5F60A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sg3-014
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f60A01
4O76A 4TU6A 4BJXA 4HXPA 4YBTA 4PCEA 4WHUA 4HBXA 5D0CA 4LYIA 5EWVA 4UIVA 5A5OA 4NRAA 4NRCA 5G4SA 3SVFA 2DATA 2OSSA 5AD3A 4O72A 4UYHA 5EU1A 5D25A 2WP1A 3MULA 4YYMA 5CUBA 4NUDA 3QZVA 2RNYA 4IR3A 5A81A 4NYWA 4QSVA 3ZYUA 5ETBA 3U5PA 4Q0NA 5HLSA 4OUFA 4QSRA 3MUKA 4CUQA 4CUTA 5I7YA 3G0LA 4YY4A 5CQ3A 5CUEA 5EI4A 4A9OA 3LQJA 5FE3A 4MENA 4QC1A 5EV9A 3IU5A 5ENIA 3JVKA 2D9EA 5JWMA 5FG5A 5A5PA 5FE9A 3MB3A 5H1VA 3NXBA 5HELA 4WHWA 5H1TA 4YYJA 5A5RA 5I86A 4YYHA 4N4GA 5C8GA 5HFQA 3UV5A 2GRCA 2E7OA 4NQNA 5TB6A 3LQHA 5FH8A 5IG6A 5CU8A 1JM4B 3UVXA 4PY6A 1X0JA 4O7BA 5F1LA 4YC9A 4QSXA 4YH4A 5DBMA 4TT4A 4QSPA 4IORA 5FG4A 4QBMA 5E3GA 5E73A 5J0DA 4LZSA 5LVRA 4O70A 5K29A 4IOOA 5ENBA 4QSUA 5EK9A 4BHWA 4BW2A 4YYGA 2WP2A 4LC2A 5D3LA 4QY4A 2F6NA 3P1EA 4A9MA 4ZW1A 3UVYA 5FH7A 5HQ7A 4HBVA 5D7XA 5KTXA 5IIDA 5L97A 5E9LA 5CQ8A 2YW5A 2YELA 3UW9A 2RNWA 4O78A 2YQDA 4OGJA 4QUTA 5LJ2A 5ENCA 4O7EA 5FE2A 4HXOA 5F1HA 4NUCA 5FFVA 1F68A 3HMHA 5EPRA 4ALGA 2I7KA 5BT3A 5KTUA 5I88A 4TQNA 4TYLA 4UYGA 4J3IA 5DLZA 5CPEA 4QEVA 5DYCA 3O33A 4CURA 1ZS5A 4UIXA 4N3WA 4HBYA 4QR4A 5A5SA 5C4QA 5G4RA 2NXBA 4YATA 3DAIA 5E3DA 4CUPA 4HXNA 4J1PA 4NRBA 2H60A 3O35A 4UYDA 4IR5A 3U5NA 4O75A 5FE7A 3FKMX 3UVDA 5CQAA 2L85A 3ONIA 5TCMA 5L99A 5HRXA 2L84A 4WIVA 4CUUA 4YYDA 5ENFA 5LJ1A 4TTEA 4UYFB 5CY9A 4O71A 4A9EA 5HEMA 3AQAA 5D3HA 5F3AA 2YEKA 5II1A 4IR4A 4F3IA 2LSPB 4LR6A 4YAXA 5CQ7A 5DFCA 5H85A 5EM3A 5IBNA 5I40A 5D3JA 5EWDA 4YBMA 4LRGA 5D3PA 5HJCA 4PS5A 5EGUA 5CFWA 4QC3A 3DWYA 4NR8A 5EISA 5IGKA 4Y03A 4LZRA 2DVSA 5CGPA 4Q0OA 4QR5A 3HMFA 2RI7A 2DVQA 3P1CA 5FE8A 4HBWA 1WUGA 2FSAA 1WUMA 4YK0A 5ACYA 4YH3A 3QZTA 5LKZA 4BW4A 4UIWA 5DKDA 4C66A 5C85A 4QYLA 5E9KA 4ZC9A 3MB4A 4NR6A 5CUGA 4TT6A 3RCWA 5L8TA 5LKXA 4Z93A 3UV2A 5DFBA 5D3NA 5FBXA 3JVJA 5I29A 5L98A 5AMEA 5EPBA 5I83A 5A7CA 5CP5A 4QSTA 4Z6HA 3Q2EA 5CTLA 4O77A 5A82A 5A5QA 4RVRA 4UITA 3O36A 5HFRA 2I8NA 5ENHA 2YDWA 4HXSA 5ENJA 4QSSA 5HQ6A 4YADA 5IGLA 4NYVA 4HXMA 4LYSA 4QNSA 4UYEA 5DKHA 2DKWA 2OUOA 4HXLA 5LUUA 5DYUA 5AD2A 4MR3A 4TT2A 5D3RA 3U5OA 4OGIA 4GPJA 5CUDA 5KHMA 2G4AA 4LDFA 5JI8A 4QSWA 4O7AA 3JVMA 5E9YA 2YEMA 5FE5A 4NR9A 4QUUA 2D82A 2R0VA 3LXJA 4CFKA 4O74A 3K2JA 3I3JA 5DYAA 5D3SA 3SVGA 2RFJA 4YBSA 4HXRA 5AMFA 3D7CA 5D3TA 5DW1A 4TZ2A 5I80A 1JSPB 4NUEA 5LVQA 4QZSA 2DVVA 3G0JA 4QYDA 5CQTA 4IOQA 4NXJA 3HMEA 5CQ6A 4KV1A 5CZGA 5LJ0A 2KTBB 4X2IA 4MEOA 4J0SA 3SVHA 5DY7A 5DKCA 5L8UA 3U5LA 2F6JA 4YY6A 5FFWA 5LKUA 4TS8A 4XY9A 4NR7A 4QEWA 4TZ8A 4QEUA 5EPSA 5FB1A 5FE0A 5DW2A 3UV4A 2RS9B 3QZSA 1E6IA 4XY8A 3LQIA 5F63A 5ENGA 4CUSA 3U5KA 4YYIA 4NQMA 5F5ZA 4NR4A 5A5NA 4BW3A 3P1FA 4DONA 1EQFA 5E0RA 3LJWA 5HQ5A 2R0SA 4QSQA 2MJVB 5A83A 2DWWA 5DLXA 4UYFA 4A9HA 2RO1A 2YYNA 5CQ5A 5EICA 4N4FA 3Q2FA 4O7CA 4HXKA 4LYWA 2R0YA 5E9IA 5FE6A 4CLBA 5DYXA 5DX4A 5HRWA 5FE1A 4XYAA 3AADA 5E9VA 4Z6IA 5C87A 3TLPA 5H1UA 5E7DA 4NS5A 4J0RA 5EVAA 1N72A 5EA1A 4NR5A 4A9LA 3UVWA 4C67A 4Z1SA 5C7NA 4PCIA 3P1DA 2RNXA 4UIZA 2E3KA 5F62A 5I89A 5EWCA 3P5OA 5BT4A 4PKLA 5C89A 4YYNA 4XUBA 5EQ1A 4AKNA 2DVRA 4UIUA 5HENA 5KU3A 4XUAA 5E9MA 5IGNA 5FG6A 5CUCA 3GG3A 5FDZA 4A9FA 5ENEA 4KCXA 5II2A 5BT5A 2L5EA 4A9JA 3MQMA 4TU4A 5CS8A 5E74A 4LZ2A 4QR3A 5FH6A 4ALHA 3U5JA 5I1QA 5CUAA 5LKTA 4MEQA 5DFDA 4A9KA 4KV4A 5D26A 5EWHA 2R10A 5FB0A 3U5MA 3S91A 5D24A 4E96A 4YYKA 4N4HA 2OO1A 5ETDA 4A9NA 4N4IA 5KTWA 4CFLA 3O37A 4A9IA 3S92A 4ZQLA 5F36A 4O7FA 5EP7A 5CRZA 3MXFA 5EWWA 4UIYA 4PTBA 3O34A 5HCLA 5HRVA 5IGMA 5HM0A 3JVLA 5CQ4A 4IR6A 4CL9A 5CRMA 4YABA 4Z1QA 4FLPA 4MR6A 4BW1A 5F25A 5F60A 2E7NA 5FFYA 5FE4A 3IU6A 5F2PA 5F61A 5A85A 4QB3A 5KO4A 4MR5A 5COIA 4MEPA 2N9GA 4NYXA 4MR4A 5L96A 5I7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O76A 4TU6A 4BJXA 4HXPA 4YBTA 4PCEA 4WHUA 4HBXA 5D0CA 4LYIA 5EWVA 4UIVA 5A5OA 4NRAA 4NRCA 5G4SA 3SVFA 2DATA 2OSSA 5AD3A 4O72A 4UYHA 5EU1A 5D25A 2WP1A 3MULA 4YYMA 5CUBA 4NUDA 3QZVA 2RNYA 4IR3A 5A81A 4NYWA 4QSVA 3ZYUA 5ETBA 3U5PA 4Q0NA 5HLSA 4OUFA 4QSRA 3MUKA 4CUQA 4CUTA 5I7YA 3G0LA 4YY4A 5CQ3A 5CUEA 5EI4A 4A9OA 3LQJA 5FE3A 4MENA 4QC1A 5EV9A 3IU5A 5ENIA 3JVKA 2D9EA 5JWMA 5FG5A 5A5PA 5FE9A 3MB3A 5H1VA 3NXBA 5HELA 4WHWA 5H1TA 4YYJA 5A5RA 5I86A 4YYHA 4N4GA 5C8GA 5HFQA 3UV5A 2GRCA 2E7OA 4NQNA 5TB6A 3LQHA 5FH8A 5IG6A 5CU8A 1JM4B 3UVXA 4PY6A 1X0JA 4O7BA 5F1LA 4YC9A 4QSXA 4YH4A 5DBMA 4TT4A 4QSPA 4IORA 5FG4A 4QBMA 5E3GA 5E73A 5J0DA 4LZSA 5LVRA 4O70A 5K29A 4IOOA 5ENBA 4QSUA 5EK9A 4BHWA 4BW2A 4YYGA 2WP2A 4LC2A 5D3LA 4QY4A 2F6NA 3P1EA 4A9MA 4ZW1A 3UVYA 5FH7A 5HQ7A 4HBVA 5D7XA 5KTXA 5IIDA 5L97A 5E9LA 5CQ8A 2YW5A 2YELA 3UW9A 2RNWA 4O78A 2YQDA 4OGJA 4QUTA 5LJ2A 5ENCA 4O7EA 5FE2A 4HXOA 5F1HA 4NUCA 5FFVA 1F68A 3HMHA 5EPRA 4ALGA 2I7KA 5BT3A 5KTUA 5I88A 4TQNA 4TYLA 4UYGA 4J3IA 5DLZA 5CPEA 4QEVA 5DYCA 3O33A 4CURA 1ZS5A 4UIXA 4N3WA 4HBYA 4QR4A 5A5SA 5C4QA 5G4RA 2NXBA 4YATA 3DAIA 5E3DA 4CUPA 4HXNA 4J1PA 4NRBA 2H60A 3O35A 4UYDA 4IR5A 3U5NA 4O75A 5FE7A 3FKMX 3UVDA 5CQAA 2L85A 3ONIA 3D1BA 5TCMA 5L99A 5HRXA 2L84A 4WIVA 4CUUA 4YYDA 5ENFA 5LJ1A 4TTEA 4UYFB 5CY9A 4O71A 4A9EA 5HEMA 3AQAA 5D3HA 5F3AA 2YEKA 5II1A 4IR4A 4F3IA 2LSPB 4LR6A 4YAXA 5CQ7A 5DFCA 5H85A 5EM3A 5IBNA 5I40A 5D3JA 5EWDA 4YBMA 4LRGA 5D3PA 5HJCA 4PS5A 5EGUA 5CFWA 4QC3A 1ZKRA 3DWYA 4NR8A 5EISA 5IGKA 4Y03A 4LZRA 2DVSA 5CGPA 4Q0OA 4QR5A 3HMFA 2RI7A 2DVQA 3P1CA 5FE8A 4HBWA 1WUGA 2FSAA 1WUMA 3D1DA 4YK0A 5ACYA 4YH3A 3QZTA 5LKZA 4BW4A 4UIWA 5DKDA 4C66A 5C85A 4QYLA 5E9KA 4ZC9A 3MB4A 4NR6A 5CUGA 4TT6A 3RCWA 5L8TA 5LKXA 3VKHA 4Z93A 3UV2A 5DFBA 5D3NA 5FBXA 3JVJA 5I29A 5L98A 5AMEA 5EPBA 5I83A 5A7CA 5CP5A 4QSTA 4Z6HA 3Q2EA 5CTLA 4O77A 5A82A 5A5QA 4RVRA 4UITA 3O36A 5HFRA 2I8NA 5ENHA 2YDWA 4HXSA 5ENJA 4QSSA 5HQ6A 4YADA 5IGLA 4NYVA 4HXMA 4LYSA 4QNSA 4UYEA 5DKHA 2DKWA 4AI6A 2OUOA 4HXLA 5LUUA 5DYUA 5AD2A 4MR3A 4TT2A 5D3RA 3U5OA 4OGIA 4GPJA 5CUDA 5KHMA 2G4AA 4LDFA 5JI8A 4QSWA 4O7AA 3JVMA 5E9YA 2YEMA 5FE5A 4NR9A 4QUUA 2D82A 2R0VA 3LXJA 4CFKA 4O74A 3K2JA 3I3JA 5DYAA 5D3SA 3SVGA 2RFJA 4YBSA 4HXRA 5AMFA 3D7CA 5D3TA 5DW1A 4TZ2A 5I80A 1JSPB 4AKIA 4NUEA 5LVQA 4QZSA 2DVVA 3G0JA 4QYDA 5CQTA 4IOQA 4NXJA 3HMEA 5CQ6A 4KV1A 5CZGA 5LJ0A 2KTBB 4X2IA 4MEOA 4J0SA 3SVHA 5DY7A 5DKCA 5L8UA 3U5LA 2F6JA 4YY6A 5FFWA 5LKUA 4TS8A 4XY9A 4NR7A 4QEWA 4TZ8A 4QEUA 5EPSA 5FB1A 5FE0A 5DW2A 3UV4A 2RS9B 3QZSA 1E6IA 4XY8A 3LQIA 5F63A 5ENGA 4CUSA 3U5KA 4YYIA 4NQMA 5F5ZA 4NR4A 5A5NA 4BW3A 3P1FA 4DONA 1EQFA 5E0RA 3LJWA 5HQ5A 2R0SA 4QSQA 2MJVB 5A83A 2DWWA 5DLXA 4UYFA 4A9HA 2RO1A 2YYNA 5CQ5A 5EICA 4N4FA 3Q2FA 4O7CA 4HXKA 4LYWA 2R0YA 5E9IA 5FE6A 4CLBA 4AKHA 5DYXA 5DX4A 5HRWA 5FE1A 4XYAA 3AADA 3ERRA 5E9VA 4Z6IA 5C87A 3TLPA 5H1UA 5E7DA 4NS5A 4J0RA 5EVAA 1N72A 5EA1A 4NR5A 4A9LA 3UVWA 4C67A 4Z1SA 5C7NA 4PCIA 3P1DA 2RNXA 4UIZA 2E3KA 5F62A 5I89A 5EWCA 3P5OA 5BT4A 4PKLA 5C89A 4YYNA 4XUBA 5EQ1A 4AKNA 2DVRA 4UIUA 5HENA 5KU3A 4XUAA 3VKGA 5E9MA 5IGNA 2EJNA 5FG6A 5CUCA 3GG3A 5FDZA 4A9FA 5ENEA 4KCXA 5II2A 5BT5A 2L5EA 4A9JA 3MQMA 4TU4A 5CS8A 5E74A 4LZ2A 4QR3A 5FH6A 4ALHA 3U5JA 5I1QA 5CUAA 5LKTA 4MEQA 5DFDA 4A9KA 4KV4A 5D26A 5EWHA 2R10A 5FB0A 3U5MA 3S91A 5D24A 4E96A 4YYKA 4AKGA 4N4HA 2OO1A 5ETDA 4A9NA 4N4IA 5KTWA 4CFLA 3O37A 4A9IA 3S92A 4ZQLA 5F36A 4O7FA 5EP7A 5CRZA 3MXFA 5EWWA 4UIYA 4PTBA 3O34A 5HCLA 5HRVA 5IGMA 5HM0A 3JVLA 5CQ4A 4IR6A 4CL9A 5CRMA 4YABA 4Z1QA 4FLPA 4MR6A 4BW1A 5F25A 1PUOA 5F60A 2E7NA 5FFYA 5FE4A 3IU6A 5F2PA 5F61A 5A85A 4QB3A 5KO4A 4MR5A 5COIA 4MEPA 2N9GA 4NYXA 4MR4A 5L96A 5I7XA
chains in the Genus database with same CATH topology
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