 4QSSA 4LYIA 5FE8A 5C7NA 4NUEA 4QBMA 5ETBA 1JSPB 5DYUA 4Z6HA 4UYEA 5D3HA 4MR4A 4UYFB 4TS8A 4QR4A 5JI8A 5FH7A 4TZ2A 4A9EA 3U5JA 5EICA 2E7OA 4WHWA 5EU1A 4YBMA 4QSRA 2F6JA 2YELA 4HXLA 4ALHA 4UIUA 5ETDA 5I40A 4TYLA 4CUSA 5EPBA 3NXBA 4IOQA 3ONIA 4CUPA 3JVMA 4NS5A 4J3IA 4QZSA 4YYHA 5CZGA 5FG5A 5HEMA 3Q2EA 5I83A 5H1TA 4LZSA 4XY8A 5DYAA 5CUDA 5II1A 5CU8A 4NUDA 4BW4A 4O7AA 4NRBA 2LSPB 5I7XA 4QUTA 4WIVA 5CRZA 4HBXA 5BT4A 5IG6A 5LKTA 5CUBA 4MR3A 5HFRA 5FE3A 4QY4A 5K29A 5E3GA 4QSWA 5D3NA 5ACYA 5IBNA 5CUCA 5FBXA 2R0VA 4J1PA 4NYXA 5LVQA 4YYDA 2OO1A 4KV1A 4QSTA 3JVKA 5HJCA 5FH6A 5FE7A 2I7KA 3UW9A 5CQ4A 5L98A 3UV5A 4UITA 4NXJA 4A9OA 5FG4A 4YABA 1WUMA 5FE6A 5ENJA 4IR4A 5E9VA 5I29A 5A7CA 4QYLA 4CUTA 4IORA 5L8TA 3LJWA 4UIZA 5CQ6A 2E3KA 2D9EA 4PKLA 3P1FA 5ENFA 5LJ0A 5AMFA 2D82A 4BW2A 4YYJA 1JM4B 5FG6A 4HBVA 2KTBB 5DKCA 3SVGA 4UYDA 4ALGA 1ZS5A 5EVAA 4UYGA 4O77A 5E9IA 2F6NA 5EWWA 5ENHA 5EISA 4ZQLA 4NYWA 4PS5A 5DW2A 3LXJA 4IR6A 5II2A 5EK9A 5LVRA 5I89A 4RVRA 3RCWA 5C8GA 3S92A 4C66A 4CFLA 4QEUA 4QSUA 4YATA 2FSAA 5I80A 3U5NA 5EGUA 2E7NA 5DFCA 4QSPA 5DBMA 4N4IA 4QEVA 4A9LA 3LQJA 2G4AA 4A9JA 4ZC9A 3I3JA 5EWHA 4NR6A 3UVYA 5CY9A 4YH4A 5L8UA 5CQ3A 5A5SA 5FE4A 4Q0OA 4UYHA 4Y03A 5DLZA 5HCLA 2WP2A 5FFVA 5FE1A 3HMFA 5DX4A 5F36A 5CGPA 4NRAA 4XY9A 4KV4A 3DAIA 3UVXA 5F1LA 4A9MA 5D25A 4YY6A 5KHMA 2I8NA 2OSSA 5EPRA 3O37A 4QR5A 4BW1A 5E7DA 5CQ8A 3MB3A 4HXPA 3UVDA 3HMEA 1E6IA 3LQHA 3QZVA 5IGNA 5IIDA 2DVQA 1N72A 2RI7A 4A9HA 3MXFA 5C89A 5CQAA 5EP7A 5D3RA 5CFWA 3JVJA 5HQ6A 5HQ5A 4C67A 4IR5A 4LYWA 5CPEA 4N4FA 5IGKA 5EWDA 5EQ1A 4YC9A 5DLXA 4YK0A 4NYVA 1F68A 3UV2A 4UIYA 4XUBA 4O7FA 4NRCA 3AQAA 5COIA 4BJXA 5LKZA 5BT5A 4PTBA 2GRCA 3P1DA 5CP5A 5D3LA 4Z6IA 2NXBA 3P1CA 2YQDA 4QC3A 4QR3A 2YYNA 3FKMX 4CURA 3U5LA 5A5PA 4CFKA 5L96A 4QC1A 5HRVA 5C87A 5I88A 5EI4A 4O7BA 5E9MA 5J0DA 5D3JA 5HQ7A 1WUGA 5EA1A 4TZ8A 2RS9B 4HBYA 4YBTA 5F2PA 4XYAA 4UIXA 4NR8A 4IOOA 2R0SA 4YYNA 5HELA 4PY6A 2MJVB 5F3AA 3QZTA 3U5KA 3G0LA 5LKUA 3SVHA 3P1EA 5G4RA 4O7CA 4N4HA 4NR7A 5KTUA 4TT4A 5F62A 5CS8A 4N4GA 5A5RA 4NQNA 2RO1A 5D26A 4YH3A 5TB6A 5I1QA 5LUUA 4IR3A 4N3WA 5D24A 4OUFA 4YY4A 5ENBA 5G4SA 4KCXA 4NR5A 4QSXA 3U5OA 4TT2A 5LJ1A 4BHWA 5E9LA 5FB0A 4LR6A 1X0JA 5A82A 4AKNA 5AMEA 5D7XA 5CQTA 5EWCA 5CTLA 5F63A 5DYCA 3IU5A 5TCMA 3S91A 4FLPA 3IU6A 2DWWA 4A9NA 5FB1A 4O75A 4UIWA 5KTXA 4HXSA 2H60A 4HXKA 2YEMA 5FE2A 2YEKA 2RNWA 4LDFA 4J0SA 5L97A 2N9GA 5BT3A 2DVVA 3GG3A 2DKWA 5D3TA 4MEOA 1EQFA 3UV4A 5HRXA 5A5NA 3MULA 5AD3A 5C4QA 5F1HA 4A9KA 2RFJA 2L84A 5DKDA 4YYMA 5DYXA 5FFWA 5C85A 4HBWA 5D3PA 5ENCA 5CUGA 4WHUA 4MENA 5LKXA 4O78A 2OUOA 3G0JA 3SVFA 3AADA 2WP1A 4F3IA 5E9YA 4A9FA 3K2JA 5DY7A 4TU6A 5KTWA 4O76A 5F5ZA 4Q0NA 5CUEA 5EM3A 5A85A 4Z1SA 3MQMA 5D0CA 5A83A 4LC2A 4LYSA 4HXNA 4X2IA 5EWVA 4QSVA 3UVWA 4OGIA 5IGMA 4HXRA 5FE5A 4MR5A 5JWMA 3O35A 5CQ5A 4A9IA 4TU4A 4ZW1A 4MEQA 4CUQA 3O36A 3TLPA 4NR9A 5L99A 4PCIA 4YADA 4QEWA 5FE0A 4LRGA 5DFBA 5F60A 4QUUA 5E73A 5E9KA 3P5OA 5H1UA 5HFQA 2L5EA 4UYFA 4CL9A 5HENA 5FDZA 4PCEA 5AD2A 4GPJA 4MEPA 2R0YA 5A81A 5IGLA 4Z1QA 4CUUA 4XUAA 4QSQA 4YYGA 3MUKA 5H85A 4YYIA 4J0RA 4BW3A 5F25A 4NR4A 4QB3A 3JVLA 4MR6A 5ENEA 5HM0A 2DVRA 5I86A 5DFDA 2R10A 5E3DA 5FFYA 4Z93A 3U5MA 5ENGA 4O72A 4YYKA 4HXOA 5DW1A 5EPSA 4CLBA 4DONA 5CUAA 4YBSA 5LJ2A 5FE9A 4LZ2A 5ENIA 4OGJA 5E74A 4HXMA 5EV9A 3U5PA 3D7CA 2RNXA 4E96A 4NUCA 5KO4A 3LQIA 3O33A 5H1VA 2L85A 2YW5A 5A5QA 3DWYA 5CRMA 5DKHA 5HLSA 3MB4A 5HRWA 4TT6A 5KU3A 4YAXA 4QNSA 4TQNA 3HMHA 2DVSA 3O34A 4LZRA 4O70A 4QYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I7YA 4NQMA 5F61A 3QZSA 5FH8A 4TTEA 2YDWA 2RNYA 2DATA 5A5OA 4UIVA 3Q2FA 4O71A 5CQ7A 3ZYUA 4O74A 5D3SA 4O7EA 5E0RA 4QSSA 4LYIA 5FE8A 5C7NA 4NUEA 4QBMA 5ETBA 1JSPB 5DYUA 4Z6HA 4UYEA 5D3HA 4MR4A 4UYFB 4TS8A 4QR4A 5JI8A 2EJNA 5FH7A 4AKIA 4TZ2A 4A9EA 3U5JA 5EICA 2E7OA 4WHWA 5EU1A 4YBMA 4QSRA 2F6JA 2YELA 4HXLA 4ALHA 4UIUA 5ETDA 5I40A 4AI6A 4TYLA 4CUSA 5EPBA 3NXBA 4IOQA 3ONIA 4CUPA 3JVMA 4NS5A 4J3IA 4QZSA 4YYHA 5CZGA 5FG5A 5HEMA 3Q2EA 5I83A 5H1TA 4LZSA 4XY8A 5DYAA 5CUDA 5II1A 5CU8A 4NUDA 4BW4A 4O7AA 4NRBA 2LSPB 5I7XA 4QUTA 4WIVA 5CRZA 4HBXA 5BT4A 5IG6A 5LKTA 5CUBA 4MR3A 5HFRA 5FE3A 4QY4A 5K29A 5E3GA 4QSWA 5D3NA 5ACYA 5IBNA 5CUCA 5FBXA 2R0VA 4J1PA 4NYXA 5LVQA 4YYDA 2OO1A 4KV1A 4QSTA 3JVKA 5HJCA 5FH6A 5FE7A 2I7KA 3UW9A 5CQ4A 5L98A 3UV5A 4UITA 4NXJA 4A9OA 5FG4A 4YABA 1WUMA 5FE6A 5ENJA 4IR4A 5E9VA 5I29A 5A7CA 4QYLA 4CUTA 4IORA 5L8TA 3LJWA 3D1BA 4UIZA 5CQ6A 2E3KA 2D9EA 4PKLA 3P1FA 5ENFA 5LJ0A 5AMFA 2D82A 4BW2A 4YYJA 1JM4B 5FG6A 4HBVA 2KTBB 5DKCA 3SVGA 4UYDA 4ALGA 1ZS5A 5EVAA 4UYGA 3D1DA 4O77A 5E9IA 2F6NA 5EWWA 5ENHA 5EISA 4ZQLA 4NYWA 4PS5A 5DW2A 3LXJA 4IR6A 5II2A 5EK9A 5LVRA 5I89A 4RVRA 3RCWA 5C8GA 3S92A 4C66A 4CFLA 4QEUA 4QSUA 4YATA 2FSAA 5I80A 3U5NA 5EGUA 2E7NA 5DFCA 4QSPA 5DBMA 4N4IA 4QEVA 4A9LA 3LQJA 2G4AA 4A9JA 4ZC9A 3I3JA 5EWHA 4NR6A 3UVYA 5CY9A 4YH4A 5L8UA 5CQ3A 5A5SA 5FE4A 4Q0OA 4UYHA 4Y03A 5DLZA 5HCLA 2WP2A 5FFVA 5FE1A 3HMFA 5DX4A 5F36A 5CGPA 4NRAA 4XY9A 4KV4A 3ERRA 3DAIA 3UVXA 5F1LA 4A9MA 5D25A 4YY6A 5KHMA 2I8NA 2OSSA 5EPRA 3O37A 4QR5A 4BW1A 5E7DA 5CQ8A 1ZKRA 3MB3A 4HXPA 3UVDA 3HMEA 1E6IA 3LQHA 3QZVA 5IGNA 5IIDA 2DVQA 1N72A 2RI7A 4A9HA 3MXFA 5C89A 5CQAA 5EP7A 5D3RA 5CFWA 3JVJA 5HQ6A 5HQ5A 4C67A 4IR5A 4LYWA 5CPEA 4N4FA 5IGKA 5EWDA 5EQ1A 4YC9A 5DLXA 4YK0A 4NYVA 1F68A 3UV2A 4UIYA 4XUBA 4O7FA 4NRCA 3AQAA 5COIA 4BJXA 5LKZA 5BT5A 4PTBA 2GRCA 3P1DA 5CP5A 5D3LA 4Z6IA 2NXBA 3P1CA 2YQDA 4QC3A 4QR3A 2YYNA 3FKMX 4CURA 3U5LA 5A5PA 4CFKA 5L96A 4QC1A 5HRVA 5C87A 5I88A 5EI4A 4O7BA 4AKHA 5E9MA 5J0DA 5D3JA 5HQ7A 1WUGA 5EA1A 4TZ8A 2RS9B 4HBYA 4YBTA 5F2PA 4XYAA 4UIXA 4NR8A 4IOOA 2R0SA 4YYNA 5HELA 4PY6A 2MJVB 5F3AA 3QZTA 3U5KA 3G0LA 5LKUA 3SVHA 3P1EA 5G4RA 4O7CA 4N4HA 4NR7A 5KTUA 4TT4A 5F62A 5CS8A 4N4GA 5A5RA 4NQNA 2RO1A 5D26A 4YH3A 5TB6A 5I1QA 5LUUA 4IR3A 4N3WA 5D24A 4OUFA 4YY4A 5ENBA 5G4SA 4KCXA 4NR5A 4QSXA 3U5OA 4TT2A 5LJ1A 4BHWA 5E9LA 5FB0A 4LR6A 1X0JA 5A82A 4AKNA 5AMEA 5D7XA 5CQTA 5EWCA 5CTLA 5F63A 5DYCA 3IU5A 3VKHA 5TCMA 3S91A 4FLPA 3IU6A 2DWWA 4A9NA 5FB1A 4O75A 4UIWA 5KTXA 4HXSA 2H60A 4HXKA 2YEMA 5FE2A 2YEKA 2RNWA 4LDFA 4J0SA 5L97A 2N9GA 5BT3A 2DVVA 3GG3A 2DKWA 5D3TA 4MEOA 1EQFA 3UV4A 5HRXA 5A5NA 3MULA 5AD3A 5C4QA 5F1HA 4A9KA 2RFJA 2L84A 5DKDA 4YYMA 5DYXA 5FFWA 5C85A 3VKGA 4HBWA 5D3PA 5ENCA 5CUGA 4WHUA 4MENA 5LKXA 4O78A 2OUOA 3G0JA 3SVFA 3AADA 2WP1A 4F3IA 5E9YA 4A9FA 3K2JA 5DY7A 4TU6A 5KTWA 4O76A 5F5ZA 4Q0NA 5CUEA 5EM3A 5A85A 4Z1SA 3MQMA 5D0CA 5A83A 4LC2A 4LYSA 4HXNA 4X2IA 5EWVA 4QSVA 3UVWA 4OGIA 5IGMA 4HXRA 1PUOA 5FE5A 4MR5A 5JWMA 3O35A 5CQ5A 4A9IA 4AKGA 4TU4A 4ZW1A 4MEQA 4CUQA 3O36A 3TLPA 4NR9A 5L99A 4PCIA 4YADA 4QEWA 5FE0A 4LRGA 5DFBA 5F60A 4QUUA 5E73A 5E9KA 3P5OA 5H1UA 5HFQA 2L5EA 4UYFA 4CL9A 5HENA 5FDZA 4PCEA 5AD2A 4GPJA 4MEPA 2R0YA 5A81A 5IGLA 4Z1QA 4CUUA 4XUAA 4QSQA 4YYGA 3MUKA 5H85A 4YYIA 4J0RA 4BW3A 5F25A 4NR4A 4QB3A 3JVLA 4MR6A 5ENEA 5HM0A 2DVRA 5I86A 5DFDA 2R10A 5E3DA 5FFYA 4Z93A 3U5MA 5ENGA 4O72A 4YYKA 4HXOA 5DW1A 5EPSA 4CLBA 4DONA 5CUAA 4YBSA 5LJ2A 5FE9A 4LZ2A 5ENIA 4OGJA 5E74A 4HXMA 5EV9A 3U5PA 3D7CA 2RNXA 4E96A 4NUCA 5KO4A 3LQIA 3O33A 5H1VA 2L85A 2YW5A 5A5QA 3DWYA 5CRMA 5DKHA 5HLSA 3MB4A 5HRWA 4TT6A 5KU3A 4YAXA 4QNSA 4TQNA 3HMHA 2DVSA 3O34A 4LZRA 4O70A 4QYDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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