4MEOA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a 2-methyl-quinoline ligand
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Discovery of Novel Small-Molecule Inhibitors of BRD4 Using Structure-Based Virtual Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4meoA01
2F6JA 5AD3A 5C7NA 4LC2A 4YADA 2WP2A 5FFYA 4QEWA 4HXOA 3O36A 5D3RA 4TT6A 5EV9A 5FB1A 2RNYA 2N9GA 2I8NA 5CS8A 4Y03A 4QR3A 4QSTA 5HEMA 5EWDA 5EISA 5HFRA 5BT4A 5FE5A 5DX4A 3MUKA 5D25A 5CUAA 5FH6A 5I7XA 5FE9A 5FE0A 5LKUA 5DFBA 4CURA 5EICA 4YYKA 5DW2A 5FE2A 5HLSA 4RVRA 4N4HA 4NXJA 3U5NA 4CLBA 5DYCA 3UV5A 5C87A 5A83A 2OSSA 5K29A 5H85A 4NRCA 2E7OA 4N4GA 4HXKA 4YK0A 2DVVA 3JVJA 4KV4A 3S91A 4QSPA 5EGUA 4CFKA 5KO4A 4YYHA 1E6IA 5HELA 5LKTA 4TTEA 5BT5A 2R0SA 5FG4A 5LUUA 5ENJA 5D0CA 4ZC9A 4X2IA 3U5KA 3SVHA 5E9LA 5A7CA 2R0VA 4OUFA 4BW3A 4GPJA 5G4RA 3LQHA 5TCMA 3P5OA 5EA1A 5JI8A 4C67A 4QY4A 4LDFA 4J0RA 4WHWA 4LYIA 5FE1A 5EP7A 5L99A 1F68A 3QZSA 3K2JA 5HJCA 5E9VA 4YABA 3S92A 4YC9A 4O7FA 2L84A 4YAXA 4KCXA 3UW9A 3P1CA 3Q2FA 4O76A 4UYFB 2RI7A 2OO1A 1WUMA 5E9MA 5EQ1A 2H60A 4HXRA 3MXFA 5II1A 3LJWA 5CGPA 4QEVA 5HCLA 4Z1QA 2GRCA 5CQ4A 5CZGA 5DLXA 5H1TA 2YEKA 4HXSA 4LYSA 5FDZA 3U5OA 4PCEA 5DYAA 5F5ZA 4XY9A 5FH8A 3IU6A 5L8UA 4QSXA 4XYAA 5IGMA 3UV2A 4MR4A 5LJ0A 4HBVA 4TS8A 4A9OA 4F3IA 3HMEA 5D3LA 1N72A 4NQNA 3I3JA 2R0YA 4ZW1A 4TZ2A 5CY9A 4NRAA 5FG5A 3LQIA 5FFVA 5I40A 4YY4A 4O72A 4TT2A 3QZVA 3ZYUA 5D3JA 4XUBA 4CUTA 4CUQA 4UYFA 5CTLA 5DFDA 4NUEA 4ZQLA 2DVRA 4UIUA 5ETBA 5FH7A 1X0JA 4IORA 5FE8A 5CUGA 3G0LA 5G4SA 4ALHA 4A9IA 2YDWA 5IIDA 4N4FA 4LYWA 5A81A 2YW5A 4C66A 3O35A 5FE6A 5F2PA 5EWCA 4IOQA 5IGKA 5ENFA 5KTUA 5LVRA 2I7KA 4N4IA 2E3KA 4IR5A 5D3SA 2DKWA 5DKDA 4Z6IA 5FE7A 4LZRA 3UVXA 5HRWA 3UVDA 5I1QA 3JVLA 4TU6A 3LXJA 4TU4A 5DBMA 4PS5A 5HRVA 5CQ8A 5EWHA 5C85A 3JVKA 4NRBA 2DWWA 3ONIA 5L97A 4YH3A 4YATA 2R10A 5DYXA 5DKCA 3TLPA 4UIZA 5C4QA 4QB3A 5IGNA 4J0SA 5HM0A 2OUOA 5E74A 4A9EA 4HBWA 4UYEA 4PKLA 5DKHA 4BW1A 4TZ8A 4QR4A 4HXNA 4O71A 4XUAA 5CU8A 5KU3A 4BHWA 3O34A 2NXBA 2RS9B 5CP5A 5FB0A 4Q0NA 3Q2EA 4J1PA 5DLZA 2YYNA 4NR8A 4NYVA 5KTXA 5F62A 4KV1A 4TYLA 5BT3A 5E3GA 5II2A 3AQAA 4YYMA 5KHMA 4BJXA 4UYHA 5EWVA 4NYWA 5E0RA 4YY6A 5A5NA 3IU5A 4YH4A 5E9IA 2DATA 3QZTA 5F36A 5L98A 4LRGA 2D9EA 2YQDA 5CQAA 4UIVA 4QZSA 4BW2A 5DFCA 5D3TA 5KTWA 4IR4A 5CQ3A 5HQ7A 4AKNA 5IGLA 3U5JA 4Z93A 5AD2A 2FSAA 4YBTA 4HXMA 3GG3A 5AMFA 4IR6A 5CUCA 5L96A 5DW1A 4NR9A 4WIVA 5F1LA 4LZSA 1WUGA 4O7EA 4QSWA 5C89A 4CFLA 4CL9A 5D26A 4ALGA 4UIYA 5E9KA 5F61A 4IR3A 4QSUA 4E96A 5HQ5A 2KTBB 4UIXA 3FKMX 5HQ6A 2YEMA 5C8GA 4CUUA 5A5QA 5D3HA 4A9HA 3MQMA 3DAIA 4QSSA 3U5LA 5EPSA 4MR6A 4MEOA 5EVAA 4A9MA 2MJVB 4OGJA 4Q0OA 5D3NA 4TQNA 4CUPA 5A5OA 5ENGA 5J0DA 4MEQA 4YYIA 4MR3A 5CUEA 4UIWA 4N3WA 4O75A 3SVFA 1EQFA 4HBYA 4Z6HA 5CUBA 5LKXA 5F60A 3UVYA 4HBXA 5ENEA 5A82A 4QC1A 3D7CA 5A5RA 4NS5A 5L8TA 4J3IA 4O7CA 4QNSA 4UITA 5FE3A 4NUCA 4NR7A 2L85A 4PCIA 5EU1A 4HXLA 5FE4A 5CQ7A 4A9FA 5CQTA 4QUUA 4YYNA 5ETDA 5I80A 5D24A 5D7XA 5A85A 5E73A 5FBXA 5E7DA 4IOOA 5A5PA 5CQ6A 2RO1A 4QSQA 5CUDA 4QYDA 5JWMA 4PTBA 4YBSA 4NR6A 3P1EA 5CRZA 3DWYA 4HXPA 5I86A 4CUSA 3MULA 4UYGA 5ENBA 4QYLA 3P1DA 5ENHA 4BW4A 3U5PA 5HENA 5ENIA 5EK9A 2WP1A 2YELA 4MENA 4LZ2A 5E3DA 3MB4A 5H1UA 2F6NA 4UYDA 4A9NA 3HMFA 4WHUA 4A9KA 2DVSA 2L5EA 5IG6A 4O78A 3UVWA 3G0JA 5HFQA 4YYDA 2DVQA 5EM3A 5CFWA 5I7YA 4MR5A 4NUDA 4O70A 4Z1SA 5F63A 5E9YA 5H1VA 3U5MA 4QSRA 4DONA 5CPEA 2RNWA 4NYXA 2D82A 4QSVA 5AMEA 4QC3A 5CRMA 5EI4A 4QEUA 5DYUA 3AADA 4O74A 3MB3A 5FFWA 4QBMA 4LR6A 5TB6A 1ZS5A 3P1FA 4NQMA 4A9LA 5EWWA 5HRXA 3LQJA 5LKZA 4O77A 5FG6A 4XY8A 5F1HA 5EPBA 4QUTA 5I29A 5D3PA 4A9JA 1JM4B 3O37A 5I88A 4NR4A 3HMHA 5ENCA 1JSPB 5A5SA 5EPRA 3O33A 5F25A 4O7AA 5LJ1A 3NXBA 2RFJA 4YYGA 3JVMA 5ACYA 4TT4A 5I83A 2RNXA 4O7BA 4YYJA 4NR5A 5I89A 5COIA 2E7NA 4MEPA 4FLPA 5F3AA 4OGIA 3UV4A 4YBMA 5IBNA 5DY7A 5LVQA 2LSPB 2G4AA 3RCWA 3SVGA 5LJ2A 4QR5A 4PY6A 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F6JA 5AD3A 5C7NA 4LC2A 4YADA 2WP2A 5FFYA 4QEWA 4HXOA 3O36A 5D3RA 4TT6A 5EV9A 5FB1A 2RNYA 2N9GA 2I8NA 5CS8A 4Y03A 4QR3A 4QSTA 5HEMA 5EWDA 5EISA 5HFRA 5BT4A 5FE5A 5DX4A 3MUKA 5D25A 5CUAA 5FH6A 5I7XA 5FE9A 5FE0A 5LKUA 5DFBA 4CURA 5EICA 4YYKA 5DW2A 5FE2A 5HLSA 4RVRA 4N4HA 4NXJA 3U5NA 4CLBA 5DYCA 3UV5A 5C87A 5A83A 2OSSA 5K29A 5H85A 4NRCA 2E7OA 4N4GA 4HXKA 4YK0A 2DVVA 3JVJA 4KV4A 3S91A 4QSPA 5EGUA 4CFKA 5KO4A 4YYHA 1E6IA 5HELA 5LKTA 4TTEA 5BT5A 2R0SA 5FG4A 5LUUA 5ENJA 5D0CA 4ZC9A 4X2IA 3U5KA 3SVHA 5E9LA 5A7CA 2R0VA 4OUFA 4BW3A 4GPJA 5G4RA 3LQHA 5TCMA 3P5OA 5EA1A 5JI8A 4C67A 4QY4A 4LDFA 4J0RA 4WHWA 4LYIA 5FE1A 5EP7A 5L99A 1F68A 3QZSA 3K2JA 5HJCA 5E9VA 4YABA 3S92A 4YC9A 4O7FA 2L84A 4YAXA 4KCXA 3UW9A 3P1CA 3Q2FA 4O76A 4UYFB 2RI7A 2OO1A 1PUOA 1WUMA 5E9MA 5EQ1A 2H60A 4HXRA 3MXFA 5II1A 3LJWA 5CGPA 4QEVA 5HCLA 4Z1QA 2GRCA 5CQ4A 5CZGA 5DLXA 4AKIA 5H1TA 2YEKA 4HXSA 4LYSA 5FDZA 3U5OA 3D1DA 4PCEA 5DYAA 5F5ZA 4XY9A 5FH8A 3IU6A 5L8UA 4QSXA 4XYAA 5IGMA 3UV2A 4MR4A 5LJ0A 4HBVA 4TS8A 4A9OA 4F3IA 3HMEA 5D3LA 1N72A 4NQNA 3I3JA 2R0YA 4ZW1A 4TZ2A 5CY9A 4NRAA 5FG5A 3LQIA 5FFVA 5I40A 4YY4A 4O72A 4TT2A 3QZVA 3ZYUA 5D3JA 4XUBA 4CUTA 4CUQA 4UYFA 5CTLA 5DFDA 4NUEA 4ZQLA 2DVRA 4UIUA 5ETBA 5FH7A 1X0JA 4IORA 5FE8A 5CUGA 3G0LA 5G4SA 4ALHA 4A9IA 2YDWA 5IIDA 4N4FA 4LYWA 5A81A 2YW5A 4C66A 3O35A 5FE6A 5F2PA 5EWCA 4IOQA 5IGKA 5ENFA 5KTUA 1ZKRA 5LVRA 2I7KA 4N4IA 2E3KA 4IR5A 5D3SA 2DKWA 5DKDA 4Z6IA 5FE7A 4LZRA 3UVXA 5HRWA 3UVDA 5I1QA 3JVLA 4TU6A 3LXJA 4TU4A 5DBMA 4PS5A 5HRVA 5CQ8A 5EWHA 5C85A 3JVKA 4NRBA 2DWWA 3ONIA 5L97A 4YH3A 4YATA 3VKHA 2R10A 5DYXA 5DKCA 3TLPA 4UIZA 5C4QA 4QB3A 5IGNA 4J0SA 5HM0A 2OUOA 5E74A 4A9EA 4HBWA 4UYEA 4PKLA 5DKHA 4BW1A 4TZ8A 4QR4A 4HXNA 4O71A 4XUAA 5CU8A 5KU3A 4BHWA 3O34A 2NXBA 2RS9B 3D1BA 5CP5A 5FB0A 4Q0NA 3Q2EA 4J1PA 5DLZA 2YYNA 4NR8A 4NYVA 5KTXA 5F62A 4KV1A 4TYLA 5BT3A 5E3GA 5II2A 3AQAA 4YYMA 5KHMA 4BJXA 4UYHA 5EWVA 4NYWA 5E0RA 4YY6A 5A5NA 3IU5A 4YH4A 5E9IA 2DATA 3QZTA 5F36A 5L98A 4LRGA 2D9EA 2YQDA 5CQAA 4UIVA 4QZSA 4BW2A 5DFCA 5D3TA 5KTWA 4IR4A 5CQ3A 5HQ7A 4AKNA 5IGLA 3U5JA 4Z93A 5AD2A 2FSAA 4YBTA 4HXMA 3GG3A 5AMFA 4IR6A 5CUCA 5L96A 5DW1A 4NR9A 4WIVA 5F1LA 4LZSA 1WUGA 4O7EA 4QSWA 5C89A 4CFLA 4CL9A 5D26A 4ALGA 4UIYA 5E9KA 5F61A 4IR3A 4AKHA 4QSUA 4E96A 5HQ5A 2KTBB 4UIXA 3FKMX 5HQ6A 2YEMA 5C8GA 4CUUA 5A5QA 5D3HA 4A9HA 3MQMA 3DAIA 4QSSA 3U5LA 5EPSA 4MR6A 4MEOA 5EVAA 4A9MA 2MJVB 4OGJA 4Q0OA 5D3NA 4TQNA 4CUPA 5A5OA 5ENGA 5J0DA 4MEQA 4YYIA 4MR3A 5CUEA 4UIWA 4N3WA 4O75A 3SVFA 1EQFA 4HBYA 4Z6HA 4AI6A 5CUBA 5LKXA 5F60A 3UVYA 4HBXA 5ENEA 5A82A 4QC1A 3D7CA 5A5RA 4NS5A 5L8TA 4J3IA 3ERRA 4O7CA 4QNSA 4UITA 5FE3A 4NUCA 4NR7A 2L85A 4PCIA 5EU1A 4HXLA 5FE4A 5CQ7A 4A9FA 5CQTA 4QUUA 4YYNA 5ETDA 5I80A 5D24A 5D7XA 5A85A 5E73A 5FBXA 5E7DA 4IOOA 5A5PA 5CQ6A 2RO1A 4QSQA 5CUDA 4QYDA 5JWMA 4PTBA 4YBSA 4NR6A 3P1EA 5CRZA 3DWYA 4HXPA 5I86A 4CUSA 3MULA 4UYGA 5ENBA 3VKGA 4QYLA 3P1DA 5ENHA 4BW4A 3U5PA 5HENA 5ENIA 5EK9A 2WP1A 2YELA 4MENA 4LZ2A 5E3DA 3MB4A 5H1UA 2F6NA 4UYDA 4A9NA 3HMFA 4WHUA 2EJNA 4A9KA 2DVSA 2L5EA 5IG6A 4O78A 3UVWA 3G0JA 5HFQA 4YYDA 2DVQA 5EM3A 5CFWA 5I7YA 4MR5A 4NUDA 4O70A 4Z1SA 5F63A 5E9YA 5H1VA 3U5MA 4QSRA 4DONA 5CPEA 2RNWA 4NYXA 2D82A 4QSVA 5AMEA 4QC3A 5CRMA 5EI4A 4QEUA 5DYUA 3AADA 4O74A 3MB3A 5FFWA 4QBMA 4LR6A 5TB6A 1ZS5A 3P1FA 4NQMA 4A9LA 5EWWA 5HRXA 3LQJA 5LKZA 4O77A 5FG6A 4XY8A 5F1HA 5EPBA 4QUTA 5I29A 5D3PA 4A9JA 1JM4B 3O37A 5I88A 4NR4A 3HMHA 5ENCA 1JSPB 5A5SA 5EPRA 3O33A 5F25A 4O7AA 5LJ1A 3NXBA 2RFJA 4YYGA 3JVMA 5ACYA 4TT4A 5I83A 2RNXA 4O7BA 4YYJA 4NR5A 5I89A 4AKGA 5COIA 2E7NA 4MEPA 4FLPA 5F3AA 4OGIA 3UV4A 4YBMA 5IBNA 5DY7A 5LVQA 2LSPB 2G4AA 3RCWA 3SVGA 5LJ2A 4QR5A 4PY6A 5CQ5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 2F6J A;  5AD3 A;  5C7N A;  4LC2 A;  4YAD A;  2WP2 A;  5FFY A;  4QEW A;  4HXO A;  3O36 A;  5D3R A;  4TT6 A;  5EV9 A;  5FB1 A;  2RNY A;  2N9G A;  2I8N A;  5CS8 A;  4Y03 A;  4QR3 A;  4QST A;  5HEM A;  5EWD A;  5EIS A;  5HFR A;  5BT4 A;  5FE5 A;  5DX4 A;  3MUK A;  5D25 A;  5CUA A;  5FH6 A;  5I7X A;  5FE9 A;  5FE0 A;  5LKU A;  5DFB A;  4CUR A;  5EIC A;  4YYK A;  5DW2 A;  5FE2 A;  5HLS A;  4RVR A;  4N4H A;  4NXJ A;  3U5N A;  4CLB A;  5DYC A;  3UV5 A;  5C87 A;  5A83 A;  2OSS A;  5K29 A;  5H85 A;  4NRC A;  2E7O A;  4N4G A;  4HXK A;  4YK0 A;  2DVV A;  3JVJ A;  4KV4 A;  3S91 A;  4QSP A;  5EGU A;  4CFK A;  5KO4 A;  4YYH A;  1E6I A;  5HEL A;  5LKT A;  4TTE A;  5BT5 A;  2R0S A;  5FG4 A;  5LUU A;  5ENJ A;  5D0C A;  4ZC9 A;  4X2I A;  3U5K A;  3SVH A;  5E9L A;  5A7C A;  2R0V A;  4OUF A;  4BW3 A;  4GPJ A;  5G4R A;  3LQH A;  5TCM A;  3P5O A;  5EA1 A;  5JI8 A;  4C67 A;  4QY4 A;  4LDF A;  4J0R A;  4WHW A;  4LYI A;  5FE1 A;  5EP7 A;  5L99 A;  1F68 A;  3QZS A;  3K2J A;  5HJC A;  5E9V A;  4YAB A;  3S92 A;  4YC9 A; 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