3DWYA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 40
structure length 114
sequence length 114
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2008-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3dwyA00
4LDFA 4QNSA 5LKTA 4TT2A 3Q2EA 5I29A 4TS8A 5CY9A 5FE8A 4LZ2A 5CGPA 4NYVA 5I89A 3U5MA 4NR8A 5L96A 2E7OA 5FB0A 5CQTA 2F6JA 4UYEA 5DKDA 4YATA 3LXJA 5CRMA 2KTBB 3JVJA 3ONIA 3P1CA 4QSXA 5A82A 5A83A 4PCIA 4IR6A 5FG4A 4NQMA 4UYDA 4MEPA 4NRCA 4TT4A 4YADA 4YC9A 4WIVA 4YYNA 5F3AA 5FE7A 5HELA 5D3SA 5ENEA 5FG5A 5H1VA 5KTWA 5LJ1A 4HXMA 2DKWA 4KCXA 2LSPB 2YEKA 4N4FA 5LJ0A 1WUMA 4XY9A 5F2PA 5CUBA 4O7FA 4XUAA 3U5OA 4CUTA 5ACYA 5FE0A 5EWDA 5FE6A 4O74A 4CURA 5L8UA 3U5LA 4O70A 5FE2A 3JVMA 5EWVA 5DW2A 5FB1A 5KU3A 5A5RA 2YW5A 5DYXA 4LR6A 4YAXA 5KTUA 4PS5A 5I40A 4O7BA 5D3HA 5LKUA 5A85A 4PY6A 4MR3A 1E6IA 2RNWA 4OGJA 5CUAA 4XY8A 4YABA 3P1FA 4HXPA 4WHUA 4A9HA 5II1A 2YDWA 5EPSA 5KHMA 5C87A 4BW1A 4QEWA 4IOQA 5FG6A 5D7XA 3LQHA 5JI8A 2OO1A 3QZVA 4QR4A 4UIVA 5IGNA 2E3KA 5CU8A 5CUEA 5CUDA 4FLPA 4MEQA 4HXNA 4J0SA 5FBXA 4BW2A 5FFWA 5DFDA 4ALGA 5CUCA 5FH8A 4Q0NA 5CUGA 4TU6A 4O7AA 4CFLA 4O7EA 5CPEA 5A5NA 4O7CA 5DLZA 3LQJA 4UIZA 4PCEA 5DYUA 5D3LA 5E3DA 5ENGA 5EK9A 2DWWA 4YYKA 4QEVA 5DBMA 5E9VA 5HQ5A 3DWYA 5L8TA 2YYNA 4IOOA 5FH6A 5FE1A 5E7DA 4QYDA 5HRWA 4IR5A 5ENFA 5F5ZA 4XYAA 5HRXA 4O75A 4UIUA 5H85A 4HXSA 5CQ4A 2D9EA 4QY4A 5IIDA 5LKXA 5D24A 4HBWA 5C4QA 5LUUA 3O34A 4QYLA 4A9JA 5CQAA 4HXOA 5G4SA 4CLBA 2L5EA 4XUBA 5DY7A 2GRCA 2G4AA 5I86A 2R0VA 5CRZA 3O33A 4LC2A 3HMEA 3NXBA 3QZSA 4YH4A 5IGLA 5LKZA 5D3TA 4A9LA 4HXLA 4QSSA 5H1UA 3Q2FA 4UYFA 5CQ7A 3JVKA 4QUUA 5ENCA 4MENA 5HRVA 4X2IA 5BT3A 5EP7A 4NYWA 3P5OA 4WHWA 5KO4A 3LJWA 4NYXA 3MULA 5DX4A 2WP1A 5DFBA 5HEMA 4NUCA 5FE9A 3MXFA 5ENBA 5H1TA 4YBTA 2R10A 5EISA 5DYCA 3SVHA 2RI7A 4NRAA 5DKHA 2L84A 3TLPA 5DFCA 2RS9B 3UVXA 5CQ6A 4BW3A 3IU6A 5EV9A 1JM4B 4A9IA 5F61A 5A5OA 2I7KA 4QSWA 4TT6A 4QEUA 5HFQA 4UYFB 3SVGA 5EPBA 1WUGA 3GG3A 4YYHA 4YBMA 5EA1A 4UYHA 2NXBA 3K2JA 4UYGA 5JWMA 3QZTA 5E3GA 4CUSA 4QSRA 4PKLA 3AADA 5HQ6A 4DONA 5F1LA 4LZRA 4NR6A 4NR9A 4YH3A 4F3IA 5II2A 2YEMA 5I88A 3MUKA 5C7NA 4CL9A 4NQNA 1F68A 3UVYA 5AMFA 5E9IA 4Z1SA 5CFWA 4CFKA 5ETDA 2DATA 2FSAA 3HMFA 4MR5A 5E9KA 5FE4A 5I7XA 3U5JA 4ZC9A 4ZW1A 5HM0A 5IGKA 4UITA 5ENHA 3UV2A 2DVRA 5EVAA 4ALHA 4YYMA 5HENA 5C89A 5EGUA 5CP5A 5LJ2A 1N72A 4IR4A 4NR5A 4MEOA 4NR4A 4TU4A 4A9KA 4MR6A 4YY4A 3RCWA 5IGMA 5EPRA 1ZS5A 4J3IA 5F1HA 2R0YA 5D3PA 3IU5A 5AMEA 5LVQA 4HXRA 5HCLA 4N4GA 4QC1A 4RVRA 1EQFA 5D3RA 4QC3A 5A5PA 4HBXA 5E9YA 5FFYA 4BJXA 2E7NA 4NXJA 4QSVA 5C8GA 3U5KA 3UW9A 4A9EA 5KTXA 3LQIA 2OUOA 4QSTA 5DW1A 5I7YA 5I1QA 4YYJA 5EM3A 5E74A 4GPJA 5EU1A 4LYIA 4HBYA 4PTBA 3U5NA 4UIYA 5E0RA 4QSPA 5FFVA 2MJVB 5EI4A 5FE5A 5D26A 2RNYA 5I83A 2H60A 4NUEA 2WP2A 3HMHA 3DAIA 5DKCA 3SVFA 4OGIA 5I80A 5D25A 2RFJA 4AKNA 4HBVA 1X0JA 4QR3A 3JVLA 4QB3A 4UIWA 4O72A 4UIXA 4YYDA 5A7CA 2F6NA 4IR3A 4YYGA 5CQ3A 5COIA 4N3WA 4J0RA 4C66A 4Z6IA 5FH7A 4ZQLA 5HJCA 5CZGA 3U5PA 5ETBA 5DLXA 4MR4A 2R0SA 4O76A 5ENIA 5AD3A 5TB6A 4TTEA 4YBSA 4TYLA 3UVWA 2D82A 5EWWA 5F25A 4NS5A 3O35A 5E73A 5CQ5A 4NUDA 5K29A 4A9OA 4TQNA 4J1PA 4BW4A 4LZSA 3P1DA 3AQAA 4YYIA 4QSUA 5DYAA 4C67A 4QBMA 4E96A 3S91A 4NRBA 2OSSA 4O77A 3MB4A 4N4HA 4QZSA 4O71A 4CUPA 5IBNA 4Z6HA 5CQ8A 5ENJA 2YQDA 4CUQA 2N9GA 4TZ8A 5HLSA 5C85A 2DVQA 3UV4A 4QUTA 4IORA 4KV4A 4OUFA 4YK0A 4NR7A 5EWCA 3O36A 4A9NA 5E9LA 5HQ7A 5CTLA 5A5QA 4LYSA 4Z1QA 5D3JA 4BHWA 3I3JA 4CUUA 2L85A 5L98A 3UV5A 1JSPB 2I8NA 5BT4A 5FDZA 5BT5A 4YY6A 4LRGA 5E9MA 5F62A 2DVSA 4QR5A 5TCMA 5A5SA 5AD2A 3FKMX 4KV1A 3G0LA 4TZ2A 4A9FA 3G0JA 3O37A 4Y03A 5L99A 5HFRA 4A9MA 3S92A 5F36A 4LYWA 5FE3A 5EQ1A 5EWHA 3ZYUA 2YELA 3MB3A 2DVVA 5LVRA 5D3NA 5J0DA 5G4RA 5IG6A 4Z93A 4HXKA 5F63A 3UVDA 5D0CA 5F60A 4QSQA 2RO1A 3P1EA 5EICA 5CS8A 3MQMA 4N4IA 2RNXA 3D7CA 4O78A 5L97A 5A81A 4Q0OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LDFA 4QNSA 5LKTA 4TT2A 3Q2EA 5I29A 4TS8A 5CY9A 5FE8A 4LZ2A 1PUOA 5CGPA 4NYVA 5I89A 3U5MA 4NR8A 5L96A 2E7OA 5FB0A 5CQTA 2F6JA 4UYEA 5DKDA 4YATA 3LXJA 5CRMA 2KTBB 3JVJA 3ONIA 3P1CA 4QSXA 5A82A 5A83A 4PCIA 4IR6A 5FG4A 4NQMA 4UYDA 4MEPA 4NRCA 4TT4A 4YADA 4YC9A 4WIVA 4YYNA 5F3AA 5FE7A 5HELA 5D3SA 5ENEA 5FG5A 5H1VA 5KTWA 5LJ1A 4HXMA 2DKWA 4KCXA 2LSPB 2YEKA 4N4FA 5LJ0A 1WUMA 4XY9A 5F2PA 5CUBA 4O7FA 4XUAA 3U5OA 4CUTA 5ACYA 5FE0A 5EWDA 5FE6A 4O74A 4CURA 5L8UA 3U5LA 4O70A 5FE2A 3JVMA 5EWVA 5DW2A 5FB1A 5KU3A 5A5RA 2YW5A 5DYXA 4LR6A 4YAXA 5KTUA 4PS5A 5I40A 4O7BA 5D3HA 5LKUA 5A85A 4PY6A 4MR3A 1E6IA 2RNWA 4OGJA 5CUAA 4XY8A 4YABA 3P1FA 4HXPA 4WHUA 4AI6A 4A9HA 5II1A 2YDWA 5EPSA 5KHMA 5C87A 4BW1A 4QEWA 4IOQA 5FG6A 5D7XA 3LQHA 5JI8A 2OO1A 3QZVA 4QR4A 4UIVA 5IGNA 2E3KA 5CU8A 5CUEA 5CUDA 4FLPA 4MEQA 4HXNA 4J0SA 5FBXA 4BW2A 5FFWA 5DFDA 4ALGA 5CUCA 5FH8A 4Q0NA 5CUGA 4TU6A 4O7AA 4CFLA 4O7EA 5CPEA 5A5NA 4O7CA 5DLZA 3LQJA 4UIZA 4PCEA 5DYUA 5D3LA 5E3DA 5ENGA 5EK9A 2DWWA 4YYKA 4QEVA 5DBMA 5E9VA 5HQ5A 3DWYA 5L8TA 2YYNA 4IOOA 5FH6A 5FE1A 5E7DA 4QYDA 5HRWA 4IR5A 5ENFA 5F5ZA 4XYAA 5HRXA 4O75A 4UIUA 5H85A 4HXSA 5CQ4A 2D9EA 4QY4A 5IIDA 5LKXA 5D24A 4HBWA 5C4QA 5LUUA 3O34A 4QYLA 4A9JA 5CQAA 4HXOA 5G4SA 4CLBA 2L5EA 4XUBA 5DY7A 2GRCA 2G4AA 5I86A 2R0VA 5CRZA 3O33A 4LC2A 3HMEA 3NXBA 3QZSA 4YH4A 5IGLA 5LKZA 5D3TA 4A9LA 4HXLA 4QSSA 5H1UA 3Q2FA 4UYFA 5CQ7A 3JVKA 4QUUA 5ENCA 4MENA 5HRVA 4X2IA 5BT3A 5EP7A 4NYWA 3P5OA 4WHWA 5KO4A 3LJWA 4NYXA 3MULA 5DX4A 2WP1A 5DFBA 5HEMA 4NUCA 5FE9A 4AKHA 3MXFA 5ENBA 5H1TA 4YBTA 2R10A 5EISA 5DYCA 3SVHA 2RI7A 4NRAA 5DKHA 2L84A 3TLPA 5DFCA 2RS9B 3UVXA 4AKGA 5CQ6A 4BW3A 3IU6A 5EV9A 1JM4B 4A9IA 5F61A 5A5OA 2I7KA 4QSWA 4TT6A 4QEUA 5HFQA 4UYFB 3SVGA 5EPBA 1WUGA 3GG3A 4YYHA 4YBMA 5EA1A 4UYHA 2NXBA 3K2JA 4UYGA 5JWMA 3QZTA 5E3GA 4CUSA 4QSRA 4PKLA 3AADA 5HQ6A 4DONA 5F1LA 4LZRA 4NR6A 4NR9A 4YH3A 4F3IA 5II2A 2YEMA 5I88A 3MUKA 3VKHA 5C7NA 4CL9A 3ERRA 4NQNA 1F68A 3UVYA 5AMFA 5E9IA 4Z1SA 5CFWA 4CFKA 5ETDA 2DATA 2FSAA 3HMFA 4MR5A 5E9KA 5FE4A 5I7XA 3U5JA 4ZC9A 4ZW1A 5HM0A 5IGKA 4UITA 5ENHA 3UV2A 2DVRA 5EVAA 4ALHA 4YYMA 5HENA 5C89A 5EGUA 5CP5A 5LJ2A 1N72A 4IR4A 4NR5A 4MEOA 4NR4A 4TU4A 4A9KA 4MR6A 4YY4A 2EJNA 3RCWA 5IGMA 5EPRA 1ZS5A 4J3IA 5F1HA 2R0YA 5D3PA 3IU5A 5AMEA 5LVQA 4HXRA 5HCLA 4N4GA 4QC1A 4RVRA 1EQFA 5D3RA 4QC3A 5A5PA 4HBXA 5E9YA 5FFYA 4BJXA 2E7NA 4NXJA 4QSVA 5C8GA 3U5KA 3UW9A 4A9EA 5KTXA 3LQIA 2OUOA 4QSTA 5DW1A 5I7YA 5I1QA 4YYJA 5EM3A 5E74A 4GPJA 5EU1A 4LYIA 4HBYA 4PTBA 3U5NA 4UIYA 5E0RA 4QSPA 5FFVA 2MJVB 5EI4A 5FE5A 5D26A 2RNYA 5I83A 2H60A 4NUEA 2WP2A 3HMHA 3DAIA 5DKCA 3SVFA 4OGIA 5I80A 5D25A 2RFJA 4AKNA 4HBVA 1X0JA 4QR3A 3JVLA 4QB3A 4UIWA 4O72A 4UIXA 4YYDA 5A7CA 2F6NA 4IR3A 3D1DA 4YYGA 5CQ3A 5COIA 1ZKRA 4N3WA 4J0RA 4C66A 4Z6IA 5FH7A 4ZQLA 5HJCA 5CZGA 3U5PA 5ETBA 5DLXA 4MR4A 2R0SA 4O76A 5ENIA 5AD3A 5TB6A 4TTEA 4YBSA 4TYLA 3UVWA 2D82A 5EWWA 5F25A 4NS5A 3O35A 5E73A 5CQ5A 4NUDA 5K29A 4A9OA 4TQNA 4J1PA 4BW4A 4AKIA 4LZSA 3P1DA 3AQAA 4YYIA 4QSUA 5DYAA 4C67A 4QBMA 4E96A 3S91A 4NRBA 2OSSA 4O77A 3MB4A 4N4HA 4QZSA 4O71A 4CUPA 5IBNA 4Z6HA 5CQ8A 5ENJA 2YQDA 4CUQA 2N9GA 4TZ8A 5HLSA 5C85A 2DVQA 3UV4A 4QUTA 4IORA 4KV4A 4OUFA 4YK0A 4NR7A 5EWCA 3O36A 4A9NA 5E9LA 5HQ7A 5CTLA 5A5QA 4LYSA 4Z1QA 5D3JA 4BHWA 3I3JA 4CUUA 2L85A 5L98A 3UV5A 1JSPB 2I8NA 5BT4A 5FDZA 5BT5A 4YY6A 4LRGA 5E9MA 5F62A 2DVSA 4QR5A 5TCMA 5A5SA 5AD2A 3FKMX 4KV1A 3G0LA 4TZ2A 4A9FA 3G0JA 3O37A 4Y03A 5L99A 5HFRA 4A9MA 3VKGA 3S92A 5F36A 4LYWA 5FE3A 5EQ1A 5EWHA 3ZYUA 2YELA 3MB3A 2DVVA 5LVRA 5D3NA 5J0DA 5G4RA 5IG6A 4Z93A 3D1BA 4HXKA 5F63A 3UVDA 5D0CA 5F60A 4QSQA 2RO1A 3P1EA 5EICA 5CS8A 3MQMA 4N4IA 2RNXA 3D7CA 4O78A 5L97A 5A81A 4Q0OA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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