5FE6A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment zb1916 (fragment 10)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe6A00
4UIZA 5CUEA 4HBWA 5L98A 2FSAA 3U5KA 4QEUA 5FFWA 4XUBA 5EV9A 5F25A 4QR5A 4QSPA 4UIYA 4MR5A 3HMHA 3MB3A 4TZ2A 5CGPA 5AD2A 2R0SA 3D7CA 5COIA 4NUDA 5C4QA 4TT2A 5CQ8A 5EICA 5FBXA 4NR8A 5EPSA 4YBTA 3U5LA 3G0JA 4LYIA 3LJWA 5A5OA 5IGLA 5IG6A 4C66A 3DAIA 5HEMA 4HXLA 5FE9A 4LYSA 5I80A 2YEKA 4N4FA 5KU3A 5EWCA 3P5OA 3ZYUA 4KV4A 4WHWA 5EWHA 2R10A 4LC2A 4CLBA 4LZSA 4ZC9A 2RFJA 5II1A 5DYXA 5F5ZA 4IORA 5FH7A 5J0DA 5BT3A 2R0YA 5HRVA 4QSQA 2L84A 4QC1A 3S92A 4J1PA 5I29A 4CUSA 5D3LA 5EA1A 5ENEA 5L96A 1N72A 1JSPB 4WHUA 4TT6A 5EQ1A 4IR5A 4NR7A 5D24A 5CTLA 5HQ7A 5LVQA 4NXJA 5KTXA 4NYXA 5L8UA 2NXBA 2E3KA 5EISA 4HXSA 3NXBA 3O36A 4YADA 4A9HA 5JWMA 4QY4A 1WUGA 5HM0A 5BT4A 5EGUA 4J0RA 5DKCA 2DVSA 4UYGA 4QNSA 5FE0A 5I86A 2D82A 5D26A 5HLSA 2YDWA 4O70A 4Z93A 4QBMA 4HXMA 3O37A 3S91A 5IGKA 4A9KA 4PKLA 5AMFA 2L85A 4XY9A 5DYAA 4NYVA 2KTBB 4LZRA 5FH8A 4HBYA 5FDZA 4KCXA 4BW1A 5I1QA 3UW9A 3UVDA 5DLZA 4NR4A 5HCLA 5JI8A 4O72A 5AD3A 3RCWA 4NRCA 5CRZA 4CUUA 4YBMA 5CQ6A 5CQ7A 5DKDA 4UYFB 4HXKA 5D25A 3UVWA 4QC3A 5CUBA 2RNXA 4O75A 3LXJA 5FE7A 5D3HA 4YBSA 4YYGA 5F2PA 4UIUA 4A9FA 3Q2FA 5H1VA 2N9GA 5A81A 5ENFA 5DYCA 4IR3A 2F6JA 5ENGA 4YY6A 4YYHA 4MR6A 5I40A 3U5JA 3P1FA 4C67A 5A83A 5HFQA 3MULA 4UIXA 4MR3A 3K2JA 5E7DA 5KO4A 4NQNA 5II2A 4YYNA 4Z1QA 5IGMA 4NR5A 4NQMA 5HENA 5E73A 5H1TA 5HQ5A 2L5EA 4O78A 2WP2A 5DBMA 3AQAA 5EI4A 4LZ2A 2DVRA 4NR6A 2DKWA 3ONIA 1WUMA 4UYDA 3SVHA 1X0JA 4QSTA 2RS9B 4TTEA 4CUTA 4O77A 5D3RA 5CUDA 5FE8A 2RO1A 5EPRA 3O33A 5CU8A 5H1UA 3U5OA 5I7YA 1JM4B 5IIDA 3O35A 4TYLA 4ZQLA 4QUUA 4Q0NA 5DW2A 4LR6A 5EPBA 5EP7A 5FB0A 4O7FA 5E9YA 2DWWA 5TCMA 4IR4A 3Q2EA 4LDFA 5A82A 5LJ0A 4NRAA 5EM3A 5FE1A 4J0SA 3QZSA 2YELA 5CS8A 3MXFA 5DYUA 5BT5A 4YYDA 4QSSA 5KHMA 3HMEA 5C85A 5C7NA 3AADA 5L99A 4A9IA 5A7CA 5G4SA 2YEMA 5F1HA 1EQFA 2YYNA 4BW2A 3JVLA 3UVXA 2H60A 3LQIA 5DFCA 4RVRA 4A9JA 4BHWA 5F60A 4MR4A 5EK9A 5EVAA 4WIVA 3MQMA 1E6IA 5AMEA 3IU6A 4QB3A 4HXRA 4X2IA 5EWDA 4A9OA 4YYMA 5LUUA 4O7EA 3P1EA 4N4HA 4MEQA 3LQHA 4Y03A 4YC9A 5F61A 4A9MA 5A5RA 4NUCA 4YK0A 4YATA 4NYWA 5EWWA 4CL9A 3DWYA 5E9VA 4PCIA 4YYJA 3HMFA 2E7OA 3UVYA 4QYDA 4HBXA 4XYAA 5I89A 4HXPA 5I7XA 4OGJA 5FE3A 4O7CA 5EWVA 4LRGA 5ETDA 4MENA 5ENBA 5IBNA 4YABA 5HFRA 5CP5A 5CFWA 4PY6A 5LKZA 4FLPA 4QSXA 5HELA 4CUQA 5CUGA 5LJ1A 3LQJA 3JVMA 5ENHA 5F36A 4N3WA 5CQ4A 4ZW1A 5D3PA 4QUTA 4MEPA 4XUAA 2E7NA 4F3IA 3MUKA 5FE6A 3GG3A 5F62A 5DW1A 5HRWA 5FB1A 3U5NA 4YYIA 5F3AA 4OGIA 5ACYA 4QEWA 4O71A 4LYWA 3TLPA 4J3IA 5EU1A 4UIWA 4UIVA 2I8NA 4IOOA 4E96A 4Z6HA 3IU5A 4TU6A 5IGNA 5CUAA 5DFBA 4BW4A 4A9LA 4QR4A 4A9EA 5ENIA 4CUPA 2I7KA 4HXOA 4QYLA 2RI7A 5CQAA 3MB4A 2RNWA 3SVFA 2YW5A 5FG6A 5FH6A 4OUFA 4QEVA 5HJCA 4N4GA 5ENJA 5ETBA 3P1CA 5A5PA 2YQDA 5LKXA 5FE5A 5D7XA 4PTBA 5ENCA 5HQ6A 5LVRA 5DLXA 4IOQA 4CFLA 5HRXA 2DVQA 5TB6A 5I83A 2WP1A 4XY8A 1ZS5A 4QSRA 4NS5A 3P1DA 3UV2A 4TZ8A 5FE4A 4BW3A 2GRCA 3UV4A 4YYKA 4NR9A 5CQTA 4Z6IA 5A5SA 3UV5A 5DKHA 5LJ2A 4YY4A 3QZVA 4KV1A 2F6NA 4AKNA 5D0CA 3U5PA 5FFVA 3JVJA 5KTWA 5E3GA 5H85A 4YH4A 5DY7A 4ALHA 5KTUA 5C87A 3G0LA 2OUOA 4N4IA 5CRMA 5A85A 1F68A 4TS8A 4QZSA 5D3SA 5F1LA 4NRBA 5G4RA 5CQ5A 5I88A 5LKUA 5L97A 5LKTA 4PS5A 5A5QA 2DVVA 5E9IA 5E9KA 3I3JA 4GPJA 4HXNA 4DONA 4QSUA 4YH3A 5E0RA 5K29A 2DATA 4UYEA 4TQNA 5E9MA 5D3NA 2G4AA 4QSWA 4A9NA 4CFKA 4PCEA 2LSPB 5CUCA 4UYFA 5FG5A 5A5NA 5E3DA 4CURA 4O76A 3QZTA 5FG4A 5E9LA 2RNYA 4NUEA 2MJVB 4QR3A 4TU4A 4BJXA 3U5MA 4Z1SA 4ALGA 5CQ3A 5C89A 4UYHA 5CZGA 5D3TA 2R0VA 5DFDA 5D3JA 4O7AA 4HBVA 5F63A 5E74A 3JVKA 4TT4A 4YAXA 3SVGA 4O7BA 5FFYA 5CY9A 5C8GA 2OO1A 2D9EA 4QSVA 4Q0OA 5DX4A 4UITA 2OSSA 5CPEA 5FE2A 4O74A 3FKMX 4IR6A 4MEOA 5L8TA 3O34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UIZA 5CUEA 4HBWA 5L98A 2FSAA 3U5KA 4QEUA 5FFWA 4XUBA 5EV9A 5F25A 4QR5A 4QSPA 4UIYA 4MR5A 3HMHA 3MB3A 4TZ2A 5CGPA 5AD2A 2R0SA 3D7CA 5COIA 4NUDA 5C4QA 4TT2A 5CQ8A 5EICA 5FBXA 4NR8A 5EPSA 4YBTA 3U5LA 3G0JA 4LYIA 3LJWA 5A5OA 5IGLA 1PUOA 5IG6A 4C66A 3DAIA 5HEMA 4HXLA 5FE9A 4LYSA 5I80A 2YEKA 4N4FA 5KU3A 5EWCA 3P5OA 3ZYUA 4KV4A 4WHWA 5EWHA 2R10A 4LC2A 4CLBA 4LZSA 4ZC9A 2RFJA 5II1A 5DYXA 5F5ZA 4IORA 5FH7A 5J0DA 5BT3A 2R0YA 5HRVA 4QSQA 2L84A 4QC1A 3S92A 4J1PA 5I29A 4CUSA 5D3LA 5EA1A 5ENEA 5L96A 1N72A 1JSPB 4WHUA 4TT6A 5EQ1A 4IR5A 4NR7A 5D24A 5CTLA 5HQ7A 5LVQA 4NXJA 5KTXA 4NYXA 5L8UA 2NXBA 2E3KA 5EISA 4HXSA 3NXBA 3O36A 4YADA 4A9HA 5JWMA 4QY4A 1WUGA 5HM0A 5BT4A 5EGUA 4J0RA 5DKCA 2DVSA 4UYGA 4QNSA 5FE0A 5I86A 2D82A 5D26A 5HLSA 2YDWA 4O70A 4Z93A 4QBMA 4HXMA 2EJNA 3O37A 3S91A 5IGKA 4A9KA 4PKLA 5AMFA 2L85A 4XY9A 5DYAA 4NYVA 2KTBB 4LZRA 5FH8A 4HBYA 5FDZA 4KCXA 4BW1A 5I1QA 3UW9A 3UVDA 5DLZA 4NR4A 5HCLA 5JI8A 4O72A 5AD3A 3RCWA 4NRCA 5CRZA 4CUUA 4YBMA 5CQ6A 5CQ7A 5DKDA 4UYFB 4HXKA 5D25A 3UVWA 4QC3A 5CUBA 2RNXA 4O75A 3LXJA 5FE7A 5D3HA 4YBSA 4YYGA 5F2PA 4UIUA 4A9FA 3Q2FA 5H1VA 2N9GA 5A81A 5ENFA 5DYCA 3D1DA 4IR3A 2F6JA 5ENGA 4YY6A 4YYHA 4MR6A 5I40A 4AKHA 3U5JA 3P1FA 4C67A 5A83A 5HFQA 3MULA 4UIXA 4MR3A 3K2JA 5E7DA 4AI6A 5KO4A 4NQNA 5II2A 4YYNA 4Z1QA 5IGMA 4NR5A 4NQMA 5HENA 5E73A 5H1TA 5HQ5A 2L5EA 4O78A 2WP2A 5DBMA 3AQAA 5EI4A 4LZ2A 2DVRA 4NR6A 2DKWA 3ONIA 1WUMA 4UYDA 3SVHA 1ZKRA 1X0JA 4QSTA 2RS9B 4TTEA 4CUTA 4O77A 5D3RA 5CUDA 5FE8A 2RO1A 5EPRA 3O33A 5CU8A 5H1UA 3U5OA 5I7YA 1JM4B 5IIDA 3O35A 4TYLA 4ZQLA 4QUUA 4Q0NA 5DW2A 4LR6A 5EPBA 5EP7A 5FB0A 4O7FA 5E9YA 2DWWA 5TCMA 4IR4A 3Q2EA 4LDFA 5A82A 5LJ0A 4NRAA 5EM3A 5FE1A 4J0SA 3QZSA 2YELA 5CS8A 3MXFA 5DYUA 5BT5A 4YYDA 4QSSA 5KHMA 3HMEA 5C85A 5C7NA 3AADA 5L99A 4A9IA 5A7CA 5G4SA 2YEMA 5F1HA 1EQFA 2YYNA 4BW2A 3JVLA 3UVXA 2H60A 3LQIA 5DFCA 4RVRA 4A9JA 4BHWA 5F60A 4MR4A 5EK9A 5EVAA 4WIVA 3MQMA 1E6IA 5AMEA 3IU6A 4QB3A 4HXRA 4X2IA 5EWDA 4A9OA 4YYMA 5LUUA 3ERRA 4O7EA 3P1EA 4N4HA 4MEQA 3LQHA 4Y03A 4YC9A 5F61A 4A9MA 5A5RA 4NUCA 4YK0A 4YATA 4NYWA 5EWWA 4CL9A 3DWYA 5E9VA 4PCIA 4YYJA 3HMFA 2E7OA 3UVYA 4QYDA 4HBXA 4XYAA 5I89A 4HXPA 5I7XA 4OGJA 5FE3A 4O7CA 5EWVA 4LRGA 3VKGA 5ETDA 4MENA 5ENBA 5IBNA 4YABA 5HFRA 5CP5A 5CFWA 4PY6A 5LKZA 4FLPA 4QSXA 5HELA 4CUQA 5CUGA 5LJ1A 3LQJA 3JVMA 5ENHA 5F36A 4N3WA 5CQ4A 4ZW1A 5D3PA 4QUTA 4MEPA 4XUAA 2E7NA 4F3IA 3MUKA 5FE6A 3GG3A 5F62A 5DW1A 5HRWA 5FB1A 3U5NA 4YYIA 5F3AA 4OGIA 5ACYA 4QEWA 4O71A 4LYWA 3TLPA 4J3IA 5EU1A 4UIWA 4UIVA 2I8NA 4IOOA 4E96A 4Z6HA 3IU5A 4TU6A 5IGNA 5CUAA 5DFBA 4BW4A 4A9LA 4QR4A 4A9EA 5ENIA 4CUPA 2I7KA 4HXOA 4QYLA 2RI7A 5CQAA 3MB4A 2RNWA 3SVFA 2YW5A 5FG6A 5FH6A 4OUFA 4QEVA 5HJCA 4N4GA 5ENJA 5ETBA 3P1CA 5A5PA 2YQDA 5LKXA 5FE5A 5D7XA 4PTBA 5ENCA 5HQ6A 5LVRA 5DLXA 4IOQA 4CFLA 5HRXA 2DVQA 5TB6A 5I83A 2WP1A 4XY8A 4AKGA 1ZS5A 4QSRA 4NS5A 3P1DA 3UV2A 4TZ8A 5FE4A 4BW3A 2GRCA 3UV4A 4YYKA 4NR9A 5CQTA 4Z6IA 5A5SA 3UV5A 5DKHA 5LJ2A 4YY4A 3QZVA 4KV1A 2F6NA 4AKNA 5D0CA 3U5PA 5FFVA 3JVJA 5KTWA 5E3GA 5H85A 4YH4A 5DY7A 4ALHA 5KTUA 5C87A 3G0LA 2OUOA 4N4IA 5CRMA 5A85A 1F68A 4TS8A 4QZSA 5D3SA 5F1LA 4NRBA 5G4RA 5CQ5A 5I88A 5LKUA 5L97A 5LKTA 4PS5A 5A5QA 2DVVA 5E9IA 5E9KA 3I3JA 4GPJA 4AKIA 4HXNA 4DONA 4QSUA 4YH3A 5E0RA 5K29A 2DATA 4UYEA 4TQNA 5E9MA 5D3NA 2G4AA 4QSWA 4A9NA 4CFKA 4PCEA 2LSPB 5CUCA 4UYFA 5FG5A 5A5NA 5E3DA 4CURA 3D1BA 4O76A 3QZTA 5FG4A 5E9LA 2RNYA 4NUEA 2MJVB 4QR3A 4TU4A 4BJXA 3U5MA 4Z1SA 4ALGA 5CQ3A 5C89A 4UYHA 5CZGA 5D3TA 2R0VA 5DFDA 5D3JA 4O7AA 4HBVA 5F63A 5E74A 3JVKA 4TT4A 4YAXA 3SVGA 4O7BA 5FFYA 5CY9A 5C8GA 2OO1A 2D9EA 3VKHA 4QSVA 4Q0OA 5DX4A 4UITA 2OSSA 5CPEA 5FE2A 4O74A 3FKMX 4IR6A 4MEOA 5L8TA 3O34A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UIZ A;  5CUE A;  4HBW A;  5L98 A;  2FSA A;  3U5K A;  4QEU A;  5FFW A;  4XUB A;  5EV9 A;  5F25 A;  4QR5 A;  4QSP A;  4UIY A;  4MR5 A;  3HMH A;  3MB3 A;  4TZ2 A;  5CGP A;  5AD2 A;  2R0S A;  3D7C A;  5COI A;  4NUD A;  5C4Q A;  4TT2 A;  5CQ8 A;  5EIC A;  5FBX A;  4NR8 A;  5EPS A;  4YBT A;  3U5L A;  3G0J A;  4LYI A;  3LJW A;  5A5O A;  5IGL A;  5IG6 A;  4C66 A;  3DAI A;  5HEM A;  4HXL A;  5FE9 A;  4LYS A;  5I80 A;  2YEK A;  4N4F A;  5KU3 A;  5EWC A;  3P5O A;  3ZYU A;  4KV4 A;  4WHW A;  5EWH A;  2R10 A;  4LC2 A;  4CLB A;  4LZS A;  4ZC9 A;  2RFJ A;  5II1 A;  5DYX A;  5F5Z A;  4IOR A;  5FH7 A;  5J0D A;  5BT3 A;  2R0Y A;  5HRV A;  4QSQ A;  2L84 A;  4QC1 A;  3S92 A;  4J1P A;  5I29 A;  4CUS A;  5D3L A;  5EA1 A;  5ENE A;  5L96 A;  1N72 A;  1JSP B;  4WHU A;  4TT6 A;  5EQ1 A;  4IR5 A;  4NR7 A;  5D24 A;  5CTL A;  5HQ7 A;  5LVQ A;  4NXJ A;  5KTX A;  4NYX A;  5L8U A;  2NXB A;  2E3K A;  5EIS A;  4HXS A;  3NXB A;  3O36 A;  4YAD A;  4A9H A;  5JWM A;  4QY4 A;  1WUG A;  5HM0 A;  5BT4 A;  5EGU A;  4J0R A;  5DKC A; 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