5L99A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with 3-amino-2-methylpyridine derivative 6
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5l99A00
3QZSA 4QZSA 2E7OA 4HXOA 5C89A 4OGIA 5ENBA 3UVYA 5COIA 3MULA 5TCMA 5JI8A 5KTXA 4QEUA 5F1LA 3AADA 4A9FA 5L97A 5LKTA 4YAXA 4X2IA 4Q0OA 5HQ7A 3NXBA 5DLXA 5A7CA 2YQDA 4YYJA 2MJVB 2GRCA 4YC9A 3UV2A 5AMEA 3GG3A 4QC3A 4A9KA 2L85A 5FE8A 5LJ0A 2DVQA 4BHWA 3JVJA 5H1VA 5CQ6A 4HBYA 3UV4A 5FB0A 4XYAA 5A5QA 3MQMA 3DWYA 5A5OA 4XUAA 2RNWA 5I86A 5HCLA 5D3TA 5DFCA 4HXKA 5AD3A 4CURA 5AD2A 3U5JA 2WP2A 5CY9A 4UYHA 2YEKA 4QEVA 5CPEA 3D7CA 5D26A 4KV4A 4MR5A 4WHUA 3P1DA 5FE0A 5L8TA 1E6IA 5D24A 4QYDA 4UYFB 5CUDA 5DLZA 4QBMA 4DONA 5EV9A 5DYCA 5LKUA 5CQ4A 3JVLA 5G4RA 5I7YA 4O7FA 5DKHA 3DAIA 5ENIA 5ENJA 4CLBA 3P5OA 3P1FA 5FG5A 3G0LA 4QSWA 5CUBA 5DFBA 4A9NA 4LDFA 5EWCA 4A9EA 4UYGA 4AKNA 3U5KA 4O7BA 5L99A 4NUCA 3O36A 5BT4A 4NS5A 5EPSA 4NRBA 4NR8A 5EISA 4MR6A 2KTBB 3UVXA 4O77A 4UIUA 4BW2A 5CUCA 5IGMA 4TZ2A 3TLPA 3U5NA 2I8NA 2E7NA 5EWHA 5EU1A 2DVVA 5HM0A 5LJ2A 5LKZA 3ZYUA 3O37A 5A83A 4C67A 4IR5A 5KO4A 5HRWA 3QZVA 4HXMA 2H60A 5IGNA 4FLPA 5CQAA 2D82A 5E0RA 5FE7A 5FG4A 5H1UA 4Q0NA 5CQ5A 4KV1A 4XY8A 5ETBA 4TT2A 4NR7A 5ENGA 5D3SA 4HXPA 3LJWA 4HBVA 4YYNA 4NYXA 5FE9A 5KU3A 5D3NA 4NR5A 2R0VA 5II1A 1ZS5A 3S92A 5K29A 5DY7A 3JVKA 5IGKA 4QR3A 5CUAA 4WIVA 4CUTA 5D25A 5FH7A 4YYGA 4QYLA 5C8GA 5FE1A 4NR9A 2DATA 2YYNA 2OSSA 4O7CA 4PS5A 5FH6A 4NR4A 4J0SA 5FFWA 3LQHA 2RO1A 2G4AA 2D9EA 4YYHA 3MB3A 5CS8A 1WUMA 2R0YA 3JVMA 5JWMA 4QY4A 4CUSA 5EGUA 4HBWA 5E9LA 5HLSA 5DBMA 4HBXA 4MEPA 5HQ5A 4BJXA 4HXNA 4J1PA 4UYEA 4CFLA 4QC1A 4UIZA 5LVQA 4KCXA 3S91A 4NRAA 5I1QA 5ENCA 1X0JA 4YABA 1N72A 5H1TA 5F25A 4TU4A 4A9LA 3LQJA 5DKDA 5LKXA 1F68A 3P1CA 4C66A 4MEQA 2L84A 4ZQLA 4YBTA 4NR6A 3UVDA 5FFYA 4YYMA 4BW4A 5H85A 5CP5A 3U5PA 5FE3A 4IR6A 5ENFA 5A81A 2NXBA 2DVRA 2RS9B 4QSVA 5KTWA 5D7XA 4XUBA 4QSPA 5DKCA 5C87A 4QSTA 5DFDA 5I83A 5CZGA 5E73A 4A9MA 5CQ3A 1JSPB 4QR4A 2F6NA 4ALGA 5D3JA 5FB1A 4XY9A 5HRXA 3Q2FA 4QSRA 4QSSA 4YH4A 4NUEA 4CUUA 5KHMA 5ENHA 4PY6A 4TQNA 4A9JA 4IOOA 5CRMA 4LYSA 2N9GA 5FG6A 5EQ1A 5CUEA 4PTBA 4ALHA 2R0SA 4QR5A 5HJCA 4OGJA 5IGLA 4O78A 5CQ7A 2YDWA 5I7XA 4Z93A 5HFQA 5E3DA 4UYFA 5EP7A 4LZRA 4NUDA 5EWWA 1EQFA 2E3KA 2OO1A 4YATA 5BT5A 5DX4A 5LVRA 4MR4A 4O7AA 5A5PA 3K2JA 5DW2A 4LC2A 4QSUA 3O33A 4UIWA 5E9MA 5FE4A 5CUGA 2FSAA 5F2PA 4LZSA 5F61A 2LSPB 5ETDA 4Z1SA 3MXFA 5HFRA 2DWWA 2YW5A 5CTLA 5EPBA 5CQ8A 5TB6A 3O34A 5EWVA 5FFVA 4LRGA 2DKWA 5HENA 4QUTA 5I29A 4UIYA 5A82A 5FBXA 3HMEA 4UIVA 2RNYA 4TTEA 3U5MA 5E9VA 4HXLA 4YBSA 3FKMX 5C4QA 2YELA 4PCIA 5EK9A 3ONIA 4TYLA 5E9KA 4LR6A 4HXSA 4YYKA 2R10A 4N4GA 5F60A 5I40A 5CRZA 4QEWA 5CGPA 2L5EA 4O71A 5A5SA 5AMFA 3MB4A 5G4SA 3IU5A 5HRVA 3P1EA 4O74A 2DVSA 5IIDA 5D3HA 5ACYA 5F62A 5L96A 4Z6IA 4UYDA 5FE6A 4IORA 5L98A 2OUOA 4UITA 2YEMA 5F3AA 5HEMA 4CFKA 4YY6A 4YADA 5HQ6A 4A9OA 4QNSA 5E7DA 2I7KA 3I3JA 4NYVA 5II2A 4A9IA 5D3PA 3UV5A 4QB3A 4BW1A 5ENEA 4NQMA 5CU8A 5EWDA 5F5ZA 4O7EA 2WP1A 4WHWA 4J3IA 5CQTA 5A5NA 5FE5A 3O35A 4ZC9A 5IG6A 3U5OA 4Y03A 4Z6HA 4A9HA 4HXRA 2RNXA 5BT3A 5HELA 4O75A 4YYDA 4CUPA 3QZTA 4RVRA 4IR4A 5EI4A 5I89A 4UIXA 4N4FA 3G0JA 4MEOA 5I88A 4IOQA 5D3RA 4LZ2A 5C85A 5DYUA 4YY4A 3SVHA 5I80A 3AQAA 5EICA 4N4HA 5E74A 5DYXA 5FE2A 5CFWA 4TT4A 5E3GA 3LXJA 4E96A 3Q2EA 1WUGA 3LQIA 3U5LA 4QUUA 4YYIA 4O70A 4LYIA 4YH3A 4BW3A 4CUQA 5FH8A 5L8UA 2RI7A 2RFJA 3UW9A 3RCWA 3IU6A 4N4IA 4QSQA 2F6JA 4CL9A 3MUKA 5EA1A 3UVWA 5IBNA 4O72A 4YBMA 4PCEA 4NXJA 4NYWA 5F63A 1JM4B 4TZ8A 4OUFA 3HMHA 4Z1QA 4LYWA 4TS8A 5D3LA 5DYAA 5A5RA 5KTUA 5DW1A 4J0RA 4N3WA 4IR3A 5A85A 4YK0A 5J0DA 5EPRA 5FDZA 5LJ1A 4QSXA 5EVAA 5F1HA 5C7NA 5EM3A 5LUUA 3SVFA 4MR3A 4PKLA 5D0CA 5E9YA 5E9IA 4TU6A 4NRCA 5F36A 4ZW1A 3SVGA 4TT6A 3HMFA 4O76A 4GPJA 4MENA 4F3IA 4NQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QZSA 4QZSA 2E7OA 4HXOA 5C89A 4OGIA 5ENBA 3UVYA 5COIA 3MULA 5TCMA 5JI8A 5KTXA 4QEUA 3D1DA 5F1LA 3AADA 4A9FA 5L97A 5LKTA 4YAXA 4AKIA 4X2IA 4Q0OA 5HQ7A 3NXBA 5DLXA 5A7CA 2YQDA 4YYJA 2MJVB 2GRCA 4YC9A 3UV2A 5AMEA 3GG3A 4QC3A 4A9KA 2L85A 5FE8A 5LJ0A 2DVQA 4BHWA 3JVJA 5H1VA 5CQ6A 4HBYA 3UV4A 5FB0A 4XYAA 5A5QA 3MQMA 3DWYA 5A5OA 4XUAA 2RNWA 5I86A 5HCLA 5D3TA 5DFCA 4HXKA 5AD3A 4CURA 5AD2A 3U5JA 2WP2A 5CY9A 4UYHA 2YEKA 4QEVA 5CPEA 3D7CA 5D26A 4KV4A 4MR5A 4WHUA 3P1DA 5FE0A 5L8TA 1E6IA 5D24A 4QYDA 4UYFB 5CUDA 5DLZA 4QBMA 4DONA 5EV9A 5DYCA 5LKUA 5CQ4A 3JVLA 5G4RA 5I7YA 4O7FA 5DKHA 3DAIA 5ENIA 5ENJA 4CLBA 3P5OA 3P1FA 5FG5A 3G0LA 4QSWA 5CUBA 5DFBA 4A9NA 4LDFA 5EWCA 4A9EA 4UYGA 3VKHA 4AKNA 3U5KA 4O7BA 5L99A 4NUCA 3O36A 5BT4A 4NS5A 5EPSA 4NRBA 4NR8A 5EISA 4MR6A 2KTBB 3UVXA 4O77A 4UIUA 4BW2A 5CUCA 5IGMA 4TZ2A 3TLPA 3U5NA 2I8NA 2E7NA 5EWHA 5EU1A 2DVVA 5HM0A 5LJ2A 5LKZA 3ZYUA 3O37A 5A83A 4C67A 4IR5A 5KO4A 5HRWA 3QZVA 4HXMA 2H60A 5IGNA 4FLPA 5CQAA 2D82A 5E0RA 5FE7A 5FG4A 5H1UA 4Q0NA 5CQ5A 4KV1A 4XY8A 5ETBA 4TT2A 4NR7A 5ENGA 5D3SA 4HXPA 3LJWA 4HBVA 4YYNA 4NYXA 5FE9A 5KU3A 5D3NA 4NR5A 2R0VA 5II1A 1ZS5A 3S92A 5K29A 5DY7A 3JVKA 5IGKA 4QR3A 5CUAA 4WIVA 4CUTA 5D25A 5FH7A 4YYGA 4QYLA 5C8GA 5FE1A 4NR9A 3ERRA 2DATA 2YYNA 2OSSA 4O7CA 4PS5A 5FH6A 4NR4A 4J0SA 5FFWA 3LQHA 4AKHA 2RO1A 2G4AA 2D9EA 4YYHA 3MB3A 5CS8A 1WUMA 2R0YA 3JVMA 5JWMA 4QY4A 4CUSA 5EGUA 4HBWA 5E9LA 5HLSA 5DBMA 4HBXA 4MEPA 5HQ5A 4BJXA 4HXNA 4J1PA 4UYEA 4CFLA 4QC1A 4UIZA 5LVQA 4KCXA 3S91A 4NRAA 5I1QA 5ENCA 1X0JA 4YABA 1N72A 5H1TA 5F25A 4TU4A 4A9LA 4AKGA 3LQJA 5DKDA 5LKXA 1F68A 3P1CA 4C66A 4MEQA 2L84A 4ZQLA 4YBTA 4NR6A 3UVDA 5FFYA 4YYMA 4BW4A 5H85A 5CP5A 3U5PA 5FE3A 4IR6A 5ENFA 5A81A 2NXBA 2DVRA 2RS9B 4QSVA 5KTWA 5D7XA 4XUBA 4QSPA 5DKCA 5C87A 4QSTA 5DFDA 5I83A 5CZGA 5E73A 4A9MA 5CQ3A 1JSPB 4QR4A 2F6NA 4ALGA 5D3JA 5FB1A 4XY9A 5HRXA 3Q2FA 4QSRA 4QSSA 4YH4A 4NUEA 4CUUA 5KHMA 5ENHA 4PY6A 4TQNA 4A9JA 4IOOA 5CRMA 3D1BA 4LYSA 2N9GA 5FG6A 5EQ1A 5CUEA 4PTBA 4ALHA 1ZKRA 2R0SA 4QR5A 5HJCA 4OGJA 5IGLA 4O78A 5CQ7A 2YDWA 5I7XA 4Z93A 5HFQA 5E3DA 4UYFA 5EP7A 4LZRA 4NUDA 5EWWA 1EQFA 2E3KA 2OO1A 4YATA 5BT5A 5DX4A 5LVRA 4MR4A 4O7AA 5A5PA 3K2JA 5DW2A 4LC2A 4QSUA 3O33A 4UIWA 5E9MA 5FE4A 5CUGA 2FSAA 5F2PA 4LZSA 5F61A 2LSPB 5ETDA 4Z1SA 3MXFA 5HFRA 2DWWA 2YW5A 5CTLA 5EPBA 5CQ8A 2EJNA 5TB6A 3O34A 5EWVA 5FFVA 4LRGA 2DKWA 5HENA 4QUTA 5I29A 4UIYA 5A82A 5FBXA 3HMEA 4UIVA 2RNYA 4TTEA 3U5MA 5E9VA 4HXLA 4YBSA 3FKMX 5C4QA 2YELA 4PCIA 5EK9A 3ONIA 4TYLA 5E9KA 4LR6A 4HXSA 4YYKA 2R10A 4N4GA 5F60A 5I40A 5CRZA 4QEWA 5CGPA 2L5EA 4O71A 5A5SA 5AMFA 3MB4A 5G4SA 3IU5A 5HRVA 3P1EA 4O74A 2DVSA 5IIDA 5D3HA 5ACYA 5F62A 5L96A 4Z6IA 4UYDA 5FE6A 4IORA 5L98A 2OUOA 4UITA 2YEMA 5F3AA 4AI6A 5HEMA 4CFKA 4YY6A 4YADA 5HQ6A 4A9OA 4QNSA 5E7DA 2I7KA 3I3JA 4NYVA 5II2A 4A9IA 5D3PA 3UV5A 4QB3A 4BW1A 5ENEA 4NQMA 5CU8A 5EWDA 5F5ZA 4O7EA 2WP1A 4WHWA 4J3IA 5CQTA 5A5NA 5FE5A 3O35A 4ZC9A 5IG6A 3U5OA 4Y03A 4Z6HA 4A9HA 4HXRA 2RNXA 5BT3A 5HELA 4O75A 4YYDA 4CUPA 3QZTA 4RVRA 4IR4A 5EI4A 5I89A 4UIXA 4N4FA 3G0JA 4MEOA 5I88A 4IOQA 5D3RA 4LZ2A 5C85A 5DYUA 4YY4A 3SVHA 5I80A 1PUOA 3AQAA 5EICA 4N4HA 5E74A 5DYXA 5FE2A 5CFWA 4TT4A 5E3GA 3LXJA 4E96A 3Q2EA 1WUGA 3LQIA 3U5LA 4QUUA 4YYIA 4O70A 4LYIA 4YH3A 4BW3A 4CUQA 5FH8A 5L8UA 2RI7A 2RFJA 3UW9A 3RCWA 3IU6A 4N4IA 4QSQA 2F6JA 4CL9A 3MUKA 5EA1A 3UVWA 5IBNA 4O72A 4YBMA 4PCEA 4NXJA 4NYWA 5F63A 1JM4B 4TZ8A 4OUFA 3HMHA 4Z1QA 4LYWA 4TS8A 5D3LA 5DYAA 5A5RA 5KTUA 5DW1A 4J0RA 4N3WA 4IR3A 5A85A 4YK0A 5J0DA 5EPRA 5FDZA 5LJ1A 4QSXA 3VKGA 5EVAA 5F1HA 5C7NA 5EM3A 5LUUA 3SVFA 4MR3A 4PKLA 5D0CA 5E9YA 5E9IA 4TU6A 4NRCA 5F36A 4ZW1A 3SVGA 4TT6A 3HMFA 4O76A 4GPJA 4MENA 4F3IA 4NQNA
chains in the Genus database with same CATH topology
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