4HXMA

Brd4 bromodomain 1 complex with n-{3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)-5-[(thiophen-2-ylsulfonyl)amino]phenyl}butanamide inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxmA01
5I83A 2E7OA 5CRZA 4Z6IA 5A5SA 4BJXA 4QEVA 4YABA 4NRBA 5F5ZA 5BT3A 4A9IA 5CS8A 4LZSA 5ENEA 2MJVB 2DVQA 5JWMA 5D3HA 5EWVA 1ZS5A 2DKWA 5LJ0A 1N72A 5EGUA 2L5EA 4GPJA 2G4AA 4Z1QA 4O7CA 5FE3A 4PS5A 5CUEA 2L85A 5BT4A 5ETDA 5D3NA 3I3JA 5DKDA 4YY4A 4BW2A 4HBXA 4UYFB 5CTLA 4YATA 4Z93A 2DATA 2R0YA 2OSSA 5HFQA 5FFYA 4KV4A 3U5LA 4LR6A 2D82A 2RNYA 4UIXA 2R10A 4LYSA 5FE4A 3DWYA 1JM4B 4HBVA 5EI4A 2YW5A 3GG3A 5AMEA 5F60A 2R0SA 4TTEA 4YYDA 3UV4A 5AD3A 4O77A 4QR3A 5DYXA 3P1FA 2D9EA 4ALHA 5LJ2A 5D3LA 2RO1A 2YEKA 4UIUA 5A7CA 4NR9A 5I89A 2OO1A 5IIDA 4UIWA 2E3KA 2RNWA 4NQNA 5DBMA 3MXFA 5CUAA 4QSXA 5FFWA 4A9NA 5ACYA 5A85A 3S92A 5FH7A 4N3WA 2DVSA 4E96A 4OUFA 4QYLA 5FFVA 3U5MA 4NUCA 5C87A 3O34A 5F2PA 4QSRA 5I86A 5CU8A 4ZC9A 5FE8A 3LXJA 2YDWA 4QEWA 4QUTA 5DKHA 5D7XA 4DONA 4YBSA 4HXSA 2R0VA 5DLZA 4QSQA 4TZ2A 5FE5A 5CQ5A 4NYVA 5HQ6A 5DKCA 5E3DA 1E6IA 4OGJA 4YYIA 3D7CA 4WIVA 5L99A 4O72A 4CUUA 4MR5A 4CUQA 4J0SA 4ALGA 4NYXA 5FG5A 3UVYA 3IU5A 5K29A 3ONIA 4PCIA 4LDFA 3UVDA 5AMFA 5ETBA 4MR4A 4QSVA 5E7DA 5A5QA 5DW2A 4UYHA 4YYKA 4O70A 5A5RA 4J3IA 4TZ8A 4X2IA 5D3SA 5EM3A 5EISA 5FH6A 4CUTA 4NR7A 4KV1A 5J0DA 5CRMA 5DYAA 4YADA 4KCXA 4O7FA 4XY8A 5IG6A 4HXPA 5HELA 5HENA 5HRXA 3AADA 4MEPA 5TB6A 3LQJA 4YBTA 5F61A 4UITA 2YYNA 4PKLA 3HMFA 2RS9B 3QZSA 5ENJA 5ENCA 5CQAA 5II1A 4QSSA 2WP1A 5D25A 3U5JA 2H60A 5D3JA 3UVXA 5CP5A 5ENHA 2WP2A 4A9JA 5E9LA 5LJ1A 5LVQA 5II2A 3G0LA 4MR6A 4LZRA 5FDZA 4C67A 3HMEA 4QY4A 5ENIA 2RFJA 4NRAA 5A82A 5EQ1A 5F1HA 4UYGA 5CUBA 5EA1A 4BW1A 2RI7A 2FSAA 5FE1A 4YYHA 3K2JA 3HMHA 5C89A 4TT6A 5HEMA 4CUSA 2YELA 4QR4A 5EVAA 5CQ6A 5E74A 4QEUA 5EWWA 3UV5A 5HLSA 4QSWA 5F36A 2L84A 2N9GA 4QSPA 5D24A 5EPBA 4Z1SA 5D26A 4HBWA 5HFRA 5E9IA 5E9KA 4A9OA 4IR5A 4PTBA 4HXRA 5CY9A 4LC2A 5HCLA 5A81A 5FH8A 3MQMA 5KU3A 4UIYA 4IR6A 5IGNA 5CQ7A 4O7AA 3SVHA 5L96A 5FE0A 4QZSA 4XYAA 5CZGA 3FKMX 4YK0A 3QZTA 4QNSA 5CUDA 5IGLA 3LQIA 2KTBB 4LYIA 5D0CA 5D3RA 5LUUA 3O37A 5H1UA 5E9YA 4NRCA 4YBMA 3P5OA 4CURA 4BW3A 5BT5A 4IOOA 5DLXA 4Y03A 5H1VA 5G4SA 5DYUA 4TU4A 5EWDA 5DFBA 5EICA 4QYDA 5H85A 5IBNA 2LSPB 5A83A 3U5NA 5I29A 4OGIA 5CUCA 5HRWA 3QZVA 4O75A 4YH4A 5HQ7A 3UV2A 4ZQLA 5FG6A 5CPEA 5F1LA 4YH3A 3TLPA 5LKTA 5EP7A 3MB3A 3MULA 4O76A 4UYDA 4Q0NA 4QR5A 5FB1A 4F3IA 5DYCA 4O78A 5FE9A 5CQ3A 4A9LA 5IGKA 3U5KA 4IORA 3U5PA 4QC3A 5HM0A 5LKZA 2DVRA 5D3TA 4YC9A 4YYGA 4BW4A 2YEMA 5G4RA 4YY6A 5EK9A 4N4FA 4Z6HA 4XUAA 5EPSA 1EQFA 5E9MA 4CUPA 4LYWA 5F25A 5F3AA 4QC1A 4HXLA 4YYNA 3Q2EA 4XUBA 4QB3A 4CL9A 4TQNA 4J1PA 4CFKA 4YYJA 5EWCA 5ENBA 4NUEA 5HJCA 1X0JA 2I7KA 3AQAA 4UIZA 5EWHA 3S91A 4CFLA 4PCEA 5E9VA 4HXNA 3UVWA 4IR4A 4NR5A 4ZW1A 3JVKA 4LRGA 4O7BA 5F63A 3P1CA 3DAIA 4IOQA 5DFDA 3MB4A 1F68A 5C4QA 5L8UA 5DX4A 4NXJA 4A9HA 5L97A 5LKXA 4NR4A 5L8TA 4UIVA 5FE6A 5E0RA 5FB0A 5KTWA 5FE7A 4QUUA 5L98A 5COIA 4WHUA 4MEOA 4MENA 4PY6A 4TT4A 2DWWA 5I7YA 2E7NA 3P1DA 5E73A 4A9KA 5CQTA 4HXKA 4O71A 3O35A 3UW9A 2F6JA 3O36A 5ENFA 5IGMA 3NXBA 4N4IA 5EV9A 5CGPA 5I40A 3IU6A 4N4GA 5DY7A 5KTUA 1WUMA 4AKNA 5TCMA 3ZYUA 5KO4A 3O33A 5E3GA 4TS8A 4C66A 5C7NA 4QSUA 4QSTA 4TT2A 5I88A 2NXBA 5HRVA 5A5OA 3SVGA 5HQ5A 4NQMA 4A9EA 4QBMA 4YAXA 4MEQA 4NR6A 4HXMA 4XY9A 5D3PA 5ENGA 3P1EA 5LKUA 3SVFA 5I7XA 5C85A 4HXOA 5C8GA 5JI8A 5KTXA 2GRCA 4CLBA 3U5OA 4NYWA 4UYEA 3JVJA 4TYLA 5I1QA 4IR3A 5EU1A 4LZ2A 3G0JA 4NUDA 5AD2A 5KHMA 4BHWA 5A5NA 2RNXA 5CUGA 4A9MA 2I8NA 4FLPA 5CFWA 5DFCA 4HBYA 5FG4A 1JSPB 4N4HA 4TU6A 5I80A 2DVVA 4A9FA 3JVMA 2F6NA 3MUKA 4UYFA 4J0RA 4NR8A 4MR3A 4Q0OA 5F62A 4YYMA 5A5PA 5LVRA 4RVRA 3LQHA 3RCWA 5CQ4A 4O74A 1WUGA 5DW1A 4WHWA 3JVLA 4O7EA 5FBXA 5CQ8A 3Q2FA 2OUOA 3LJWA 5FE2A 2YQDA 4NS5A 5H1TA 5EPRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I83A 2E7OA 5CRZA 4Z6IA 5A5SA 4BJXA 4QEVA 4YABA 4NRBA 5F5ZA 5BT3A 4A9IA 5CS8A 4LZSA 5ENEA 2MJVB 2DVQA 5JWMA 5D3HA 5EWVA 1ZS5A 2DKWA 5LJ0A 1N72A 5EGUA 2L5EA 4GPJA 2G4AA 4Z1QA 4O7CA 5FE3A 4PS5A 5CUEA 2L85A 5BT4A 5ETDA 4AKGA 5D3NA 3I3JA 5DKDA 4YY4A 4BW2A 4HBXA 4UYFB 5CTLA 4YATA 4Z93A 2DATA 2R0YA 2OSSA 5HFQA 5FFYA 4KV4A 3U5LA 4LR6A 2D82A 2RNYA 4UIXA 2R10A 4LYSA 5FE4A 3DWYA 1JM4B 4HBVA 5EI4A 2YW5A 3GG3A 5AMEA 5F60A 2R0SA 4TTEA 4YYDA 3UV4A 5AD3A 4O77A 4QR3A 5DYXA 3P1FA 2D9EA 4ALHA 5LJ2A 5D3LA 2RO1A 2YEKA 3ERRA 4UIUA 4NR9A 5A7CA 5I89A 2OO1A 5IIDA 4UIWA 2E3KA 2RNWA 4NQNA 5DBMA 3MXFA 5CUAA 4QSXA 5FFWA 4A9NA 5ACYA 1PUOA 5A85A 3S92A 5FH7A 4N3WA 2DVSA 4E96A 4OUFA 4QYLA 5FFVA 3U5MA 4NUCA 5C87A 3O34A 5F2PA 4QSRA 5I86A 5CU8A 4ZC9A 5FE8A 3LXJA 2YDWA 4QEWA 4QUTA 5DKHA 5D7XA 4DONA 4YBSA 4HXSA 3D1BA 2R0VA 5DLZA 4QSQA 4TZ2A 5FE5A 5CQ5A 4NYVA 5HQ6A 5DKCA 5E3DA 1E6IA 4OGJA 4YYIA 3D7CA 4WIVA 5L99A 4O72A 4CUUA 4MR5A 4CUQA 4J0SA 4ALGA 4NYXA 5FG5A 3UVYA 3IU5A 5K29A 3ONIA 4PCIA 4LDFA 3UVDA 5AMFA 5ETBA 4MR4A 4QSVA 5E7DA 5A5QA 5DW2A 4UYHA 4YYKA 4O70A 5A5RA 4J3IA 4TZ8A 4X2IA 5D3SA 5EM3A 5EISA 5FH6A 4CUTA 4NR7A 4KV1A 5J0DA 5CRMA 5DYAA 4YADA 4KCXA 4O7FA 4XY8A 5IG6A 4HXPA 5HELA 5HENA 5HRXA 3AADA 4MEPA 5TB6A 3LQJA 4YBTA 5F61A 4UITA 2YYNA 4PKLA 3HMFA 2RS9B 3QZSA 5ENJA 5ENCA 5CQAA 5II1A 4QSSA 2WP1A 5D25A 3U5JA 2H60A 5D3JA 3UVXA 5CP5A 5ENHA 2WP2A 4A9JA 5E9LA 5LJ1A 5LVQA 5II2A 3G0LA 4MR6A 4LZRA 5FDZA 4C67A 3HMEA 4QY4A 5ENIA 2RFJA 4NRAA 5A82A 5EQ1A 5F1HA 4UYGA 5CUBA 5EA1A 4BW1A 2RI7A 2FSAA 5FE1A 4AKHA 4YYHA 3K2JA 3HMHA 5C89A 4TT6A 5HEMA 4CUSA 2YELA 4QR4A 5EVAA 5CQ6A 5E74A 4QEUA 5EWWA 3UV5A 5HLSA 4QSWA 5F36A 2L84A 2N9GA 4QSPA 5D24A 5EPBA 4Z1SA 5D26A 4HBWA 5HFRA 5E9IA 5E9KA 4A9OA 4IR5A 4PTBA 4HXRA 5CY9A 4LC2A 5HCLA 5A81A 5FH8A 3MQMA 5KU3A 4UIYA 4IR6A 5IGNA 5CQ7A 4O7AA 3SVHA 5L96A 5FE0A 4QZSA 4XYAA 5CZGA 3FKMX 4YK0A 3QZTA 4QNSA 5CUDA 5IGLA 3LQIA 2KTBB 4LYIA 5D0CA 5D3RA 5LUUA 3O37A 5H1UA 5E9YA 4NRCA 4YBMA 3P5OA 4CURA 4BW3A 5BT5A 4IOOA 5DLXA 4Y03A 5H1VA 5G4SA 5DYUA 4TU4A 5EWDA 5DFBA 5EICA 4QYDA 5H85A 5IBNA 2LSPB 5A83A 3U5NA 5I29A 4OGIA 5CUCA 5HRWA 3QZVA 4O75A 4YH4A 5HQ7A 3UV2A 4ZQLA 5FG6A 5CPEA 5F1LA 4YH3A 3TLPA 5LKTA 5EP7A 3MB3A 3MULA 4O76A 4UYDA 4Q0NA 4QR5A 5FB1A 4F3IA 5DYCA 4O78A 5FE9A 5CQ3A 4A9LA 5IGKA 3U5KA 4IORA 3U5PA 4QC3A 5HM0A 5LKZA 2DVRA 5D3TA 4YC9A 4YYGA 4BW4A 2YEMA 5G4RA 4YY6A 5EK9A 4N4FA 4Z6HA 4XUAA 5EPSA 1EQFA 5E9MA 4CUPA 4LYWA 5F25A 5F3AA 4QC1A 4HXLA 4YYNA 3Q2EA 4XUBA 4QB3A 4CL9A 4TQNA 4J1PA 4CFKA 4YYJA 5EWCA 5ENBA 3VKGA 4NUEA 5HJCA 1X0JA 2I7KA 3AQAA 4UIZA 5EWHA 3S91A 4CFLA 4PCEA 5E9VA 4HXNA 3UVWA 4IR4A 4NR5A 4ZW1A 3JVKA 4LRGA 4O7BA 5F63A 3P1CA 3DAIA 4IOQA 5DFDA 3MB4A 1F68A 5C4QA 5L8UA 5DX4A 4AKIA 4NXJA 4A9HA 5L97A 5LKXA 4NR4A 5L8TA 4UIVA 5FE6A 5E0RA 5FB0A 5KTWA 5FE7A 4QUUA 5L98A 5COIA 4WHUA 4MEOA 4MENA 4PY6A 4TT4A 1ZKRA 2DWWA 5I7YA 2E7NA 3P1DA 5E73A 4A9KA 5CQTA 4HXKA 4O71A 3O35A 3UW9A 2F6JA 3O36A 5ENFA 5IGMA 3NXBA 4N4IA 5EV9A 5CGPA 4AI6A 5I40A 2EJNA 3IU6A 4N4GA 5DY7A 5KTUA 1WUMA 4AKNA 5TCMA 3ZYUA 5KO4A 3O33A 5E3GA 4TS8A 4C66A 5C7NA 4QSUA 4QSTA 4TT2A 5I88A 2NXBA 5HRVA 5A5OA 3SVGA 5HQ5A 4NQMA 4A9EA 4QBMA 4YAXA 4MEQA 4NR6A 4HXMA 4XY9A 5D3PA 5ENGA 3P1EA 5LKUA 3SVFA 5I7XA 5C85A 4HXOA 5C8GA 5JI8A 5KTXA 2GRCA 4CLBA 3U5OA 4NYWA 4UYEA 3JVJA 4TYLA 5I1QA 4IR3A 5EU1A 4LZ2A 3G0JA 4NUDA 5AD2A 5KHMA 4BHWA 5A5NA 2RNXA 5CUGA 4A9MA 2I8NA 4FLPA 5CFWA 5DFCA 4HBYA 5FG4A 1JSPB 4N4HA 4TU6A 5I80A 2DVVA 4A9FA 3JVMA 2F6NA 3MUKA 4UYFA 4J0RA 4NR8A 4MR3A 4Q0OA 5F62A 4YYMA 5A5PA 5LVRA 4RVRA 3LQHA 3RCWA 5CQ4A 4O74A 1WUGA 3VKHA 3D1DA 5DW1A 4WHWA 3JVLA 4O7EA 5FBXA 5CQ8A 3Q2FA 2OUOA 3LJWA 5FE2A 2YQDA 4NS5A 5H1TA 5EPRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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