4NR4A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
FKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr4A00
5FE9A 5A85A 2I8NA 2YQDA 3D7CA 4QUUA 4OGJA 4ALHA 3IU5A 2RS9B 4LRGA 5I40A 5I86A 5CUBA 4BW4A 5FE5A 4NR7A 2RNWA 3IU6A 3LJWA 5KO4A 5C4QA 4O7AA 5FH6A 2WP2A 3O37A 3MQMA 4NR8A 3HMFA 4LDFA 4NR6A 4XYAA 5CRZA 5E9YA 5FH7A 3U5KA 3QZVA 2RFJA 1JSPB 5L96A 5E9VA 4NUCA 1JM4B 4IR4A 3UV5A 4YY6A 4A9FA 5BT5A 2OO1A 2F6NA 5ENFA 5EM3A 4BW3A 5E3GA 5D3RA 5AMEA 5A7CA 2YELA 5D25A 5F1HA 3NXBA 5FE4A 4YY4A 1ZS5A 5EWWA 4YADA 4WHUA 5D7XA 5AD2A 5HFQA 5IBNA 2RO1A 4QR4A 5DKCA 4J3IA 3SVFA 5F36A 4CUQA 5ACYA 2R0SA 5EVAA 4BHWA 3MULA 4HBXA 5K29A 4A9NA 4QSPA 1WUGA 5D3TA 4YBMA 5CQTA 5HQ6A 2D82A 5EU1A 4MR3A 4HBYA 4NR4A 4QEUA 4YK0A 5H1UA 4CUSA 4WHWA 5DX4A 5A82A 3Q2FA 4YYNA 5F2PA 3LXJA 4MENA 4C67A 3G0JA 3P1EA 2RI7A 5EGUA 5L98A 4YYKA 5ETDA 1WUMA 2G4AA 2RNXA 4HBVA 3Q2EA 4YH4A 5HRXA 5IIDA 3MUKA 4MR4A 5IGKA 4PTBA 3MXFA 3O34A 4GPJA 4F3IA 5HLSA 4N4HA 5IGNA 5ENBA 5HENA 5CQ8A 5FE8A 4AKNA 5FE1A 5ENCA 5C85A 3G0LA 5EA1A 5CUDA 5TCMA 2YEMA 5CUEA 3UVWA 5EPSA 5E7DA 4O72A 4QBMA 3MB3A 5I7XA 5ENHA 5CFWA 3ONIA 5IG6A 4Q0OA 4YATA 2L5EA 3U5OA 4HXRA 2YEKA 3U5MA 5I89A 4A9HA 5FB0A 4QR5A 5LKTA 4WIVA 2YYNA 4ZC9A 4QSXA 5HRVA 5CP5A 5HQ5A 4HXLA 5DFBA 5IGLA 4YABA 4QB3A 4UYGA 3AQAA 2GRCA 5D3NA 3MB4A 3GG3A 5FFVA 4O71A 4YBTA 2DATA 4Z6IA 2DVVA 4QR3A 3ZYUA 5DBMA 4TZ8A 4OGIA 5EWHA 4PKLA 2NXBA 5F3AA 2E3KA 4LZSA 4NS5A 4IR6A 4NR9A 4KV1A 5F61A 2WP1A 4TU6A 5EPBA 4HXMA 5DLXA 5A5RA 5C8GA 4TTEA 5A5SA 2N9GA 5CY9A 2DVQA 5ENIA 5CGPA 3O35A 3JVMA 5DYCA 4PY6A 1X0JA 2DVSA 4PCIA 4KCXA 5HELA 3U5PA 5FE0A 4IOOA 5A81A 4HXPA 5DKHA 5HEMA 4LZ2A 5L8TA 4CURA 4NQNA 4YYMA 5FG4A 4UIWA 4O74A 5EV9A 5CQ3A 4LYSA 3QZTA 4IOQA 4NYVA 4TT4A 4CLBA 1F68A 3U5JA 3UVDA 5FE2A 4FLPA 4QSSA 3LQIA 5FH8A 4BW1A 4NRAA 4YAXA 4MR6A 4UIXA 3FKMX 3SVHA 4RVRA 5DW2A 2DVRA 5EWCA 5KTUA 4J0RA 4ZW1A 5DYAA 4O76A 5E73A 5EK9A 4HXNA 5F1LA 5HFRA 4UIVA 5JWMA 5D3PA 4YH3A 5KU3A 5LUUA 5D3HA 4QNSA 3LQJA 4QSVA 4O7CA 5CQ4A 5LKXA 5FG5A 4A9JA 4KV4A 3P5OA 5KTWA 5E3DA 4TYLA 4CFKA 5FDZA 4Q0NA 4QSUA 5H1VA 5ENJA 4NR5A 5FG6A 4QUTA 3U5NA 4YC9A 5D3LA 5LJ2A 2RNYA 5CQ5A 4YYDA 4TT6A 4Z6HA 4UYEA 5KHMA 5CRMA 5G4RA 4LYWA 5D24A 5FFWA 5EWDA 4XUBA 5FE7A 4NQMA 4NRBA 2FSAA 5DLZA 3AADA 4A9KA 5EISA 4DONA 4LYIA 4ALGA 5E9MA 4MEOA 4CFLA 4HXKA 2DKWA 4YYJA 5CQ7A 4C66A 4TT2A 5E9IA 5KTXA 4YBSA 5I7YA 5FFYA 5HQ7A 4ZQLA 5E9LA 2R10A 5CU8A 5DY7A 5COIA 5I29A 3K2JA 5I1QA 4QEWA 4PCEA 4NRCA 3UVXA 2L85A 5EI4A 5TB6A 5FB1A 5F5ZA 5LVRA 4YYHA 3DWYA 5HRWA 4CUUA 4QSQA 4TU4A 4HBWA 4J1PA 4O77A 5E0RA 5L97A 4O7FA 4QY4A 4UITA 5D26A 5C7NA 3LQHA 2H60A 3S92A 1EQFA 4UYFA 5EICA 5D3JA 5CZGA 4UIYA 4XY9A 4UIUA 5AD3A 5LKUA 5H85A 5CUAA 2R0VA 4CUTA 4BJXA 2F6JA 5FE3A 4CUPA 3S91A 3QZSA 5CQ6A 5HM0A 5AMFA 2OUOA 4TQNA 5A83A 4QC1A 2D9EA 2KTBB 2E7OA 4UYHA 3UV2A 5ENEA 4QSWA 5EPRA 4N3WA 5CUGA 3UVYA 5E9KA 4MEQA 4NXJA 4O7BA 5ETBA 5FBXA 4IR3A 2MJVB 3HMHA 5L99A 4QC3A 4XY8A 4NYWA 4Z1QA 4N4IA 2I7KA 5BT3A 3P1DA 5L8UA 5I83A 5G4SA 4CL9A 3SVGA 5F63A 5D0CA 5F62A 5CTLA 5H1TA 5A5PA 5F25A 2YDWA 2OSSA 4A9EA 5J0DA 5LJ1A 4A9OA 5II1A 5C87A 4UYDA 5EWVA 4IORA 3HMEA 4MEPA 5HJCA 4QYLA 4LC2A 5A5OA 4N4GA 3TLPA 3DAIA 2DWWA 3O33A 5DFDA 5FE6A 4O70A 4Z1SA 4QYDA 3U5LA 4NUDA 5DFCA 4J0SA 4HXSA 5CPEA 4LR6A 5CS8A 5A5QA 5IGMA 5E74A 4QSRA 3P1FA 4E96A 1E6IA 4QZSA 4HXOA 5CUCA 5LJ0A 5I80A 4OUFA 3JVKA 5F60A 4O78A 4YYGA 4Z93A 5II2A 5BT4A 4MR5A 4A9LA 5C89A 3I3JA 5DYUA 5LKZA 2LSPB 4QSTA 3JVJA 5DYXA 5A5NA 4Y03A 4UYFB 2L84A 4A9MA 5HCLA 4BW2A 4YYIA 4X2IA 4QEVA 4UIZA 2E7NA 5ENGA 5EQ1A 4N4FA 4LZRA 5EP7A 3UW9A 4XUAA 3P1CA 5JI8A 5CQAA 4O75A 4PS5A 5DW1A 3UV4A 4NUEA 5DKDA 4NYXA 2R0YA 4IR5A 3JVLA 5LVQA 2YW5A 3O36A 4TZ2A 5D3SA 1N72A 4A9IA 3RCWA 4TS8A 5I88A 4O7EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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