4CUQA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-2 n09594
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-2 N09594
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuqA00
5II1A 4QSTA 5IIDA 5LKXA 5FB0A 4NR7A 2RNYA 2YELA 2D9EA 2I8NA 4LDFA 4XYAA 5A5PA 5I7XA 4A9FA 5EWDA 2YQDA 4LYWA 3P1EA 3UVDA 4MEPA 5CQ3A 5A83A 5AMFA 3JVLA 4QSRA 3FKMX 4CFKA 4F3IA 5LVRA 4IR5A 5D3JA 3UV2A 4NUDA 4NYVA 4LC2A 5A5NA 5L99A 5CQTA 5FE0A 5CQ4A 5FE1A 5CTLA 2WP1A 4UYHA 4TT6A 3K2JA 4NRAA 2LSPB 5CY9A 5A5RA 3LQHA 2DVSA 5CUAA 4NR5A 4LR6A 5IGLA 5DLZA 3HMHA 5DX4A 4WHUA 5C7NA 4UYFA 5D3RA 4YBMA 4QSWA 4CUQA 2YYNA 5L97A 4NR8A 5ACYA 4TQNA 5EWVA 5DKCA 4A9EA 4UIWA 2L5EA 5L96A 4HXSA 5FH7A 5H1UA 2F6NA 4BW4A 5F62A 3P1DA 5KHMA 4Z1SA 5CU8A 5FG5A 4Q0OA 4TU4A 5CQ6A 3DAIA 4LZ2A 5EWWA 4A9LA 3U5MA 5EISA 5D3TA 5E0RA 3G0LA 5ENGA 5FE6A 5FG6A 5FH8A 4A9NA 4YABA 1X0JA 5COIA 5BT4A 5K29A 5FE7A 5I83A 3JVJA 4QSUA 4Z93A 4UIXA 4KCXA 2DVVA 4ALHA 5FE2A 5KO4A 4TZ2A 4ZQLA 5E9YA 3UV4A 5J0DA 5E9IA 5FE4A 5D25A 4C67A 4UYFB 5I1QA 4N3WA 4PS5A 5HRVA 1N72A 2E7NA 4O7BA 4A9OA 4NS5A 3O34A 4N4HA 3U5PA 3O37A 5FFYA 4QUUA 5EA1A 3P1FA 4IOOA 4ALGA 4QYLA 5E7DA 5CUCA 3SVFA 3MXFA 5EWCA 3MB3A 1F68A 4N4GA 5DKHA 2R0SA 5I7YA 2F6JA 2YEMA 5DYAA 5EWHA 5EQ1A 4CUTA 5DFCA 3RCWA 5AMEA 4CURA 5DW1A 5E74A 5EGUA 2YEKA 5LJ2A 4Z6HA 5G4RA 2WP2A 4J0SA 4O72A 4QR4A 4MR5A 2MJVB 2E7OA 4NRCA 5JWMA 5I86A 5D3NA 5D3SA 4UYEA 4UIUA 5C85A 2L85A 4QNSA 4UIYA 4O70A 3LQIA 3GG3A 3U5JA 4N4FA 3S91A 5ENEA 4YY4A 4LZSA 3JVMA 4NR9A 3G0JA 4KV1A 5D3HA 4UIZA 3U5LA 4O76A 4CFLA 4QZSA 5HRWA 3AADA 5EI4A 5CP5A 4NRBA 5IGNA 5EVAA 5II2A 5DFDA 5LJ1A 3I3JA 2L84A 5ENIA 4UYGA 2R0VA 4YAXA 5ENFA 2D82A 2KTBB 4MEOA 5EICA 5C89A 5CRZA 2DKWA 5DBMA 5F1HA 4MR3A 5ENJA 4QC1A 5HCLA 5IG6A 5F5ZA 3UVXA 4TU6A 5LKZA 4QUTA 2OO1A 5FBXA 5C87A 5FB1A 4A9JA 4YBSA 4YYDA 2R0YA 4HXNA 5CQ8A 5F25A 5EPBA 5A81A 5EPSA 5HENA 4BW2A 3LJWA 5G4SA 5EPRA 4PY6A 4YY6A 5I29A 2I7KA 5CUEA 4Q0NA 2DVRA 4YH3A 5I88A 3U5OA 5CRMA 5EV9A 2E3KA 5F2PA 4YBTA 4E96A 4NYXA 5ETDA 4BHWA 5JI8A 3MUKA 3UVWA 4C66A 2DWWA 5CUGA 4LZRA 3S92A 4O7FA 3TLPA 2N9GA 4YYNA 4J0RA 5E73A 5E9VA 4UITA 2RS9B 4YATA 3ZYUA 4YYGA 4O77A 4LYIA 5FFWA 4A9IA 5CQ7A 4MEQA 4CUPA 4QSQA 5KTWA 2RNWA 5I89A 5D26A 4Y03A 3UW9A 5D7XA 2RFJA 5AD2A 4QY4A 4OUFA 5DYXA 4XUAA 4LYSA 4WHWA 5KU3A 5F3AA 4O7EA 5C4QA 3QZSA 2R10A 4Z6IA 5HLSA 4CLBA 2YW5A 5HFRA 4YC9A 2DATA 5LUUA 3QZVA 4YADA 4O7AA 3IU6A 5LVQA 4XY9A 4MR6A 4O71A 4HBVA 5CGPA 4WIVA 4HXMA 5F61A 5FH6A 4J3IA 5FFVA 4ZC9A 4PTBA 3HMFA 3O35A 3UVYA 4PCIA 5HELA 4HBWA 5F60A 5A5OA 4QC3A 1JSPB 5H1TA 2OSSA 3DWYA 4BW3A 4HXRA 3LQJA 4IR4A 5DYUA 4X2IA 4NR6A 5C8GA 4YYIA 4BJXA 4A9HA 5D0CA 4YH4A 4HXLA 5LJ0A 4LRGA 4A9KA 5A7CA 5F36A 4QBMA 4HBXA 2FSAA 5ETBA 4BW1A 4DONA 4IR3A 5ENBA 4QR5A 4QEWA 4NXJA 3P5OA 5A5QA 5E9MA 5E9LA 3Q2EA 5CS8A 3IU5A 4QEUA 4QSPA 5FG4A 4NQNA 4QSXA 5FE3A 4QSSA 1WUGA 2DVQA 4TTEA 3JVKA 5FE9A 4QB3A 5HM0A 4HXKA 4CL9A 3LXJA 4GPJA 5DFBA 5HQ5A 5D3LA 5FE5A 4O75A 4KV4A 4J1PA 5CUBA 5E3DA 2G4AA 5HJCA 2RI7A 4IR6A 4O78A 5FDZA 4NQMA 5LKUA 4YK0A 5I80A 4CUSA 5BT5A 4NYWA 5H1VA 4QR3A 3D7CA 4TT4A 3AQAA 4YYJA 5CZGA 3MQMA 5AD3A 4RVRA 4CUUA 4OGIA 5HQ6A 5D3PA 3SVGA 3Q2FA 4XUBA 5CUDA 5DLXA 5KTUA 2H60A 3NXBA 4MR4A 4HXPA 5F1LA 5KTXA 5EU1A 3O36A 4TT2A 5EM3A 4NUEA 4QYDA 5DY7A 4OGJA 2GRCA 5LKTA 4FLPA 4IORA 4TZ8A 5CFWA 5HRXA 2OUOA 4NR4A 5BT3A 1WUMA 5HFQA 4ZW1A 4O74A 4UYDA 3MULA 4XY8A 4AKNA 5FE8A 5EP7A 3U5NA 5D24A 5DW2A 1E6IA 5TCMA 3QZTA 5CQ5A 5H85A 5A82A 3O33A 5TB6A 5HQ7A 5EK9A 2NXBA 4YYMA 3SVHA 4YYHA 4A9MA 3P1CA 5DKDA 4MENA 5E9KA 4TS8A 4HBYA 4QSVA 5DYCA 4UIVA 4HXOA 4TYLA 5F63A 5L98A 3MB4A 5I40A 5CPEA 4Z1QA 5HEMA 4YYKA 2RNXA 1JM4B 2RO1A 5CQAA 5A85A 1ZS5A 5A5SA 1EQFA 4IOQA 3U5KA 2YDWA 5IGMA 5L8TA 4QEVA 3HMEA 3ONIA 4NUCA 4N4IA 4PKLA 5L8UA 3UV5A 4O7CA 5ENHA 5IGKA 5E3GA 5IBNA 5ENCA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5II1A 4QSTA 5IIDA 5LKXA 5FB0A 4NR7A 2RNYA 2YELA 2D9EA 2I8NA 4LDFA 4XYAA 5A5PA 5I7XA 4A9FA 5EWDA 2YQDA 4LYWA 4AKHA 3P1EA 3UVDA 4MEPA 5CQ3A 5A83A 5AMFA 3JVLA 2EJNA 4QSRA 3FKMX 4CFKA 4F3IA 5LVRA 4IR5A 5D3JA 3UV2A 4NUDA 4NYVA 4LC2A 5A5NA 5L99A 5CQTA 5FE0A 5CQ4A 5FE1A 5CTLA 2WP1A 4UYHA 4TT6A 3K2JA 4NRAA 2LSPB 5CY9A 5A5RA 3LQHA 2DVSA 5CUAA 4NR5A 4LR6A 5IGLA 5DLZA 3HMHA 5DX4A 4WHUA 5C7NA 4UYFA 5D3RA 4YBMA 4QSWA 4CUQA 2YYNA 5L97A 4NR8A 1ZKRA 5ACYA 4TQNA 5EWVA 5DKCA 4A9EA 4UIWA 2L5EA 5L96A 4HXSA 5FH7A 5H1UA 2F6NA 4BW4A 4AI6A 5F62A 3P1DA 5KHMA 4Z1SA 5CU8A 5FG5A 4Q0OA 4TU4A 5CQ6A 3DAIA 4LZ2A 5EWWA 4A9LA 3U5MA 5EISA 5D3TA 5E0RA 3G0LA 5ENGA 5FE6A 5FG6A 5FH8A 4A9NA 4YABA 1PUOA 1X0JA 5COIA 5BT4A 5K29A 5FE7A 5I83A 3JVJA 4QSUA 4Z93A 4UIXA 4KCXA 2DVVA 4ALHA 5FE2A 5KO4A 4TZ2A 4ZQLA 5E9YA 3UV4A 5J0DA 5E9IA 5FE4A 5D25A 4C67A 4UYFB 5I1QA 4N3WA 4PS5A 5HRVA 1N72A 2E7NA 4O7BA 4A9OA 4NS5A 3O34A 4N4HA 3U5PA 3O37A 5FFYA 4QUUA 5EA1A 3P1FA 4IOOA 4ALGA 4QYLA 5E7DA 5CUCA 3SVFA 3MXFA 5EWCA 3MB3A 1F68A 4N4GA 5DKHA 2R0SA 5I7YA 2F6JA 2YEMA 5DYAA 5EWHA 5EQ1A 4CUTA 5DFCA 3RCWA 5AMEA 4CURA 5DW1A 5E74A 5EGUA 2YEKA 5LJ2A 4Z6HA 5G4RA 2WP2A 4J0SA 4O72A 4QR4A 4MR5A 2MJVB 2E7OA 4NRCA 5JWMA 5I86A 5D3NA 5D3SA 4UYEA 4UIUA 5C85A 2L85A 4QNSA 4UIYA 4O70A 3LQIA 3GG3A 3U5JA 4N4FA 3S91A 5ENEA 4YY4A 4LZSA 3JVMA 4NR9A 3G0JA 4KV1A 5D3HA 4UIZA 3U5LA 4O76A 4CFLA 4QZSA 5HRWA 3AADA 5EI4A 5CP5A 4NRBA 5IGNA 5EVAA 5II2A 5DFDA 5LJ1A 3I3JA 2L84A 3D1BA 5ENIA 4UYGA 2R0VA 4YAXA 5ENFA 2D82A 2KTBB 4MEOA 5EICA 5C89A 5CRZA 2DKWA 5DBMA 5F1HA 4MR3A 5ENJA 4QC1A 5HCLA 5IG6A 5F5ZA 3UVXA 4TU6A 5LKZA 4QUTA 2OO1A 5FBXA 5C87A 5FB1A 4A9JA 4YBSA 4YYDA 2R0YA 4HXNA 5CQ8A 5F25A 5EPBA 5A81A 5EPSA 5HENA 4BW2A 3LJWA 5G4SA 5EPRA 4PY6A 4YY6A 5I29A 2I7KA 5CUEA 4Q0NA 2DVRA 4YH3A 5I88A 3U5OA 5CRMA 5EV9A 2E3KA 5F2PA 4YBTA 4E96A 4NYXA 5ETDA 4BHWA 5JI8A 3MUKA 3UVWA 4C66A 2DWWA 5CUGA 4LZRA 3S92A 4O7FA 3TLPA 2N9GA 4YYNA 4J0RA 5E73A 5E9VA 4UITA 2RS9B 4YATA 3ZYUA 4YYGA 4O77A 4LYIA 5FFWA 4A9IA 5CQ7A 4MEQA 4CUPA 4QSQA 5KTWA 2RNWA 5I89A 5D26A 4Y03A 3UW9A 5D7XA 2RFJA 5AD2A 4QY4A 4OUFA 5DYXA 4XUAA 4LYSA 4WHWA 5KU3A 5F3AA 4O7EA 5C4QA 3QZSA 2R10A 4Z6IA 5HLSA 4CLBA 2YW5A 5HFRA 4YC9A 2DATA 5LUUA 3QZVA 4YADA 4O7AA 3IU6A 5LVQA 4XY9A 4MR6A 4O71A 4HBVA 5CGPA 4WIVA 4HXMA 5F61A 5FH6A 4J3IA 5FFVA 4ZC9A 4PTBA 3HMFA 3O35A 3UVYA 4PCIA 5HELA 4HBWA 5F60A 5A5OA 4QC3A 1JSPB 3ERRA 5H1TA 2OSSA 3DWYA 4BW3A 4HXRA 3LQJA 4IR4A 5DYUA 4X2IA 4NR6A 5C8GA 4YYIA 4BJXA 4A9HA 5D0CA 4YH4A 4HXLA 5LJ0A 4LRGA 4A9KA 5A7CA 5F36A 4QBMA 4HBXA 2FSAA 5ETBA 4BW1A 4DONA 4IR3A 5ENBA 4QR5A 4QEWA 4NXJA 3P5OA 5A5QA 5E9MA 5E9LA 3Q2EA 5CS8A 3IU5A 4QEUA 4QSPA 5FG4A 4NQNA 4QSXA 5FE3A 4QSSA 1WUGA 2DVQA 4TTEA 3JVKA 5FE9A 4QB3A 5HM0A 4HXKA 4CL9A 3LXJA 4GPJA 5DFBA 5HQ5A 3VKHA 5D3LA 5FE5A 4O75A 4KV4A 4J1PA 5CUBA 3VKGA 5E3DA 2G4AA 5HJCA 2RI7A 4IR6A 4O78A 5FDZA 4NQMA 5LKUA 4YK0A 5I80A 4CUSA 5BT5A 4NYWA 5H1VA 4QR3A 3D7CA 4TT4A 3AQAA 4YYJA 5CZGA 3MQMA 5AD3A 4RVRA 4CUUA 4OGIA 5HQ6A 5D3PA 3SVGA 3Q2FA 4XUBA 5CUDA 5DLXA 5KTUA 2H60A 3NXBA 4MR4A 4HXPA 5F1LA 5KTXA 5EU1A 4AKIA 3O36A 4TT2A 5EM3A 4NUEA 4QYDA 5DY7A 4OGJA 2GRCA 5LKTA 4FLPA 4IORA 4TZ8A 5CFWA 5HRXA 2OUOA 4NR4A 5BT3A 1WUMA 5HFQA 4ZW1A 4O74A 4UYDA 3MULA 4XY8A 4AKNA 5FE8A 5EP7A 3U5NA 5D24A 5DW2A 1E6IA 3D1DA 5TCMA 3QZTA 5CQ5A 5H85A 5A82A 3O33A 5TB6A 5HQ7A 5EK9A 2NXBA 4YYMA 3SVHA 4YYHA 4A9MA 3P1CA 5DKDA 4MENA 5E9KA 4TS8A 4HBYA 4QSVA 5DYCA 4UIVA 4AKGA 4HXOA 4TYLA 5F63A 5L98A 3MB4A 5I40A 5CPEA 4Z1QA 5HEMA 4YYKA 2RNXA 1JM4B 2RO1A 5CQAA 5A85A 1ZS5A 5A5SA 1EQFA 4IOQA 3U5KA 2YDWA 5IGMA 5L8TA 4QEVA 3HMEA 3ONIA 4NUCA 4N4IA 4PKLA 5L8UA 3UV5A 4O7CA 5ENHA 5IGKA 5E3GA 5IBNA 5ENCA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5II1 A;  4QST A;  5IID A;  5LKX A;  5FB0 A;  4NR7 A;  2RNY A;  2YEL A;  2D9E A;  2I8N A;  4LDF A;  4XYA A;  5A5P A;  5I7X A;  4A9F A;  5EWD A;  2YQD A;  4LYW A;  3P1E A;  3UVD A;  4MEP A;  5CQ3 A;  5A83 A;  5AMF A;  3JVL A;  4QSR A;  3FKM X;  4CFK A;  4F3I A;  5LVR A;  4IR5 A;  5D3J A;  3UV2 A;  4NUD A;  4NYV A;  4LC2 A;  5A5N A;  5L99 A;  5CQT A;  5FE0 A;  5CQ4 A;  5FE1 A;  5CTL A;  2WP1 A;  4UYH A;  4TT6 A;  3K2J A;  4NRA A;  2LSP B;  5CY9 A;  5A5R A;  3LQH A;  2DVS A;  5CUA A;  4NR5 A;  4LR6 A;  5IGL A;  5DLZ A;  3HMH A;  5DX4 A;  4WHU A;  5C7N A;  4UYF A;  5D3R A;  4YBM A;  4QSW A;  4CUQ A;  2YYN A;  5L97 A;  4NR8 A;  5ACY A;  4TQN A;  5EWV A;  5DKC A;  4A9E A;  4UIW A;  2L5E A;  5L96 A;  4HXS A;  5FH7 A;  5H1U A;  2F6N A;  4BW4 A;  5F62 A;  3P1D A;  5KHM A;  4Z1S A;  5CU8 A;  5FG5 A;  4Q0O A;  4TU4 A;  5CQ6 A;  3DAI A;  4LZ2 A;  5EWW A;  4A9L A;  3U5M A;  5EIS A;  5D3T A;  5E0R A;  3G0L A;  5ENG A;  5FE6 A;  5FG6 A;  5FH8 A;  4A9N A;  4YAB A;  1X0J A;  5COI A;  5BT4 A;  5K29 A;  5FE7 A; 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