4QSRA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) with bound mpd
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsrA00
4WHUA 4OUFA 2YEKA 2RI7A 4NRBA 5I83A 3O37A 5FDZA 4HBWA 4LYIA 5F36A 4YYNA 4Z93A 4QSRA 5I89A 5IIDA 5LVRA 1WUMA 4O70A 5ENJA 4IR4A 3JVJA 5CGPA 5ENBA 4UYHA 3IU6A 3MB3A 5FE1A 4O71A 4TU4A 4O7FA 4UYGA 4UIYA 3FKMX 5DW2A 3UW9A 4LR6A 5LVQA 2WP1A 4QEUA 4QSXA 4YYJA 4NQMA 5FE2A 4LZSA 4IOOA 5DY7A 5BT5A 5I88A 3K2JA 4WHWA 4Z1SA 5IBNA 3U5LA 4O74A 5E9IA 2D82A 5E73A 5H1UA 5C85A 5DKHA 4BW4A 4XUAA 4OGIA 4XYAA 2YW5A 4A9NA 5IGNA 3QZSA 5BT4A 3UVYA 4TT6A 4MR4A 5A5QA 5KTUA 4XY8A 4PCIA 2RS9B 5FE4A 3HMFA 5FH8A 3P5OA 5E3DA 1EQFA 5HQ7A 3O36A 2LSPB 5I7YA 5F25A 4HXSA 5CUBA 4IR6A 5CPEA 5ACYA 4N3WA 5F62A 4NUEA 5F60A 5FH6A 5D3RA 4QNSA 5ETBA 4QYLA 1N72A 5KO4A 4HXNA 5E9MA 5KTWA 5D0CA 2N9GA 4KV1A 5EWVA 2I7KA 4YC9A 3G0JA 4TS8A 4O7CA 4YY6A 4YYMA 5C4QA 4CL9A 4CUTA 4NUCA 5F1LA 4UIUA 2R0YA 3AADA 5CUAA 3S91A 4CFKA 4NRCA 4NRAA 4YYHA 4QBMA 4BJXA 4LRGA 5E9LA 4QUTA 5D25A 5HELA 2OSSA 4HBVA 4PKLA 5CQ3A 4UYDA 4QB3A 4WIVA 5EISA 1JM4B 4MR3A 5DLZA 5LKXA 4HXRA 5CZGA 4YBSA 4YYGA 4UYFA 2R0VA 4ZQLA 5HQ6A 2RNWA 5D3SA 5FBXA 5HCLA 3UVWA 4QR4A 4QZSA 2L5EA 4YBMA 4YYIA 4UIVA 4ZW1A 2RNXA 5FE7A 4BHWA 4YADA 5L98A 4XY9A 4O77A 5HQ5A 5ENGA 4YH4A 5I86A 5E3GA 5A83A 4J0SA 4O78A 4GPJA 3Q2FA 5E9YA 4MENA 5F61A 5L8TA 5IGMA 3P1EA 4QSWA 4ZC9A 4A9IA 4ALHA 4BW2A 4N4GA 2YEMA 5A5SA 4QEVA 3AQAA 4NXJA 3DWYA 5IGLA 4HXPA 4NQNA 3P1CA 3GG3A 4Z6HA 5DKCA 5HRWA 4LYSA 4DONA 5A5RA 5HFRA 3HMHA 5CQAA 4YH3A 5COIA 5FE8A 4YYDA 4O72A 5DYCA 2L85A 2L84A 4YK0A 2DVSA 5EK9A 4O7AA 5D3TA 5EVAA 5AMFA 4A9HA 4IR5A 5AD2A 2NXBA 3QZTA 5IGKA 5A7CA 4OGJA 1ZS5A 3JVMA 4LC2A 5FE9A 4Q0NA 3MXFA 5G4SA 5J0DA 4IORA 5LKTA 3SVGA 5C89A 4CUUA 4HBXA 5CRZA 5CUDA 4A9LA 3MUKA 5E9VA 4YABA 5CFWA 5F1HA 5C87A 5AD3A 4MR5A 4IOQA 5I1QA 5L99A 5II1A 5I80A 5EQ1A 1F68A 5EPSA 5ENEA 4NYXA 4AKNA 5EWCA 3ONIA 5ENFA 5I7XA 4BW1A 4MEQA 5HEMA 3JVKA 4YAXA 5KU3A 4UIXA 2YDWA 5EM3A 4A9JA 4TU6A 5LKUA 3UV2A 4NYWA 4QR3A 5DYXA 4CUQA 4A9MA 5EP7A 5LJ2A 4QSSA 5DBMA 4TZ8A 4Z6IA 5KHMA 5HLSA 4UITA 5E9KA 5D3PA 4TT4A 4YY4A 5LKZA 2OO1A 4O75A 4TQNA 3U5OA 5C7NA 5H1TA 4BW3A 4CUPA 4UYEA 5G4RA 5FG5A 4PCEA 3S92A 5EWHA 5D3LA 5F5ZA 5LJ0A 3O33A 3IU5A 2WP2A 5A5OA 5L8UA 1JSPB 4A9EA 2R10A 3LJWA 5EGUA 5DLXA 4LZRA 4QC3A 2D9EA 2RNYA 4N4HA 4PY6A 2DVRA 5L97A 4ALGA 4CFLA 5HENA 2YYNA 4O76A 4HXLA 5CTLA 4QR5A 4YATA 2KTBB 3UVXA 3SVHA 4HBYA 5ETDA 1E6IA 5A85A 5FFYA 3LXJA 4PS5A 4QSQA 3G0LA 5E7DA 2G4AA 4YYKA 5DYUA 4F3IA 2DKWA 5FE3A 2DVVA 3TLPA 3O35A 2E3KA 3U5KA 2FSAA 3RCWA 4LYWA 5CS8A 5FE0A 4Y03A 5TCMA 3Q2EA 3U5JA 4QC1A 5DX4A 5II2A 5EWWA 4TZ2A 2OUOA 5FE6A 3HMEA 5BT3A 4C66A 4QSUA 4QSVA 4UIWA 4J0RA 5EV9A 4UIZA 4PTBA 5E0RA 3NXBA 2DVQA 2GRCA 5CY9A 5H1VA 4CLBA 5CUEA 5FFWA 2MJVB 4J1PA 5FH7A 5JWMA 3ZYUA 2E7OA 4J3IA 4QY4A 4NS5A 5D24A 2YQDA 5F63A 5A5PA 5EICA 2RFJA 5F2PA 4XUBA 3D7CA 4NUDA 5KTXA 5EPBA 5ENHA 4CUSA 5A5NA 4LZ2A 4A9FA 4HXOA 5D3NA 5DFBA 5FFVA 4Q0OA 3U5NA 5CQTA 3LQHA 3LQIA 4N4FA 2YELA 5JI8A 4UYFB 3MULA 3DAIA 4MEOA 4MEPA 3UV5A 2E7NA 2DATA 4QYDA 4FLPA 4LDFA 5HM0A 3LQJA 5FB0A 5IG6A 5CQ7A 3SVFA 4O7BA 2F6JA 2I8NA 4E96A 5HFQA 2DWWA 1X0JA 5EU1A 5A81A 5ENIA 4NR4A 5D26A 4C67A 3P1DA 5CU8A 4YBTA 5CQ6A 2RO1A 4QSTA 3MB4A 3JVLA 5CQ8A 5LJ1A 5CQ5A 5CRMA 4KCXA 5L96A 5TB6A 5F3AA 4A9KA 1WUGA 3MQMA 2F6NA 4IR3A 3P1FA 5CQ4A 4KV4A 5A82A 5FG4A 5LUUA 5ENCA 2H60A 5DFCA 4NR5A 5EPRA 4NYVA 5K29A 4NR6A 4O7EA 4TT2A 5FG6A 5DKDA 5D3JA 5C8GA 4N4IA 4NR7A 3QZVA 5CUCA 5E74A 5FE5A 4QSPA 3U5MA 3UV4A 4MR6A 5HJCA 4QUUA 5D7XA 5FB1A 4NR8A 4CURA 5DFDA 4NR9A 4HXKA 4A9OA 4QEWA 5EI4A 5CUGA 5I29A 5D3HA 3I3JA 5HRVA 4TYLA 4TTEA 5DW1A 3U5PA 3O34A 5EA1A 4HXMA 2R0SA 5EWDA 4Z1QA 5H85A 4X2IA 5AMEA 5CP5A 5I40A 4RVRA 5HRXA 5DYAA 3UVDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WHUA 4OUFA 2YEKA 2RI7A 4NRBA 5I83A 3O37A 5FDZA 4HBWA 4LYIA 5F36A 4YYNA 1ZKRA 1PUOA 4Z93A 4QSRA 5I89A 5IIDA 5LVRA 1WUMA 4O70A 5ENJA 4IR4A 3JVJA 5CGPA 5ENBA 4UYHA 3IU6A 3MB3A 5FE1A 4O71A 4TU4A 4O7FA 4UYGA 4UIYA 3FKMX 5DW2A 3UW9A 4LR6A 5LVQA 2WP1A 4QEUA 4QSXA 4YYJA 4NQMA 5FE2A 4LZSA 4IOOA 5DY7A 5BT5A 5I88A 3K2JA 4WHWA 4Z1SA 5IBNA 3U5LA 4O74A 5E9IA 2D82A 5E73A 5H1UA 5C85A 5DKHA 4BW4A 4XUAA 4OGIA 4XYAA 2YW5A 4A9NA 3VKGA 5IGNA 3QZSA 5BT4A 3UVYA 4TT6A 4MR4A 5A5QA 5KTUA 4XY8A 4PCIA 2RS9B 5FE4A 3HMFA 5FH8A 3P5OA 5E3DA 1EQFA 5HQ7A 3O36A 2LSPB 5I7YA 5F25A 4HXSA 5CUBA 4IR6A 5CPEA 5ACYA 4N3WA 5F62A 4NUEA 5F60A 5FH6A 5D3RA 4QNSA 5ETBA 4QYLA 1N72A 5KO4A 4HXNA 5E9MA 5KTWA 5D0CA 2N9GA 4KV1A 5EWVA 2I7KA 4YC9A 3G0JA 4TS8A 4O7CA 4YY6A 4YYMA 5C4QA 4CL9A 4CUTA 4NUCA 5F1LA 4UIUA 2R0YA 3AADA 5CUAA 3S91A 4CFKA 4NRCA 4NRAA 4YYHA 4QBMA 4BJXA 4LRGA 5E9LA 4QUTA 5D25A 5HELA 2OSSA 4HBVA 4PKLA 5CQ3A 4UYDA 4QB3A 4WIVA 5EISA 1JM4B 4MR3A 5DLZA 5LKXA 4HXRA 5CZGA 4YBSA 4YYGA 4UYFA 2R0VA 4ZQLA 5HQ6A 2RNWA 5D3SA 5FBXA 5HCLA 3UVWA 4QR4A 4QZSA 2L5EA 4YBMA 4YYIA 4UIVA 4ZW1A 2RNXA 5FE7A 4BHWA 4YADA 4AI6A 5L98A 4XY9A 4O77A 5HQ5A 5ENGA 4YH4A 5I86A 5E3GA 5A83A 4J0SA 4O78A 4GPJA 3Q2FA 5E9YA 4MENA 5F61A 5L8TA 5IGMA 3P1EA 4QSWA 4ZC9A 4A9IA 4ALHA 4BW2A 4N4GA 2YEMA 5A5SA 4QEVA 3AQAA 4NXJA 3DWYA 5IGLA 4AKIA 4HXPA 4NQNA 3P1CA 3GG3A 4Z6HA 5DKCA 5HRWA 4LYSA 4DONA 5A5RA 5HFRA 3HMHA 5CQAA 4YH3A 5COIA 5FE8A 4YYDA 4O72A 5DYCA 2L85A 2L84A 4YK0A 2DVSA 5EK9A 4O7AA 5D3TA 5EVAA 5AMFA 4A9HA 4IR5A 5AD2A 2NXBA 3QZTA 5IGKA 5A7CA 4OGJA 1ZS5A 3JVMA 4LC2A 5FE9A 4Q0NA 3MXFA 5G4SA 5J0DA 4IORA 5LKTA 3SVGA 5C89A 4CUUA 4HBXA 5CRZA 5CUDA 4A9LA 3MUKA 5E9VA 4YABA 5CFWA 5F1HA 5C87A 5AD3A 4MR5A 4IOQA 5I1QA 5L99A 5II1A 5I80A 5EQ1A 1F68A 5EPSA 5ENEA 4NYXA 4AKNA 5EWCA 3ONIA 5ENFA 5I7XA 4BW1A 3D1BA 4MEQA 5HEMA 3JVKA 4YAXA 5KU3A 4UIXA 2YDWA 5EM3A 4A9JA 4TU6A 5LKUA 3UV2A 4NYWA 2EJNA 4QR3A 5DYXA 4CUQA 4A9MA 5EP7A 5LJ2A 4QSSA 5DBMA 4TZ8A 4Z6IA 5KHMA 5HLSA 4UITA 5E9KA 5D3PA 4TT4A 4YY4A 5LKZA 2OO1A 4O75A 4TQNA 3U5OA 5C7NA 5H1TA 3D1DA 4BW3A 4CUPA 4UYEA 5G4RA 5FG5A 4PCEA 3S92A 5EWHA 5D3LA 5F5ZA 5LJ0A 3O33A 3IU5A 2WP2A 5A5OA 5L8UA 1JSPB 4A9EA 2R10A 3LJWA 5EGUA 5DLXA 4LZRA 4QC3A 2D9EA 2RNYA 4N4HA 4PY6A 2DVRA 5L97A 4ALGA 4CFLA 5HENA 2YYNA 4O76A 4HXLA 5CTLA 4QR5A 4YATA 2KTBB 3UVXA 3SVHA 4HBYA 5ETDA 1E6IA 5A85A 5FFYA 3LXJA 4PS5A 4QSQA 3G0LA 5E7DA 2G4AA 4YYKA 5DYUA 4F3IA 2DKWA 5FE3A 2DVVA 3TLPA 3O35A 2E3KA 3U5KA 2FSAA 3RCWA 4LYWA 5CS8A 5FE0A 4Y03A 5TCMA 3Q2EA 3U5JA 4QC1A 5DX4A 5II2A 5EWWA 4TZ2A 2OUOA 5FE6A 3HMEA 5BT3A 4C66A 4QSUA 4QSVA 4UIWA 4J0RA 5EV9A 4UIZA 4PTBA 5E0RA 3NXBA 2DVQA 2GRCA 4AKHA 5CY9A 5H1VA 4CLBA 5CUEA 5FFWA 2MJVB 4J1PA 5FH7A 5JWMA 3ZYUA 2E7OA 4J3IA 4QY4A 4NS5A 5D24A 2YQDA 5F63A 5A5PA 5EICA 2RFJA 5F2PA 4XUBA 3ERRA 3D7CA 4NUDA 5KTXA 5EPBA 5ENHA 4CUSA 5A5NA 4LZ2A 4A9FA 4HXOA 5D3NA 5DFBA 5FFVA 4Q0OA 3U5NA 5CQTA 3LQHA 3LQIA 4N4FA 2YELA 5JI8A 4UYFB 3MULA 3DAIA 4MEOA 4MEPA 3UV5A 2E7NA 2DATA 4QYDA 4FLPA 4LDFA 5HM0A 3LQJA 5FB0A 5IG6A 5CQ7A 3SVFA 4O7BA 2F6JA 2I8NA 4E96A 5HFQA 2DWWA 1X0JA 5EU1A 5A81A 5ENIA 4NR4A 5D26A 4C67A 3P1DA 5CU8A 4YBTA 5CQ6A 2RO1A 4QSTA 3MB4A 3JVLA 5CQ8A 5LJ1A 5CQ5A 5CRMA 4KCXA 5L96A 5TB6A 5F3AA 4A9KA 1WUGA 3MQMA 2F6NA 4IR3A 3P1FA 5CQ4A 4KV4A 5A82A 5FG4A 5LUUA 5ENCA 2H60A 5DFCA 4NR5A 5EPRA 4NYVA 5K29A 4NR6A 4O7EA 4TT2A 5FG6A 5DKDA 5D3JA 5C8GA 4N4IA 4NR7A 3QZVA 5CUCA 5E74A 5FE5A 4QSPA 3U5MA 3UV4A 4MR6A 5HJCA 4QUUA 5D7XA 5FB1A 4NR8A 4CURA 5DFDA 4NR9A 4HXKA 4A9OA 4QEWA 5EI4A 3VKHA 5CUGA 5I29A 5D3HA 3I3JA 5HRVA 4TYLA 4TTEA 5DW1A 3U5PA 3O34A 4AKGA 5EA1A 4HXMA 2R0SA 5EWDA 4Z1QA 5H85A 4X2IA 5AMEA 5CP5A 5I40A 4RVRA 5HRXA 5DYAA 3UVDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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