2YW5A

Solution structure of the bromodomain from human bromodomain containing protein 3
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
GSSGSSGEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution structure of the bromodomain from human bromodomain containing protein 3
rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
total genus 37
structure length 138
sequence length 138
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2yw5A00
3IU6A 4C66A 4LYIA 5E9IA 4Z6IA 4A9JA 4MR3A 5FBXA 3SVGA 5I80A 4LZSA 4AKNA 5D3TA 1ZS5A 4A9MA 5E9LA 4UIYA 2OO1A 4CUUA 1JM4B 5FDZA 4QUTA 4A9HA 4CFLA 5EU1A 4NXJA 4A9LA 5HLSA 3LQJA 4HXPA 2KTBB 4OGJA 5FE8A 4QSRA 4KCXA 5C8GA 5FE3A 3GG3A 5HJCA 5I89A 4N4IA 4QYLA 4MR6A 3S91A 5I7YA 4QY4A 3DWYA 2RO1A 5KTWA 3K2JA 4QSTA 2H60A 5ENBA 2YYNA 3NXBA 5ETBA 4UYDA 5AD2A 2DWWA 5FH7A 4LDFA 5EWWA 4TTEA 3UVWA 3RCWA 4IR6A 5EPSA 4IOQA 2YEKA 4LZRA 4YYNA 5TB6A 5CQAA 4F3IA 5D3NA 4Z93A 4X2IA 5DLZA 5ENIA 2G4AA 4XY9A 4LYWA 2E3KA 4XYAA 4MR5A 3ONIA 5ACYA 5FE9A 4QR3A 5CQ4A 4TQNA 5A83A 3UW9A 4UIZA 4QSVA 2RNWA 3P5OA 5I1QA 4YYDA 5DW2A 4NR8A 5FE4A 5DLXA 4BHWA 4CURA 5FE1A 5KU3A 4N3WA 5LVQA 5FE0A 4LYSA 5HM0A 5L8UA 4TT4A 4CLBA 5EK9A 4HXMA 4QBMA 5D7XA 5A5PA 5FG5A 5D3LA 5HRXA 5DKDA 2OSSA 3HMHA 4MR4A 3ZYUA 3UV5A 4YADA 3SVFA 2WP1A 3AADA 5EWHA 5LJ0A 5KO4A 5CP5A 5HRWA 3SVHA 2DVVA 5CY9A 5FE7A 4C67A 5EGUA 2F6NA 4QUUA 4CUSA 5CUCA 4PY6A 5ENFA 3IU5A 4J0RA 5HQ7A 4YABA 1EQFA 5HQ6A 4GPJA 4O74A 5E9YA 4A9IA 3D7CA 4MEPA 5IG6A 5HEMA 3G0JA 5HFQA 3MB4A 5D25A 2E7OA 5CQ7A 2OUOA 2FSAA 5HFRA 2WP2A 4NYXA 5KHMA 5D26A 3P1EA 4UIVA 4NUCA 5A5RA 4LC2A 3LXJA 2GRCA 5ENHA 3U5MA 4QR4A 3S92A 4Y03A 5I86A 4YH4A 4XUAA 4TYLA 1F68A 4YY6A 5I83A 4UIXA 5C4QA 2MJVB 5CQ3A 5L98A 2YELA 5A5QA 3JVJA 2D82A 5L99A 5D3SA 5FG4A 5IIDA 5DYUA 2YDWA 4HXOA 5AMFA 4NR9A 4IR4A 5L96A 4O7CA 4YH3A 3U5NA 2DATA 5CS8A 5ENJA 5DY7A 1JSPB 4YYIA 5D3JA 5DYXA 4QSPA 5HRVA 5CRMA 5G4SA 4O75A 2E7NA 2DKWA 4NQNA 3O33A 4NQMA 5I40A 5FFVA 3I3JA 5TCMA 2I7KA 4TZ2A 5DW1A 5LJ1A 4PCIA 5D24A 4QSQA 5F1HA 5F25A 5KTUA 4IOOA 4QB3A 4ZC9A 5FG6A 4O72A 4YBMA 5CZGA 5CU8A 4O71A 3O35A 4UYGA 3QZSA 3AQAA 3TLPA 2R0YA 1WUGA 2YW5A 5DFCA 4ZQLA 5LJ2A 4PTBA 4MEOA 3MULA 5EWDA 3P1FA 4O70A 5CQ8A 5CQ5A 4BW4A 4YAXA 5IGKA 5EPBA 4UIWA 4NUDA 5CUBA 5I88A 5EP7A 5D3RA 1WUMA 5F36A 5FFWA 5IGNA 4QEUA 4A9FA 2L5EA 4QSUA 4XUBA 5E9VA 5BT3A 4OUFA 3U5OA 5CGPA 4TU6A 5D3HA 3O37A 3P1DA 5EV9A 5DYAA 4HBWA 5IGLA 1N72A 5FE5A 4PS5A 4A9OA 5DFDA 4YYGA 5HELA 2L85A 2DVSA 5K29A 5LKTA 3LQIA 4YATA 5A5OA 5DBMA 5LKXA 4NR7A 4HBXA 4J0SA 5FB1A 5E74A 3U5JA 2RNYA 2YEMA 4O7BA 3MB3A 2DVQA 4TT6A 4HBYA 4NYWA 4UIUA 2RS9B 3Q2EA 3UVYA 1E6IA 5E7DA 4DONA 4YK0A 3JVKA 5ETDA 4QYDA 4TZ8A 3UV4A 5F63A 4QC1A 5L8TA 4LRGA 4ALGA 3P1CA 4KV1A 4MEQA 5EWCA 5F61A 4TT2A 4PKLA 2D9EA 5EISA 3LJWA 3MQMA 4NR4A 4YY4A 5H1UA 5HENA 4J1PA 4QR5A 4FLPA 4NRBA 4O7AA 4CUQA 2R0VA 5DKHA 5F2PA 3MUKA 4ZW1A 5A85A 5EVAA 2R10A 4TS8A 4HXLA 4RVRA 5L97A 4A9KA 5LKUA 4IR3A 4KV4A 5CQTA 5DX4A 2LSPB 5CPEA 4WIVA 3UVXA 5IBNA 4WHUA 5II2A 4UYHA 4YYHA 4QC3A 4NYVA 5E9MA 3QZVA 2DVRA 4Z1SA 4QEWA 4QSXA 4HXKA 2F6JA 5FH8A 5EQ1A 5HQ5A 2NXBA 5H1VA 3O36A 4PCEA 5COIA 4YBSA 3HMFA 4HXNA 4BW2A 5F1LA 4BW1A 3UV2A 4UITA 5EI4A 4O77A 4QSSA 5AMEA 3JVLA 4TU4A 5A5NA 5LVRA 4UYFA 5DYCA 4YYJA 4IORA 5EA1A 5F5ZA 3U5PA 5FE6A 5ENEA 2L84A 5E9KA 4WHWA 5A82A 4NS5A 4YYMA 4Z6HA 2RFJA 5ENGA 4J3IA 5FE2A 5CRZA 5C85A 4QSWA 5AD3A 5EICA 4UYFB 4Z1QA 3JVMA 5F60A 5JWMA 4HXRA 2N9GA 4A9NA 4QZSA 5CUDA 4BW3A 1X0JA 4QEVA 4O7EA 4NUEA 4O76A 5II1A 4NRCA 5D3PA 5FB0A 4MENA 4CFKA 5J0DA 5FH6A 4N4HA 5CTLA 4CUPA 4NR5A 5CQ6A 4OGIA 4UYEA 4YC9A 5F3AA 5ENCA 5IGMA 5H85A 5G4RA 4NR6A 4BJXA 5DKCA 4HXSA 2RNXA 4ALHA 5E73A 4YBTA 5EM3A 3HMEA 5A5SA 3U5KA 5CUAA 4O7FA 5DFBA 4HBVA 4YYKA 5EPRA 5HCLA 5LKZA 2R0SA 5H1TA 5FFYA 5E0RA 4Q0OA 4XY8A 4LZ2A 3G0LA 3MXFA 4CUTA 5I29A 5C87A 4N4GA 5BT4A 3QZTA 5CUGA 5BT5A 4O78A 3FKMX 5A81A 4N4FA 4QNSA 2RI7A 4Q0NA 3DAIA 3U5LA 4CL9A 4IR5A 5E3DA 5EWVA 3UVDA 5F62A 2I8NA 3LQHA 5CFWA 5D0CA 5CUEA 5JI8A 3Q2FA 4NRAA 5LUUA 5KTXA 2YQDA 4LR6A 5E3GA 5A7CA 4A9EA 5C7NA 4E96A 5C89A 3O34A 5I7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZKRA 3IU6A 4C66A 4LYIA 5E9IA 4Z6IA 4A9JA 4MR3A 3D1DA 5FBXA 3SVGA 5I80A 4LZSA 4AKNA 5D3TA 1ZS5A 4A9MA 5E9LA 4UIYA 2OO1A 4CUUA 1JM4B 5FDZA 4QUTA 4A9HA 4CFLA 5EU1A 4NXJA 4A9LA 5HLSA 3LQJA 4HXPA 2KTBB 4OGJA 5FE8A 4QSRA 4KCXA 5C8GA 5FE3A 3GG3A 5HJCA 5I89A 4N4IA 4QYLA 4MR6A 3S91A 5I7YA 1PUOA 4QY4A 4AI6A 3DWYA 2RO1A 5KTWA 3K2JA 4QSTA 2H60A 5ENBA 2YYNA 3NXBA 5ETBA 4AKIA 4UYDA 5AD2A 2DWWA 5FH7A 3VKHA 4LDFA 5EWWA 4TTEA 3UVWA 3RCWA 4IR6A 5EPSA 4IOQA 2YEKA 4LZRA 4YYNA 5TB6A 5CQAA 4F3IA 5D3NA 4Z93A 4X2IA 5DLZA 5ENIA 2G4AA 4XY9A 4LYWA 2E3KA 4XYAA 3D1BA 3ONIA 4MR5A 5ACYA 5FE9A 4QR3A 5CQ4A 4TQNA 5A83A 3UW9A 4UIZA 4QSVA 2RNWA 3P5OA 5I1QA 4YYDA 5DW2A 4NR8A 5FE4A 5DLXA 4BHWA 4CURA 5FE1A 5KU3A 4N3WA 5LVQA 2EJNA 5FE0A 4LYSA 5HM0A 5L8UA 4TT4A 4CLBA 5EK9A 4HXMA 4QBMA 5D7XA 5A5PA 5FG5A 5D3LA 5HRXA 5DKDA 2OSSA 3HMHA 4MR4A 3ZYUA 3UV5A 4YADA 3SVFA 2WP1A 3AADA 5EWHA 5LJ0A 5KO4A 5CP5A 5HRWA 3SVHA 2DVVA 5CY9A 5FE7A 4C67A 5EGUA 2F6NA 4QUUA 4CUSA 5CUCA 4PY6A 5ENFA 3IU5A 4J0RA 5HQ7A 4YABA 1EQFA 5HQ6A 4GPJA 4O74A 5E9YA 4A9IA 3D7CA 4MEPA 5IG6A 5HEMA 3G0JA 5HFQA 3MB4A 5D25A 2E7OA 5CQ7A 2OUOA 2FSAA 5HFRA 2WP2A 4NYXA 5KHMA 5D26A 3P1EA 4UIVA 4NUCA 5A5RA 4LC2A 3LXJA 2GRCA 5ENHA 3U5MA 4QR4A 3S92A 4Y03A 5I86A 3VKGA 4YH4A 4XUAA 4TYLA 1F68A 4YY6A 5I83A 4UIXA 5C4QA 2MJVB 5CQ3A 5L98A 2YELA 5A5QA 3JVJA 2D82A 5L99A 5D3SA 5FG4A 5IIDA 5DYUA 2YDWA 4HXOA 5AMFA 4NR9A 4IR4A 5L96A 4O7CA 4YH3A 3U5NA 2DATA 5CS8A 5ENJA 5DY7A 1JSPB 4YYIA 5D3JA 5DYXA 4QSPA 5HRVA 5CRMA 5G4SA 4O75A 2E7NA 2DKWA 4NQNA 3O33A 4NQMA 5I40A 5FFVA 3I3JA 5TCMA 2I7KA 4TZ2A 5DW1A 5LJ1A 4PCIA 5D24A 4QSQA 5F1HA 5F25A 5KTUA 4IOOA 4QB3A 4ZC9A 5FG6A 4O72A 4YBMA 5CZGA 5CU8A 4O71A 3O35A 4UYGA 3QZSA 3AQAA 3TLPA 2R0YA 1WUGA 2YW5A 5DFCA 4ZQLA 5LJ2A 4PTBA 4MEOA 3MULA 5EWDA 3P1FA 4O70A 5CQ8A 5CQ5A 4BW4A 4YAXA 5IGKA 5EPBA 4UIWA 4NUDA 5CUBA 5I88A 5EP7A 5D3RA 1WUMA 5F36A 5FFWA 5IGNA 4QEUA 4A9FA 2L5EA 4QSUA 4XUBA 5E9VA 5BT3A 4OUFA 3U5OA 5CGPA 4TU6A 5D3HA 3O37A 3P1DA 5EV9A 5DYAA 4HBWA 5IGLA 1N72A 5FE5A 4PS5A 4A9OA 5DFDA 4YYGA 5HELA 2L85A 2DVSA 5K29A 5LKTA 3LQIA 4YATA 5A5OA 5DBMA 5LKXA 4NR7A 4HBXA 4J0SA 5FB1A 5E74A 3U5JA 2RNYA 2YEMA 4O7BA 3MB3A 2DVQA 4TT6A 4HBYA 4NYWA 4UIUA 2RS9B 3Q2EA 3UVYA 1E6IA 5E7DA 4DONA 4YK0A 3JVKA 5ETDA 4QYDA 4TZ8A 3UV4A 5F63A 4QC1A 5L8TA 4LRGA 4ALGA 3P1CA 4KV1A 4MEQA 5EWCA 5F61A 4TT2A 4PKLA 2D9EA 5EISA 3LJWA 3MQMA 4NR4A 4YY4A 5H1UA 5HENA 4J1PA 4QR5A 4FLPA 4NRBA 4O7AA 4CUQA 2R0VA 5DKHA 5F2PA 3MUKA 4ZW1A 5A85A 5EVAA 2R10A 4TS8A 4HXLA 4RVRA 5L97A 4A9KA 5LKUA 4IR3A 4KV4A 5CQTA 5DX4A 3ERRA 2LSPB 5CPEA 4WIVA 3UVXA 5IBNA 4WHUA 5II2A 4UYHA 4YYHA 4QC3A 4NYVA 5E9MA 3QZVA 2DVRA 4Z1SA 4QEWA 4QSXA 4HXKA 2F6JA 5FH8A 5EQ1A 5HQ5A 2NXBA 5H1VA 3O36A 4PCEA 5COIA 4YBSA 3HMFA 4HXNA 4BW2A 5F1LA 4BW1A 3UV2A 4UITA 5EI4A 4O77A 4QSSA 5AMEA 3JVLA 4TU4A 5A5NA 5LVRA 4UYFA 5DYCA 4YYJA 4IORA 5EA1A 5F5ZA 3U5PA 5FE6A 5ENEA 2L84A 5E9KA 4WHWA 5A82A 4NS5A 4YYMA 4Z6HA 2RFJA 5ENGA 4J3IA 5FE2A 5CRZA 5C85A 4QSWA 5AD3A 5EICA 4UYFB 4Z1QA 3JVMA 5F60A 5JWMA 4HXRA 2N9GA 4A9NA 4QZSA 5CUDA 4BW3A 1X0JA 4QEVA 4O7EA 4NUEA 4O76A 5II1A 4NRCA 5D3PA 4AKGA 5FB0A 4MENA 4CFKA 5J0DA 5FH6A 4N4HA 5CTLA 4CUPA 4NR5A 5CQ6A 4OGIA 4UYEA 4YC9A 5F3AA 5ENCA 5IGMA 5H85A 5G4RA 4NR6A 4BJXA 5DKCA 4HXSA 2RNXA 4ALHA 5E73A 4YBTA 5EM3A 3HMEA 5A5SA 3U5KA 5CUAA 4O7FA 5DFBA 4HBVA 4YYKA 5EPRA 5HCLA 5LKZA 2R0SA 5H1TA 5FFYA 5E0RA 4Q0OA 4XY8A 4LZ2A 3G0LA 3MXFA 4CUTA 4AKHA 5I29A 5C87A 4N4GA 5BT4A 3QZTA 5CUGA 5BT5A 4O78A 3FKMX 5A81A 4N4FA 4QNSA 2RI7A 4Q0NA 3DAIA 3U5LA 4CL9A 4IR5A 5E3DA 5EWVA 3UVDA 5F62A 2I8NA 3LQHA 5CFWA 5D0CA 5CUEA 5JI8A 3Q2FA 4NRAA 5LUUA 5KTXA 2YQDA 4LR6A 5E3GA 5A7CA 4A9EA 5C7NA 4E96A 5C89A 3O34A 5I7XA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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