5F60A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sg3-014
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f60A01
4HXPA 4O71A 5KTXA 2LSPB 4ZW1A 4Z93A 4UIUA 5KO4A 5A83A 5EVAA 4PCIA 5DFCA 4ALHA 5K29A 3U5PA 3QZSA 2KTBB 4N4GA 5CGPA 5E74A 4IR6A 5CQ7A 5ETBA 4TT4A 5DX4A 5ENFA 2OO1A 4QSQA 4YC9A 5I1QA 5FE4A 5LKTA 5EQ1A 3RCWA 5E7DA 5FE2A 5FDZA 4QSTA 5CRMA 5LJ0A 3MB4A 3LJWA 3O35A 5IIDA 5HENA 5HQ5A 5CUGA 5FE3A 5E9YA 2E7NA 4NXJA 5FG5A 5IG6A 4QR4A 4O7EA 5CUBA 5I88A 5HLSA 3HMFA 5L99A 4UYGA 3UV4A 5HJCA 5I29A 5E73A 5DYXA 3SVHA 3U5OA 5A5QA 5FG4A 2OUOA 4QSWA 5DYCA 5KTWA 4QUUA 4PCEA 5EV9A 2RI7A 5FB0A 4LZ2A 4BW3A 3UVWA 2D82A 4OGIA 4QYDA 3P5OA 5LVRA 5F3AA 4RVRA 4N3WA 5CQ6A 3MQMA 4O77A 5LKXA 4LC2A 4QR3A 5EICA 3ZYUA 4O78A 5A81A 5LUUA 4XUAA 3UVDA 4UIXA 4YYNA 4O7BA 4YBMA 4BHWA 3LQHA 4CFLA 1JM4B 4TU4A 4A9JA 5I86A 3LQJA 5LJ1A 3UVYA 5KHMA 2RNXA 4TTEA 4MENA 4KV1A 4NQNA 5IGNA 2NXBA 4YYGA 2N9GA 5F1LA 5F2PA 4FLPA 4O75A 5FB1A 3U5KA 2YELA 5D3LA 4IR4A 5C89A 2E3KA 3G0JA 5ENCA 5DFDA 5CS8A 4OUFA 5CP5A 5A5SA 5E9KA 1EQFA 4WHUA 4CUUA 4MR5A 4YBTA 5HM0A 4NR7A 3HMEA 4UIWA 5II2A 4BW2A 2RNYA 4A9NA 5LJ2A 3IU5A 5ACYA 5ENIA 4CUPA 4KV4A 1JSPB 3ONIA 5AD3A 2YEMA 3S92A 4O74A 3O36A 4QEVA 4XUBA 2YQDA 3O37A 5CZGA 1WUMA 2DVSA 4YYIA 4LZRA 3UW9A 4E96A 4CL9A 5IGKA 2I8NA 5CQ5A 3GG3A 4DONA 5EU1A 4NQMA 5JI8A 5F60A 4MEPA 4TU6A 5A5NA 2L84A 1E6IA 4NR4A 4NUCA 4O72A 2RS9B 5E3GA 5EM3A 4CUSA 4A9FA 5FFWA 4N4FA 4C66A 4QSPA 5BT3A 4NR9A 4NR5A 5CPEA 5ETDA 4QYLA 4HXRA 5ENJA 5C87A 5EK9A 5FE1A 4HBVA 5D3SA 5D25A 4UYFA 4Z6HA 2WP2A 3UVXA 5IGLA 2DATA 4X2IA 4ZC9A 5FE9A 5E3DA 2DKWA 4A9MA 5ENHA 3S91A 5DW1A 4Z6IA 5BT4A 5D3TA 2GRCA 5CUDA 5FE6A 4OGJA 3P1CA 3Q2EA 5EWWA 5E9MA 5DFBA 4YY6A 5C7NA 5TCMA 4YYDA 5EISA 4UIZA 5F5ZA 5KU3A 3MULA 5C85A 3JVKA 5IGMA 5C4QA 4A9OA 5EWCA 4YYMA 5F62A 5D3PA 4HBXA 5DKDA 4TYLA 4A9LA 5D3NA 5AD2A 5CUCA 5H1VA 3IU6A 5I40A 2MJVB 5AMEA 5FG6A 4QSXA 2YYNA 5IBNA 4NR6A 2L85A 2D9EA 5G4RA 4CUQA 5DKCA 5LKZA 4NUEA 5CU8A 5CQAA 4UYHA 5C8GA 3HMHA 4TZ2A 5HRVA 4YYKA 5EWVA 5II1A 4N4HA 5HFQA 4YH4A 4J0RA 5DBMA 5D3HA 2H60A 4IR3A 5F1HA 5FE5A 2WP1A 4O7AA 2FSAA 5FH7A 5KTUA 3K2JA 5I7YA 5LVQA 5D24A 4HBWA 5DYUA 5DLXA 3UV2A 4BJXA 4F3IA 5EPRA 5ENEA 3DAIA 5FH6A 4QUTA 4QBMA 4HXNA 4BW4A 3LQIA 3D7CA 2G4AA 4IORA 4UITA 3QZTA 5FE7A 5D26A 3P1FA 2YEKA 4J1PA 4LDFA 4Q0NA 2YDWA 2F6JA 3FKMX 5HRXA 4TT6A 3AQAA 4ZQLA 4AKNA 4IR5A 4O70A 4YYHA 4HBYA 5CQ4A 5A7CA 5E9IA 3U5JA 3MUKA 5CQTA 4PTBA 2RO1A 4J0SA 5CQ8A 4QB3A 4NRBA 4CFKA 5A82A 5G4SA 4CLBA 2RFJA 4UYEA 5EP7A 5JWMA 5DY7A 3O34A 5D3RA 4A9KA 1ZS5A 4WIVA 4YYJA 5FH8A 5AMFA 4TT2A 4YY4A 5J0DA 4HXLA 4YBSA 5FE8A 5EGUA 2DVQA 3LXJA 3Q2FA 5I83A 4NYVA 4YADA 4NUDA 4QY4A 4N4IA 3P1EA 3U5MA 3P1DA 4NRAA 4LYIA 5D0CA 4A9IA 4UIVA 5I7XA 5I89A 5CQ3A 4QNSA 4UYDA 3U5NA 3JVJA 1WUGA 5L97A 4O7FA 5A85A 4Y03A 4MR3A 4MR6A 4QEWA 2DVVA 5F25A 5EPSA 3SVGA 2E7OA 4YK0A 4Z1QA 4QSUA 5DKHA 4A9HA 4A9EA 2YW5A 5HQ7A 3AADA 4UYFB 5E9LA 5BT5A 5DYAA 5EWHA 4IOQA 5H85A 4BW1A 2L5EA 5CUAA 4QSSA 4WHWA 4NYWA 5L96A 3MB3A 5HFRA 5CUEA 4HXSA 5CY9A 4NS5A 5FFVA 4CURA 4UIYA 5EPBA 5E0RA 3MXFA 2R0YA 4YAXA 4GPJA 5F61A 4Q0OA 5A5OA 5H1UA 4KCXA 3JVLA 3UV5A 5DLZA 4QC1A 5FE0A 5EWDA 5DW2A 4MEQA 5HQ6A 5L98A 4HXKA 4PKLA 4XYAA 4LYWA 5EI4A 3U5LA 4TQNA 2R0SA 4QSRA 5CRZA 5L8TA 4QSVA 5F36A 4MEOA 4PY6A 3SVFA 5COIA 5HRWA 4QR5A 4YABA 4LRGA 2I7KA 5L8UA 2RNWA 4PS5A 4IOOA 4J3IA 4QC3A 5EA1A 4NRCA 2DWWA 5A5RA 3NXBA 5HEMA 5LKUA 4ALGA 2F6NA 4C67A 5D3JA 4HXOA 3DWYA 5I80A 5E9VA 5H1TA 4LR6A 1X0JA 5FBXA 5CFWA 3JVMA 4Z1SA 4LZSA 5D7XA 4HXMA 2R10A 4LYSA 4YATA 4TZ8A 4O7CA 4NR8A 4XY8A 3TLPA 4QEUA 4YH3A 5F63A 4NYXA 3QZVA 1N72A 3G0LA 5A5PA 2DVRA 5HCLA 5ENBA 2R0VA 1F68A 5ENGA 4QZSA 4O76A 2OSSA 5FFYA 4MR4A 4CUTA 5HELA 5CTLA 3O33A 3I3JA 5TB6A 4TS8A 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXPA 4O71A 5KTXA 2LSPB 4ZW1A 4Z93A 4UIUA 5KO4A 5A83A 5EVAA 4PCIA 5DFCA 4ALHA 5K29A 3U5PA 3QZSA 2KTBB 4N4GA 5CGPA 5E74A 4IR6A 5CQ7A 5ETBA 4TT4A 5DX4A 5ENFA 2OO1A 4QSQA 4YC9A 5I1QA 5FE4A 5LKTA 5EQ1A 3RCWA 5E7DA 5FE2A 5FDZA 4QSTA 5CRMA 5LJ0A 3MB4A 3LJWA 3O35A 5IIDA 5HENA 5HQ5A 5CUGA 5FE3A 5E9YA 2E7NA 4NXJA 5FG5A 5IG6A 4QR4A 4O7EA 5CUBA 5I88A 5HLSA 3HMFA 5L99A 4UYGA 3UV4A 5HJCA 5I29A 5E73A 5DYXA 3SVHA 3U5OA 5A5QA 5FG4A 2OUOA 4QSWA 5DYCA 5KTWA 4QUUA 4PCEA 5EV9A 2RI7A 5FB0A 4LZ2A 4BW3A 3UVWA 2D82A 4OGIA 4QYDA 3P5OA 5LVRA 5F3AA 4RVRA 4N3WA 5CQ6A 3D1BA 3MQMA 4O77A 5LKXA 4LC2A 4QR3A 5EICA 3ZYUA 4O78A 5A81A 5LUUA 1ZKRA 4XUAA 3UVDA 4UIXA 4YYNA 4O7BA 4YBMA 4BHWA 3LQHA 4CFLA 1JM4B 4TU4A 4A9JA 5I86A 3LQJA 5LJ1A 3UVYA 5KHMA 2RNXA 4TTEA 4MENA 4KV1A 4NQNA 5IGNA 2NXBA 4YYGA 2N9GA 5F1LA 5F2PA 4FLPA 4O75A 5FB1A 3U5KA 2YELA 5D3LA 4IR4A 5C89A 2E3KA 3G0JA 5ENCA 5CS8A 4OUFA 5DFDA 3VKHA 5CP5A 5A5SA 5E9KA 1EQFA 4WHUA 4CUUA 4MR5A 4YBTA 5HM0A 4NR7A 3HMEA 4UIWA 5II2A 4BW2A 2RNYA 4A9NA 5LJ2A 3IU5A 5ACYA 5ENIA 4CUPA 4KV4A 1JSPB 3ONIA 5AD3A 2YEMA 3S92A 4O74A 3O36A 4QEVA 4XUBA 2YQDA 3O37A 5CZGA 1WUMA 2DVSA 4YYIA 4LZRA 3UW9A 4E96A 4CL9A 5IGKA 2I8NA 5CQ5A 3GG3A 4DONA 5EU1A 4NQMA 5JI8A 5F60A 4MEPA 4TU6A 5A5NA 2L84A 1E6IA 4NR4A 4NUCA 4O72A 2RS9B 5E3GA 5EM3A 4CUSA 4A9FA 5FFWA 4N4FA 4C66A 4QSPA 5BT3A 4NR9A 4NR5A 5CPEA 5ETDA 4QYLA 4HXRA 5ENJA 5C87A 5EK9A 5FE1A 4HBVA 5D3SA 5D25A 4UYFA 4Z6HA 2WP2A 3UVXA 5IGLA 2DATA 4X2IA 4ZC9A 5FE9A 5E3DA 2DKWA 4A9MA 5ENHA 3S91A 5DW1A 4Z6IA 5BT4A 5D3TA 2GRCA 5CUDA 5FE6A 4OGJA 3P1CA 3Q2EA 5EWWA 5E9MA 5DFBA 4YY6A 5C7NA 5TCMA 4YYDA 5EISA 4UIZA 5F5ZA 5KU3A 3MULA 5C85A 3JVKA 5IGMA 5C4QA 4A9OA 5EWCA 4YYMA 5F62A 5D3PA 4HBXA 5DKDA 4TYLA 4A9LA 5D3NA 5AD2A 5CUCA 5H1VA 3IU6A 5I40A 2MJVB 5AMEA 5FG6A 4QSXA 2YYNA 5IBNA 4NR6A 2L85A 2D9EA 5G4RA 4CUQA 5DKCA 5LKZA 4NUEA 5CU8A 5CQAA 4UYHA 5C8GA 3HMHA 4TZ2A 5HRVA 4YYKA 5EWVA 5II1A 4N4HA 5HFQA 4YH4A 4J0RA 5DBMA 4AKIA 5D3HA 2H60A 1PUOA 4IR3A 5F1HA 5FE5A 2WP1A 4O7AA 2FSAA 5FH7A 5KTUA 3K2JA 5I7YA 5LVQA 5D24A 4HBWA 5DYUA 5DLXA 3UV2A 4BJXA 4F3IA 5EPRA 5ENEA 3DAIA 5FH6A 4QUTA 4QBMA 4HXNA 4BW4A 3LQIA 3D7CA 2G4AA 4IORA 4UITA 3QZTA 5FE7A 5D26A 3P1FA 2YEKA 4J1PA 4LDFA 4Q0NA 2YDWA 2F6JA 3FKMX 3VKGA 5HRXA 4TT6A 3AQAA 4ZQLA 4AKNA 4IR5A 4O70A 4YYHA 4HBYA 5CQ4A 5A7CA 5E9IA 4AKHA 3U5JA 3MUKA 5CQTA 4PTBA 2RO1A 4J0SA 5CQ8A 4QB3A 4NRBA 4CFKA 5A82A 5G4SA 4CLBA 2RFJA 4UYEA 5EP7A 5JWMA 5DY7A 3O34A 5D3RA 4A9KA 1ZS5A 4WIVA 4YYJA 5FH8A 5AMFA 4TT2A 4YY4A 5J0DA 4HXLA 4YBSA 5FE8A 5EGUA 2DVQA 3LXJA 3Q2FA 5I83A 3ERRA 4NYVA 4YADA 4NUDA 4QY4A 4N4IA 3P1EA 3U5MA 3P1DA 4NRAA 4LYIA 5D0CA 4A9IA 4UIVA 5I7XA 5I89A 5CQ3A 4QNSA 4UYDA 3U5NA 3JVJA 1WUGA 5L97A 4O7FA 5A85A 4Y03A 4MR3A 4MR6A 4QEWA 2DVVA 5F25A 5EPSA 3SVGA 2E7OA 4YK0A 4Z1QA 4QSUA 5DKHA 4A9HA 4A9EA 2YW5A 5HQ7A 3AADA 4UYFB 5E9LA 5BT5A 5DYAA 5EWHA 4IOQA 5H85A 4BW1A 2L5EA 5CUAA 4QSSA 4WHWA 4NYWA 5L96A 3MB3A 5HFRA 5CUEA 4HXSA 5CY9A 4NS5A 5FFVA 4CURA 4UIYA 5EPBA 5E0RA 3MXFA 2R0YA 4YAXA 4GPJA 5F61A 4Q0OA 5A5OA 5H1UA 4KCXA 3JVLA 3UV5A 5DLZA 2EJNA 4QC1A 5FE0A 5EWDA 5DW2A 4MEQA 5HQ6A 4AKGA 5L98A 4HXKA 4PKLA 4XYAA 4LYWA 5EI4A 3U5LA 4TQNA 2R0SA 4QSRA 5CRZA 5L8TA 4QSVA 5F36A 4MEOA 4PY6A 3SVFA 5COIA 5HRWA 4AI6A 4QR5A 4YABA 4LRGA 2I7KA 5L8UA 2RNWA 4PS5A 4IOOA 4J3IA 4QC3A 5EA1A 4NRCA 2DWWA 5A5RA 3NXBA 5HEMA 5LKUA 4ALGA 2F6NA 4C67A 5D3JA 4HXOA 3DWYA 5I80A 5E9VA 5H1TA 4LR6A 1X0JA 5FBXA 5CFWA 3JVMA 4Z1SA 4LZSA 5D7XA 4HXMA 2R10A 4LYSA 4YATA 4TZ8A 4O7CA 4NR8A 4XY8A 3TLPA 4QEUA 4YH3A 5F63A 4NYXA 3QZVA 1N72A 3G0LA 5A5PA 2DVRA 5HCLA 5ENBA 2R0VA 1F68A 5ENGA 3D1DA 4QZSA 4O76A 2OSSA 5FFYA 4MR4A 4CUTA 5HELA 5CTLA 3O33A 3I3JA 5TB6A 4TS8A 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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