4O71A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with flavopiridol
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 40
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o71A01
5D3NA 4N4HA 3P1CA 5FFVA 2WP1A 4LZRA 4TU4A 4TT2A 5II1A 2DVRA 5CP5A 3U5JA 4WIVA 3AADA 4MR3A 4NUDA 4HXSA 3U5KA 5D25A 4HXNA 2YEKA 4BW1A 5HQ5A 5D3LA 5F36A 2E7OA 5EWVA 4YYIA 5D0CA 3S91A 5CUCA 5D3SA 5DKDA 5A5RA 4O7BA 5F60A 5AD2A 5F63A 5EWDA 4QSVA 4TT6A 4IR5A 4LRGA 4YYMA 3O36A 4RVRA 2E7NA 2YDWA 4UIXA 1WUGA 3U5LA 4J0SA 5LVRA 5DX4A 1X0JA 4MEQA 4HXMA 4QB3A 4O76A 5FFYA 5E0RA 4PCIA 5A85A 2DVVA 4CFKA 5LUUA 2E3KA 5L96A 5AMFA 3LJWA 3Q2FA 4XY9A 4YYNA 5LKXA 2F6NA 4QSWA 5H1TA 5K29A 4Q0OA 3ZYUA 5I7XA 5E9YA 5II2A 4QSXA 3ONIA 5AD3A 5FE5A 5G4SA 5I89A 5I80A 5IG6A 5HQ7A 5CQ6A 5H1UA 5C4QA 4YYGA 4X2IA 5A7CA 5EP7A 5A5PA 5HELA 4IR6A 5EPBA 3K2JA 4TT4A 4FLPA 5G4RA 4A9FA 4CUQA 4MR5A 2RFJA 5E9LA 3DAIA 1JSPB 5C87A 5E7DA 5ETDA 5ACYA 4BW3A 4IOOA 3P1DA 4QEWA 4NR7A 5DFCA 4YBTA 5CUAA 5L99A 4Z6HA 5EI4A 2RS9B 4O77A 3HMFA 5E9IA 5EV9A 4CUTA 4O7CA 5COIA 5A5SA 4UIVA 4TZ2A 5E3DA 5FE6A 4UYDA 4O7EA 4N4IA 5J0DA 4O70A 4TYLA 3S92A 4HXOA 3LQJA 5E74A 5D7XA 1E6IA 5BT3A 3UW9A 5AMEA 4YYHA 4OGJA 5CRMA 5CQ3A 3Q2EA 3HMHA 4QNSA 4O74A 4TU6A 5HRVA 4YATA 4XUAA 4A9MA 5CQ7A 5FH8A 5C8GA 4O78A 4C66A 4NR6A 4QSQA 4CUSA 3P5OA 4UITA 5FE0A 5EWWA 5EK9A 5FH6A 3G0LA 2OUOA 4HXKA 4QUTA 5DFDA 5IGMA 4QSUA 5CU8A 3IU5A 3UVYA 5EPSA 4YABA 4CUUA 5FDZA 4MENA 3TLPA 3SVHA 4YH3A 5L8UA 4J0RA 5I83A 1F68A 4Z6IA 5CQ4A 4QY4A 3GG3A 5ETBA 5A5NA 5EWHA 3U5MA 3JVLA 4IR4A 4KCXA 2N9GA 3QZVA 5I86A 4MR6A 5F61A 4QSTA 4NYXA 3QZTA 1N72A 4AKNA 4N4FA 5JI8A 4QEVA 4PS5A 3U5NA 2YELA 4UYFA 5E9VA 3LXJA 5H1VA 3RCWA 4ZC9A 5F1LA 4QC1A 5LVQA 4QYLA 5E73A 5IIDA 4XUBA 5D3JA 4A9NA 4J3IA 4Z1SA 5LKTA 4ALGA 4A9KA 5FE1A 4YADA 5ENGA 4NS5A 2FSAA 4BW4A 5CQTA 5ENFA 3G0JA 4NUCA 1EQFA 5FE8A 5LKZA 3NXBA 2R0YA 5FFWA 5HEMA 2RNWA 2DVQA 5CUEA 4NUEA 2YEMA 4LDFA 4NRBA 5KTXA 5TCMA 3UVDA 5KU3A 4BHWA 5E9MA 3JVJA 3UVXA 5CQ5A 4UYEA 5IBNA 5JWMA 5FE2A 5CPEA 5EPRA 5CUDA 5FE7A 2R0SA 5D3PA 5ENCA 4YBMA 5A81A 4TQNA 2YYNA 2D9EA 4YYDA 4YY6A 3O35A 5DW1A 5FBXA 4OUFA 4F3IA 4IORA 5CQAA 4UYFB 5DYUA 4Z1QA 5HLSA 5CS8A 3UV5A 4WHWA 3O33A 3UVWA 5DKCA 5DY7A 3DWYA 4WHUA 5F3AA 5FH7A 4PTBA 1JM4B 5ENJA 4ZW1A 2I7KA 4TS8A 2RO1A 4XYAA 4YC9A 4UYGA 5DFBA 3SVGA 5FE9A 3O34A 3I3JA 5HFQA 2L5EA 3QZSA 5L97A 5IGNA 5F1HA 5ENHA 5DKHA 5F62A 5DYAA 5FB1A 5F5ZA 4TZ8A 2R0VA 4LYWA 4O72A 5FG4A 4QUUA 5F2PA 4CFLA 5DYXA 5FE3A 5HENA 4E96A 5HM0A 4QEUA 4NYVA 3MUKA 5E9KA 5DLZA 4Y03A 5CTLA 5D3TA 5DBMA 4J1PA 5HJCA 1WUMA 5A83A 4CL9A 4NR8A 5FE4A 5HFRA 4UIWA 4KV1A 3MB3A 2L85A 3U5OA 4QR4A 5EQ1A 2YW5A 4NQNA 5DW2A 4Z93A 5KHMA 2WP2A 4QSRA 4QZSA 2F6JA 2KTBB 5EGUA 4DONA 4QC3A 4QR3A 5A5OA 4O7FA 4GPJA 5I40A 4CLBA 3LQHA 2I8NA 4NRAA 2G4AA 4N4GA 4YBSA 4CURA 4LZ2A 2R10A 4HXLA 4MR4A 3JVKA 3HMEA 4NYWA 2DWWA 5EA1A 4O71A 5EICA 5LKUA 4A9LA 5C7NA 2LSPB 2YQDA 4IR3A 4UYHA 5ENBA 5E3GA 5CUBA 5CY9A 5DYCA 5EWCA 4ZQLA 4QR5A 4XY8A 2OSSA 4O75A 4BW2A 4YYJA 4PKLA 4UIYA 5I88A 5FG6A 5C85A 4HBWA 4OGIA 3SVFA 5BT4A 5HCLA 4A9EA 4A9IA 4HBYA 4YK0A 4PCEA 5ENEA 5CQ8A 4NXJA 4NR9A 5EISA 4A9HA 4LR6A 5CZGA 5IGKA 5L98A 5D24A 4HBXA 2GRCA 5I7YA 2D82A 3MQMA 5A82A 5IGLA 5KTWA 5H85A 4C67A 5KTUA 4O7AA 3MULA 4QSSA 4QSPA 4NR4A 4Q0NA 4HXRA 5CUGA 3P1FA 4A9JA 2RNYA 4PY6A 4HXPA 5A5QA 4YAXA 3MXFA 4YY4A 5CFWA 3FKMX 5D3HA 5ENIA 5L8TA 2MJVB 5C89A 5HRXA 5CRZA 1ZS5A 5EU1A 4YH4A 4LYIA 5EVAA 4YYKA 5LJ0A 5EM3A 4ALHA 3D7CA 5LJ1A 4BJXA 5CGPA 4LYSA 4LZSA 4TTEA 4KV4A 5DLXA 4N3WA 4QBMA 2DATA 4LC2A 3AQAA 3P1EA 5FG5A 4A9OA 2RI7A 3IU6A 4HBVA 3O37A 3UV4A 5TB6A 2RNXA 5I29A 3MB4A 3U5PA 3UV2A 4UIUA 4QYDA 2H60A 5HRWA 5HQ6A 5I1QA 5BT5A 4NQMA 5FB0A 4MEPA 3LQIA 4IOQA 4NRCA 5D26A 5F25A 5KO4A 4MEOA 3JVMA 5D3RA 4CUPA 2DVSA 2OO1A 2DKWA 2NXBA 4UIZA 4NR5A 5LJ2A 2L84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D3NA 4N4HA 3P1CA 5FFVA 2WP1A 4LZRA 4TU4A 4TT2A 5II1A 2DVRA 5CP5A 3U5JA 4AKHA 3D1BA 4WIVA 3AADA 4MR3A 4NUDA 4HXSA 3U5KA 5D25A 4HXNA 2YEKA 4BW1A 5HQ5A 5D3LA 5F36A 2E7OA 5EWVA 4YYIA 5D0CA 3S91A 5CUCA 5D3SA 5DKDA 5A5RA 4O7BA 5F60A 5AD2A 5F63A 5EWDA 4QSVA 4TT6A 4IR5A 4LRGA 4YYMA 3O36A 4RVRA 2E7NA 2YDWA 4UIXA 1WUGA 3U5LA 4J0SA 5LVRA 5DX4A 1X0JA 4MEQA 4HXMA 4QB3A 4O76A 5FFYA 5E0RA 4PCIA 5A85A 2DVVA 4CFKA 5LUUA 2E3KA 5L96A 5AMFA 3LJWA 3Q2FA 4XY9A 4YYNA 5LKXA 2F6NA 4QSWA 5H1TA 5K29A 4Q0OA 3ZYUA 5I7XA 5E9YA 5II2A 4QSXA 3ONIA 5AD3A 5FE5A 5G4SA 5I89A 5I80A 5IG6A 5HQ7A 2EJNA 5CQ6A 5H1UA 5C4QA 4YYGA 4X2IA 5A7CA 5EP7A 5A5PA 5HELA 4IR6A 5EPBA 3K2JA 4TT4A 4FLPA 5G4RA 4A9FA 4CUQA 4MR5A 2RFJA 5E9LA 3DAIA 1JSPB 5C87A 5E7DA 5ETDA 5ACYA 4BW3A 4IOOA 3VKHA 3P1DA 4QEWA 4NR7A 5DFCA 4YBTA 5CUAA 5L99A 4Z6HA 5EI4A 2RS9B 4O77A 3HMFA 5E9IA 5EV9A 4CUTA 4O7CA 5COIA 5A5SA 4UIVA 4TZ2A 5E3DA 5FE6A 4UYDA 4O7EA 4N4IA 5J0DA 4O70A 4TYLA 3S92A 4HXOA 3LQJA 5E74A 5D7XA 1E6IA 5BT3A 3UW9A 5AMEA 4YYHA 4OGJA 5CRMA 5CQ3A 3Q2EA 3HMHA 4QNSA 4O74A 4TU6A 5HRVA 4YATA 4XUAA 4A9MA 5CQ7A 5FH8A 5C8GA 4O78A 4C66A 4NR6A 4QSQA 4CUSA 3P5OA 4UITA 4AKGA 5FE0A 5EWWA 5EK9A 5FH6A 3G0LA 2OUOA 4HXKA 4QUTA 5DFDA 5IGMA 4QSUA 5CU8A 3IU5A 3UVYA 5EPSA 4YABA 4CUUA 5FDZA 4MENA 3TLPA 3SVHA 4YH3A 5L8UA 4J0RA 5I83A 1F68A 4Z6IA 5CQ4A 4QY4A 3GG3A 5ETBA 5A5NA 5EWHA 3U5MA 3JVLA 4IR4A 4KCXA 2N9GA 3QZVA 5I86A 4MR6A 5F61A 4QSTA 4NYXA 3QZTA 1N72A 4AKNA 4N4FA 5JI8A 4QEVA 4PS5A 3U5NA 2YELA 4UYFA 5E9VA 3LXJA 5H1VA 3RCWA 4ZC9A 3D1DA 5F1LA 4QC1A 5LVQA 4QYLA 5E73A 5IIDA 4XUBA 5D3JA 4A9NA 4J3IA 4Z1SA 5LKTA 4ALGA 4A9KA 5FE1A 4YADA 5ENGA 4NS5A 2FSAA 4BW4A 5CQTA 5ENFA 3G0JA 4NUCA 1EQFA 5FE8A 5LKZA 3NXBA 2R0YA 5FFWA 5HEMA 2RNWA 2DVQA 5CUEA 4NUEA 2YEMA 4LDFA 4NRBA 5KTXA 5TCMA 3UVDA 5KU3A 4BHWA 5E9MA 3JVJA 3UVXA 5CQ5A 4UYEA 5IBNA 5JWMA 5FE2A 5CPEA 5EPRA 5CUDA 1PUOA 5FE7A 2R0SA 5D3PA 5ENCA 4YBMA 5A81A 4TQNA 2YYNA 2D9EA 4YYDA 4YY6A 3O35A 5DW1A 5FBXA 4OUFA 4F3IA 4IORA 5CQAA 4UYFB 5DYUA 4Z1QA 5HLSA 5CS8A 3UV5A 4WHWA 3O33A 3UVWA 5DKCA 5DY7A 3DWYA 4WHUA 5F3AA 5FH7A 4PTBA 1JM4B 5ENJA 4ZW1A 2I7KA 4TS8A 2RO1A 4XYAA 4YC9A 4UYGA 5DFBA 3SVGA 3VKGA 5FE9A 3O34A 3I3JA 5HFQA 2L5EA 3QZSA 5L97A 5IGNA 5F1HA 5ENHA 5DKHA 5F62A 5DYAA 5FB1A 5F5ZA 4TZ8A 2R0VA 4LYWA 4O72A 5FG4A 4QUUA 5F2PA 4CFLA 5DYXA 5FE3A 5HENA 4E96A 5HM0A 4QEUA 4NYVA 3MUKA 5E9KA 5DLZA 3ERRA 4Y03A 5CTLA 5D3TA 5DBMA 4J1PA 5HJCA 1WUMA 5A83A 4CL9A 4NR8A 5FE4A 5HFRA 4UIWA 4KV1A 3MB3A 2L85A 3U5OA 4QR4A 5EQ1A 2YW5A 4NQNA 5DW2A 4Z93A 5KHMA 2WP2A 4QSRA 4QZSA 4AKIA 2F6JA 2KTBB 5EGUA 4DONA 4QC3A 4QR3A 5A5OA 4O7FA 4GPJA 5I40A 4CLBA 3LQHA 2I8NA 4NRAA 2G4AA 4N4GA 4YBSA 4CURA 4LZ2A 2R10A 4HXLA 4MR4A 3JVKA 3HMEA 4NYWA 2DWWA 5EA1A 4O71A 5EICA 5LKUA 4A9LA 5C7NA 2LSPB 2YQDA 4IR3A 4UYHA 5ENBA 5E3GA 5CUBA 1ZKRA 5CY9A 5DYCA 5EWCA 4ZQLA 4QR5A 4XY8A 2OSSA 4O75A 4BW2A 4YYJA 4PKLA 4UIYA 5I88A 5FG6A 5C85A 4HBWA 4OGIA 3SVFA 5BT4A 5HCLA 4A9EA 4A9IA 4HBYA 4YK0A 4PCEA 5ENEA 5CQ8A 4NXJA 4NR9A 5EISA 4A9HA 4LR6A 5CZGA 5IGKA 5L98A 5D24A 4HBXA 2GRCA 5I7YA 2D82A 3MQMA 5A82A 5IGLA 5KTWA 5H85A 4C67A 5KTUA 4O7AA 3MULA 4QSSA 4QSPA 4NR4A 4Q0NA 4HXRA 5CUGA 3P1FA 4A9JA 2RNYA 4PY6A 4HXPA 5A5QA 4YAXA 3MXFA 4YY4A 5CFWA 3FKMX 5D3HA 5ENIA 5L8TA 2MJVB 5C89A 5HRXA 5CRZA 1ZS5A 5EU1A 4YH4A 4LYIA 5EVAA 4YYKA 5LJ0A 5EM3A 4ALHA 3D7CA 5LJ1A 4BJXA 5CGPA 4LYSA 4LZSA 4TTEA 4KV4A 5DLXA 4N3WA 4QBMA 2DATA 4LC2A 3AQAA 3P1EA 5FG5A 4A9OA 2RI7A 3IU6A 4HBVA 3O37A 3UV4A 5TB6A 2RNXA 5I29A 3MB4A 3U5PA 4AI6A 3UV2A 4UIUA 4QYDA 2H60A 5HRWA 5HQ6A 5I1QA 5BT5A 4NQMA 5FB0A 4MEPA 3LQIA 4IOQA 4NRCA 5D26A 5F25A 5KO4A 4MEOA 3JVMA 5D3RA 4CUPA 2DVSA 2OO1A 2DKWA 2NXBA 4UIZA 4NR5A 5LJ2A 2L84A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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