4NS5A

Crystal structure of human bs69 bromo-zinc finger-pwwp
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
185
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKEVDVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGADSEQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNIHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
publication title Crystal structure of human BS69 Bromo-ZnF-PWWP reveals its role in H3K36me3 nucleosome binding.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription regulator
total genus 66
structure length 185
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ns5A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4ns5A02
1SSFA 4X2IA 4MEPA 3OYIA 5D3JA 3UVDA 5HQ7A 5E9IA 5COIA 5ACYA 3SVFA 2VYTA 4O7EA 5D3PA 5A82A 4HXLA 3BDLA 3L2VA 5HJCA 4FL6A 3HMHA 4QSXA 5FFYA 5ENGA 5C8GA 4HBVA 4UYDA 3Q2FA 5I80A 3U5JA 2DAQA 2LRQA 4QEWA 4TYLA 5EK9A 2R5MA 4LYIA 1X0JA 5F5ZA 4A9MA 4KCXA 4PCIA 5DFBA 2WACA 2I8NA 3O33A 2HQXA 2IG0A 3LGFA 5DFDA 4KV4A 5F25A 2G3RA 3P1CA 5J0DA 4MENA 2X35A 4TU4A 4F3IA 4ZQLA 3MQMA 4XYAA 5FE3A 5JI8A 3QKJA 1G5VA 4UYFB 4WIVA 4YYNA 5M9OA 1RI0A 4BE0A 5FBXA 5FDZA 4IURA 5E9YA 4ZW1A 4BACA 4A9NA 4IR5A 5EWWA 2GFAA 5J26A 4Z6IA 3E9FA 2R5AA 5L97A 4N3WA 4Y03A 5C0MA 2RJDA 4CRIA 2GF7A 3L2UA 5LVRA 1EQFA 2O4XB 4PL6A 4RVRA 2GRCA 4QSUA 5D3LA 5HRVA 4A4GA 5D25A 4TU6A 3QJ6A 5CGPA 4IUVA 3L2QA 4UYGA 5CQ5A 5E74A 5J39A 4QEVA 4ALHA 2QQRA 3CEYA 5LKUA 5F36A 5I83A 3OY9A 3U5KA 3ASKA 3I3JA 4MR5A 3OYDA 2F6JA 2E7NA 2RS9B 4YYMA 4ZC9A 3OS0A 5D3TA 2M16A 5EM3A 2E7OA 5D6YA 5IBNA 4J3IA 5KTWA 5LJ2A 3LX7A 3OA6A 4HXSA 3DB3A 5TB6A 5F63A 5BT5A 2LVMA 3F70A 3SVHA 3LQIA 5CP5A 4LYSA 5CUDA 3UWNA 4MR4A 4O76A 5EQ1A 2OUOA 5AMEA 3UVYA 2I7KA 5CPEA 2PQWA 2RO1A 4YAXA 5L8TA 4CUSA 3RCWA 2RHYA 4C66A 5I7YA 4B9XA 4TTEA 5CTLA 5KO4A 5EPBA 2RHXA 5DYAA 4PS5A 4NR6A 4PKLA 4QR5A 3OYKA 2NLUA 2E3KA 5LKXA 5LJ0A 4L59A 3O36A 5ENIA 5IGNA 3OYAA 4UYHA 5D7XA 4QQ6A 5II1A 3U5LA 4XUBA 5FFVA 2DVVA 4FLPA 4GPJA 3S91A 4A9HA 5IIDA 4A4EA 4EDUA 5KE2A 5F2PA 3OS1A 5FRNA 4UIVA 4A4FA 5FG6A 5FB0A 2DVQA 4YY6A 4PCEA 5EPRA 5C4QA 4IR4A 5F1HA 3HMFA 3OS2A 4QQGA 4QYLA 3G0JA 5CQ7A 2RHZA 2L84A 2YEKA 4NYVA 4QSQA 4YYIA 5KTXA 4IUUA 4CURA 4NS5A 3PMTA 5KH6A 5LKTA 3NTHA 2E6NA 5E9MA 3MEVA 3OYHA 5L99A 4J0RA 3LH0A 2F6NA 5D26A 5HQ5A 5AD2A 4QEUA 5CUGA 5EWCA 5FE5A 5CUEA 3MUKA 4Q5WA 3OYGA 3O35A 5HLSA 4OGJA 3FDRA 4AKNA 5CQ8A 4A9KA 2YRVA 3ZEHA 4WHWA 4YK0A 3DAIA 5ENFA 5KTUA 3PFSA 3L42A 4NQNA 4C5IA 2CKKA 2R0YA 4YADA 5EU1A 3MEAA 5TCMA 3PMIA 2N9GA 5CZGA 5KE3A 4QNSA 1WJSA 3ZYUA 5CRMA 5K29A 4A4HA 4UIUA 2X4YA 5DLXA 4HXMA 3IU6A 5JWMA 3MP8A 2RNWA 4PLIA 4CFLA 4NYXA 5HFRA 4LZ2A 4II1A 5FB1A 4C67A 3MO8A 5DW1A 4Z6HA 5C89A 1JM4B 4A9LA 2XDPA 3META 5C6SA 5C87A 5IGLA 2R58A 3DLMA 4IUQA 3S3NA 4N4IA 3UV2A 5DX4A 2GFUA 2LDMA 3S3MA 5L98A 3OYLA 3M9QA 4IR6A 2WP1A 4N4HA 2RI7A 3JVJA 5CY9A 2XK0A 3JVLA 5CQAA 2EFIA 4E7JA 3SD4A 5FRMA 2X4WA 3H8ZA 4O71A 4B9WA 2BKDN 5G4SA 5L96A 4NR5A 2OO1A 4E7KA 4LYWA 4Z02A 5CQ4A 3L2RA 4BDYA 4LZRA 4NQMA 4MEOA 3OYJA 1JSPB 4IKFA 4HBWA 4BW4A 1OI1A 4HXOA 3TLPA 3S6WA 5FE1A 5FG5A 4BW1A 3P8DA 3K2JA 4ALGA 2LCCA 3GG3A 5I40A 3HMEA 4NUCA 3MP1A 5BT4A 5FE0A 5A5QA 2D9EA 4TT4A 5CIUA 5HELA 4O75A 4TQNA 2L3RA 4BE1A 3P8HA 1WJQA 3PNWC 1KHCA 2DIGA 4NXJA 5LJ1A 4YABA 3MB4A 5G4RA 5FE8A 4QUUA 2X4XA 2L5EA 5CQ6A 4HBXA 5D3RA 1XNIA 3OYBA 5HENA 5HCLA 4RG2A 5CS8A 3OMGA 5A85A 5DKHA 5E9KA 5EWHA 4YYHA 5FE2A 2G4AA 1MHNA 4A9FA 5HEMA 4BDZA 4OUFA 4QC3A 5A5SA 3JVKA 2EQJA 4IUTA 5DYUA 4QB3A 3UVXA 5CRZA 4HXRA 4O74A 5CQ3A 4YBMA 2LSPB 3NTKA 4UYFA 4A9JA 4E7LA 4QZSA 3O37A 3QBYA 4QSWA 4QSPA 5D3SA 2YELA 5IAYA 5DYCA 1E6IA 4UIYA 2E5QA 3Q1JA 4O7BA 5ETBA 4O7FA 4YYGA 4NUDA 4TZ8A 2RI5A 4LDFA 4O70A 5EISA 2DVSA 3LQHA 4GY5A 2RFJA 4BJXA 2EQKA 3UW9A 2O4XA 5A83A 4CL9A 4YY4A 5F60A 4NR4A 5HRWA 4YH4A 5EVAA 2R57A 4CUPA 4QSTA 5D0CA 5CFWA 5FG4A 4YYJA 5D3HA 1WGSA 1WJRA 2MWOA 4ZTFA 3OYMA 4CUTA 5H1TA 5EWDA 1N72A 2YYNA 4UC4A 3LJWA 4NYWA 4QSRA 4QQDA 4YC9A 5FE4A 5D6XA 3U5MA 4DONA 5FH7A 2RO0A 2R10A 5HM0A 2EQMA 4O7AA 3NTIA 5H85A 5DKDA 5CUBA 5CQTA 4PTBA 5CUCA 3OQ5A 2RNYA 5AMFA 4NR9A 2D9TA 4QSVA 2FSAA 5IG6A 3MEWA 4QYDA 4LC2A 5LKZA 2R0VA 4QC1A 2M0OA 4A9IA 1F68A 4UIWA 5ENHA 5E9LA 4Q0NA 2BUDA 5E7DA 3MEUA 1OYXA 4NRBA 3OB9A 5FE7A 2HQEA 2NXBA 1ZS5A 2R0SA 4HBYA 3MP6A 4OGIA 4UIXA 3O34A 4YYDA 2DIQA 5DY7A 3DB4A 2F5KA 5DLZA 2B8AA 3OYFA 3AQAA 3OMCA 4QSSA 4Z1SA 3U5OA 2LTOA 3MXFA 5LUUA 4Z1QA 5F1LA 3P5OA 4J1PA 4O7CA 4LD6A 3FC3A 4E7IA 2RI3A 5I29A 4HXNA 4QR3A 5D24A 3MULA 5A7CA 3S3OA 3ONIA 4Z93A 4Q0OA 3QZTA 2QQSA 2L8DA 2MWPA 5KU3A 3H6ZA 4XUAA 3FLGA 5A5PA 5AD3A 3D7CA 4NUEA 4YBTA 5E73A 5DFCA 4O77A 2D82A 2KTBB 4BW3A 5I88A 5HQ6A 5BT3A 5E3DA 4HXPA 5F61A 4YYKA 5IGKA 3UT1A 3O8VA 1OZ2A 4E96A 5KHMA 5HFQA 3QIIA 4QR4A 4O78A 2RJFA 4YH3A 3S92A 5A5NA 5F62A 2EKOA 4HXKA 4FU6A 4CFKA 4C5GA 5KCHA 4QY4A 5EV9A 2OSSA 5D6WA 5DYXA 2K3XA 2RJCA 4E7HA 4MEQA 4PY6A 4PLLA 4HCZA 2MJVB 4YBSA 4CUUA 2DKWA 1OZ3A 5A5OA 1N27A 5H1UA 5I86A 3U5NA 3ME9A 3OYEA 4LR6A 4IOQA 3QZVA 5IGMA 4QVZA 4LZSA 2RJEA 3C4SA 4TZ2A 1WUGA 3KUFA 2H60A 4KV1A 4J0SA 4XY8A 2P0KA 2RHIA 4LRGA 2JZ2A 3NXBA 3P1FA 5EICA 4BD3A 3MB3A 5ENCA 4IUPA 2EQUA 3LLRA 5H1VA 2DWWA 4N4FA 5CU8A 5II2A 2RNXA 4QW2A 4ZTJA 4A9OA 4UITA 5ETDA 3DWYA 3L2WA 3LGLA 3UV4A 3IU5A 5A81A 3P1DA 5DKCA 5FE6A 4BHWA 4NR8A 5A5RA 2L89A 4O72A 3UV5A 5E3GA 2YDWA 2M1HA 4UIZA 5ENEA 2YEMA 3Q2EA 4IOOA 5E9VA 2RI2A 3LYIA 4C5HA 4N4GA 4YATA 5I7XA 2YQDA 5EI4A 3U5PA 5L8UA 5CUAA 2FHDA 5F3AA 5I89A 4TT6A 4TT2A 3P1EA 4NR7A 3JVMA 5I1QA 2DVRA 4BW2A 5FE9A 5EP7A 1WUMA 4WHUA 2BIVA 5ENJA 5ENBA 5LVQA 4C5EA 5D3NA 5EA1A 5KCOA 3G0LA 4XY9A 5FH6A 4BE2A 3AADA 2JTFA 4MR6A 2RHUA 3QZSA 5IN1A 3FKMX 4OVAA 4TS8A 4NRAA 4CUQA 4IR3A 5EPSA 3E9GA 1H3ZA 2YW5A 5C85A 4X34A 5E0RA 4CLBA 4MR3A 5FH8A 4IORA 4QUTA 5C7NA 2WP2A 5EWVA 4NRCA 5FFWA 4A9EA 5DBMA 5FROA 3OYNA 3LQJA 5DW2A 2DATA 4QBMA 3SVGA 3UVWA 3OYCA 3GOXA 5HRXA 2L85A 2K3YA 4UYEA 3FEOA 3LXJA 5EGUA 3EAEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ABQA 4X2IA 1SSFA 1W4SA 5ECAA 2G6FX 5D3JA 2A0FB 2O2OA 5COIA 2OTJQ 4O7EA 1N8RU 2HZYA 3L2VA 3WVEB 2QK0A 5HJCA 2RF0A 1UGQB 2EIFA 2KBTA 3Q2FA 2LRQA 3EFSA 3I35A 1ZUKA 4LYIA 5F5ZA 4KCXA 4PCIA 3CC2A 5GAN2 1SF9A 2IG0A 2LCSA 2KVQG 5F25A 3P1CA 2P0QA 4MENA 2K2MA 5FE3A 5JI8A 1NEGA 3NHNA 3JCMP 2ATCB 2L0AA 5A0GA 1VQ6Q 1SEMA 2AK5A 4IURA 4M78F 3ZFJA 5DM7R 3M57A 3X24B 2QTVA 3E9FA 5L97A 2ZCFB 5L23A 5C0MA 1RAFB 3RBBB 4CRIA 2GF7A 5LVRA 1EQFA 3CCEA 5D3LA 4A4GA 3UA7A 5GMKm 3QJ6A 1VQKT 1LJOA 5E74A 1YI2Q 5J39A 5HY6A 1N5ZA 4PFZA 5LKUA 5I83A 3OY9A 5GMKl 2PNIA 2WSCE 4C92C 4WTOB 1M2VA 1PCXA 4M77E 2BZYA 5KTWA 5LJ2A 3LX7A 3DB3A 5F63A 5BT5A 2DVJA 2LVMA 3LQIA 2YXYA 3UWNA 2CUDA 5EQ1A 5AMEA 2MYSA 1VQ9T 3V8KA 5CR2A 4YAXA 4HVWA 3KBGA 1RL2A 4CUSA 3A5ZB 3EG3A 1RAGB 4B9XA 1SHFA 4XTUA 1OPKA 2RHXA 4PKLA 3OYKA 2DFUA 5LKXA 1X69A 2CP0A 2J6KA 2LNHB 1FWZA 4UYHA 3T9NA 1VYVA 5II1A 3R6NA 2QEXA 3U5LA 5I2SA 2DVVA 4FLPA 5GAOm 4EDUA 1VQ5Q 5F2PA 4UIVA 1ZUYA 1KC8U 1KIKA 3M59A 4PJOG 5GAOl 1HXDA 3HMFA 3VS6A 3PIPA 1V1CA 1M90U 3QZ5B 3PMTA 5KH6A 5LKTA 2FPDA 2SRCA 5L99A 2RK1A 5D26A 1LVKA 4JRKA 5CUEA 2DYIA 4HVUA 2DEUA 1AWOA 4Q5WA 3OYGA 3O35A 9ATCB 5HLSA 4OGJA 1G8XA 4CC3A 2QEXQ 5KTUA 5ENFA 2EGAA 4C8QE 1RI9A 1M1FA 3L42A 5EU1A 3RR6A 3PMIA 1WJSA 5CRMA 2KE9A 1VQPA 3IU6A 2GBQA 1VQMT 4KUDK 1JBMA 5HFRA 5FB1A 1H8KA 4C67A 4AKIA 3MO8A 5DW1A 4Z6HA 5C89A 1SKUB 1AD5A 1WHLA 1CSKA 1QVFA 4M4ZA 2KMTA 5C87A 1IRXA 2R58A 4IUQA 3OSSC 4PNOA 3I55T 3OYLA 2W0ZA 1VQ8Q 2WP1A 1VQLQ 1NE8A 5CY9A 3JVJA 4JPBW 3QHSA 3JVLA 1TTHB 2EFIA 2W10A 3SD4A 3CCUQ 3PVQA 4B9WA 3CXCA 4LDVA 2DF6A 2NWMA 3H41A 1SRLA 4JLGA 1O9SA 1V29B 2P4TA 2A37A 3EGUA 3S6WA 2HAXA 5FG5A 3CCMA 2D6FA 2LCCA 2M0YA 3IQLA 2IVWA 3HMEA 5IXFA 3J81E 1R0CB 4AKHA 1TU0B 2DJZA 1AEYA 3PGGA 4OMFB 4C92F 4O75A 3CBOA 1X2QA 1YJ9Q 4M78E 1MNEA 2CYZB 2HBWA 3PNWC 4NXJA 4OB1B 4YABA 3V7RA 2HCKA 1OOTA 3OSVA 4QUUA 2X4XA 2L5EA 2FL7A 1WXTA 2QQAA 2L2PA 5A85A 5EWHA 3GIBA 4EMGA 2G4AA 1VQNQ 4A9FA 1X75C 4OMOA 1QKXA 4OUFA 4QC3A 2E41A 1VQ7T 1N6AA 2EQJA 1HSQA 2D0QB 3CD6T 4IUTA 4QB3A 2ROLA 1E7OA 1CKAA 3I9QA 3JCMX 4O74A 5CQ3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5IN1 A;  3FKM X;  4OVA A;  4TS8 A;  4NRA A;  4CUQ A;  4IR3 A;  5EPS A;  3E9G A;  1H3Z A;  2YW5 A;  5C85 A;  4X34 A;  5E0R A;  4CLB A;  4MR3 A;  5FH8 A;  4IOR A;  4QUT A;  5C7N A;  2WP2 A;  5EWV A;  4NRC A;  5FFW A;  4A9E A;  5DBM A;  5FRO A;  3OYN A;  3LQJ A;  5DW2 A;  2DAT A;  4QBM A;  3SVG A;  3UVW A;  3OYC A;  3GOX A;  5HRX A;  2L85 A;  2K3Y A;  4UYE A;  3FEO A;  3LXJ A;  5EGU A;  3EAE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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