4YYNA

Crystal structure of taf1 bd2 bromodomain bound to a crotonyllysine peptide
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
DDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding
molecule keywords Transcription initiation factor TFIID subunit 1
publication title A Subset of Human Bromodomains Recognizes Butyryllysine and Crotonyllysine Histone Peptide Modifications.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yynA00
4N4HA 5F1LA 4O71A 5ENJA 4LZSA 4TU4A 4MENA 5LJ2A 2YYNA 5F1HA 5L96A 5LVQA 5ETDA 3P1DA 5I7XA 5CFWA 3Q2EA 4HXNA 4UYFB 5HELA 5LKUA 2E7OA 5A85A 5H1TA 5CQTA 4YYMA 4XUAA 3MB3A 5DKDA 2L84A 4QYDA 4UYDA 5HJCA 5DYXA 5FFYA 5FG6A 5L99A 4A9OA 5CU8A 4YH4A 4HBXA 3D7CA 4QBMA 1EQFA 5I80A 3Q2FA 5KO4A 3HMFA 5EVAA 3G0JA 5DLZA 5BT5A 2F6JA 4YADA 4QUTA 4QR3A 4AKNA 5H85A 3AADA 3LXJA 4A9JA 4HXPA 3FKMX 4OUFA 5DYAA 4UIVA 4N4GA 3MUKA 5EWDA 3ONIA 5L8TA 5LKXA 4BW3A 4UIZA 5ENFA 5EICA 5F60A 4TZ8A 4QEVA 5DYCA 4PY6A 5E9LA 4MR4A 4BW1A 3O34A 2RNWA 5ENBA 4PCEA 2MJVB 5D3HA 5H1UA 5D3PA 4YBSA 2OO1A 5L97A 4IR3A 4TQNA 4LR6A 5FG4A 4PTBA 4A9MA 4QZSA 5CRMA 5F61A 5F2PA 4YYIA 4LRGA 5CRZA 4NYXA 4QSXA 5EWCA 4Q0OA 2G4AA 5EPBA 4NQMA 4CUTA 4NRAA 5G4SA 3LJWA 4N4IA 5A5RA 5FH7A 5HENA 2E7NA 4UYGA 4J1PA 4NR4A 2YQDA 4O7AA 3U5MA 5EU1A 3O37A 5C8GA 4MR5A 5E9YA 4YYDA 5AD2A 5E73A 4DONA 5D3LA 2R10A 4YBTA 5E7DA 4NYWA 4QR4A 4TT4A 5D7XA 5FG5A 5L98A 3JVKA 5CQ8A 3DAIA 5J0DA 5EA1A 4UIXA 5TB6A 5EWHA 5C87A 4QSRA 5CS8A 2DVRA 5CUBA 3IU5A 4Z1QA 2L85A 4QEWA 4QR5A 5TCMA 4IORA 4QC3A 4BHWA 4QSQA 4A9HA 2WP2A 5A83A 4E96A 4O76A 5LJ1A 3U5PA 3SVFA 3K2JA 5I83A 4LC2A 4WIVA 2FSAA 4PS5A 4IOQA 5CUEA 5BT4A 5HQ5A 4HXLA 5I88A 5CGPA 5EISA 3ZYUA 4LYIA 2R0SA 5CQ3A 4ZW1A 4LZ2A 4HBWA 5FB0A 4YABA 5IGMA 4A9LA 5KTUA 5CY9A 5C7NA 4NYVA 5IIDA 5HEMA 4QYLA 5EPSA 4NR5A 2NXBA 4TYLA 5HRXA 4OGJA 4Y03A 5FE1A 4A9IA 5D26A 5II1A 4NXJA 4CFLA 3U5NA 4XY8A 5EI4A 5E9KA 1WUGA 3I3JA 4Z6HA 4Z1SA 2RFJA 4C67A 4ZQLA 5FE3A 4XY9A 1N72A 4BW4A 2GRCA 2RS9B 5DFBA 5CUAA 4YK0A 4J3IA 5FFVA 5KTWA 4LYWA 4NUEA 5KTXA 5I86A 4TT6A 5EQ1A 5AMEA 4GPJA 5ENCA 3JVMA 1F68A 5HM0A 4YATA 3LQJA 5IGKA 2R0YA 3P5OA 4QUUA 4YBMA 3S92A 3G0LA 3O33A 4BW2A 5FFWA 4HBYA 4KV1A 5CQ5A 5ENHA 5CQ4A 5CUCA 4O7CA 3HMEA 5KU3A 5ACYA 5IGNA 4HXOA 4NQNA 2DVQA 2YEKA 4NUCA 4OGIA 2WP1A 3QZSA 3GG3A 4UIWA 3UVDA 4QSUA 4KCXA 5G4RA 4UITA 3UVYA 4ALGA 4UIUA 4CURA 4NS5A 2RO1A 3UVXA 1E6IA 2E3KA 4N3WA 5A5OA 3IU6A 3UV2A 4O78A 2N9GA 4O77A 4X2IA 2D82A 4XUBA 5CPEA 5DYUA 4A9NA 1JSPB 1WUMA 5HQ6A 5COIA 5CUDA 4YYGA 4HBVA 5FE0A 4NR7A 5JI8A 5CP5A 5DKHA 4YY6A 2DWWA 2YDWA 4YYJA 5C89A 4IR6A 5F3AA 5C4QA 4QSPA 5DKCA 3QZVA 5FBXA 5A5NA 5II2A 5ENGA 5FE5A 4TTEA 5K29A 5A5SA 4C66A 2RNYA 5DFDA 4YC9A 4QSSA 2OSSA 4NRCA 5D24A 5I40A 4HXMA 4WHWA 5EP7A 5D25A 5HFQA 3UV4A 4NRBA 5KHMA 4O7BA 5DW2A 2DATA 5E3DA 4YY4A 4TS8A 2DVVA 3U5LA 5FE9A 4XYAA 4QY4A 5BT3A 5IG6A 3MB4A 4MEQA 5F62A 5AMFA 2RNXA 3SVGA 5F25A 4LYSA 5FE7A 5AD3A 5I29A 3HMHA 5D3NA 3NXBA 5D0CA 4RVRA 4PKLA 5HQ7A 4CUSA 4QNSA 5E9MA 4IOOA 4YYNA 4YYHA 4HXRA 4UIYA 4ZC9A 4Q0NA 4NR6A 4O72A 5L8UA 5E9IA 4O70A 4QSWA 4O7EA 5DLXA 5A5PA 5EGUA 5CQ6A 5CQAA 5D3RA 5IBNA 1X0JA 4HXSA 5LUUA 4CUUA 4N4FA 5F36A 3DWYA 5C85A 4CUQA 4NR9A 3UV5A 3JVLA 4MEOA 3P1EA 5I7YA 2I8NA 4HXKA 4A9FA 4QC1A 5I89A 4CL9A 4KV4A 5IGLA 4TU6A 3LQIA 3SVHA 4BJXA 4MEPA 3MXFA 4YH3A 2F6NA 4IR4A 2OUOA 4WHUA 5EPRA 4Z93A 5LVRA 4O7FA 3LQHA 5D3TA 5CZGA 5I1QA 3MQMA 5A5QA 3U5JA 4NR8A 2YELA 5H1VA 4QSVA 5E3GA 4A9EA 4Z6IA 5HLSA 1ZS5A 3UVWA 4UYEA 5FH6A 4PCIA 2LSPB 5FDZA 2YW5A 2DKWA 4MR6A 4CUPA 5HRVA 5CTLA 5F5ZA 3QZTA 4O75A 5CUGA 4YAXA 4FLPA 4MR3A 4UYFA 5EV9A 5FE2A 5HRWA 3MULA 5DW1A 4QEUA 3P1FA 4TT2A 5EWWA 5A7CA 5EWVA 5F63A 4LDFA 5ETBA 5CQ7A 3O35A 2DVSA 5D3JA 4IR5A 4TZ2A 5ENIA 5HFRA 3JVJA 5DBMA 5DX4A 5E74A 2R0VA 5EK9A 5EM3A 2I7KA 2L5EA 2KTBB 5E9VA 4YYKA 4O74A 3AQAA 4UYHA 4A9KA 3TLPA 5LJ0A 5FE4A 3RCWA 5ENEA 5LKTA 2RI7A 5JWMA 3S91A 2YEMA 3U5KA 5FE8A 5LKZA 5E0RA 5DY7A 4J0SA 4QB3A 3U5OA 3UW9A 5D3SA 4CFKA 5FE6A 4F3IA 4QSTA 5HCLA 4CLBA 5A81A 3O36A 4LZRA 4ALHA 1JM4B 5FH8A 4NUDA 4J0RA 5DFCA 5FB1A 3P1CA 2H60A 5A82A 2D9EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N4HA 2EJNA 5F1LA 4O71A 5ENJA 4LZSA 4TU4A 4MENA 5LJ2A 2YYNA 5F1HA 5L96A 5LVQA 3VKGA 5ETDA 3P1DA 5I7XA 5CFWA 3Q2EA 4HXNA 4UYFB 5HELA 5LKUA 2E7OA 5A85A 5H1TA 5CQTA 4YYMA 4XUAA 3MB3A 5DKDA 2L84A 4QYDA 4UYDA 5HJCA 5DYXA 5FFYA 5FG6A 5L99A 4A9OA 5CU8A 4YH4A 4HBXA 3D7CA 4QBMA 1EQFA 5I80A 3Q2FA 5KO4A 3HMFA 5EVAA 3G0JA 5DLZA 5BT5A 3ERRA 2F6JA 4YADA 4QUTA 4QR3A 4AKNA 5H85A 3AADA 3LXJA 4A9JA 4HXPA 4AKGA 3FKMX 4OUFA 5DYAA 4UIVA 4N4GA 3MUKA 5EWDA 3ONIA 5L8TA 5LKXA 4BW3A 4UIZA 5ENFA 5EICA 5F60A 4TZ8A 4QEVA 5DYCA 1PUOA 4PY6A 5E9LA 4MR4A 4BW1A 3O34A 2RNWA 5ENBA 4PCEA 2MJVB 5D3HA 5H1UA 5D3PA 4YBSA 2OO1A 5L97A 4IR3A 4AKHA 4TQNA 4LR6A 5FG4A 4PTBA 4A9MA 4QZSA 5CRMA 5F61A 5F2PA 4YYIA 4LRGA 5CRZA 4NYXA 4QSXA 5EWCA 4Q0OA 2G4AA 5EPBA 4NQMA 4CUTA 4NRAA 5G4SA 3LJWA 4N4IA 5A5RA 5FH7A 5HENA 2E7NA 4UYGA 4J1PA 4NR4A 2YQDA 4O7AA 3U5MA 5EU1A 3O37A 5C8GA 4MR5A 5E9YA 4YYDA 5AD2A 5E73A 4DONA 5D3LA 2R10A 4YBTA 5E7DA 4NYWA 4QR4A 4TT4A 5D7XA 5FG5A 5L98A 3JVKA 5CQ8A 3DAIA 5J0DA 5EA1A 4UIXA 5TB6A 5EWHA 5C87A 4QSRA 5CS8A 2DVRA 5CUBA 3IU5A 4Z1QA 2L85A 4QEWA 4QR5A 5TCMA 4IORA 4QC3A 4BHWA 4QSQA 4A9HA 2WP2A 5A83A 4E96A 4O76A 5LJ1A 3U5PA 3SVFA 3K2JA 5I83A 4LC2A 4WIVA 2FSAA 4PS5A 4IOQA 5CUEA 5BT4A 5HQ5A 4HXLA 5I88A 5CGPA 5EISA 3ZYUA 4LYIA 2R0SA 5CQ3A 4ZW1A 4LZ2A 4HBWA 5FB0A 4YABA 5IGMA 4A9LA 5KTUA 5CY9A 5C7NA 4NYVA 5IIDA 5HEMA 4QYLA 5EPSA 4NR5A 2NXBA 4TYLA 5HRXA 4OGJA 4Y03A 5FE1A 4A9IA 5D26A 5II1A 4NXJA 4CFLA 3U5NA 4XY8A 5EI4A 5E9KA 1WUGA 3I3JA 4Z6HA 4Z1SA 2RFJA 4AI6A 4C67A 4ZQLA 5FE3A 4XY9A 1N72A 4BW4A 2GRCA 2RS9B 5DFBA 5CUAA 4YK0A 4J3IA 5FFVA 5KTWA 4LYWA 4NUEA 5KTXA 5I86A 4TT6A 5EQ1A 5AMEA 4GPJA 5ENCA 3JVMA 1F68A 5HM0A 4YATA 3LQJA 5IGKA 2R0YA 3P5OA 4QUUA 4YBMA 3S92A 3G0LA 3O33A 4BW2A 5FFWA 4HBYA 4KV1A 5CQ5A 5ENHA 5CQ4A 5CUCA 4O7CA 3HMEA 5KU3A 5ACYA 5IGNA 4HXOA 4NQNA 2DVQA 2YEKA 4NUCA 4OGIA 2WP1A 3QZSA 3GG3A 4UIWA 3UVDA 4QSUA 4KCXA 5G4RA 4UITA 3UVYA 4ALGA 4UIUA 4CURA 4NS5A 2RO1A 3UVXA 1E6IA 2E3KA 4N3WA 5A5OA 3IU6A 3UV2A 4O78A 2N9GA 4O77A 4X2IA 2D82A 4XUBA 5CPEA 5DYUA 4A9NA 1JSPB 1WUMA 5HQ6A 5COIA 5CUDA 4YYGA 4HBVA 5FE0A 4NR7A 5JI8A 5CP5A 5DKHA 4YY6A 2DWWA 2YDWA 4YYJA 3D1DA 5C89A 4IR6A 5F3AA 5C4QA 4QSPA 5DKCA 3QZVA 5FBXA 5A5NA 5II2A 5ENGA 5FE5A 4TTEA 5K29A 5A5SA 4C66A 2RNYA 5DFDA 4YC9A 4QSSA 2OSSA 4NRCA 5D24A 5I40A 4HXMA 4WHWA 5EP7A 5D25A 5HFQA 3UV4A 4NRBA 5KHMA 4O7BA 5DW2A 2DATA 5E3DA 4YY4A 4TS8A 2DVVA 3U5LA 5FE9A 4XYAA 4QY4A 5BT3A 5IG6A 3MB4A 4MEQA 5F62A 5AMFA 2RNXA 3SVGA 5F25A 4LYSA 5FE7A 5AD3A 5I29A 3HMHA 5D3NA 3NXBA 5D0CA 4RVRA 4PKLA 5HQ7A 4CUSA 4QNSA 5E9MA 4IOOA 4YYNA 4YYHA 1ZKRA 4HXRA 4UIYA 4ZC9A 4Q0NA 4NR6A 4O72A 5L8UA 5E9IA 4O70A 4QSWA 4O7EA 5DLXA 5A5PA 5EGUA 5CQ6A 5CQAA 5D3RA 5IBNA 1X0JA 4HXSA 5LUUA 4CUUA 4N4FA 5F36A 3DWYA 5C85A 4CUQA 4NR9A 3UV5A 3JVLA 4MEOA 3P1EA 5I7YA 2I8NA 4HXKA 4A9FA 4QC1A 5I89A 4AKIA 4CL9A 4KV4A 5IGLA 4TU6A 3LQIA 3SVHA 4BJXA 4MEPA 3MXFA 4YH3A 2F6NA 4IR4A 2OUOA 4WHUA 5EPRA 4Z93A 5LVRA 4O7FA 3LQHA 5D3TA 5CZGA 5I1QA 3MQMA 5A5QA 3U5JA 4NR8A 2YELA 5H1VA 4QSVA 5E3GA 4A9EA 4Z6IA 5HLSA 1ZS5A 3UVWA 4UYEA 5FH6A 4PCIA 2LSPB 5FDZA 2YW5A 2DKWA 4MR6A 4CUPA 5HRVA 5CTLA 5F5ZA 3QZTA 3VKHA 4O75A 5CUGA 4YAXA 4FLPA 4MR3A 4UYFA 5EV9A 5FE2A 5HRWA 3MULA 5DW1A 4QEUA 3P1FA 4TT2A 5EWWA 5A7CA 5EWVA 5F63A 4LDFA 5ETBA 5CQ7A 3O35A 2DVSA 5D3JA 4IR5A 4TZ2A 5ENIA 5HFRA 3JVJA 5DBMA 5DX4A 5E74A 2R0VA 5EK9A 5EM3A 2I7KA 2L5EA 2KTBB 5E9VA 4YYKA 4O74A 3AQAA 4UYHA 4A9KA 3TLPA 5LJ0A 5FE4A 3RCWA 5ENEA 5LKTA 2RI7A 5JWMA 3S91A 2YEMA 3U5KA 5FE8A 5LKZA 5E0RA 5DY7A 4J0SA 4QB3A 3U5OA 3UW9A 3D1BA 5D3SA 5FE6A 4CFKA 4QSTA 4F3IA 5HCLA 4CLBA 5A81A 3O36A 4LZRA 4ALHA 1JM4B 5FH8A 4NUDA 4J0RA 5DFCA 5FB1A 3P1CA 2H60A 5A82A 2D9EA
chains in the Genus database with same CATH topology
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