5F60A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sg3-014
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f60A01
3U5LA 4TTEA 4NRBA 4PS5A 4X2IA 3ZYUA 1N72A 5ENFA 4HBWA 4TU4A 4QR4A 5TCMA 4LZ2A 3U5PA 2L84A 3LQJA 5EPBA 5E9LA 4YYGA 4YYHA 3MB3A 4NQMA 5DKCA 5CQ6A 5FH7A 5D0CA 5LKXA 5IIDA 5EK9A 3Q2FA 3P1EA 4UIWA 5CQ3A 2RNYA 5HQ5A 4A9JA 4KV1A 4QUTA 4NRCA 3DWYA 5HFRA 5HJCA 5HRVA 5EI4A 4QC3A 4YAXA 4HXPA 4Z1SA 2I8NA 5LJ1A 3SVFA 5A83A 5EWDA 3UVWA 4QR3A 4NUDA 3O34A 2D82A 4NYVA 4QR5A 5EISA 4ALHA 5E9KA 4O72A 5DY7A 5F1HA 2RNXA 4ZC9A 4XY9A 5CUEA 4HXSA 4O75A 5FDZA 5FE3A 4J0SA 4UIXA 4XUBA 5IG6A 4PCIA 2YEKA 2DVSA 3JVKA 4QSPA 5DYCA 4QUUA 4O71A 5DYUA 5C85A 5DLXA 4CUPA 3GG3A 4XYAA 5EU1A 5HQ7A 3HMFA 2L85A 3AQAA 5K29A 2DKWA 4NR7A 4J1PA 5CZGA 4PTBA 4QSRA 5F25A 2LSPB 3MULA 2RS9B 3IU5A 4Z93A 4TYLA 5CGPA 4O7FA 2YDWA 5CQ7A 5CQ4A 2KTBB 5H1TA 4N4IA 4UYGA 5ENCA 3QZSA 3ONIA 5CUCA 4WIVA 4QYDA 3SVHA 3U5JA 5DFDA 4YBMA 5KTWA 5DW2A 5IGLA 2WP2A 5DFCA 5D3HA 1ZS5A 3U5NA 3UV4A 3JVJA 5AD2A 4OGIA 3MQMA 4O7CA 5HM0A 4HXMA 5CS8A 4YYIA 4TQNA 3AADA 3G0LA 4LYSA 4QSXA 5COIA 5EWVA 3DAIA 5E74A 3MB4A 4HBVA 4LZSA 5I83A 4A9NA 4ZQLA 4IOOA 4TT4A 5CU8A 5ENBA 5HELA 2YEMA 4LZRA 5DKDA 4A9FA 5KU3A 5E3DA 3O36A 4MR6A 5E9VA 5IBNA 5D25A 4QEUA 2YELA 4A9EA 2RNWA 4TU6A 5C4QA 5L8UA 5HLSA 4A9OA 5BT5A 5I7XA 5CY9A 4NRAA 5FE2A 3LJWA 4O77A 4UYEA 1E6IA 5H1UA 5HCLA 3O37A 4OGJA 5D3TA 5J0DA 2WP1A 5ENIA 5CUAA 5DLZA 5EP7A 4QSUA 5I1QA 4CUQA 4HXKA 4YATA 2R0YA 3U5OA 5CQAA 3UVXA 4BW3A 3U5KA 4YYJA 4CUSA 5KTXA 4UIVA 2DVVA 4QNSA 4OUFA 4CFKA 5F36A 4NR8A 3K2JA 5ENHA 5LUUA 5DFBA 5E7DA 4AKNA 5BT4A 4NQNA 4KV4A 5D3PA 2GRCA 5HEMA 4CFLA 5D26A 5FE4A 3D7CA 5BT3A 4CUUA 5G4RA 5D3NA 4UIUA 5L99A 5FG5A 5FE6A 5EPRA 4PY6A 2YW5A 4RVRA 5FFVA 5EGUA 4IOQA 2NXBA 4NYXA 5H1VA 5F5ZA 5FE9A 5D3RA 4O7BA 3P1FA 3O33A 4QSQA 4Q0NA 4QY4A 5I29A 2YYNA 5I7YA 4O76A 4YYMA 5CQ8A 3RCWA 5AMEA 5FB1A 4Z1QA 4A9LA 4YY6A 4UYFB 4A9HA 4CL9A 5LJ0A 5CRMA 5CUGA 5F2PA 5D3LA 3HMHA 5I40A 4NUEA 4Y03A 5EQ1A 5C8GA 4N4HA 5FH8A 3UV2A 3O35A 4IR3A 5A7CA 3I3JA 5H85A 4MR4A 3FKMX 5A5RA 2RO1A 5FE7A 2R0SA 3QZTA 3MUKA 1X0JA 4YC9A 4N3WA 1WUGA 5ETDA 4UITA 4YYDA 2DATA 3QZVA 4QB3A 4HXNA 4QBMA 4QSTA 5F62A 2F6JA 5IGNA 5HQ6A 5LJ2A 4WHUA 5E3GA 5FE8A 4HXRA 5E9YA 4HBYA 5C89A 4UYFA 2L5EA 5HRXA 5CQ5A 5AMFA 5DYXA 2I7KA 5DW1A 5FH6A 5L97A 5EICA 4HBXA 5LVRA 3LQIA 3UVDA 4O70A 4QSVA 3UW9A 5JWMA 2D9EA 5HRWA 5JI8A 5F1LA 4CLBA 5CRZA 5IGKA 5A5NA 4LYWA 2G4AA 4HXLA 3MXFA 4MEPA 5FE0A 4LRGA 4KCXA 4J0RA 4N4GA 5A85A 5FB0A 5ENEA 5LKUA 5CTLA 4GPJA 3LXJA 5CQTA 5EWHA 4UYDA 5E73A 4WHWA 5ENGA 5EWCA 2E7NA 4QZSA 3P1DA 5DX4A 2H60A 4A9IA 5A5QA 4BW2A 4PCEA 1JM4B 4F3IA 4Z6HA 3SVGA 3HMEA 4MR5A 5LKZA 4YK0A 5DYAA 4YY4A 5DBMA 2R0VA 4NYWA 5KO4A 5CFWA 5LVQA 5LKTA 5C87A 3UV5A 3NXBA 3UVYA 4YYKA 4YYNA 5F63A 2RFJA 4UIZA 5FFWA 5I80A 4UYHA 4QSWA 3P1CA 5FG4A 5EVAA 5HENA 4FLPA 4QYLA 3G0JA 4QC1A 4ZW1A 2RI7A 5F60A 5EPSA 5FBXA 2DWWA 2F6NA 2DVRA 5C7NA 4IR5A 5D3JA 2MJVB 4IR6A 4TZ2A 4IORA 5CP5A 3S92A 4BJXA 4NR9A 4O78A 2YQDA 5FFYA 4HXOA 5EWWA 5L96A 5ETBA 4LC2A 4MR3A 1JSPB 5D24A 2DVQA 3TLPA 4MENA 3S91A 4YBSA 4BHWA 5E9IA 4XY8A 5IGMA 5KTUA 4ALGA 5TB6A 2E7OA 4XUAA 5ACYA 3JVMA 4CUTA 4NR4A 4YH3A 5D3SA 5E0RA 4C67A 4IR4A 5DKHA 5I89A 4YABA 4J3IA 5F3AA 5II1A 4BW1A 5CUDA 5CUBA 4O7AA 4E96A 5A5SA 5II2A 4NR5A 5A5OA 5L8TA 5D7XA 4TS8A 2OO1A 3JVLA 4NS5A 4NXJA 5CPEA 4BW4A 4YBTA 4MEOA 4UIYA 5I86A 4QEVA 2R10A 5E9MA 4YADA 4Z6IA 1EQFA 5EV9A 5A82A 5FE5A 4QEWA 5L98A 4A9MA 1WUMA 3U5MA 4NUCA 4N4FA 2E3KA 5HFQA 5FG6A 4MEQA 5AD3A 4LYIA 3P5OA 5A81A 4C66A 4O74A 5EA1A 4LDFA 2OSSA 4TT6A 4NR6A 1F68A 4Q0OA 5A5PA 5FE1A 5I88A 4DONA 4A9KA 4PKLA 4O7EA 5EM3A 5KHMA 5F61A 4QSSA 4LR6A 5ENJA 3IU6A 3Q2EA 4TT2A 4YH4A 5G4SA 2N9GA 4CURA 3LQHA 2FSAA 2OUOA 4TZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U5LA 4TTEA 4NRBA 4PS5A 4X2IA 3ZYUA 1N72A 5ENFA 4HBWA 4TU4A 4QR4A 5TCMA 4LZ2A 3U5PA 2L84A 3LQJA 5EPBA 5E9LA 4YYGA 4YYHA 3MB3A 4NQMA 5DKCA 5CQ6A 5FH7A 4AKHA 5D0CA 5LKXA 5IIDA 5EK9A 3Q2FA 3P1EA 4UIWA 5CQ3A 2RNYA 5HQ5A 4A9JA 4KV1A 4QUTA 4NRCA 3DWYA 5HFRA 5HJCA 5HRVA 5EI4A 4QC3A 4YAXA 4HXPA 4Z1SA 2I8NA 5LJ1A 3SVFA 5A83A 5EWDA 3UVWA 4QR3A 4NUDA 3O34A 2D82A 3VKHA 4NYVA 4QR5A 5EISA 4ALHA 5E9KA 4O72A 5DY7A 5F1HA 2RNXA 4ZC9A 4XY9A 5CUEA 4HXSA 4O75A 5FDZA 5FE3A 4J0SA 4UIXA 4XUBA 5IG6A 4PCIA 2YEKA 2DVSA 3JVKA 4QSPA 5DYCA 4QUUA 4O71A 5DYUA 5C85A 5DLXA 4CUPA 3GG3A 4XYAA 5EU1A 5HQ7A 3HMFA 2L85A 3AQAA 5K29A 2DKWA 4NR7A 4J1PA 5CZGA 4PTBA 4QSRA 5F25A 2LSPB 3MULA 2RS9B 3IU5A 4Z93A 4TYLA 5CGPA 4O7FA 2YDWA 5CQ7A 5CQ4A 2KTBB 5H1TA 4N4IA 4UYGA 5ENCA 3QZSA 3ONIA 5CUCA 4WIVA 4QYDA 3SVHA 3U5JA 5DFDA 4YBMA 5KTWA 5DW2A 5IGLA 2WP2A 5DFCA 5D3HA 1ZS5A 3U5NA 3UV4A 3JVJA 5AD2A 4OGIA 3MQMA 4O7CA 5HM0A 4HXMA 5CS8A 4YYIA 4TQNA 3AADA 3G0LA 4LYSA 4QSXA 5COIA 5EWVA 3DAIA 5E74A 3MB4A 4HBVA 4LZSA 5I83A 4A9NA 4ZQLA 4IOOA 4TT4A 5CU8A 5ENBA 5HELA 2YEMA 4LZRA 5DKDA 4A9FA 5KU3A 5E3DA 3O36A 4MR6A 5E9VA 5IBNA 5D25A 4QEUA 2YELA 4A9EA 2RNWA 4TU6A 5C4QA 5L8UA 5HLSA 4A9OA 5BT5A 5I7XA 5CY9A 4NRAA 5FE2A 3LJWA 4O77A 4UYEA 1E6IA 5H1UA 5HCLA 3O37A 4OGJA 5D3TA 5J0DA 2WP1A 5ENIA 5CUAA 5DLZA 5EP7A 4QSUA 5I1QA 4CUQA 4HXKA 4YATA 2R0YA 3U5OA 5CQAA 3UVXA 4BW3A 3U5KA 4YYJA 4CUSA 5KTXA 4UIVA 2DVVA 4QNSA 4OUFA 4CFKA 5F36A 4NR8A 3K2JA 5ENHA 5LUUA 5DFBA 5E7DA 4AKNA 5BT4A 4NQNA 4KV4A 5D3PA 2GRCA 5HEMA 4CFLA 5D26A 5FE4A 3D7CA 5BT3A 4CUUA 5G4RA 5D3NA 4UIUA 5L99A 5FG5A 5FE6A 5EPRA 4PY6A 2YW5A 4RVRA 5FFVA 5EGUA 4IOQA 2NXBA 4NYXA 5H1VA 5F5ZA 5FE9A 5D3RA 4O7BA 3P1FA 3O33A 4QSQA 4Q0NA 4QY4A 5I29A 2YYNA 5I7YA 4O76A 4YYMA 5CQ8A 3D1DA 3RCWA 5AMEA 5FB1A 4Z1QA 4A9LA 4YY6A 4UYFB 4A9HA 4CL9A 5LJ0A 5CRMA 5CUGA 5F2PA 5D3LA 3HMHA 5I40A 4NUEA 4Y03A 5EQ1A 5C8GA 4N4HA 5FH8A 3UV2A 3O35A 4IR3A 5A7CA 3I3JA 5H85A 4MR4A 3FKMX 5A5RA 2RO1A 5FE7A 3VKGA 2R0SA 3QZTA 3MUKA 1X0JA 4YC9A 4N3WA 1WUGA 5ETDA 4UITA 4YYDA 2DATA 3QZVA 4QB3A 4HXNA 4QBMA 4QSTA 5F62A 2F6JA 5IGNA 5HQ6A 5LJ2A 4WHUA 5E3GA 5FE8A 3D1BA 4HXRA 5E9YA 4HBYA 5C89A 4UYFA 2L5EA 5HRXA 5CQ5A 5AMFA 5DYXA 2I7KA 5DW1A 5FH6A 5L97A 5EICA 4HBXA 5LVRA 3LQIA 3UVDA 4O70A 4QSVA 3UW9A 5JWMA 2D9EA 5HRWA 5JI8A 5F1LA 4CLBA 5CRZA 1PUOA 5IGKA 5A5NA 4LYWA 2G4AA 4HXLA 3MXFA 4MEPA 5FE0A 4LRGA 4KCXA 4J0RA 4N4GA 5A85A 5FB0A 5ENEA 3ERRA 5LKUA 5CTLA 4GPJA 3LXJA 5CQTA 5EWHA 4UYDA 5E73A 4WHWA 5ENGA 5EWCA 2E7NA 4QZSA 3P1DA 5DX4A 2H60A 4A9IA 5A5QA 4BW2A 4PCEA 1JM4B 4F3IA 4Z6HA 3SVGA 1ZKRA 3HMEA 4AKIA 4MR5A 5LKZA 4YK0A 5DYAA 4YY4A 5DBMA 2R0VA 4NYWA 5KO4A 5CFWA 5LVQA 5LKTA 5C87A 3UV5A 3NXBA 3UVYA 4YYKA 4YYNA 5F63A 2RFJA 4UIZA 5FFWA 5I80A 4UYHA 4QSWA 3P1CA 5FG4A 5EVAA 5HENA 4FLPA 4QYLA 3G0JA 4QC1A 4ZW1A 2RI7A 5F60A 5EPSA 5FBXA 2DWWA 2F6NA 2DVRA 5C7NA 4IR5A 5D3JA 2MJVB 4IR6A 4TZ2A 4IORA 5CP5A 3S92A 4BJXA 4NR9A 4O78A 2YQDA 5FFYA 4HXOA 5EWWA 5L96A 5ETBA 4LC2A 4MR3A 1JSPB 5D24A 2DVQA 3TLPA 4MENA 3S91A 4YBSA 4BHWA 5E9IA 4XY8A 5IGMA 5KTUA 4ALGA 5TB6A 2E7OA 4XUAA 5ACYA 3JVMA 4CUTA 4NR4A 4YH3A 5D3SA 5E0RA 4C67A 4IR4A 5DKHA 5I89A 4YABA 4J3IA 5F3AA 5II1A 4BW1A 5CUDA 5CUBA 4O7AA 4E96A 5A5SA 5II2A 4NR5A 5A5OA 5L8TA 5D7XA 4TS8A 2OO1A 3JVLA 4NS5A 4NXJA 5CPEA 4BW4A 4YBTA 4MEOA 4UIYA 5I86A 4QEVA 2R10A 5E9MA 4YADA 4Z6IA 1EQFA 5EV9A 5A82A 5FE5A 4QEWA 5L98A 4A9MA 1WUMA 3U5MA 4NUCA 4N4FA 2E3KA 5HFQA 5FG6A 4MEQA 5AD3A 4AI6A 4LYIA 3P5OA 5A81A 4C66A 4O74A 5EA1A 4LDFA 2OSSA 4TT6A 4NR6A 1F68A 4Q0OA 5A5PA 5FE1A 5I88A 2EJNA 4DONA 4A9KA 4PKLA 4O7EA 5EM3A 5KHMA 5F61A 4QSSA 4AKGA 4LR6A 5ENJA 3IU6A 3Q2EA 4TT2A 4YH4A 5G4SA 2N9GA 4CURA 3LQHA 2FSAA 2OUOA 4TZ8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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