4QSRA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) with bound mpd
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsrA00
5ENBA 3GG3A 4A9OA 5FDZA 4TS8A 4YBSA 4TTEA 4O78A 4UYHA 4WHUA 5IIDA 3U5NA 4LYSA 3U5LA 4MEQA 4O74A 4UYFA 4UIZA 4QC1A 2RS9B 2RNWA 4ALHA 2L5EA 4KCXA 5A85A 5E0RA 5I89A 4PCEA 4YK0A 4CUSA 4QZSA 2R10A 4NUCA 5II1A 3O37A 5G4SA 2FSAA 4MEOA 5IG6A 1ZS5A 4O7BA 2YQDA 5A7CA 3SVFA 4AKNA 4YYDA 5EWVA 5D0CA 3UW9A 5BT5A 4O7CA 5CGPA 3FKMX 5I40A 3IU5A 5D3NA 5FE9A 4O76A 4NR7A 4BW1A 4NXJA 4OGJA 5KTWA 5A5PA 4F3IA 3QZVA 4LYIA 4XYAA 1WUGA 4N4FA 3LXJA 5ENEA 5DLXA 5FE7A 5EWDA 5DKHA 2YW5A 5HQ7A 5HRWA 4TT2A 4X2IA 5CUEA 5F63A 4QR5A 4QEWA 4TT6A 4IOOA 5FFYA 4BJXA 3LQHA 5HJCA 5CY9A 5LKZA 5KTXA 4QB3A 5F1HA 4NR6A 4NYVA 2E7OA 4HXSA 5HQ6A 3S91A 5E3GA 2YEKA 4HBVA 4NS5A 4O7FA 5HM0A 4CL9A 4QEUA 2F6NA 5IGLA 4UIWA 4UIYA 2MJVB 5HFQA 1JSPB 3U5MA 1E6IA 4QYDA 3JVMA 4E96A 5I1QA 5A5RA 5KHMA 4A9KA 3MB3A 2I8NA 4NR4A 5DKCA 4WHWA 5ETDA 3UVXA 3LQIA 3HMHA 2R0VA 5DYXA 3U5JA 4MR4A 2RI7A 5D3PA 4BW4A 5DYCA 4UIXA 3O33A 4YYJA 5FE2A 3UV5A 5CU8A 4TU6A 5F1LA 2D9EA 5EWCA 5A5NA 5IBNA 4YYMA 4Z1QA 2KTBB 4O75A 5D3SA 5E9YA 5ENIA 5DX4A 4IR4A 5CUAA 5EWWA 3DWYA 5DW1A 4FLPA 4HXOA 4A9LA 4LYWA 5CUCA 5E9LA 4QSRA 5C85A 5CQTA 1EQFA 4CLBA 5EI4A 5CS8A 5DFDA 2RFJA 5G4RA 4O72A 4QSSA 3U5KA 4TZ2A 5BT3A 3O34A 3U5PA 3MXFA 5E7DA 5AD2A 5LVRA 5CUDA 4XY8A 5CRMA 5F5ZA 4QNSA 5DW2A 5L8UA 4MEPA 4N4IA 2YEMA 3LJWA 5AMEA 2F6JA 2D82A 2L84A 2N9GA 4NYXA 5IGNA 5LJ2A 4NR8A 5FFVA 4YBMA 4MR5A 3G0JA 4O77A 5C87A 2YDWA 5FH6A 4Z6HA 5COIA 4LRGA 2YELA 5EK9A 4NRBA 3SVGA 2I7KA 4NQMA 4IR3A 5K29A 2WP1A 5EPRA 4O70A 4UIVA 4MR3A 5KU3A 4YATA 5D25A 3UVYA 3U5OA 5FBXA 4QR3A 5DFBA 4NR5A 5CUGA 5F25A 4Y03A 5FE1A 4HXRA 2RO1A 5ENFA 4Z1SA 5JWMA 5FE6A 4HXNA 3P1EA 4A9JA 4HXPA 4IR5A 5DBMA 5F2PA 5A5QA 5FFWA 3P5OA 3DAIA 4YH4A 3UVDA 2E7NA 4BW3A 5EQ1A 4BHWA 4C67A 5EU1A 5D24A 5TCMA 5HRVA 4NRAA 5HELA 5D3RA 2DATA 4QSQA 5CQAA 5C7NA 3MUKA 4QUTA 4OGIA 5A83A 4QC3A 5FE0A 3P1DA 3JVJA 4QSTA 5EVAA 4CUTA 4XY9A 5IGKA 5DYAA 5HRXA 2OUOA 4O7EA 4QUUA 4YY6A 5FG6A 5LUUA 5A81A 5TB6A 4IR6A 4QSUA 4XUBA 5I7XA 5II2A 5D3JA 1JM4B 2NXBA 2H60A 2R0YA 3MB4A 4A9EA 4WIVA 2DWWA 5DFCA 5L98A 4PCIA 5EGUA 3QZSA 5JI8A 5CQ8A 5LKXA 1N72A 5DLZA 4J0SA 3S92A 3AADA 5I88A 2OO1A 5EPSA 4YADA 4PY6A 4UITA 4DONA 5LKUA 4KV1A 5I29A 5CQ4A 2E3KA 4UYDA 4BW2A 5DYUA 4YYHA 3HMEA 3TLPA 5CQ6A 5E3DA 4NYWA 4KV4A 5ENGA 5D26A 4ZC9A 3RCWA 3IU6A 5HEMA 4PTBA 2DVRA 5I83A 5C89A 5EICA 2DVQA 5L8TA 5F3AA 4NRCA 5EM3A 4YY4A 4ZW1A 5LJ1A 5D7XA 2RNYA 5C4QA 4YABA 3UV4A 2L85A 3Q2FA 4YC9A 3JVLA 5D3LA 3I3JA 5EPBA 2YYNA 4O71A 4QY4A 4UYFB 5H1TA 5ACYA 3P1FA 4PS5A 5DY7A 3JVKA 4YH3A 3O35A 5FE5A 4ALGA 4Q0OA 5KO4A 4HBWA 2GRCA 4QEVA 5AMFA 5F61A 5FE3A 5HLSA 4MENA 5HQ5A 4N3WA 4QSWA 4CUQA 4NUDA 3QZTA 4CFLA 3Q2EA 4YYGA 4CURA 4TT4A 5FE8A 2DKWA 4GPJA 2R0SA 5ENJA 5ENHA 5ETBA 2DVVA 4LR6A 5CQ3A 4LZSA 5FG4A 5E73A 5CUBA 5CPEA 5BT4A 3MQMA 5FB1A 5LKTA 4N4GA 5FH8A 5A5SA 4CFKA 5H1UA 3P1CA 1WUMA 5I86A 2WP2A 3SVHA 4Z6IA 5L99A 5EP7A 5I7YA 4HXLA 5IGMA 2G4AA 5FB0A 2OSSA 5F62A 5FE4A 4HXMA 5LJ0A 4YYIA 4UYGA 1X0JA 4MR6A 4UIUA 4IORA 5E9IA 4YAXA 3NXBA 3HMFA 4NUEA 5HFRA 3D7CA 5I80A 4OUFA 5CRZA 3UV2A 5CQ7A 4C66A 2DVSA 2LSPB 5FH7A 5CQ5A 4LZRA 5A82A 4ZQLA 4TZ8A 5E9MA 1F68A 4A9NA 5D3HA 5CTLA 4QSXA 4PKLA 4A9HA 3ZYUA 5E9VA 5EV9A 3ONIA 3UVWA 4TQNA 4XUAA 4QR4A 4CUUA 5E74A 5FG5A 3AQAA 4IOQA 4UYEA 3MULA 5AD3A 5ENCA 5CP5A 4QBMA 4RVRA 4TU4A 5H1VA 4HBXA 4CUPA 4HXKA 5A5OA 4QSPA 5EISA 5F60A 4QYLA 5H85A 5EWHA 4J3IA 4J1PA 4LZ2A 5CZGA 5E9KA 5L97A 4QSVA 4TYLA 5HENA 5EA1A 4O7AA 5D3TA 4A9IA 3G0LA 4YYNA 5DKDA 3K2JA 3O36A 4Z93A 4YBTA 5C8GA 4YYKA 4LC2A 4HBYA 4LDFA 4J0RA 4NQNA 3LQJA 5F36A 5L96A 4N4HA 4A9MA 5KTUA 2RNXA 4A9FA 5HCLA 4NR9A 5LVQA 5J0DA 5CFWA 4Q0NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENBA 3GG3A 4A9OA 5FDZA 3D1DA 4TS8A 4YBSA 4TTEA 4O78A 4UYHA 4WHUA 5IIDA 3U5NA 4LYSA 3U5LA 4MEQA 4O74A 4UYFA 4UIZA 4QC1A 2RS9B 3VKGA 2RNWA 4ALHA 2L5EA 4KCXA 5A85A 5E0RA 5I89A 4PCEA 4YK0A 4CUSA 4QZSA 2R10A 4NUCA 5II1A 3O37A 5G4SA 2FSAA 4MEOA 5IG6A 1ZS5A 4O7BA 2YQDA 5A7CA 3SVFA 4AKNA 4YYDA 5EWVA 5D0CA 3UW9A 5BT5A 4O7CA 5CGPA 3FKMX 5I40A 3IU5A 5D3NA 5FE9A 4O76A 4NR7A 4BW1A 4NXJA 4OGJA 5KTWA 5A5PA 4F3IA 3QZVA 4LYIA 4XYAA 1WUGA 4N4FA 3LXJA 5ENEA 1ZKRA 5DLXA 5FE7A 5EWDA 5DKHA 2YW5A 5HQ7A 5HRWA 4TT2A 4X2IA 5CUEA 5F63A 4AKIA 4QR5A 4QEWA 4TT6A 4IOOA 5FFYA 4BJXA 3LQHA 5HJCA 5CY9A 5LKZA 5KTXA 4AI6A 4QB3A 5F1HA 4NR6A 4NYVA 2E7OA 4HXSA 5HQ6A 3S91A 5E3GA 2YEKA 4HBVA 4NS5A 4O7FA 5HM0A 4CL9A 4QEUA 2F6NA 4AKHA 5IGLA 4UIWA 4UIYA 2MJVB 5HFQA 1JSPB 3U5MA 1E6IA 4QYDA 3JVMA 4E96A 5I1QA 5A5RA 5KHMA 4A9KA 3MB3A 2I8NA 4NR4A 5DKCA 4WHWA 5ETDA 3UVXA 3LQIA 3HMHA 2R0VA 5DYXA 3U5JA 4MR4A 2RI7A 5D3PA 4BW4A 5DYCA 4UIXA 3O33A 4YYJA 5FE2A 3UV5A 5CU8A 4TU6A 5F1LA 2D9EA 5EWCA 5A5NA 5IBNA 4YYMA 4Z1QA 2KTBB 4O75A 5D3SA 5E9YA 5ENIA 5DX4A 4IR4A 5CUAA 5EWWA 3DWYA 5DW1A 4FLPA 4HXOA 4A9LA 4LYWA 5CUCA 5E9LA 4QSRA 5C85A 5CQTA 1EQFA 4CLBA 5EI4A 5CS8A 5DFDA 2RFJA 5G4RA 4O72A 4QSSA 3U5KA 4TZ2A 5BT3A 3O34A 3U5PA 3MXFA 5E7DA 5AD2A 5LVRA 5CUDA 4XY8A 5CRMA 5F5ZA 4QNSA 5DW2A 5L8UA 4MEPA 4N4IA 2YEMA 3LJWA 5AMEA 2F6JA 2D82A 2L84A 2N9GA 4NYXA 5IGNA 5LJ2A 4NR8A 5FFVA 4YBMA 4MR5A 3G0JA 4O77A 5C87A 2YDWA 5FH6A 4Z6HA 5COIA 4LRGA 4AKGA 2YELA 5EK9A 4NRBA 3SVGA 2I7KA 4NQMA 4IR3A 5K29A 2WP1A 5EPRA 4O70A 4UIVA 4MR3A 5KU3A 4YATA 5D25A 3UVYA 3U5OA 5FBXA 4QR3A 5DFBA 3ERRA 4NR5A 5CUGA 5F25A 4Y03A 5FE1A 4HXRA 2RO1A 5ENFA 4Z1SA 5JWMA 5FE6A 4HXNA 3P1EA 4A9JA 4HXPA 4IR5A 5DBMA 5F2PA 5A5QA 5FFWA 3P5OA 3DAIA 4YH4A 3UVDA 2E7NA 4BW3A 5EQ1A 4BHWA 4C67A 5EU1A 5D24A 5TCMA 5HRVA 4NRAA 5HELA 5D3RA 2DATA 4QSQA 5CQAA 5C7NA 3MUKA 4QUTA 4OGIA 5A83A 4QC3A 5FE0A 3P1DA 3JVJA 4QSTA 5EVAA 4CUTA 4XY9A 5IGKA 5DYAA 5HRXA 2OUOA 4O7EA 4QUUA 4YY6A 5FG6A 5LUUA 5A81A 5TB6A 4IR6A 4QSUA 4XUBA 5I7XA 5II2A 5D3JA 1JM4B 2NXBA 2H60A 2R0YA 3MB4A 4A9EA 4WIVA 2DWWA 5DFCA 5L98A 4PCIA 5EGUA 3QZSA 5JI8A 2EJNA 5CQ8A 5LKXA 1N72A 5DLZA 4J0SA 3S92A 3AADA 5I88A 2OO1A 5EPSA 4YADA 4PY6A 4UITA 4DONA 5LKUA 4KV1A 5I29A 5CQ4A 2E3KA 4UYDA 4BW2A 5DYUA 4YYHA 3HMEA 3TLPA 5CQ6A 5E3DA 4NYWA 4KV4A 5ENGA 5D26A 4ZC9A 3RCWA 3IU6A 5HEMA 4PTBA 2DVRA 5I83A 5C89A 5EICA 2DVQA 5L8TA 5F3AA 4NRCA 5EM3A 4YY4A 4ZW1A 5LJ1A 5D7XA 2RNYA 5C4QA 4YABA 3UV4A 2L85A 3Q2FA 4YC9A 3JVLA 5D3LA 3I3JA 5EPBA 2YYNA 4O71A 4QY4A 4UYFB 5H1TA 5ACYA 3P1FA 4PS5A 5DY7A 3JVKA 4YH3A 3O35A 5FE5A 4ALGA 4Q0OA 5KO4A 4HBWA 2GRCA 4QEVA 5AMFA 5F61A 5FE3A 5HLSA 4MENA 5HQ5A 4N3WA 4QSWA 4CUQA 4NUDA 3QZTA 4CFLA 3Q2EA 4YYGA 4CURA 4TT4A 5FE8A 2DKWA 4GPJA 2R0SA 5ENJA 5ENHA 5ETBA 2DVVA 3D1BA 4LR6A 5CQ3A 4LZSA 5FG4A 5E73A 5CUBA 5CPEA 5BT4A 3MQMA 5FB1A 5LKTA 4N4GA 5FH8A 5A5SA 4CFKA 5H1UA 3P1CA 1WUMA 5I86A 3VKHA 2WP2A 3SVHA 4Z6IA 5L99A 5EP7A 5I7YA 4HXLA 5IGMA 2G4AA 5FB0A 2OSSA 5F62A 5FE4A 4HXMA 5LJ0A 4YYIA 4UYGA 1X0JA 4MR6A 4UIUA 4IORA 5E9IA 4YAXA 3NXBA 3HMFA 4NUEA 5HFRA 3D7CA 1PUOA 5I80A 4OUFA 5CRZA 3UV2A 5CQ7A 4C66A 2DVSA 2LSPB 5FH7A 5CQ5A 4LZRA 5A82A 4ZQLA 4TZ8A 5E9MA 1F68A 4A9NA 5D3HA 5CTLA 4QSXA 4PKLA 4A9HA 3ZYUA 5E9VA 5EV9A 3ONIA 3UVWA 4TQNA 4XUAA 4QR4A 4CUUA 5E74A 5FG5A 3AQAA 4IOQA 4UYEA 3MULA 5AD3A 5ENCA 5CP5A 4QBMA 4RVRA 4TU4A 5H1VA 4HBXA 4CUPA 4HXKA 5A5OA 4QSPA 5EISA 5F60A 4QYLA 5H85A 5EWHA 4J3IA 4J1PA 4LZ2A 5CZGA 5E9KA 5L97A 4QSVA 4TYLA 5HENA 5EA1A 4O7AA 5D3TA 4A9IA 3G0LA 4YYNA 5DKDA 3K2JA 3O36A 4Z93A 4YBTA 5C8GA 4YYKA 4LC2A 4HBYA 4LDFA 4J0RA 4NQNA 3LQJA 5F36A 5L96A 4N4HA 4A9MA 5KTUA 2RNXA 4A9FA 5HCLA 4NR9A 5LVQA 5J0DA 5CFWA 4Q0NA
chains in the Genus database with same CATH topology
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