4CUQA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-2 n09594
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-2 N09594
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuqA00
3UVXA 5KTWA 2DVRA 5EPBA 4NUDA 5EWCA 5LJ0A 4IR3A 5H1VA 4HXLA 5EWWA 4C66A 4J1PA 5C87A 4WHWA 5KTXA 2I7KA 3QZTA 4A9OA 5FE7A 4YYDA 5JWMA 5FG6A 3U5LA 4QSWA 5E3GA 3O35A 3P1CA 4NR7A 4HXMA 5ENJA 4YH4A 2H60A 5KO4A 4NUCA 4YBTA 1F68A 4A9MA 5FH7A 3O36A 3U5JA 5CUGA 4Z6HA 4N4FA 5ENBA 2I8NA 4NR4A 5F5ZA 4XYAA 4A9FA 5D0CA 4CFKA 5A7CA 4O78A 4CFLA 4PCIA 4CURA 3DAIA 5ETDA 4QC3A 4CUQA 5ETBA 4TU6A 5EU1A 5AMEA 5L8UA 5KU3A 5EPSA 2R0YA 4Q0OA 5CGPA 5J0DA 5E9KA 5HELA 5FB0A 4YY6A 4NQMA 5AD3A 3P5OA 2RS9B 2NXBA 4YYNA 2E7OA 3MB4A 5FFVA 5HRWA 2L5EA 3IU6A 3QZVA 4O77A 5CTLA 5TCMA 5A5OA 4YYMA 5E73A 2F6NA 3LQIA 2G4AA 4LZSA 5CQ3A 5HQ6A 5CUAA 4QSSA 4Z1QA 2WP1A 5E3DA 5DFDA 5EVAA 5DKCA 2OUOA 2KTBB 3DWYA 3MULA 4MENA 2YW5A 2RNXA 5A5SA 4QR4A 3P1EA 5IGKA 2L85A 4J0SA 5CRZA 5E74A 4HXKA 3UVDA 4NQNA 5DYXA 4QYDA 3SVFA 2DKWA 4OUFA 4TT2A 3LQHA 3UVYA 4WIVA 3SVGA 4AKNA 4XY8A 4NR8A 5I80A 3GG3A 4OGIA 5FB1A 5DW2A 4QSQA 4Z1SA 4TYLA 4NXJA 4UYFA 5BT4A 4NYWA 5LJ1A 3O34A 3P1DA 3G0JA 4NRBA 4QSXA 4N3WA 4YATA 5E7DA 4A9HA 2RO1A 4QSUA 4MR3A 4UYEA 5D3LA 5EV9A 4YYIA 3UVWA 4UYDA 4MEPA 5CQ5A 1N72A 4MR6A 5I89A 1WUGA 5F60A 4QSPA 5LKTA 5D3HA 4NYVA 5A82A 3LXJA 4O71A 5EP7A 4BHWA 4YABA 5ACYA 5H1UA 4IOOA 5D3PA 4RVRA 4YADA 4QR5A 5ENHA 3Q2FA 2D82A 5IGNA 5E9LA 3S92A 4GPJA 5FE4A 2N9GA 2YEKA 5FE5A 5CS8A 4BW4A 2RI7A 2R10A 5I1QA 2MJVB 4UYGA 1WUMA 5F63A 5A5QA 1X0JA 5G4SA 4TQNA 5DFBA 3JVMA 5D24A 5HEMA 5LKUA 5EWDA 4MR4A 5DFCA 5L99A 1JM4B 5FE0A 4NUEA 4A9JA 5CUEA 2RNYA 5CQAA 5CQ7A 5L98A 4QSTA 5EK9A 5C8GA 4YYKA 5IIDA 4HXRA 5TB6A 5CUDA 5EISA 3P1FA 2E7NA 4YAXA 5CQ4A 5F36A 4QY4A 5EM3A 5LJ2A 2YDWA 4LRGA 4TS8A 4LYWA 5LVRA 3U5KA 4QEVA 5I88A 5FE1A 2R0SA 4N4GA 5A5PA 3MUKA 5EA1A 3NXBA 5EGUA 3UW9A 5FH8A 5COIA 2YELA 4QUTA 5I40A 4HBVA 4LYSA 4UIZA 4LYIA 5C85A 2DWWA 5C4QA 4O7CA 5FBXA 5DKHA 4QEUA 5F25A 4TT6A 5D25A 4Z93A 3Q2EA 4PCEA 2D9EA 2WP2A 5LKZA 3JVLA 4HXNA 5CUBA 3ZYUA 5C7NA 2OSSA 5FE6A 4XY9A 3IU5A 5HQ7A 5ENEA 5LVQA 3MQMA 5DYUA 4LR6A 4CUTA 5ENGA 5E0RA 5G4RA 5DX4A 4NR6A 4ZQLA 4LC2A 3G0LA 2LSPB 5LUUA 2FSAA 5D3SA 4O70A 1JSPB 5BT3A 4TU4A 3UV4A 4CUUA 5I86A 4PY6A 4HBYA 4F3IA 4YY4A 4YYHA 4YH3A 3ONIA 5ENIA 5D3TA 4LDFA 3LJWA 5IBNA 5A5NA 5A5RA 4O76A 4QSRA 5FG4A 5HFQA 1E6IA 4YYJA 2DATA 5L8TA 3HMEA 4IR6A 5H85A 4O7EA 5DYCA 4YBSA 3TLPA 4J3IA 2YQDA 5EI4A 5F1LA 5I7YA 5E9VA 4BW1A 2YEMA 2GRCA 4ZW1A 5BT5A 3HMHA 4YK0A 4CUPA 5F61A 4IOQA 5F1HA 4MR5A 2RFJA 4UIXA 4TZ8A 5AMFA 5CU8A 5CQ8A 5HM0A 3JVKA 5D3RA 4UYFB 4CLBA 4TT4A 4HXPA 5HRVA 4O75A 4HBWA 2DVVA 3S91A 2YYNA 4TZ2A 4QYLA 5E9MA 5KTUA 4BW2A 4UIUA 4QZSA 5E9YA 5EWHA 5FDZA 2DVQA 5II1A 5EQ1A 4KV1A 3MXFA 4QB3A 4HXSA 5FE9A 4O74A 4XUBA 4NR9A 4A9LA 2L84A 5CRMA 3I3JA 4N4IA 3QZSA 4UIWA 5I7XA 5JI8A 5HCLA 4IR4A 5CUCA 5L97A 3D7CA 4ZC9A 5HLSA 5DLXA 3HMFA 5D3JA 5A81A 5H1TA 4DONA 2E3KA 3MB3A 4LZ2A 3O37A 4X2IA 4UITA 5CPEA 4QNSA 5C89A 4KCXA 5F2PA 4QR3A 5FE3A 4YC9A 3JVJA 5F3AA 3UV5A 4QC1A 5FE2A 4YBMA 5D26A 4KV4A 3U5OA 4A9EA 2R0VA 5HQ5A 5K29A 5CFWA 5FG5A 4OGJA 4O72A 5EPRA 4MEQA 5FH6A 4NR5A 5ENCA 5EICA 5KHMA 3FKMX 5L96A 4ALGA 3K2JA 5DYAA 5EWVA 5ENFA 3AADA 4PTBA 5CY9A 5LKXA 4Y03A 2OO1A 4O7BA 5I29A 5CP5A 5A83A 5A85A 3LQJA 5D7XA 4QBMA 4MEOA 4QSVA 5HJCA 4E96A 3U5PA 4YYGA 4N4HA 4O7AA 4FLPA 4HBXA 5D3NA 5FE8A 4WHUA 5FFWA 5I83A 4C67A 4J0RA 4XUAA 4A9KA 4ALHA 5E9IA 5DBMA 4CUSA 4NRAA 4UYHA 1EQFA 5II2A 4A9IA 5HFRA 5F62A 5HENA 1ZS5A 4IORA 4A9NA 5FFYA 4CL9A 4UIVA 2DVSA 4TTEA 5HRXA 3SVHA 2RNWA 5CQTA 4NRCA 3AQAA 4UIYA 5CZGA 5DY7A 4PS5A 4LZRA 4NYXA 4QUUA 5IGLA 2F6JA 5CQ6A 4BJXA 4NS5A 3U5MA 4BW3A 4PKLA 4HXOA 5DW1A 3UV2A 5IGMA 5AD2A 3RCWA 4O7FA 5DLZA 3O33A 5DKDA 3U5NA 4IR5A 4Z6IA 4QEWA 4Q0NA 5IG6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UVXA 5KTWA 2DVRA 5EPBA 4NUDA 5EWCA 5LJ0A 4IR3A 5H1VA 4HXLA 5EWWA 4C66A 4J1PA 5C87A 4WHWA 5KTXA 2I7KA 3QZTA 4A9OA 5FE7A 4YYDA 5JWMA 5FG6A 3U5LA 4QSWA 5E3GA 3O35A 3P1CA 4NR7A 4HXMA 5ENJA 4YH4A 2H60A 5KO4A 4NUCA 4YBTA 1F68A 4A9MA 5FH7A 3O36A 3U5JA 5CUGA 4Z6HA 4N4FA 5ENBA 2I8NA 4NR4A 5F5ZA 4XYAA 4A9FA 5D0CA 4CFKA 2EJNA 4O78A 5A7CA 4CFLA 4PCIA 4CURA 3DAIA 5ETDA 4QC3A 4CUQA 5ETBA 4AI6A 4TU6A 5EU1A 5AMEA 3D1BA 5L8UA 5KU3A 5EPSA 2R0YA 4Q0OA 5CGPA 5J0DA 5E9KA 5HELA 5FB0A 4YY6A 4NQMA 5AD3A 3P5OA 2RS9B 2NXBA 4YYNA 2E7OA 3MB4A 5FFVA 5HRWA 2L5EA 4AKHA 3IU6A 3QZVA 4O77A 5CTLA 5TCMA 5A5OA 4YYMA 5E73A 2F6NA 3LQIA 2G4AA 4LZSA 5CQ3A 5HQ6A 5CUAA 4QSSA 4Z1QA 2WP1A 5E3DA 5DFDA 5EVAA 5DKCA 2OUOA 2KTBB 3DWYA 3MULA 4MENA 2YW5A 2RNXA 5A5SA 4QR4A 3P1EA 5IGKA 2L85A 4J0SA 5CRZA 5E74A 4HXKA 3UVDA 4NQNA 5DYXA 4QYDA 3SVFA 2DKWA 4OUFA 3ERRA 4TT2A 3LQHA 3UVYA 4WIVA 3SVGA 4AKNA 4XY8A 4NR8A 5I80A 3GG3A 4OGIA 5FB1A 5DW2A 4QSQA 4Z1SA 4TYLA 4NXJA 4UYFA 5BT4A 4NYWA 5LJ1A 3O34A 3P1DA 3G0JA 4NRBA 4QSXA 4N3WA 4YATA 5E7DA 4A9HA 2RO1A 4QSUA 4MR3A 4UYEA 5D3LA 5EV9A 4YYIA 3UVWA 4UYDA 4MEPA 5CQ5A 1N72A 4MR6A 5I89A 1WUGA 5F60A 4QSPA 5LKTA 5D3HA 4NYVA 5A82A 3LXJA 4O71A 5EP7A 4BHWA 4YABA 5ACYA 5H1UA 4IOOA 5D3PA 4RVRA 4YADA 4QR5A 5ENHA 3Q2FA 2D82A 5IGNA 5E9LA 3S92A 4GPJA 5FE4A 2N9GA 2YEKA 5FE5A 5CS8A 4BW4A 2RI7A 2R10A 5I1QA 2MJVB 4UYGA 1WUMA 5F63A 5A5QA 1X0JA 5G4SA 4TQNA 5DFBA 3JVMA 5D24A 5HEMA 5LKUA 5EWDA 4MR4A 5DFCA 5L99A 1JM4B 5FE0A 4NUEA 4A9JA 5CUEA 2RNYA 5CQAA 5CQ7A 5L98A 4QSTA 5EK9A 5C8GA 4YYKA 5IIDA 4HXRA 5TB6A 5CUDA 5EISA 3P1FA 2E7NA 4YAXA 5CQ4A 5F36A 4QY4A 5EM3A 5LJ2A 2YDWA 4LRGA 4TS8A 4LYWA 3VKGA 5LVRA 3U5KA 4QEVA 5I88A 5FE1A 2R0SA 4N4GA 5A5PA 3MUKA 5EA1A 3NXBA 5EGUA 3UW9A 5FH8A 5COIA 2YELA 4QUTA 5I40A 4HBVA 4LYSA 4UIZA 4LYIA 5C85A 2DWWA 5C4QA 4O7CA 5FBXA 5DKHA 4QEUA 5F25A 4TT6A 5D25A 4Z93A 3Q2EA 4PCEA 2D9EA 2WP2A 5LKZA 3JVLA 4HXNA 5CUBA 3ZYUA 5C7NA 2OSSA 5FE6A 4XY9A 3IU5A 3D1DA 5HQ7A 5ENEA 5LVQA 3MQMA 5DYUA 4LR6A 4CUTA 5ENGA 5E0RA 5G4RA 5DX4A 4NR6A 4ZQLA 4LC2A 3G0LA 2LSPB 5LUUA 2FSAA 5D3SA 4O70A 1JSPB 5BT3A 4TU4A 3UV4A 4CUUA 5I86A 4PY6A 4HBYA 4F3IA 4YY4A 4YYHA 4YH3A 3ONIA 5ENIA 5D3TA 4LDFA 3LJWA 5IBNA 4AKGA 5A5NA 5A5RA 4O76A 4QSRA 5FG4A 5HFQA 1E6IA 4YYJA 2DATA 5L8TA 3HMEA 4IR6A 5H85A 4O7EA 5DYCA 4YBSA 3TLPA 4J3IA 2YQDA 5EI4A 5F1LA 5I7YA 5E9VA 4BW1A 2YEMA 2GRCA 4ZW1A 5BT5A 3HMHA 4YK0A 4CUPA 5F61A 4IOQA 5F1HA 4MR5A 2RFJA 4UIXA 4TZ8A 5AMFA 5CU8A 5CQ8A 5HM0A 3JVKA 5D3RA 4UYFB 4CLBA 4TT4A 4HXPA 5HRVA 4O75A 4HBWA 2DVVA 3S91A 2YYNA 4TZ2A 4QYLA 5E9MA 5KTUA 4BW2A 4UIUA 4QZSA 5E9YA 5EWHA 5FDZA 2DVQA 5II1A 5EQ1A 4KV1A 3MXFA 4QB3A 4HXSA 5FE9A 4O74A 4XUBA 4NR9A 4A9LA 2L84A 5CRMA 3I3JA 4N4IA 3QZSA 4UIWA 5I7XA 5JI8A 5HCLA 4IR4A 5CUCA 5L97A 3D7CA 4ZC9A 5HLSA 5DLXA 3HMFA 5D3JA 5A81A 5H1TA 4DONA 2E3KA 3MB3A 4LZ2A 3O37A 4X2IA 4AKIA 4UITA 5CPEA 4QNSA 5C89A 4KCXA 5F2PA 4QR3A 5FE3A 4YC9A 3JVJA 5F3AA 3UV5A 4QC1A 5FE2A 4YBMA 5D26A 4KV4A 3U5OA 4A9EA 1ZKRA 2R0VA 5HQ5A 5K29A 5CFWA 5FG5A 4OGJA 4O72A 5EPRA 1PUOA 4MEQA 5FH6A 4NR5A 5ENCA 5EICA 5KHMA 3FKMX 5L96A 4ALGA 3K2JA 5DYAA 5EWVA 5ENFA 3AADA 4PTBA 5CY9A 5LKXA 4Y03A 2OO1A 4O7BA 5I29A 5CP5A 5A83A 5A85A 3LQJA 5D7XA 4QBMA 4MEOA 4QSVA 5HJCA 4E96A 3U5PA 4YYGA 3VKHA 4N4HA 4O7AA 4FLPA 4HBXA 5D3NA 5FE8A 4WHUA 5FFWA 5I83A 4C67A 4J0RA 4XUAA 4A9KA 4ALHA 5E9IA 5DBMA 4CUSA 4NRAA 4UYHA 1EQFA 5II2A 4A9IA 5HFRA 5F62A 5HENA 1ZS5A 4IORA 4A9NA 5FFYA 4CL9A 4UIVA 2DVSA 4TTEA 5HRXA 3SVHA 2RNWA 5CQTA 4NRCA 3AQAA 4UIYA 5CZGA 5DY7A 4PS5A 4LZRA 4NYXA 4QUUA 5IGLA 2F6JA 5CQ6A 4BJXA 4NS5A 3U5MA 4BW3A 4PKLA 4HXOA 5DW1A 3UV2A 5IGMA 5AD2A 3RCWA 4O7FA 5DLZA 3O33A 5DKDA 3U5NA 4IR5A 4Z6IA 4QEWA 4Q0NA 5IG6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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