5F60A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sg3-014
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f60A01
5ETDA 4N4FA 1N72A 5CP5A 5D26A 5DKDA 3O34A 2YYNA 4IR6A 3MB3A 5CUAA 4XY9A 4TZ8A 5AMEA 5JI8A 4NRAA 5CU8A 4DONA 4HXNA 5E74A 5FB0A 4UYFA 4A9JA 5CFWA 5HEMA 5CUDA 4YYMA 5DKCA 5LVQA 5DYCA 4PCEA 5AD2A 5EQ1A 4YBTA 4CL9A 3Q2FA 5EWWA 4IR3A 3UVXA 5FH6A 5HELA 3U5MA 4YADA 4CUPA 5E0RA 5FFVA 3G0LA 5DFCA 4Z1QA 5DYUA 5C7NA 2RNXA 4LZRA 4YC9A 5EA1A 4QSUA 4NYVA 5D3PA 2YDWA 3DWYA 5K29A 3HMHA 3O36A 4Z93A 4TYLA 5I86A 5HENA 5D24A 5EV9A 4PY6A 2DWWA 3DAIA 2I7KA 5D25A 5EVAA 5F61A 2F6NA 4HBWA 5I40A 4TU6A 5COIA 5L97A 5DFDA 4J1PA 5FG4A 3ZYUA 5I1QA 4MENA 3LQJA 5CQ7A 2R0VA 4O7AA 4YY6A 4A9HA 5IGNA 4RVRA 3JVLA 3LJWA 4NQNA 5A5RA 4PS5A 4O70A 3MXFA 4J0SA 4A9EA 5FE1A 4IOQA 4GPJA 5E73A 1F68A 5TB6A 2YEMA 5D3LA 5FBXA 4LR6A 3LQIA 5F1LA 5EPRA 5LKXA 2RS9B 4QYLA 5D3HA 5TCMA 5FFYA 4CFLA 4HXMA 4LC2A 4OUFA 5L8TA 5CQ4A 4A9KA 1X0JA 3QZSA 5J0DA 5HLSA 4XY8A 5CQ8A 4IR5A 5KO4A 3P1CA 5FE7A 5CUCA 2KTBB 3QZTA 5L99A 4NQMA 5CQ3A 4HBXA 4FLPA 5F2PA 4NUDA 3MULA 3P5OA 5DKHA 4LZSA 4O75A 4QNSA 4CUUA 4PCIA 4X2IA 4QB3A 1EQFA 1ZS5A 5H1VA 3P1DA 4ZW1A 2YQDA 5CUGA 4YY4A 5I89A 5LVRA 3U5KA 4UITA 5KTXA 5H1TA 4UIZA 5E3GA 4F3IA 5EICA 4QSPA 4YATA 1WUGA 4HXPA 2OSSA 5ETBA 3UVDA 4LRGA 4O78A 4Y03A 4QSRA 3UVWA 5DYAA 2RNYA 4A9NA 2FSAA 2E7OA 4MEPA 5LKTA 5D0CA 4O7EA 5IGKA 5A5NA 5CQAA 5ACYA 4YK0A 4NRBA 5IG6A 5A5QA 4O7FA 5EM3A 4WHWA 2I8NA 5CQTA 4TT6A 4LZ2A 4LYWA 4O7BA 5CRMA 4O74A 5II2A 5KTWA 4QUTA 4O76A 2RFJA 3LXJA 5A5PA 5C8GA 5FE9A 3U5JA 5FE3A 5E9MA 3TLPA 2L5EA 4Q0OA 5LUUA 5ENJA 3QZVA 2RNWA 4XUAA 5A81A 4QR3A 4NRCA 5EWHA 5F60A 5CY9A 4QR5A 4QSWA 4YYNA 2R0SA 5ENIA 4A9IA 4LYSA 4HXOA 4CUTA 4PTBA 3RCWA 5E7DA 5A83A 4YYGA 4OGJA 4NYWA 3NXBA 4QYDA 4QEUA 5FB1A 5DFBA 4HXLA 4QSVA 4WIVA 2L84A 3Q2EA 5F63A 5EISA 5FFWA 5ENCA 3AQAA 5HCLA 1JM4B 5D3SA 4BW3A 5CS8A 5HRXA 4Q0NA 5FE2A 2MJVB 1E6IA 5E9VA 5FDZA 2DVVA 4CUSA 5AD3A 5I88A 5FE8A 4MEQA 5LKUA 5LKZA 2YW5A 5EPBA 4J0RA 5FG5A 2DVQA 3IU6A 5LJ2A 2OO1A 4O71A 2RI7A 4YYDA 5KHMA 3SVHA 4BW2A 3HMEA 5I80A 5DW2A 5KTUA 3UW9A 5DY7A 5D3JA 5DLZA 4TQNA 4AKNA 4LYIA 4LDFA 4ZC9A 5FE6A 5EU1A 4NYXA 3UV4A 5LJ1A 4NUCA 5CPEA 2LSPB 2DATA 4QC3A 4UYFB 3U5NA 4XUBA 5EI4A 4KCXA 4QSXA 4A9OA 4ALGA 5L96A 2H60A 5A5SA 5FE5A 5CQ5A 4NR7A 3P1FA 4NS5A 5EWCA 5F62A 2OUOA 5FE4A 5FG6A 4QEVA 4KV4A 4HXSA 4QC1A 4YYJA 5LJ0A 3MB4A 5L8UA 3GG3A 5BT5A 4KV1A 5HFQA 4YYIA 5HFRA 4UYDA 5E9YA 4A9LA 5BT3A 5F25A 5ENGA 5F3AA 5A7CA 4A9FA 3UV2A 5D3TA 2DKWA 4UIUA 4QSSA 3S91A 4BW1A 1JSPB 4MR6A 5C4QA 4O7CA 3FKMX 4OGIA 5I7YA 2N9GA 3P1EA 5DX4A 5EWVA 5E9KA 1WUMA 4NXJA 3JVMA 4YAXA 5EWDA 4CURA 5HJCA 2GRCA 4XYAA 4NR9A 3AADA 3SVFA 4IOOA 4C66A 4YYHA 2NXBA 4CLBA 5DLXA 5F5ZA 5C87A 2F6JA 2D9EA 5DYXA 2G4AA 5IGLA 5CRZA 3O37A 4Z6HA 5IBNA 3JVJA 5CGPA 5A85A 4YABA 5A82A 5I7XA 4NR8A 4HBVA 2E7NA 4CFKA 5C89A 4C67A 3LQHA 3O33A 5EP7A 4MR4A 4TTEA 4TS8A 4YBSA 4N4GA 5HRWA 4UYEA 3U5LA 5HRVA 3IU5A 4Z6IA 5HQ6A 4PKLA 2WP2A 5E9LA 4QY4A 3S92A 4ALHA 5E9IA 4WHUA 2R10A 4NR5A 5E3DA 3O35A 5I29A 5G4RA 5ENEA 4QSTA 4HXKA 4YH4A 5F1HA 5JWMA 5F36A 3U5PA 4BW4A 5ENBA 5IIDA 5HQ5A 4UIWA 4IORA 5C85A 3I3JA 4NR4A 4QUUA 4BJXA 2L85A 3MUKA 4QSQA 5CUBA 3K2JA 5HQ7A 4N4IA 5L98A 3D7CA 5EK9A 5FE0A 4TT2A 4YBMA 4HXRA 4QBMA 4UIYA 4CUQA 3UV5A 5I83A 5A5OA 5FH8A 4NR6A 4NUEA 4BHWA 3MQMA 4QEWA 5DBMA 5ENHA 5H1UA 4HBYA 5CUEA 5H85A 4ZQLA 5EGUA 4UYGA 2YELA 4YH3A 2R0YA 2DVRA 3HMFA 5ENFA 5IGMA 5FH7A 4N4HA 4Z1SA 4QZSA 4MEOA 2DVSA 4MR5A 5II1A 5KU3A 3G0JA 4YYKA 3U5OA 2E3KA 4TT4A 4UIXA 4UIVA 5BT4A 2RO1A 5D3RA 5D3NA 3SVGA 3UVYA 2WP1A 2D82A 5CQ6A 4QR4A 2YEKA 4N3WA 4UYHA 5CZGA 4A9MA 5AMFA 5EPSA 4O72A 4TZ2A 4J3IA 4IR4A 5HM0A 5D7XA 5G4SA 3JVKA 4TU4A 4MR3A 5CTLA 4O77A 5DW1A 4E96A 3ONIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ETDA 4N4FA 1N72A 5CP5A 5D26A 5DKDA 3O34A 2YYNA 4IR6A 3MB3A 5CUAA 4XY9A 4TZ8A 5AMEA 5JI8A 4AKGA 4NRAA 5CU8A 4DONA 4HXNA 5E74A 5FB0A 4UYFA 4A9JA 5CFWA 5HEMA 5CUDA 4YYMA 5DKCA 5LVQA 5DYCA 4PCEA 5AD2A 3D1BA 5EQ1A 4YBTA 4CL9A 3Q2FA 4AKHA 5EWWA 4IR3A 3UVXA 5FH6A 5HELA 3U5MA 4YADA 4CUPA 5E0RA 5FFVA 3G0LA 5DFCA 4Z1QA 5DYUA 5C7NA 2RNXA 4LZRA 4YC9A 5EA1A 4QSUA 4NYVA 5D3PA 2YDWA 3DWYA 5K29A 3HMHA 3O36A 4Z93A 4TYLA 5I86A 5HENA 5D24A 5EV9A 4PY6A 2DWWA 3DAIA 2I7KA 5D25A 5EVAA 5F61A 2F6NA 4HBWA 5I40A 4TU6A 5COIA 5L97A 5DFDA 4J1PA 5FG4A 3ZYUA 5I1QA 1ZKRA 4MENA 3LQJA 5CQ7A 2R0VA 4O7AA 4YY6A 4A9HA 5IGNA 4RVRA 3JVLA 3LJWA 4NQNA 5A5RA 4PS5A 4O70A 3MXFA 4J0SA 4A9EA 5FE1A 4IOQA 4GPJA 5E73A 1F68A 5TB6A 2YEMA 5D3LA 5FBXA 4LR6A 3LQIA 5F1LA 5EPRA 5LKXA 2RS9B 4QYLA 5D3HA 5TCMA 5FFYA 4CFLA 4HXMA 4LC2A 4OUFA 5L8TA 5CQ4A 4A9KA 1X0JA 3QZSA 5J0DA 5HLSA 4XY8A 5CQ8A 4IR5A 5KO4A 3P1CA 5FE7A 5CUCA 2KTBB 3QZTA 5L99A 4NQMA 5CQ3A 4HBXA 3ERRA 4FLPA 5F2PA 4NUDA 3MULA 3P5OA 5DKHA 4LZSA 4O75A 4QNSA 4CUUA 4PCIA 4X2IA 4QB3A 1EQFA 1ZS5A 5H1VA 3P1DA 4ZW1A 2YQDA 5CUGA 4YY4A 5I89A 5LVRA 3U5KA 4UITA 5KTXA 5H1TA 4UIZA 5E3GA 4F3IA 5EICA 4QSPA 4YATA 1WUGA 4HXPA 2OSSA 5ETBA 3UVDA 4LRGA 4O78A 4Y03A 4QSRA 3UVWA 5DYAA 2RNYA 4A9NA 2FSAA 2E7OA 4MEPA 5LKTA 5D0CA 4O7EA 5IGKA 5A5NA 5CQAA 5ACYA 4YK0A 4NRBA 5IG6A 5A5QA 4O7FA 5EM3A 4WHWA 2I8NA 5CQTA 4TT6A 4LZ2A 4LYWA 4O7BA 5CRMA 4O74A 5II2A 5KTWA 4QUTA 4AI6A 4O76A 2RFJA 3LXJA 5A5PA 5C8GA 5FE9A 3U5JA 5FE3A 5E9MA 3TLPA 2L5EA 4Q0OA 5LUUA 5ENJA 3VKHA 3QZVA 2RNWA 4XUAA 5A81A 4QR3A 4NRCA 5EWHA 5F60A 5CY9A 4QR5A 4QSWA 4YYNA 2R0SA 5ENIA 4A9IA 4LYSA 4HXOA 4CUTA 4PTBA 3RCWA 5E7DA 5A83A 4YYGA 4OGJA 4NYWA 3NXBA 4QYDA 4QEUA 5FB1A 5DFBA 4HXLA 4QSVA 4WIVA 2L84A 3Q2EA 5F63A 5EISA 5FFWA 5ENCA 3AQAA 5HCLA 1JM4B 5D3SA 4BW3A 5CS8A 5HRXA 4Q0NA 5FE2A 2MJVB 1E6IA 5E9VA 5FDZA 2DVVA 4CUSA 5AD3A 5I88A 5FE8A 4MEQA 5LKUA 5LKZA 2YW5A 5EPBA 4J0RA 5FG5A 2DVQA 3IU6A 5LJ2A 2OO1A 4O71A 2RI7A 4YYDA 5KHMA 3SVHA 4BW2A 3HMEA 5I80A 5DW2A 5KTUA 3UW9A 5DY7A 5D3JA 5DLZA 4TQNA 4AKNA 4LYIA 4LDFA 4ZC9A 5FE6A 5EU1A 4NYXA 3UV4A 5LJ1A 4NUCA 5CPEA 2LSPB 2DATA 4QC3A 4UYFB 3U5NA 4XUBA 5EI4A 4KCXA 4QSXA 4A9OA 4ALGA 5L96A 2H60A 5A5SA 5FE5A 5CQ5A 4NR7A 3P1FA 4NS5A 5EWCA 5F62A 2OUOA 5FE4A 5FG6A 4QEVA 4KV4A 4HXSA 4QC1A 4YYJA 5LJ0A 3MB4A 5L8UA 3GG3A 5BT5A 4KV1A 3VKGA 5HFQA 4YYIA 5HFRA 4UYDA 4AKIA 5E9YA 4A9LA 5BT3A 5F25A 5ENGA 5F3AA 5A7CA 4A9FA 3UV2A 5D3TA 2DKWA 4UIUA 4QSSA 3S91A 4BW1A 1JSPB 4MR6A 5C4QA 4O7CA 3FKMX 4OGIA 5I7YA 1PUOA 2N9GA 3P1EA 5DX4A 5EWVA 5E9KA 1WUMA 4NXJA 3JVMA 4YAXA 5EWDA 4CURA 5HJCA 2GRCA 4XYAA 4NR9A 3AADA 3SVFA 4IOOA 4C66A 4YYHA 2NXBA 4CLBA 5DLXA 5F5ZA 5C87A 2F6JA 2D9EA 5DYXA 2G4AA 5IGLA 5CRZA 3O37A 4Z6HA 5IBNA 3D1DA 3JVJA 5CGPA 5A85A 4YABA 5A82A 5I7XA 4NR8A 4HBVA 2E7NA 4CFKA 5C89A 4C67A 3LQHA 3O33A 5EP7A 4MR4A 4TTEA 4TS8A 4YBSA 4N4GA 5HRWA 4UYEA 3U5LA 5HRVA 3IU5A 4Z6IA 5HQ6A 4PKLA 2WP2A 5E9LA 4QY4A 3S92A 4ALHA 5E9IA 4WHUA 2R10A 4NR5A 5E3DA 3O35A 5I29A 5G4RA 5ENEA 4QSTA 4HXKA 4YH4A 5F1HA 5JWMA 5F36A 3U5PA 4BW4A 5ENBA 5IIDA 5HQ5A 4UIWA 4IORA 5C85A 3I3JA 4NR4A 4QUUA 4BJXA 2L85A 3MUKA 4QSQA 5CUBA 3K2JA 5HQ7A 4N4IA 5L98A 3D7CA 5EK9A 5FE0A 4TT2A 4YBMA 4HXRA 4QBMA 4UIYA 4CUQA 3UV5A 5I83A 5A5OA 5FH8A 4NR6A 4NUEA 4BHWA 3MQMA 4QEWA 5DBMA 5ENHA 5H1UA 4HBYA 5CUEA 5H85A 4ZQLA 5EGUA 4UYGA 2YELA 4YH3A 2R0YA 2DVRA 3HMFA 5ENFA 5IGMA 5FH7A 4N4HA 4Z1SA 4QZSA 4MEOA 2DVSA 4MR5A 5II1A 5KU3A 3G0JA 4YYKA 3U5OA 2E3KA 4TT4A 4UIXA 4UIVA 5BT4A 2RO1A 5D3RA 5D3NA 3SVGA 3UVYA 2WP1A 2D82A 2EJNA 5CQ6A 4QR4A 2YEKA 4N3WA 4UYHA 5CZGA 4A9MA 5AMFA 5EPSA 4O72A 4TZ2A 4J3IA 4IR4A 5HM0A 5D7XA 5G4SA 3JVKA 4TU4A 4MR3A 5CTLA 4O77A 5DW1A 4E96A 3ONIA
chains in the Genus database with same CATH topology
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