5ENFA

Crystal structure of the second bromodomain of pleckstrin homology domain interacting protein (phip) in complex with fragment-4 n10142 (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
SMSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A poised fragment library enables rapid synthetic expansion yielding the first reported inhibitors of PHIP(2), an atypical bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PH-interacting protein
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 46
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5enfA00
5KO4A 4QUUA 5A83A 4YBMA 5ACYA 5KU3A 4HXOA 5LJ0A 5E9KA 5FE1A 2DVQA 5F25A 2L84A 3LXJA 4QC1A 4MR5A 5E3GA 5G4RA 5A5SA 4RVRA 5DY7A 5F1HA 5AD2A 2DVVA 4MEOA 5D3LA 4HBVA 5IGKA 4J1PA 2YQDA 3O35A 5HJCA 2D9EA 5CQAA 4NRAA 5D3RA 2OO1A 4DONA 5H85A 3UV2A 5E9LA 4KV4A 4YYNA 4NYXA 4O7FA 4HXPA 2YELA 5CS8A 5ENHA 3HMFA 5H1UA 5D24A 4LR6A 4NUEA 4QR5A 1E6IA 4O77A 5I83A 5I89A 4A9EA 2I8NA 4QNSA 5KHMA 5DYXA 4QSSA 5ENFA 5CQ5A 3MB3A 5HRXA 4O7CA 3HMEA 3MB4A 5JWMA 4TU4A 2RNWA 4A9KA 4NUDA 5CUDA 4XY8A 5EPRA 4CFLA 5K29A 5E73A 5FG4A 4YY6A 3S92A 3JVKA 4YABA 5E9VA 5I88A 4XUAA 4TU6A 5DW2A 5L97A 2R0SA 4QUTA 4CLBA 5FG6A 3LQHA 1WUMA 5HFRA 4NR9A 4HBWA 5DLXA 2OUOA 4O75A 5FBXA 4QSTA 5HRVA 5CTLA 5TCMA 4LYWA 5EP7A 3U5KA 4TT2A 2RNXA 5A5OA 4LC2A 4ZQLA 3HMHA 5AMFA 4PTBA 5D3NA 4GPJA 4A9HA 1WUGA 4UITA 3QZVA 5FB0A 5E0RA 4PCIA 2R10A 5I7XA 5F2PA 4QR4A 3IU6A 5E74A 5ENJA 4A9LA 5C7NA 5LKXA 4YADA 4QEVA 4XY9A 5FE8A 4NQNA 4XUBA 4Q0OA 5CQ3A 4O71A 5CUBA 5E9YA 4CURA 5IGNA 5DFDA 4A9FA 5A81A 2YEMA 5A5NA 4MR4A 2MJVB 5H1TA 4NR6A 4XYAA 4WIVA 4HXRA 5ENGA 5HQ7A 4LZ2A 5FB1A 4UYDA 4QYDA 4LZRA 5FE9A 2WP2A 3P1EA 4UIYA 5ENBA 2R0YA 3IU5A 4OGIA 2RS9B 5DKHA 3P5OA 5CUAA 4O72A 5D3HA 5COIA 5I86A 5E9MA 5L99A 5L98A 4Z93A 5IG6A 2R0VA 4OGJA 4FLPA 5EPBA 3I3JA 4WHUA 5A82A 4CUUA 4QSPA 5DBMA 5C8GA 5LJ2A 5FE4A 4QYLA 5F1LA 2RO1A 4QSWA 5FFVA 4WHWA 5FE0A 5HEMA 5EK9A 3S91A 5I80A 3DWYA 5D25A 3QZSA 5FH6A 5LVQA 3UW9A 5D3SA 3UVXA 2E7NA 4MR6A 5DYAA 4YYJA 4N4IA 4TTEA 3D7CA 1X0JA 4TZ2A 5ENIA 4Q0NA 5LKZA 4UYHA 2YDWA 5ENCA 4A9IA 4O7AA 4Y03A 3U5LA 4ALGA 5CP5A 5TB6A 1EQFA 3U5JA 4NS5A 5DFBA 3UVDA 4TZ8A 4UYGA 4IR5A 4PS5A 4NRCA 4QSUA 2I7KA 5D3JA 5FH8A 4YATA 4YH3A 5F36A 3ZYUA 2L5EA 5CQ7A 5J0DA 5CQTA 5H1VA 5E7DA 4CUPA 4BW2A 4YYHA 3JVJA 4PY6A 4UIUA 4CUSA 5FE2A 4KCXA 4MEPA 4CUQA 3AADA 4YH4A 5CRZA 4YYKA 5D3PA 5LKTA 5HLSA 5JI8A 3SVFA 4LRGA 4LZSA 4NR5A 4A9MA 5DKDA 5CUCA 3P1CA 4E96A 4LYIA 2YEKA 4O78A 5EV9A 5HM0A 4A9JA 2RNYA 3AQAA 4HBYA 3UV5A 2F6JA 4HXLA 4QSVA 4QC3A 5L8TA 4NR7A 5EPSA 1N72A 4NYWA 4QR3A 4PKLA 2DKWA 4IOQA 4TYLA 2NXBA 4IR6A 5D0CA 2H60A 2F6NA 4Z6HA 5D26A 5FFYA 5CZGA 3MXFA 5EGUA 5KTUA 4NQMA 4O7BA 4QSXA 5HCLA 4BW1A 4QB3A 5EWHA 1JSPB 4QEWA 2DVRA 5II2A 5C4QA 5A5PA 5F3AA 4O76A 5FDZA 5EWCA 3U5PA 4IOOA 5FE3A 4UIXA 5CQ4A 3G0LA 5IIDA 2DATA 5CY9A 2E3KA 5IGLA 4QBMA 3QZTA 5A85A 4A9OA 4IORA 5G4SA 3O36A 5F5ZA 4QZSA 5HRWA 3O37A 4QY4A 4C66A 5DX4A 2L85A 2D82A 5F63A 3LQJA 5AMEA 5EVAA 4CFKA 4OUFA 4YY4A 5EQ1A 5I29A 4BJXA 5FH7A 4IR3A 4N3WA 5D3TA 4YYMA 4UIZA 4TS8A 5HQ5A 5KTWA 5DYUA 3FKMX 4TT6A 5CRMA 5DW1A 4CUTA 4QEUA 4N4HA 3P1FA 3U5MA 4O70A 3O34A 5DLZA 5BT3A 4LYSA 5C89A 5FE7A 4TT4A 5F62A 4NRBA 3K2JA 3U5OA 4TQNA 5CU8A 5DYCA 3JVMA 4NR8A 4NUCA 4ZW1A 4J0SA 4BW4A 4YYIA 4MEQA 5DKCA 2YYNA 5CFWA 5KTXA 1F68A 4NXJA 5CQ6A 3MULA 5DFCA 4YYDA 2LSPB 4YK0A 5EWWA 4HXNA 4X2IA 5IBNA 4BHWA 5FE5A 2FSAA 4Z1SA 3G0JA 5L8UA 5EWVA 5A5RA 5EI4A 4C67A 5II1A 3LQIA 5F60A 5BT4A 2KTBB 5BT5A 4IR4A 5LVRA 4ZC9A 4NR4A 3GG3A 3P1DA 1ZS5A 5EA1A 5I7YA 4J3IA 4HXSA 4YBTA 2N9GA 4O74A 3MQMA 5F61A 2DWWA 5HQ6A 5D7XA 3UVWA 4YBSA 4N4GA 5CGPA 5ENEA 5EWDA 4A9NA 3NXBA 3DAIA 3JVLA 4YC9A 4Z1QA 5A5QA 4QSRA 4YAXA 4CL9A 5I1QA 2GRCA 5HELA 3MUKA 4BW3A 4UYFA 5FG5A 4HXKA 2G4AA 4O7EA 3SVHA 5LUUA 4KV1A 2YW5A 5CUEA 3UV4A 4UYEA 5FFWA 3SVGA 5HENA 4LDFA 3TLPA 4HXMA 5LKUA 5EICA 5HFQA 5EM3A 5E9IA 4Z6IA 5FE6A 4PCEA 4NYVA 5IGMA 5A7CA 4UIWA 3RCWA 4AKNA 5C85A 5ETBA 3Q2EA 5C87A 5CQ8A 4UIVA 3ONIA 4QSQA 4F3IA 5EU1A 4ALHA 2DVSA 1JM4B 2RI7A 2OSSA 2WP1A 4N4FA 4MR3A 5E3DA 3LJWA 3Q2FA 5EISA 5I40A 4UYFB 5LJ1A 5L96A 4J0RA 4YYGA 4HBXA 2RFJA 3O33A 2E7OA 5CUGA 5ETDA 3UVYA 4MENA 3U5NA 5CPEA 5AD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KO4A 4QUUA 5A83A 4YBMA 5ACYA 5KU3A 4HXOA 5LJ0A 5E9KA 5FE1A 2DVQA 5F25A 2L84A 3LXJA 4QC1A 4MR5A 5E3GA 5G4RA 5A5SA 4RVRA 5DY7A 5F1HA 5AD2A 2DVVA 4MEOA 5D3LA 4HBVA 5IGKA 4J1PA 2YQDA 3O35A 5HJCA 2D9EA 5CQAA 4NRAA 5D3RA 2OO1A 4DONA 5H85A 3UV2A 5E9LA 4KV4A 4YYNA 4NYXA 4O7FA 4HXPA 2YELA 5CS8A 5ENHA 3HMFA 5H1UA 5D24A 4LR6A 4NUEA 4QR5A 1E6IA 4O77A 5I83A 5I89A 4A9EA 2I8NA 4QNSA 5KHMA 5DYXA 4QSSA 5ENFA 5CQ5A 3MB3A 5HRXA 3ERRA 4O7CA 3HMEA 3MB4A 5JWMA 4TU4A 2RNWA 4A9KA 4NUDA 5CUDA 4XY8A 5EPRA 4CFLA 5K29A 5E73A 5FG4A 4YY6A 3S92A 3JVKA 4YABA 5E9VA 5I88A 4XUAA 4TU6A 5DW2A 5L97A 2R0SA 4QUTA 4CLBA 5FG6A 3LQHA 1WUMA 5HFRA 4NR9A 4HBWA 5DLXA 2OUOA 4O75A 5FBXA 4QSTA 5HRVA 5CTLA 5TCMA 4LYWA 5EP7A 3U5KA 4AKGA 4TT2A 2RNXA 5A5OA 4LC2A 4ZQLA 3HMHA 5AMFA 4PTBA 5D3NA 4GPJA 4A9HA 1WUGA 4UITA 3QZVA 5FB0A 5E0RA 4PCIA 2R10A 5I7XA 5F2PA 4QR4A 3IU6A 5E74A 5ENJA 4A9LA 5C7NA 5LKXA 4YADA 4QEVA 4XY9A 5FE8A 4NQNA 4XUBA 4Q0OA 5CQ3A 4O71A 5CUBA 5E9YA 4CURA 5IGNA 5DFDA 4A9FA 5A81A 2YEMA 5A5NA 4MR4A 3D1DA 2MJVB 5H1TA 4NR6A 4XYAA 4WIVA 4HXRA 5ENGA 5HQ7A 4LZ2A 5FB1A 4UYDA 4QYDA 4LZRA 5FE9A 2WP2A 3P1EA 4UIYA 5ENBA 2R0YA 3IU5A 4OGIA 2RS9B 5DKHA 3P5OA 5CUAA 4O72A 5D3HA 5COIA 5I86A 5E9MA 5L99A 3D1BA 4Z93A 5L98A 5IG6A 2R0VA 4OGJA 4FLPA 5EPBA 3I3JA 4WHUA 5A82A 4CUUA 4QSPA 5DBMA 5C8GA 5LJ2A 5FE4A 4QYLA 5F1LA 2RO1A 4QSWA 3VKHA 5FFVA 4WHWA 5FE0A 5HEMA 5EK9A 3S91A 5I80A 3DWYA 5D25A 3QZSA 5FH6A 5LVQA 3UW9A 5D3SA 3UVXA 2E7NA 4MR6A 5DYAA 4YYJA 4N4IA 4TTEA 3D7CA 1X0JA 4TZ2A 5ENIA 4Q0NA 5LKZA 4UYHA 2YDWA 5ENCA 4A9IA 4O7AA 4Y03A 3U5LA 4ALGA 3VKGA 5CP5A 5TB6A 1EQFA 3U5JA 4NS5A 5DFBA 3UVDA 4TZ8A 4UYGA 4IR5A 4PS5A 4NRCA 4QSUA 2I7KA 5D3JA 5FH8A 4YATA 4YH3A 5F36A 3ZYUA 2L5EA 5CQ7A 5J0DA 4AI6A 5CQTA 5H1VA 5E7DA 4CUPA 4BW2A 4YYHA 3JVJA 4PY6A 4UIUA 4CUSA 5FE2A 4KCXA 4MEPA 4CUQA 3AADA 4YH4A 5CRZA 4YYKA 5D3PA 5LKTA 5HLSA 5JI8A 3SVFA 4LRGA 4LZSA 4NR5A 4A9MA 5DKDA 5CUCA 3P1CA 4E96A 4LYIA 2YEKA 4O78A 5EV9A 5HM0A 4A9JA 2RNYA 3AQAA 4HBYA 3UV5A 2F6JA 4HXLA 4QSVA 4QC3A 5L8TA 4NR7A 5EPSA 1N72A 4NYWA 4QR3A 4PKLA 2DKWA 4IOQA 4TYLA 2NXBA 4IR6A 5D0CA 2H60A 2F6NA 4Z6HA 5D26A 5FFYA 5CZGA 3MXFA 5EGUA 5KTUA 4NQMA 4O7BA 4QSXA 5HCLA 4BW1A 4QB3A 5EWHA 1JSPB 4QEWA 2DVRA 5II2A 5C4QA 5A5PA 5F3AA 4O76A 5FDZA 5EWCA 3U5PA 4IOOA 5FE3A 4UIXA 5CQ4A 3G0LA 5IIDA 2DATA 4AKIA 5CY9A 2E3KA 5IGLA 4QBMA 3QZTA 5A85A 4A9OA 4IORA 5G4SA 3O36A 5F5ZA 4QZSA 5HRWA 3O37A 4QY4A 4C66A 5DX4A 2L85A 4AKHA 1PUOA 2D82A 5F63A 3LQJA 5AMEA 5EVAA 4CFKA 4OUFA 4YY4A 5EQ1A 5I29A 4BJXA 5FH7A 4IR3A 4N3WA 5D3TA 4YYMA 4UIZA 4TS8A 5HQ5A 5KTWA 5DYUA 3FKMX 4TT6A 5CRMA 5DW1A 4CUTA 4QEUA 4N4HA 3P1FA 3U5MA 4O70A 3O34A 5DLZA 5BT3A 4LYSA 5C89A 5FE7A 4TT4A 5F62A 4NRBA 3K2JA 3U5OA 4TQNA 5CU8A 5DYCA 3JVMA 4NR8A 4NUCA 4ZW1A 4J0SA 4BW4A 4YYIA 4MEQA 5DKCA 2YYNA 5CFWA 5KTXA 1F68A 4NXJA 5CQ6A 3MULA 5DFCA 4YYDA 2LSPB 4YK0A 5EWWA 4HXNA 4X2IA 5IBNA 4BHWA 5FE5A 2FSAA 4Z1SA 3G0JA 5L8UA 5EWVA 5A5RA 5EI4A 4C67A 5II1A 3LQIA 5F60A 5BT4A 2KTBB 5BT5A 4IR4A 5LVRA 4ZC9A 4NR4A 3GG3A 3P1DA 1ZS5A 2EJNA 5EA1A 5I7YA 4J3IA 4HXSA 4YBTA 2N9GA 4O74A 3MQMA 5F61A 2DWWA 5HQ6A 5D7XA 3UVWA 4YBSA 4N4GA 5CGPA 5ENEA 5EWDA 4A9NA 3NXBA 3DAIA 3JVLA 4YC9A 4Z1QA 5A5QA 4QSRA 4YAXA 4CL9A 5I1QA 2GRCA 5HELA 3MUKA 4BW3A 4UYFA 5FG5A 4HXKA 2G4AA 4O7EA 3SVHA 5LUUA 4KV1A 2YW5A 5CUEA 3UV4A 4UYEA 5FFWA 3SVGA 5HENA 4LDFA 3TLPA 4HXMA 5LKUA 5EICA 5HFQA 5EM3A 5E9IA 4Z6IA 5FE6A 4PCEA 4NYVA 5IGMA 5A7CA 4UIWA 3RCWA 4AKNA 5C85A 5ETBA 3Q2EA 5C87A 5CQ8A 4UIVA 3ONIA 4QSQA 4F3IA 5EU1A 4ALHA 2DVSA 1JM4B 2RI7A 2OSSA 2WP1A 1ZKRA 4N4FA 4MR3A 5E3DA 3LJWA 3Q2FA 5EISA 5I40A 4UYFB 5LJ1A 5L96A 4J0RA 4YYGA 4HBXA 2RFJA 3O33A 2E7OA 5CUGA 5ETDA 3UVYA 4MENA 3U5NA 5CPEA 5AD3A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5KO4 A;  4QUU A;  5A83 A;  4YBM A;  5ACY A;  5KU3 A;  4HXO A;  5LJ0 A;  5E9K A;  5FE1 A;  2DVQ A;  5F25 A;  2L84 A;  3LXJ A;  4QC1 A;  4MR5 A;  5E3G A;  5G4R A;  5A5S A;  4RVR A;  5DY7 A;  5F1H A;  5AD2 A;  2DVV A;  4MEO A;  5D3L A;  4HBV A;  5IGK A;  4J1P A;  2YQD A;  3O35 A;  5HJC A;  2D9E A;  5CQA A;  4NRA A;  5D3R A;  2OO1 A;  4DON A;  5H85 A;  3UV2 A;  5E9L A;  4KV4 A;  4YYN A;  4NYX A;  4O7F A;  4HXP A;  2YEL A;  5CS8 A;  5ENH A;  3HMF A;  5H1U A;  5D24 A;  4LR6 A;  4NUE A;  4QR5 A;  1E6I A;  4O77 A;  5I83 A;  5I89 A;  4A9E A;  2I8N A;  4QNS A;  5KHM A;  5DYX A;  4QSS A;  5ENF A;  5CQ5 A;  3MB3 A;  5HRX A;  4O7C A;  3HME A;  3MB4 A;  5JWM A;  4TU4 A;  2RNW A;  4A9K A;  4NUD A;  5CUD A;  4XY8 A;  5EPR A;  4CFL A;  5K29 A;  5E73 A;  5FG4 A;  4YY6 A;  3S92 A;  3JVK A;  4YAB A;  5E9V A;  5I88 A;  4XUA A;  4TU6 A;  5DW2 A;  5L97 A;  2R0S A;  4QUT A;  4CLB A;  5FG6 A;  3LQH A;  1WUM A;  5HFR A;  4NR9 A;  4HBW A;  5DLX A;  2OUO A;  4O75 A;  5FBX A;  4QST A;  5HRV A;  5CTL A;  5TCM A;  4LYW A; 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