4O72A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with nu7441
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o72A01
1ZS5A 3RCWA 5I89A 5ENHA 2YELA 4LDFA 2WP2A 5F61A 5LKTA 5FB1A 4QR3A 5A7CA 3D7CA 5FE3A 3O37A 5DKHA 4UYFA 5E9IA 5D3PA 3JVKA 3DWYA 3I3JA 3UV4A 5ENBA 4HBYA 4ZC9A 3QZTA 4NYXA 4UYFB 4LYIA 4ALHA 4A9HA 5LKUA 3UW9A 4BW1A 3P1EA 3U5KA 3UVXA 4HXNA 5II2A 3JVJA 4IOOA 4QSTA 4NQNA 4LRGA 5LVQA 3P1CA 5LKZA 2YQDA 4CURA 5HQ5A 3MULA 4QYDA 5F63A 3ZYUA 5C8GA 4CFLA 5HFQA 5BT3A 2F6NA 4UYHA 4O77A 5CQAA 5IGKA 5CUAA 4A9EA 4O7EA 2DWWA 5EU1A 4ZW1A 5FE8A 5H1UA 4OGJA 5HRWA 3Q2FA 4OUFA 2R0SA 4YC9A 5FE1A 4J1PA 5C85A 4TT4A 5DYXA 2DVQA 4YATA 5K29A 3LQJA 4UYDA 4QR4A 4UIWA 4HBVA 5ENEA 2G4AA 5CPEA 4O7FA 4QYLA 4A9MA 5EM3A 4RVRA 5CQTA 4CFKA 5KTWA 4YY4A 4UIUA 5C89A 5EA1A 5II1A 3LQHA 5CFWA 5A5OA 5CQ8A 5AD3A 4BW4A 5F62A 5ACYA 3IU6A 5I83A 5DW1A 2KTBB 5F2PA 4O75A 4PY6A 2MJVB 5TB6A 2GRCA 4UITA 5HELA 5HRVA 4PCIA 4QZSA 3JVLA 4YYKA 5I29A 2DATA 1EQFA 4UYGA 3QZVA 4NR6A 5L8TA 2NXBA 3UV2A 4HBXA 5ENGA 4N4GA 5I7YA 5EGUA 5LVRA 4QEWA 2D9EA 5CZGA 5CQ4A 5D25A 5F25A 5KHMA 5A5QA 3SVHA 4A9LA 4BW2A 4QSSA 4NUCA 4MENA 2YEMA 2DKWA 5LJ0A 5HFRA 4Z6HA 4O7BA 2RS9B 2YDWA 4A9KA 4HXKA 4QBMA 4AKNA 5CUGA 5A5RA 2YW5A 4HXOA 4IOQA 4XYAA 5E9MA 5E9YA 4YABA 5CS8A 3MUKA 5IGNA 4QC3A 4Y03A 5CQ3A 5EP7A 2LSPB 4CUTA 5EWVA 4YYIA 4QSVA 4YAXA 3HMFA 4NYVA 4QSUA 4UIXA 5EPRA 5HQ6A 3O36A 4MR6A 4QUTA 2N9GA 4NUEA 4XY9A 5CUEA 5F36A 2DVRA 4N4IA 4UIZA 5A5NA 5I86A 4TTEA 2WP1A 4YADA 5D3SA 4O74A 5LUUA 4BHWA 5DY7A 1F68A 4UIVA 4GPJA 2YEKA 4YH4A 4Z93A 4WHWA 4QB3A 3ONIA 5EWWA 4OGIA 5L96A 2R10A 4YBSA 4NXJA 4QSQA 5DKCA 5D3RA 3UVYA 3LJWA 5F1HA 3SVFA 5C7NA 3U5JA 4CLBA 4QR5A 2DVSA 5G4SA 5COIA 5A85A 5ENIA 5IBNA 5FH8A 1WUMA 5I80A 5FE9A 3U5OA 4YYHA 2RO1A 1WUGA 5FE4A 5HEMA 5I40A 4XUBA 5EWDA 4MR3A 4IR6A 3UVDA 3MB3A 5DLZA 4HXRA 4A9IA 3G0LA 4J0RA 5A81A 5D3HA 4PS5A 5AD2A 2OUOA 5HENA 2RI7A 1JSPB 5DX4A 4QEVA 3JVMA 5FFWA 5F60A 3P5OA 3LXJA 5EISA 4YYMA 5HRXA 4ZQLA 4LZRA 5CTLA 1JM4B 5DBMA 5L8UA 3G0JA 5DFBA 4FLPA 5E3GA 4YY6A 5D3JA 3AQAA 4NRAA 5F5ZA 5AMEA 4QUUA 5ENCA 2E7NA 5ETDA 3P1DA 4MR4A 5FBXA 4PCEA 2E3KA 4XY8A 5DYCA 3U5NA 4IR4A 5FE6A 5EPBA 5CUDA 5DW2A 4E96A 5D24A 4TZ8A 4TQNA 5DKDA 5EV9A 5KTUA 3S92A 4YH3A 4XUAA 5G4RA 4TS8A 5J0DA 4LZ2A 4MEQA 4WIVA 4QY4A 5H1TA 4WHUA 3AADA 5LJ1A 3K2JA 2DVVA 3O34A 4NYWA 5FDZA 4TT6A 2F6JA 4A9FA 5FE2A 4TU6A 4QSPA 5TCMA 4LC2A 5EPSA 4O7AA 4YYJA 5HQ7A 5HCLA 3MQMA 4O71A 4O70A 5I1QA 4O78A 5FFVA 2YYNA 4NR7A 3SVGA 5EWHA 5CQ5A 4J0SA 4O72A 4IORA 5FE0A 5DYUA 4IR3A 5FE7A 5L99A 4KCXA 5C4QA 3GG3A 4J3IA 4N3WA 5I88A 3Q2EA 4HXPA 5E9KA 5EI4A 5ETBA 5FB0A 1E6IA 4QSXA 4A9NA 4N4FA 5E3DA 5CRZA 2H60A 5CQ6A 5IG6A 4NR9A 5FE5A 3FKMX 4A9OA 4Q0OA 5CY9A 5IGLA 2R0YA 5D3LA 5FH7A 3U5LA 4TZ2A 3IU5A 5JI8A 5KU3A 4NR5A 4NRBA 5CP5A 4YBMA 5ENJA 4PKLA 4QNSA 4X2IA 3HMEA 4Z6IA 4BW3A 4YK0A 3UVWA 4UYEA 5FG4A 3S91A 5HJCA 5A83A 4KV1A 5FFYA 4TT2A 4CUQA 5JWMA 3LQIA 4KV4A 4O76A 4CL9A 5D3NA 4A9JA 4LYSA 5KTXA 5CGPA 5H1VA 4NRCA 5E0RA 5A5SA 3DAIA 5E7DA 4YBTA 5FH6A 4HXSA 4QSRA 4QEUA 5E9VA 4Q0NA 4MEOA 5E9LA 3P1FA 5LJ2A 5EK9A 4DONA 5FG5A 2L84A 4MR5A 2L5EA 4TYLA 3HMHA 5F3AA 2FSAA 3UV5A 5LKXA 4CUPA 5DFDA 2OO1A 2RNXA 2I7KA 5CU8A 1X0JA 5A82A 5ENFA 5D7XA 4C67A 4HXLA 5E73A 5IIDA 4YYGA 1N72A 4UIYA 2RFJA 5EICA 5BT4A 4Z1QA 3QZSA 4N4HA 4QSWA 4BJXA 3O35A 2I8NA 3NXBA 4ALGA 5KO4A 5C87A 5H85A 4O7CA 3U5MA 5D0CA 4PTBA 5EWCA 3TLPA 5HLSA 4HBWA 4NQMA 3O33A 4MEPA 5E74A 3MXFA 4HXMA 4NS5A 2OSSA 4LR6A 5D26A 5D3TA 4IR5A 5CRMA 2RNYA 3MB4A 5CUCA 5A5PA 5EQ1A 5CUBA 5DYAA 4YYNA 5I7XA 4LYWA 2L85A 4NR8A 4C66A 5HM0A 2D82A 4QC1A 3U5PA 5AMFA 4NR4A 5IGMA 4CUSA 5L98A 5EVAA 5DLXA 2RNWA 4TU4A 5DFCA 5F1LA 4Z1SA 4NUDA 2R0VA 2E7OA 5BT5A 4F3IA 4YYDA 5CQ7A 5L97A 4CUUA 5FG6A 4LZSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZS5A 3RCWA 5I89A 5ENHA 2YELA 4LDFA 2WP2A 5F61A 5LKTA 5FB1A 4QR3A 5A7CA 3D7CA 5FE3A 3O37A 5DKHA 4UYFA 2EJNA 5E9IA 5D3PA 3JVKA 3DWYA 3I3JA 3UV4A 5ENBA 4HBYA 4ZC9A 3QZTA 4NYXA 4UYFB 4LYIA 4ALHA 4A9HA 5LKUA 3UW9A 4BW1A 3P1EA 3U5KA 3UVXA 4HXNA 5II2A 3JVJA 4IOOA 4QSTA 4NQNA 4LRGA 5LVQA 3P1CA 5LKZA 2YQDA 4CURA 5HQ5A 3MULA 4QYDA 5F63A 3ZYUA 5C8GA 4CFLA 4AKGA 5HFQA 5BT3A 2F6NA 4UYHA 4O77A 5CQAA 5IGKA 5CUAA 4A9EA 4O7EA 2DWWA 5EU1A 4ZW1A 5FE8A 5H1UA 4OGJA 5HRWA 3Q2FA 4OUFA 2R0SA 4YC9A 5FE1A 4J1PA 5C85A 4TT4A 5DYXA 2DVQA 4YATA 5K29A 3LQJA 4UYDA 4QR4A 4UIWA 4HBVA 5ENEA 2G4AA 5CPEA 4O7FA 4QYLA 4A9MA 5EM3A 4RVRA 5CQTA 4CFKA 5KTWA 4YY4A 4UIUA 5C89A 5EA1A 5II1A 3LQHA 5CFWA 5A5OA 5CQ8A 5AD3A 4BW4A 5F62A 5ACYA 3IU6A 4AI6A 5I83A 5DW1A 2KTBB 5F2PA 4O75A 4PY6A 2MJVB 5TB6A 2GRCA 4UITA 5HELA 5HRVA 4AKHA 4PCIA 4QZSA 3JVLA 4YYKA 5I29A 2DATA 1EQFA 4UYGA 3QZVA 4NR6A 5L8TA 2NXBA 3UV2A 4HBXA 5ENGA 4N4GA 5I7YA 5EGUA 3ERRA 5LVRA 4QEWA 2D9EA 5CZGA 5CQ4A 5D25A 5F25A 5KHMA 5A5QA 3SVHA 4A9LA 4BW2A 1PUOA 4QSSA 4NUCA 4MENA 2YEMA 2DKWA 5LJ0A 5HFRA 4Z6HA 4O7BA 2RS9B 2YDWA 4A9KA 4HXKA 4QBMA 4AKNA 5CUGA 5A5RA 2YW5A 4HXOA 4IOQA 4XYAA 5E9MA 5E9YA 4YABA 5CS8A 3MUKA 5IGNA 4QC3A 4Y03A 5CQ3A 5EP7A 2LSPB 4CUTA 5EWVA 4YYIA 4QSVA 4YAXA 3HMFA 4NYVA 4QSUA 4UIXA 5EPRA 5HQ6A 3O36A 4MR6A 4QUTA 2N9GA 4NUEA 4XY9A 5CUEA 5F36A 2DVRA 4N4IA 4UIZA 5A5NA 5I86A 4TTEA 2WP1A 4YADA 5D3SA 4O74A 5LUUA 4BHWA 5DY7A 1F68A 4UIVA 4GPJA 2YEKA 4YH4A 4Z93A 4WHWA 4QB3A 3ONIA 5EWWA 4OGIA 5L96A 2R10A 4YBSA 4NXJA 4QSQA 5DKCA 5D3RA 3UVYA 3LJWA 5F1HA 3SVFA 5C7NA 3U5JA 4CLBA 4QR5A 2DVSA 5G4SA 5COIA 5A85A 5ENIA 5IBNA 5FH8A 3VKGA 1WUMA 5I80A 5FE9A 3U5OA 4YYHA 2RO1A 1WUGA 5FE4A 5HEMA 5I40A 4XUBA 5EWDA 4MR3A 4IR6A 3UVDA 3MB3A 5DLZA 4HXRA 4A9IA 3G0LA 4J0RA 5A81A 5D3HA 4PS5A 5AD2A 2OUOA 5HENA 2RI7A 1JSPB 5DX4A 4QEVA 3JVMA 5FFWA 5F60A 3P5OA 3LXJA 5EISA 4YYMA 5HRXA 4ZQLA 4LZRA 5CTLA 1JM4B 5DBMA 5L8UA 3G0JA 5DFBA 4FLPA 5E3GA 4YY6A 4AKIA 5D3JA 3AQAA 4NRAA 5F5ZA 5AMEA 4QUUA 5ENCA 2E7NA 5ETDA 3P1DA 4MR4A 5FBXA 4PCEA 2E3KA 4XY8A 5DYCA 3U5NA 4IR4A 5FE6A 5EPBA 5CUDA 5DW2A 4E96A 5D24A 4TZ8A 4TQNA 5DKDA 5EV9A 5KTUA 3S92A 4YH3A 4XUAA 5G4RA 4TS8A 5J0DA 4LZ2A 4MEQA 4WIVA 4QY4A 5H1TA 4WHUA 3AADA 5LJ1A 3K2JA 2DVVA 3O34A 4NYWA 5FDZA 4TT6A 2F6JA 4A9FA 5FE2A 1ZKRA 4TU6A 4QSPA 5TCMA 4LC2A 5EPSA 4O7AA 4YYJA 5HQ7A 5HCLA 3MQMA 4O71A 4O70A 5I1QA 4O78A 5FFVA 2YYNA 4NR7A 3SVGA 5EWHA 5CQ5A 4J0SA 4O72A 4IORA 5FE0A 5DYUA 3D1DA 4IR3A 5FE7A 5L99A 4KCXA 5C4QA 3GG3A 4J3IA 4N3WA 5I88A 3Q2EA 4HXPA 5E9KA 5EI4A 5ETBA 5FB0A 1E6IA 4QSXA 4A9NA 4N4FA 5E3DA 5CRZA 2H60A 5CQ6A 5IG6A 4NR9A 5FE5A 3FKMX 4A9OA 4Q0OA 5CY9A 5IGLA 2R0YA 5D3LA 5FH7A 3U5LA 4TZ2A 3IU5A 5JI8A 5KU3A 4NR5A 4NRBA 3VKHA 5CP5A 4YBMA 5ENJA 4PKLA 4QNSA 4X2IA 3HMEA 4Z6IA 4BW3A 4YK0A 3UVWA 3D1BA 4UYEA 5FG4A 3S91A 5HJCA 5A83A 4KV1A 5FFYA 4TT2A 4CUQA 5JWMA 3LQIA 4KV4A 4O76A 4CL9A 5D3NA 4A9JA 4LYSA 5KTXA 5CGPA 5H1VA 4NRCA 5E0RA 5A5SA 3DAIA 5E7DA 4YBTA 5FH6A 4HXSA 4QSRA 4QEUA 5E9VA 4Q0NA 4MEOA 5E9LA 3P1FA 5LJ2A 5EK9A 4DONA 5FG5A 2L84A 4MR5A 2L5EA 4TYLA 3HMHA 5F3AA 2FSAA 3UV5A 5LKXA 4CUPA 5DFDA 2OO1A 2RNXA 2I7KA 5CU8A 1X0JA 5A82A 5ENFA 5D7XA 4C67A 4HXLA 5E73A 5IIDA 4YYGA 1N72A 4UIYA 2RFJA 5EICA 5BT4A 4Z1QA 3QZSA 4N4HA 4QSWA 4BJXA 3O35A 2I8NA 3NXBA 4ALGA 5KO4A 5C87A 5H85A 4O7CA 3U5MA 5D0CA 4PTBA 5EWCA 3TLPA 5HLSA 4HBWA 4NQMA 3O33A 4MEPA 5E74A 3MXFA 4HXMA 4NS5A 2OSSA 4LR6A 5D26A 5D3TA 4IR5A 5CRMA 2RNYA 3MB4A 5CUCA 5A5PA 5EQ1A 5CUBA 5DYAA 4YYNA 5I7XA 4LYWA 2L85A 4NR8A 4C66A 5HM0A 2D82A 4QC1A 3U5PA 5AMFA 4NR4A 5IGMA 4CUSA 5L98A 5EVAA 5DLXA 2RNWA 4TU4A 5DFCA 5F1LA 4Z1SA 4NUDA 2R0VA 2E7OA 5BT5A 4F3IA 4YYDA 5CQ7A 5L97A 4CUUA 5FG6A 4LZSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ZS5 A;  3RCW A;  5I89 A;  5ENH A;  2YEL A;  4LDF A;  2WP2 A;  5F61 A;  5LKT A;  5FB1 A;  4QR3 A;  5A7C A;  3D7C A;  5FE3 A;  3O37 A;  5DKH A;  4UYF A;  5E9I A;  5D3P A;  3JVK A;  3DWY A;  3I3J A;  3UV4 A;  5ENB A;  4HBY A;  4ZC9 A;  3QZT A;  4NYX A;  4UYF B;  4LYI A;  4ALH A;  4A9H A;  5LKU A;  3UW9 A;  4BW1 A;  3P1E A;  3U5K A;  3UVX A;  4HXN A;  5II2 A;  3JVJ A;  4IOO A;  4QST A;  4NQN A;  4LRG A;  5LVQ A;  3P1C A;  5LKZ A;  2YQD A;  4CUR A;  5HQ5 A;  3MUL A;  4QYD A;  5F63 A;  3ZYU A;  5C8G A;  4CFL A;  5HFQ A;  5BT3 A;  2F6N A;  4UYH A;  4O77 A;  5CQA A;  5IGK A;  5CUA A;  4A9E A;  4O7E A;  2DWW A;  5EU1 A;  4ZW1 A;  5FE8 A;  5H1U A;  4OGJ A;  5HRW A;  3Q2F A;  4OUF A;  2R0S A;  4YC9 A;  5FE1 A;  4J1P A;  5C85 A;  4TT4 A;  5DYX A;  2DVQ A;  4YAT A;  5K29 A;  3LQJ A;  4UYD A;  4QR4 A;  4UIW A;  4HBV A;  5ENE A;  2G4A A;  5CPE A;  4O7F A;  4QYL A;  4A9M A;  5EM3 A;  4RVR A;  5CQT A;  4CFK A;  5KTW A;  4YY4 A;  4UIU A;  5C89 A;  5EA1 A;  5II1 A;  3LQH A;  5CFW A;  5A5O A;  5CQ8 A;  5AD3 A; 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