2RS9B

Solution structure of the bromodomain of human brpf1 in complex with histone h4k5ac peptide
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSSGSSGFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMGSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Acetylated lysine 5 of peptide from Histone H4
publication title Site-specific histone recognition by the bromodomain of Brpf1 and the role in MOZ/MORF histone acetyltransferase complexes
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 36
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2rs9B00
4NYXA 4BW2A 5CQ7A 5AMEA 5F1LA 5CRMA 4Y03A 3DAIA 5II1A 4TYLA 4BJXA 4RVRA 5F25A 5D3HA 4N4FA 5KTXA 3U5MA 5E9VA 5A5NA 5L97A 4PCIA 4QSSA 4UIXA 5DFCA 5L99A 4F3IA 4UIUA 4YBTA 5F2PA 4YYDA 5A7CA 5E9YA 3AADA 5IGKA 4O74A 5JWMA 5D7XA 3K2JA 5C8GA 5EPSA 2RO1A 4UIYA 5ENCA 4UIVA 5DLXA 5FFVA 3MB4A 5C89A 3U5JA 3JVMA 4DONA 5A85A 4WHWA 4A9NA 4YBMA 5EA1A 4N3WA 5D3RA 5AD2A 5IGMA 2WP2A 1X0JA 5D0CA 4UYEA 5FDZA 4CUQA 5A5OA 4QSVA 2R10A 5CU8A 5HCLA 4O76A 4CL9A 4KV1A 4ZC9A 4NR8A 4UITA 5DYCA 4IR5A 4YYIA 5HELA 4KV4A 5FG4A 5AMFA 3I3JA 4QEUA 5DBMA 5HEMA 5H1UA 3ZYUA 4Z6IA 5FE9A 1N72A 4LZSA 5FB1A 4YK0A 3P1CA 4NYVA 5D26A 4BW1A 4LZ2A 5DX4A 5IGNA 3IU5A 3P1FA 5ENHA 2YEKA 5LJ2A 2R0YA 5L8UA 4TT6A 3JVJA 5C87A 1E6IA 5ETBA 5DYAA 5CY9A 3UVDA 3MUKA 2H60A 3MXFA 3S92A 5HQ6A 5CQ4A 2D82A 5HRVA 4N4IA 1ZS5A 4O7AA 5FE1A 5EWDA 5ENBA 1F68A 4HXSA 4TT2A 5HFRA 5EWCA 2L5EA 2DVSA 4QSPA 3SVGA 4PY6A 5E7DA 3ONIA 3P5OA 4N4HA 4BW3A 4LZRA 5CQTA 3G0LA 5CUGA 5I1QA 5I80A 4NUCA 1JM4B 4NR7A 3P1EA 4NR9A 4UYDA 4MR3A 5EWVA 5I29A 5ENJA 5E9KA 5FFWA 4HBWA 1WUMA 5F36A 4YBSA 4NR6A 5L98A 5F61A 5A5SA 4OUFA 2I7KA 3LQHA 4YC9A 4N4GA 5FE3A 5HQ7A 4QB3A 4IR3A 4HXRA 5I40A 4A9FA 5EI4A 4TQNA 5EP7A 2DKWA 4E96A 5DFBA 5FH7A 5ENIA 5FG5A 5G4RA 5H85A 3U5LA 5D3SA 4QSWA 4TS8A 5E3GA 3Q2FA 2RNXA 5DLZA 5CS8A 5I86A 5EPRA 4LYWA 4QR5A 4LYIA 5EQ1A 5DY7A 3HMFA 3FKMX 3HMEA 4NQNA 5LKUA 3U5PA 5EGUA 5C4QA 5LJ1A 5II2A 4CUSA 5ENEA 5DW1A 2YW5A 5IIDA 4PKLA 4MR4A 2KTBB 2YEMA 3DWYA 4HBYA 4BW4A 4CUUA 4Q0NA 3SVHA 5I7YA 4ZW1A 3UW9A 5F5ZA 4YY6A 3O35A 4QBMA 5FH8A 2DATA 5FG6A 3U5NA 2F6NA 2RI7A 4Z6HA 3U5KA 4LR6A 3SVFA 4TZ8A 4MEQA 5FFYA 5ENFA 4C66A 4IR6A 2L85A 4QUUA 2RFJA 4NR5A 4O7CA 4J3IA 3LQIA 4O77A 4O78A 4TTEA 5D3NA 5D25A 4A9IA 5FE5A 4QZSA 5CP5A 4O7EA 5DFDA 2I8NA 3TLPA 5CUDA 4YAXA 5C85A 4CURA 4YATA 3HMHA 2OSSA 5LJ0A 5DKCA 5FH6A 2E7OA 3O36A 5KTUA 5HRXA 3QZTA 4NR4A 5CUCA 4TT4A 3UV2A 4TU6A 5A5QA 5C7NA 5E9LA 4YY4A 5A5RA 4MEPA 4O75A 5ETDA 4NYWA 5EISA 5DKDA 2GRCA 5DYUA 5ACYA 4TZ2A 4PS5A 3LJWA 5E9IA 2YELA 2FSAA 5CQ6A 5FE6A 4HXLA 4LRGA 2N9GA 4A9OA 4QSUA 4MR6A 4MEOA 4PCEA 5EU1A 4QNSA 3MB3A 3GG3A 4GPJA 5CQ8A 4IORA 3UV5A 4CUTA 2RS9B 5EM3A 5KTWA 4BHWA 2YQDA 5LVRA 5FE8A 4O7FA 4YYGA 4A9JA 2DVVA 4NRAA 5H1VA 4QUTA 4O72A 5LVQA 5L8TA 2F6JA 4UYFB 5G4SA 4CUPA 5D3TA 5I83A 5K29A 3UVWA 4QYLA 4FLPA 5F60A 4XY9A 4YYNA 2D9EA 4O7BA 5LKTA 5HENA 4TU4A 3LXJA 5CTLA 4HBVA 5EWHA 4XY8A 4X2IA 2L84A 2LSPB 4QSQA 3JVLA 4QC1A 3RCWA 5DW2A 4Z1SA 3O33A 5HRWA 5KHMA 2WP1A 4YH3A 2G4AA 4LYSA 3NXBA 4NXJA 4YH4A 4CLBA 1WUGA 2OO1A 5E74A 5HM0A 5I89A 2DVRA 5F1HA 2DVQA 5I7XA 3Q2EA 2YDWA 4YADA 5IG6A 4HXOA 5A81A 5KU3A 4NUDA 5TB6A 4QR4A 4QSRA 4IOQA 3AQAA 3MULA 4QSTA 4J0RA 5ENGA 5BT4A 3QZSA 4Z93A 4ZQLA 5D3LA 4PTBA 5D3JA 5JI8A 5CGPA 4XUBA 5LKZA 5A82A 4HXNA 5A83A 4A9KA 5CZGA 5DKHA 5HQ5A 5CUBA 3P1DA 4ALGA 4XUAA 4YYKA 3LQJA 1JSPB 4Q0OA 5J0DA 2E3KA 4MENA 4HXKA 4XYAA 5CRZA 3G0JA 3UVXA 4O71A 4WHUA 3JVKA 4WIVA 3UV4A 4YYMA 5COIA 2E7NA 4HXMA 5EVAA 2DWWA 5HFQA 2OUOA 4Z1QA 4UIZA 4QSXA 2YYNA 5AD3A 4YYJA 5DYXA 4NUEA 4A9HA 3QZVA 4CFLA 4QY4A 4UYHA 4UIWA 4OGJA 5CQ5A 3U5OA 3UVYA 4IR4A 1EQFA 5F62A 2R0SA 5EPBA 5BT3A 5D3PA 5CQAA 5HJCA 5H1TA 5TCMA 4MR5A 3O37A 3MQMA 5E0RA 4NQMA 5IGLA 5EICA 5F3AA 5I88A 5EK9A 4HBXA 4AKNA 5FBXA 4NRBA 2R0VA 5FE2A 5CFWA 4LDFA 4A9LA 4ALHA 2MJVB 4A9EA 5FE4A 4YYHA 5E73A 4HXPA 5IBNA 5E9MA 4KCXA 4LC2A 4IOOA 4OGIA 4QYDA 4UYFA 5L96A 4CFKA 5A5PA 4NS5A 5LUUA 4UYGA 4J0SA 4QR3A 3IU6A 5F63A 5CUEA 5D24A 2RNWA 2RNYA 5E3DA 2NXBA 4C67A 3D7CA 5BT5A 5CUAA 5LKXA 3S91A 4YABA 5CPEA 5FE0A 5FE7A 5EWWA 4QC3A 4A9MA 4O70A 4QEVA 3O34A 4J1PA 5FB0A 4NRCA 5KO4A 5EV9A 4QEWA 5CQ3A 5HLSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NYXA 2EJNA 4BW2A 5CQ7A 5AMEA 5F1LA 5CRMA 4Y03A 3DAIA 5II1A 4TYLA 4BJXA 4RVRA 5F25A 5D3HA 4N4FA 5KTXA 3U5MA 5E9VA 5A5NA 5L97A 4PCIA 4QSSA 4UIXA 5DFCA 5L99A 4F3IA 4UIUA 4YBTA 5F2PA 4YYDA 5A7CA 5E9YA 3AADA 5IGKA 4O74A 5JWMA 5D7XA 3K2JA 5C8GA 5EPSA 2RO1A 4UIYA 5ENCA 4UIVA 5DLXA 5FFVA 3MB4A 5C89A 3U5JA 3JVMA 4DONA 5A85A 4WHWA 4A9NA 4YBMA 5EA1A 4N3WA 5D3RA 5AD2A 5IGMA 2WP2A 1X0JA 5D0CA 4UYEA 5FDZA 4CUQA 5A5OA 4QSVA 2R10A 5CU8A 5HCLA 4O76A 4CL9A 4KV1A 4ZC9A 4NR8A 4UITA 5DYCA 4IR5A 4YYIA 5HELA 4KV4A 5FG4A 5AMFA 3I3JA 1PUOA 4QEUA 5DBMA 5HEMA 5H1UA 3ZYUA 4Z6IA 5FE9A 1N72A 4LZSA 5FB1A 4YK0A 3P1CA 4NYVA 5D26A 4BW1A 4LZ2A 5DX4A 5IGNA 3IU5A 3P1FA 5ENHA 2YEKA 5LJ2A 2R0YA 5L8UA 4TT6A 3JVJA 5C87A 1E6IA 4AKHA 5ETBA 5DYAA 5CY9A 3UVDA 3MUKA 2H60A 3MXFA 3S92A 5HQ6A 5CQ4A 2D82A 5HRVA 4N4IA 1ZS5A 4O7AA 5FE1A 5EWDA 5ENBA 1F68A 4HXSA 4TT2A 5HFRA 5EWCA 2L5EA 2DVSA 4QSPA 3SVGA 4PY6A 5E7DA 3ONIA 3VKGA 3P5OA 4N4HA 4BW3A 4LZRA 5CQTA 3G0LA 5CUGA 3D1DA 5I1QA 5I80A 4NUCA 1JM4B 4NR7A 3P1EA 4NR9A 4UYDA 4MR3A 5EWVA 5I29A 5ENJA 5E9KA 5FFWA 4HBWA 1WUMA 5F36A 4YBSA 4NR6A 5L98A 5F61A 5A5SA 4OUFA 2I7KA 3ERRA 3LQHA 4YC9A 4N4GA 5FE3A 5HQ7A 4QB3A 4IR3A 4HXRA 5I40A 4A9FA 5EI4A 4TQNA 5EP7A 2DKWA 4E96A 5DFBA 5FH7A 5ENIA 5FG5A 5G4RA 5H85A 3U5LA 5D3SA 4QSWA 4TS8A 5E3GA 3Q2FA 2RNXA 5DLZA 5CS8A 5I86A 5EPRA 4LYWA 4QR5A 4LYIA 5EQ1A 5DY7A 3HMFA 3FKMX 3HMEA 4NQNA 5LKUA 3U5PA 5EGUA 5C4QA 5LJ1A 3D1BA 5II2A 4CUSA 5ENEA 5DW1A 2YW5A 5IIDA 4PKLA 4MR4A 2KTBB 2YEMA 3DWYA 4HBYA 4BW4A 4CUUA 4Q0NA 3SVHA 5I7YA 4ZW1A 3UW9A 5F5ZA 4YY6A 3O35A 4QBMA 5FH8A 2DATA 5FG6A 3U5NA 2F6NA 2RI7A 4Z6HA 3U5KA 4LR6A 3SVFA 4TZ8A 4MEQA 5FFYA 5ENFA 4C66A 4IR6A 2L85A 4QUUA 2RFJA 4NR5A 4O7CA 4J3IA 3LQIA 4O77A 4O78A 4TTEA 5D3NA 5D25A 4A9IA 5FE5A 4QZSA 5CP5A 4O7EA 5DFDA 2I8NA 3TLPA 5CUDA 4YAXA 5C85A 4CURA 4YATA 3HMHA 2OSSA 5LJ0A 5DKCA 4AI6A 5FH6A 2E7OA 3O36A 5KTUA 5HRXA 3QZTA 4NR4A 5CUCA 4TT4A 3UV2A 4TU6A 5A5QA 5C7NA 5E9LA 4YY4A 5A5RA 4MEPA 4O75A 5ETDA 4NYWA 5EISA 5DKDA 2GRCA 5DYUA 5ACYA 4TZ2A 4PS5A 3LJWA 5E9IA 2YELA 2FSAA 5CQ6A 5FE6A 4HXLA 4LRGA 2N9GA 4A9OA 4QSUA 4MR6A 4MEOA 4PCEA 5EU1A 4QNSA 3MB3A 3GG3A 4GPJA 5CQ8A 4IORA 3UV5A 4CUTA 2RS9B 5EM3A 5KTWA 4BHWA 2YQDA 5LVRA 5FE8A 4O7FA 4YYGA 4A9JA 2DVVA 4NRAA 5H1VA 4QUTA 4O72A 5LVQA 5L8TA 2F6JA 4UYFB 5G4SA 4CUPA 5D3TA 5I83A 5K29A 3UVWA 4QYLA 4FLPA 4AKGA 5F60A 4XY9A 4YYNA 2D9EA 4O7BA 5LKTA 5HENA 4TU4A 3LXJA 5CTLA 4HBVA 5EWHA 4XY8A 4X2IA 2L84A 2LSPB 4QSQA 3JVLA 4QC1A 3RCWA 5DW2A 4Z1SA 3O33A 5HRWA 5KHMA 2WP1A 4YH3A 2G4AA 4LYSA 3NXBA 4NXJA 4YH4A 4CLBA 3VKHA 1WUGA 2OO1A 5E74A 5HM0A 5I89A 2DVRA 5F1HA 2DVQA 5I7XA 3Q2EA 2YDWA 4YADA 5IG6A 4HXOA 5A81A 5KU3A 4NUDA 5TB6A 4QR4A 4QSRA 4IOQA 3AQAA 3MULA 4QSTA 4J0RA 5ENGA 5BT4A 3QZSA 4Z93A 4ZQLA 5D3LA 4PTBA 5D3JA 5JI8A 5CGPA 4XUBA 5LKZA 5A82A 4HXNA 5A83A 4A9KA 5CZGA 5DKHA 5HQ5A 5CUBA 3P1DA 4ALGA 4XUAA 4YYKA 3LQJA 1JSPB 4Q0OA 5J0DA 2E3KA 4MENA 4HXKA 4XYAA 5CRZA 3G0JA 3UVXA 4O71A 4WHUA 3JVKA 4WIVA 3UV4A 4YYMA 5COIA 2E7NA 4HXMA 5EVAA 2DWWA 5HFQA 2OUOA 4Z1QA 4UIZA 4QSXA 2YYNA 5AD3A 4YYJA 5DYXA 4NUEA 4A9HA 3QZVA 4CFLA 4QY4A 4UYHA 4UIWA 4OGJA 5CQ5A 3U5OA 3UVYA 4IR4A 1EQFA 5F62A 2R0SA 5EPBA 5BT3A 5D3PA 5CQAA 5HJCA 5H1TA 5TCMA 4MR5A 3O37A 3MQMA 5E0RA 4NQMA 5IGLA 5EICA 5F3AA 5I88A 5EK9A 4HBXA 4AKNA 5FBXA 4NRBA 4AKIA 2R0VA 5FE2A 5CFWA 4LDFA 4A9LA 4ALHA 2MJVB 4A9EA 5FE4A 4YYHA 5E73A 4HXPA 5IBNA 5E9MA 4KCXA 4LC2A 4IOOA 4OGIA 4QYDA 4UYFA 5L96A 4CFKA 5A5PA 4NS5A 5LUUA 4UYGA 4J0SA 4QR3A 3IU6A 5F63A 5CUEA 5D24A 2RNWA 2RNYA 1ZKRA 5E3DA 2NXBA 4C67A 3D7CA 5BT5A 5CUAA 5LKXA 3S91A 4YABA 5CPEA 5FE0A 5FE7A 5EWWA 4QC3A 4A9MA 4O70A 4QEVA 3O34A 4J1PA 5FB0A 4NRCA 5KO4A 5EV9A 4QEWA 5CQ3A 5HLSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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