5FE3A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment mb360 (fragment 4)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe3A00
4NUCA 4BW1A 3UW9A 4QC1A 5COIA 5KTXA 4WIVA 5I7XA 4YC9A 4PTBA 5I83A 4O75A 5FG4A 4HXOA 4NS5A 2N9GA 5I86A 5FE7A 2DWWA 3QZTA 5I88A 4MR4A 5ENHA 5EA1A 4NYVA 5EPSA 4MR6A 5F25A 3UV4A 5FB1A 4LR6A 4UIZA 5CUAA 2DVRA 3DWYA 4N4FA 4LDFA 4O7EA 2I8NA 4CURA 5F1LA 5FE0A 1E6IA 4YAXA 3SVFA 4NYWA 4YBSA 4UYFA 1F68A 5E3GA 5HRVA 4O77A 4QR3A 2YQDA 4J3IA 4O78A 5A85A 5E9VA 2YDWA 4LZRA 4Z1SA 3NXBA 4NR9A 4O70A 4NRCA 4CUSA 1WUGA 5C89A 3U5LA 2RNWA 5HEMA 4NYXA 2RFJA 4QSWA 4TT4A 4A9NA 4UITA 4N4IA 4CUQA 4YADA 2L84A 5I40A 4A9HA 5LJ1A 5E0RA 5AD3A 4YH3A 4YYGA 4XUAA 5FE9A 3AADA 4UIXA 4GPJA 1JSPB 5D3TA 3AQAA 5FBXA 4ALHA 4Z6HA 4WHUA 5II2A 4A9FA 3U5MA 1N72A 4UYDA 3O37A 4HXRA 5EP7A 3I3JA 5ENBA 4QSVA 3UVDA 5EQ1A 4TQNA 3S91A 5DLZA 5EICA 4O74A 5CY9A 5ENCA 2E7OA 5L98A 4LYSA 4TT6A 5EWHA 5A83A 4NR4A 4CL9A 4BHWA 3G0LA 5CQTA 5I80A 5AMFA 4IR5A 4NUEA 5A5QA 4NUDA 5DX4A 5HCLA 5LKTA 3K2JA 3QZSA 5CPEA 4A9EA 3S92A 4A9MA 5BT4A 4HXKA 5IGNA 5E74A 5EWWA 5FE6A 5F1HA 2R0YA 4MR3A 3MXFA 4QEWA 4O72A 5C7NA 5AD2A 2R0VA 5DW1A 4XUBA 5IIDA 4C67A 5D3NA 5E9LA 2OSSA 3IU5A 3MB3A 5D3RA 4LC2A 5CTLA 4UIUA 3MQMA 5D24A 5C85A 5AMEA 4MR5A 5TB6A 5DKHA 5E7DA 4OGJA 4YABA 4YY4A 5DFCA 2OUOA 4A9IA 5H85A 5D3JA 4NR6A 5ENEA 5IGLA 5FE2A 5CFWA 5F36A 5CUDA 5I7YA 4QSUA 4HXPA 4Q0OA 5EI4A 5C8GA 3MUKA 5L99A 4QUUA 4A9LA 5FG6A 5ETBA 4QSTA 4YBTA 4Z93A 5ENIA 4HBXA 3UVXA 3HMHA 5G4RA 5CUGA 5FG5A 2D82A 4DONA 3P1EA 5EU1A 4FLPA 4TTEA 2YYNA 4KV1A 4LYWA 5DYCA 5CUEA 4ZQLA 4PCIA 5EK9A 5EVAA 2WP1A 5EWVA 5KTUA 4HXLA 4O7AA 4KV4A 5A5NA 4YYKA 5ENFA 3JVLA 4NR5A 5FDZA 3JVMA 5CUBA 5J0DA 3Q2FA 5LKXA 5I29A 4XYAA 4QSRA 5E9MA 4TZ2A 5E9YA 5A81A 5FFYA 5KHMA 5L96A 2KTBB 5BT3A 4O7FA 4NRAA 4YY6A 4BJXA 4YH4A 4TU4A 2E3KA 4TYLA 5I1QA 3U5OA 5DYXA 3FKMX 5DKCA 5F61A 4QSQA 2NXBA 3LQJA 4QUTA 2F6JA 2RO1A 3O34A 5LJ0A 2GRCA 4NRBA 4N4GA 3ZYUA 2DVVA 3LQHA 4QC3A 4IR3A 5EM3A 5F62A 4J0RA 5IGKA 3LJWA 4QR4A 4WHWA 4YYJA 3MB4A 5LUUA 5D26A 4QY4A 4NQNA 5F2PA 3HMFA 4Z1QA 2LSPB 4CLBA 5FE8A 5KTWA 5FFVA 3O35A 3IU6A 5E9KA 5JWMA 5HJCA 4O7BA 4YK0A 4X2IA 5CU8A 5CQ4A 3D7CA 5DLXA 5CZGA 5HFRA 4MEPA 5ACYA 5DKDA 4CFKA 5LKUA 2H60A 4KCXA 5DY7A 5EGUA 4A9KA 5HQ5A 4YATA 3O36A 4QBMA 5L8TA 5H1TA 3MULA 4HBWA 4NQMA 5D3SA 2OO1A 3SVHA 5DBMA 5D7XA 3UVWA 5ENJA 4BW2A 5A82A 4ZW1A 5FH7A 3SVGA 5IG6A 4HXSA 4UYGA 5ETDA 5H1VA 2RI7A 2D9EA 4QEUA 5L97A 5CUCA 4A9JA 5ENGA 3DAIA 5FH6A 4O76A 4LYIA 5FH8A 5EISA 4QZSA 4IR4A 5CQ7A 4PS5A 4IORA 3UV5A 4C66A 4TT2A 5HQ7A 3U5JA 4MENA 4CUUA 2DVSA 3GG3A 2DATA 3JVJA 4UIYA 3UVYA 5EPBA 2G4AA 4BW3A 1WUMA 4PKLA 5CQ6A 4TZ8A 5DFBA 4UYEA 5CQ5A 1X0JA 4AKNA 3G0JA 2RNYA 4ZC9A 3O33A 5E9IA 5HM0A 4QYLA 2F6NA 3U5PA 5D25A 4F3IA 3P1FA 5DYUA 3LXJA 5HRXA 1JM4B 5CRZA 5LJ2A 1EQFA 5HELA 5D3PA 2R10A 4QSPA 5CRMA 5CQAA 4YYHA 5F60A 4OGIA 2YELA 4UYFB 5DW2A 5A5PA 3JVKA 5CQ8A 4MEOA 3U5KA 5JI8A 5FB0A 4CUTA 3HMEA 4A9OA 4LZSA 3U5NA 2YEMA 5A5RA 5LKZA 4BW4A 3RCWA 4UIWA 4ALGA 1ZS5A 4XY8A 4YBMA 4O7CA 5E73A 3TLPA 5DFDA 4QSSA 2DKWA 5FE3A 5DYAA 5IBNA 5L8UA 4CUPA 4N3WA 4O71A 5II1A 5EV9A 5IGMA 4IR6A 4YYNA 5CP5A 4YYDA 5HRWA 5CS8A 5BT5A 2MJVB 5A5OA 5D0CA 4J0SA 5FFWA 5TCMA 2WP2A 4QSXA 4YYIA 4NR8A 4N4HA 3Q2EA 5LVRA 4QB3A 5A7CA 4LZ2A 4NR7A 2R0SA 4QR5A 2RNXA 4TU6A 4MEQA 2DVQA 5E3DA 4Y03A 2YEKA 5EPRA 3UV2A 5FE1A 4UYHA 4QYDA 3LQIA 4QEVA 4CFLA 2E7NA 2L5EA 4OUFA 3QZVA 2I7KA 4UIVA 4IOQA 5FE5A 4QNSA 5F5ZA 4E96A 4PY6A 5EWCA 4Q0NA 3ONIA 5CGPA 4LRGA 5KU3A 3P1CA 5I89A 2FSAA 4HXNA 5CQ3A 5FE4A 2L85A 5C4QA 4Z6IA 5F3AA 4RVRA 4NXJA 4PCEA 4HBYA 5KO4A 5HFQA 5LVQA 5D3HA 4HBVA 5K29A 4YYMA 5H1UA 4HXMA 5A5SA 5HENA 5C87A 2RS9B 2YW5A 4IOOA 4TS8A 5HLSA 5F63A 4XY9A 3P5OA 5D3LA 4J1PA 5HQ6A 3P1DA 5EWDA 5G4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NUCA 4BW1A 3UW9A 4QC1A 5COIA 5KTXA 4WIVA 5I7XA 4YC9A 4PTBA 5I83A 4O75A 5FG4A 4HXOA 4NS5A 2N9GA 5I86A 5FE7A 2DWWA 3QZTA 5I88A 4MR4A 5ENHA 5EA1A 4NYVA 5EPSA 4MR6A 5F25A 3UV4A 5FB1A 4LR6A 4UIZA 5CUAA 2DVRA 3DWYA 4N4FA 4LDFA 4O7EA 2I8NA 4CURA 5F1LA 5FE0A 1E6IA 4YAXA 3SVFA 4NYWA 4YBSA 4UYFA 1F68A 5E3GA 5HRVA 4O77A 4QR3A 2YQDA 4J3IA 4O78A 5A85A 5E9VA 2YDWA 4LZRA 4Z1SA 3NXBA 4NR9A 4O70A 4NRCA 4CUSA 1WUGA 5C89A 3U5LA 2RNWA 5HEMA 4NYXA 2RFJA 4QSWA 4TT4A 4A9NA 4UITA 4N4IA 4CUQA 4YADA 2L84A 5I40A 4A9HA 5LJ1A 5E0RA 5AD3A 4YH3A 4YYGA 4XUAA 5FE9A 3AADA 4UIXA 4GPJA 1JSPB 5D3TA 3AQAA 5FBXA 4ALHA 4Z6HA 4WHUA 5II2A 4A9FA 3U5MA 1N72A 4UYDA 3O37A 4HXRA 5EP7A 3I3JA 5ENBA 4QSVA 3UVDA 5EQ1A 4TQNA 3S91A 5DLZA 5EICA 4O74A 5CY9A 5ENCA 2E7OA 5L98A 4LYSA 4TT6A 5EWHA 5A83A 4NR4A 4CL9A 4BHWA 3G0LA 5CQTA 5I80A 5AMFA 4IR5A 4NUEA 5A5QA 4NUDA 5DX4A 5HCLA 5LKTA 3K2JA 3QZSA 5CPEA 4A9EA 3S92A 4A9MA 5BT4A 4HXKA 5IGNA 5E74A 5EWWA 5FE6A 5F1HA 2R0YA 4MR3A 3MXFA 4QEWA 4O72A 5C7NA 5AD2A 2R0VA 5DW1A 4XUBA 5IIDA 4C67A 5D3NA 1PUOA 5E9LA 2OSSA 3IU5A 3MB3A 5D3RA 4LC2A 5CTLA 4UIUA 4AKIA 3MQMA 5D24A 5C85A 5AMEA 4MR5A 5TB6A 5DKHA 5E7DA 4OGJA 4YABA 4YY4A 5DFCA 2OUOA 4A9IA 5H85A 5D3JA 4NR6A 5ENEA 5IGLA 5FE2A 5CFWA 5F36A 5CUDA 5I7YA 4QSUA 4HXPA 4Q0OA 5EI4A 5C8GA 3MUKA 5L99A 4QUUA 4A9LA 3D1BA 5FG6A 5ETBA 4QSTA 4YBTA 4Z93A 5ENIA 4HBXA 3UVXA 3HMHA 5G4RA 5CUGA 5FG5A 2D82A 4DONA 3D1DA 3P1EA 5EU1A 4FLPA 4TTEA 2YYNA 4KV1A 4LYWA 5DYCA 5CUEA 4ZQLA 4PCIA 5EK9A 5EVAA 2WP1A 5EWVA 5KTUA 4HXLA 4O7AA 2EJNA 4KV4A 5A5NA 4YYKA 5ENFA 3JVLA 4NR5A 5FDZA 3JVMA 5CUBA 5J0DA 3Q2FA 5LKXA 5I29A 4XYAA 4QSRA 5E9MA 4TZ2A 5E9YA 5A81A 5FFYA 5KHMA 5L96A 2KTBB 5BT3A 4O7FA 4NRAA 4YY6A 4BJXA 4YH4A 4TU4A 2E3KA 4TYLA 5I1QA 3U5OA 5DYXA 3FKMX 5DKCA 5F61A 4QSQA 2NXBA 3LQJA 4QUTA 2F6JA 2RO1A 3O34A 5LJ0A 2GRCA 4NRBA 4N4GA 3ZYUA 2DVVA 3LQHA 4QC3A 4IR3A 5EM3A 5F62A 4J0RA 5IGKA 3LJWA 4QR4A 4WHWA 4YYJA 3MB4A 5LUUA 5D26A 4QY4A 4NQNA 5F2PA 3VKGA 3HMFA 4Z1QA 2LSPB 4CLBA 5FE8A 5KTWA 5FFVA 3O35A 3IU6A 5E9KA 5JWMA 5HJCA 4O7BA 4YK0A 4X2IA 5CU8A 5CQ4A 3D7CA 5DLXA 5CZGA 5HFRA 4MEPA 5ACYA 5DKDA 4CFKA 5LKUA 2H60A 4KCXA 5DY7A 5EGUA 4A9KA 5HQ5A 4YATA 3O36A 4QBMA 5L8TA 5H1TA 4AKGA 3MULA 4HBWA 4NQMA 5D3SA 2OO1A 3SVHA 5DBMA 5D7XA 3UVWA 5ENJA 4BW2A 5A82A 4ZW1A 5FH7A 3SVGA 5IG6A 4HXSA 4UYGA 5ETDA 5H1VA 2RI7A 2D9EA 4QEUA 5L97A 5CUCA 4A9JA 5ENGA 3DAIA 5FH6A 4O76A 4LYIA 5FH8A 5EISA 4QZSA 4IR4A 5CQ7A 4PS5A 4IORA 3UV5A 4C66A 4TT2A 5HQ7A 4AI6A 3U5JA 4MENA 4CUUA 2DVSA 3GG3A 2DATA 3JVJA 4UIYA 3UVYA 5EPBA 2G4AA 4BW3A 1WUMA 4PKLA 3ERRA 5CQ6A 4TZ8A 5DFBA 4UYEA 5CQ5A 1X0JA 4AKNA 3G0JA 2RNYA 4ZC9A 3O33A 5E9IA 5HM0A 4QYLA 2F6NA 3U5PA 5D25A 4F3IA 3P1FA 5DYUA 3LXJA 5HRXA 1JM4B 5CRZA 5LJ2A 1EQFA 5HELA 5D3PA 2R10A 4QSPA 5CRMA 5CQAA 4YYHA 5F60A 4OGIA 2YELA 4UYFB 5DW2A 5A5PA 3JVKA 5CQ8A 4MEOA 3U5KA 5JI8A 5FB0A 4CUTA 3HMEA 4A9OA 4LZSA 3U5NA 2YEMA 5A5RA 5LKZA 4BW4A 3RCWA 4UIWA 4ALGA 1ZS5A 4XY8A 4YBMA 4O7CA 5E73A 3TLPA 5DFDA 4QSSA 3VKHA 2DKWA 5FE3A 5DYAA 5IBNA 5L8UA 4CUPA 4N3WA 4O71A 5II1A 5EV9A 5IGMA 4IR6A 4YYNA 5CP5A 4YYDA 5HRWA 5CS8A 5BT5A 2MJVB 5A5OA 5D0CA 4J0SA 5FFWA 5TCMA 2WP2A 4QSXA 4YYIA 4NR8A 1ZKRA 4N4HA 3Q2EA 5LVRA 4QB3A 5A7CA 4LZ2A 4NR7A 2R0SA 4QR5A 2RNXA 4TU6A 4MEQA 2DVQA 5E3DA 4Y03A 2YEKA 5EPRA 3UV2A 5FE1A 4UYHA 4QYDA 3LQIA 4QEVA 4CFLA 2E7NA 2L5EA 4AKHA 4OUFA 3QZVA 2I7KA 4UIVA 4IOQA 5FE5A 4QNSA 5F5ZA 4E96A 4PY6A 5EWCA 4Q0NA 3ONIA 5CGPA 4LRGA 5KU3A 3P1CA 5I89A 2FSAA 4HXNA 5CQ3A 5FE4A 2L85A 5C4QA 4Z6IA 5F3AA 4RVRA 4NXJA 4PCEA 4HBYA 5KO4A 5HFQA 5LVQA 5D3HA 4HBVA 5K29A 4YYMA 5H1UA 4HXMA 5A5SA 5HENA 5C87A 2RS9B 2YW5A 4IOOA 4TS8A 5HLSA 5F63A 4XY9A 3P5OA 5D3LA 4J1PA 5HQ6A 3P1DA 5EWDA 5G4SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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