2RS9B

Solution structure of the bromodomain of human brpf1 in complex with histone h4k5ac peptide
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSSGSSGFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMGSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Site-specific histone recognition by the bromodomain of Brpf1 and the role in MOZ/MORF histone acetyltransferase complexes
rcsb
molecule keywords Acetylated lysine 5 of peptide from Histone H4
total genus 36
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2rs9B00
5L8TA 4TYLA 4BW4A 3ZYUA 4QSSA 3UV5A 4NYXA 4QC1A 4UIUA 4QSQA 4O71A 5HELA 5KU3A 5DFBA 3O33A 5KO4A 5L99A 4YC9A 4NRCA 3U5LA 3UV2A 5E3DA 5A5NA 5F61A 5L97A 5LKTA 4CUPA 4O74A 4N3WA 4QR3A 3JVJA 5DKHA 5A85A 5ENEA 2DVQA 5CQ8A 5AD2A 4PY6A 5HLSA 5IGKA 4ALGA 5FH8A 3S92A 4YY6A 5CZGA 4MR6A 5EQ1A 4HXKA 2FSAA 3U5NA 3P1CA 3ONIA 5EPBA 4QUTA 5E9VA 4YATA 4LRGA 4LYWA 4O7AA 4Q0NA 4KCXA 5CFWA 5LVQA 5ENGA 5F2PA 5FE3A 5D24A 4NR4A 5EVAA 5ACYA 4LYSA 5CQ6A 5AMFA 3LXJA 5FE1A 5HRVA 5F60A 5I80A 5JI8A 4NR5A 4QYLA 5IG6A 5DYUA 4LZ2A 5EA1A 3QZSA 4TT4A 5CPEA 2RS9B 5EP7A 4ZQLA 5CQ3A 5EICA 3O37A 5CQ4A 3HMHA 5FE4A 1WUGA 4MENA 4UYEA 2WP2A 4WHUA 4HBYA 2L84A 5E74A 3P1EA 4MEQA 2DVVA 5IGLA 4YAXA 5E9IA 2D82A 2NXBA 4PS5A 3JVKA 3P1DA 4N4IA 4UYGA 5A5OA 3NXBA 5FE2A 3MUKA 2OO1A 5D0CA 5DKCA 5EWCA 4YH3A 5EWVA 1WUMA 5FE5A 5A82A 4YK0A 4QSWA 4XY8A 3FKMX 2GRCA 4OGJA 2YEKA 4AKNA 2WP1A 4HBWA 4CUQA 4BHWA 3LQIA 4NR8A 3JVMA 4YY4A 3K2JA 5ENCA 4HXSA 1X0JA 5F1LA 5DW1A 5EU1A 1JSPB 3LJWA 4NXJA 4A9FA 3IU6A 5HQ5A 3AADA 4NR9A 5I83A 4ALHA 1EQFA 4UIWA 2DVSA 2RNWA 3AQAA 4O78A 4E96A 5I86A 1N72A 4NS5A 4J3IA 4TQNA 5C85A 4O7CA 3IU5A 4QNSA 3SVFA 4QEVA 4N4HA 5EPSA 4OGIA 1E6IA 4BW2A 4Z6IA 5EISA 4N4GA 5II2A 5HQ7A 5DBMA 5CS8A 5KHMA 5C8GA 4HXPA 4O70A 4PKLA 5CRMA 4UIZA 5E9MA 4NUCA 4IR4A 2R10A 4XYAA 4J1PA 4UITA 2E3KA 3LQJA 5EV9A 4NRAA 5TB6A 2D9EA 4Q0OA 5HEMA 5I7YA 5CP5A 4A9HA 3HMEA 4NR7A 4O77A 5FBXA 4TTEA 4HXMA 5G4RA 5I88A 5CUGA 4O76A 5CUAA 5DKDA 4CFKA 5C89A 2R0YA 3JVLA 5F62A 5I89A 4YYDA 4XUBA 4YABA 5A7CA 5EI4A 4YYHA 3SVHA 4BW3A 2RNYA 4XUAA 5AMEA 4LDFA 5KTWA 3D7CA 4QEUA 5DX4A 3I3JA 5D7XA 5C7NA 4NQMA 4PTBA 2YYNA 4A9NA 3UVYA 3UV4A 4YYJA 5CUEA 5LKZA 4QSVA 2E7NA 4Z1QA 4IR5A 5ETDA 3MQMA 3P5OA 4BW1A 4NR6A 4TZ8A 4Z6HA 5TCMA 5L8UA 4F3IA 5LJ0A 2YELA 4LZSA 2DVRA 3O36A 4PCIA 4QBMA 4LC2A 5F25A 5FG6A 5E9KA 5II1A 4HXOA 3G0JA 3O34A 5FH7A 5CQ5A 5FH6A 4KV4A 5HJCA 3U5KA 2I8NA 5EWDA 4FLPA 5ENBA 5EM3A 5ENFA 5BT4A 4HXLA 5A5RA 4HXNA 2DKWA 5BT3A 2YDWA 5HRWA 5EK9A 3HMFA 5LUUA 3P1FA 4MEOA 5E9LA 2R0VA 5A81A 4TZ2A 5BT5A 1ZS5A 5A5QA 4UYHA 5DLZA 5FFYA 5IBNA 4YADA 5FE8A 5H1VA 5DLXA 4NQNA 5I7XA 5KTUA 4DONA 5H1UA 4N4FA 3G0LA 5ENHA 5EGUA 5D3LA 2N9GA 4A9JA 5HRXA 4NRBA 3U5MA 4TS8A 3UVDA 5LKXA 5HENA 4O7BA 4C66A 2YEMA 5C87A 5FE0A 4IR3A 4O72A 4J0RA 4A9KA 1F68A 4O7FA 5AD3A 2F6JA 4J0SA 3MULA 5IGMA 4O75A 5DYXA 4TT6A 5H1TA 2RI7A 3Q2FA 4O7EA 5CQTA 4HBVA 5COIA 4UYFA 2KTBB 5CUBA 5A83A 4YYMA 5IIDA 5A5SA 4PCEA 4CFLA 4YYNA 5A5PA 4QSUA 5H85A 2YQDA 3DAIA 2F6NA 3LQHA 2G4AA 4UYFB 4YBSA 3MB4A 5HFRA 3GG3A 4HXRA 4CLBA 4Z93A 5E7DA 3O35A 5DY7A 4CUTA 4YYKA 5HCLA 4MR5A 5HFQA 5HQ6A 2R0SA 3TLPA 4Z1SA 5ETBA 5D3SA 3QZTA 3MB3A 4YH4A 5IGNA 4IORA 4QYDA 5D3JA 4UYDA 4CL9A 5E73A 5FE7A 2MJVB 4QUUA 5FDZA 5EWWA 4UIXA 2OUOA 4A9MA 5D25A 5E3GA 4A9IA 5EPRA 1JM4B 4RVRA 5CY9A 5D3TA 5C4QA 4YYGA 5FG4A 4HBXA 5DYCA 4UIYA 5KTXA 4TT2A 4CUSA 4MEPA 3UVXA 4YBTA 5FB0A 5ENIA 4LYIA 5CRZA 4A9OA 5D3RA 4QSPA 5CU8A 5FE9A 2OSSA 3UVWA 3UW9A 4A9EA 5CUDA 5CTLA 4NUEA 3U5JA 5G4SA 4QY4A 3QZVA 4YBMA 2I7KA 2L85A 5CQAA 4BJXA 4QSTA 5K29A 4QSRA 5F63A 3SVGA 5CQ7A 5LJ2A 5D3NA 5L96A 5LVRA 3Q2EA 5DFDA 2E7OA 5FE6A 3MXFA 5F5ZA 5F3AA 4CUUA 5L98A 5J0DA 4KV1A 4YYIA 4MR3A 4ZC9A 2YW5A 3RCWA 5I29A 4QEWA 4IR6A 4Y03A 4NYVA 2DWWA 4QR4A 5CGPA 5D3HA 4OUFA 5DW2A 2RO1A 5E9YA 2H60A 2RNXA 4LR6A 4IOOA 5DYAA 2L5EA 4XY9A 4WHWA 3DWYA 2RFJA 4UIVA 5FB1A 4ZW1A 5DFCA 4GPJA 4MR4A 4CURA 4QB3A 4QR5A 5FG5A 4NUDA 5FFWA 4NYWA 5D26A 4WIVA 5F1HA 4X2IA 3U5PA 5CUCA 4LZRA 2DATA 4TU6A 4QSXA 2LSPB 4QC3A 5F36A 4A9LA 5I1QA 4QZSA 5E0RA 3U5OA 4IOQA 5D3PA 3S91A 5LKUA 5LJ1A 5ENJA 4TU4A 4C67A 5JWMA 5I40A 5HM0A 5EWHA 5FFVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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