5FH6A

Crystal structure of the fifth bromodomain of human pb1 in complex with compound 10
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
KYMTPMQQKLNEVYEAVKNYTDKRGRRLSAIFLRLPSRSELPDYYLTIKKPMDMEKIRSHMMANKYQDIDSMVEDFVMMFNNACTYNEPESLIYKDALVLHKVLLETRRDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification and Development of 2,3-Dihydropyrrolo[1,2-a]quinazolin-5(1H)-one Inhibitors Targeting Bromodomains within the Switch/Sucrose Nonfermenting Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein polybromo-1
total genus 35
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fh6A00
4O7CA 4QSQA 4TS8A 1E6IA 4CFLA 5CS8A 4LZRA 4HXRA 5E0RA 3O37A 4C67A 4Z6HA 4O76A 4WIVA 5C85A 4LYWA 5CUEA 5FE9A 5HJCA 5DYXA 3K2JA 5FE1A 3G0JA 4NR5A 5ETDA 4A9JA 5KTXA 4NXJA 2DATA 3U5MA 4MR6A 5EWDA 4QSWA 1JM4B 2L5EA 5DYAA 1N72A 3HMHA 5BT3A 5I40A 5LUUA 4HXMA 5I83A 5CFWA 4UIZA 4TT4A 3U5LA 2RO1A 4XYAA 5K29A 5F62A 4OGIA 3O34A 4O71A 5E74A 4A9OA 5ACYA 1F68A 5FE7A 4ALGA 5ETBA 4NR7A 4KV4A 4HBVA 4CUPA 2KTBB 4N4HA 5IBNA 4LZSA 5CUCA 4HBYA 4QBMA 5J0DA 5A5QA 5DKCA 5EP7A 3QZSA 5FE3A 5DX4A 2WP2A 4QSVA 5H1TA 4TZ2A 5E7DA 5IGKA 3O33A 5D3PA 5LVRA 5E9VA 3UV5A 4UIXA 4WHUA 3UVXA 5IIDA 2RFJA 4Z1SA 2DVSA 1ZS5A 5FH7A 5HRWA 3S91A 5AD3A 5DKDA 2F6JA 5CQ4A 3MB4A 4YH3A 5EWWA 2I7KA 5FB1A 5KHMA 5HELA 3UVWA 5LKZA 4HXKA 5DW1A 5CPEA 5I89A 4YYGA 5EGUA 4CUSA 4MR4A 5A82A 3U5NA 4HBWA 2YYNA 5DW2A 3TLPA 5CUGA 4CL9A 4ZC9A 2RNXA 1X0JA 3IU5A 4UIWA 4NRBA 3LQHA 2L85A 4IR5A 3MB3A 4MR5A 3I3JA 5A5RA 4LYIA 4Q0OA 4TU6A 4PKLA 5E3GA 4Z6IA 4O7FA 5A83A 4UIYA 4ZW1A 4BW3A 4CLBA 2E3KA 2RI7A 4OUFA 5H1VA 3RCWA 5CY9A 5IGLA 2RNYA 5F5ZA 5H1UA 3P5OA 2DKWA 5AMFA 5G4SA 3MQMA 3JVJA 3MXFA 4QY4A 4BW4A 4O7BA 3SVGA 2R10A 5CQ7A 4PS5A 5I86A 3U5JA 4FLPA 2RNWA 5FFVA 5CZGA 3JVKA 4J3IA 3UVYA 3LXJA 2GRCA 3U5KA 4BW2A 4F3IA 4QEVA 1EQFA 5EWVA 5D3TA 4QSTA 3Q2EA 4IR4A 5I29A 4BW1A 4Y03A 4HXNA 5F63A 5A85A 4LZ2A 4KV1A 4QR3A 2H60A 4GPJA 4LRGA 4X2IA 1JSPB 4J0SA 4HXPA 5F1HA 2OO1A 5ENIA 4CUUA 4TZ8A 4NYVA 5ENJA 5IG6A 5IGMA 4TYLA 4LDFA 5D3JA 5ENHA 4UYFB 3GG3A 5DKHA 5EPBA 5EM3A 2D82A 5DLXA 5FE5A 5F36A 2DVRA 4Z1QA 3U5PA 3P1FA 5E9IA 3D7CA 4RVRA 4CUTA 5EPSA 5EWHA 5HEMA 4WHWA 4YYDA 5ENFA 5C87A 5C8GA 2YQDA 3UV4A 5FH8A 5HFQA 3DAIA 3ZYUA 5D24A 4O77A 5ENGA 5CTLA 5L98A 3UV2A 5CRMA 5EA1A 3DWYA 5CUBA 5C7NA 5ENBA 5DFCA 5H85A 4IOOA 5II2A 4HBXA 5LJ0A 2RS9B 4A9LA 5FB0A 2F6NA 4CUQA 2OSSA 5FE0A 1WUMA 2YELA 4O75A 2G4AA 5II1A 5F25A 3JVLA 5E73A 4QUTA 2YW5A 4O72A 5L97A 4NRCA 5L8TA 4QSPA 4YABA 4A9FA 5FDZA 5FFWA 4CFKA 4A9MA 4NR8A 5FE8A 4TT2A 5EK9A 4YC9A 3JVMA 5CQAA 5EU1A 4ALHA 3G0LA 5ENEA 5F61A 5FBXA 3UW9A 4N4GA 5JI8A 4J1PA 3Q2FA 4QNSA 3LQIA 5HCLA 3NXBA 4YBSA 4N4FA 2N9GA 5HRVA 5EICA 4LC2A 5CQTA 5CQ3A 5D3HA 5A5NA 5KTWA 4IR6A 5CUDA 5D25A 4QSXA 3LQJA 4TQNA 5FE4A 5DFBA 3MUKA 4QC1A 5D26A 3FKMX 4QEUA 4QYDA 3P1EA 4QR5A 4BHWA 2R0YA 5TCMA 5FG6A 4YY4A 5LKXA 4NRAA 3O35A 3HMEA 5HLSA 4XUBA 4A9HA 4PCIA 4YADA 4YYNA 4QSSA 5AMEA 3SVFA 4Z93A 5FG4A 4QC3A 3LJWA 4UIUA 4YBMA 4NUDA 5D3NA 4O70A 4QZSA 4UYGA 3U5OA 5KU3A 5D3RA 4PTBA 3UVDA 4UYDA 4XUAA 4NR9A 4OGJA 5E9MA 4C66A 2DVVA 1WUGA 3QZTA 5CU8A 5I1QA 5CGPA 2DVQA 5HQ7A 4O7AA 5AD2A 4YBTA 5D3SA 5E9YA 5A81A 5C4QA 4XY9A 4UYFA 4QR4A 4XY8A 4NQNA 2I8NA 5A7CA 4HXOA 4KCXA 5L99A 5CQ6A 2LSPB 4NQMA 4YAXA 4NR6A 2YEKA 4MEQA 5A5OA 4PCEA 4ZQLA 4UITA 5EISA 5EWCA 5TB6A 5EI4A 4LR6A 4YYKA 3HMFA 4MEOA 4A9EA 5I7XA 4NUCA 4DONA 3IU6A 4YYJA 3ONIA 4O78A 5COIA 5CUAA 5JWMA 2R0SA 4BJXA 2R0VA 5I80A 4NUEA 5L8UA 5E9LA 3SVHA 4MEPA 4TTEA 3O36A 4YH4A 4O7EA 4J0RA 5CQ8A 4NYXA 4MENA 2E7NA 5IGNA 2NXBA 5D3LA 2FSAA 5FFYA 4IOQA 4AKNA 5DYCA 5G4RA 5C89A 2E7OA 5EQ1A 4HXLA 4Q0NA 3P1DA 5EVAA 5A5PA 5LKUA 5FG5A 4YYMA 5HQ5A 4IORA 5HFRA 5DBMA 4NYWA 5BT4A 2OUOA 4A9KA 5A5SA 4PY6A 4IR3A 5F3AA 4QYLA 5LJ1A 5L96A 4TU4A 5CRZA 4UYEA 5BT5A 5EV9A 3AADA 5CP5A 5FE6A 2WP1A 5FH6A 2YEMA 5D7XA 4LYSA 5F2PA 4QUUA 5CQ5A 2DWWA 5DY7A 4QSUA 5D0CA 4QB3A 5HM0A 4YK0A 5ENCA 3QZVA 4UIVA 5DFDA 2D9EA 5E9KA 4CURA 5KO4A 4YY6A 4UYHA 5F1LA 2YDWA 4N3WA 4A9IA 5I7YA 2L84A 4QEWA 4A9NA 5EPRA 5I88A 3AQAA 4TT6A 3MULA 3P1CA 5HRXA 5HQ6A 4MR3A 5F60A 3S92A 4N4IA 5HENA 4YATA 4YYIA 2MJVB 5DYUA 4E96A 4NR4A 5LVQA 4YYHA 5LKTA 5FE2A 4HXSA 4NS5A 4QSRA 5E3DA 5LJ2A 5KTUA 5DLZA 4O74A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7CA 4QSQA 4TS8A 1E6IA 4CFLA 5CS8A 4LZRA 4HXRA 5E0RA 3O37A 4C67A 4Z6HA 4O76A 4WIVA 5C85A 4LYWA 5CUEA 5FE9A 5HJCA 5DYXA 3K2JA 5FE1A 3G0JA 4NR5A 5ETDA 4A9JA 5KTXA 4NXJA 2DATA 3U5MA 4MR6A 1ZKRA 5EWDA 4QSWA 1JM4B 2L5EA 5DYAA 1N72A 3HMHA 5BT3A 5I40A 5LUUA 4HXMA 5I83A 5CFWA 4UIZA 4TT4A 3U5LA 2RO1A 4XYAA 5K29A 5F62A 4OGIA 3O34A 4O71A 5E74A 4A9OA 5ACYA 1F68A 5FE7A 4ALGA 5ETBA 4NR7A 4KV4A 4HBVA 4CUPA 2KTBB 4N4HA 5IBNA 4LZSA 5CUCA 4HBYA 4QBMA 5J0DA 5A5QA 5DKCA 5EP7A 3QZSA 5FE3A 5DX4A 2WP2A 4QSVA 5H1TA 4TZ2A 5E7DA 5IGKA 3O33A 5D3PA 5LVRA 5E9VA 3UV5A 4UIXA 4WHUA 3UVXA 5IIDA 2RFJA 2EJNA 4Z1SA 2DVSA 1ZS5A 5FH7A 5HRWA 3S91A 5AD3A 5DKDA 2F6JA 5CQ4A 3MB4A 4YH3A 5EWWA 2I7KA 5FB1A 5KHMA 5HELA 3UVWA 5LKZA 4AKHA 4HXKA 5DW1A 5CPEA 5I89A 4YYGA 5EGUA 4CUSA 4MR4A 5A82A 3U5NA 4HBWA 2YYNA 5DW2A 3TLPA 5CUGA 4CL9A 4ZC9A 2RNXA 3IU5A 1X0JA 4UIWA 4NRBA 3LQHA 2L85A 4IR5A 3MB3A 4MR5A 3I3JA 5A5RA 4LYIA 4Q0OA 4TU6A 4PKLA 5E3GA 4Z6IA 4O7FA 5A83A 4UIYA 4ZW1A 4BW3A 4CLBA 3VKHA 2E3KA 2RI7A 4OUFA 5H1VA 3RCWA 5CY9A 5IGLA 2RNYA 5F5ZA 5H1UA 3P5OA 2DKWA 5AMFA 5G4SA 3MQMA 3JVJA 3MXFA 4QY4A 4BW4A 4O7BA 3SVGA 2R10A 5CQ7A 4PS5A 5I86A 3U5JA 4FLPA 2RNWA 5FFVA 5CZGA 3JVKA 4J3IA 3UVYA 3LXJA 2GRCA 3U5KA 4AKIA 4BW2A 4F3IA 4QEVA 1EQFA 5EWVA 5D3TA 4QSTA 3Q2EA 4IR4A 5I29A 4BW1A 4Y03A 4HXNA 5F63A 5A85A 4LZ2A 4KV1A 4QR3A 2H60A 4GPJA 4LRGA 4X2IA 1JSPB 4J0SA 4HXPA 5F1HA 2OO1A 5ENIA 4CUUA 4TZ8A 4NYVA 5ENJA 5IG6A 5IGMA 4TYLA 4LDFA 5D3JA 5ENHA 4UYFB 3GG3A 5DKHA 5EPBA 5EM3A 2D82A 5DLXA 5FE5A 5F36A 2DVRA 4Z1QA 3U5PA 3P1FA 5E9IA 3D7CA 4RVRA 4CUTA 5EPSA 5EWHA 5HEMA 4WHWA 4YYDA 5ENFA 5C87A 5C8GA 2YQDA 3UV4A 5FH8A 5HFQA 3DAIA 3ZYUA 5D24A 4O77A 5ENGA 5CTLA 5L98A 3UV2A 5CRMA 5EA1A 3DWYA 5CUBA 5C7NA 5ENBA 5DFCA 5H85A 4IOOA 5II2A 4HBXA 5LJ0A 2RS9B 4A9LA 5FB0A 2F6NA 4CUQA 3VKGA 2OSSA 5FE0A 1WUMA 2YELA 4O75A 2G4AA 5II1A 5F25A 3JVLA 5E73A 4QUTA 2YW5A 4O72A 4AI6A 5L97A 4NRCA 5L8TA 4QSPA 4YABA 4A9FA 3D1DA 5FDZA 3ERRA 5FFWA 4CFKA 4A9MA 4NR8A 5FE8A 4TT2A 5EK9A 4YC9A 3JVMA 5CQAA 5EU1A 4ALHA 3G0LA 5ENEA 5F61A 5FBXA 3UW9A 4N4GA 5JI8A 4J1PA 3Q2FA 4QNSA 3LQIA 5HCLA 3NXBA 4YBSA 4N4FA 2N9GA 5HRVA 5EICA 4LC2A 5CQTA 5CQ3A 5D3HA 5A5NA 5KTWA 4IR6A 5CUDA 5D25A 4QSXA 3LQJA 4TQNA 5FE4A 5DFBA 3MUKA 4QC1A 5D26A 3FKMX 4QEUA 4QYDA 3P1EA 4QR5A 4BHWA 2R0YA 5TCMA 5FG6A 4YY4A 5LKXA 4NRAA 3O35A 3HMEA 5HLSA 4XUBA 4A9HA 4PCIA 4YADA 4YYNA 4QSSA 5AMEA 3SVFA 4Z93A 5FG4A 4QC3A 3LJWA 4UIUA 4AKGA 4YBMA 4NUDA 5D3NA 4O70A 4QZSA 4UYGA 3U5OA 5KU3A 5D3RA 4PTBA 3UVDA 4UYDA 4XUAA 4NR9A 4OGJA 5E9MA 4C66A 2DVVA 1WUGA 3QZTA 5CU8A 5I1QA 5CGPA 2DVQA 5HQ7A 4O7AA 5AD2A 4YBTA 5D3SA 5E9YA 5A81A 5C4QA 4XY9A 4UYFA 4QR4A 4XY8A 4NQNA 2I8NA 5A7CA 4HXOA 4KCXA 5L99A 5CQ6A 2LSPB 4NQMA 4YAXA 4NR6A 2YEKA 4MEQA 5A5OA 4PCEA 4ZQLA 4UITA 5EISA 5EWCA 5TB6A 5EI4A 4LR6A 4YYKA 3HMFA 4MEOA 4A9EA 5I7XA 4NUCA 4DONA 3D1BA 3IU6A 4YYJA 3ONIA 4O78A 5COIA 5CUAA 5JWMA 2R0SA 4BJXA 2R0VA 5I80A 4NUEA 5L8UA 5E9LA 3SVHA 4MEPA 4TTEA 3O36A 1PUOA 4YH4A 4O7EA 4J0RA 5CQ8A 4NYXA 4MENA 2E7NA 5IGNA 2NXBA 5D3LA 2FSAA 5FFYA 4IOQA 4AKNA 5DYCA 5G4RA 5C89A 2E7OA 5EQ1A 4HXLA 4Q0NA 3P1DA 5EVAA 5A5PA 5LKUA 5FG5A 4YYMA 5HQ5A 4IORA 5HFRA 5DBMA 4NYWA 5BT4A 2OUOA 4A9KA 5A5SA 4PY6A 4IR3A 5F3AA 4QYLA 5LJ1A 5L96A 4TU4A 5CRZA 4UYEA 5BT5A 5EV9A 3AADA 5CP5A 5FE6A 2WP1A 5FH6A 2YEMA 5D7XA 4LYSA 5F2PA 4QUUA 5CQ5A 2DWWA 5DY7A 4QSUA 5D0CA 4QB3A 5HM0A 4YK0A 5ENCA 3QZVA 4UIVA 5DFDA 2D9EA 5E9KA 4CURA 5KO4A 4YY6A 4UYHA 5F1LA 2YDWA 4N3WA 4A9IA 5I7YA 2L84A 4QEWA 4A9NA 5EPRA 5I88A 3AQAA 4TT6A 3MULA 3P1CA 5HRXA 5HQ6A 4MR3A 5F60A 3S92A 4N4IA 5HENA 4YATA 4YYIA 2MJVB 5DYUA 4E96A 4NR4A 5LVQA 4YYHA 5LKTA 5FE2A 4HXSA 4NS5A 4QSRA 5E3DA 5LJ2A 5KTUA 5DLZA 4O74A
chains in the Genus database with same CATH topology
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