4HBYA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazolin ligand
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbyA01
5AD3A 5LKZA 5DFDA 5HJCA 4QSRA 4TZ8A 5CTLA 4QBMA 5EV9A 5JWMA 5F60A 4O77A 5EWWA 4CUTA 2DVSA 4QEWA 5A5QA 5D3NA 5FH6A 5EWHA 5HELA 5EK9A 2YELA 2YEMA 5II2A 5IGLA 4LRGA 5C89A 4MR4A 4CUQA 2N9GA 4UIWA 4MR5A 5HQ5A 5E3GA 4PKLA 4ALGA 2DVVA 5IIDA 1WUGA 5D25A 3QZTA 5EGUA 1E6IA 4YK0A 5EICA 3D7CA 2WP2A 4QEVA 5EQ1A 5FE1A 2L5EA 5KHMA 4Z1QA 4NR5A 5D3SA 5IBNA 3UW9A 4QEUA 5ENHA 4N4FA 2H60A 4CLBA 4QNSA 4WHUA 5D3LA 4UIZA 4N4HA 5CQAA 4YBTA 4YYJA 5EP7A 4QR5A 5DY7A 5DLXA 4J0RA 5FH8A 5IG6A 5FE6A 3HMHA 3P1CA 2OUOA 5ENFA 5A85A 4AKNA 4Z6HA 4UYGA 5BT3A 4IR4A 4UYEA 4NR8A 3Q2FA 4A9FA 5A81A 5E9IA 5DLZA 5FE2A 3AQAA 5A5PA 4HBYA 4QB3A 4RVRA 5FB1A 5II1A 2RI7A 5E9LA 5ENJA 4YAXA 5DKDA 5LVRA 5CQ5A 4E96A 4CUPA 3JVMA 4YYHA 4CURA 4HXKA 4F3IA 4Y03A 5G4RA 3MUKA 3O33A 5CUBA 3LQJA 5ENEA 5I80A 5HRXA 4NUCA 4A9JA 3UV2A 3RCWA 5CUEA 3DAIA 4QYLA 3IU5A 2GRCA 4BHWA 2OSSA 5E0RA 4WHWA 5EPBA 2DATA 5IGKA 4C67A 4QR4A 3U5NA 5LKUA 5HM0A 5DFBA 5FB0A 4O71A 5ENBA 4XY9A 5KU3A 5EWVA 3G0LA 4BW3A 4BJXA 4YATA 3P1FA 4MENA 5I89A 5CRZA 2E3KA 5F63A 5H85A 4PCEA 4HXLA 4HBXA 4QSVA 4CFLA 3HMFA 5D24A 4QSPA 5HRWA 5CS8A 4A9MA 3UVDA 3G0JA 4O72A 3MQMA 4LZSA 5HEMA 4A9IA 4UIXA 4ZQLA 5TCMA 2L85A 3DWYA 3FKMX 5F36A 5E9YA 1F68A 5I7YA 4MEPA 5D3JA 5I40A 5A7CA 2E7OA 5CUCA 5LKXA 5EPRA 4QSXA 5L99A 4NR4A 2RS9B 3Q2EA 4CFKA 4GPJA 5DYAA 4UIYA 5FG5A 5CP5A 4NQMA 2NXBA 4TZ2A 4UYFB 4QY4A 5F5ZA 3P1EA 3U5KA 4CUSA 3ZYUA 4A9EA 4TU6A 4YH3A 5D3PA 4Z93A 5TB6A 4XUBA 5FE4A 4HXNA 5D0CA 5C8GA 2WP1A 5A83A 2YYNA 5DBMA 5CRMA 5DKHA 3QZVA 4IR6A 5F2PA 2D82A 5AMEA 4YADA 5EM3A 4YYNA 5FE8A 5FG6A 5EI4A 2R10A 4BW4A 4ZC9A 4CUUA 5C85A 3U5JA 5DYXA 4NS5A 5E9MA 4TS8A 4TT6A 2RNXA 3UVXA 5EVAA 5F61A 4QSSA 4IR3A 2YW5A 3MB3A 4NYWA 4O70A 4UYDA 2MJVB 4ZW1A 5KTWA 5ETBA 4PY6A 5F1HA 4IORA 4XYAA 4J0SA 4YBSA 5FFVA 4O76A 4LZ2A 3LQHA 5FDZA 4Z1SA 4TQNA 4YABA 5HFQA 2RFJA 4LR6A 5EWDA 5L98A 5C87A 3SVHA 4J1PA 4NXJA 4O7CA 4YYGA 4O74A 2LSPB 5CZGA 4Q0NA 5H1VA 5LKTA 5L8TA 5I1QA 4NUEA 3LJWA 3MULA 5IGNA 4TTEA 5DW1A 5K29A 4WIVA 5FH7A 5HQ7A 3IU6A 4HBWA 3SVGA 4A9NA 5H1UA 4NQNA 3JVKA 5I7XA 4A9OA 3UV5A 4QYDA 4DONA 5EPSA 4O7EA 5F62A 5FBXA 3I3JA 3UV4A 5HRVA 4LDFA 4NR9A 4IOQA 4OUFA 4NRBA 5CUDA 5A5OA 4HXRA 4QC3A 5D3TA 5ENCA 4QUUA 3U5LA 5E7DA 4KV1A 2F6JA 3HMEA 4MEQA 5CU8A 4N4GA 2F6NA 2I7KA 5HLSA 3MB4A 5DX4A 2RNYA 4TT4A 5F3AA 4A9KA 2RNWA 5CQ4A 4O7BA 5HFRA 5LUUA 4TT2A 4YY6A 4PCIA 5KTXA 5E74A 2R0VA 4NYXA 3GG3A 3LQIA 4QSUA 5ETDA 5KTUA 5D7XA 5FE5A 2DKWA 5CUGA 5CGPA 5AMFA 3K2JA 4YY4A 5DYUA 2YQDA 4QZSA 4TU4A 3UVWA 4NRAA 5EU1A 5L96A 5A5SA 2R0SA 4UITA 4YYIA 5FE0A 2DVRA 5A82A 4C66A 4XY8A 4LYIA 4NYVA 4YYMA 5FG4A 3AADA 3S92A 3JVLA 1EQFA 5D3HA 5CY9A 2R0YA 4IOOA 5L8UA 2G4AA 2I8NA 3NXBA 3O34A 4OGIA 3U5PA 5HCLA 5I29A 3O36A 5IGMA 5LVQA 4MR6A 4HXSA 5KO4A 4HBVA 4QSQA 5CQ8A 4QSWA 4NRCA 2OO1A 3O35A 4LYSA 4O78A 4QR3A 5ENIA 4IR5A 4QUTA 4NR6A 4N4IA 3P1DA 4BW1A 4HXMA 5FFYA 5LJ2A 5FE9A 2KTBB 5FE7A 5EISA 5BT4A 4LC2A 4UYFA 3SVFA 3UVYA 4UIVA 5A5NA 5DFCA 1X0JA 2FSAA 2YEKA 5E73A 4HXOA 3TLPA 5I88A 5LJ0A 3MXFA 5CFWA 5A5RA 5C4QA 5E9KA 4TYLA 5BT5A 5I86A 5I83A 4ALHA 4YBMA 3JVJA 4UIUA 2DVQA 5CQ3A 4LZRA 3P5OA 5DKCA 5H1TA 4QSTA 1WUMA 4OGJA 5G4SA 4CL9A 1ZS5A 5ACYA 4QC1A 3LXJA 4PS5A 2L84A 5CPEA 4FLPA 4LYWA 4YH4A 4X2IA 5CQTA 2D9EA 5AD2A 3U5OA 4HXPA 5D3RA 4A9LA 5LJ1A 5D26A 2YDWA 5COIA 4A9HA 5FFWA 5F25A 1JSPB 5DYCA 5J0DA 3U5MA 4YYKA 5L97A 4XUAA 4Q0OA 5EWCA 1N72A 2DWWA 5CQ7A 5HENA 5HQ6A 4YC9A 3QZSA 5E9VA 3ONIA 5C7NA 5F1LA 5JI8A 5EA1A 4KCXA 1JM4B 4YYDA 5ENGA 4J3IA 2E7NA 5CQ6A 5DW2A 5E3DA 4O7AA 4MEOA 4O75A 4Z6IA 4KV4A 3O37A 2RO1A 4O7FA 4UYHA 5CUAA 4N3WA 5FE3A 4NR7A 4PTBA 3S91A 4BW2A 4MR3A 4NUDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AD3A 5LKZA 5DFDA 5HJCA 4QSRA 4TZ8A 5CTLA 4QBMA 5EV9A 5JWMA 5F60A 4O77A 5EWWA 4CUTA 2DVSA 4QEWA 5A5QA 5D3NA 5FH6A 5EWHA 5HELA 5EK9A 2YELA 2YEMA 5II2A 5IGLA 4LRGA 5C89A 4MR4A 4CUQA 2N9GA 4UIWA 4MR5A 5HQ5A 5E3GA 4PKLA 4ALGA 2DVVA 5IIDA 1WUGA 5D25A 3QZTA 5EGUA 1E6IA 4YK0A 5EICA 3D7CA 2WP2A 4QEVA 5EQ1A 5FE1A 2L5EA 5KHMA 4Z1QA 4NR5A 5D3SA 5IBNA 3UW9A 4QEUA 5ENHA 4N4FA 2H60A 4CLBA 4QNSA 4WHUA 5D3LA 4UIZA 4N4HA 5CQAA 4YBTA 3D1DA 4YYJA 5EP7A 4QR5A 5DY7A 5DLXA 4J0RA 5FH8A 5IG6A 5FE6A 3HMHA 3P1CA 2OUOA 5ENFA 5A85A 4AKNA 4Z6HA 4UYGA 5BT3A 4IR4A 4UYEA 4NR8A 3Q2FA 4A9FA 5A81A 5E9IA 5DLZA 5FE2A 3AQAA 5A5PA 4HBYA 4QB3A 4RVRA 5FB1A 5II1A 2RI7A 5E9LA 5ENJA 4YAXA 5DKDA 5LVRA 5CQ5A 4E96A 4CUPA 3JVMA 4YYHA 4CURA 4HXKA 4F3IA 4Y03A 5G4RA 3MUKA 3O33A 5CUBA 3LQJA 5ENEA 5I80A 5HRXA 4NUCA 4A9JA 4AKIA 3UV2A 3RCWA 5CUEA 3DAIA 4QYLA 3IU5A 2GRCA 4BHWA 2OSSA 5E0RA 4WHWA 5EPBA 2DATA 5IGKA 4C67A 4QR4A 3U5NA 4AKHA 5LKUA 5HM0A 5DFBA 1PUOA 5FB0A 4O71A 5ENBA 4XY9A 5KU3A 5EWVA 3G0LA 4BW3A 4BJXA 4YATA 3P1FA 4MENA 5I89A 5CRZA 2E3KA 5F63A 5H85A 4PCEA 4HXLA 4HBXA 4QSVA 4CFLA 3HMFA 5D24A 4QSPA 5HRWA 5CS8A 4A9MA 3UVDA 3G0JA 4O72A 3MQMA 4LZSA 5HEMA 4AKGA 4A9IA 4UIXA 4ZQLA 5TCMA 2L85A 3DWYA 3FKMX 5F36A 5E9YA 1F68A 5I7YA 4MEPA 5D3JA 5I40A 5A7CA 2E7OA 5CUCA 5LKXA 5EPRA 4QSXA 5L99A 4NR4A 2RS9B 3Q2EA 4CFKA 4GPJA 5DYAA 4UIYA 5FG5A 5CP5A 4NQMA 2NXBA 4TZ2A 4UYFB 4QY4A 5F5ZA 3P1EA 3U5KA 4CUSA 3ZYUA 4A9EA 4TU6A 4YH3A 5D3PA 4Z93A 5TB6A 4XUBA 5FE4A 4HXNA 5D0CA 5C8GA 2WP1A 5A83A 2YYNA 5DBMA 5CRMA 5DKHA 3QZVA 4IR6A 5F2PA 2D82A 5AMEA 4YADA 5EM3A 4YYNA 3ERRA 5FE8A 5FG6A 5EI4A 2R10A 4BW4A 4ZC9A 4CUUA 5C85A 3U5JA 5DYXA 4NS5A 5E9MA 4TS8A 4TT6A 2RNXA 3UVXA 5EVAA 5F61A 4QSSA 4IR3A 2YW5A 3MB3A 4NYWA 4O70A 4UYDA 2MJVB 4ZW1A 5KTWA 5ETBA 4PY6A 5F1HA 4IORA 4AI6A 4XYAA 4J0SA 4YBSA 5FFVA 4O76A 4LZ2A 3LQHA 5FDZA 4Z1SA 3D1BA 4TQNA 4YABA 5HFQA 2RFJA 4LR6A 5EWDA 5L98A 5C87A 3SVHA 4J1PA 4NXJA 4O7CA 4YYGA 4O74A 2LSPB 5CZGA 4Q0NA 5H1VA 5LKTA 3VKHA 5L8TA 5I1QA 4NUEA 3LJWA 3MULA 5IGNA 4TTEA 5DW1A 5K29A 4WIVA 5FH7A 5HQ7A 3IU6A 4HBWA 3SVGA 4A9NA 5H1UA 4NQNA 3JVKA 5I7XA 4A9OA 3UV5A 4QYDA 4DONA 5EPSA 4O7EA 5F62A 5FBXA 3I3JA 3UV4A 5HRVA 4LDFA 4NR9A 4IOQA 4OUFA 4NRBA 5CUDA 5A5OA 4HXRA 4QC3A 5D3TA 5ENCA 4QUUA 3U5LA 5E7DA 4KV1A 2F6JA 3HMEA 4MEQA 5CU8A 4N4GA 2F6NA 2I7KA 5HLSA 3MB4A 5DX4A 2RNYA 4TT4A 5F3AA 4A9KA 2RNWA 5CQ4A 4O7BA 5HFRA 5LUUA 4TT2A 4YY6A 4PCIA 5KTXA 5E74A 2R0VA 4NYXA 3GG3A 3LQIA 4QSUA 5ETDA 5KTUA 5D7XA 5FE5A 2DKWA 5CUGA 5CGPA 5AMFA 3K2JA 4YY4A 5DYUA 2YQDA 4QZSA 4TU4A 3UVWA 4NRAA 5EU1A 5L96A 5A5SA 2R0SA 3VKGA 4UITA 4YYIA 5FE0A 2DVRA 5A82A 4C66A 4XY8A 4LYIA 4NYVA 4YYMA 5FG4A 3AADA 3S92A 3JVLA 1EQFA 5D3HA 5CY9A 2R0YA 4IOOA 5L8UA 2G4AA 2I8NA 3NXBA 3O34A 4OGIA 3U5PA 5HCLA 5I29A 3O36A 5IGMA 5LVQA 4MR6A 4HXSA 5KO4A 4HBVA 4QSQA 5CQ8A 4QSWA 4NRCA 2OO1A 3O35A 4LYSA 4O78A 4QR3A 5ENIA 4IR5A 4QUTA 4NR6A 4N4IA 3P1DA 4BW1A 4HXMA 5FFYA 5LJ2A 5FE9A 2KTBB 5FE7A 5EISA 5BT4A 4LC2A 4UYFA 3SVFA 3UVYA 4UIVA 5A5NA 5DFCA 1X0JA 2FSAA 2YEKA 5E73A 4HXOA 3TLPA 5I88A 5LJ0A 3MXFA 5CFWA 5A5RA 5C4QA 5E9KA 4TYLA 5BT5A 5I86A 5I83A 4ALHA 4YBMA 3JVJA 4UIUA 2DVQA 5CQ3A 4LZRA 3P5OA 5DKCA 5H1TA 4QSTA 1WUMA 4OGJA 5G4SA 4CL9A 1ZS5A 5ACYA 2EJNA 4QC1A 3LXJA 1ZKRA 4PS5A 2L84A 5CPEA 4FLPA 4LYWA 4YH4A 4X2IA 5CQTA 2D9EA 5AD2A 3U5OA 4HXPA 5D3RA 4A9LA 5LJ1A 5D26A 2YDWA 5COIA 4A9HA 5FFWA 5F25A 1JSPB 5DYCA 5J0DA 3U5MA 4YYKA 5L97A 4XUAA 4Q0OA 5EWCA 1N72A 2DWWA 5CQ7A 5HENA 5HQ6A 4YC9A 3QZSA 5E9VA 3ONIA 5C7NA 5F1LA 5JI8A 5EA1A 4KCXA 1JM4B 4YYDA 5ENGA 4J3IA 2E7NA 5CQ6A 5DW2A 5E3DA 4O7AA 4MEOA 4O75A 4Z6IA 4KV4A 3O37A 2RO1A 4O7FA 4UYHA 5CUAA 4N3WA 5FE3A 4NR7A 4PTBA 3S91A 4BW2A 4MR3A 4NUDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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