4A9KA

Bromodomain of human crebbp with n-(4-hydroxyphenyl)acetamide
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords CREB-BINDING PROTEIN
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9kA00
4O72A 5CY9A 3P1FA 5DY7A 4CUUA 5HRXA 3P1EA 4MR6A 4QSSA 3QZSA 2NXBA 5LKUA 4KCXA 4LRGA 2YQDA 5FE3A 4XUBA 5I86A 5D7XA 5I89A 5FH6A 3Q2EA 4QUTA 4NS5A 3MUKA 4LZRA 4O7BA 4YYDA 3O37A 5FB1A 5BT4A 4IR5A 4TT2A 4Q0NA 3RCWA 5C87A 4NRCA 4YYJA 5F1HA 5FFYA 5JWMA 3D7CA 5DFCA 5FE1A 4CURA 5LJ1A 4NUCA 5D3RA 5G4RA 5I80A 3O34A 5A85A 3I3JA 4ZQLA 4UITA 5LKZA 5E3DA 5KU3A 3HMEA 2F6NA 5LKXA 5FE6A 5DKHA 4MR4A 3UVWA 3LQHA 5HENA 3U5PA 5I29A 2H60A 4MENA 2E7NA 5DX4A 5EICA 5CQAA 5EWWA 5L98A 5C4QA 3P1DA 4N3WA 4Z93A 4HXPA 4QZSA 5A82A 5F3AA 3UV4A 4QNSA 5FG4A 4ALGA 5DLZA 5IBNA 4QSUA 3SVFA 4ZW1A 5CGPA 4WHWA 4IR3A 2YEKA 3SVHA 3MB4A 5D3LA 5CQ3A 4QBMA 4QY4A 3UV5A 3IU6A 2G4AA 5CUBA 2DVQA 5D3SA 5FE8A 4QSRA 5ACYA 4NYXA 4J0SA 4Z6IA 4QC3A 4Z1SA 5CU8A 3DWYA 5KTWA 3S92A 2D9EA 5K29A 5IGMA 5L97A 2R10A 4HXKA 5HELA 5FE4A 5KO4A 2E7OA 5H1VA 4NR5A 5E7DA 4YYMA 4UIYA 5D3TA 4QR5A 4YYNA 5F60A 5EM3A 4N4IA 2L84A 4NYVA 4BW3A 5A5OA 4PCEA 5DFDA 5DYCA 4YBSA 4OGJA 5I1QA 5C7NA 2DKWA 4KV1A 5ENBA 5II2A 3LQIA 5FDZA 5EWCA 4YYKA 4NR8A 5BT5A 3P1CA 5L99A 4MR5A 4WIVA 4OGIA 2OO1A 4BHWA 2RFJA 4TTEA 5HFRA 2YYNA 3MQMA 3U5MA 3U5NA 5F1LA 5C8GA 4LZSA 2LSPB 3O33A 5CRMA 5CUGA 2L85A 4ZC9A 4UYFB 4YK0A 3FKMX 3LXJA 4O71A 4YY6A 5A5SA 4Y03A 4Q0OA 4O75A 2F6JA 4TZ8A 5DFBA 5HCLA 2RS9B 5D25A 5ENFA 3UVXA 4Z6HA 5FG5A 4A9IA 3AQAA 4A9HA 4UYFA 4A9LA 5CQ8A 4X2IA 4QEWA 5FG6A 4UYGA 5CRZA 5D3NA 2DVVA 5CUEA 2I8NA 4QB3A 5D3HA 4NRAA 3SVGA 4O7FA 5CUDA 5KHMA 5L8UA 4A9KA 5DYUA 4WHUA 5F61A 5LVRA 5EQ1A 4NR7A 4CFKA 5E0RA 5DW1A 5FB0A 3P5OA 4YYGA 5H1TA 5IGKA 4NQMA 4YC9A 5HJCA 4LDFA 4QSPA 3O36A 4N4HA 3JVJA 3S91A 2RNWA 5EP7A 1X0JA 4C67A 5EWHA 3MULA 5EA1A 3QZVA 4PKLA 5E9VA 5A5PA 5H1UA 4C66A 4UIVA 4QSWA 3NXBA 2OSSA 1E6IA 4LC2A 4TS8A 5E73A 3Q2FA 5EWVA 2RNXA 5E74A 3GG3A 2YDWA 4TZ2A 3LQJA 5E9IA 5EU1A 4HXRA 5TCMA 4O70A 5HRWA 4J0RA 4GPJA 4BJXA 5EWDA 5A7CA 5A5NA 5KTUA 5DW2A 5EI4A 4A9NA 4YYHA 5F5ZA 5C89A 2I7KA 5FH7A 5L96A 2DATA 3IU5A 4XYAA 5A5RA 4UIUA 4IR4A 5FH8A 4CUQA 2R0VA 4NR6A 5ENHA 5CQ5A 1N72A 5LJ0A 4O78A 2RI7A 4A9JA 2N9GA 4PTBA 4UYEA 5E3GA 4A9MA 5I83A 2YEMA 5I40A 5LVQA 4PY6A 4QEUA 5HLSA 4TU4A 2KTBB 5HQ5A 5CZGA 4YADA 2YELA 4YH3A 4DONA 5IGLA 3UW9A 4YBTA 4MR3A 5DYXA 5LUUA 2WP1A 3U5LA 4PS5A 2GRCA 3G0JA 1F68A 4IOQA 3MB3A 5AMEA 5CQ6A 4F3IA 1ZS5A 2L5EA 4QSTA 2R0SA 4HBVA 2D82A 5D3PA 5DKCA 4HXNA 5I7XA 4LYWA 5F25A 4HBWA 4O7CA 5LJ2A 5DYAA 4UIWA 5CQ4A 5HRVA 4QEVA 3UV2A 5FE0A 4YABA 4YBMA 5DBMA 4Z1QA 4NR4A 5HEMA 4LYIA 3HMFA 5F36A 2WP2A 4HXMA 5I88A 3JVKA 5A81A 5CFWA 4CUPA 5D0CA 4IORA 4QUUA 5TB6A 5HM0A 5ENJA 4LYSA 4UIZA 4TQNA 4MEPA 4NXJA 5IGNA 5EVAA 4A9FA 4HXSA 4HXLA 4LR6A 4YAXA 5II1A 3G0LA 4XUAA 5EPBA 4HBXA 5DLXA 5JI8A 1JSPB 2OUOA 5KTXA 5D24A 4HBYA 4TU6A 5I7YA 4QR3A 3O35A 4UYHA 5FE2A 4TT4A 5ENIA 5D3JA 4YY4A 4YYIA 1EQFA 5LKTA 3DAIA 5H85A 2E3KA 4AKNA 5E9KA 5ENEA 5IG6A 3JVLA 5DKDA 4NRBA 5G4SA 2MJVB 5FE9A 4O7AA 4O76A 5CQTA 3MXFA 5J0DA 2RO1A 4XY9A 4QSXA 5FFWA 2R0YA 4XY8A 5CTLA 5CQ7A 4CFLA 4NQNA 4NUDA 4O7EA 5E9YA 4J3IA 1WUMA 4MEOA 5FE5A 4J1PA 3LJWA 4MEQA 3ONIA 4QYDA 4N4FA 5EK9A 3U5KA 5E9LA 2DVRA 3K2JA 3ZYUA 4O74A 2DVSA 5HFQA 5HQ7A 4BW1A 5AD3A 5EISA 5AD2A 5CPEA 3HMHA 4KV4A 4N4GA 4A9OA 4BW4A 4E96A 2DWWA 3UVDA 3QZTA 3UVYA 4LZ2A 5CUCA 5EPSA 4UIXA 3U5OA 4YATA 5AMFA 2FSAA 4TT6A 5FFVA 4QYLA 5E9MA 5COIA 5ENGA 5A83A 5FE7A 4PCIA 4TYLA 4QR4A 4CLBA 5BT3A 4NR9A 5EGUA 4QSQA 3TLPA 5CS8A 4CUSA 4UYDA 4O77A 5F63A 5FBXA 5HQ6A 5IIDA 4IR6A 4YH4A 5EV9A 2RNYA 5A5QA 4CUTA 3U5JA 4A9EA 1JM4B 5L8TA 4IOOA 5CP5A 4QSVA 5C85A 5EPRA 3JVMA 1WUGA 4NYWA 5D26A 4RVRA 4NUEA 2YW5A 5F2PA 4OUFA 5F62A 5ENCA 4CL9A 5ETBA 4QC1A 5CUAA 5ETDA 4ALHA 4HXOA 3AADA 4BW2A 4FLPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O72A 5CY9A 3P1FA 5DY7A 4CUUA 5HRXA 3P1EA 3D1BA 4MR6A 4QSSA 3QZSA 2NXBA 5LKUA 4KCXA 4LRGA 2YQDA 5FE3A 4XUBA 5I86A 5D7XA 5I89A 5FH6A 3Q2EA 4QUTA 4NS5A 3MUKA 4LZRA 4O7BA 4YYDA 3O37A 5FB1A 5BT4A 4IR5A 4TT2A 4Q0NA 3RCWA 5C87A 4NRCA 4YYJA 5F1HA 5FFYA 5JWMA 3D7CA 5DFCA 5FE1A 4CURA 5LJ1A 4NUCA 5D3RA 5G4RA 5I80A 3O34A 5A85A 3I3JA 4ZQLA 4UITA 5LKZA 5E3DA 5KU3A 3HMEA 2F6NA 5LKXA 5FE6A 5DKHA 4MR4A 3UVWA 3LQHA 5HENA 3U5PA 5I29A 2H60A 4MENA 2E7NA 5DX4A 5EICA 5CQAA 5EWWA 2EJNA 5L98A 5C4QA 3P1DA 4N3WA 4Z93A 4HXPA 4QZSA 5A82A 5F3AA 3UV4A 4QNSA 5FG4A 4ALGA 5DLZA 5IBNA 4QSUA 3SVFA 4ZW1A 5CGPA 4WHWA 4IR3A 2YEKA 3SVHA 3MB4A 5D3LA 5CQ3A 4QBMA 4QY4A 3UV5A 3IU6A 4AKGA 2G4AA 5CUBA 2DVQA 5D3SA 5FE8A 4QSRA 5ACYA 4NYXA 4J0SA 4Z6IA 4QC3A 4Z1SA 5CU8A 3DWYA 5KTWA 3S92A 2D9EA 5K29A 5IGMA 5L97A 2R10A 4HXKA 5HELA 5FE4A 5KO4A 2E7OA 5H1VA 4NR5A 5E7DA 4YYMA 4UIYA 5D3TA 4QR5A 4YYNA 5F60A 5EM3A 4N4IA 2L84A 4NYVA 4BW3A 5A5OA 4PCEA 5DFDA 5DYCA 4YBSA 4OGJA 5I1QA 5C7NA 2DKWA 4KV1A 5ENBA 5II2A 3LQIA 5FDZA 5EWCA 4YYKA 4NR8A 5BT5A 3P1CA 5L99A 4MR5A 4WIVA 4OGIA 2OO1A 4BHWA 2RFJA 4TTEA 5HFRA 2YYNA 3MQMA 3U5MA 3U5NA 5F1LA 5C8GA 4LZSA 2LSPB 3O33A 5CRMA 5CUGA 2L85A 4ZC9A 4UYFB 4YK0A 3FKMX 3LXJA 4O71A 4YY6A 5A5SA 4Y03A 4Q0OA 4O75A 2F6JA 4TZ8A 5DFBA 5HCLA 2RS9B 5D25A 5ENFA 3UVXA 4Z6HA 5FG5A 4A9IA 3AQAA 4A9HA 4UYFA 4A9LA 5CQ8A 4X2IA 4QEWA 5FG6A 4UYGA 5CRZA 5D3NA 2DVVA 5CUEA 2I8NA 4QB3A 5D3HA 4NRAA 3SVGA 4O7FA 5CUDA 5KHMA 5L8UA 4A9KA 5DYUA 1ZKRA 4WHUA 5F61A 5LVRA 5EQ1A 4NR7A 4CFKA 5E0RA 5DW1A 5FB0A 3P5OA 4YYGA 5H1TA 5IGKA 4NQMA 4YC9A 5HJCA 4LDFA 4QSPA 3O36A 4N4HA 3JVJA 3S91A 2RNWA 5EP7A 1X0JA 4C67A 5EWHA 3MULA 5EA1A 3QZVA 4PKLA 5E9VA 5A5PA 5H1UA 4C66A 4UIVA 4QSWA 3NXBA 2OSSA 1E6IA 4LC2A 4TS8A 5E73A 3Q2FA 5EWVA 2RNXA 5E74A 3GG3A 2YDWA 4TZ2A 3LQJA 5E9IA 5EU1A 4HXRA 5TCMA 4O70A 5HRWA 4J0RA 4GPJA 4BJXA 5EWDA 5A7CA 5A5NA 5KTUA 5DW2A 5EI4A 4A9NA 4YYHA 5F5ZA 5C89A 2I7KA 5FH7A 5L96A 2DATA 3IU5A 4XYAA 5A5RA 4UIUA 4IR4A 5FH8A 4CUQA 2R0VA 4NR6A 5ENHA 5CQ5A 1N72A 5LJ0A 4O78A 2RI7A 4A9JA 2N9GA 4PTBA 4UYEA 5E3GA 4A9MA 5I83A 2YEMA 5I40A 5LVQA 4PY6A 3ERRA 4QEUA 5HLSA 4TU4A 2KTBB 5HQ5A 5CZGA 4YADA 2YELA 4YH3A 4DONA 5IGLA 3UW9A 4YBTA 4MR3A 5DYXA 5LUUA 2WP1A 3U5LA 4PS5A 2GRCA 3G0JA 1F68A 4IOQA 3MB3A 5AMEA 5CQ6A 4F3IA 1ZS5A 2L5EA 4QSTA 2R0SA 4HBVA 2D82A 5D3PA 5DKCA 4HXNA 5I7XA 4LYWA 5F25A 4HBWA 4O7CA 5LJ2A 5DYAA 4UIWA 5CQ4A 5HRVA 4QEVA 3UV2A 5FE0A 4YABA 4YBMA 5DBMA 4Z1QA 4NR4A 5HEMA 4LYIA 3HMFA 4AKHA 5F36A 2WP2A 4HXMA 5I88A 3JVKA 5A81A 5CFWA 4CUPA 5D0CA 4IORA 4QUUA 5TB6A 5HM0A 5ENJA 4LYSA 4UIZA 4TQNA 4MEPA 4NXJA 5IGNA 5EVAA 4A9FA 4HXSA 4HXLA 4LR6A 4YAXA 5II1A 3G0LA 4XUAA 5EPBA 4HBXA 5DLXA 5JI8A 1JSPB 2OUOA 5KTXA 5D24A 4HBYA 4TU6A 5I7YA 4QR3A 3O35A 4UYHA 5FE2A 4TT4A 5ENIA 3D1DA 5D3JA 4YY4A 4YYIA 1EQFA 5LKTA 3DAIA 5H85A 2E3KA 4AKNA 5E9KA 5ENEA 5IG6A 3VKHA 3JVLA 5DKDA 4NRBA 5G4SA 2MJVB 5FE9A 4O7AA 4O76A 5CQTA 3MXFA 5J0DA 2RO1A 4XY9A 4QSXA 5FFWA 2R0YA 4XY8A 5CTLA 5CQ7A 4CFLA 4NQNA 4NUDA 4O7EA 5E9YA 4J3IA 1WUMA 4MEOA 5FE5A 4J1PA 3LJWA 4MEQA 3ONIA 4QYDA 4N4FA 5EK9A 3U5KA 5E9LA 2DVRA 3K2JA 3ZYUA 4O74A 2DVSA 5HFQA 5HQ7A 4BW1A 5AD3A 5EISA 5AD2A 5CPEA 1PUOA 3HMHA 4KV4A 4N4GA 4A9OA 4BW4A 4E96A 2DWWA 3UVDA 3QZTA 3UVYA 4LZ2A 5CUCA 5EPSA 4UIXA 3U5OA 4AI6A 4YATA 5AMFA 2FSAA 4TT6A 5FFVA 4QYLA 5E9MA 5COIA 5ENGA 5A83A 5FE7A 4PCIA 4TYLA 4QR4A 4CLBA 5BT3A 4NR9A 3VKGA 5EGUA 4QSQA 3TLPA 5CS8A 4CUSA 4UYDA 4O77A 5F63A 5FBXA 5HQ6A 5IIDA 4IR6A 4YH4A 4AKIA 5EV9A 2RNYA 5A5QA 4CUTA 3U5JA 4A9EA 1JM4B 5L8TA 4IOOA 5CP5A 4QSVA 5C85A 5EPRA 3JVMA 1WUGA 4NYWA 5D26A 4RVRA 4NUEA 2YW5A 5F2PA 4OUFA 5F62A 5ENCA 4CL9A 5ETBA 4QC1A 5CUAA 5ETDA 4ALHA 4HXOA 3AADA 4BW2A 4FLPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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