4LYSA

Crystal structure of brd4(1) bound to colchiceine
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl pyrroles: mimicking acetylated lysines in histone code reading.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4lysA01
5D3PA 4NRBA 4LYIA 4HBWA 4ZC9A 4UIUA 5KTXA 3O34A 4Z1QA 5FB0A 4QBMA 4CUTA 5BT3A 4RVRA 4TT4A 4ALGA 4XY9A 4ZW1A 5EGUA 5HCLA 5BT5A 3MB4A 5ACYA 4TQNA 5E74A 2RI7A 1WUGA 4A9MA 5E0RA 5CQ7A 4J1PA 4N4GA 4A9NA 5C4QA 3DAIA 5COIA 4MEPA 5H1UA 5IGMA 5EP7A 2YYNA 2F6NA 5TCMA 5EPSA 5D3RA 5LKUA 3QZTA 4YATA 5JI8A 5DY7A 4Z93A 4J0RA 4HXKA 4NQNA 4HXSA 4CFKA 3FKMX 5D3NA 1ZS5A 4O7BA 5DKCA 3UV4A 5G4RA 5AD3A 4CUQA 5L8UA 4YYHA 3QZSA 5CQ4A 5D25A 4QR3A 2RO1A 4NRCA 2YEMA 5DKHA 5K29A 4PS5A 4YYIA 5H1TA 2DVQA 4TS8A 5FE7A 4J3IA 4QYDA 4YYKA 4A9LA 4BHWA 5DYCA 5IGLA 5F25A 4QEWA 5EQ1A 4MR5A 4TT2A 4N4IA 5D7XA 4QY4A 5A5RA 5EWHA 3AADA 5FE3A 4HXOA 4NUDA 5DYUA 5F1HA 4O7AA 4QB3A 4PKLA 3LXJA 4QSXA 4UYDA 5LVQA 1JSPB 3O33A 5CZGA 4BW1A 4QSTA 4HXRA 5F36A 4Z6HA 4UYHA 5A5OA 1X0JA 3U5PA 5E9IA 5CUBA 5KO4A 5HRWA 4ZQLA 4IR3A 4N4HA 5A81A 3TLPA 4MENA 5HQ5A 4QEUA 3U5MA 5CRMA 4N3WA 3IU6A 4YBSA 4Q0NA 5CQ8A 4YK0A 5CUAA 5FE9A 2G4AA 5I89A 3HMEA 4Q0OA 4UIYA 4NRAA 5DW1A 5HLSA 2RNYA 4QZSA 4LR6A 4XUBA 5CGPA 4YY6A 5F60A 4KV1A 5DX4A 3G0JA 5A82A 4OGJA 5LKXA 2RNWA 3U5KA 5FFYA 5DFDA 4X2IA 5HFQA 5ENGA 4HXMA 5CPEA 4NXJA 5FG4A 3O35A 2R0VA 3SVFA 5BT4A 4TU4A 5FDZA 5DFBA 4QEVA 5A5PA 5JWMA 4XUAA 5E9YA 2I7KA 4AKNA 2R0YA 4NR6A 5CS8A 4LZRA 5F3AA 5I86A 4NR5A 4O74A 4DONA 5A5SA 5A83A 5EICA 5KU3A 4HXNA 4QUTA 4A9JA 5I40A 3GG3A 5A7CA 4CURA 4A9EA 2YQDA 3UVWA 5II1A 5TB6A 5CQAA 4IR5A 3LQHA 4Y03A 3QZVA 5HELA 5KHMA 5AMFA 4QC3A 5HENA 1F68A 5HQ7A 5E3DA 5I29A 5FBXA 2F6JA 4O7FA 5CUCA 4YYDA 5H85A 4PCEA 4QSWA 5L99A 3UVYA 5HJCA 5L97A 4QSVA 5C85A 2KTBB 4NQMA 5EPBA 4CLBA 2RS9B 5FE2A 4QC1A 4ALHA 5D3TA 3K2JA 5LUUA 4NUCA 5FFVA 4YC9A 5EWDA 5A85A 4LYWA 5ETBA 5IIDA 4QR4A 5ENBA 5I7XA 5A5NA 5D26A 2D82A 5CQ5A 2DATA 5DYAA 3Q2FA 4NYVA 4NYXA 2GRCA 5F5ZA 3SVGA 5CFWA 2OSSA 4HBXA 3MB3A 4UITA 2L5EA 2DVSA 4YYMA 4BW4A 5D3SA 5L96A 5CUDA 4QYLA 4A9OA 4A9HA 4CFLA 5EI4A 2OUOA 5LJ1A 5CQ6A 4TT6A 5KTWA 5CTLA 5F63A 5CRZA 1JM4B 5F1LA 5D24A 5ENIA 4NYWA 3ZYUA 3JVJA 4O71A 2DKWA 5IG6A 4UIWA 5CU8A 4QNSA 4QSQA 2D9EA 5G4SA 5FE6A 4O7CA 4HBYA 5EV9A 4A9KA 5EWCA 5DLZA 5EISA 3NXBA 4YADA 5IBNA 4HBVA 3LQJA 4TZ8A 5FG6A 2MJVB 4O75A 5ENFA 4HXPA 4NS5A 4YYJA 5DBMA 4OUFA 5I83A 5J0DA 5ENCA 3P5OA 3JVKA 4TTEA 4LDFA 4HXLA 2OO1A 2R0SA 5CQTA 5FH8A 3O37A 5L98A 5LVRA 4LRGA 4MR4A 4PY6A 5AD2A 3U5NA 3U5OA 3MXFA 5EA1A 5FE4A 5EWVA 4Z1SA 4YBTA 2E3KA 4TU6A 3G0LA 4WHWA 4UYGA 4YH3A 5KTUA 4F3IA 2YELA 2WP2A 5AMEA 3S91A 4C67A 4BJXA 2I8NA 4O78A 5I80A 5LJ0A 4O7EA 4MR6A 5EWWA 5C8GA 2L84A 5D3LA 5FFWA 3UV5A 3HMHA 3UW9A 3MULA 4IORA 2N9GA 5E73A 5FE0A 4QSUA 5CUGA 2LSPB 4O76A 5C89A 5E9MA 5ENJA 4J0SA 2E7OA 5FH6A 3U5LA 5HEMA 4NR9A 5LKZA 5DYXA 5EPRA 2NXBA 3UVDA 4QUUA 4LC2A 1E6IA 5C7NA 4FLPA 3ONIA 5DLXA 4IR6A 4YAXA 4Z6IA 5EM3A 4YBMA 5LJ2A 3LJWA 4NR4A 4BW3A 5F62A 3U5JA 1N72A 5FG5A 3UVXA 3HMFA 5FB1A 2R10A 5EU1A 4A9FA 3P1FA 3I3JA 4TYLA 2YEKA 4KCXA 2L85A 3IU5A 4MR3A 4UYFB 5E9KA 4CUUA 5IGKA 5I88A 4LYSA 4YYGA 4LZ2A 5DKDA 3O36A 4QSSA 2DVRA 4PCIA 5ETDA 2E7NA 4O77A 4UYEA 4GPJA 4IOOA 5DW2A 4MEQA 4C66A 5D0CA 4LZSA 2YDWA 5HRVA 4YYNA 3S92A 5EVAA 2DVVA 3P1EA 1EQFA 3RCWA 5E7DA 3MQMA 4UIXA 4IOQA 5D3JA 5I7YA 5F2PA 4UYFA 2DWWA 4IR4A 2RNXA 5L8TA 5I1QA 4YABA 5A5QA 5II2A 5CUEA 5D3HA 4QR5A 3JVLA 4O70A 4KV4A 4NR8A 2H60A 5HQ6A 5CP5A 5HRXA 4YY4A 4YH4A 2FSAA 4TZ2A 4WHUA 4A9IA 2WP1A 5DFCA 4CUPA 4BW2A 5C87A 4NUEA 3LQIA 4CL9A 4O72A 3DWYA 4UIZA 4E96A 5E9VA 3Q2EA 5HM0A 4XYAA 1WUMA 5FH7A 4CUSA 3JVMA 4OGIA 5FE8A 4QSRA 4NR7A 4WIVA 4PTBA 4N4FA 5LKTA 3P1CA 5CQ3A 4QSPA 5H1VA 4UIVA 5HFRA 5EK9A 5FE1A 4XY8A 5E3GA 3SVHA 2RFJA 4MEOA 3P1DA 5ENHA 5IGNA 5FE5A 3D7CA 5CY9A 2YW5A 3AQAA 3MUKA 5ENEA 5F61A 5E9LA 3UV2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D3PA 4NRBA 4LYIA 4HBWA 4ZC9A 4UIUA 2EJNA 5KTXA 3O34A 4Z1QA 5FB0A 4QBMA 4CUTA 5BT3A 4RVRA 4TT4A 4ALGA 4XY9A 4ZW1A 5EGUA 5HCLA 5BT5A 3MB4A 5ACYA 4TQNA 5E74A 2RI7A 1WUGA 4A9MA 5E0RA 5CQ7A 4J1PA 4N4GA 4A9NA 5C4QA 3DAIA 5COIA 4MEPA 5H1UA 5IGMA 5EP7A 2YYNA 2F6NA 5TCMA 5EPSA 3ERRA 5D3RA 5LKUA 3QZTA 4YATA 5JI8A 5DY7A 4Z93A 4J0RA 4HXKA 4NQNA 4HXSA 4CFKA 3FKMX 5D3NA 1ZS5A 4O7BA 5DKCA 3UV4A 5G4RA 5AD3A 4CUQA 5L8UA 4YYHA 3QZSA 5CQ4A 5D25A 4QR3A 2RO1A 4NRCA 2YEMA 5DKHA 5K29A 4PS5A 4YYIA 5H1TA 2DVQA 4TS8A 5FE7A 4J3IA 4QYDA 4YYKA 4A9LA 4BHWA 5DYCA 5IGLA 5F25A 4QEWA 5EQ1A 4MR5A 4TT2A 4N4IA 5D7XA 4QY4A 5A5RA 5EWHA 3AADA 5FE3A 4HXOA 4NUDA 5DYUA 5F1HA 4O7AA 4QB3A 4PKLA 3LXJA 4QSXA 4UYDA 5LVQA 1JSPB 3O33A 5CZGA 4BW1A 4QSTA 4HXRA 5F36A 4Z6HA 4UYHA 5A5OA 1X0JA 3U5PA 5E9IA 5CUBA 5KO4A 5HRWA 4ZQLA 4IR3A 4N4HA 5A81A 3TLPA 4MENA 5HQ5A 4QEUA 3U5MA 5CRMA 4N3WA 3IU6A 4YBSA 4Q0NA 5CQ8A 4YK0A 5CUAA 5FE9A 2G4AA 5I89A 3HMEA 4Q0OA 4UIYA 4NRAA 5DW1A 5HLSA 2RNYA 4QZSA 4AKIA 4LR6A 4XUBA 5CGPA 4YY6A 5F60A 4KV1A 5DX4A 3G0JA 5A82A 4OGJA 5LKXA 2RNWA 3U5KA 5FFYA 5DFDA 4X2IA 5HFQA 5ENGA 4HXMA 5CPEA 4NXJA 5FG4A 3O35A 2R0VA 3SVFA 5BT4A 4TU4A 5FDZA 5DFBA 4QEVA 5A5PA 5JWMA 4XUAA 5E9YA 2I7KA 4AKNA 2R0YA 4NR6A 5CS8A 4LZRA 5F3AA 5I86A 4NR5A 4O74A 4DONA 5A5SA 5A83A 5EICA 5KU3A 4HXNA 4QUTA 4A9JA 5I40A 3GG3A 5A7CA 4CURA 4A9EA 2YQDA 3UVWA 5II1A 5TB6A 5CQAA 4IR5A 3LQHA 4Y03A 3QZVA 5HELA 5KHMA 5AMFA 4QC3A 5HENA 1F68A 5HQ7A 5E3DA 5I29A 3D1BA 2F6JA 4O7FA 5FBXA 5CUCA 4YYDA 5H85A 4PCEA 4QSWA 5L99A 3UVYA 5HJCA 5L97A 4QSVA 5C85A 2KTBB 4NQMA 5EPBA 4CLBA 2RS9B 5FE2A 4QC1A 4ALHA 5D3TA 3K2JA 5LUUA 4NUCA 5FFVA 4YC9A 5EWDA 5A85A 4LYWA 5ETBA 5IIDA 4QR4A 5ENBA 5I7XA 5A5NA 5D26A 2D82A 5CQ5A 2DATA 5DYAA 3Q2FA 4NYVA 4NYXA 2GRCA 5F5ZA 3SVGA 5CFWA 2OSSA 4HBXA 3MB3A 4UITA 4AI6A 2L5EA 2DVSA 4YYMA 4BW4A 5D3SA 5L96A 5CUDA 4QYLA 4A9OA 4A9HA 4CFLA 5EI4A 2OUOA 5LJ1A 5CQ6A 4TT6A 5KTWA 5CTLA 5F63A 5CRZA 1JM4B 5F1LA 5D24A 5ENIA 4NYWA 3ZYUA 3JVJA 4O71A 2DKWA 5IG6A 4UIWA 5CU8A 4QNSA 4QSQA 2D9EA 5G4SA 5FE6A 4O7CA 4HBYA 5EV9A 4A9KA 5EWCA 5DLZA 5EISA 3NXBA 3VKHA 4YADA 5IBNA 4AKHA 4HBVA 3LQJA 4TZ8A 5FG6A 2MJVB 4O75A 5ENFA 4HXPA 4NS5A 4YYJA 5DBMA 4OUFA 5I83A 5J0DA 5ENCA 3P5OA 3JVKA 4LDFA 4TTEA 4HXLA 2OO1A 2R0SA 5CQTA 5FH8A 3O37A 5L98A 5LVRA 4LRGA 4MR4A 4PY6A 5AD2A 3U5NA 3U5OA 3MXFA 5EA1A 5FE4A 5EWVA 4Z1SA 4YBTA 2E3KA 4TU6A 3G0LA 4WHWA 4UYGA 3VKGA 4YH3A 5KTUA 4F3IA 2YELA 2WP2A 5AMEA 3S91A 4C67A 4BJXA 2I8NA 4O78A 5I80A 5LJ0A 4O7EA 4MR6A 5EWWA 5C8GA 2L84A 5D3LA 5FFWA 3UV5A 3HMHA 3UW9A 3MULA 4IORA 2N9GA 5E73A 5FE0A 4QSUA 5CUGA 2LSPB 4O76A 5C89A 5E9MA 5ENJA 4J0SA 2E7OA 5FH6A 3U5LA 5HEMA 4NR9A 5LKZA 5DYXA 5EPRA 2NXBA 3UVDA 4QUUA 4LC2A 1E6IA 5C7NA 4FLPA 3ONIA 5DLXA 4IR6A 4YAXA 4Z6IA 5EM3A 4YBMA 5LJ2A 3LJWA 4NR4A 4BW3A 5F62A 3U5JA 1N72A 5FG5A 3UVXA 3HMFA 5FB1A 2R10A 5EU1A 4A9FA 3P1FA 3I3JA 4TYLA 2YEKA 4KCXA 2L85A 3IU5A 4MR3A 4UYFB 5E9KA 4CUUA 5IGKA 5I88A 4LYSA 4YYGA 4LZ2A 5DKDA 3O36A 4QSSA 2DVRA 4PCIA 5ETDA 2E7NA 4O77A 4UYEA 4GPJA 4IOOA 5DW2A 4MEQA 4C66A 5D0CA 4LZSA 2YDWA 5HRVA 4YYNA 3S92A 5EVAA 2DVVA 3P1EA 1EQFA 3RCWA 5E7DA 3MQMA 4UIXA 4IOQA 5D3JA 5I7YA 5F2PA 4UYFA 2DWWA 4IR4A 2RNXA 5L8TA 5I1QA 4YABA 5A5QA 5II2A 3D1DA 5CUEA 5D3HA 1PUOA 4QR5A 3JVLA 4O70A 4KV4A 4NR8A 2H60A 4AKGA 5HQ6A 5CP5A 5HRXA 4YY4A 4YH4A 2FSAA 4TZ2A 4WHUA 4A9IA 2WP1A 5DFCA 4CUPA 4BW2A 5C87A 4NUEA 3LQIA 4CL9A 4O72A 3DWYA 4UIZA 4E96A 5E9VA 3Q2EA 5HM0A 4XYAA 1WUMA 5FH7A 4CUSA 3JVMA 4OGIA 5FE8A 4QSRA 4NR7A 4WIVA 4PTBA 4N4FA 5LKTA 3P1CA 5CQ3A 4QSPA 5H1VA 4UIVA 5HFRA 5EK9A 5FE1A 4XY8A 5E3GA 3SVHA 2RFJA 4MEOA 3P1DA 1ZKRA 5ENHA 5IGNA 5FE5A 3D7CA 5CY9A 2YW5A 3AQAA 3MUKA 5ENEA 5F61A 5E9LA 3UV2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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