5FE6A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment zb1916 (fragment 10)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe6A00
4QC3A 4LYSA 5A5RA 4YYGA 5ENIA 3U5MA 4QSVA 4A9EA 5I40A 4CL9A 4A9JA 3P1CA 4A9LA 3IU6A 4O75A 4HXRA 5FE7A 5LKUA 4ALGA 5EWVA 4QEUA 4Z93A 5F3AA 3NXBA 5DY7A 3UV5A 4YADA 5IIDA 4IR3A 5ENJA 4YBTA 3MUKA 3ONIA 5L99A 5I7XA 5AMFA 5CU8A 5DKDA 2RNYA 5DW1A 5EWWA 5DYUA 4UITA 4CFLA 4XUAA 5D3HA 2FSAA 4YBMA 2RI7A 5F60A 3ZYUA 3G0JA 3SVGA 4YYKA 4YYDA 5F2PA 4O7BA 4QSSA 5HRVA 5F61A 4QSUA 4WHUA 4PTBA 2MJVB 5EWCA 2OSSA 5CRMA 4O7AA 4N4FA 4E96A 3SVFA 5FE6A 5KU3A 4O77A 5A5SA 5C8GA 5A5PA 4J0SA 5CQ4A 4ZQLA 3QZTA 5IGKA 3U5NA 4NS5A 2NXBA 4O72A 5EP7A 5CQAA 5FFYA 4F3IA 5EISA 2KTBB 5DFBA 3QZSA 4QUTA 3UVDA 3MB4A 4J3IA 4QUUA 2OO1A 5EPBA 2LSPB 4HXOA 4O74A 4QEVA 3LXJA 4NQNA 3JVKA 5E73A 4NUDA 3RCWA 3U5KA 2YELA 3U5PA 5TB6A 5BT3A 4IORA 5C89A 2E7NA 4YYIA 4HXPA 5E9VA 5HFRA 5TCMA 5A82A 4HBXA 5I1QA 5I86A 1JM4B 4PS5A 3O33A 5EI4A 4QSXA 5L96A 2WP1A 5G4SA 2DVRA 4A9NA 5IGNA 2I7KA 5FB1A 5IGMA 4O70A 5DYXA 1EQFA 3JVJA 4NR6A 2F6JA 4QR3A 4MR4A 5EWHA 2F6NA 4HBWA 5HFQA 3LQIA 5HM0A 2L5EA 3SVHA 3JVLA 4UYEA 4YATA 5ACYA 5ETDA 4HBYA 4A9KA 1N72A 4Q0NA 4X2IA 4ZC9A 5FG5A 4NR4A 4J0RA 4QR5A 5EVAA 4MR6A 3UVXA 4BW1A 4CURA 5H1TA 4YYJA 3QZVA 4UIZA 5EK9A 4O71A 5CUCA 4XY9A 4QSWA 5C87A 4NUCA 4QNSA 4MR5A 3S92A 5LVRA 5HLSA 5IGLA 3HMHA 5EPRA 4ZW1A 4NR9A 2D9EA 5DFCA 2DVQA 5D3PA 4BHWA 5E3DA 5ETBA 4LYIA 4O76A 2RFJA 5F63A 2DATA 4NR7A 5D0CA 5CUDA 2RS9B 4CUTA 5FE5A 5IBNA 3AQAA 4TYLA 5CZGA 5II1A 5E7DA 5I89A 3UW9A 5H1UA 3MB3A 5KTXA 4CUPA 4GPJA 2E7OA 2YDWA 5F25A 4BW4A 5LJ0A 2DVVA 4MENA 4OUFA 5D3LA 5CUBA 5HQ5A 4UYFA 4UYHA 3S91A 4NXJA 5CUGA 5FE9A 4KV1A 4QEWA 3MULA 4YBSA 2E3KA 5A7CA 5FE2A 5CTLA 5LJ2A 5L98A 5DLZA 5DYCA 3UV2A 4IOOA 2L84A 3P5OA 4TT6A 4UYDA 3P1EA 4TZ2A 4A9FA 5D25A 4QBMA 5HJCA 4NRCA 5F62A 2DVSA 5DW2A 4NRBA 1ZS5A 5EPSA 3MQMA 1X0JA 4HXKA 4QC1A 5I83A 2R0YA 4PY6A 5IG6A 2RNWA 5A81A 2I8NA 3P1FA 4CFKA 5A5QA 4Z1QA 5D7XA 5CPEA 4IR5A 5DFDA 3JVMA 4YC9A 4NYVA 4OGJA 4IR6A 2L85A 5LKTA 5D26A 3LQHA 5I88A 4YY4A 4MEOA 3O34A 5D24A 5DBMA 5DYAA 2DWWA 3U5OA 5H85A 4LZRA 5BT4A 1WUGA 5JWMA 5F5ZA 3DWYA 4Z6IA 5D3JA 5I80A 4MEPA 4UIWA 5J0DA 4HBVA 5C7NA 5E0RA 4LZ2A 4TU4A 4YYNA 3I3JA 4QSQA 3Q2EA 5E9YA 4PCEA 3UV4A 5E9LA 5FE1A 5EM3A 2YEKA 4CUSA 5EICA 5EV9A 5E3GA 5DKHA 3AADA 4NR5A 1JSPB 4OGIA 5D3SA 5CS8A 5FG4A 4KV4A 3P1DA 4Q0OA 4YY6A 4RVRA 5CQ7A 5EA1A 5HRXA 2DKWA 4YAXA 5HENA 4LRGA 3GG3A 3FKMX 5HEMA 5CUEA 4TU6A 3Q2FA 4O7FA 4TQNA 3LQJA 4YH3A 4QZSA 5E74A 1WUMA 5CQ8A 5FE4A 5LUUA 5CGPA 5ENHA 5FH8A 4CLBA 2RO1A 5HQ6A 4Y03A 4N4HA 3HMEA 3O35A 4UIVA 5A5NA 4Z1SA 5F36A 5ENBA 5FBXA 1F68A 5HRWA 4QB3A 5FB0A 4UYGA 3HMFA 4C67A 5HELA 5DLXA 5E9IA 5CRZA 4QY4A 2G4AA 3U5LA 4XY8A 4Z6HA 5CUAA 5CQ6A 5AD3A 4QSTA 4QYLA 3D7CA 4BW3A 4ALHA 4QR4A 2D82A 4YYMA 4IOQA 4J1PA 5E9KA 5KO4A 4A9IA 2OUOA 4NRAA 5H1VA 5KTUA 4YABA 5FH7A 2YW5A 5CY9A 4O78A 4AKNA 4KCXA 5CFWA 5AD2A 5COIA 5LKXA 4LR6A 4PCIA 5FFVA 5FE3A 5I29A 4WHWA 4TT2A 5L97A 5D3RA 5FE8A 5KHMA 5FFWA 3LJWA 3MXFA 2H60A 3O36A 4IR4A 4MR3A 5DX4A 5F1LA 4TTEA 5ENCA 4XYAA 4A9HA 1E6IA 4DONA 4N3WA 5FDZA 2WP2A 5K29A 4UIUA 4PKLA 4LZSA 5AMEA 5FH6A 4LDFA 4O7CA 4HXSA 5EWDA 5C85A 3U5JA 5FG6A 2N9GA 2YQDA 4CUUA 4HXLA 4TZ8A 3TLPA 5E9MA 4UIXA 5LVQA 5F1HA 5DKCA 4YYHA 5CQ5A 5EU1A 4QYDA 5ENGA 5BT5A 4NYWA 5I7YA 4LC2A 5ENEA 4N4GA 3IU5A 4CUQA 5A5OA 4WIVA 4NR8A 5A85A 4HXNA 4YH4A 3G0LA 4MEQA 4QSPA 5C4QA 2R0SA 4UYFB 5HCLA 5II2A 2RNXA 5L8UA 3DAIA 3O37A 5G4RA 4YK0A 5JI8A 4A9OA 5HQ7A 4O7EA 5EQ1A 5LJ1A 2GRCA 4XUBA 5L8TA 4FLPA 2YEMA 4QSRA 5LKZA 4NYXA 2R0VA 5D3TA 4N4IA 5EGUA 4NUEA 5A83A 4LYWA 5D3NA 5ENFA 3UVYA 4A9MA 4UIYA 5CQ3A 4BJXA 4HXMA 5CP5A 5CQTA 2R10A 3K2JA 5FE0A 4NQMA 3UVWA 4TS8A 4C66A 4BW2A 2YYNA 5KTWA 4TT4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QC3A 4LYSA 5A5RA 4YYGA 5ENIA 3U5MA 4QSVA 4A9EA 5I40A 4CL9A 4A9JA 3P1CA 4A9LA 3IU6A 4O75A 4HXRA 5FE7A 5LKUA 4ALGA 5EWVA 4QEUA 4Z93A 5F3AA 3NXBA 5DY7A 3UV5A 4YADA 5IIDA 4IR3A 5ENJA 4YBTA 3MUKA 3ONIA 5L99A 5I7XA 5AMFA 5CU8A 5DKDA 2RNYA 5DW1A 5EWWA 5DYUA 4UITA 4CFLA 4XUAA 5D3HA 2FSAA 4YBMA 2RI7A 5F60A 3ZYUA 3G0JA 3ERRA 3SVGA 4YYKA 4YYDA 5F2PA 4O7BA 4QSSA 5HRVA 5F61A 4QSUA 4WHUA 4PTBA 2MJVB 5EWCA 2OSSA 5CRMA 4O7AA 4N4FA 4E96A 3SVFA 5FE6A 5KU3A 4O77A 5A5SA 5C8GA 5A5PA 4J0SA 5CQ4A 4ZQLA 3QZTA 5IGKA 3U5NA 1ZKRA 4NS5A 2NXBA 4O72A 5EP7A 5CQAA 5FFYA 4F3IA 5EISA 2KTBB 5DFBA 3QZSA 4QUTA 3UVDA 3MB4A 4J3IA 4QUUA 2OO1A 5EPBA 2LSPB 4HXOA 4O74A 4QEVA 3LXJA 4NQNA 3JVKA 5E73A 4NUDA 3RCWA 3U5KA 2YELA 3U5PA 5TB6A 5BT3A 4IORA 5C89A 2E7NA 4YYIA 4HXPA 5E9VA 5HFRA 5TCMA 5A82A 4HBXA 5I1QA 5I86A 1JM4B 4PS5A 3O33A 5EI4A 4QSXA 5L96A 2WP1A 5G4SA 2DVRA 4A9NA 5IGNA 2I7KA 5FB1A 5IGMA 4O70A 5DYXA 1EQFA 3JVJA 4NR6A 2F6JA 4QR3A 4MR4A 5EWHA 2F6NA 4HBWA 5HFQA 3LQIA 5HM0A 2L5EA 3SVHA 3JVLA 4AKIA 4UYEA 4YATA 5ACYA 5ETDA 4HBYA 4A9KA 1N72A 4Q0NA 4X2IA 4ZC9A 5FG5A 4NR4A 4J0RA 4QR5A 5EVAA 4MR6A 3UVXA 4BW1A 3VKHA 4CURA 5H1TA 4YYJA 3QZVA 4UIZA 5EK9A 4O71A 5CUCA 4XY9A 4QSWA 5C87A 4NUCA 4QNSA 4MR5A 3S92A 5LVRA 5HLSA 5IGLA 3HMHA 5EPRA 4ZW1A 4NR9A 2D9EA 5DFCA 2DVQA 5D3PA 4BHWA 5E3DA 5ETBA 4LYIA 4O76A 2RFJA 5F63A 2DATA 4NR7A 5D0CA 5CUDA 2RS9B 4CUTA 5FE5A 5IBNA 3AQAA 4TYLA 5CZGA 5II1A 5E7DA 5I89A 3UW9A 5H1UA 3MB3A 5KTXA 4CUPA 4GPJA 2E7OA 2YDWA 5F25A 4BW4A 5LJ0A 2DVVA 4MENA 4OUFA 5D3LA 5CUBA 5HQ5A 4UYFA 4UYHA 3S91A 4NXJA 5CUGA 5FE9A 4KV1A 4QEWA 3MULA 4YBSA 2E3KA 5A7CA 5FE2A 5CTLA 5LJ2A 5L98A 5DLZA 5DYCA 3UV2A 4IOOA 2L84A 3P5OA 4TT6A 4UYDA 3P1EA 4TZ2A 4A9FA 5D25A 4QBMA 5HJCA 4NRCA 4AKHA 5F62A 2DVSA 5DW2A 4NRBA 1ZS5A 5EPSA 3MQMA 1X0JA 4HXKA 4QC1A 5I83A 2R0YA 4PY6A 5IG6A 2RNWA 5A81A 2I8NA 3P1FA 4CFKA 5A5QA 4Z1QA 5D7XA 5CPEA 4IR5A 5DFDA 3JVMA 1PUOA 4YC9A 4NYVA 4OGJA 4IR6A 2L85A 5LKTA 2EJNA 5D26A 3LQHA 5I88A 4YY4A 4MEOA 3O34A 5D24A 5DBMA 5DYAA 2DWWA 3U5OA 5H85A 4LZRA 5BT4A 1WUGA 5JWMA 4AI6A 5F5ZA 3DWYA 4Z6IA 5D3JA 5I80A 4MEPA 4UIWA 5J0DA 4HBVA 5C7NA 5E0RA 4LZ2A 4TU4A 4YYNA 3I3JA 4QSQA 3Q2EA 5E9YA 4PCEA 3UV4A 5E9LA 5FE1A 5EM3A 2YEKA 4CUSA 5EICA 5EV9A 5E3GA 5DKHA 3AADA 4NR5A 1JSPB 4OGIA 5D3SA 5CS8A 5FG4A 4KV4A 3P1DA 4Q0OA 4YY6A 4RVRA 5CQ7A 5EA1A 5HRXA 2DKWA 4YAXA 5HENA 4LRGA 3GG3A 3FKMX 5HEMA 5CUEA 4TU6A 3Q2FA 4O7FA 4TQNA 3LQJA 4YH3A 4QZSA 5E74A 1WUMA 5CQ8A 5FE4A 5LUUA 5CGPA 5ENHA 5FH8A 4CLBA 2RO1A 5HQ6A 4Y03A 4N4HA 3HMEA 3O35A 4UIVA 5A5NA 4Z1SA 5F36A 5ENBA 5FBXA 1F68A 5HRWA 4QB3A 5FB0A 4UYGA 3HMFA 4C67A 5HELA 5DLXA 5E9IA 5CRZA 4QY4A 2G4AA 3U5LA 4XY8A 4Z6HA 5CUAA 3D1DA 5CQ6A 5AD3A 4QSTA 4QYLA 3D7CA 4BW3A 4ALHA 4QR4A 2D82A 4YYMA 4IOQA 4J1PA 5E9KA 5KO4A 4A9IA 2OUOA 4NRAA 5H1VA 5KTUA 4AKGA 4YABA 5FH7A 2YW5A 5CY9A 4O78A 4AKNA 4KCXA 5CFWA 5AD2A 5COIA 5LKXA 4LR6A 4PCIA 5FFVA 5FE3A 5I29A 4WHWA 4TT2A 5L97A 5D3RA 5FE8A 5KHMA 5FFWA 3LJWA 3MXFA 2H60A 3O36A 4IR4A 4MR3A 5DX4A 5F1LA 4TTEA 5ENCA 4XYAA 4A9HA 1E6IA 4DONA 4N3WA 5FDZA 2WP2A 5K29A 4UIUA 4PKLA 4LZSA 5AMEA 5FH6A 4LDFA 4O7CA 4HXSA 5EWDA 5C85A 3U5JA 5FG6A 2N9GA 2YQDA 4CUUA 4HXLA 4TZ8A 3TLPA 5E9MA 4UIXA 5LVQA 5F1HA 5DKCA 4YYHA 5CQ5A 5EU1A 4QYDA 5ENGA 5BT5A 4NYWA 5I7YA 4LC2A 5ENEA 3D1BA 4N4GA 3IU5A 4CUQA 5A5OA 4WIVA 4NR8A 5A85A 4HXNA 4YH4A 3G0LA 4MEQA 4QSPA 5C4QA 2R0SA 4UYFB 5HCLA 5II2A 2RNXA 3VKGA 5L8UA 3DAIA 3O37A 5G4RA 4YK0A 5JI8A 4A9OA 5HQ7A 4O7EA 5EQ1A 5LJ1A 2GRCA 4XUBA 5L8TA 4FLPA 2YEMA 4QSRA 5LKZA 4NYXA 2R0VA 5D3TA 4N4IA 5EGUA 4NUEA 5A83A 4LYWA 5D3NA 5ENFA 3UVYA 4A9MA 4UIYA 5CQ3A 4BJXA 4HXMA 5CP5A 5CQTA 2R10A 3K2JA 5FE0A 4NQMA 3UVWA 4TS8A 4C66A 4BW2A 2YYNA 5KTWA 4TT4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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