3UV2A

Crystal structure of the bromodomain of human nucleosome-remodeling factor subunit bptf
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
EDAMTVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTKIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKASRSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords bromodomain of human nucleosome-remodeling factor subunit BP
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uv2A00
4NS5A 3ZYUA 5FE9A 2RI7A 4UYHA 5I89A 4NYVA 4PTBA 4A9LA 4YADA 2LSPB 5F25A 4WHWA 4Z6IA 4PCIA 3HMFA 3UVXA 5EWVA 5CUEA 4PY6A 4A9MA 5DY7A 3MUKA 3LXJA 5ENFA 3MB4A 3UW9A 2G4AA 5J0DA 4CURA 2E3KA 4O7EA 5CZGA 3Q2FA 4YYGA 5BT3A 2DVQA 4LYSA 4QYDA 4NUCA 5DKHA 4QSPA 2E7OA 4UITA 4XUBA 5II1A 4RVRA 4A9FA 4HXOA 2H60A 3AADA 5F1LA 4NUEA 5CUBA 4NQNA 5DYXA 4BW2A 4LYWA 5ETDA 5FE6A 2YEMA 3JVJA 4A9IA 2DKWA 5CQ7A 4Y03A 5C4QA 3FKMX 4HBYA 4YH3A 5CRMA 2DVVA 4QBMA 3P1CA 4TU6A 5G4RA 5TB6A 4NYWA 4O70A 5DFDA 5LUUA 3RCWA 5DKDA 5E73A 5L8TA 5D3SA 4O76A 5CPEA 5F63A 4ALHA 5HCLA 4F3IA 5E3DA 5DYCA 5F62A 4O7BA 5I86A 5I88A 4MEQA 5D25A 5DFCA 5FG6A 5LVQA 4MR4A 5DYUA 4O74A 5EWHA 3LQJA 4CUPA 5I80A 5FH8A 5L99A 4NR6A 3UVWA 5D24A 4YYIA 4LC2A 5FE1A 5D3HA 5CFWA 2WP1A 5ENHA 4YYMA 4YYKA 5CQ3A 3O37A 2R0YA 5FB1A 5HQ7A 5AD2A 4XUAA 5EPRA 5FB0A 5HFQA 4QSUA 3ONIA 3MXFA 4NXJA 4N4IA 5IBNA 4A9JA 4CUQA 3HMHA 4HXRA 3K2JA 3P5OA 3UVYA 5LJ0A 3U5OA 4YY6A 4QB3A 5D3NA 4BW4A 5I83A 4LR6A 5I7XA 5HLSA 4AKNA 4J1PA 4IOOA 5A5QA 4Z93A 4QSQA 4YYHA 5IIDA 4HXSA 4NR7A 4Q0NA 5HELA 4UIVA 5FE0A 3LQIA 5HRXA 4YH4A 4A9OA 2F6JA 5AMFA 2GRCA 4QUTA 5ENEA 5CQ6A 4HXPA 5I29A 4HXMA 4QSXA 5FE2A 5I1QA 4J3IA 5FFYA 4NRAA 2RNWA 2D9EA 5EISA 4HBVA 2R0VA 4TS8A 3I3JA 4LZ2A 5A5PA 2DATA 3IU5A 5CQAA 5CQ5A 4GPJA 5DYAA 4A9HA 4BHWA 3U5KA 2I8NA 3P1FA 5IG6A 5H1TA 4CFLA 4NR8A 3AQAA 5FG5A 5HENA 5BT5A 5DW2A 5FFWA 2N9GA 5E7DA 5E9VA 4YBMA 4YBTA 4IR6A 5KO4A 3UVDA 4YYJA 1F68A 4TZ8A 5ENJA 3JVLA 5DFBA 3G0LA 5D3RA 5A7CA 5F60A 4O75A 5EWWA 5DLZA 5HQ6A 4YYNA 4NUDA 4ZC9A 4YAXA 3S92A 5H1UA 3U5MA 2L84A 4OGIA 4QEVA 2D82A 4XY8A 4MEPA 3O33A 4BJXA 4YYDA 5CGPA 4QSRA 5HM0A 5EP7A 1EQFA 5ENCA 4NRBA 4UYFB 4XY9A 3QZVA 5CU8A 5IGMA 5EVAA 1JSPB 1N72A 4KV1A 4QSWA 5LJ1A 4OUFA 4LRGA 5HRVA 4X2IA 5FE3A 4MEOA 2OSSA 2R0SA 5JI8A 4O7CA 4NQMA 4E96A 5E9LA 4PKLA 4LZSA 3U5LA 3P1EA 4CUSA 4YY4A 5EI4A 5A5RA 3JVKA 4J0SA 5FBXA 5C89A 4HBXA 2F6NA 5HJCA 4TZ2A 5A5NA 3UV2A 5E9MA 3SVHA 2I7KA 5CUDA 5FH6A 5C85A 2FSAA 5LKUA 5LKTA 5HFRA 2MJVB 4TTEA 5KTUA 4QNSA 2RNYA 2NXBA 4YABA 4YC9A 2YEKA 4C67A 3DAIA 5A83A 4MR5A 5FFVA 4TU4A 5L97A 5CUGA 4IOQA 1WUMA 1E6IA 5D3TA 4O71A 4A9KA 4NYXA 5I7YA 4C66A 1ZS5A 4CUTA 2OO1A 3Q2EA 4QUUA 2YDWA 5ENGA 4BW1A 2YYNA 4WHUA 2DVSA 4O78A 3HMEA 3O36A 5H85A 5CQ4A 4UIZA 5EPSA 5FE7A 4UIXA 3SVGA 2RS9B 5EM3A 4YBSA 5HQ5A 4QSSA 5LVRA 5FE4A 4HXLA 4DONA 3UV5A 5DW1A 5CTLA 5F3AA 4QC1A 3U5NA 4KV4A 4N4GA 5AMEA 4QEWA 4QR4A 2KTBB 5LJ2A 5D26A 4IR4A 3GG3A 5I40A 4Z1SA 4CFKA 2RO1A 3MB3A 4YK0A 3TLPA 5F61A 5EA1A 5FDZA 3S91A 3U5JA 4IORA 3IU6A 5TCMA 2DWWA 4Q0OA 4IR5A 5E74A 3U5PA 5LKXA 4O7FA 3O35A 5E9IA 4J0RA 5EQ1A 4KCXA 3UV4A 4FLPA 4CL9A 4NR9A 4MENA 5CUCA 5D0CA 4Z1QA 4QSVA 5AD3A 5K29A 3P1DA 5FE8A 4BW3A 4HXNA 5CQ8A 5D3PA 5L96A 5A5OA 5DX4A 5L8UA 5CQTA 5DLXA 1JM4B 4CUUA 5L98A 4HXKA 5E9KA 4A9EA 4HBWA 5EGUA 4A9NA 4O72A 5II2A 5E3GA 3LQHA 5HRWA 4UYEA 3MULA 4XYAA 4QEUA 4QR3A 3MQMA 4QY4A 5C87A 4UYDA 1WUGA 4WIVA 4UIUA 4QSTA 4UIWA 4PS5A 2RNXA 5KU3A 5EK9A 5EPBA 5EWDA 1X0JA 5D3LA 5A82A 5CP5A 5EU1A 5A5SA 4IR3A 4NR4A 4TT2A 5CS8A 5IGKA 3G0JA 4LYIA 5ACYA 5DBMA 5COIA 4NR5A 4QYLA 5A81A 5IGNA 2YELA 4ALGA 4QC3A 4O77A 5F36A 4N4HA 5FE5A 4LDFA 4UYFA 5EWCA 4Z6HA 5A85A 3D7CA 4MR6A 5F5ZA 5G4SA 4PCEA 5C8GA 4O7AA 5D3JA 5D7XA 5ENIA 2R10A 2YW5A 2RFJA 4NRCA 4YATA 5H1VA 2OUOA 5KTXA 3DWYA 3SVFA 2E7NA 2YQDA 5DKCA 4QR5A 4LZRA 5KTWA 5E9YA 4CLBA 4OGJA 5EV9A 4TT6A 3QZSA 4UYGA 4N3WA 5HEMA 3QZTA 5CUAA 5FH7A 5ETBA 5ENBA 4ZW1A 2L85A 5KHMA 4MR3A 4ZQLA 5BT4A 5EICA 2L5EA 3LJWA 5CY9A 2WP2A 5E0RA 3NXBA 5F2PA 4N4FA 4TYLA 5IGLA 3O34A 5FG4A 4UIYA 4TQNA 5C7NA 5CRZA 5JWMA 4QZSA 2DVRA 5F1HA 3JVMA 5LKZA 4TT4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NS5A 3ZYUA 5FE9A 2RI7A 4UYHA 5I89A 4NYVA 4PTBA 4A9LA 4YADA 2LSPB 5F25A 4WHWA 4Z6IA 4PCIA 3HMFA 3UVXA 5EWVA 5CUEA 4PY6A 4A9MA 5DY7A 3MUKA 3LXJA 5ENFA 3MB4A 3UW9A 2G4AA 5J0DA 4CURA 2E3KA 4O7EA 5CZGA 3Q2FA 4YYGA 5BT3A 2DVQA 4LYSA 4QYDA 4NUCA 5DKHA 4QSPA 2E7OA 4UITA 4XUBA 5II1A 4RVRA 4A9FA 4HXOA 2H60A 3AADA 5F1LA 4NUEA 5CUBA 4NQNA 5DYXA 4BW2A 4LYWA 5ETDA 5FE6A 2YEMA 3JVJA 4A9IA 2DKWA 5CQ7A 4Y03A 5C4QA 3FKMX 4HBYA 4YH3A 5CRMA 2DVVA 4QBMA 3P1CA 4TU6A 5G4RA 5TB6A 2EJNA 4AKHA 4NYWA 4O70A 5DFDA 5LUUA 3RCWA 5DKDA 5E73A 5L8TA 5D3SA 4O76A 5CPEA 5F63A 4ALHA 5HCLA 4F3IA 5E3DA 5DYCA 5F62A 4O7BA 5I86A 5I88A 4MEQA 5D25A 5DFCA 5FG6A 5LVQA 4MR4A 5DYUA 4O74A 5EWHA 3LQJA 4CUPA 5I80A 5FH8A 5L99A 4NR6A 3UVWA 5D24A 4YYIA 4LC2A 5FE1A 5D3HA 5CFWA 2WP1A 5ENHA 4YYMA 4YYKA 5CQ3A 3O37A 2R0YA 5FB1A 5HQ7A 5AD2A 4XUAA 5EPRA 5FB0A 5HFQA 4QSUA 3ONIA 3MXFA 4NXJA 4N4IA 5IBNA 4A9JA 4CUQA 3HMHA 4HXRA 3K2JA 3P5OA 3UVYA 5LJ0A 4AI6A 3U5OA 4YY6A 4QB3A 5D3NA 4BW4A 5I83A 4LR6A 5I7XA 5HLSA 4AKNA 4J1PA 4IOOA 5A5QA 4Z93A 4QSQA 4YYHA 5IIDA 4HXSA 4NR7A 4Q0NA 5HELA 4UIVA 5FE0A 3LQIA 5HRXA 4YH4A 4A9OA 2F6JA 5AMFA 2GRCA 4QUTA 5ENEA 1ZKRA 5CQ6A 4HXPA 5I29A 4HXMA 4QSXA 5FE2A 5I1QA 4J3IA 5FFYA 4NRAA 2RNWA 2D9EA 5EISA 4HBVA 2R0VA 4TS8A 3I3JA 4LZ2A 5A5PA 2DATA 3IU5A 5CQAA 5CQ5A 3ERRA 4GPJA 5DYAA 4A9HA 4BHWA 3U5KA 2I8NA 3P1FA 5IG6A 5H1TA 4CFLA 4NR8A 3AQAA 5FG5A 5HENA 5BT5A 5DW2A 5FFWA 2N9GA 5E7DA 5E9VA 4YBMA 4YBTA 4IR6A 5KO4A 3UVDA 4YYJA 1F68A 4TZ8A 5ENJA 3JVLA 5DFBA 3G0LA 5D3RA 5A7CA 5F60A 4O75A 5EWWA 5DLZA 5HQ6A 4YYNA 4NUDA 4ZC9A 4AKIA 4YAXA 3S92A 5H1UA 3U5MA 2L84A 4OGIA 4QEVA 2D82A 4XY8A 4MEPA 3O33A 4BJXA 4YYDA 5CGPA 4QSRA 5HM0A 5EP7A 1EQFA 5ENCA 4NRBA 4UYFB 4XY9A 3QZVA 5CU8A 5IGMA 3D1DA 5EVAA 1JSPB 1N72A 4KV1A 4QSWA 5LJ1A 4OUFA 4LRGA 5HRVA 4X2IA 5FE3A 4MEOA 2OSSA 2R0SA 5JI8A 4O7CA 4NQMA 4E96A 5E9LA 4PKLA 4LZSA 3U5LA 3P1EA 4CUSA 4YY4A 5EI4A 5A5RA 3JVKA 4J0SA 5FBXA 5C89A 4HBXA 2F6NA 5HJCA 4TZ2A 5A5NA 3UV2A 5E9MA 3SVHA 2I7KA 5CUDA 4AKGA 5FH6A 5C85A 2FSAA 5LKUA 5LKTA 5HFRA 2MJVB 4TTEA 5KTUA 4QNSA 2RNYA 2NXBA 4YABA 4YC9A 2YEKA 4C67A 3DAIA 5A83A 4MR5A 5FFVA 4TU4A 5L97A 5CUGA 4IOQA 1WUMA 1E6IA 5D3TA 4O71A 4A9KA 4NYXA 5I7YA 4C66A 1ZS5A 4CUTA 2OO1A 3Q2EA 4QUUA 2YDWA 5ENGA 4BW1A 2YYNA 4WHUA 2DVSA 4O78A 3HMEA 3O36A 5H85A 5CQ4A 4UIZA 5EPSA 5FE7A 4UIXA 3SVGA 2RS9B 5EM3A 4YBSA 5HQ5A 4QSSA 5LVRA 5FE4A 4HXLA 4DONA 3UV5A 5DW1A 5CTLA 5F3AA 4QC1A 3VKHA 3U5NA 4KV4A 4N4GA 5AMEA 4QEWA 4QR4A 2KTBB 5LJ2A 5D26A 4IR4A 3GG3A 5I40A 4Z1SA 4CFKA 2RO1A 3MB3A 4YK0A 3TLPA 5F61A 5EA1A 5FDZA 3S91A 3U5JA 4IORA 3IU6A 5TCMA 2DWWA 4Q0OA 4IR5A 5E74A 3U5PA 5LKXA 4O7FA 3O35A 5E9IA 4J0RA 5EQ1A 4KCXA 3UV4A 4FLPA 4CL9A 4NR9A 4MENA 5CUCA 5D0CA 4Z1QA 4QSVA 5AD3A 5K29A 3P1DA 5FE8A 4BW3A 4HXNA 5CQ8A 5D3PA 5L96A 5A5OA 3VKGA 5DX4A 5L8UA 5CQTA 5DLXA 1JM4B 4CUUA 5L98A 4HXKA 5E9KA 4A9EA 4HBWA 5EGUA 4A9NA 4O72A 5II2A 5E3GA 3LQHA 5HRWA 4UYEA 3MULA 4XYAA 4QEUA 4QR3A 3MQMA 4QY4A 5C87A 4UYDA 1WUGA 4WIVA 4UIUA 4QSTA 4UIWA 4PS5A 2RNXA 5KU3A 5EK9A 5EPBA 5EWDA 1X0JA 5D3LA 5A82A 5CP5A 5EU1A 5A5SA 4IR3A 4NR4A 4TT2A 5CS8A 5IGKA 3G0JA 4LYIA 5ACYA 5DBMA 5COIA 4NR5A 4QYLA 5A81A 5IGNA 2YELA 4ALGA 4QC3A 4O77A 5F36A 4N4HA 5FE5A 4LDFA 4UYFA 5EWCA 4Z6HA 5A85A 3D7CA 4MR6A 5F5ZA 5G4SA 4PCEA 5C8GA 4O7AA 5D3JA 5D7XA 5ENIA 2R10A 2YW5A 2RFJA 4NRCA 4YATA 5H1VA 2OUOA 5KTXA 3DWYA 3SVFA 2E7NA 2YQDA 5DKCA 4QR5A 4LZRA 5KTWA 5E9YA 4CLBA 4OGJA 5EV9A 4TT6A 3QZSA 4UYGA 4N3WA 5HEMA 3QZTA 5CUAA 5FH7A 5ETBA 5ENBA 4ZW1A 2L85A 5KHMA 4MR3A 4ZQLA 5BT4A 5EICA 1PUOA 2L5EA 3D1BA 3LJWA 5CY9A 2WP2A 5E0RA 3NXBA 5F2PA 4N4FA 4TYLA 5IGLA 3O34A 5FG4A 4UIYA 4TQNA 5C7NA 5CRZA 5JWMA 4QZSA 2DVRA 5F1HA 3JVMA 5LKZA 4TT4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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