2DWWA

Crystal structure of bromodomain-containing protein 4
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
KSSKISEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLESREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
publication title Crystal structure of Bromodomain-containing protein 4
rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 30
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2dwwA00
2DKWA 5C8GA 4HBXA 5H85A 4LZRA 2L84A 5FE4A 4C66A 5EGUA 4A9EA 2F6JA 1WUMA 3LJWA 5ENHA 4HXNA 5E9MA 5G4RA 4UIYA 5A85A 4CUUA 5CQ7A 5CZGA 4MEPA 3UW9A 3JVMA 5E74A 3U5LA 5AD3A 5EA1A 5E9IA 5F36A 4YY6A 5DW2A 2DVVA 5AMFA 4OUFA 3G0LA 4QYLA 4TU6A 5DLZA 5DKCA 4UYHA 4HBVA 5D0CA 4LR6A 5I86A 5IG6A 3LQHA 3P1FA 5DY7A 4IR5A 4YY4A 4CUPA 4Z6IA 4O7EA 4QY4A 2WP2A 5ENEA 2MJVB 2F6NA 4MR4A 5CUDA 5A5NA 4LZ2A 3HMHA 5HM0A 5I88A 4A9JA 3LQJA 4MR6A 5F2PA 4WHWA 4E96A 4MENA 4PY6A 4NYWA 3U5JA 4BW2A 5EM3A 4NRAA 5A83A 5A7CA 3I3JA 5DLXA 3UV2A 4O7BA 5LUUA 2L85A 5DFCA 5BT3A 4ZW1A 4YYMA 5HQ5A 2RO1A 2YW5A 4YBTA 4N4GA 3ZYUA 2RI7A 5DYXA 3DAIA 5DYCA 4QBMA 2I7KA 3MB4A 5LKZA 5JWMA 5ENJA 5D24A 5IGNA 4J0RA 4O72A 4QSRA 2DWWA 5II1A 5E7DA 4CUSA 3U5PA 4O77A 5L97A 4KV4A 3JVLA 4A9LA 5CQ8A 5CQTA 5A5SA 3U5NA 1X0JA 5FE7A 5E3DA 5JI8A 4Z1SA 5EP7A 5ENCA 3O37A 5L8UA 4Q0OA 5A5RA 5CU8A 5I1QA 5CUCA 4YBMA 3JVJA 5HCLA 3TLPA 4BW3A 4MEOA 5F61A 3K2JA 2FSAA 5CY9A 3MUKA 2YEMA 5D3PA 5E73A 5G4SA 2E7OA 3LQIA 4NR6A 4OGJA 5F60A 5I7XA 5TCMA 3Q2FA 4NR9A 5FE5A 4PCIA 4A9OA 5H1TA 4O70A 4NYXA 4YK0A 5HFRA 4AKNA 4O75A 4YBSA 2NXBA 5FH7A 5L99A 4NRBA 5E3GA 4UYDA 5EU1A 5L96A 4WHUA 4LDFA 1F68A 4CFLA 2GRCA 5FE8A 5F63A 1EQFA 5FH8A 5CUGA 4J1PA 3MB3A 5TB6A 3UV4A 2RNXA 3Q2EA 5HJCA 4UIZA 5F1HA 5F25A 5ACYA 5FE2A 4KCXA 4NUCA 4A9IA 4YH4A 5HFQA 4LYSA 5CS8A 5FFWA 5LKTA 4LRGA 4O78A 4A9KA 5BT5A 4QSPA 4YYIA 4TTEA 5LVRA 5A81A 4O7AA 5A5PA 4Q0NA 5I89A 5IBNA 4QC1A 2YDWA 4YYNA 3AADA 4GPJA 4LC2A 4LYIA 5CGPA 4N4IA 5KTWA 5EICA 2DVQA 5D26A 5CQ4A 5D3HA 5CUBA 4TYLA 5EQ1A 5D7XA 3IU5A 3UVXA 5IGLA 5D3SA 5EPBA 4NR5A 3O35A 3DWYA 4TU4A 5D3NA 4ALGA 3HMEA 3P1DA 4QR3A 2OSSA 4O7FA 4RVRA 5HLSA 1WUGA 4HBWA 5EPRA 5HELA 5DKDA 5AMEA 5EI4A 5D25A 5EISA 4PKLA 5LKUA 5ENFA 4QC3A 4NQNA 5HRVA 2R10A 5A5OA 5EWWA 5CTLA 2KTBB 2YYNA 5FDZA 3SVFA 4Z93A 5CQAA 4MEQA 5F3AA 4HXRA 3P1CA 4ZC9A 5HEMA 5FE0A 4O7CA 4PCEA 3QZVA 5ENGA 3SVGA 4Z6HA 4QYDA 4IR4A 2R0SA 5LKXA 4WIVA 3UVDA 5FFVA 5LJ1A 4HXLA 1ZS5A 4TS8A 5LJ2A 2OUOA 4NXJA 5KHMA 4QUUA 4QUTA 5I7YA 4NUEA 4UIVA 2E7NA 5CUAA 3U5KA 5DBMA 4YAXA 4YATA 3LXJA 4BHWA 2WP1A 5FE6A 4IOQA 5HENA 3D7CA 5C85A 4IR3A 4NYVA 1E6IA 4UYFA 4N4HA 4QEVA 4ALHA 5DYUA 5L8TA 5L98A 5LJ0A 4NRCA 4NR8A 4QSWA 5HQ6A 5EWCA 5II2A 4QSSA 4YYKA 4QNSA 3MQMA 4YYJA 5CQ3A 5IIDA 5KU3A 4F3IA 5EWVA 3U5MA 2D82A 5IGMA 4BW4A 5D3RA 5A5QA 5EK9A 2H60A 4QB3A 5FH6A 5CQ5A 4HXOA 5F62A 5C89A 4TT6A 3P5OA 4YADA 2RNYA 4CFKA 5A82A 4YYDA 2DATA 1JSPB 3QZTA 4YC9A 5EV9A 4HBYA 3SVHA 5C4QA 2N9GA 5I83A 4QSQA 4UITA 4YH3A 3G0JA 4X2IA 4C67A 4TZ2A 5AD2A 4IR6A 3MXFA 4CUTA 3RCWA 4TT2A 4Y03A 4TT4A 3IU6A 4N4FA 4QEUA 4QSVA 4QSXA 3O33A 5EWHA 5KTUA 4NUDA 5DX4A 4CUQA 5E9KA 5HRXA 4HXMA 4NQMA 5J0DA 5K29A 4ZQLA 4QSUA 4OGIA 5FG5A 5I80A 5CUEA 4XYAA 5D3JA 2R0VA 5F5ZA 5D3TA 2YEKA 4O74A 5C87A 4J0SA 5C7NA 5F1LA 5COIA 4FLPA 4BW1A 4CL9A 4A9NA 5EVAA 4MR3A 5FB0A 5ENIA 4YYHA 2RNWA 4Z1QA 5ENBA 4A9FA 4LZSA 4BJXA 4O71A 5HRWA 5D3LA 5DW1A 5FE9A 5EPSA 1N72A 4QEWA 2RS9B 5H1UA 5KTXA 4CLBA 2YELA 5HQ7A 4XUAA 5FB1A 5I40A 3AQAA 4NR7A 4IORA 4J3IA 5H1VA 5IGKA 5DFBA 4KV1A 4QSTA 5ETDA 4A9HA 5FE3A 4DONA 3MULA 4N3WA 5KO4A 4QR4A 4TQNA 4MR5A 4PS5A 5LVQA 4O76A 4IOOA 5CRZA 4TZ8A 5E9LA 3UVWA 4UYFB 2G4AA 2RFJA 4YABA 3ONIA 4HXPA 5FG4A 2L5EA 4XUBA 3FKMX 5I29A 5CPEA 4CURA 4UIUA 3JVKA 2DVRA 5E0RA 3NXBA 3S91A 2YQDA 4PTBA 4HXKA 5BT4A 4LYWA 2OO1A 4XY8A 2E3KA 4NR4A 5FE1A 5EWDA 5FFYA 4UYEA 4NS5A 4XY9A 4A9MA 2D9EA 2DVSA 3O34A 1JM4B 2R0YA 4HXSA 4YYGA 5FG6A 3HMFA 5ETBA 2I8NA 3O36A 5FBXA 3GG3A 3UVYA 5CFWA 4UIXA 3UV5A 3S92A 3QZSA 5CQ6A 4UIWA 5E9YA 5DKHA 3P1EA 5CRMA 5DYAA 4UYGA 2LSPB 5CP5A 5DFDA 5E9VA 4QR5A 3U5OA 4QZSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DKWA 5C8GA 4HBXA 5H85A 4LZRA 2L84A 5FE4A 4C66A 5EGUA 4A9EA 2F6JA 1WUMA 3LJWA 5ENHA 4HXNA 5E9MA 5G4RA 4UIYA 5A85A 4CUUA 5CQ7A 5CZGA 4MEPA 3VKGA 3UW9A 3JVMA 5E74A 3U5LA 5AD3A 5EA1A 5E9IA 3D1BA 1PUOA 5F36A 4YY6A 5DW2A 2DVVA 5AMFA 4OUFA 3G0LA 4QYLA 4TU6A 5DLZA 5DKCA 4UYHA 4HBVA 5D0CA 4LR6A 5I86A 5IG6A 3LQHA 3P1FA 5DY7A 4IR5A 4YY4A 4CUPA 4Z6IA 4O7EA 4QY4A 2WP2A 5ENEA 2MJVB 2F6NA 4MR4A 5CUDA 5A5NA 4LZ2A 3HMHA 5HM0A 5I88A 4A9JA 3LQJA 4MR6A 5F2PA 4WHWA 4E96A 4MENA 4PY6A 4NYWA 3U5JA 4BW2A 5EM3A 4NRAA 5A83A 5A7CA 3I3JA 5DLXA 3UV2A 4O7BA 5LUUA 2L85A 5DFCA 5BT3A 4ZW1A 4YYMA 5HQ5A 2RO1A 2YW5A 4YBTA 4N4GA 3ZYUA 2RI7A 5DYXA 3DAIA 5DYCA 4QBMA 2I7KA 3MB4A 5LKZA 5JWMA 5ENJA 5D24A 5IGNA 4J0RA 4O72A 4QSRA 2DWWA 5II1A 5E7DA 4CUSA 3U5PA 4O77A 5L97A 4KV4A 3JVLA 4A9LA 5CQ8A 5CQTA 5A5SA 3U5NA 1X0JA 5FE7A 5E3DA 5JI8A 4Z1SA 5EP7A 5ENCA 3O37A 5L8UA 4Q0OA 5A5RA 5CU8A 5I1QA 5CUCA 4YBMA 3JVJA 5HCLA 3TLPA 4BW3A 4MEOA 5F61A 3K2JA 2FSAA 5CY9A 3MUKA 2YEMA 5D3PA 5E73A 5G4SA 2E7OA 3LQIA 4NR6A 4OGJA 5F60A 5I7XA 5TCMA 3Q2FA 4NR9A 5FE5A 4PCIA 4A9OA 5H1TA 4O70A 4NYXA 4YK0A 5HFRA 4AKNA 4O75A 4YBSA 2NXBA 5FH7A 5L99A 3ERRA 4NRBA 5E3GA 4UYDA 5EU1A 5L96A 4WHUA 4LDFA 1F68A 4CFLA 2GRCA 5FE8A 5F63A 1EQFA 5FH8A 5CUGA 4J1PA 3MB3A 5TB6A 3UV4A 2RNXA 3Q2EA 5HJCA 4UIZA 5F1HA 5F25A 5ACYA 5FE2A 4KCXA 4NUCA 4A9IA 4YH4A 5HFQA 4LYSA 5CS8A 5FFWA 5LKTA 4LRGA 4O78A 4A9KA 5BT5A 4QSPA 4YYIA 4TTEA 5LVRA 5A81A 4O7AA 5A5PA 4Q0NA 5I89A 5IBNA 4QC1A 2YDWA 4YYNA 3AADA 4GPJA 4LC2A 4LYIA 5CGPA 4N4IA 5KTWA 5EICA 2DVQA 5D26A 5CQ4A 5D3HA 5CUBA 4TYLA 5EQ1A 5D7XA 3D1DA 3IU5A 3UVXA 5IGLA 5D3SA 5EPBA 4NR5A 3O35A 3DWYA 4TU4A 5D3NA 4ALGA 3HMEA 3P1DA 4QR3A 2OSSA 4O7FA 4RVRA 5HLSA 1WUGA 4HBWA 2EJNA 5EPRA 5HELA 5DKDA 5AMEA 5EI4A 5D25A 5EISA 4PKLA 5LKUA 5ENFA 4QC3A 4NQNA 5HRVA 4AKIA 2R10A 5A5OA 5EWWA 5CTLA 2KTBB 2YYNA 5FDZA 3SVFA 4Z93A 5CQAA 4MEQA 5F3AA 4HXRA 3P1CA 4ZC9A 5HEMA 5FE0A 4O7CA 4PCEA 3QZVA 5ENGA 3SVGA 4Z6HA 4QYDA 4IR4A 2R0SA 5LKXA 4WIVA 3UVDA 5FFVA 5LJ1A 4HXLA 1ZS5A 4TS8A 5LJ2A 2OUOA 4NXJA 5KHMA 4QUUA 4QUTA 5I7YA 4NUEA 4UIVA 2E7NA 5CUAA 3U5KA 5DBMA 4YAXA 4YATA 3LXJA 4BHWA 2WP1A 5FE6A 4IOQA 5HENA 3D7CA 5C85A 4IR3A 4NYVA 4AKHA 1E6IA 4UYFA 4N4HA 4QEVA 4ALHA 5DYUA 5L8TA 5L98A 5LJ0A 4NRCA 4NR8A 4QSWA 5HQ6A 5EWCA 5II2A 4QSSA 4YYKA 4QNSA 3MQMA 4YYJA 5CQ3A 5IIDA 5KU3A 4F3IA 1ZKRA 5EWVA 3U5MA 2D82A 5IGMA 4BW4A 5D3RA 5A5QA 5EK9A 2H60A 4QB3A 5FH6A 5CQ5A 4HXOA 5F62A 5C89A 4TT6A 3P5OA 4YADA 2RNYA 4CFKA 5A82A 4YYDA 2DATA 1JSPB 3QZTA 4YC9A 5EV9A 4HBYA 3SVHA 5C4QA 2N9GA 5I83A 4QSQA 4UITA 4YH3A 3G0JA 4X2IA 4C67A 4TZ2A 5AD2A 4IR6A 3MXFA 4CUTA 3RCWA 4TT2A 4Y03A 4TT4A 3IU6A 4N4FA 4QEUA 4QSVA 4QSXA 3O33A 5EWHA 5KTUA 4NUDA 5DX4A 4CUQA 4AI6A 5E9KA 5HRXA 4HXMA 4NQMA 5J0DA 5K29A 4ZQLA 4QSUA 4OGIA 5FG5A 5I80A 5CUEA 4XYAA 5D3JA 2R0VA 5F5ZA 5D3TA 2YEKA 4O74A 5C87A 4J0SA 5C7NA 5F1LA 5COIA 4FLPA 4BW1A 4CL9A 4A9NA 5EVAA 4MR3A 5FB0A 5ENIA 4YYHA 4AKGA 2RNWA 4Z1QA 5ENBA 4A9FA 4LZSA 4BJXA 4O71A 5HRWA 5D3LA 5DW1A 5FE9A 5EPSA 1N72A 4QEWA 2RS9B 5H1UA 5KTXA 4CLBA 2YELA 5HQ7A 4XUAA 5FB1A 5I40A 3AQAA 4NR7A 4IORA 4J3IA 5H1VA 5IGKA 5DFBA 4KV1A 4QSTA 5ETDA 4A9HA 5FE3A 4DONA 3MULA 4N3WA 5KO4A 4QR4A 4TQNA 4MR5A 4PS5A 5LVQA 4O76A 4IOOA 5CRZA 4TZ8A 5E9LA 3UVWA 4UYFB 2G4AA 2RFJA 4YABA 3ONIA 4HXPA 5FG4A 3VKHA 2L5EA 4XUBA 3FKMX 5I29A 5CPEA 4CURA 4UIUA 3JVKA 2DVRA 5E0RA 3NXBA 3S91A 2YQDA 4PTBA 4HXKA 5BT4A 4LYWA 2OO1A 4XY8A 2E3KA 4NR4A 5FE1A 5EWDA 5FFYA 4UYEA 4NS5A 4XY9A 4A9MA 2D9EA 2DVSA 3O34A 1JM4B 2R0YA 4HXSA 4YYGA 5FG6A 3HMFA 5ETBA 2I8NA 3O36A 5FBXA 3GG3A 3UVYA 5CFWA 4UIXA 3UV5A 3S92A 3QZSA 5CQ6A 4UIWA 5E9YA 5DKHA 3P1EA 5CRMA 5DYAA 4UYGA 2LSPB 5CP5A 5DFDA 5E9VA 4QR5A 3U5OA 4QZSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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