5E73A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh47
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e73A00
4UIVA 4CUSA 4A9HA 5EPSA 3IU5A 5FE9A 4O7EA 3P1CA 5FG6A 4MEOA 4TS8A 4MR3A 4BHWA 3UVWA 2RI7A 4O72A 5AD2A 2MJVB 4NYVA 4YYKA 5I80A 5L99A 4QSVA 5ENCA 5HQ6A 1EQFA 4QSQA 3P1FA 4QSRA 1WUMA 4PS5A 5BT3A 4NRCA 2YEMA 4A9IA 4TT2A 5CUCA 4QEWA 5D3TA 4ZQLA 5HEMA 4IOQA 4LZSA 5KHMA 5EPBA 5IGKA 5ENBA 3UW9A 4YYDA 4PKLA 5C8GA 5F60A 3UVDA 5F3AA 3D7CA 4WHWA 3U5OA 4YATA 4HXRA 5FDZA 2E7OA 4YY4A 5ENHA 3MUKA 4A9EA 5C4QA 3U5NA 3P1EA 2I8NA 2D9EA 4QSSA 5FE4A 5EWHA 4N4GA 4MR5A 3LQIA 5A7CA 1JM4B 4NYWA 5A85A 5IG6A 5CUBA 5LKXA 4NS5A 5FG5A 5FE8A 4NRBA 5DLXA 4IR3A 3QZTA 5DYXA 5HM0A 5CPEA 5EK9A 5FFYA 4NR9A 4UYHA 3UV5A 2DWWA 5CUAA 4YYHA 5E9IA 5TB6A 4O76A 5DKDA 5EGUA 5H1TA 5JWMA 4QZSA 5ETBA 4DONA 2OUOA 3P5OA 4HXSA 5D26A 5FE7A 5LKUA 2L5EA 3ONIA 1E6IA 5CUDA 5EU1A 5L8TA 4YYNA 5HCLA 5E3GA 5E0RA 4NR7A 5F1HA 2FSAA 2N9GA 4TZ2A 5FH7A 2RS9B 5D3PA 4NR4A 5EICA 4CUUA 5A83A 4QSWA 4UYGA 2WP1A 3Q2EA 5D3JA 4XUBA 5KTUA 4LDFA 5ENIA 3O36A 4NYXA 4YH4A 4CUTA 3K2JA 4CUQA 4ZC9A 2KTBB 5CS8A 3U5KA 5D3SA 2R0VA 4IORA 5II1A 4A9KA 4O71A 4BW3A 5CFWA 5TCMA 3AQAA 4QUUA 3U5MA 3UV4A 2GRCA 4MENA 5EWWA 5HQ7A 4Q0NA 3S91A 4HBWA 5D3LA 2D82A 5C7NA 3NXBA 5F25A 2DVQA 3AADA 4GPJA 4QY4A 3LQHA 5CQ6A 5AD3A 3S92A 4O7AA 5LKZA 4QSUA 5I7YA 5H85A 5EWCA 4YK0A 5D3RA 4Z93A 5HFRA 2RFJA 4QEVA 5CQ7A 2E3KA 4NQNA 4QSXA 5FE2A 5EWDA 5KO4A 4J0RA 1F68A 2DKWA 4HXOA 5DYCA 3O34A 4YC9A 5IIDA 5I89A 5A5QA 3I3JA 5HRWA 4LRGA 4NUDA 5H1UA 4CLBA 4QR5A 5D3HA 4QSPA 5CGPA 2DVRA 5COIA 2OO1A 3LJWA 4UIZA 4BW4A 5D3NA 5A5OA 5CQ8A 4HBVA 3QZVA 5A5RA 5FH6A 4NR8A 4LYIA 5LJ1A 5E74A 5LJ2A 5CY9A 5CQ5A 2R0SA 5A81A 4QBMA 3U5PA 2RNWA 4KV4A 2NXBA 4A9LA 2RNYA 4NUCA 4OUFA 5ENEA 3Q2FA 5I86A 2YQDA 2DVVA 4QR3A 5E9MA 4HXLA 5EPRA 4QC1A 3HMFA 4Q0OA 4QR4A 5AMEA 5L98A 5IBNA 5CTLA 5E9KA 5DKHA 4BW2A 4UYDA 4TYLA 5ETDA 4HXMA 4O78A 3UV2A 2R0YA 4UYFB 2OSSA 5IGNA 3SVGA 5I83A 5ENJA 3JVKA 5HRVA 4CURA 4O77A 1ZS5A 2L84A 4IR4A 4BJXA 5D7XA 3SVHA 4A9JA 2YDWA 4TZ8A 4LC2A 5LJ0A 3U5JA 4Y03A 5CQAA 4NUEA 5DX4A 5FBXA 5EV9A 5E9LA 5G4SA 4QC3A 4IR6A 5DW2A 4YYGA 5C87A 5FE1A 5A5PA 5E3DA 3LXJA 4UIUA 5HLSA 5K29A 5FFWA 1X0JA 3MULA 5JI8A 4YBTA 2R10A 2RNXA 3P1DA 4RVRA 2I7KA 4FLPA 3IU6A 5FE5A 4CFKA 5EWVA 5DY7A 1N72A 5ENFA 4LR6A 5F2PA 2E7NA 4NR6A 4KCXA 3DAIA 5C85A 3O33A 2G4AA 3HMEA 2F6JA 5LVQA 5DBMA 4CL9A 5D24A 5CQ3A 5DKCA 4N4FA 5DFBA 5D0CA 5LVRA 2F6NA 5KU3A 5E9YA 4QYDA 3JVLA 5L96A 5CU8A 5CQ4A 5HELA 3RCWA 4O7FA 4CUPA 5I7XA 5EISA 4QYLA 4O7BA 3MB4A 4O7CA 5E7DA 2DVSA 4YYJA 5FE0A 4LZ2A 3FKMX 4WIVA 4A9MA 4HBXA 2YW5A 4OGJA 4QNSA 5A5NA 4YYIA 4TQNA 3MQMA 5BT5A 5ENGA 4QB3A 4MR6A 4HBYA 5F61A 4NXJA 4NQMA 3ZYUA 4TU4A 5E9VA 4Z1QA 4O74A 5FG4A 5LUUA 4TT6A 5CZGA 5DFDA 4N4IA 4TT4A 5FE3A 5EVAA 4QSTA 4YH3A 4UIYA 5FB1A 4XUAA 4XY8A 4HXKA 5I88A 5A82A 3O37A 3SVFA 5EQ1A 5CRZA 5DFCA 4QEUA 3U5LA 5BT4A 4YYMA 3O35A 4QUTA 2LSPB 4PCIA 5CUGA 4YBSA 4WHUA 3HMHA 2H60A 3DWYA 4YY6A 4Z1SA 5L97A 5F62A 3UVYA 5CQTA 4A9OA 1WUGA 4PY6A 4HXNA 5E73A 2YEKA 5L8UA 4TTEA 4MEPA 3UVXA 4AKNA 3G0JA 4BW1A 3G0LA 4E96A 5J0DA 4LYSA 5G4RA 4YADA 4O70A 4ALHA 5F1LA 5F36A 4PCEA 5EP7A 5FFVA 4UYEA 3QZSA 4XYAA 4UYFA 5I29A 2WP2A 5FH8A 5FE6A 5CUEA 4O75A 5II2A 5EM3A 5HENA 4YABA 4Z6IA 4YBMA 4LZRA 5A5SA 4ZW1A 4HXPA 4MR4A 5C89A 3JVMA 4YAXA 5FB0A 2YELA 3MXFA 5LKTA 5IGLA 5I1QA 4XY9A 3TLPA 4IR5A 4OGIA 4J3IA 4NR5A 4CFLA 5HRXA 5DW1A 5HJCA 4Z6HA 5IGMA 4N4HA 5H1VA 1JSPB 4F3IA 5I40A 5D25A 5DYUA 4KV1A 3JVJA 4X2IA 4TU6A 5EI4A 4C66A 5F5ZA 2DATA 2L85A 4NRAA 4ALGA 4J1PA 5CRMA 5F63A 5HQ5A 4C67A 5KTWA 4LYWA 4UITA 4A9NA 4J0SA 2RO1A 4UIWA 4A9FA 5AMFA 3LQJA 3GG3A 4UIXA 4N3WA 3MB3A 4MEQA 5HFQA 5CP5A 2YYNA 5DYAA 5EA1A 5ACYA 5DLZA 4IOOA 4PTBA 5KTXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UIVA 4CUSA 4A9HA 5EPSA 3IU5A 5FE9A 4O7EA 3P1CA 5FG6A 4MEOA 4TS8A 4MR3A 4BHWA 3D1BA 3UVWA 2RI7A 4O72A 5AD2A 2MJVB 4NYVA 4YYKA 5I80A 5L99A 4QSVA 5ENCA 5HQ6A 1EQFA 4QSQA 3P1FA 4QSRA 1WUMA 4PS5A 5BT3A 4NRCA 2YEMA 4A9IA 4TT2A 3D1DA 5CUCA 4QEWA 5D3TA 4ZQLA 5HEMA 4IOQA 4LZSA 5KHMA 5EPBA 5IGKA 5ENBA 3UW9A 4YYDA 4PKLA 5C8GA 5F60A 3UVDA 5F3AA 3D7CA 4WHWA 3U5OA 4YATA 4HXRA 5FDZA 2E7OA 4YY4A 5ENHA 3MUKA 4A9EA 5C4QA 3U5NA 3P1EA 2I8NA 2D9EA 4QSSA 5FE4A 5EWHA 4N4GA 4MR5A 3LQIA 5A7CA 1JM4B 4NYWA 5A85A 5IG6A 5CUBA 5LKXA 4NS5A 5FG5A 5FE8A 4NRBA 5DLXA 4IR3A 3QZTA 5DYXA 5HM0A 5CPEA 5EK9A 5FFYA 4NR9A 4UYHA 3UV5A 2DWWA 5CUAA 4YYHA 5E9IA 5TB6A 4O76A 5DKDA 5EGUA 5H1TA 5JWMA 4QZSA 5ETBA 4DONA 2OUOA 3P5OA 4HXSA 5D26A 5FE7A 5LKUA 2L5EA 3ONIA 1E6IA 5CUDA 5EU1A 5L8TA 4YYNA 5HCLA 5E3GA 5E0RA 4NR7A 5F1HA 2FSAA 2N9GA 4TZ2A 5FH7A 2RS9B 5D3PA 4NR4A 5EICA 4CUUA 5A83A 4QSWA 4UYGA 2WP1A 3Q2EA 5D3JA 4XUBA 5KTUA 4LDFA 5ENIA 3O36A 4NYXA 4YH4A 4CUTA 3K2JA 4CUQA 4ZC9A 2KTBB 5CS8A 3U5KA 5D3SA 2R0VA 4IORA 5II1A 4A9KA 4O71A 4BW3A 5CFWA 5TCMA 3AQAA 4QUUA 3U5MA 3UV4A 2GRCA 4MENA 5EWWA 5HQ7A 4Q0NA 3S91A 4HBWA 5D3LA 2D82A 4AKGA 5C7NA 3NXBA 5F25A 2DVQA 3AADA 4GPJA 4QY4A 3LQHA 5CQ6A 5AD3A 3S92A 4O7AA 5LKZA 3VKGA 4QSUA 5I7YA 5H85A 4AKHA 5EWCA 4YK0A 5D3RA 4Z93A 5HFRA 2RFJA 4QEVA 5CQ7A 2E3KA 4NQNA 4QSXA 5FE2A 5EWDA 5KO4A 4J0RA 1F68A 2DKWA 4HXOA 5DYCA 3O34A 4YC9A 5IIDA 5I89A 5A5QA 3I3JA 5HRWA 4LRGA 4NUDA 5H1UA 4CLBA 4QR5A 5D3HA 4QSPA 5CGPA 2DVRA 5COIA 2OO1A 4AKIA 3LJWA 4UIZA 4BW4A 5D3NA 2EJNA 5A5OA 5CQ8A 4HBVA 3QZVA 5A5RA 5FH6A 4NR8A 4LYIA 5LJ1A 5E74A 5LJ2A 5CY9A 5CQ5A 2R0SA 5A81A 4QBMA 3U5PA 2RNWA 4KV4A 2NXBA 4A9LA 2RNYA 4NUCA 4OUFA 5ENEA 3Q2FA 5I86A 2YQDA 2DVVA 4QR3A 5E9MA 4HXLA 5EPRA 4QC1A 3ERRA 3HMFA 4Q0OA 4QR4A 5AMEA 5L98A 5IBNA 5CTLA 5E9KA 5DKHA 4BW2A 4UYDA 4TYLA 5ETDA 4HXMA 4O78A 3UV2A 2R0YA 4UYFB 2OSSA 5IGNA 3SVGA 5I83A 5ENJA 3JVKA 5HRVA 4CURA 4O77A 1ZS5A 2L84A 4IR4A 4BJXA 5D7XA 3SVHA 4A9JA 2YDWA 4TZ8A 4LC2A 5LJ0A 3U5JA 4Y03A 5CQAA 4NUEA 5DX4A 5FBXA 5EV9A 5E9LA 5G4SA 4QC3A 4IR6A 5DW2A 4YYGA 5C87A 5FE1A 5A5PA 5E3DA 3LXJA 4UIUA 5HLSA 5K29A 5FFWA 1X0JA 3MULA 5JI8A 4YBTA 2R10A 2RNXA 3P1DA 4RVRA 2I7KA 4FLPA 3IU6A 5FE5A 4CFKA 5EWVA 4AI6A 5DY7A 1N72A 5ENFA 4LR6A 5F2PA 2E7NA 4NR6A 4KCXA 3DAIA 5C85A 3O33A 2G4AA 3HMEA 2F6JA 5LVQA 5DBMA 4CL9A 5D24A 5CQ3A 5DKCA 4N4FA 5DFBA 5D0CA 5LVRA 2F6NA 5KU3A 5E9YA 4QYDA 3JVLA 5L96A 5CU8A 5CQ4A 5HELA 3RCWA 4O7FA 4CUPA 5I7XA 5EISA 4QYLA 4O7BA 3MB4A 4O7CA 5E7DA 2DVSA 4YYJA 5FE0A 4LZ2A 3FKMX 4WIVA 4A9MA 4HBXA 2YW5A 4OGJA 4QNSA 5A5NA 4YYIA 4TQNA 3MQMA 5BT5A 5ENGA 4QB3A 4MR6A 4HBYA 5F61A 4NXJA 4NQMA 3ZYUA 4TU4A 5E9VA 4Z1QA 4O74A 5FG4A 5LUUA 4TT6A 5CZGA 5DFDA 4N4IA 4TT4A 5FE3A 5EVAA 4QSTA 4YH3A 4UIYA 5FB1A 4XUAA 4XY8A 4HXKA 5I88A 5A82A 3O37A 3SVFA 5EQ1A 5CRZA 5DFCA 4QEUA 3U5LA 5BT4A 4YYMA 3O35A 1PUOA 4QUTA 2LSPB 4PCIA 1ZKRA 5CUGA 4YBSA 4WHUA 3HMHA 2H60A 3DWYA 4YY6A 4Z1SA 5L97A 5F62A 3UVYA 5CQTA 4A9OA 1WUGA 4PY6A 4HXNA 5E73A 2YEKA 5L8UA 4TTEA 4MEPA 3UVXA 4AKNA 3G0JA 4BW1A 3VKHA 3G0LA 4E96A 5J0DA 4LYSA 5G4RA 4YADA 4O70A 4ALHA 5F1LA 5F36A 4PCEA 5EP7A 5FFVA 4UYEA 3QZSA 4XYAA 4UYFA 5I29A 2WP2A 5FH8A 5FE6A 5CUEA 4O75A 5II2A 5EM3A 5HENA 4YABA 4Z6IA 4YBMA 4LZRA 5A5SA 4ZW1A 4HXPA 4MR4A 5C89A 3JVMA 4YAXA 5FB0A 2YELA 3MXFA 5LKTA 5IGLA 5I1QA 4XY9A 3TLPA 4IR5A 4OGIA 4J3IA 4NR5A 4CFLA 5HRXA 5DW1A 5HJCA 4Z6HA 5IGMA 4N4HA 5H1VA 1JSPB 4F3IA 5I40A 5D25A 5DYUA 4KV1A 3JVJA 4X2IA 4TU6A 5EI4A 4C66A 5F5ZA 2DATA 2L85A 4NRAA 4ALGA 4J1PA 5CRMA 5F63A 5HQ5A 4C67A 5KTWA 4LYWA 4UITA 4A9NA 4J0SA 2RO1A 4UIWA 4A9FA 5AMFA 3LQJA 3GG3A 4UIXA 4N3WA 3MB3A 4MEQA 5HFQA 5CP5A 2YYNA 5DYAA 5EA1A 5ACYA 5DLZA 4IOOA 4PTBA 5KTXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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