3DAIA

Crystal structure of the bromodomain of the human atad2
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2008-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3daiA00
5A83A 4QSWA 4UITA 2OO1A 5CQTA 4A9NA 4HXNA 4KCXA 4LDFA 4TTEA 4O7AA 5H1TA 5I7XA 5D3TA 5FDZA 5CUGA 5A7CA 4NRBA 5EI4A 5CQ4A 5FE7A 5I29A 2YEMA 5TB6A 2H60A 4QSSA 5HLSA 4A9EA 3DAIA 5CUBA 5DFCA 5CQ3A 3I3JA 5FFWA 5DKHA 4LYWA 4MR4A 4YATA 4FLPA 4TU6A 4J0RA 5CQ7A 3DWYA 4J1PA 3RCWA 3JVLA 4ZQLA 5CUCA 5LUUA 4NR9A 5ENCA 5TCMA 3UVWA 5EPSA 5D3RA 4A9LA 4UYHA 3MB3A 4CFLA 5J0DA 5DY7A 5EGUA 4A9HA 5HQ6A 5IIDA 5HJCA 2R10A 5ENHA 2D9EA 5D3PA 2E3KA 5DX4A 4UIYA 5KO4A 5EWWA 4IORA 4LYSA 5EM3A 5LVRA 4NXJA 2L5EA 4NUDA 3Q2FA 4HBWA 5EU1A 5FE3A 5AMFA 5I88A 4NQMA 4C67A 1JSPB 3UV5A 5HM0A 3MXFA 5HQ5A 4Z1SA 5FE5A 4TZ8A 5EWCA 4YH3A 5C87A 5KHMA 5EICA 4IOQA 5FB0A 4MR3A 5DYAA 4LR6A 1N72A 5FH8A 4LZ2A 4KV1A 5E9VA 2RI7A 5F60A 3LJWA 4QYDA 4LRGA 4IOOA 5F61A 2YDWA 4YH4A 4NYWA 5DLZA 5EWHA 1F68A 5ENBA 4ALHA 1JM4B 5D0CA 4HXKA 3O37A 5AMEA 2E7NA 5LKUA 5HQ7A 4XUBA 5II1A 4NR5A 3D7CA 5COIA 2YYNA 5C4QA 5E9MA 4TS8A 5I7YA 5FE2A 4E96A 4YYJA 5LVQA 4PTBA 4A9IA 5CGPA 5ETDA 3QZSA 5FE1A 5G4SA 2RS9B 4KV4A 4TZ2A 4YYMA 4O75A 4PKLA 5DKCA 4TYLA 4OGIA 3O36A 4A9OA 4O78A 5EWVA 4CUTA 3O35A 5F36A 4YK0A 3NXBA 2MJVB 5EV9A 5LKZA 1ZS5A 3FKMX 4YADA 4CUUA 4TT6A 4YBMA 4YBTA 5KTXA 2DATA 4HBXA 4UIWA 5I1QA 4NRCA 3G0LA 4A9MA 4BW1A 3JVKA 4QBMA 4TT4A 4MR5A 4O71A 4Z6IA 4XYAA 4QYLA 5DKDA 4QEWA 4O76A 3G0JA 3K2JA 4IR3A 4YBSA 5ENFA 3QZVA 5EPBA 4NYXA 5D25A 4UYFB 5BT3A 4NS5A 5AD2A 5IGKA 2F6NA 4LC2A 4QSQA 5D3HA 5D24A 4Q0OA 3U5KA 5DYCA 5EISA 4NR6A 1WUMA 4NUEA 4CURA 5A5SA 3LQJA 5EA1A 4QY4A 5FG4A 5CTLA 4HXPA 4CLBA 5FG6A 4YYGA 4MEPA 2RNYA 4A9JA 3UV4A 5FFYA 4MR6A 3S92A 3HMHA 4A9KA 4QZSA 5LKTA 5BT4A 2G4AA 5A5QA 5FE8A 4BJXA 4ZW1A 5A5OA 4ZC9A 2RNXA 4N3WA 3HMFA 5A5NA 4XY9A 3UW9A 5ENIA 5C7NA 5A5PA 2YELA 4Z6HA 5HENA 3IU5A 4WIVA 4O7CA 2DVVA 5FE9A 3MB4A 4QC3A 4GPJA 5FH6A 3P1CA 4DONA 4PS5A 3LQHA 5H85A 5F62A 4X2IA 5F25A 5FBXA 4N4IA 4CL9A 3Q2EA 5IG6A 3SVGA 5KTUA 4O7FA 4YY4A 4QEVA 4BHWA 3MQMA 3P5OA 2YEKA 4YYDA 4F3IA 5DYXA 4QSPA 2YW5A 3GG3A 4BW4A 4UIVA 4ALGA 2NXBA 5CQ5A 5EWDA 4LYIA 5E9YA 4MENA 3UV2A 5CUDA 2DKWA 3O34A 5CU8A 2I8NA 2I7KA 4TQNA 4MEQA 5C89A 4HXOA 5L8TA 4YYNA 5HEMA 4QEUA 4QUUA 2RNWA 3U5JA 4UIXA 5L96A 5A5RA 5HCLA 4RVRA 4UYGA 5HRVA 2WP2A 2D82A 5LJ1A 4QSTA 4NR7A 5L98A 5EP7A 5HELA 4PY6A 4QR4A 4CFKA 4N4GA 5C85A 4NRAA 4HXRA 4YC9A 5D7XA 5IGMA 3UVDA 5L99A 4QR5A 3O33A 3S91A 4QB3A 3AADA 4YYKA 5DFDA 4QC1A 4QNSA 5A85A 5KU3A 4NR4A 4OUFA 5HRXA 4Q0NA 4O77A 5CUEA 5F2PA 3MUKA 3QZTA 5F5ZA 5EPRA 2OUOA 4PCIA 5CUAA 5D3SA 5DFBA 4YY6A 4BW2A 4CUSA 4YABA 4C66A 5LJ0A 3SVFA 5FB1A 4N4FA 5D26A 4QSXA 5KTWA 4PCEA 4AKNA 5CRMA 5I89A 4IR6A 5E7DA 1WUGA 4A9FA 5E74A 2DVSA 5E9LA 2L85A 5EK9A 4UIUA 5A82A 5F3AA 5IGNA 5FE6A 4NR8A 2R0VA 3JVMA 4HXSA 2LSPB 3AQAA 4HBVA 4IR5A 5II2A 3U5OA 4J0SA 3SVHA 5DBMA 2KTBB 2DVRA 5CRZA 4J3IA 4N4HA 4NUCA 2N9GA 5L8UA 5JWMA 2RO1A 5CQ6A 4Z1QA 5CFWA 5ETBA 1EQFA 4O74A 4IR4A 3U5PA 5ACYA 5F1LA 5FE4A 2F6JA 4HBYA 4QSRA 5CPEA 3UVXA 3ZYUA 4O7BA 4YAXA 5AD3A 4LZRA 3U5LA 5ENGA 3TLPA 5C8GA 5H1VA 2R0SA 5D3JA 4Z93A 2DVQA 2GRCA 5I80A 3JVJA 4XUAA 4UYEA 2DWWA 5F1HA 5H1UA 2YQDA 3UVYA 4Y03A 5E9IA 4O7EA 4OGJA 5CP5A 5CZGA 5DLXA 4WHWA 5DYUA 5IBNA 3U5NA 4WHUA 4TU4A 2OSSA 4NQNA 5CS8A 2WP1A 3P1EA 5BT5A 5CQAA 5DW1A 5I83A 3P1DA 5EVAA 4UIZA 4O72A 3ONIA 4QR3A 3LQIA 5FG5A 5K29A 5I86A 5HRWA 4LZSA 1X0JA 2L84A 5HFRA 4XY8A 2R0YA 5I40A 4YYIA 4O70A 4NYVA 5D3LA 5HFQA 4QSVA 4QUTA 5CY9A 5LJ2A 5JI8A 4HXLA 2RFJA 3U5MA 4MEOA 5F63A 5E73A 3P1FA 5G4RA 4UYDA 5EQ1A 5A81A 5IGLA 4UYFA 3LXJA 4YYHA 2FSAA 5FFVA 5FH7A 2E7OA 1E6IA 5E3DA 5CQ8A 3MULA 4QSUA 5FE0A 5L97A 5ENJA 4CUPA 5E0RA 4HXMA 4CUQA 5DW2A 5D3NA 3IU6A 3HMEA 4BW3A 5ENEA 5LKXA 4TT2A 5E3GA 5E9KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A83A 4QSWA 4UITA 2OO1A 5CQTA 4A9NA 4HXNA 4KCXA 4LDFA 4TTEA 4O7AA 5H1TA 5I7XA 5D3TA 5FDZA 5CUGA 5A7CA 4NRBA 5EI4A 5CQ4A 5FE7A 5I29A 2YEMA 5TB6A 2H60A 4QSSA 5HLSA 4A9EA 3DAIA 5CUBA 5DFCA 5CQ3A 3I3JA 5FFWA 5DKHA 4LYWA 4MR4A 4YATA 4FLPA 4TU6A 4J0RA 5CQ7A 3DWYA 4J1PA 3RCWA 3JVLA 4ZQLA 5CUCA 5LUUA 4NR9A 5ENCA 5TCMA 3UVWA 5EPSA 5D3RA 3VKHA 4A9LA 4UYHA 3MB3A 4CFLA 5J0DA 5DY7A 5EGUA 4A9HA 5HQ6A 5IIDA 5HJCA 2R10A 5ENHA 2D9EA 5D3PA 2E3KA 5DX4A 4UIYA 5KO4A 5EWWA 4IORA 4LYSA 5EM3A 5LVRA 4NXJA 2L5EA 4NUDA 3Q2FA 4HBWA 5EU1A 5FE3A 5AMFA 5I88A 4NQMA 4C67A 1JSPB 3UV5A 5HM0A 3MXFA 5HQ5A 4Z1SA 5FE5A 4TZ8A 5EWCA 4YH3A 5C87A 5KHMA 5EICA 4IOQA 5FB0A 4MR3A 5DYAA 4LR6A 1N72A 5FH8A 4LZ2A 4KV1A 5E9VA 2RI7A 5F60A 3LJWA 4QYDA 4LRGA 4IOOA 5F61A 2YDWA 4YH4A 4NYWA 5DLZA 5EWHA 1F68A 5ENBA 4ALHA 1JM4B 5D0CA 4HXKA 3O37A 5AMEA 2E7NA 5LKUA 5HQ7A 4XUBA 5II1A 4NR5A 3D7CA 5COIA 2YYNA 5C4QA 5E9MA 4TS8A 5I7YA 5FE2A 4E96A 4YYJA 5LVQA 4PTBA 4A9IA 5CGPA 5ETDA 3QZSA 5FE1A 5G4SA 2RS9B 4KV4A 4TZ2A 4YYMA 4O75A 4PKLA 5DKCA 4TYLA 4OGIA 3O36A 4A9OA 4O78A 5EWVA 4CUTA 3O35A 5F36A 4YK0A 3NXBA 2MJVB 5EV9A 5LKZA 1ZS5A 3FKMX 4YADA 4CUUA 4TT6A 4YBMA 4YBTA 5KTXA 2DATA 4HBXA 4UIWA 5I1QA 4NRCA 3G0LA 4A9MA 4BW1A 3JVKA 4QBMA 4TT4A 4MR5A 4O71A 4Z6IA 4XYAA 4QYLA 5DKDA 4QEWA 4O76A 3G0JA 3K2JA 4IR3A 3VKGA 4YBSA 5ENFA 3QZVA 5EPBA 4NYXA 5D25A 4UYFB 5BT3A 4NS5A 5AD2A 5IGKA 2F6NA 4LC2A 4QSQA 5D3HA 3D1DA 5D24A 4Q0OA 3U5KA 5DYCA 5EISA 3ERRA 3D1BA 1WUMA 4NR6A 4NUEA 4CURA 4AKGA 5A5SA 3LQJA 5EA1A 4QY4A 5FG4A 5CTLA 4HXPA 4CLBA 5FG6A 4YYGA 4MEPA 2RNYA 4A9JA 3UV4A 5FFYA 4MR6A 3S92A 3HMHA 4A9KA 4QZSA 5LKTA 5BT4A 2G4AA 5A5QA 5FE8A 4BJXA 4ZW1A 5A5OA 4ZC9A 2RNXA 4N3WA 3HMFA 5A5NA 4XY9A 3UW9A 5ENIA 5C7NA 5A5PA 2YELA 4Z6HA 5HENA 3IU5A 4WIVA 4O7CA 2DVVA 5FE9A 3MB4A 4QC3A 4GPJA 5FH6A 3P1CA 4DONA 4PS5A 3LQHA 5H85A 5F62A 4X2IA 5F25A 5FBXA 4N4IA 4CL9A 3Q2EA 5IG6A 3SVGA 5KTUA 4O7FA 4YY4A 4QEVA 4BHWA 3MQMA 3P5OA 2YEKA 4YYDA 4AKHA 4F3IA 5DYXA 4QSPA 2YW5A 3GG3A 4BW4A 1PUOA 4UIVA 4ALGA 2NXBA 5CQ5A 5EWDA 4LYIA 5E9YA 4MENA 3UV2A 5CUDA 2DKWA 3O34A 5CU8A 2I8NA 2I7KA 4TQNA 4MEQA 5C89A 4HXOA 5L8TA 4YYNA 5HEMA 4QEUA 4QUUA 2RNWA 3U5JA 4UIXA 5L96A 5A5RA 5HCLA 4RVRA 4UYGA 5HRVA 2WP2A 2D82A 5LJ1A 4QSTA 4NR7A 5L98A 5EP7A 5HELA 4AKIA 4PY6A 4QR4A 4CFKA 4N4GA 5C85A 4NRAA 4HXRA 4YC9A 5D7XA 5IGMA 1ZKRA 3UVDA 5L99A 4QR5A 3O33A 3S91A 4QB3A 3AADA 4YYKA 5DFDA 4QC1A 4QNSA 5A85A 5KU3A 4NR4A 4OUFA 5HRXA 4Q0NA 4O77A 5CUEA 5F2PA 3MUKA 3QZTA 5F5ZA 5EPRA 2OUOA 4PCIA 5CUAA 5D3SA 5DFBA 4YY6A 4BW2A 4CUSA 4YABA 4C66A 5LJ0A 3SVFA 5FB1A 4N4FA 5D26A 4QSXA 5KTWA 4PCEA 4AKNA 5CRMA 5I89A 4IR6A 5E7DA 1WUGA 4A9FA 5E74A 2DVSA 5E9LA 2L85A 5EK9A 4UIUA 5A82A 5F3AA 5IGNA 5FE6A 4NR8A 2R0VA 3JVMA 4HXSA 2LSPB 3AQAA 4HBVA 4IR5A 5II2A 3U5OA 4J0SA 4AI6A 3SVHA 5DBMA 2KTBB 2DVRA 5CRZA 4J3IA 4N4HA 4NUCA 2N9GA 5L8UA 5JWMA 2RO1A 5CQ6A 4Z1QA 5CFWA 5ETBA 1EQFA 4O74A 4IR4A 3U5PA 5ACYA 5F1LA 5FE4A 2F6JA 4HBYA 4QSRA 5CPEA 3UVXA 3ZYUA 4O7BA 4YAXA 5AD3A 4LZRA 3U5LA 5ENGA 3TLPA 5C8GA 5H1VA 2R0SA 5D3JA 4Z93A 2DVQA 2GRCA 5I80A 3JVJA 4XUAA 4UYEA 2DWWA 5F1HA 5H1UA 2YQDA 3UVYA 4Y03A 5E9IA 4O7EA 4OGJA 5CP5A 5CZGA 5DLXA 4WHWA 5DYUA 5IBNA 3U5NA 4WHUA 4TU4A 2OSSA 4NQNA 5CS8A 2WP1A 3P1EA 5BT5A 5CQAA 5DW1A 5I83A 3P1DA 5EVAA 4UIZA 4O72A 3ONIA 4QR3A 3LQIA 5FG5A 5K29A 5I86A 5HRWA 4LZSA 1X0JA 2L84A 5HFRA 4XY8A 2R0YA 5I40A 4YYIA 4O70A 4NYVA 5D3LA 5HFQA 4QSVA 4QUTA 5CY9A 5LJ2A 5JI8A 4HXLA 2RFJA 3U5MA 4MEOA 5F63A 5E73A 3P1FA 5G4RA 4UYDA 5EQ1A 5A81A 5IGLA 4UYFA 3LXJA 4YYHA 2FSAA 5FFVA 5FH7A 2E7OA 1E6IA 5E3DA 5CQ8A 3MULA 4QSUA 5FE0A 5L97A 5ENJA 4CUPA 2EJNA 5E0RA 4HXMA 4CUQA 5DW2A 5D3NA 3IU6A 3HMEA 4BW3A 5ENEA 5LKXA 4TT2A 5E3GA 5E9KA
chains in the Genus database with same CATH topology
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