4O7AA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-409514
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7aA01
4OGJA 5E74A 5KTUA 5ETDA 4A9NA 1ZS5A 5DW1A 5LJ1A 3IU5A 4QC3A 5EK9A 4HXKA 4MR6A 3TLPA 3AQAA 3Q2FA 5EU1A 4LYWA 4QSXA 2YELA 2NXBA 4TT4A 5EQ1A 5L97A 5CUCA 4MEPA 4NR5A 4N3WA 3LXJA 4A9LA 5DKDA 5AMFA 4UIYA 2YDWA 3JVLA 1WUMA 5A5NA 5BT3A 5COIA 5K29A 5CQTA 5EISA 5D3PA 4UYDA 4KV1A 5F61A 5I89A 4NYXA 5F1HA 4O77A 4O78A 4UITA 4C66A 3AADA 2DVSA 3LQHA 5F36A 4CUPA 5F62A 3MQMA 5CS8A 5FE6A 4OUFA 5EPSA 5KTWA 3ZYUA 4CL9A 5KTXA 5LKTA 4QSTA 2RI7A 2DVVA 3G0JA 5LKZA 3HMHA 1EQFA 5LJ0A 4YH4A 3O34A 4QNSA 4YY6A 4A9FA 2F6NA 5A82A 5DKCA 4O7EA 5C85A 4FLPA 3LQJA 5DLZA 5A7CA 4O7FA 4NRBA 5ENEA 4CLBA 4IORA 4KV4A 5DLXA 5C4QA 4YBTA 2FSAA 4NQMA 5FG6A 4MEQA 4HBXA 3U5JA 4OGIA 3P1CA 5LVQA 5FE4A 4XY9A 5IIDA 2D82A 2LSPB 4TU6A 4IR3A 4NR6A 4XUAA 2YEMA 5HRWA 5CQ4A 4CUSA 4Z93A 5CQ5A 4UYFB 4ALHA 5H1UA 4A9OA 4C67A 5L96A 5CU8A 4TU4A 5IGKA 4UIZA 4BW3A 1JM4B 5TB6A 5CY9A 4QR3A 5CQ3A 3SVFA 2RO1A 4CUTA 2E7NA 5IGNA 4NRAA 4Q0NA 3FKMX 5A5RA 4NUDA 5CQ7A 5EVAA 4WHWA 4CUQA 2H60A 3LQIA 3P1DA 3HMFA 4X2IA 3K2JA 4ZQLA 4PTBA 4NR8A 5CQ6A 5D0CA 3QZTA 5DYUA 5D3NA 4CFLA 4IR6A 4O7CA 5E9YA 4HXRA 5I88A 2L84A 2L5EA 3S92A 4MR4A 4IR5A 5I80A 2OO1A 4NRCA 5FFWA 4BJXA 4YATA 3U5LA 5ENJA 5D3RA 4YY4A 4N4FA 3QZVA 5CZGA 5L98A 5DFDA 2R0SA 2OSSA 5CRMA 4YH3A 5D24A 5HQ5A 5DFBA 3IU6A 4QEUA 5C89A 4YABA 5LJ2A 3U5NA 5FBXA 4A9JA 4BW1A 4Z1QA 5D3SA 5HENA 2RNXA 4MEOA 4O74A 5DX4A 5I40A 3O35A 4HXLA 5A81A 3JVKA 5G4RA 4YAXA 5D3TA 5FE8A 3U5MA 5CQ8A 4TZ2A 3HMEA 5DW2A 4YADA 4BW4A 2N9GA 4A9EA 4YYMA 4WHUA 5FE3A 5FB0A 3UVDA 3MUKA 5A85A 5HRXA 4UIUA 5EM3A 5FH8A 4N4IA 5FG5A 3RCWA 3DAIA 3UV5A 5EWDA 4TQNA 5I83A 4TS8A 3P5OA 1JSPB 2G4AA 4NR4A 5ENFA 4DONA 5C7NA 5I7YA 5EWVA 5ENHA 5DBMA 3U5KA 5AD2A 4XYAA 5LUUA 4UYEA 2I7KA 5L8UA 3G0LA 5II1A 4J0RA 4LRGA 4J3IA 5IG6A 4QBMA 5I86A 2KTBB 5CUGA 4NUCA 4PKLA 4QEVA 5IGMA 5CGPA 2WP2A 3SVHA 2YW5A 5A5QA 4PCEA 5D3LA 4ZC9A 5KHMA 5H1VA 5A5PA 4F3IA 3UVYA 1E6IA 4O71A 4UIVA 4PY6A 4UYFA 5C8GA 4QEWA 5LVRA 5HELA 5FE0A 4IOQA 3DWYA 5CUBA 5BT4A 3I3JA 4CURA 5EP7A 5KO4A 5CUAA 5AD3A 5HM0A 4QUUA 4GPJA 5F25A 4Y03A 5IBNA 5FFYA 5F60A 5HFRA 3UV2A 4YYDA 4KCXA 3GG3A 4CUUA 5E0RA 4WIVA 5CUEA 3JVMA 3UV4A 4YBSA 4YYNA 4Z1SA 5FE9A 4HXPA 5KU3A 4ZW1A 2E3KA 5HLSA 3MULA 4O72A 5ETBA 3NXBA 3UVWA 2DVQA 5DYXA 5E9VA 5E7DA 5CP5A 5I29A 5A5OA 4HBWA 5ENIA 4CFKA 4O76A 3O33A 4TYLA 5CRZA 4LR6A 5EV9A 5HQ7A 5H85A 5FE5A 5JWMA 5EPRA 5DKHA 5FB1A 3MB4A 4IR4A 4TT2A 2GRCA 2R0VA 4A9MA 4HXOA 5FDZA 2RNYA 4UIXA 5EWWA 4UYGA 2OUOA 5HEMA 2DVRA 5EA1A 4YYJA 5D3HA 5CQAA 4MR5A 3JVJA 5EI4A 5FG4A 4YYKA 4TTEA 2YQDA 4O70A 4QUTA 4LZ2A 2YYNA 4UYHA 5C87A 4YK0A 4QSQA 4AKNA 4BW2A 5FE2A 4NUEA 5EWCA 4LYIA 5L99A 3MXFA 5IGLA 3LJWA 3S91A 4Q0OA 5F63A 5F1LA 3UVXA 4NR9A 5G4SA 4E96A 2MJVB 5FFVA 4QB3A 2RNWA 3MB3A 5F5ZA 5DYAA 5EICA 5ENBA 4HXMA 2RFJA 5CFWA 5D7XA 5FH7A 3O36A 3P1FA 4QSRA 5D25A 5D26A 5HRVA 4O75A 4A9KA 4YYIA 4XUBA 1X0JA 4Z6HA 5HFQA 3D7CA 5LKXA 4QZSA 4Z6IA 4ALGA 3Q2EA 5E9KA 3U5PA 4J0SA 5CUDA 1WUGA 3UW9A 4YC9A 5ENCA 2L85A 5ACYA 5HQ6A 5EGUA 1N72A 4QSWA 4O7AA 5TCMA 5FH6A 4O7BA 2F6JA 4QC1A 4YYHA 5F2PA 4NYWA 4QSUA 4LYSA 4MR3A 4YYGA 4J1PA 5FE7A 3O37A 5E3GA 5D3JA 4NXJA 4TZ8A 5HCLA 4BHWA 5DY7A 3ONIA 5E3DA 5JI8A 4QSSA 5J0DA 4RVRA 5F3AA 2DATA 5A83A 2DKWA 3U5OA 4MENA 5I1QA 4LZRA 3QZSA 5DYCA 4YBMA 2WP1A 4NR7A 4NYVA 4UIWA 4LZSA 2R10A 4NQNA 5E9LA 4QYLA 4TT6A 3SVGA 4PCIA 4N4HA 5HJCA 5A5SA 4QR4A 4N4GA 4A9HA 4LC2A 4HBYA 5L8TA 4A9IA 5II2A 5CPEA 5DFCA 4QYDA 2I8NA 5LKUA 5ENGA 4PS5A 2YEKA 4XY8A 5CTLA 3P1EA 5BT5A 5H1TA 2DWWA 5FE1A 4IOOA 4HBVA 4NS5A 5I7XA 4HXNA 4QSPA 5E9IA 5E73A 5AMEA 2D9EA 5EWHA 2E7OA 4QY4A 2RS9B 1F68A 4QR5A 4QSVA 5E9MA 5EPBA 4LDFA 4HXSA 2R0YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OGJA 5E74A 5KTUA 5ETDA 4A9NA 1ZS5A 5DW1A 5LJ1A 3IU5A 4QC3A 5EK9A 4HXKA 4MR6A 3TLPA 3AQAA 3Q2FA 5EU1A 4LYWA 4QSXA 2YELA 2NXBA 4TT4A 5EQ1A 5L97A 5CUCA 4MEPA 4NR5A 3D1BA 4N3WA 3LXJA 4A9LA 5DKDA 5AMFA 4UIYA 2YDWA 3JVLA 1WUMA 5A5NA 5BT3A 5COIA 5K29A 5CQTA 5EISA 5D3PA 4UYDA 4KV1A 5F61A 5I89A 4NYXA 5F1HA 4O77A 4AKIA 4O78A 4UITA 4C66A 3AADA 2DVSA 3LQHA 5F36A 4CUPA 5F62A 3MQMA 5CS8A 5FE6A 4OUFA 5EPSA 5KTWA 3ZYUA 4CL9A 5KTXA 5LKTA 4QSTA 2RI7A 2DVVA 3G0JA 5LKZA 3HMHA 1EQFA 5LJ0A 4YH4A 3O34A 4QNSA 4YY6A 4A9FA 2F6NA 5A82A 5DKCA 4O7EA 5C85A 4FLPA 3LQJA 5DLZA 5A7CA 4O7FA 4NRBA 5ENEA 4CLBA 4IORA 4KV4A 5DLXA 5C4QA 4YBTA 2FSAA 4NQMA 5FG6A 4MEQA 4HBXA 3U5JA 4OGIA 3P1CA 5LVQA 5FE4A 4XY9A 5IIDA 2D82A 2LSPB 4TU6A 4IR3A 1PUOA 4NR6A 4XUAA 2YEMA 5HRWA 5CQ4A 4CUSA 4Z93A 5CQ5A 4UYFB 4ALHA 5H1UA 4A9OA 4C67A 5L96A 5CU8A 4TU4A 5IGKA 4UIZA 4BW3A 1JM4B 5TB6A 5CY9A 4QR3A 5CQ3A 3SVFA 2RO1A 4CUTA 2E7NA 5IGNA 4NRAA 4Q0NA 3FKMX 5A5RA 4NUDA 5CQ7A 5EVAA 4WHWA 4CUQA 2H60A 3LQIA 3P1DA 3HMFA 4X2IA 3K2JA 4ZQLA 4PTBA 4NR8A 5CQ6A 5D0CA 3QZTA 5DYUA 5D3NA 4CFLA 4IR6A 4O7CA 5E9YA 4HXRA 5I88A 2L84A 2L5EA 3S92A 4MR4A 4IR5A 5I80A 2OO1A 4NRCA 5FFWA 4BJXA 4YATA 3U5LA 5ENJA 5D3RA 4YY4A 4N4FA 3QZVA 5CZGA 5L98A 5DFDA 2R0SA 2OSSA 5CRMA 4YH3A 5D24A 5HQ5A 5DFBA 3IU6A 4QEUA 5C89A 4YABA 5LJ2A 3U5NA 5FBXA 4A9JA 4BW1A 4Z1QA 5D3SA 5HENA 2RNXA 4MEOA 4O74A 5DX4A 5I40A 3O35A 4HXLA 3VKHA 5A81A 3JVKA 5G4RA 4YAXA 5D3TA 5FE8A 3U5MA 5CQ8A 4TZ2A 3HMEA 5DW2A 4YADA 4BW4A 2N9GA 4A9EA 4YYMA 4WHUA 5FE3A 5FB0A 3UVDA 4AKGA 3MUKA 5A85A 5HRXA 4UIUA 5EM3A 5FH8A 4N4IA 5FG5A 3RCWA 3DAIA 3UV5A 5EWDA 4TQNA 5I83A 4TS8A 3P5OA 1JSPB 2G4AA 4NR4A 5ENFA 4DONA 5C7NA 5I7YA 5EWVA 5ENHA 5DBMA 3U5KA 5AD2A 1ZKRA 4XYAA 5LUUA 4UYEA 2I7KA 5L8UA 3G0LA 5II1A 4J0RA 4LRGA 4J3IA 5IG6A 4QBMA 5I86A 2KTBB 5CUGA 4NUCA 4PKLA 4QEVA 5IGMA 5CGPA 2WP2A 3SVHA 2YW5A 5A5QA 4PCEA 5D3LA 4ZC9A 5KHMA 5H1VA 5A5PA 4F3IA 3UVYA 1E6IA 4O71A 4UIVA 4PY6A 4UYFA 5C8GA 4QEWA 5LVRA 5HELA 5FE0A 4IOQA 3DWYA 5CUBA 5BT4A 3I3JA 4CURA 5EP7A 5KO4A 5CUAA 5AD3A 5HM0A 4QUUA 4GPJA 5F25A 4Y03A 5IBNA 5FFYA 5F60A 5HFRA 3UV2A 4YYDA 4KCXA 3GG3A 4CUUA 5E0RA 4WIVA 5CUEA 3JVMA 3UV4A 4YBSA 4YYNA 4Z1SA 5FE9A 4HXPA 5KU3A 4ZW1A 2E3KA 5HLSA 3MULA 4O72A 5ETBA 3NXBA 3UVWA 2DVQA 5DYXA 5E9VA 5E7DA 5CP5A 5I29A 5A5OA 4HBWA 5ENIA 4CFKA 4O76A 3O33A 4TYLA 5CRZA 4LR6A 5EV9A 5HQ7A 5H85A 5FE5A 5JWMA 5EPRA 5DKHA 5FB1A 3MB4A 4IR4A 4TT2A 2GRCA 2R0VA 4A9MA 4HXOA 5FDZA 2RNYA 4UIXA 5EWWA 4UYGA 2OUOA 5HEMA 2DVRA 5EA1A 4YYJA 5D3HA 5CQAA 4MR5A 3JVJA 5EI4A 5FG4A 4YYKA 4TTEA 2YQDA 4O70A 3ERRA 4QUTA 4LZ2A 2YYNA 4UYHA 5C87A 4YK0A 4QSQA 4AKNA 4BW2A 5FE2A 4NUEA 5EWCA 4LYIA 5L99A 3MXFA 5IGLA 3LJWA 3S91A 4Q0OA 5F63A 5F1LA 3UVXA 4NR9A 5G4SA 4E96A 2MJVB 5FFVA 4QB3A 2RNWA 3MB3A 5F5ZA 5DYAA 5EICA 5ENBA 4HXMA 2RFJA 5CFWA 5D7XA 5FH7A 3O36A 3P1FA 4QSRA 5D25A 5D26A 5HRVA 4O75A 4A9KA 4YYIA 4XUBA 1X0JA 4Z6HA 5HFQA 3D7CA 5LKXA 4QZSA 4Z6IA 4ALGA 3Q2EA 5E9KA 3U5PA 4J0SA 5CUDA 1WUGA 3UW9A 4YC9A 5ENCA 2L85A 5ACYA 5HQ6A 2EJNA 5EGUA 1N72A 4QSWA 4O7AA 5TCMA 5FH6A 4O7BA 2F6JA 4QC1A 4YYHA 5F2PA 4NYWA 4QSUA 4LYSA 4MR3A 4YYGA 4J1PA 5FE7A 3O37A 5E3GA 5D3JA 4NXJA 4TZ8A 5HCLA 4BHWA 5DY7A 3ONIA 5E3DA 5JI8A 4QSSA 5J0DA 4RVRA 5F3AA 2DATA 5A83A 2DKWA 3U5OA 4MENA 3VKGA 5I1QA 4LZRA 3QZSA 5DYCA 4YBMA 2WP1A 4NR7A 4NYVA 4UIWA 4AI6A 4LZSA 2R10A 4NQNA 5E9LA 4QYLA 4TT6A 3SVGA 4PCIA 4N4HA 5HJCA 5A5SA 4QR4A 4N4GA 4A9HA 4LC2A 4HBYA 5L8TA 4A9IA 5II2A 5CPEA 5DFCA 4QYDA 4AKHA 2I8NA 5LKUA 5ENGA 3D1DA 4PS5A 2YEKA 4XY8A 5CTLA 3P1EA 5BT5A 5H1TA 2DWWA 5FE1A 4IOOA 4HBVA 4NS5A 5I7XA 4HXNA 4QSPA 5E9IA 5E73A 5AMEA 2D9EA 5EWHA 2E7OA 4QY4A 2RS9B 1F68A 4QR5A 4QSVA 5E9MA 5EPBA 4LDFA 4HXSA 2R0YA
chains in the Genus database with same CATH topology
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