5FE3A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment mb360 (fragment 4)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe3A00
5I1QA 4BW3A 4YAXA 3P1EA 4CUQA 4O7FA 5CZGA 5LJ1A 3U5PA 4QSVA 5L96A 5CQ4A 5A82A 5EP7A 2RNYA 5IG6A 5KU3A 5H85A 5A5PA 2L85A 4TYLA 4TTEA 5II2A 5FG4A 5J0DA 3MXFA 5DW2A 5E74A 2RO1A 5CUCA 4E96A 5II1A 5EWVA 5IGMA 5EV9A 5HCLA 1F68A 4NXJA 4ALGA 2I8NA 5LKUA 4NR6A 4QYDA 2WP1A 2R0YA 2D9EA 5FE1A 4AKNA 2RFJA 3O35A 4HXPA 5D24A 3G0JA 3JVJA 5EWDA 4IR6A 5HM0A 4A9IA 4QSSA 4F3IA 4IOQA 5CQTA 5FBXA 5CY9A 4HXLA 4MR4A 4QUTA 3DWYA 5CQ5A 4N4IA 4Z6HA 5FFVA 2RI7A 3HMFA 4C66A 5DY7A 5D3JA 5A83A 3P1CA 5CUBA 2E7OA 2KTBB 5F3AA 4CUUA 4A9FA 5E9IA 4NRBA 5KO4A 5CGPA 4TZ2A 4Y03A 5H1TA 5D3LA 4LYIA 4NUEA 4NUDA 5L8UA 5A5RA 3JVMA 4YYHA 5HLSA 2YQDA 4QYLA 3QZSA 5FE7A 4YH3A 4Z6IA 5DYAA 3I3JA 2DVRA 2DATA 5FE0A 5DFBA 5I83A 4IORA 4XUAA 2NXBA 5D3SA 5I40A 5IGNA 5I7XA 4BW2A 5G4RA 4HXOA 2WP2A 2FSAA 4MR6A 5DBMA 5CUGA 4NR8A 4LYWA 4IR5A 3U5JA 5C85A 5D3TA 4TS8A 4NYWA 2R10A 4O78A 2YYNA 4FLPA 5FE6A 2YEMA 4Z93A 4QC1A 4QSUA 5EM3A 2R0VA 5FG5A 4YY4A 3G0LA 5HFRA 4CUPA 5LKXA 4YATA 5D3PA 5ENGA 5HQ5A 4KV4A 3JVKA 5ENBA 5C4QA 5I7YA 5E9KA 3UV4A 5LKZA 3SVHA 5EA1A 5HRXA 5EI4A 4HXSA 4OGIA 3DAIA 5ENHA 4O77A 5EPSA 4CL9A 4OUFA 4NRCA 5EWWA 5F25A 5COIA 4LZ2A 4OGJA 4HBYA 4ZQLA 4MR3A 4Q0NA 5FFWA 5DW1A 3QZVA 2YW5A 5EPBA 2MJVB 4UITA 5AD2A 4O7EA 5CRZA 5EICA 4CLBA 4IR3A 5H1VA 5H1UA 4A9OA 3MUKA 5LKTA 2N9GA 5F1HA 4LR6A 5A7CA 4HBVA 5DYXA 3Q2FA 4UYDA 4QR4A 3IU6A 3MB4A 4YYIA 4TU6A 2YELA 5KHMA 4O71A 5ENCA 5EISA 5FDZA 4QB3A 5D25A 1EQFA 2D82A 4NR5A 5L8TA 4TT6A 4YK0A 4HBWA 5FE4A 4QSRA 4UIZA 3D7CA 4QNSA 4IOOA 4N4FA 2L84A 4YC9A 3SVGA 5AMEA 2DVQA 3UVWA 5FE3A 4X2IA 4NYVA 5DFDA 4C67A 5L97A 5LUUA 5L98A 5KTWA 4QC3A 2E3KA 5FH6A 4CURA 4IR4A 3IU5A 2G4AA 4O7CA 4UIYA 5HQ6A 5DKDA 5L99A 2H60A 5A5QA 5A5NA 4BJXA 4UYFA 5E7DA 5DKCA 5EPRA 3U5MA 4UYEA 5CQ8A 5EQ1A 5C8GA 3Q2EA 2OO1A 4UIWA 4A9MA 5KTXA 5LJ2A 3AADA 3LJWA 5E3GA 5EVAA 5EK9A 5F36A 4WHWA 2F6JA 5AD3A 4UIXA 4O74A 4LDFA 5K29A 4HXMA 2R0SA 4J3IA 4HBXA 3U5KA 4YBMA 5DKHA 2OUOA 3FKMX 4LRGA 5IGLA 2F6NA 4NYXA 4DONA 4YYJA 5FH8A 5A81A 4NQNA 3UV2A 5HEMA 4QSWA 4Z1SA 5G4SA 4UIVA 5DFCA 2RNWA 4J1PA 4PCEA 5F1LA 5HFQA 4YBSA 5D7XA 3S91A 4A9NA 4BW4A 4O72A 4QEUA 4MEQA 4BW1A 5DLZA 3K2JA 4QSPA 3U5LA 5CQAA 4HXKA 4N3WA 3ZYUA 4CFLA 4GPJA 5DYCA 5TCMA 5A5OA 4UYHA 4WHUA 5ENJA 4QY4A 5HJCA 5FE5A 4HXNA 5FG6A 4QSXA 5HELA 5CU8A 5E9LA 5CUDA 4NR9A 3P1DA 5DX4A 3QZTA 4TQNA 1JM4B 5FE9A 4LC2A 5CFWA 5C89A 4UIUA 5E0RA 5FB0A 5AMFA 5CPEA 4QEWA 3HMHA 3LQIA 5TB6A 4QBMA 4J0RA 3ONIA 3MQMA 5F2PA 4O7BA 5CP5A 2OSSA 3NXBA 3U5NA 3HMEA 3O37A 5HRVA 5ETDA 5BT3A 2L5EA 4TT4A 4QR5A 5F62A 4YYNA 5FE2A 5ENEA 4LZSA 4CFKA 4PKLA 5FH7A 5FB1A 4CUSA 5C7NA 2RS9B 5ENIA 4ALHA 3O34A 5F61A 3MB3A 5CUEA 4PY6A 4QSQA 5D3HA 5HENA 5E3DA 3SVFA 3GG3A 5E9MA 1JSPB 4A9KA 5I29A 5C87A 4XY8A 5IIDA 4A9LA 5ACYA 5I88A 5EWHA 4TT2A 2DKWA 3U5OA 4O7AA 5JWMA 4KV1A 3LQHA 4PTBA 5HQ7A 4O76A 5ETBA 4CUTA 4PCIA 3O33A 4QZSA 4YH4A 2YDWA 2DVSA 3TLPA 4A9EA 3LQJA 1ZS5A 3RCWA 3O36A 4YYDA 2LSPB 4J0SA 5E9VA 5KTUA 5CUAA 5A5SA 2RNXA 4MENA 1WUGA 4WIVA 4XYAA 5EGUA 5CQ7A 5F60A 5CTLA 2DVVA 4MEOA 4KCXA 3P1FA 5IBNA 4NS5A 3S92A 5F63A 4UYFB 5ENFA 4QR3A 4Q0OA 5DYUA 4RVRA 1E6IA 4BHWA 4TU4A 4XY9A 4O75A 5LVQA 4YYMA 1N72A 4Z1QA 4MEPA 2I7KA 5LJ0A 4NRAA 3AQAA 4YY6A 5DLXA 4YYKA 4XUBA 5JI8A 5CQ3A 5D26A 2GRCA 4YYGA 3UVYA 3LXJA 5EU1A 4MR5A 5I86A 5E9YA 5D3RA 3UVDA 4QEVA 5D0CA 4N4HA 4O70A 3P5OA 4NUCA 5D3NA 4NQMA 4ZW1A 4HXRA 4LZRA 3UW9A 5BT4A 5FE8A 2YEKA 5LVRA 5EWCA 5CRMA 4NR7A 5I89A 5CQ6A 1WUMA 5FFYA 4NR4A 5E73A 5A85A 4LYSA 5I80A 2E7NA 3UV5A 4YADA 4A9JA 5HRWA 1X0JA 3MULA 4QSTA 2DWWA 4ZC9A 4A9HA 4YABA 3UVXA 5BT5A 3JVLA 4TZ8A 4YBTA 5IGKA 4QUUA 4UYGA 5F5ZA 4N4GA 5CS8A 4PS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I1QA 4BW3A 4YAXA 3P1EA 4CUQA 4O7FA 5CZGA 5LJ1A 3U5PA 4QSVA 5L96A 5CQ4A 5A82A 5EP7A 2RNYA 5IG6A 5KU3A 5H85A 5A5PA 2L85A 4TYLA 4TTEA 5II2A 5FG4A 5J0DA 3MXFA 5DW2A 5E74A 2RO1A 5CUCA 4E96A 5II1A 5EWVA 5IGMA 5EV9A 5HCLA 1F68A 4NXJA 4ALGA 2I8NA 5LKUA 4NR6A 4QYDA 2WP1A 2R0YA 2D9EA 5FE1A 4AKNA 2RFJA 3O35A 4HXPA 5D24A 3G0JA 3JVJA 5EWDA 4IR6A 5HM0A 4A9IA 4QSSA 4F3IA 4IOQA 5CQTA 5FBXA 5CY9A 4HXLA 4MR4A 4QUTA 3DWYA 5CQ5A 4N4IA 4Z6HA 5FFVA 2RI7A 3HMFA 4C66A 5DY7A 5D3JA 5A83A 3P1CA 5CUBA 2E7OA 2KTBB 5F3AA 4CUUA 4A9FA 5E9IA 4NRBA 5KO4A 5CGPA 4TZ2A 4Y03A 5H1TA 5D3LA 4LYIA 4NUEA 4NUDA 5L8UA 5A5RA 3JVMA 3VKGA 4YYHA 5HLSA 2YQDA 4QYLA 3QZSA 5FE7A 4YH3A 4Z6IA 5DYAA 3I3JA 2DVRA 2DATA 5FE0A 5DFBA 5I83A 4IORA 4XUAA 2NXBA 5D3SA 5I40A 5IGNA 5I7XA 4BW2A 5G4RA 4HXOA 2WP2A 2FSAA 4MR6A 5DBMA 5CUGA 2EJNA 4NR8A 4LYWA 4IR5A 3U5JA 5C85A 5D3TA 4TS8A 4NYWA 2R10A 4O78A 2YYNA 4FLPA 5FE6A 2YEMA 4Z93A 4QC1A 4AKIA 4QSUA 5EM3A 2R0VA 5FG5A 4YY4A 3G0LA 5HFRA 4CUPA 5LKXA 4YATA 5D3PA 5ENGA 5HQ5A 4KV4A 3JVKA 5ENBA 5C4QA 5I7YA 5E9KA 3UV4A 5LKZA 3SVHA 5EA1A 5HRXA 5EI4A 4HXSA 4OGIA 3DAIA 5ENHA 4O77A 5EPSA 4CL9A 4OUFA 4NRCA 5EWWA 5F25A 5COIA 4LZ2A 4OGJA 4HBYA 4ZQLA 4MR3A 4Q0NA 5FFWA 5DW1A 3QZVA 2YW5A 5EPBA 2MJVB 4UITA 5AD2A 4O7EA 5CRZA 5EICA 4CLBA 4IR3A 5H1VA 5H1UA 4A9OA 3VKHA 3MUKA 5LKTA 2N9GA 5F1HA 4LR6A 5A7CA 4AKHA 4HBVA 5DYXA 3Q2FA 4UYDA 4QR4A 3IU6A 3MB4A 4YYIA 4TU6A 2YELA 5KHMA 4O71A 5ENCA 5EISA 5FDZA 4QB3A 5D25A 1EQFA 2D82A 4NR5A 5L8TA 4TT6A 4YK0A 3D1BA 4HBWA 5FE4A 4QSRA 4UIZA 3D7CA 4QNSA 4IOOA 4N4FA 2L84A 4YC9A 3SVGA 5AMEA 2DVQA 3UVWA 5FE3A 4X2IA 4NYVA 5DFDA 4C67A 5L97A 5LUUA 5L98A 5KTWA 4QC3A 2E3KA 5FH6A 4CURA 4IR4A 3IU5A 2G4AA 4O7CA 4UIYA 5HQ6A 5DKDA 5L99A 2H60A 5A5QA 5A5NA 4BJXA 4UYFA 5E7DA 5DKCA 5EPRA 3U5MA 4UYEA 5CQ8A 5EQ1A 5C8GA 3Q2EA 2OO1A 4UIWA 4A9MA 5KTXA 5LJ2A 3AADA 3LJWA 5E3GA 5EVAA 5EK9A 5F36A 4WHWA 2F6JA 5AD3A 4UIXA 4O74A 4LDFA 5K29A 4HXMA 2R0SA 4J3IA 4HBXA 3U5KA 4YBMA 5DKHA 2OUOA 3FKMX 4LRGA 5IGLA 2F6NA 1ZKRA 4NYXA 4DONA 4YYJA 5FH8A 5A81A 4NQNA 3UV2A 5HEMA 4QSWA 4Z1SA 5G4SA 4UIVA 5DFCA 1PUOA 2RNWA 4J1PA 4PCEA 5F1LA 5HFQA 4YBSA 5D7XA 3S91A 4A9NA 4BW4A 4O72A 4QEUA 4MEQA 4BW1A 5DLZA 3K2JA 4QSPA 3U5LA 5CQAA 4HXKA 4N3WA 3ZYUA 4CFLA 4GPJA 5DYCA 5TCMA 5A5OA 4UYHA 4WHUA 5ENJA 4QY4A 5HJCA 5FE5A 4HXNA 5FG6A 4QSXA 5HELA 5CU8A 5E9LA 5CUDA 4NR9A 3P1DA 5DX4A 3QZTA 4TQNA 1JM4B 5FE9A 4LC2A 5CFWA 5C89A 4UIUA 5E0RA 5FB0A 5AMFA 5CPEA 4QEWA 3HMHA 3LQIA 5TB6A 4QBMA 4J0RA 3ONIA 3MQMA 5F2PA 4O7BA 5CP5A 2OSSA 3NXBA 3U5NA 3HMEA 3O37A 4AI6A 5HRVA 5ETDA 5BT3A 2L5EA 4TT4A 4QR5A 5F62A 4YYNA 5FE2A 5ENEA 4LZSA 4CFKA 4PKLA 5FH7A 5FB1A 4CUSA 5C7NA 2RS9B 5ENIA 4ALHA 3O34A 5F61A 3MB3A 5CUEA 4PY6A 4QSQA 5D3HA 5HENA 5E3DA 3SVFA 3GG3A 5E9MA 1JSPB 4A9KA 5I29A 5C87A 4XY8A 5IIDA 4A9LA 5ACYA 5I88A 5EWHA 4TT2A 2DKWA 3U5OA 4O7AA 5JWMA 4KV1A 3LQHA 4PTBA 5HQ7A 4O76A 5ETBA 4CUTA 4PCIA 3O33A 4QZSA 4YH4A 2YDWA 3ERRA 2DVSA 3TLPA 4A9EA 3LQJA 1ZS5A 3RCWA 3O36A 4YYDA 2LSPB 4J0SA 5E9VA 5KTUA 5CUAA 5A5SA 2RNXA 4MENA 1WUGA 4WIVA 4XYAA 5EGUA 5CQ7A 5F60A 5CTLA 2DVVA 4MEOA 4KCXA 3P1FA 5IBNA 4NS5A 3S92A 5F63A 4UYFB 5ENFA 4QR3A 4Q0OA 5DYUA 4RVRA 1E6IA 4BHWA 4TU4A 4XY9A 4O75A 5LVQA 4YYMA 1N72A 4Z1QA 4MEPA 2I7KA 5LJ0A 4NRAA 3AQAA 4YY6A 5DLXA 4YYKA 4XUBA 5JI8A 5CQ3A 5D26A 2GRCA 4YYGA 3UVYA 3LXJA 5EU1A 4MR5A 5I86A 5E9YA 5D3RA 3UVDA 4QEVA 5D0CA 4N4HA 4O70A 3P5OA 4NUCA 5D3NA 4NQMA 4ZW1A 4HXRA 4LZRA 3UW9A 5BT4A 5FE8A 2YEKA 5LVRA 5EWCA 5CRMA 4NR7A 5I89A 5CQ6A 1WUMA 5FFYA 4NR4A 5E73A 5A85A 4LYSA 5I80A 2E7NA 3UV5A 4YADA 4A9JA 5HRWA 1X0JA 3MULA 4QSTA 2DWWA 4ZC9A 4A9HA 4YABA 3UVXA 5BT5A 3JVLA 4TZ8A 4YBTA 5IGKA 4QUUA 4UYGA 5F5ZA 4N4GA 5CS8A 3D1DA 4PS5A 4AKGA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5I1Q A;  4BW3 A;  4YAX A;  3P1E A;  4CUQ A;  4O7F A;  5CZG A;  5LJ1 A;  3U5P A;  4QSV A;  5L96 A;  5CQ4 A;  5A82 A;  5EP7 A;  2RNY A;  5IG6 A;  5KU3 A;  5H85 A;  5A5P A;  2L85 A;  4TYL A;  4TTE A;  5II2 A;  5FG4 A;  5J0D A;  3MXF A;  5DW2 A;  5E74 A;  2RO1 A;  5CUC A;  4E96 A;  5II1 A;  5EWV A;  5IGM A;  5EV9 A;  5HCL A;  1F68 A;  4NXJ A;  4ALG A;  2I8N A;  5LKU A;  4NR6 A;  4QYD A;  2WP1 A;  2R0Y A;  2D9E A;  5FE1 A;  4AKN A;  2RFJ A;  3O35 A;  4HXP A;  5D24 A;  3G0J A;  3JVJ A;  5EWD A;  4IR6 A;  5HM0 A;  4A9I A;  4QSS A;  4F3I A;  4IOQ A;  5CQT A;  5FBX A;  5CY9 A;  4HXL A;  4MR4 A;  4QUT A;  3DWY A;  5CQ5 A;  4N4I A;  4Z6H A;  5FFV A;  2RI7 A;  3HMF A;  4C66 A;  5DY7 A;  5D3J A;  5A83 A;  3P1C A;  5CUB A;  2E7O A;  2KTB B;  5F3A A;  4CUU A;  4A9F A;  5E9I A;  4NRB A;  5KO4 A;  5CGP A;  4TZ2 A;  4Y03 A;  5H1T A;  5D3L A;  4LYI A;  4NUE A;  4NUD A;  5L8U A;  5A5R A;  3JVM A;  4YYH A;  5HLS A;  2YQD A;  4QYL A;  3QZS A;  5FE7 A;  4YH3 A;  4Z6I A;  5DYA A;  3I3J A;  2DVR A;  2DAT A;  5FE0 A; 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