5FE3A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment mb360 (fragment 4)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe3A00
2N9GA 2GRCA 5L96A 3S91A 4QSVA 2R0SA 4YYKA 5FH6A 4YYNA 4UYEA 5FE3A 2DKWA 3MB3A 5EK9A 5HM0A 2DVQA 4O7AA 4XY9A 3LQIA 5FB1A 4ZW1A 2D9EA 4QUUA 4QC3A 5AMFA 4LC2A 5EWHA 4A9EA 5KO4A 3FKMX 5LKUA 3P1FA 5IGLA 5C4QA 4NS5A 2RI7A 5ENHA 3G0LA 2H60A 4N4HA 4O7FA 5F60A 5AD2A 2RNXA 4O74A 5D3NA 5AD3A 5ENGA 3UV5A 2R10A 4MR5A 2WP1A 5FE4A 5H1UA 5F1HA 5I40A 4LYSA 4YY6A 5A85A 2E3KA 3P1DA 4MR4A 3U5KA 5CU8A 5EWDA 5KTWA 4CFKA 4HBXA 4NUEA 5G4RA 5H1TA 4TZ2A 2F6NA 5FE1A 5L8TA 5A5SA 5E3GA 5DX4A 5DYAA 4Z93A 4Y03A 3U5MA 4NRCA 5FG6A 5D25A 1ZS5A 5D3TA 5HRVA 4UIYA 4NXJA 4QSRA 5HQ6A 3JVLA 5A5OA 5AMEA 5ENCA 4KV4A 4A9FA 5DKCA 4QSSA 5FE0A 3JVKA 5CQ5A 4ZC9A 4QB3A 5EA1A 5HQ7A 4PKLA 5EPRA 5IGMA 4MENA 3I3JA 4A9JA 1F68A 5TB6A 4UIUA 5HFRA 2L84A 4HXNA 3U5JA 5D3RA 3JVMA 4A9IA 3QZVA 2F6JA 4Z1SA 4O72A 4A9NA 3IU6A 5I7XA 4OUFA 4RVRA 5EM3A 1X0JA 4O7BA 5C8GA 5F1LA 3O36A 3Q2EA 4CUQA 3AADA 4MR3A 3MXFA 4J1PA 5FH8A 5KTUA 5EWWA 5HEMA 4UYFA 5DKDA 5IIDA 5F62A 2OSSA 5CP5A 5CQ6A 3LQJA 5E9IA 4KCXA 2DWWA 3MULA 5EICA 3IU5A 5CZGA 4WIVA 5FE7A 4CFLA 5HLSA 5L8UA 5DY7A 4QNSA 5DFBA 3P1EA 5I88A 5HJCA 3UW9A 4YYDA 4AKNA 4CUSA 5D3HA 4IOOA 3DAIA 5LVRA 5I86A 4O76A 2DATA 4QEUA 4TZ8A 4HXOA 4LR6A 2RFJA 5CFWA 4QSUA 4QY4A 5CGPA 2OO1A 4KV1A 3QZSA 5DLZA 4O70A 4NRBA 4BW4A 5CQTA 4Z1QA 3U5LA 5DFDA 5E9VA 5BT4A 5DW1A 5ENBA 5D24A 5C87A 5F2PA 5E9MA 2YYNA 4YH3A 2YEMA 1WUMA 4A9KA 4LYWA 4QSPA 4C66A 5LKTA 4QSQA 3O33A 4IR6A 4J0SA 4O78A 5FE6A 5D3LA 5ENFA 3HMHA 5FE9A 4O7CA 5E7DA 4Z6IA 4O77A 4DONA 2R0YA 2E7NA 4NR5A 5II1A 5LUUA 5FG5A 3S92A 5EQ1A 5D3PA 5H85A 5ETBA 5JI8A 4HBVA 5II2A 4YYIA 5E9KA 3NXBA 1JM4B 2OUOA 4FLPA 4NQMA 3LQHA 4O71A 5CPEA 5DYXA 5EI4A 4OGJA 4BW1A 3UV2A 3SVHA 4TT6A 4BW3A 3MQMA 2NXBA 4NR9A 4ALHA 3O34A 5DYUA 5A5RA 4YYMA 5LKZA 5F61A 2I8NA 4YYHA 4O7EA 5LJ2A 3RCWA 2L85A 4BHWA 4YYGA 4X2IA 5EWCA 4A9MA 5CY9A 4J3IA 5CUAA 5D7XA 5D26A 3UVXA 4QYDA 5EPSA 4UIZA 4YADA 4QEVA 5CQAA 4HXSA 4NUDA 4NRAA 3AQAA 3P5OA 3SVGA 4CURA 4QZSA 4LYIA 4O75A 5DW2A 5FE5A 4YH4A 5EWVA 3ZYUA 2E7OA 5D3JA 4XUBA 4UIXA 4IR3A 5D0CA 4F3IA 3LXJA 5TCMA 4HBWA 4A9LA 4QR4A 4NYVA 5K29A 2YW5A 2DVSA 2YEKA 4NR6A 4LZSA 5I7YA 3DWYA 2YDWA 4UITA 5A5NA 5C7NA 2RO1A 2D82A 3HMFA 5FFYA 4QR3A 5A5PA 3QZTA 5CRMA 5H1VA 4TS8A 5I83A 3G0JA 4QC1A 5F3AA 5HCLA 4IR4A 5I80A 5A5QA 2R0VA 3SVFA 5DFCA 5CRZA 2DVRA 4LZ2A 5EV9A 5EGUA 5KTXA 4YAXA 4QR5A 5E73A 4YATA 4PY6A 4CUTA 5HQ5A 5FBXA 4WHUA 5E3DA 5I1QA 3HMEA 4HXLA 4YC9A 3JVJA 4ZQLA 5L98A 3P1CA 3LJWA 4HBYA 4HXMA 4IORA 5E9YA 5D3SA 5ACYA 5CUDA 4TT2A 5FFVA 5E9LA 3UVDA 5LJ1A 4HXPA 1N72A 5F5ZA 4CUUA 5F25A 4TU4A 4YABA 4XUAA 5EVAA 4UYFB 3MB4A 3ONIA 4PCEA 1E6IA 5HRXA 4QSWA 5IGKA 4QSTA 4HXRA 4C67A 3UV4A 2YQDA 4TQNA 2RNWA 3U5NA 2G4AA 3Q2FA 4UYGA 4YBSA 3U5PA 5E0RA 4MEOA 5CUGA 4BW2A 4PS5A 5FFWA 5A81A 4TTEA 4IR5A 4UYHA 5FE8A 4LRGA 5IG6A 3MUKA 4Z6HA 5F63A 2I7KA 4Q0OA 5JWMA 5CQ8A 4NYWA 5LVQA 5CUCA 4NUCA 1WUGA 5A83A 4E96A 4NR7A 5IBNA 4PCIA 4QEWA 4TT4A 5COIA 4J0RA 4UYDA 5FH7A 5C85A 5BT5A 4QUTA 3O35A 5G4SA 2LSPB 5LKXA 5ETDA 3U5OA 5CTLA 2WP2A 5DBMA 5I89A 5I29A 4LDFA 5HENA 5FDZA 4A9OA 5ENIA 2RS9B 5F36A 5DLXA 3TLPA 5CQ4A 4CLBA 5FB0A 5FG4A 4XYAA 5FE2A 5C89A 5LJ0A 4NR8A 4TU6A 5L99A 4GPJA 4A9HA 2YELA 4LZRA 2DVVA 4UIVA 4NQNA 3UVWA 4CUPA 4CL9A 4WHWA 3UVYA 4YBMA 5KHMA 4QSXA 5ENEA 3K2JA 5HRWA 5EPBA 5J0DA 5EP7A 5DYCA 4Q0NA 5KU3A 4N4GA 5A82A 2KTBB 3O37A 4N3WA 4BJXA 5EISA 4PTBA 4TYLA 4NR4A 4HXKA 5IGNA 4MR6A 5HELA 4YYJA 2FSAA 4YBTA 2MJVB 5BT3A 5HFQA 5ENJA 5CQ7A 4ALGA 3GG3A 4YK0A 5L97A 4QYLA 4YY4A 3D7CA 5CUEA 5E74A 1JSPB 4MEPA 4QBMA 5CS8A 1EQFA 4MEQA 2RNYA 4N4IA 5DKHA 5EU1A 4UIWA 4IOQA 5A7CA 4NYXA 4OGIA 4XY8A 5CQ3A 2L5EA 4N4FA 5CUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2N9GA 2GRCA 5L96A 3S91A 4QSVA 2R0SA 4YYKA 5FH6A 4YYNA 4UYEA 5FE3A 2DKWA 3MB3A 5EK9A 5HM0A 2DVQA 4O7AA 4XY9A 3LQIA 5FB1A 4ZW1A 2D9EA 4QUUA 4QC3A 5AMFA 4LC2A 5EWHA 4A9EA 5KO4A 3FKMX 5LKUA 3P1FA 5IGLA 5C4QA 4NS5A 2RI7A 5ENHA 3G0LA 2H60A 4N4HA 4O7FA 5F60A 5AD2A 2RNXA 4O74A 5D3NA 5AD3A 5ENGA 3UV5A 2R10A 4MR5A 2WP1A 5FE4A 5H1UA 5F1HA 5I40A 4LYSA 4YY6A 5A85A 2E3KA 3P1DA 4MR4A 3U5KA 5CU8A 5EWDA 5KTWA 4CFKA 4HBXA 4NUEA 5G4RA 5H1TA 4TZ2A 2F6NA 5FE1A 5L8TA 5A5SA 5E3GA 5DX4A 5DYAA 4Z93A 4Y03A 3U5MA 4NRCA 5FG6A 5D25A 1ZS5A 5D3TA 5HRVA 4UIYA 4NXJA 4QSRA 5HQ6A 3JVLA 5A5OA 5AMEA 5ENCA 4KV4A 4A9FA 5DKCA 4QSSA 5FE0A 3JVKA 5CQ5A 4ZC9A 4QB3A 5EA1A 5HQ7A 4PKLA 5EPRA 5IGMA 4MENA 3I3JA 4A9JA 1F68A 5TB6A 4UIUA 5HFRA 2L84A 4AKIA 4HXNA 3U5JA 5D3RA 3JVMA 4A9IA 3QZVA 2F6JA 4Z1SA 4O72A 4A9NA 3IU6A 5I7XA 4OUFA 4RVRA 5EM3A 1X0JA 4O7BA 5C8GA 5F1LA 3O36A 3Q2EA 4CUQA 3AADA 4MR3A 3MXFA 4J1PA 5FH8A 5KTUA 5EWWA 5HEMA 3D1BA 4UYFA 5DKDA 5IIDA 5F62A 2OSSA 5CP5A 5CQ6A 3LQJA 5E9IA 4KCXA 2DWWA 3MULA 5EICA 3IU5A 5CZGA 4WIVA 5FE7A 4CFLA 5HLSA 5L8UA 5DY7A 4QNSA 5DFBA 3P1EA 5I88A 5HJCA 3UW9A 4YYDA 4AKNA 4CUSA 5D3HA 4IOOA 3DAIA 5LVRA 5I86A 4O76A 2DATA 4QEUA 4TZ8A 4HXOA 1PUOA 4LR6A 2RFJA 5CFWA 4QSUA 4QY4A 5CGPA 2OO1A 4KV1A 3QZSA 5DLZA 4O70A 4NRBA 4BW4A 5CQTA 4Z1QA 3U5LA 5DFDA 5E9VA 5BT4A 5DW1A 5ENBA 5D24A 5C87A 5F2PA 5E9MA 2YYNA 4YH3A 2YEMA 1WUMA 4A9KA 4LYWA 4QSPA 4C66A 5LKTA 4QSQA 3O33A 4IR6A 4J0SA 4O78A 5FE6A 5D3LA 5ENFA 3HMHA 5FE9A 4O7CA 5E7DA 4Z6IA 4O77A 4DONA 2R0YA 2E7NA 4NR5A 5II1A 5LUUA 5FG5A 3S92A 3VKGA 5EQ1A 5D3PA 5H85A 5ETBA 5JI8A 4HBVA 5II2A 4YYIA 5E9KA 3NXBA 1JM4B 2OUOA 4FLPA 4NQMA 3LQHA 4O71A 5CPEA 5DYXA 5EI4A 4OGJA 4BW1A 3UV2A 4AKHA 3SVHA 4TT6A 4BW3A 3MQMA 2NXBA 4NR9A 4ALHA 3O34A 5DYUA 5A5RA 4YYMA 5LKZA 5F61A 2I8NA 4YYHA 4O7EA 5LJ2A 3RCWA 2L85A 4BHWA 4YYGA 4X2IA 5EWCA 4A9MA 5CY9A 4J3IA 5CUAA 4AI6A 5D7XA 5D26A 3UVXA 4QYDA 5EPSA 4UIZA 4YADA 4QEVA 2EJNA 5CQAA 4HXSA 4NUDA 4NRAA 3AQAA 3P5OA 3SVGA 4CURA 4QZSA 4LYIA 4O75A 5DW2A 5FE5A 4YH4A 5EWVA 3ZYUA 2E7OA 5D3JA 4XUBA 4UIXA 4IR3A 5D0CA 4F3IA 3LXJA 5TCMA 4HBWA 4A9LA 4QR4A 4NYVA 5K29A 2YW5A 2DVSA 2YEKA 4NR6A 4LZSA 5I7YA 3DWYA 2YDWA 4UITA 5A5NA 5C7NA 2RO1A 2D82A 3HMFA 5FFYA 4QR3A 5A5PA 3QZTA 5CRMA 5H1VA 4TS8A 5I83A 3G0JA 4QC1A 5F3AA 5HCLA 4IR4A 5I80A 5A5QA 2R0VA 3SVFA 5DFCA 5CRZA 2DVRA 4LZ2A 5EV9A 5EGUA 5KTXA 4YAXA 4QR5A 5E73A 4YATA 4PY6A 4CUTA 5HQ5A 5FBXA 4WHUA 5E3DA 5I1QA 3HMEA 4HXLA 4YC9A 3JVJA 4ZQLA 5L98A 3P1CA 3LJWA 4HBYA 4HXMA 4IORA 5E9YA 5D3SA 5ACYA 5CUDA 4TT2A 5FFVA 5E9LA 3UVDA 5LJ1A 4HXPA 1N72A 5F5ZA 4CUUA 5F25A 4TU4A 4YABA 4AKGA 4XUAA 5EVAA 4UYFB 3MB4A 3ONIA 4PCEA 1E6IA 5HRXA 3VKHA 4QSWA 5IGKA 4QSTA 4HXRA 4C67A 3UV4A 2YQDA 4TQNA 2RNWA 3U5NA 2G4AA 3Q2FA 4UYGA 4YBSA 3U5PA 5E0RA 4MEOA 5CUGA 4BW2A 4PS5A 5FFWA 5A81A 4TTEA 4IR5A 4UYHA 5FE8A 4LRGA 5IG6A 3MUKA 4Z6HA 5F63A 2I7KA 4Q0OA 5JWMA 5CQ8A 4NYWA 5LVQA 5CUCA 4NUCA 1WUGA 5A83A 4E96A 4NR7A 5IBNA 4PCIA 4QEWA 4TT4A 5COIA 4J0RA 4UYDA 5FH7A 5C85A 3D1DA 5BT5A 4QUTA 3O35A 5G4SA 2LSPB 5LKXA 5ETDA 3U5OA 5CTLA 2WP2A 5DBMA 5I89A 5I29A 4LDFA 5HENA 5FDZA 4A9OA 5ENIA 2RS9B 5F36A 5DLXA 3TLPA 5CQ4A 4CLBA 5FB0A 5FG4A 4XYAA 5FE2A 5C89A 5LJ0A 1ZKRA 4NR8A 4TU6A 5L99A 4GPJA 4A9HA 2YELA 4LZRA 2DVVA 4UIVA 4NQNA 3UVWA 4CUPA 4CL9A 4WHWA 3UVYA 4YBMA 5KHMA 4QSXA 5ENEA 3K2JA 5HRWA 5EPBA 5J0DA 5EP7A 5DYCA 4Q0NA 5KU3A 4N4GA 5A82A 2KTBB 3O37A 4N3WA 4BJXA 5EISA 4PTBA 4TYLA 4NR4A 4HXKA 5IGNA 4MR6A 5HELA 4YYJA 2FSAA 4YBTA 2MJVB 5BT3A 5HFQA 3ERRA 5ENJA 5CQ7A 4ALGA 3GG3A 4YK0A 5L97A 4QYLA 4YY4A 3D7CA 5CUEA 5E74A 1JSPB 4MEPA 4QBMA 5CS8A 1EQFA 4MEQA 2RNYA 4N4IA 5DKHA 5EU1A 4UIWA 4IOQA 5A7CA 4NYXA 4OGIA 4XY8A 5CQ3A 2L5EA 4N4FA 5CUBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 2N9G A;  2GRC A;  5L96 A;  3S91 A;  4QSV A;  2R0S A;  4YYK A;  5FH6 A;  4YYN A;  4UYE A;  5FE3 A;  2DKW A;  3MB3 A;  5EK9 A;  5HM0 A;  2DVQ A;  4O7A A;  4XY9 A;  3LQI A;  5FB1 A;  4ZW1 A;  2D9E A;  4QUU A;  4QC3 A;  5AMF A;  4LC2 A;  5EWH A;  4A9E A;  5KO4 A;  3FKM X;  5LKU A;  3P1F A;  5IGL A;  5C4Q A;  4NS5 A;  2RI7 A;  5ENH A;  3G0L A;  2H60 A;  4N4H A;  4O7F A;  5F60 A;  5AD2 A;  2RNX A;  4O74 A;  5D3N A;  5AD3 A;  5ENG A;  3UV5 A;  2R10 A;  4MR5 A;  2WP1 A;  5FE4 A;  5H1U A;  5F1H A;  5I40 A;  4LYS A;  4YY6 A;  5A85 A;  2E3K A;  3P1D A;  4MR4 A;  3U5K A;  5CU8 A;  5EWD A;  5KTW A;  4CFK A;  4HBX A;  4NUE A;  5G4R A;  5H1T A;  4TZ2 A;  2F6N A;  5FE1 A;  5L8T A;  5A5S A;  5E3G A;  5DX4 A;  5DYA A;  4Z93 A;  4Y03 A;  3U5M A;  4NRC A;  5FG6 A;  5D25 A;  1ZS5 A;  5D3T A;  5HRV A;  4UIY A;  4NXJ A;  4QSR A;  5HQ6 A;  3JVL A;  5A5O A;  5AME A;  5ENC A;  4KV4 A;  4A9F A;  5DKC A;  4QSS A;  5FE0 A;  3JVK A;  5CQ5 A;  4ZC9 A;  4QB3 A;  5EA1 A;  5HQ7 A;  4PKL A;  5EPR A;  5IGM A;  4MEN A;  3I3J A; 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