5F62A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with ma4-022-2
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f62A01
4O7BA 4O71A 4NYVA 2E3KA 2DVQA 5BT3A 4IOOA 4N4IA 2DWWA 5EWDA 5JWMA 2DVRA 4MR5A 3GG3A 4QSSA 5FH8A 3P1DA 3P1CA 5I29A 4NUEA 4BJXA 5D3HA 3U5OA 5FE2A 4PTBA 5D3PA 3UVXA 5A5OA 3U5KA 4UIWA 5H1UA 4CUPA 4QEWA 5IGMA 4QC3A 5EM3A 5E9VA 2R0SA 2E7OA 4TZ2A 2YW5A 4MEPA 5A5SA 4XY9A 5I7XA 4YYHA 5HM0A 4NYWA 4NQNA 3D7CA 5DLZA 5HENA 4TT6A 5EICA 5LUUA 5IIDA 4A9MA 4PCEA 3IU5A 4BHWA 4QSVA 4RVRA 5CUGA 4XUAA 3K2JA 4YY4A 4HXRA 3U5LA 5LKZA 3UV2A 5D3JA 5DFCA 5C8GA 5KTXA 4YY6A 5CY9A 4O7AA 5DFDA 2L5EA 4O78A 5ENGA 4A9EA 5FH7A 2RI7A 4IR6A 4YC9A 2OUOA 4UYEA 5EPRA 4UIZA 4F3IA 5FE4A 5TCMA 3U5PA 5E9KA 5L8UA 5HFRA 4YAXA 4J1PA 4UIYA 5CQAA 2LSPB 4O77A 4QSUA 4NUDA 4YADA 5CQ3A 3U5NA 5E3GA 4MEOA 4N4HA 5A5NA 4A9OA 4A9IA 5DW2A 3NXBA 4WHWA 5D3LA 4CFLA 5JI8A 3HMEA 5H85A 5H1VA 4A9KA 4YYIA 5LKUA 4O7FA 2OSSA 5A5RA 4WHUA 1WUMA 5TB6A 2I8NA 4NUCA 1WUGA 2RO1A 3LJWA 5J0DA 5DW1A 4LRGA 4LZRA 4NR5A 3QZTA 3MXFA 4YYMA 5DLXA 4UIVA 4NR4A 4HXOA 4TZ8A 4HXMA 5CU8A 5CZGA 5DKCA 4HBYA 4NR9A 4A9FA 5I1QA 5E3DA 1X0JA 5DBMA 5I7YA 5FE5A 2R10A 5F1LA 4PKLA 1E6IA 5I88A 4TTEA 4TU6A 4XUBA 5LJ0A 4YH4A 5E74A 4NYXA 4NS5A 5EVAA 5HRXA 5IGLA 2F6JA 5F2PA 4HBWA 5EI4A 5ACYA 4O76A 4XY8A 5AD3A 5ETDA 4O7EA 5AMEA 4CUUA 5II2A 4HXSA 2DVSA 5L98A 3SVGA 3U5JA 5CUBA 5FE6A 4QY4A 1N72A 4LYSA 3O35A 4HXPA 4YBMA 4YBTA 4C67A 5FE0A 3Q2FA 5D3NA 2DATA 5KTUA 5IGNA 4ALGA 5FE1A 4KV4A 3U5MA 5F25A 3UV5A 4O70A 5LJ1A 2RNXA 5IG6A 5HQ5A 2RFJA 4ZW1A 4QEUA 5HFQA 5D26A 5A83A 5E0RA 4QYDA 3O36A 4QBMA 5C4QA 4IR5A 5E9YA 2I7KA 5D3RA 3ZYUA 3FKMX 5C85A 4HXLA 4QR5A 5D0CA 2R0YA 4QZSA 5DY7A 4OUFA 4MR3A 5DFBA 5F1HA 1JM4B 3LQHA 5CUDA 4UYFA 2DKWA 5ENJA 2N9GA 5F63A 5CQ6A 5KHMA 5KTWA 4CUQA 4J0RA 2YDWA 4QR4A 5ENHA 4A9HA 2RS9B 4QEVA 5EU1A 5F36A 5K29A 5EQ1A 4WIVA 4YYJA 2DVVA 3P1EA 4KCXA 3P1FA 4YYDA 5EA1A 4LC2A 4QUTA 4QC1A 5C89A 5LKXA 4HXNA 4MR6A 5CUEA 5CRMA 4NRAA 4HBVA 3S92A 4Z6HA 4CFKA 5I86A 5D25A 5EWVA 5CP5A 5EPSA 5HLSA 4YYGA 5IGKA 5DYAA 2YYNA 4PCIA 5FB0A 3MQMA 5CS8A 5BT4A 4FLPA 5ETBA 5D3TA 4QSQA 4Y03A 5G4SA 5HRVA 5E9LA 5CQ4A 4BW4A 1EQFA 4TS8A 2L85A 2YEKA 4NR7A 4IR4A 4UIUA 5FE7A 5ENFA 4Z93A 5EPBA 3DAIA 4N4FA 4YYKA 2GRCA 4E96A 4X2IA 5BT5A 5DYUA 5A5PA 5FFYA 4CURA 4ZC9A 3AADA 4QSXA 4MENA 5AD2A 4C66A 3UVYA 4TU4A 5L96A 5CPEA 4OGIA 4N4GA 2E7NA 5G4RA 5DX4A 3SVHA 3LQIA 4LR6A 3UVDA 5EISA 5ENIA 4YABA 4Q0OA 5FH6A 4TT2A 4LYIA 4QB3A 4QSRA 4YATA 5E7DA 5CQTA 5CTLA 2YELA 2D9EA 5FE3A 3TLPA 4CL9A 4IORA 5I83A 4LDFA 2H60A 5L8TA 5LVQA 4UITA 5F3AA 4QSPA 5CUCA 5II1A 4NRCA 2RNWA 4YBSA 3UVWA 5FDZA 4QNSA 5HRWA 5FBXA 2RNYA 3IU6A 5D3SA 5HQ7A 5L99A 4HBXA 4GPJA 5E9IA 4NR8A 5D7XA 4O74A 4NRBA 4QUUA 5CQ8A 1F68A 2NXBA 5DKDA 4NXJA 4LZ2A 5EWWA 5AMFA 4A9LA 4J3IA 3Q2EA 4LZSA 3G0LA 3JVKA 5A7CA 2YEMA 4UYGA 4O75A 5F60A 1JSPB 5LJ2A 4MEQA 4TYLA 3SVFA 3O34A 5L97A 3AQAA 3JVLA 3DWYA 3HMHA 5H1TA 2D82A 4QR3A 5KU3A 5CFWA 5F61A 3I3JA 5COIA 4Q0NA 2KTBB 2FSAA 5FG5A 2WP1A 4A9JA 3RCWA 5A82A 3P5OA 4QYLA 3LQJA 4UYHA 5EP7A 4HXKA 4KV1A 5CGPA 3MULA 3S91A 5EGUA 5A81A 4IOQA 2YQDA 5CUAA 5DYXA 5F5ZA 5HEMA 4TT4A 5C87A 5A85A 5FFVA 5HELA 2G4AA 4BW3A 5DKHA 4CUSA 5KO4A 5HQ6A 3MB3A 3LXJA 4DONA 4ALHA 5EWHA 5I80A 2R0VA 5EWCA 4O7CA 5I40A 5HCLA 4CLBA 4UIXA 4Z6IA 5FE9A 5LKTA 3QZSA 4J0SA 2F6NA 5CQ7A 4MR4A 2MJVB 2L84A 4ZQLA 5ENCA 4OGJA 5CRZA 3UV4A 5E73A 3JVJA 3HMFA 3ONIA 2OO1A 5EK9A 4Z1QA 3MUKA 5FE8A 5D24A 3JVMA 5FG4A 2WP2A 4YYNA 4AKNA 3O33A 5ENEA 3O37A 4NR6A 5A5QA 5LVRA 1ZS5A 4A9NA 3G0JA 4PS5A 4TQNA 4UYFB 4QSWA 4UYDA 4NQMA 5HJCA 4CUTA 4QSTA 4YH3A 5IBNA 4Z1SA 4PY6A 5FFWA 5ENBA 5C7NA 4LYWA 3QZVA 4N3WA 5E9MA 5FB1A 3UW9A 5CQ5A 4BW2A 3MB4A 4XYAA 5F62A 5DYCA 5EV9A 4O72A 4YK0A 5FG6A 4IR3A 4BW1A 5I89A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7BA 4O71A 4NYVA 2E3KA 2DVQA 5BT3A 4IOOA 4N4IA 2DWWA 5EWDA 5JWMA 2DVRA 4MR5A 3GG3A 4QSSA 5FH8A 3P1DA 3P1CA 5I29A 4NUEA 4BJXA 5D3HA 3U5OA 5FE2A 4PTBA 5D3PA 3UVXA 5A5OA 3U5KA 4UIWA 5H1UA 4CUPA 4QEWA 5IGMA 4QC3A 5EM3A 5E9VA 2R0SA 2E7OA 4TZ2A 2YW5A 4MEPA 5A5SA 4XY9A 5I7XA 4YYHA 5HM0A 4NYWA 4NQNA 3D7CA 5DLZA 5HENA 4TT6A 2EJNA 5EICA 5LUUA 5IIDA 4A9MA 4PCEA 3IU5A 4BHWA 4QSVA 4RVRA 5CUGA 4XUAA 3K2JA 4YY4A 4HXRA 3U5LA 5LKZA 3UV2A 5D3JA 5DFCA 5C8GA 5KTXA 4YY6A 5CY9A 4O7AA 3D1BA 2L5EA 4O78A 5DFDA 5ENGA 4A9EA 5FH7A 2RI7A 4IR6A 4YC9A 2OUOA 4UYEA 5EPRA 4UIZA 4F3IA 5FE4A 5TCMA 3U5PA 5E9KA 5L8UA 5HFRA 4YAXA 4J1PA 4UIYA 5CQAA 2LSPB 4O77A 4QSUA 4NUDA 1PUOA 4YADA 5CQ3A 3U5NA 5E3GA 4MEOA 4N4HA 5A5NA 4A9OA 4A9IA 5DW2A 3NXBA 4WHWA 5D3LA 4CFLA 5JI8A 3HMEA 5H85A 5H1VA 4A9KA 4YYIA 5LKUA 4O7FA 2OSSA 5A5RA 4WHUA 1WUMA 5TB6A 2I8NA 4NUCA 1WUGA 2RO1A 3LJWA 5J0DA 5DW1A 4LRGA 4LZRA 4NR5A 3QZTA 3MXFA 4YYMA 5DLXA 4UIVA 4NR4A 4HXOA 4TZ8A 4HXMA 5CU8A 5CZGA 5DKCA 4HBYA 4NR9A 4A9FA 4AKGA 5I1QA 5E3DA 1X0JA 5DBMA 5I7YA 5FE5A 2R10A 5F1LA 4PKLA 1E6IA 5I88A 4TTEA 4TU6A 4XUBA 5LJ0A 4YH4A 5E74A 4NYXA 4NS5A 5EVAA 5HRXA 5IGLA 2F6JA 5F2PA 4HBWA 5EI4A 5ACYA 4O76A 4XY8A 1ZKRA 5AD3A 5ETDA 4O7EA 5AMEA 4CUUA 5II2A 4HXSA 2DVSA 5L98A 3SVGA 3U5JA 5CUBA 5FE6A 4QY4A 1N72A 4LYSA 3O35A 4HXPA 4YBMA 4YBTA 4C67A 5FE0A 3Q2FA 5D3NA 2DATA 5KTUA 5IGNA 4ALGA 5FE1A 4KV4A 3U5MA 5F25A 3UV5A 4O70A 5LJ1A 2RNXA 5IG6A 5HQ5A 2RFJA 4ZW1A 4QEUA 5HFQA 5D26A 5A83A 5E0RA 4QYDA 3O36A 4QBMA 5C4QA 4IR5A 5E9YA 2I7KA 5D3RA 3ZYUA 3FKMX 5C85A 4HXLA 4QR5A 5D0CA 2R0YA 4QZSA 5DY7A 4OUFA 4MR3A 5DFBA 5F1HA 1JM4B 3LQHA 5CUDA 4UYFA 2DKWA 5ENJA 2N9GA 5F63A 5CQ6A 5KHMA 5KTWA 4CUQA 4J0RA 2YDWA 4QR4A 5ENHA 4A9HA 2RS9B 4QEVA 5EU1A 5F36A 5K29A 5EQ1A 4WIVA 4YYJA 2DVVA 3P1EA 4KCXA 3P1FA 4YYDA 3D1DA 5EA1A 4LC2A 4QUTA 4QC1A 5C89A 5LKXA 4HXNA 4MR6A 5CUEA 5CRMA 4NRAA 4HBVA 3S92A 4Z6HA 4CFKA 5I86A 5D25A 3VKGA 5EWVA 5CP5A 5EPSA 5HLSA 4YYGA 5IGKA 5DYAA 2YYNA 4PCIA 5FB0A 3MQMA 5CS8A 5BT4A 4FLPA 5ETBA 5D3TA 4QSQA 4Y03A 5G4SA 5HRVA 5E9LA 5CQ4A 4BW4A 1EQFA 4TS8A 2L85A 2YEKA 4NR7A 4IR4A 4UIUA 5FE7A 5ENFA 4Z93A 5EPBA 3DAIA 4N4FA 4YYKA 2GRCA 4E96A 4X2IA 5BT5A 5DYUA 5A5PA 5FFYA 4CURA 4ZC9A 3AADA 4QSXA 4MENA 5AD2A 4C66A 3UVYA 4TU4A 4AI6A 5L96A 5CPEA 4OGIA 4N4GA 2E7NA 5G4RA 5DX4A 3SVHA 3LQIA 4LR6A 3UVDA 5EISA 5ENIA 4YABA 4Q0OA 5FH6A 4TT2A 4LYIA 4QB3A 4QSRA 4YATA 5E7DA 5CQTA 5CTLA 4AKHA 2YELA 3ERRA 2D9EA 5FE3A 3TLPA 4CL9A 4IORA 5I83A 4LDFA 2H60A 5L8TA 5LVQA 4UITA 5F3AA 4QSPA 5CUCA 5II1A 4NRCA 2RNWA 4YBSA 3UVWA 5FDZA 4QNSA 5HRWA 5FBXA 2RNYA 3IU6A 5D3SA 5HQ7A 5L99A 4HBXA 4GPJA 5E9IA 4NR8A 5D7XA 4O74A 4NRBA 4QUUA 5CQ8A 1F68A 2NXBA 5DKDA 4NXJA 4LZ2A 5EWWA 5AMFA 4A9LA 4J3IA 3Q2EA 4LZSA 3G0LA 3JVKA 5A7CA 2YEMA 4UYGA 4O75A 5F60A 1JSPB 5LJ2A 4MEQA 4TYLA 3SVFA 3O34A 5L97A 3AQAA 3JVLA 3DWYA 3HMHA 5H1TA 2D82A 4QR3A 5KU3A 5CFWA 5F61A 3I3JA 5COIA 4Q0NA 2KTBB 2FSAA 5FG5A 2WP1A 4A9JA 3RCWA 5A82A 3P5OA 4QYLA 3LQJA 4UYHA 5EP7A 4HXKA 4KV1A 5CGPA 3MULA 3S91A 5EGUA 5A81A 4IOQA 2YQDA 5CUAA 5DYXA 5F5ZA 5HEMA 4AKIA 4TT4A 5C87A 5A85A 5FFVA 5HELA 2G4AA 4BW3A 5DKHA 4CUSA 5KO4A 5HQ6A 3MB3A 3LXJA 4DONA 4ALHA 5EWHA 5I80A 2R0VA 5EWCA 4O7CA 5I40A 5HCLA 4CLBA 4UIXA 4Z6IA 5FE9A 5LKTA 3QZSA 4J0SA 2F6NA 5CQ7A 4MR4A 2MJVB 2L84A 4ZQLA 5ENCA 4OGJA 5CRZA 3UV4A 3VKHA 5E73A 3JVJA 3HMFA 3ONIA 2OO1A 5EK9A 4Z1QA 3MUKA 5FE8A 5D24A 3JVMA 5FG4A 2WP2A 4YYNA 4AKNA 3O33A 5ENEA 3O37A 4NR6A 5A5QA 5LVRA 1ZS5A 4A9NA 3G0JA 4PS5A 4TQNA 4UYFB 4QSWA 4UYDA 4NQMA 5HJCA 4CUTA 4QSTA 4YH3A 5IBNA 4Z1SA 4PY6A 5FFWA 5ENBA 5C7NA 4LYWA 3QZVA 4N3WA 5E9MA 5FB1A 3UW9A 5CQ5A 4BW2A 3MB4A 4XYAA 5F62A 5DYCA 5EV9A 4O72A 4YK0A 5FG6A 4IR3A 4BW1A 5I89A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4O7B A;  4O71 A;  4NYV A;  2E3K A;  2DVQ A;  5BT3 A;  4IOO A;  4N4I A;  2DWW A;  5EWD A;  5JWM A;  2DVR A;  4MR5 A;  3GG3 A;  4QSS A;  5FH8 A;  3P1D A;  3P1C A;  5I29 A;  4NUE A;  4BJX A;  5D3H A;  3U5O A;  5FE2 A;  4PTB A;  5D3P A;  3UVX A;  5A5O A;  3U5K A;  4UIW A;  5H1U A;  4CUP A;  4QEW A;  5IGM A;  4QC3 A;  5EM3 A;  5E9V A;  2R0S A;  2E7O A;  4TZ2 A;  2YW5 A;  4MEP A;  5A5S A;  4XY9 A;  5I7X A;  4YYH A;  5HM0 A;  4NYW A;  4NQN A;  3D7C A;  5DLZ A;  5HEN A;  4TT6 A;  5EIC A;  5LUU A;  5IID A;  4A9M A;  4PCE A;  3IU5 A;  4BHW A;  4QSV A;  4RVR A;  5CUG A;  4XUA A;  3K2J A;  4YY4 A;  4HXR A;  3U5L A;  5LKZ A;  3UV2 A;  5D3J A;  5DFC A;  5C8G A;  5KTX A;  4YY6 A;  5CY9 A;  4O7A A;  5DFD A;  2L5E A;  4O78 A;  5ENG A;  4A9E A;  5FH7 A;  2RI7 A;  4IR6 A;  4YC9 A;  2OUO A;  4UYE A;  5EPR A;  4UIZ A;  4F3I A;  5FE4 A;  5TCM A;  3U5P A;  5E9K A;  5L8U A;  5HFR A;  4YAX A;  4J1P A;  4UIY A;  5CQA A;  2LSP B;  4O77 A;  4QSU A;  4NUD A;  4YAD A;  5CQ3 A;  3U5N A;  5E3G A;  4MEO A;  4N4H A;  5A5N A; 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