4CUQA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-2 n09594
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-2 N09594
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuqA00
4XY9A 5DLXA 5A5RA 4N4IA 5LKXA 5ENIA 1F68A 4IR3A 2MJVB 4QR4A 5CQTA 2GRCA 5I88A 5DYUA 4QSPA 5CUBA 3O34A 4Z1QA 5E0RA 4QR5A 4KV1A 5EPBA 5FG5A 5EU1A 5A5OA 5IIDA 3FKMX 3HMEA 4A9LA 5CPEA 5HJCA 5A7CA 5JI8A 5EQ1A 5II1A 4NYWA 4WHUA 5KTWA 4NUEA 4YYIA 2YELA 5D3TA 3JVLA 4QUTA 4O75A 3P1EA 5L97A 5EPRA 4HXOA 5LVQA 5E73A 2YYNA 5FH8A 3UVXA 5DFCA 5EWDA 4QBMA 4O74A 5CY9A 5DW2A 4YYHA 3Q2FA 4YBSA 5K29A 5G4RA 5A85A 3S91A 2RS9B 4UIUA 4N4HA 4QYLA 5E9YA 3O35A 5A5PA 5ENCA 5L96A 1EQFA 2G4AA 3DAIA 4CUPA 4CUUA 2D82A 4PCIA 4PKLA 3U5KA 4YBMA 2L84A 5CQ6A 5CQ8A 5KTXA 4QZSA 4Y03A 5A5NA 4MEPA 5LJ2A 5D3JA 5DFDA 5AD3A 5I83A 4TU4A 4J1PA 4A9HA 5D0CA 5EM3A 4XUAA 5A82A 5CQ4A 5FB0A 4RVRA 5BT5A 4NR7A 5CP5A 5D25A 4CUTA 4TS8A 3UVYA 5IBNA 5HQ6A 4QC1A 4ZQLA 5FB1A 3I3JA 4QY4A 4YY6A 5EWVA 4YYGA 3UVWA 5EA1A 5DLZA 4QNSA 4O7FA 5D3PA 5I86A 4A9FA 5EI4A 5CUAA 5EGUA 5TCMA 4GPJA 4F3IA 3JVKA 5HEMA 3AADA 3QZSA 5DBMA 3S92A 3K2JA 5F5ZA 4LC2A 5I80A 3UW9A 2OUOA 5HFRA 4A9KA 5DYAA 5F1LA 5LKTA 4YY4A 3Q2EA 4NR5A 4YADA 5CUEA 2L85A 2R0YA 2RO1A 5EP7A 5ENJA 3MB3A 4UYEA 4NS5A 3SVFA 4MR4A 5L99A 5DKCA 4OUFA 3P1FA 4O78A 5CGPA 2DKWA 5FE5A 4BHWA 3UV5A 1E6IA 3MB4A 4QSQA 3QZTA 2H60A 4QUUA 3UV4A 5D3LA 5FE6A 5FDZA 4HXRA 4IR6A 3RCWA 5F63A 4NRBA 3MUKA 4C67A 2F6NA 5DX4A 2YQDA 4QSXA 3JVJA 4CLBA 3LQHA 4NQNA 5CQ5A 5A81A 4UYGA 2YEMA 4NR9A 4PCEA 4OGJA 4QSUA 4KV4A 1X0JA 5H1TA 3U5JA 5A5SA 5JWMA 5C85A 5E3DA 5LJ0A 4NUCA 5FFWA 5KO4A 5KTUA 4Q0OA 2YEKA 5ENEA 5DW1A 5HQ7A 5DYXA 4TTEA 4CUQA 2RNYA 3MXFA 4Z6IA 5E9LA 2FSAA 3O33A 5IGLA 4YYNA 4LR6A 3P1CA 5ENGA 5DYCA 5LJ1A 4XUBA 5AMFA 3DWYA 4QB3A 4A9MA 4QSRA 5CFWA 4IORA 4ALHA 3LQJA 4FLPA 4IR5A 2DVQA 4TYLA 5C87A 5HELA 4Q0NA 5EWHA 5I40A 2DVVA 5DKHA 5TB6A 5D3RA 5F36A 5ENBA 2YDWA 4HXSA 5FE7A 1WUGA 3IU5A 5I1QA 4A9NA 5CUCA 4YC9A 2WP1A 4N4GA 1N72A 2WP2A 4YYJA 5DFBA 5EV9A 5ETDA 3SVGA 5D24A 4LYIA 4NYXA 2L5EA 5E9MA 5D26A 4BW3A 5E9IA 4LRGA 5AD2A 4YYDA 5HCLA 3UVDA 4IOQA 2R0SA 2OO1A 4CFKA 5F25A 5BT3A 5LUUA 5E7DA 4CFLA 2D9EA 5FG6A 4WHWA 4O7CA 5FE1A 2RNWA 4Z93A 4QSWA 5FE4A 3LXJA 4ALGA 3GG3A 4J0SA 4TT6A 5C4QA 5HFQA 4A9OA 2LSPB 4NR6A 3LJWA 2I8NA 1WUMA 5FE0A 4A9EA 4O71A 4KCXA 4UIZA 5EVAA 2DATA 2DWWA 5E9KA 5KU3A 5COIA 4YH3A 3LQIA 3QZVA 4BW4A 5H1VA 5CU8A 5CQ7A 4UYFA 1ZS5A 2DVRA 3ZYUA 5IGKA 5D3SA 5II2A 5FE8A 5I7XA 5HRWA 5E3GA 2KTBB 4A9IA 5L8UA 4NRAA 4E96A 5AMEA 4HXLA 4HBXA 2YW5A 4TT2A 3U5OA 3D7CA 5BT4A 4LZSA 5HRXA 4UYDA 3O36A 2R10A 4NQMA 4QSTA 4HXPA 4QYDA 4WIVA 5A5QA 5I7YA 3U5MA 3SVHA 4NXJA 5CRMA 3G0LA 4IR4A 5HQ5A 3P1DA 4QSVA 5D7XA 2RFJA 4LYWA 5CQAA 4NR4A 4Z1SA 4ZW1A 4UIXA 4X2IA 5F62A 4YYMA 4NUDA 4QEUA 4NYVA 3MQMA 1JM4B 3TLPA 5FE9A 2E3KA 5ETBA 4MEQA 4UIVA 5FG4A 5D3HA 5C7NA 4LYSA 5CZGA 5FH6A 4QEWA 5FE3A 4UYHA 5DKDA 4UYFB 2F6JA 5DY7A 4QEVA 3IU6A 4XYAA 5L8TA 4LZ2A 5CUGA 4HXKA 4MR3A 4UIYA 5EPSA 5F61A 4A9JA 4YBTA 5J0DA 4O76A 4NRCA 3NXBA 4BW2A 4O70A 5EISA 3ONIA 4QC3A 2RI7A 5I89A 5F1HA 5HM0A 4UITA 4YK0A 2E7OA 5ACYA 5CRZA 5ENHA 4CUSA 4HXNA 4MENA 3UV2A 4DONA 5CS8A 3U5NA 4QR3A 5H1UA 5L98A 4XY8A 4Z6HA 4O72A 5LKZA 3O37A 4TU6A 5HLSA 5HENA 5IGMA 5E9VA 5CTLA 2DVSA 4MEOA 5EICA 4BW1A 5A83A 2NXBA 5FFYA 5F2PA 5G4SA 4BJXA 4YABA 1JSPB 5FE2A 4N3WA 5HRVA 4LDFA 3MULA 4O77A 4UIWA 5EK9A 4NR8A 5FH7A 5F60A 3JVMA 4O7AA 4TQNA 3U5PA 4N4FA 4PTBA 2R0VA 4LZRA 4HBWA 4MR6A 5FBXA 5H85A 5KHMA 4OGIA 4CURA 4HBYA 5IG6A 4HBVA 4TZ8A 3HMFA 5C89A 5LKUA 4HXMA 4PY6A 4QSSA 4CL9A 5D3NA 4IOOA 4O7BA 4O7EA 2OSSA 3U5LA 4ZC9A 4AKNA 4MR5A 4J0RA 5CQ3A 4TZ2A 5C8GA 5ENFA 3HMHA 2I7KA 4TT4A 4YH4A 2RNXA 2E7NA 5I29A 3P5OA 5CUDA 5E74A 5F3AA 5LVRA 3G0JA 4C66A 4YATA 5EWWA 3AQAA 4PS5A 4J3IA 5IGNA 4YYKA 5EWCA 4YAXA 5FFVA 2N9GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XY9A 5DLXA 5A5RA 4N4IA 5LKXA 5ENIA 1F68A 4IR3A 2MJVB 4QR4A 5CQTA 2GRCA 5I88A 5DYUA 4QSPA 5CUBA 3O34A 4Z1QA 5E0RA 4QR5A 4KV1A 5EPBA 5FG5A 5EU1A 5A5OA 5IIDA 3FKMX 3HMEA 4A9LA 5CPEA 5HJCA 5A7CA 5JI8A 5EQ1A 5II1A 4NYWA 4WHUA 5KTWA 4NUEA 4YYIA 2YELA 5D3TA 3JVLA 3D1DA 4QUTA 4O75A 3P1EA 5L97A 5EPRA 4HXOA 5LVQA 5E73A 2YYNA 5FH8A 3UVXA 5DFCA 5EWDA 4QBMA 4O74A 5CY9A 5DW2A 4YYHA 3Q2FA 4YBSA 5K29A 5G4RA 5A85A 3S91A 2RS9B 4UIUA 4N4HA 4QYLA 5E9YA 3O35A 5A5PA 5ENCA 5L96A 1EQFA 2G4AA 3DAIA 4CUPA 4CUUA 2D82A 4PCIA 4PKLA 3U5KA 4YBMA 2L84A 5CQ6A 5CQ8A 5KTXA 4QZSA 4Y03A 5A5NA 4MEPA 5LJ2A 5D3JA 5DFDA 5AD3A 5I83A 4TU4A 4J1PA 4A9HA 5D0CA 5EM3A 4XUAA 5A82A 4AKIA 5CQ4A 5FB0A 4RVRA 5BT5A 4NR7A 5CP5A 5D25A 4CUTA 4TS8A 3UVYA 5IBNA 5HQ6A 4QC1A 4ZQLA 5FB1A 3I3JA 4QY4A 4YY6A 5EWVA 4YYGA 3UVWA 5EA1A 5DLZA 4QNSA 4O7FA 5D3PA 5I86A 4A9FA 5EI4A 5CUAA 5EGUA 5TCMA 4GPJA 4F3IA 3JVKA 5HEMA 3AADA 3QZSA 5DBMA 3S92A 3K2JA 5F5ZA 4LC2A 5I80A 3UW9A 2OUOA 5HFRA 4A9KA 5DYAA 5F1LA 5LKTA 4YY4A 3Q2EA 1ZKRA 4NR5A 4YADA 5CUEA 2L85A 2R0YA 2RO1A 5EP7A 5ENJA 3MB3A 4UYEA 4NS5A 3SVFA 4MR4A 5L99A 5DKCA 4OUFA 3P1FA 4O78A 5CGPA 2DKWA 5FE5A 4BHWA 3UV5A 1E6IA 3MB4A 4QSQA 3QZTA 2H60A 4QUUA 3UV4A 5D3LA 5FE6A 5FDZA 4HXRA 4IR6A 3RCWA 5F63A 4NRBA 3MUKA 4C67A 2F6NA 5DX4A 2YQDA 4QSXA 3JVJA 4CLBA 3LQHA 4NQNA 5CQ5A 5A81A 4UYGA 2YEMA 4NR9A 4PCEA 4OGJA 4QSUA 4KV4A 1X0JA 5H1TA 3U5JA 5A5SA 5JWMA 5C85A 5E3DA 5LJ0A 4NUCA 5FFWA 5KO4A 5KTUA 4Q0OA 2YEKA 5ENEA 5DW1A 5HQ7A 5DYXA 4TTEA 4CUQA 2RNYA 3MXFA 4Z6IA 5E9LA 2FSAA 3O33A 5IGLA 4YYNA 4LR6A 3P1CA 5ENGA 5DYCA 5LJ1A 4XUBA 5AMFA 3DWYA 4QB3A 4A9MA 4QSRA 5CFWA 4IORA 4ALHA 3LQJA 4FLPA 4IR5A 2DVQA 4TYLA 5C87A 5HELA 4Q0NA 5EWHA 5I40A 2DVVA 5DKHA 5TB6A 5D3RA 5F36A 2EJNA 5ENBA 2YDWA 4HXSA 5FE7A 1WUGA 3IU5A 5I1QA 4A9NA 5CUCA 4YC9A 2WP1A 4N4GA 4AKGA 1N72A 2WP2A 4YYJA 5DFBA 5EV9A 5ETDA 3SVGA 5D24A 4LYIA 4NYXA 2L5EA 5E9MA 5D26A 4BW3A 5E9IA 4LRGA 5AD2A 4YYDA 5HCLA 3UVDA 4IOQA 2R0SA 2OO1A 4CFKA 5F25A 5BT3A 5LUUA 5E7DA 4CFLA 2D9EA 5FG6A 4WHWA 4O7CA 5FE1A 2RNWA 4Z93A 4QSWA 5FE4A 3LXJA 4ALGA 3GG3A 3ERRA 4J0SA 4TT6A 5C4QA 5HFQA 4A9OA 2LSPB 4NR6A 3LJWA 2I8NA 1WUMA 5FE0A 4A9EA 4O71A 4KCXA 4UIZA 5EVAA 2DATA 2DWWA 5E9KA 5KU3A 5COIA 4YH3A 3LQIA 3QZVA 4BW4A 5H1VA 5CU8A 5CQ7A 4UYFA 1ZS5A 2DVRA 3ZYUA 5IGKA 5D3SA 5II2A 5FE8A 5I7XA 4AI6A 5HRWA 5E3GA 2KTBB 4A9IA 5L8UA 4NRAA 4E96A 5AMEA 4HXLA 4HBXA 2YW5A 4TT2A 3U5OA 3D7CA 5BT4A 4LZSA 5HRXA 4UYDA 3O36A 2R10A 4NQMA 4QSTA 4HXPA 4QYDA 4WIVA 5A5QA 5I7YA 3U5MA 3SVHA 4NXJA 5CRMA 3G0LA 4IR4A 5HQ5A 3P1DA 4QSVA 5D7XA 3D1BA 2RFJA 4LYWA 5CQAA 4NR4A 4Z1SA 4ZW1A 4UIXA 4X2IA 5F62A 4YYMA 4NUDA 4QEUA 4NYVA 3MQMA 1JM4B 3TLPA 5FE9A 2E3KA 5ETBA 4MEQA 4UIVA 5FG4A 5D3HA 5C7NA 4LYSA 5CZGA 5FH6A 4QEWA 5FE3A 4UYHA 5DKDA 4UYFB 2F6JA 3VKHA 5DY7A 4QEVA 3IU6A 4XYAA 5L8TA 4AKHA 4LZ2A 5CUGA 4HXKA 4MR3A 4UIYA 5EPSA 5F61A 4A9JA 4YBTA 5J0DA 4O76A 4NRCA 3NXBA 4BW2A 4O70A 5EISA 3ONIA 4QC3A 2RI7A 5I89A 5F1HA 5HM0A 4UITA 4YK0A 2E7OA 5ACYA 5CRZA 5ENHA 4CUSA 4HXNA 4MENA 3UV2A 4DONA 5CS8A 3U5NA 4QR3A 5H1UA 5L98A 4XY8A 4Z6HA 4O72A 5LKZA 3O37A 4TU6A 5HLSA 5HENA 5IGMA 5E9VA 5CTLA 2DVSA 4MEOA 5EICA 4BW1A 5A83A 2NXBA 5FFYA 5F2PA 5G4SA 4BJXA 4YABA 1JSPB 5FE2A 4N3WA 5HRVA 4LDFA 3MULA 4O77A 4UIWA 5EK9A 4NR8A 5FH7A 5F60A 3JVMA 4O7AA 4TQNA 3U5PA 4N4FA 4PTBA 1PUOA 2R0VA 4LZRA 4HBWA 4MR6A 5FBXA 5H85A 5KHMA 4OGIA 4CURA 4HBYA 5IG6A 4HBVA 4TZ8A 3HMFA 5C89A 5LKUA 3VKGA 4HXMA 4PY6A 4QSSA 4CL9A 5D3NA 4IOOA 4O7BA 4O7EA 2OSSA 3U5LA 4ZC9A 4AKNA 4MR5A 4J0RA 5CQ3A 4TZ2A 5C8GA 5ENFA 3HMHA 2I7KA 4TT4A 4YH4A 2RNXA 2E7NA 5I29A 3P5OA 5CUDA 5E74A 5F3AA 5LVRA 3G0JA 4C66A 4YATA 5EWWA 3AQAA 4PS5A 4J3IA 5IGNA 4YYKA 5EWCA 4YAXA 5FFVA 2N9GA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XY9 A;  5DLX A;  5A5R A;  4N4I A;  5LKX A;  5ENI A;  1F68 A;  4IR3 A;  2MJV B;  4QR4 A;  5CQT A;  2GRC A;  5I88 A;  5DYU A;  4QSP A;  5CUB A;  3O34 A;  4Z1Q A;  5E0R A;  4QR5 A;  4KV1 A;  5EPB A;  5FG5 A;  5EU1 A;  5A5O A;  5IID A;  3FKM X;  3HME A;  4A9L A;  5CPE A;  5HJC A;  5A7C A;  5JI8 A;  5EQ1 A;  5II1 A;  4NYW A;  4WHU A;  5KTW A;  4NUE A;  4YYI A;  2YEL A;  5D3T A;  3JVL A;  4QUT A;  4O75 A;  3P1E A;  5L97 A;  5EPR A;  4HXO A;  5LVQ A;  5E73 A;  2YYN A;  5FH8 A;  3UVX A;  5DFC A;  5EWD A;  4QBM A;  4O74 A;  5CY9 A;  5DW2 A;  4YYH A;  3Q2F A;  4YBS A;  5K29 A;  5G4R A;  5A85 A;  3S91 A;  2RS9 B;  4UIU A;  4N4H A;  4QYL A;  5E9Y A;  3O35 A;  5A5P A;  5ENC A;  5L96 A;  1EQF A;  2G4A A;  3DAI A;  4CUP A;  4CUU A;  2D82 A;  4PCI A;  4PKL A;  3U5K A;  4YBM A;  2L84 A;  5CQ6 A;  5CQ8 A;  5KTX A;  4QZS A;  4Y03 A;  5A5N A;  4MEP A;  5LJ2 A;  5D3J A;  5DFD A;  5AD3 A;  5I83 A;  4TU4 A;  4J1P A;  4A9H A;  5D0C A;  5EM3 A;  4XUA A;  5A82 A;  5CQ4 A;  5FB0 A;  4RVR A;  5BT5 A;  4NR7 A;  5CP5 A; 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