5FE1A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment br004 (fragment 1)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 41
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe1A00
3P1EA 5F61A 5FE9A 4PY6A 4XY9A 5DLZA 5E0RA 1EQFA 4QSWA 4HBYA 5AMFA 4QR3A 4LYWA 5E9YA 5FE3A 4UIVA 4C67A 4GPJA 4YH4A 4O7FA 4YYNA 3D7CA 3UVWA 4WHWA 4Z93A 2L85A 4MR3A 4A9FA 4PS5A 4WHUA 5C7NA 4NR5A 5EP7A 3SVFA 5H85A 2F6JA 3HMEA 4YC9A 4ZC9A 4A9HA 5FE5A 3NXBA 5ENGA 5FG4A 3DAIA 3LQIA 3QZTA 4HXPA 2RS9B 4YYKA 4YH3A 5I88A 3U5KA 2F6NA 3JVJA 5EK9A 5D7XA 1F68A 5C85A 5FG5A 2NXBA 4X2IA 2G4AA 3UW9A 4LZRA 2WP2A 3I3JA 5LKZA 4NYWA 4ALGA 4Z1SA 4QR4A 3K2JA 4DONA 5CQ4A 4HXRA 4LZ2A 4OGJA 5I7YA 4BW1A 2WP1A 3P1DA 4N4GA 2H60A 5DY7A 4IR3A 4A9KA 1X0JA 5I40A 4MENA 1E6IA 2OO1A 5F63A 5J0DA 4YBSA 5FE2A 4LC2A 3HMHA 5E3DA 5HELA 5EWDA 5IIDA 5FH8A 1WUGA 5EICA 5HRXA 5TB6A 5HFRA 5LKXA 2R0VA 4QUTA 4QUUA 4YYGA 4C66A 3U5PA 3P1FA 4BW3A 3MUKA 4FLPA 4A9LA 4N4IA 4UYEA 5H1TA 4HXLA 5A82A 3JVKA 5G4SA 2R0SA 4TT6A 3UV4A 4CLBA 4Q0OA 2OUOA 5CQ6A 4YATA 5DKHA 5HQ7A 2R10A 4YK0A 5L8UA 3O35A 5E3GA 3O34A 5CUBA 5ACYA 3RCWA 4HXMA 4LYIA 5DYUA 4HXKA 4QY4A 4Y03A 5F36A 5DW1A 5LUUA 4TT2A 5FE0A 4ZW1A 4QZSA 5HENA 3U5NA 5FFVA 5CQAA 2L84A 2YW5A 4TTEA 3S92A 4A9EA 4UIZA 5D3PA 5D25A 2DWWA 5LKUA 4OGIA 4PKLA 4QR5A 3P1CA 4MEPA 5ENFA 4NUEA 4A9JA 5LVQA 4NR6A 5IGNA 2YQDA 3DWYA 5CUGA 4UIYA 4NYXA 5E9IA 5FE4A 4OUFA 1JSPB 2YYNA 3JVMA 5HM0A 1N72A 4BW2A 5FBXA 4MR4A 5COIA 5DYAA 5CUAA 4O70A 5CY9A 4TZ8A 4O71A 5HFQA 5CTLA 5LVRA 5E73A 3U5JA 5D3SA 5HJCA 5EWHA 4BW4A 3LJWA 4IR6A 5EWCA 4QEUA 4UYHA 4XUAA 5ETBA 4N4FA 3ONIA 4Z1QA 4NR7A 4XUBA 5F25A 5EQ1A 3FKMX 3U5MA 4IORA 4TU6A 5CP5A 5FE6A 3U5OA 3O37A 4O7EA 4QSXA 5TCMA 4CFKA 5CZGA 4QEWA 5F2PA 4NR9A 4A9IA 5LJ2A 5CQ8A 4QSUA 3MQMA 5FE8A 4QC3A 5HCLA 5ETDA 4LRGA 5C89A 4KV1A 4HXSA 5CUDA 5DKDA 1JM4B 2FSAA 3Q2EA 4Z6HA 2I7KA 5FH6A 5EVAA 4CUTA 5D26A 4MEQA 5ENHA 5CUCA 4O7AA 4YYIA 4XYAA 2YEKA 5CPEA 4NS5A 4BJXA 3MULA 5L97A 5I29A 2MJVB 2GRCA 2D9EA 4YYHA 3UV2A 5A7CA 5LKTA 5EM3A 4XY8A 5L98A 5A5RA 5CQTA 5BT3A 2YELA 4J0SA 5A5QA 4UYFB 5FG6A 5L99A 5HLSA 5D3TA 5DFBA 5EPBA 5CU8A 5II2A 5KTXA 4O77A 4O7BA 4QEVA 5CS8A 4QYDA 2LSPB 5EWVA 4YY6A 4KV4A 5DKCA 4HBWA 5FDZA 4CFLA 4QSSA 4TU4A 3U5LA 5I86A 4O75A 5DYCA 4UIXA 4LZSA 5BT5A 4QC1A 2D82A 5EV9A 5DLXA 4O78A 4CUUA 5ENJA 2N9GA 5FE7A 5CRMA 5G4RA 4LR6A 2DVQA 2YDWA 5E7DA 3SVHA 5E74A 3O33A 3P5OA 5DYXA 5EGUA 2L5EA 2RI7A 5JWMA 4CUPA 4PCEA 5I89A 4NUCA 3LQJA 5EISA 4O74A 3LQHA 4NR8A 4YYDA 4NUDA 5C8GA 5HRWA 3QZSA 5I7XA 4O72A 4UIWA 5CUEA 4TS8A 5BT4A 3G0LA 5IBNA 5FH7A 4IR5A 4NR4A 5CFWA 5IGLA 4RVRA 4MR5A 4MR6A 4HBXA 5D3JA 5EI4A 2KTBB 4O7CA 5F1HA 4Q0NA 5HRVA 5D24A 4AKNA 5KTWA 4E96A 4A9NA 3QZVA 5F3AA 5A5OA 2E7NA 4HXNA 2R0YA 5IG6A 5DX4A 5L96A 3O36A 5D3HA 3S91A 4LDFA 5CQ7A 4YYJA 5AD2A 4Z6IA 3MXFA 5AMEA 3AQAA 3G0JA 4KCXA 5L8TA 5KTUA 4YBMA 5AD3A 5H1VA 5ENCA 5LJ0A 5D3LA 5I83A 5HQ6A 5EU1A 5DW2A 4LYSA 3JVLA 5H1UA 5HEMA 4A9MA 2DVRA 4UYFA 4A9OA 4J1PA 3UVDA 2RFJA 4QSQA 2I8NA 4J0RA 5ENIA 5KHMA 4QBMA 5E9LA 5KU3A 5LJ1A 3MB3A 3Q2FA 5IGKA 4N4HA 5ENEA 5DBMA 2RO1A 4NQNA 3MB4A 4NQMA 2DVVA 5ENBA 3UV5A 5D0CA 4QB3A 4CL9A 4QSRA 5EPSA 3ZYUA 5I80A 3UVXA 4WIVA 5II1A 5F60A 4PCIA 4YY4A 5KO4A 5CQ5A 5HQ5A 4NXJA 4QSTA 4YBTA 2OSSA 4ALHA 4UYDA 4HBVA 4YYMA 5DFDA 2DVSA 5E9VA 5CGPA 5IGMA 5DFCA 4J3IA 5E9KA 4IOQA 2E3KA 5D3NA 4QNSA 3TLPA 4YABA 4PTBA 4YADA 4CUQA 3IU5A 5EPRA 5EA1A 5A81A 4QSPA 5CQ3A 2DATA 5F5ZA 5D3RA 5JI8A 2DKWA 4QSVA 4CUSA 5K29A 2YEMA 5C87A 1WUMA 4QYLA 4TT4A 5E9MA 5A5NA 3AADA 4UIUA 5FB1A 5FB0A 4N3WA 5A85A 2RNXA 4O76A 4CURA 5FE1A 5CRZA 4HXOA 5A83A 5FFWA 3HMFA 4UYGA 5F62A 2RNWA 4IOOA 3GG3A 2RNYA 3LXJA 4NRBA 5EWWA 4YAXA 3UVYA 4NYVA 4TQNA 5A5PA 4BHWA 5F1LA 5I1QA 4MEOA 1ZS5A 4ZQLA 5A5SA 4NRAA 3IU6A 4IR4A 4TYLA 3SVGA 4UITA 4NRCA 5FFYA 4F3IA 5C4QA 4TZ2A 2E7OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P1EA 5F61A 5FE9A 4PY6A 4XY9A 5DLZA 5E0RA 1EQFA 4QSWA 4HBYA 5AMFA 4QR3A 4LYWA 5E9YA 5FE3A 4UIVA 4C67A 4GPJA 4YH4A 4O7FA 4YYNA 3D7CA 3UVWA 4WHWA 4Z93A 2L85A 4MR3A 4A9FA 4PS5A 4WHUA 5C7NA 4NR5A 5EP7A 3SVFA 5H85A 2F6JA 3HMEA 4YC9A 4ZC9A 4A9HA 5FE5A 3NXBA 5ENGA 5FG4A 3DAIA 3LQIA 3ERRA 3QZTA 4HXPA 2RS9B 4YYKA 4YH3A 5I88A 3U5KA 2F6NA 3JVJA 5EK9A 5D7XA 1F68A 5C85A 5FG5A 2NXBA 4X2IA 2G4AA 3UW9A 4LZRA 2WP2A 3I3JA 5LKZA 4NYWA 4ALGA 4Z1SA 4QR4A 3K2JA 4DONA 5CQ4A 4HXRA 4LZ2A 3D1BA 4OGJA 5I7YA 4BW1A 2WP1A 3P1DA 4N4GA 2H60A 5DY7A 4IR3A 4A9KA 1X0JA 5I40A 4MENA 1E6IA 2OO1A 5F63A 5J0DA 4YBSA 5FE2A 4LC2A 3HMHA 5E3DA 5HELA 5EWDA 5IIDA 5FH8A 1WUGA 5EICA 5HRXA 5TB6A 5HFRA 5LKXA 2R0VA 4QUTA 4QUUA 4YYGA 4C66A 3U5PA 3P1FA 3VKHA 4BW3A 3MUKA 4FLPA 4A9LA 4N4IA 4UYEA 5H1TA 4HXLA 5A82A 3JVKA 5G4SA 2R0SA 4TT6A 3UV4A 4CLBA 4Q0OA 2OUOA 5CQ6A 4YATA 5DKHA 5HQ7A 2R10A 4YK0A 5L8UA 3O35A 5E3GA 3O34A 5CUBA 5ACYA 3RCWA 4HXMA 4LYIA 5DYUA 4HXKA 4QY4A 4Y03A 4AKGA 5F36A 5DW1A 5LUUA 4TT2A 5FE0A 4ZW1A 4QZSA 5HENA 3U5NA 5FFVA 5CQAA 2L84A 2YW5A 4TTEA 3S92A 4A9EA 4UIZA 5D3PA 5D25A 2DWWA 5LKUA 4OGIA 4PKLA 4QR5A 3P1CA 1ZKRA 4MEPA 5ENFA 4NUEA 4A9JA 5LVQA 4NR6A 4AI6A 5IGNA 2YQDA 3DWYA 5CUGA 4UIYA 4NYXA 5E9IA 5FE4A 4OUFA 1JSPB 2YYNA 3JVMA 5HM0A 1N72A 4BW2A 5FBXA 4MR4A 5COIA 5DYAA 5CUAA 4O70A 5CY9A 4TZ8A 4O71A 5HFQA 5CTLA 5LVRA 5E73A 3U5JA 5D3SA 5HJCA 5EWHA 4BW4A 3LJWA 4IR6A 5EWCA 4QEUA 4UYHA 4XUAA 5ETBA 4N4FA 3ONIA 4Z1QA 4NR7A 4XUBA 5F25A 5EQ1A 3FKMX 3U5MA 4IORA 4TU6A 5CP5A 5FE6A 3U5OA 3O37A 4O7EA 4QSXA 5TCMA 4CFKA 5CZGA 4QEWA 5F2PA 4NR9A 4A9IA 5LJ2A 5CQ8A 4QSUA 3MQMA 5FE8A 4QC3A 5HCLA 5ETDA 4LRGA 5C89A 4KV1A 4HXSA 5CUDA 5DKDA 1JM4B 2FSAA 3Q2EA 4Z6HA 2I7KA 5FH6A 5EVAA 4CUTA 5D26A 4MEQA 5ENHA 5CUCA 4O7AA 4YYIA 4XYAA 3VKGA 2YEKA 5CPEA 4NS5A 4BJXA 3MULA 5L97A 5I29A 2MJVB 2GRCA 2D9EA 4YYHA 3UV2A 5A7CA 5LKTA 5EM3A 4XY8A 5L98A 5A5RA 5CQTA 5BT3A 2YELA 4J0SA 5A5QA 4UYFB 5FG6A 5L99A 5HLSA 5D3TA 5DFBA 5EPBA 5CU8A 5II2A 5KTXA 4O77A 4O7BA 4QEVA 5CS8A 4QYDA 2LSPB 5EWVA 4YY6A 4KV4A 5DKCA 1PUOA 4HBWA 5FDZA 4CFLA 4QSSA 4TU4A 3U5LA 5I86A 4O75A 5DYCA 4UIXA 4LZSA 5BT5A 4QC1A 2D82A 5EV9A 5DLXA 4O78A 4CUUA 5ENJA 2N9GA 5FE7A 5CRMA 5G4RA 4AKIA 4LR6A 2DVQA 2YDWA 5E7DA 3SVHA 5E74A 3O33A 3P5OA 5DYXA 5EGUA 2L5EA 2RI7A 5JWMA 4CUPA 4PCEA 5I89A 4NUCA 3LQJA 5EISA 4AKHA 4O74A 3LQHA 4NR8A 4YYDA 4NUDA 5C8GA 5HRWA 3QZSA 5I7XA 4O72A 4UIWA 5CUEA 4TS8A 5BT4A 3G0LA 5IBNA 5FH7A 4IR5A 4NR4A 5CFWA 5IGLA 4RVRA 4MR5A 4MR6A 4HBXA 5D3JA 5EI4A 2KTBB 4O7CA 5F1HA 4Q0NA 5HRVA 5D24A 4AKNA 5KTWA 4E96A 4A9NA 3QZVA 5F3AA 5A5OA 3D1DA 2E7NA 4HXNA 2R0YA 5IG6A 5DX4A 5L96A 3O36A 5D3HA 3S91A 4LDFA 5CQ7A 4YYJA 5AD2A 4Z6IA 3MXFA 5AMEA 3AQAA 3G0JA 4KCXA 5L8TA 5KTUA 4YBMA 5AD3A 5H1VA 5ENCA 5LJ0A 5D3LA 5I83A 5HQ6A 5EU1A 5DW2A 4LYSA 3JVLA 5H1UA 5HEMA 4A9MA 2DVRA 4UYFA 4A9OA 4J1PA 3UVDA 2RFJA 4QSQA 2I8NA 4J0RA 5ENIA 5KHMA 4QBMA 5E9LA 5KU3A 5LJ1A 3MB3A 3Q2FA 5IGKA 4N4HA 5ENEA 5DBMA 2RO1A 4NQNA 3MB4A 4NQMA 2DVVA 5ENBA 3UV5A 5D0CA 4QB3A 4CL9A 2EJNA 4QSRA 5EPSA 3ZYUA 5I80A 3UVXA 4WIVA 5II1A 5F60A 4PCIA 4YY4A 5KO4A 5CQ5A 5HQ5A 4NXJA 4QSTA 4YBTA 2OSSA 4ALHA 4UYDA 4HBVA 4YYMA 5DFDA 2DVSA 5E9VA 5CGPA 5IGMA 5DFCA 4J3IA 5E9KA 4IOQA 2E3KA 5D3NA 4QNSA 3TLPA 4YABA 4PTBA 4YADA 4CUQA 3IU5A 5EPRA 5EA1A 5A81A 4QSPA 5CQ3A 2DATA 5F5ZA 5D3RA 5JI8A 2DKWA 4QSVA 4CUSA 5K29A 2YEMA 5C87A 1WUMA 4QYLA 4TT4A 5E9MA 5A5NA 3AADA 4UIUA 5FB1A 5FB0A 4N3WA 5A85A 2RNXA 4O76A 4CURA 5FE1A 5CRZA 4HXOA 5A83A 5FFWA 3HMFA 4UYGA 5F62A 2RNWA 4IOOA 3GG3A 2RNYA 3LXJA 4NRBA 5EWWA 4YAXA 3UVYA 4NYVA 4TQNA 5A5PA 4BHWA 5F1LA 5I1QA 4MEOA 1ZS5A 4ZQLA 5A5SA 4NRAA 3IU6A 4IR4A 4TYLA 3SVGA 4UITA 4NRCA 5FFYA 4F3IA 5C4QA 4TZ2A 2E7OA
chains in the Genus database with same CATH topology
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