5E73A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh47
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 38
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e73A00
5E9MA 3MXFA 5FE4A 4YYJA 5L8UA 4NR9A 5FE9A 5FE6A 2YEMA 4C67A 5CUCA 4FLPA 5D24A 5CRZA 5A5SA 2DWWA 5I1QA 4QNSA 3QZVA 3HMEA 4TTEA 5CQ7A 5DYCA 5BT3A 4O7FA 4A9NA 5JWMA 4DONA 3O36A 4LR6A 3RCWA 4IOQA 5DX4A 3P1DA 4NR6A 4OGJA 4YYGA 4QEUA 5TCMA 3AADA 4WHUA 5C89A 2DATA 5EVAA 4QSRA 3HMHA 3GG3A 3MB4A 4YADA 5F2PA 4QUUA 5EM3A 5DFCA 3LJWA 2OSSA 5FE3A 2R10A 4LC2A 5IGNA 4O74A 4TS8A 2DVVA 5ACYA 4E96A 3LQHA 4X2IA 4YBSA 1ZS5A 2YQDA 2KTBB 5E9IA 5HELA 5HRWA 4QR4A 5HEMA 3O35A 2N9GA 4LZSA 5F1HA 5A5QA 2RS9B 5A5RA 5II2A 4HXMA 4Z1QA 5F25A 2LSPB 5DKCA 5FDZA 1WUMA 4NQMA 5ETDA 5AMFA 3UV5A 4F3IA 4UIUA 4YH3A 4QBMA 4TU4A 2FSAA 4A9IA 4QY4A 4BW3A 2DVSA 1N72A 5E0RA 5FE8A 4UYGA 5L98A 4O71A 4QR3A 5FE1A 4J3IA 3Q2EA 5CQAA 4MEOA 2L84A 3MUKA 4Z6HA 5KO4A 2OO1A 4HBWA 1X0JA 4NRCA 4TYLA 4UIWA 3P1CA 4NR8A 4NYWA 4O7CA 5D3SA 5DFBA 5FB0A 4LZRA 3JVLA 5HENA 5D26A 5EP7A 5A82A 4MEPA 4O77A 3IU5A 3G0JA 3MQMA 5I7XA 4J0RA 4O78A 4YK0A 3AQAA 4TQNA 4HBXA 4Z1SA 5FE2A 4WHWA 4QSVA 4QSTA 4TT2A 4CUPA 5L97A 5DY7A 4IR4A 5IBNA 5HRVA 4N4FA 3U5LA 4UYEA 5FE7A 5HFQA 4IR5A 4MR6A 5DFDA 3HMFA 5DYAA 4QSSA 5KTUA 5CQTA 5CRMA 4YY6A 4YY4A 5E3DA 4NS5A 4WIVA 5C87A 4NR4A 3I3JA 3UW9A 4A9LA 5I80A 3U5JA 5CTLA 4YC9A 5DYXA 3UV4A 4BW1A 4BJXA 4TZ2A 4UYFB 5IIDA 5LKZA 5H1UA 4NYVA 4CFKA 2D82A 5COIA 4RVRA 3NXBA 5IGKA 3JVMA 5FE5A 4UIVA 5DBMA 5F5ZA 4PCIA 5C8GA 4O76A 4CLBA 4HXKA 4YBTA 5IG6A 5ENHA 5HRXA 3U5OA 5A5OA 3ONIA 4QSQA 5F60A 5FFYA 5DKHA 5HCLA 1WUGA 4QSPA 5D0CA 5EWDA 4TU6A 5E9LA 4BHWA 5LKUA 5EPRA 5KTXA 5CQ3A 3S91A 5KU3A 3O34A 4YYNA 5EU1A 4YATA 4QEVA 5HLSA 5ENGA 5CGPA 5KTWA 5L8TA 3U5KA 4A9KA 5CZGA 5FH6A 4PY6A 5HQ7A 4Z6IA 4IR3A 5LUUA 4QC1A 5CQ5A 4CUUA 4TT6A 1E6IA 3LQJA 5I83A 2RO1A 4QSUA 2R0SA 5HM0A 2YELA 4CUQA 4QC3A 5F1LA 5HQ5A 5ENFA 5EICA 5HQ6A 2DVQA 5A81A 4YYHA 5F3AA 5F63A 4UYDA 5DLXA 5FG5A 5G4RA 4UITA 4YH4A 4O75A 5CP5A 5H85A 4NR7A 4YBMA 2E7NA 5D3LA 3TLPA 4QR5A 5DLZA 2L85A 5D3HA 5CQ8A 2E3KA 5E9KA 4Q0NA 3FKMX 4UYHA 4LYIA 5D25A 4YABA 5CUEA 4XUBA 5F36A 3O33A 4AKNA 5EWVA 5DW1A 5BT4A 4Y03A 5FH7A 3QZSA 4MR5A 4PCEA 2OUOA 5EWHA 4O7BA 5DYUA 5II1A 5FBXA 5H1VA 5I7YA 4A9FA 3K2JA 4N4IA 5CY9A 5LJ0A 4NUEA 2YEKA 4O70A 2G4AA 4UIYA 2I8NA 4OUFA 5D7XA 5D3PA 5IGMA 5I40A 5LKXA 3O37A 4O72A 4XY9A 5FG6A 3UVWA 5JI8A 4ZC9A 4MR4A 4MEQA 4QZSA 5I88A 2GRCA 5E74A 3P1EA 4PS5A 5CU8A 5CFWA 5LJ2A 4Q0OA 2RNWA 4A9EA 5DW2A 5EQ1A 2MJVB 4LYWA 5J0DA 2I7KA 5C7NA 2E7OA 5FB1A 5CPEA 1EQFA 5EI4A 3UV2A 4TZ8A 4CUSA 3U5PA 3LQIA 4N4GA 4LZ2A 4HBVA 4NRAA 4NYXA 4PTBA 5TB6A 5IGLA 4HXOA 4C66A 4LYSA 3JVJA 2D9EA 3SVGA 4A9MA 5EPBA 4XUAA 3P1FA 4HXLA 4XYAA 3DAIA 4NR5A 3SVHA 4QSWA 2L5EA 5DKDA 4XY8A 5CUGA 4YYIA 1F68A 5E73A 2F6NA 4QYDA 2RNYA 3MULA 4HXPA 4HXRA 4LRGA 4CFLA 3LXJA 5A5PA 4BW4A 4LDFA 4UIZA 5FFWA 3P5OA 4ALHA 3U5MA 3UVXA 5AMEA 5KHMA 5I89A 3S92A 5EWWA 4KV4A 4O7EA 4TT4A 3QZTA 4HXSA 5I86A 4QUTA 5G4SA 2F6JA 5ENBA 5EWCA 5EA1A 3JVKA 5ENEA 5CUBA 4KV1A 5A85A 3MB3A 1JSPB 5A83A 4A9OA 5LVRA 5ETBA 2YYNA 4NUCA 2NXBA 5BT5A 5CQ6A 4Z93A 5FH8A 4NXJA 2YDWA 4NUDA 4OGIA 3G0LA 5C85A 5D3RA 5CUAA 3ZYUA 5F61A 5D3NA 4CUTA 4YYMA 4A9JA 4IOOA 2RNXA 3D7CA 5CS8A 2RFJA 4N4HA 4ZQLA 4PKLA 5EISA 4QSXA 5D3JA 5C4QA 4J0SA 2R0VA 3UVDA 5EGUA 3Q2FA 4YAXA 4CL9A 5E9YA 5ENJA 5AD2A 4HBYA 2R0YA 5CUDA 4IORA 5ENIA 2RI7A 2YW5A 5K29A 5HFRA 5L96A 3DWYA 4UIXA 5EPSA 5ENCA 4BW2A 5FG4A 3U5NA 3IU6A 4QYLA 5I29A 3SVFA 5CQ4A 2DVRA 4NQNA 4N3WA 5LKTA 2WP1A 5LVQA 4MENA 5A7CA 5E7DA 4ZW1A 5E9VA 4ALGA 5H1TA 4MR3A 4O7AA 5AD3A 2H60A 2WP2A 5A5NA 1JM4B 4IR6A 4GPJA 4YYDA 5EV9A 4J1PA 4QB3A 4YYKA 4KCXA 5D3TA 4QEWA 5EK9A 4HXNA 3UVYA 5HJCA 5F62A 4A9HA 5L99A 4UYFA 4CURA 2DKWA 5E3GA 5FFVA 4NRBA 5FE0A 5LJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E9MA 3MXFA 5FE4A 4YYJA 5L8UA 4NR9A 5FE9A 5FE6A 2YEMA 4C67A 5CUCA 4FLPA 5D24A 5CRZA 5A5SA 2DWWA 5I1QA 4QNSA 3QZVA 3HMEA 4TTEA 5CQ7A 5DYCA 5BT3A 4O7FA 4A9NA 5JWMA 4DONA 3O36A 4LR6A 3RCWA 4IOQA 5DX4A 3P1DA 4NR6A 4OGJA 4YYGA 4QEUA 5TCMA 3AADA 4WHUA 5C89A 2DATA 5EVAA 4QSRA 3HMHA 3GG3A 3MB4A 4YADA 5F2PA 4QUUA 5EM3A 3D1DA 5DFCA 3LJWA 2OSSA 5FE3A 2R10A 4LC2A 5IGNA 4O74A 4TS8A 2DVVA 5ACYA 4E96A 3LQHA 4X2IA 4YBSA 1ZS5A 2YQDA 2KTBB 5E9IA 5HELA 5HRWA 4QR4A 5HEMA 3O35A 2N9GA 4LZSA 5F1HA 5A5QA 2RS9B 5A5RA 5II2A 4HXMA 4Z1QA 5F25A 2LSPB 5DKCA 5FDZA 1WUMA 4NQMA 5ETDA 5AMFA 3UV5A 4F3IA 4UIUA 4YH3A 4QBMA 4TU4A 2FSAA 4A9IA 4QY4A 4BW3A 2DVSA 1N72A 5E0RA 5FE8A 4UYGA 5L98A 4O71A 4QR3A 5FE1A 4J3IA 3Q2EA 5CQAA 4MEOA 2L84A 3MUKA 4Z6HA 5KO4A 2OO1A 4HBWA 3D1BA 1X0JA 4NRCA 4TYLA 4UIWA 3P1CA 4NR8A 4NYWA 4O7CA 5D3SA 5DFBA 5FB0A 4LZRA 3JVLA 5HENA 5D26A 5EP7A 5A82A 4MEPA 4O77A 3IU5A 4AKHA 3G0JA 3MQMA 5I7XA 4J0RA 4O78A 4YK0A 3AQAA 4TQNA 4HBXA 4Z1SA 5FE2A 4WHWA 4QSVA 4QSTA 4TT2A 4CUPA 5L97A 5DY7A 4IR4A 5IBNA 5HRVA 4N4FA 3U5LA 4UYEA 5FE7A 5HFQA 4IR5A 4MR6A 5DFDA 3HMFA 5DYAA 4QSSA 5KTUA 5CQTA 5CRMA 4YY6A 4YY4A 5E3DA 4NS5A 4WIVA 5C87A 4NR4A 3I3JA 3UW9A 4A9LA 5I80A 3U5JA 5CTLA 4YC9A 5DYXA 3UV4A 4BW1A 4BJXA 4TZ2A 4UYFB 5IIDA 5LKZA 5H1UA 4AKIA 4NYVA 4CFKA 2D82A 5COIA 4RVRA 3NXBA 5IGKA 3JVMA 5FE5A 4UIVA 5DBMA 5F5ZA 4PCIA 5C8GA 4O76A 4CLBA 4HXKA 4YBTA 5IG6A 5ENHA 5HRXA 3ERRA 3U5OA 5A5OA 3ONIA 4QSQA 5F60A 5FFYA 5DKHA 5HCLA 1WUGA 4QSPA 5D0CA 5EWDA 4TU6A 5E9LA 4BHWA 5LKUA 5EPRA 5KTXA 5CQ3A 3S91A 5KU3A 3O34A 4YYNA 5EU1A 4YATA 4QEVA 5HLSA 5ENGA 5CGPA 5KTWA 5L8TA 3U5KA 4A9KA 5CZGA 5FH6A 4PY6A 5HQ7A 4Z6IA 4IR3A 5LUUA 4QC1A 5CQ5A 4CUUA 4TT6A 1E6IA 3LQJA 5I83A 2RO1A 4QSUA 2R0SA 5HM0A 2YELA 4CUQA 4QC3A 5F1LA 5HQ5A 5ENFA 5EICA 5HQ6A 2DVQA 5A81A 4YYHA 5F3AA 5F63A 4UYDA 5DLXA 5FG5A 5G4RA 4UITA 4YH4A 4O75A 5CP5A 5H85A 4NR7A 4YBMA 2E7NA 5D3LA 3TLPA 4QR5A 5DLZA 2L85A 5D3HA 5CQ8A 2E3KA 5E9KA 4Q0NA 3FKMX 4UYHA 4LYIA 5D25A 4YABA 5CUEA 4XUBA 5F36A 3O33A 4AKNA 5EWVA 5DW1A 5BT4A 4Y03A 1PUOA 5FH7A 3QZSA 4MR5A 4PCEA 2OUOA 5EWHA 4O7BA 5DYUA 5II1A 5FBXA 5H1VA 5I7YA 4A9FA 3K2JA 4N4IA 5CY9A 5LJ0A 4NUEA 2YEKA 4O70A 2G4AA 4UIYA 2I8NA 4OUFA 5D7XA 5D3PA 5IGMA 5I40A 5LKXA 3O37A 4O72A 4XY9A 5FG6A 3UVWA 5JI8A 4ZC9A 4MR4A 4MEQA 4QZSA 5I88A 4AI6A 2GRCA 5E74A 3P1EA 4PS5A 5CU8A 5CFWA 5LJ2A 4Q0OA 2RNWA 4A9EA 5DW2A 5EQ1A 2MJVB 4LYWA 5J0DA 2I7KA 5C7NA 2E7OA 5FB1A 5CPEA 1EQFA 5EI4A 3UV2A 4TZ8A 4CUSA 3U5PA 3LQIA 4N4GA 4LZ2A 4HBVA 4NRAA 4NYXA 4PTBA 5TB6A 5IGLA 4HXOA 4C66A 4LYSA 3VKGA 3JVJA 2D9EA 3SVGA 4A9MA 5EPBA 4XUAA 3P1FA 4HXLA 4XYAA 3DAIA 4NR5A 3SVHA 4QSWA 2L5EA 5DKDA 4XY8A 5CUGA 4YYIA 1F68A 5E73A 2F6NA 4QYDA 2RNYA 3MULA 4HXPA 4HXRA 4LRGA 4CFLA 3LXJA 5A5PA 4BW4A 4LDFA 4UIZA 5FFWA 3P5OA 1ZKRA 4ALHA 3U5MA 3UVXA 5AMEA 5KHMA 5I89A 3S92A 5EWWA 4KV4A 4O7EA 4TT4A 3QZTA 4HXSA 5I86A 4QUTA 5G4SA 2F6JA 5ENBA 5EWCA 5EA1A 3JVKA 5ENEA 5CUBA 4KV1A 5A85A 3MB3A 1JSPB 5A83A 4A9OA 5LVRA 5ETBA 2YYNA 4AKGA 4NUCA 2NXBA 5BT5A 5CQ6A 4Z93A 5FH8A 4NXJA 2YDWA 4NUDA 4OGIA 3G0LA 5C85A 5D3RA 5CUAA 3ZYUA 5F61A 5D3NA 4CUTA 4YYMA 4A9JA 4IOOA 2RNXA 3D7CA 5CS8A 2RFJA 4N4HA 4ZQLA 4PKLA 5EISA 4QSXA 5D3JA 5C4QA 4J0SA 2R0VA 3UVDA 5EGUA 3Q2FA 4YAXA 4CL9A 5E9YA 5ENJA 5AD2A 2EJNA 4HBYA 2R0YA 5CUDA 4IORA 5ENIA 2RI7A 2YW5A 5K29A 5HFRA 5L96A 3DWYA 4UIXA 5EPSA 5ENCA 4BW2A 5FG4A 3U5NA 3IU6A 4QYLA 5I29A 3SVFA 5CQ4A 2DVRA 4NQNA 4N3WA 5LKTA 2WP1A 5LVQA 4MENA 5A7CA 5E7DA 4ZW1A 5E9VA 4ALGA 5H1TA 4MR3A 4O7AA 5AD3A 2H60A 2WP2A 5A5NA 1JM4B 4IR6A 4GPJA 4YYDA 5EV9A 4J1PA 4QB3A 4YYKA 4KCXA 5D3TA 4QEWA 5EK9A 4HXNA 3UVYA 5HJCA 5F62A 4A9HA 3VKHA 5L99A 4UYFA 4CURA 2DKWA 5E3GA 5FFVA 4NRBA 5FE0A 5LJ1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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