5F63A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sg3-179
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f63A01
2DVSA 4UYGA 4BW1A 5I86A 5IGKA 4UYDA 5CQ8A 4Y03A 5HENA 4XUAA 4CFKA 5BT3A 5KU3A 4YYKA 5FDZA 5KTUA 3P1EA 4O77A 5DBMA 3HMHA 5EQ1A 2DVRA 2WP2A 5FG4A 5CGPA 3ONIA 3UV4A 5FH6A 4XY9A 2R0YA 4NR6A 4MEQA 5FE7A 4QUUA 5C8GA 4O7CA 3U5LA 5CQTA 5FBXA 5CUCA 5LUUA 3I3JA 4WIVA 4YYHA 5F3AA 5DFBA 5I40A 2WP1A 4QSRA 3JVJA 1ZS5A 4UIYA 4IR3A 5DFDA 5HELA 5FE5A 5HFRA 4AKNA 4E96A 4NR7A 5A5SA 4QSPA 5EI4A 1WUMA 3UVYA 4QYDA 2YEKA 2RNYA 4TZ2A 3SVHA 4UYEA 5I7YA 5E9IA 5BT5A 4IOOA 4KV1A 4NYWA 5ENEA 4CL9A 4KCXA 3UV5A 4QUTA 3S92A 5CUEA 3HMEA 4QC3A 2RI7A 4N3WA 2DWWA 5EWHA 5F36A 3LXJA 4LRGA 4O7BA 3TLPA 5EA1A 4TU4A 4NRAA 5ENCA 4LDFA 5FFVA 5JWMA 4IR5A 4YY4A 5A7CA 4NUCA 3HMFA 4UIVA 5E9KA 5FE2A 5D3HA 4MR5A 5D3PA 4N4GA 5LJ0A 4QYLA 5DW2A 5CP5A 5D3LA 3DAIA 4XY8A 5EWWA 4QR5A 5H85A 5D3NA 3JVLA 4O70A 5DKDA 3QZVA 5EICA 4YYJA 4NQMA 5C85A 2I8NA 4C67A 2LSPB 3LQHA 5CZGA 5HQ7A 4O7AA 5TCMA 5F1HA 5AMFA 4QBMA 4YAXA 4YABA 3O33A 5EGUA 3SVFA 4O72A 4YY6A 4YBTA 4KV4A 5E3GA 5I89A 5CTLA 5DFCA 5E3DA 5D24A 2YYNA 4HBXA 5I29A 5DYCA 4NYVA 5DKCA 5CQ5A 4PY6A 4CUTA 5D7XA 4HXNA 4A9KA 2L5EA 5CQ6A 4QSVA 2YDWA 4QR4A 4X2IA 2OO1A 2DVQA 4TTEA 5II2A 5E74A 3U5OA 5FH7A 5A83A 5EPSA 4CLBA 4J0RA 4TU6A 3U5JA 2YEMA 5CY9A 5LJ1A 5A5OA 5DYXA 5E73A 5L97A 4A9MA 4YBSA 4FLPA 4QSUA 5FG5A 2L84A 4CUQA 4NUEA 5I88A 5A85A 4LYIA 3UW9A 3LQJA 2DKWA 2D82A 5FG6A 5EK9A 4N4FA 5DLZA 4N4IA 5KHMA 5E9YA 4YYGA 3AADA 3MQMA 4HBVA 5ENHA 4UYFB 3U5MA 3SVGA 5E9VA 4J1PA 4CUUA 5F63A 5H1VA 5FE1A 5IG6A 4Z1SA 5LKUA 5II1A 5HQ5A 4MEOA 3U5NA 1WUGA 5F1LA 4A9JA 4OGIA 4YH3A 5F62A 5FFYA 5F5ZA 3UV2A 2F6NA 4LC2A 5CUAA 3JVKA 5H1TA 5CS8A 5E9MA 4CURA 5D25A 4QSXA 5AMEA 5F61A 4Z93A 5F60A 4A9IA 5A81A 5FFWA 5D0CA 4BJXA 5CPEA 4DONA 5HFQA 3G0LA 5A5PA 5FE9A 5D3JA 5IGMA 4NYXA 5HLSA 3ZYUA 2YELA 3QZTA 4O76A 4MR4A 5CUBA 3FKMX 4A9OA 3RCWA 3K2JA 5FB0A 4YADA 4NR5A 4YYNA 1E6IA 1N72A 5IIDA 5A5QA 4NS5A 5C89A 4QSSA 4UYFA 4NQNA 4QR3A 1F68A 5EVAA 5IGNA 3P1CA 4TT6A 4QC1A 4ALHA 4YH4A 4YYIA 5FE4A 4HBWA 4OUFA 3G0JA 4IR6A 4QSQA 5FE8A 4PCEA 5C4QA 5D3RA 1JM4B 4MR6A 5C87A 2H60A 2R0VA 3GG3A 5D3SA 2E7OA 2I7KA 5CQ7A 3UVDA 4IOQA 4MENA 2RNXA 3LQIA 3LJWA 5E0RA 4QNSA 5DX4A 5EPBA 5EV9A 4QSTA 2N9GA 5DLXA 5L99A 4HBYA 5LKZA 3UVWA 3IU5A 4NR4A 4XUBA 4O74A 4MR3A 4TZ8A 4O71A 4CFLA 4A9LA 5HRVA 3MB3A 5EWDA 4LZSA 3O37A 4Z6HA 5FH8A 5CQAA 5D26A 4ZQLA 5L96A 4A9HA 5ETBA 2G4AA 2E7NA 4HXOA 2GRCA 4LZ2A 5ENIA 3U5PA 2OUOA 3Q2FA 4UIZA 5EPRA 5HRXA 4YBMA 4ALGA 5A82A 2OSSA 3NXBA 5CUDA 4A9EA 4PS5A 5HEMA 2RS9B 5L8TA 4TT4A 4PTBA 4XYAA 4Z6IA 5EWCA 5EM3A 5FE0A 1X0JA 4ZC9A 4J3IA 4QEWA 5LVQA 4OGJA 3QZSA 4TQNA 4UITA 2RO1A 5EISA 3AQAA 4TS8A 5DYAA 4Q0NA 5FB1A 5C7NA 4QZSA 5COIA 4QY4A 5DKHA 4CUPA 4O7EA 2YQDA 4TYLA 2YW5A 5E7DA 5HCLA 2D9EA 5K29A 4O78A 3JVMA 5CFWA 5ENFA 2R10A 5EP7A 5H1UA 4HXSA 2E3KA 3U5KA 1EQFA 4NR8A 4QSWA 4A9FA 5ENGA 4RVRA 2DATA 4WHWA 5FE3A 4UIXA 4PCIA 4O7FA 4ZW1A 2DVVA 5LKTA 4F3IA 4YK0A 4A9NA 2KTBB 5HM0A 5EWVA 2MJVB 5HJCA 4N4HA 5CQ4A 4BW4A 5DYUA 2FSAA 4NUDA 5G4RA 3P5OA 5G4SA 4Q0OA 2L85A 5DY7A 5KO4A 4GPJA 5AD2A 2RNWA 5CUGA 4UIUA 3MB4A 4BW3A 5CRMA 4C66A 5TB6A 5IGLA 4HXMA 4J0SA 5ETDA 3O34A 5A5NA 5AD3A 4PKLA 5J0DA 4IR4A 4HXKA 4CUSA 2F6JA 4Z1QA 5BT4A 5JI8A 4UIWA 3MULA 4LYSA 4TT2A 3P1FA 4BW2A 4YYMA 5I83A 5CU8A 4UYHA 5HQ6A 4YATA 4YC9A 5IBNA 3IU6A 4O75A 4NRCA 4MEPA 5ENJA 3O35A 5CQ3A 3DWYA 5HRWA 5CRZA 4NR9A 4QEVA 5I7XA 4HXLA 5A5RA 5I1QA 5E9LA 4YYDA 4LR6A 3Q2EA 4LZRA 4IORA 5DW1A 5KTXA 3D7CA 5F2PA 5L98A 2RFJA 4HXPA 4NXJA 5LJ2A 4QEUA 2NXBA 5F25A 5L8UA 4BHWA 2R0SA 5ACYA 5EU1A 4NRBA 3MXFA 3P1DA 4QB3A 5D3TA 5LVRA 3MUKA 4HXRA 5LKXA 5ENBA 3UVXA 4LYWA 3O36A 1JSPB 5FE6A 3S91A 5KTWA 5I80A 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DVSA 4UYGA 4BW1A 5I86A 5IGKA 4UYDA 5CQ8A 4Y03A 5HENA 4XUAA 4CFKA 5BT3A 5KU3A 4YYKA 5FDZA 5KTUA 3P1EA 4O77A 5DBMA 3HMHA 5EQ1A 2DVRA 2WP2A 5FG4A 5CGPA 3ONIA 3UV4A 5FH6A 4XY9A 2R0YA 4NR6A 4MEQA 5FE7A 4QUUA 5C8GA 4O7CA 3U5LA 5CQTA 5FBXA 5CUCA 5LUUA 3I3JA 4WIVA 4YYHA 5F3AA 5DFBA 5I40A 2WP1A 4QSRA 3JVJA 1ZS5A 4UIYA 4IR3A 5DFDA 1ZKRA 5HELA 5FE5A 5HFRA 4AKNA 4E96A 4NR7A 5A5SA 4QSPA 5EI4A 1WUMA 3UVYA 4QYDA 2YEKA 2RNYA 4TZ2A 3SVHA 4UYEA 5I7YA 5E9IA 5BT5A 4IOOA 4KV1A 4NYWA 5ENEA 4CL9A 4KCXA 3UV5A 4QUTA 3S92A 5CUEA 3HMEA 4QC3A 2RI7A 4N3WA 2DWWA 5EWHA 5F36A 3LXJA 4LRGA 4O7BA 3TLPA 5EA1A 4TU4A 4NRAA 5ENCA 4LDFA 5FFVA 5JWMA 4IR5A 4YY4A 5A7CA 4NUCA 3HMFA 4UIVA 5E9KA 5FE2A 5D3HA 4MR5A 5D3PA 4N4GA 5LJ0A 4QYLA 5DW2A 5CP5A 5D3LA 3DAIA 4XY8A 5EWWA 4QR5A 5H85A 5D3NA 3JVLA 4O70A 5DKDA 3QZVA 5EICA 4YYJA 4NQMA 5C85A 2I8NA 4C67A 2LSPB 3LQHA 5CZGA 5HQ7A 4O7AA 5TCMA 5F1HA 5AMFA 4QBMA 4YAXA 4YABA 3O33A 5EGUA 3SVFA 4O72A 4YY6A 4YBTA 4KV4A 5E3GA 5I89A 5CTLA 5DFCA 5E3DA 5D24A 2YYNA 4HBXA 5I29A 5DYCA 4NYVA 5DKCA 5CQ5A 4PY6A 4CUTA 5D7XA 4HXNA 4A9KA 2L5EA 5CQ6A 4QSVA 2YDWA 4QR4A 4X2IA 2OO1A 2DVQA 4TTEA 5II2A 5E74A 3U5OA 5FH7A 5A83A 5EPSA 4CLBA 4J0RA 4TU6A 3U5JA 2YEMA 5CY9A 5LJ1A 5A5OA 5DYXA 5E73A 5L97A 4A9MA 4YBSA 4FLPA 4QSUA 5FG5A 2L84A 4CUQA 4NUEA 5I88A 5A85A 4LYIA 3UW9A 3LQJA 2DKWA 2D82A 5FG6A 5EK9A 4N4FA 5DLZA 4N4IA 5KHMA 5E9YA 3D1BA 4YYGA 3AADA 3MQMA 4HBVA 5ENHA 4UYFB 3U5MA 3SVGA 5E9VA 4J1PA 4CUUA 5F63A 5H1VA 5FE1A 5IG6A 4Z1SA 5LKUA 5II1A 5HQ5A 4MEOA 3U5NA 1WUGA 5F1LA 4A9JA 4OGIA 4YH3A 5F62A 5FFYA 4AKIA 5F5ZA 3UV2A 2F6NA 4LC2A 4AKGA 5CUAA 3JVKA 5H1TA 5CS8A 5E9MA 4CURA 5D25A 4AI6A 4QSXA 5AMEA 5F61A 4Z93A 5F60A 4A9IA 5A81A 5FFWA 5D0CA 4BJXA 5CPEA 4DONA 5HFQA 3G0LA 5A5PA 5FE9A 5D3JA 5IGMA 4NYXA 5HLSA 3ZYUA 2YELA 3QZTA 4O76A 4MR4A 5CUBA 3FKMX 4A9OA 3RCWA 3K2JA 5FB0A 2EJNA 4NR5A 4YADA 4YYNA 1E6IA 1N72A 5IIDA 5A5QA 4NS5A 5C89A 4QSSA 4UYFA 4NQNA 4QR3A 1F68A 5EVAA 5IGNA 3P1CA 4TT6A 4QC1A 4ALHA 4YH4A 4YYIA 5FE4A 4HBWA 4OUFA 3G0JA 4IR6A 4QSQA 5FE8A 4PCEA 5C4QA 5D3RA 1JM4B 3D1DA 4MR6A 5C87A 2H60A 2R0VA 3GG3A 5D3SA 2E7OA 2I7KA 5CQ7A 3UVDA 4IOQA 4MENA 2RNXA 3LQIA 3LJWA 5E0RA 1PUOA 4QNSA 5DX4A 5EPBA 5EV9A 4QSTA 2N9GA 5DLXA 5L99A 4HBYA 5LKZA 3UVWA 3IU5A 4NR4A 4XUBA 4O74A 4MR3A 4TZ8A 4O71A 4CFLA 4A9LA 5HRVA 3MB3A 5EWDA 4LZSA 3O37A 4Z6HA 5FH8A 5CQAA 5D26A 4ZQLA 5L96A 4A9HA 5ETBA 2G4AA 2E7NA 4HXOA 2GRCA 4LZ2A 5ENIA 3U5PA 2OUOA 3Q2FA 4UIZA 5EPRA 5HRXA 4YBMA 4ALGA 5A82A 2OSSA 3VKHA 3NXBA 5CUDA 4A9EA 4PS5A 5HEMA 2RS9B 5L8TA 4TT4A 4PTBA 4XYAA 4Z6IA 5EWCA 5EM3A 5FE0A 1X0JA 4ZC9A 4J3IA 4QEWA 5LVQA 4OGJA 3QZSA 4TQNA 4UITA 2RO1A 5EISA 3AQAA 4TS8A 5DYAA 4Q0NA 5FB1A 5C7NA 4QZSA 3ERRA 5COIA 4QY4A 5DKHA 4CUPA 4O7EA 2YQDA 4TYLA 2YW5A 5E7DA 5HCLA 2D9EA 5K29A 4O78A 3VKGA 3JVMA 5CFWA 5ENFA 2R10A 5EP7A 5H1UA 4HXSA 2E3KA 3U5KA 1EQFA 4NR8A 4QSWA 4A9FA 5ENGA 4RVRA 2DATA 4WHWA 5FE3A 4UIXA 4PCIA 4O7FA 4ZW1A 2DVVA 5LKTA 4F3IA 4YK0A 4A9NA 2KTBB 5HM0A 5EWVA 2MJVB 5HJCA 4N4HA 5CQ4A 4BW4A 5DYUA 2FSAA 4NUDA 5G4RA 3P5OA 5G4SA 4Q0OA 2L85A 4AKHA 5DY7A 5KO4A 4GPJA 5AD2A 2RNWA 5CUGA 4UIUA 3MB4A 4BW3A 5CRMA 4C66A 5TB6A 5IGLA 4HXMA 4J0SA 5ETDA 3O34A 5A5NA 5AD3A 4PKLA 5J0DA 4IR4A 4HXKA 4CUSA 2F6JA 4Z1QA 5BT4A 5JI8A 4UIWA 3MULA 4LYSA 4TT2A 3P1FA 4BW2A 4YYMA 5I83A 5CU8A 4UYHA 5HQ6A 4YATA 4YC9A 5IBNA 3IU6A 4O75A 4NRCA 4MEPA 5ENJA 3O35A 5CQ3A 3DWYA 5HRWA 5CRZA 4NR9A 4QEVA 5I7XA 4HXLA 5A5RA 5I1QA 5E9LA 4YYDA 4LR6A 3Q2EA 4LZRA 4IORA 5DW1A 5KTXA 3D7CA 5F2PA 5L98A 2RFJA 4HXPA 4NXJA 5LJ2A 4QEUA 2NXBA 5F25A 5L8UA 4BHWA 2R0SA 5ACYA 5EU1A 4NRBA 3MXFA 3P1DA 4QB3A 5D3TA 5LVRA 3MUKA 4HXRA 5LKXA 5ENBA 3UVXA 4LYWA 3O36A 1JSPB 5FE6A 3S91A 5KTWA 5I80A 4WHUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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