4QSRA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) with bound mpd
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
b'SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsrA00
4NYWA 5EPBA 3LXJA 4LZRA 4QSVA 5E3DA 5E74A 5A5PA 4Q0OA 4TT4A 5E3GA 4A9IA 5DYXA 4J0SA 5BT3A 5HLSA 5J0DA 3FKMX 3LQHA 4BW3A 2G4AA 4TU6A 4QSQA 5C7NA 4TU4A 5D3RA 5LUUA 3S92A 4MENA 4CUSA 5A85A 5I88A 4MEQA 4HXRA 5HELA 3U5MA 2DWWA 4YBTA 4YYKA 3U5LA 5C87A 4UYDA 5KTUA 5EU1A 4CUPA 5DYCA 5FE6A 5DW2A 3LJWA 5D24A 4PTBA 5F3AA 5D7XA 4BHWA 5I1QA 4QB3A 4WHUA 4IOQA 4OGIA 4AKNA 4NQNA 5DX4A 4O75A 5L8TA 3G0JA 5DFBA 5F1LA 3AQAA 1N72A 5FG5A 4N3WA 5E9KA 3MB4A 5CTLA 4QNSA 4QR4A 5FG4A 4YYHA 4NRCA 4Z1QA 4CLBA 5EQ1A 4J0RA 3TLPA 4HXNA 4C67A 4NR9A 4Z93A 5EV9A 2YQDA 3DWYA 1JM4B 5CQAA 4A9FA 5D25A 5AD3A 5FE2A 5CY9A 4A9EA 3MULA 3SVFA 5BT5A 3U5OA 4QSRA 3UVXA 4QBMA 5FFVA 2E7OA 4YBSA 5D3NA 4UIUA 5E9MA 4NR4A 4YY6A 3U5NA 5CUAA 5EGUA 4O7FA 2YEMA 1E6IA 4XYAA 4NR5A 4Q0NA 3HMFA 5E73A 3UVWA 4NUEA 5HFRA 4O7EA 2DATA 4YH3A 3UVYA 5FE1A 2YYNA 5CUDA 3D7CA 2D9EA 3O35A 5IIDA 5E9LA 2L84A 5CRMA 5H85A 5AMFA 2LSPB 5HRVA 5EA1A 5HRXA 4QY4A 5E9YA 4BJXA 1WUGA 5HQ6A 4A9JA 4KCXA 5LKUA 4A9HA 5ENHA 5TB6A 4YYNA 2WP1A 4YBMA 5FG6A 3RCWA 4UIWA 5A5RA 4O72A 5G4RA 5LKTA 3MXFA 2DVQA 2RNYA 5BT4A 5CUCA 5EI4A 4HXMA 5ENJA 5LVRA 3Q2FA 2R0VA 4A9MA 4MEOA 3NXBA 3DAIA 4LC2A 2N9GA 4HBWA 4PS5A 2L5EA 2I7KA 5HEMA 4O74A 5FB1A 5LKZA 4QYLA 5CS8A 4QR3A 4FLPA 3IU6A 4YYGA 4N4GA 2R0YA 4O77A 5ETBA 1ZS5A 5DFDA 5F63A 4X2IA 4OGJA 4QUTA 5CGPA 4QC1A 4CFLA 5F1HA 5EWVA 5ENEA 5A5NA 5DBMA 4O7AA 4MR3A 4QSXA 5HJCA 4A9KA 5IGNA 5FE4A 5HQ7A 5L97A 4O76A 3LQJA 5E7DA 3UW9A 5CUEA 5D3HA 2DVSA 4O70A 5IGKA 4A9LA 3GG3A 5CFWA 5HFQA 4DONA 4CL9A 4HXOA 5HRWA 5HQ5A 4YK0A 5EICA 5CUGA 5LKXA 4QR5A 5CZGA 5KTXA 4Z6IA 4YC9A 4O7BA 5C8GA 5II1A 4XUAA 4MR6A 5EPRA 5CQ5A 3HMHA 4HXKA 1WUMA 4ZC9A 3S91A 1F68A 4XY8A 3HMEA 5EVAA 4CUTA 4NXJA 4QSSA 4PCIA 5CQ7A 3Q2EA 4F3IA 4YYMA 4YATA 5I80A 5A82A 4PCEA 4MEPA 3AADA 2L85A 5EP7A 5L96A 5C85A 2YW5A 4HBXA 4YAXA 5G4SA 5D3LA 3UVDA 4N4HA 5FDZA 4NR8A 5DKDA 5LJ2A 5I29A 1X0JA 5D3SA 5H1TA 4ZQLA 2RNXA 2RO1A 5F5ZA 2R10A 5IGLA 4QSWA 2RS9B 4YADA 3U5KA 4YYDA 4UIXA 4QYDA 4HXLA 5EWDA 4GPJA 4ALHA 5E0RA 4BW1A 4CFKA 5DYAA 4NUDA 3O33A 3O36A 5FE0A 4YYJA 5HM0A 3K2JA 4NUCA 4QSUA 4CUQA 2YEKA 4LYWA 2NXBA 4C66A 5DLXA 3QZSA 5F62A 5CQ6A 3QZTA 3UV4A 4A9OA 3ONIA 5FBXA 5HCLA 4UIZA 4ZW1A 5FE9A 2OUOA 4NRBA 5EWHA 5JWMA 4BW4A 5A7CA 2OO1A 4TT6A 5AMEA 4A9NA 4UYEA 5I83A 5IG6A 2E7NA 5L8UA 4J1PA 3JVJA 2F6NA 4UYGA 5L98A 4Z6HA 4TYLA 5HENA 4N4FA 4MR4A 4TT2A 4IR5A 4HXSA 4KV4A 3SVHA 4NR7A 4QUUA 5FH8A 3P1EA 3P1CA 5COIA 5D3PA 5ENGA 2I8NA 5CQ3A 5A81A 4J3IA 5F61A 3JVKA 2RFJA 5LJ1A 5FE3A 5FE5A 4O71A 5DFCA 4WIVA 3SVGA 4QEUA 5DY7A 4TQNA 3O37A 5EWWA 5IBNA 5A5SA 4QEVA 5TCMA 4UIYA 5ACYA 4QEWA 4LYSA 3IU5A 5I7XA 5FE8A 2H60A 4NS5A 4E96A 2MJVB 4BW2A 3P1FA 4UITA 2DKWA 5CU8A 5H1VA 4NQMA 3QZVA 5DYUA 3LQIA 5EWCA 5D0CA 5L99A 4QC3A 5K29A 4YH4A 5CRZA 5I7YA 4HBYA 4ALGA 4UYHA 5DW1A 3UV5A 4IR3A 4YABA 5F25A 4TZ2A 4XUBA 4HBVA 5EM3A 5EK9A 4TTEA 3P1DA 5KHMA 5FH7A 5ENCA 4O78A 4LRGA 4HXPA 2WP2A 5ETDA 2FSAA 2E3KA 4MR5A 5FH6A 2D82A 5D3JA 5ENFA 5DKHA 5KU3A 3MB3A 4IR6A 4NRAA 3G0LA 3MQMA 4QSPA 2RNWA 4KV1A 4NYVA 5II2A 5DLZA 2DVVA 5EPSA 1JSPB 5FB0A 2GRCA 5D3TA 5FFYA 5LJ0A 3MUKA 4IORA 2R0SA 4Y03A 5CQTA 5A5QA 5E9VA 2DVRA 5F60A 2OSSA 5AD2A 4N4IA 5KO4A 5KTWA 5DKCA 5CQ4A 4UYFB 4YY4A 5ENBA 4PY6A 3U5PA 2YELA 4Z1SA 4WHWA 4UIVA 3ZYUA 5C4QA 2YDWA 3P5OA 5CPEA 5IGMA 4NR6A 5A83A 4IR4A 4LZSA 4TS8A 4CUUA 5C89A 3JVMA 4O7CA 5FFWA 4CURA 4XY9A 4OUFA 5F2PA 2RI7A 5I40A 5F36A 3U5JA 1EQFA 4YYIA 3JVLA 4NYXA 4QZSA 4PKLA 4QSTA 4RVRA 3I3JA 5CUBA 5FE7A 4LYIA 4LZ2A 5CP5A 5LVQA 4UYFA 3O34A 4TZ8A 5D26A 5JI8A 4IOOA 5I89A 5E9IA 5I86A 5A5OA 2KTBB 5ENIA 3UV2A 5CQ8A 5H1UA 5EISA 4LDFA 4LR6A 2F6JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NYWA 5EPBA 3LXJA 4LZRA 4QSVA 5E3DA 5E74A 5A5PA 4Q0OA 4TT4A 5E3GA 4A9IA 5DYXA 4J0SA 5BT3A 5HLSA 5J0DA 3FKMX 3LQHA 4BW3A 2G4AA 4TU6A 4QSQA 5C7NA 4TU4A 5D3RA 5LUUA 3S92A 4MENA 4CUSA 5A85A 5I88A 4MEQA 4HXRA 5HELA 3U5MA 2DWWA 4YBTA 4YYKA 3U5LA 5C87A 4UYDA 5KTUA 5EU1A 4CUPA 5DYCA 5FE6A 5DW2A 3LJWA 5D24A 4PTBA 5F3AA 5D7XA 4BHWA 5I1QA 4QB3A 4WHUA 4IOQA 4OGIA 4AKNA 4NQNA 5DX4A 4O75A 5L8TA 3G0JA 3VKHA 5DFBA 5F1LA 3AQAA 1N72A 5FG5A 4N3WA 5E9KA 3MB4A 5CTLA 4QNSA 4QR4A 5FG4A 4YYHA 4NRCA 4Z1QA 4CLBA 5EQ1A 4J0RA 3TLPA 4HXNA 4C67A 4NR9A 4Z93A 5EV9A 2YQDA 3DWYA 1JM4B 5CQAA 4AKHA 4A9FA 5D25A 5AD3A 5FE2A 5CY9A 4A9EA 3MULA 3SVFA 5BT5A 3U5OA 4QSRA 3UVXA 4QBMA 5FFVA 2E7OA 4YBSA 5D3NA 4UIUA 5E9MA 4NR4A 4YY6A 3U5NA 5CUAA 5EGUA 4O7FA 2YEMA 1E6IA 4XYAA 4NR5A 4Q0NA 3HMFA 5E73A 3UVWA 4NUEA 5HFRA 4O7EA 2DATA 4YH3A 3UVYA 5FE1A 2YYNA 5CUDA 3D7CA 2D9EA 3O35A 5IIDA 5E9LA 2L84A 5CRMA 5H85A 5AMFA 2LSPB 5HRVA 5EA1A 5HRXA 4QY4A 5E9YA 4BJXA 1WUGA 5HQ6A 4A9JA 4KCXA 5LKUA 4A9HA 5ENHA 5TB6A 4YYNA 2WP1A 4YBMA 5FG6A 3D1BA 3RCWA 4UIWA 5A5RA 4O72A 5G4RA 5LKTA 3MXFA 2DVQA 2RNYA 5BT4A 5CUCA 5EI4A 4HXMA 5ENJA 5LVRA 3Q2FA 2R0VA 4A9MA 4MEOA 3NXBA 3DAIA 4LC2A 2N9GA 4HBWA 4PS5A 2L5EA 2I7KA 5HEMA 4O74A 5FB1A 5LKZA 4QYLA 5CS8A 4QR3A 4FLPA 3IU6A 2EJNA 4YYGA 4N4GA 2R0YA 4O77A 5ETBA 1ZS5A 5DFDA 5F63A 4X2IA 4OGJA 4QUTA 5CGPA 4QC1A 4CFLA 5F1HA 5EWVA 5ENEA 5A5NA 5DBMA 4O7AA 4MR3A 4QSXA 5HJCA 4A9KA 5IGNA 5FE4A 5HQ7A 5L97A 4O76A 3LQJA 5E7DA 3UW9A 5CUEA 5D3HA 2DVSA 4O70A 5IGKA 4A9LA 3GG3A 1ZKRA 5HFQA 5CFWA 4DONA 4CL9A 4HXOA 5HRWA 3ERRA 5HQ5A 4YK0A 5EICA 5CUGA 5LKXA 4QR5A 5CZGA 5KTXA 4Z6IA 4YC9A 4O7BA 5C8GA 5II1A 4XUAA 4MR6A 5EPRA 5CQ5A 3HMHA 4HXKA 1WUMA 4ZC9A 3S91A 1F68A 4XY8A 3HMEA 5EVAA 4CUTA 4AKGA 4NXJA 4QSSA 4PCIA 5CQ7A 3Q2EA 4F3IA 4YYMA 4YATA 5I80A 5A82A 4PCEA 4MEPA 3AADA 2L85A 5EP7A 5L96A 5C85A 2YW5A 4HBXA 4YAXA 5G4SA 5D3LA 3UVDA 4N4HA 5FDZA 4NR8A 5DKDA 5LJ2A 5I29A 1X0JA 5D3SA 5H1TA 4ZQLA 2RNXA 2RO1A 5F5ZA 2R10A 5IGLA 4QSWA 2RS9B 4YADA 3U5KA 4YYDA 4UIXA 4QYDA 4HXLA 5EWDA 4GPJA 4ALHA 5E0RA 4BW1A 4CFKA 5DYAA 4NUDA 4AKIA 3O33A 3O36A 5FE0A 4YYJA 5HM0A 3K2JA 4NUCA 4QSUA 4CUQA 2YEKA 4LYWA 2NXBA 4C66A 5DLXA 3QZSA 5F62A 5CQ6A 3QZTA 3UV4A 4A9OA 3ONIA 5FBXA 5HCLA 4UIZA 4ZW1A 5FE9A 2OUOA 4NRBA 5EWHA 5JWMA 4BW4A 5A7CA 2OO1A 4TT6A 5AMEA 4A9NA 4UYEA 5I83A 5IG6A 2E7NA 5L8UA 4J1PA 3JVJA 2F6NA 4UYGA 5L98A 4Z6HA 4TYLA 5HENA 4N4FA 4MR4A 4TT2A 4IR5A 4HXSA 4KV4A 3SVHA 4NR7A 4QUUA 5FH8A 3P1EA 3P1CA 5COIA 5D3PA 5ENGA 2I8NA 5CQ3A 5A81A 4J3IA 5F61A 3JVKA 2RFJA 5LJ1A 5FE3A 5FE5A 4O71A 5DFCA 4WIVA 3SVGA 4QEUA 5DY7A 4TQNA 3O37A 5EWWA 5IBNA 5A5SA 4QEVA 5TCMA 4UIYA 5ACYA 1PUOA 4QEWA 4LYSA 3IU5A 3D1DA 5I7XA 5FE8A 2H60A 4NS5A 4E96A 2MJVB 4BW2A 3P1FA 4UITA 2DKWA 5CU8A 4AI6A 5H1VA 4NQMA 3QZVA 5DYUA 3LQIA 5EWCA 5D0CA 5L99A 4QC3A 5K29A 4YH4A 5CRZA 5I7YA 4HBYA 4ALGA 4UYHA 5DW1A 3UV5A 4IR3A 4YABA 5F25A 4TZ2A 4XUBA 4HBVA 5EM3A 5EK9A 4TTEA 3P1DA 5KHMA 5FH7A 5ENCA 4O78A 4LRGA 4HXPA 2WP2A 5ETDA 2FSAA 2E3KA 4MR5A 5FH6A 2D82A 5D3JA 5ENFA 5DKHA 5KU3A 3MB3A 4IR6A 4NRAA 3G0LA 3MQMA 4QSPA 2RNWA 4KV1A 4NYVA 5II2A 5DLZA 2DVVA 5EPSA 1JSPB 5FB0A 2GRCA 5D3TA 5FFYA 5LJ0A 3MUKA 4IORA 2R0SA 4Y03A 5CQTA 5A5QA 5E9VA 2DVRA 5F60A 2OSSA 5AD2A 4N4IA 5KO4A 5KTWA 5DKCA 5CQ4A 4UYFB 4YY4A 5ENBA 4PY6A 3U5PA 2YELA 4Z1SA 4WHWA 4UIVA 3ZYUA 5C4QA 2YDWA 3P5OA 5CPEA 5IGMA 4NR6A 5A83A 4IR4A 4LZSA 4TS8A 4CUUA 5C89A 3JVMA 4O7CA 5FFWA 4CURA 4XY9A 4OUFA 5F2PA 2RI7A 5I40A 5F36A 3U5JA 1EQFA 4YYIA 3JVLA 4NYXA 4QZSA 4PKLA 4QSTA 4RVRA 3I3JA 5CUBA 5FE7A 4LYIA 4LZ2A 5CP5A 5LVQA 4UYFA 3VKGA 3O34A 4TZ8A 5D26A 5JI8A 4IOOA 5I89A 5E9IA 5I86A 5A5OA 2KTBB 5ENIA 3UV2A 5CQ8A 5H1UA 5EISA 4LDFA 4LR6A 2F6JA
chains in the Genus database with same CATH topology
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