4NR4A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
FKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 42
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr4A00
1JM4B 3QZTA 3G0JA 4A9IA 4NUEA 5LVRA 4BW3A 2RNWA 2R0VA 5CQ8A 2H60A 4LZ2A 2OO1A 4HXSA 3MB4A 3UV4A 5IGLA 3Q2FA 4QEUA 4QNSA 5FG4A 2RFJA 3QZSA 4A9MA 5CGPA 5FE6A 3S91A 4YYNA 5A5SA 5HENA 3AQAA 5F63A 4NUCA 4ALHA 4N4GA 5A82A 5CQ6A 5KU3A 5I29A 4O77A 4UIXA 5ENBA 4CFLA 3MUKA 4TYLA 3MXFA 4XUBA 4YY4A 5CRZA 4NR8A 4MR6A 4YATA 4N4IA 5EPBA 3P1EA 5FFWA 5E9YA 5IIDA 3TLPA 5AMFA 5BT3A 4QSSA 4J1PA 5EI4A 4QR4A 4J0SA 3HMHA 4ZW1A 4N3WA 2YW5A 3AADA 4ALGA 4O7CA 4A9OA 4BW2A 5FE7A 3S92A 4PS5A 4QEVA 5DW2A 4YABA 3SVFA 3O33A 3IU5A 5KHMA 2GRCA 4NQMA 5L99A 5HQ5A 3UV2A 4C66A 5LVQA 4CURA 3GG3A 2D82A 3LXJA 5FE4A 3ZYUA 5L97A 3U5JA 5ENFA 5L8UA 5CUDA 5A85A 4UIYA 5EA1A 5FDZA 4YBSA 4O76A 4QSXA 3MQMA 2RNXA 2N9GA 4O71A 4QSRA 5ACYA 2NXBA 4Z6HA 4YK0A 3QZVA 4A9FA 3DAIA 4NRBA 4QY4A 5FE3A 4MEOA 5HM0A 4NR6A 4CFKA 4YYIA 5D24A 5CUCA 4YYKA 5DYUA 5E74A 5H1VA 3FKMX 2MJVB 3JVLA 4UIZA 4O7AA 5HFQA 4J3IA 4PCIA 4UYGA 5DKDA 4O75A 5CQ5A 4XY9A 5HQ6A 5DYAA 5KTUA 5AMEA 5CQTA 4MEPA 4QSUA 4YH3A 5HELA 5II2A 2FSAA 3UVDA 4UYFA 5DX4A 5F5ZA 4YBMA 5CQ4A 3JVJA 5IG6A 3MULA 5FH6A 5F61A 5A83A 5ETBA 2RS9B 4YYDA 4A9JA 2YEKA 4O72A 4TT4A 5HEMA 5L98A 3P5OA 1N72A 1JSPB 5I80A 5E3DA 4UYHA 2RO1A 3MB3A 4QUTA 2YQDA 4MR3A 4BJXA 5ENHA 2I7KA 5H1TA 4QSWA 5FFYA 4IR5A 4UYEA 4HXMA 1X0JA 5C89A 2RI7A 2G4AA 4XUAA 5E7DA 4A9LA 4YYMA 3U5PA 5FE8A 4Y03A 5D7XA 5CZGA 5J0DA 5DLXA 4QC3A 3O36A 4HXNA 5FB1A 5D3HA 2YYNA 5FH7A 5CY9A 5E9KA 4HBVA 4QYDA 4HXLA 2E3KA 4LZSA 5I1QA 5CUAA 3G0LA 5F3AA 3U5KA 5LUUA 5FBXA 2L84A 5FE2A 4GPJA 4UYDA 4CUTA 4HXRA 5EK9A 4UITA 5C87A 4Q0NA 5CUGA 4IOOA 5C4QA 3HMEA 4MENA 4UIWA 5DKCA 5F1HA 5HRVA 4A9KA 4KV1A 5ENGA 5D3LA 4QR5A 4O70A 4QC1A 2RNYA 3O35A 5DYXA 2I8NA 5ENEA 3P1CA 4Z93A 2DVSA 4Z6IA 5LJ0A 3U5MA 4TT6A 2D9EA 4YYHA 4BW4A 4X2IA 4ZQLA 5F62A 4HBYA 4XY8A 5CQ3A 5E9MA 2YDWA 5E9IA 2F6JA 3HMFA 4BW1A 2DWWA 5D3TA 5I88A 5HJCA 4HXPA 4MR4A 4WIVA 3U5LA 5L8TA 5A7CA 5FE9A 5KTWA 5CQ7A 5CUEA 5EISA 3IU6A 4Z1SA 4O7FA 2KTBB 4O78A 1WUGA 3UV5A 4NYWA 4YH4A 4QR3A 4YC9A 1F68A 3P1FA 5C8GA 5FH8A 5G4RA 4LYIA 4AKNA 5HRXA 5EP7A 5HCLA 4IR4A 4QBMA 4MEQA 5L96A 3JVMA 2LSPB 4YY6A 4OUFA 3O37A 5C85A 3LQJA 5DFDA 5LKTA 4NR7A 5ETDA 2DVVA 2R0YA 5DW1A 4UIVA 4QB3A 3LQIA 5EICA 5FE5A 4IOQA 2L85A 3UW9A 4F3IA 4FLPA 5DLZA 4LC2A 5HLSA 4NR5A 4E96A 4NRCA 3U5NA 4QEWA 5EQ1A 5IGNA 4O7BA 5DFBA 4IORA 5C7NA 2DVRA 5LKUA 4O74A 2DATA 5LJ1A 5HFRA 5A5PA 5I83A 5EGUA 5EWCA 4PY6A 4IR6A 5A5NA 5I40A 3SVGA 2DVQA 3UVXA 4TT2A 5DBMA 4PKLA 2YEMA 4PTBA 4A9NA 5E9VA 5DYCA 5JI8A 5IBNA 4HBWA 4Q0OA 5EWWA 4YYGA 4WHWA 5IGKA 1WUMA 4QSTA 5JWMA 3ONIA 5COIA 1ZS5A 4IR3A 5CP5A 5E3GA 5F36A 4CL9A 3LQHA 4OGJA 5FB0A 3RCWA 5H1UA 5BT4A 4QZSA 5D3RA 4LYSA 5ENCA 5CFWA 2R10A 5CTLA 5D0CA 3O34A 4LRGA 4YAXA 5LKZA 3SVHA 5EWVA 5CQAA 5FG5A 5IGMA 4CUUA 5A5QA 4NUDA 5D25A 4CUPA 4MR5A 4N4FA 5DY7A 5D3JA 5F25A 4CUSA 5D3NA 5LJ2A 5AD3A 5FE0A 4BHWA 5I7YA 3UVWA 4HXKA 4A9EA 4QSPA 4HBXA 5CPEA 5D26A 5K29A 5TCMA 4LR6A 5F2PA 5FG6A 3P1DA 2OUOA 5ENIA 5EPRA 4NR4A 3I3JA 5F60A 5H85A 5G4SA 4NQNA 3U5OA 4QUUA 4O7EA 4OGIA 4NS5A 4NR9A 4TTEA 5E9LA 5ENJA 4DONA 5A81A 4QYLA 3D7CA 3DWYA 4YBTA 5A5OA 2R0SA 2WP1A 4TZ8A 4UYFB 5I7XA 2E7OA 4NYXA 5EPSA 5CU8A 2E7NA 5KTXA 4TU4A 4WHUA 4HXOA 5DFCA 4RVRA 4ZC9A 2OSSA 4TU6A 5D3PA 3JVKA 5DKHA 5EVAA 5TB6A 4N4HA 5FFVA 4CLBA 3LJWA 4LZRA 3Q2EA 5FE1A 5AD2A 5EV9A 5LKXA 4KV4A 2F6NA 4LYWA 4QSVA 4YYJA 4PCEA 5E0RA 5EU1A 4C67A 5F1LA 5BT5A 5I86A 5KO4A 4QSQA 4A9HA 5II1A 4TZ2A 5I89A 4CUQA 4Z1QA 3K2JA 5HRWA 1EQFA 2YELA 1E6IA 5CRMA 4J0RA 4KCXA 4NXJA 2L5EA 5CS8A 4YADA 3NXBA 5EWDA 2DKWA 4TQNA 3UVYA 4UIUA 2WP2A 4TS8A 4XYAA 5EM3A 5EWHA 4LDFA 5HQ7A 5E73A 5A5RA 5CUBA 5D3SA 4NRAA 4NYVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JM4B 3QZTA 3G0JA 4A9IA 4NUEA 5LVRA 4BW3A 2RNWA 2R0VA 5CQ8A 2H60A 4LZ2A 2OO1A 4HXSA 3MB4A 3UV4A 5IGLA 3Q2FA 4QEUA 4QNSA 5FG4A 2RFJA 3QZSA 4A9MA 5CGPA 5FE6A 3S91A 4YYNA 5A5SA 5HENA 3AQAA 5F63A 4NUCA 4ALHA 4AI6A 4N4GA 5A82A 5CQ6A 5KU3A 5I29A 4O77A 4UIXA 5ENBA 4CFLA 3MUKA 4TYLA 1ZKRA 3MXFA 4XUBA 4YY4A 5CRZA 4NR8A 4MR6A 4YATA 4N4IA 5EPBA 3P1EA 5FFWA 5E9YA 5IIDA 4AKHA 3TLPA 5AMFA 5BT3A 4QSSA 4J1PA 5EI4A 4QR4A 4J0SA 3HMHA 4ZW1A 4N3WA 2YW5A 3AADA 4ALGA 4O7CA 4A9OA 4BW2A 5FE7A 3S92A 4PS5A 4QEVA 5DW2A 4YABA 3SVFA 3O33A 3IU5A 5KHMA 2GRCA 4NQMA 5L99A 5HQ5A 3UV2A 4C66A 5LVQA 4CURA 3GG3A 2D82A 3LXJA 5FE4A 3ZYUA 5L97A 3U5JA 5ENFA 5L8UA 5CUDA 5A85A 4UIYA 5EA1A 5FDZA 4YBSA 4O76A 4QSXA 3MQMA 2RNXA 2N9GA 4O71A 4QSRA 5ACYA 2NXBA 1PUOA 4YK0A 3QZVA 4Z6HA 4A9FA 3DAIA 4NRBA 4QY4A 5FE3A 4MEOA 5HM0A 4NR6A 4CFKA 4YYIA 4AKIA 5D24A 5CUCA 4YYKA 5DYUA 5E74A 5H1VA 3FKMX 2MJVB 3JVLA 4UIZA 4O7AA 5HFQA 4J3IA 4PCIA 4UYGA 5DKDA 4O75A 5CQ5A 4XY9A 5HQ6A 5DYAA 5KTUA 5AMEA 5CQTA 4MEPA 4QSUA 4YH3A 5HELA 5II2A 2FSAA 3UVDA 4UYFA 5DX4A 5F5ZA 4YBMA 5CQ4A 3JVJA 5IG6A 3MULA 5FH6A 5F61A 5A83A 5ETBA 2RS9B 4YYDA 4A9JA 2YEKA 4O72A 4TT4A 5HEMA 5L98A 3P5OA 1N72A 1JSPB 5I80A 5E3DA 4UYHA 2RO1A 3MB3A 4QUTA 2YQDA 4MR3A 4BJXA 5ENHA 2I7KA 5H1TA 4QSWA 5FFYA 4IR5A 4UYEA 4HXMA 1X0JA 5C89A 2RI7A 2G4AA 4XUAA 5E7DA 4A9LA 4YYMA 3U5PA 5FE8A 4Y03A 3D1DA 5CZGA 5D7XA 5J0DA 5DLXA 4QC3A 3O36A 4HXNA 5FB1A 5D3HA 2YYNA 5FH7A 5CY9A 5E9KA 4HBVA 4QYDA 4HXLA 2E3KA 4LZSA 5I1QA 5CUAA 3G0LA 5F3AA 3U5KA 5LUUA 5FBXA 2L84A 5FE2A 4GPJA 4UYDA 4CUTA 4HXRA 5EK9A 4UITA 5C87A 4Q0NA 5CUGA 4IOOA 5C4QA 3HMEA 4MENA 4UIWA 5DKCA 5F1HA 5HRVA 4A9KA 4KV1A 5ENGA 5D3LA 4QR5A 4O70A 4QC1A 2RNYA 3O35A 5DYXA 2I8NA 5ENEA 3P1CA 4Z93A 2DVSA 4Z6IA 5LJ0A 3U5MA 4TT6A 2D9EA 4YYHA 4BW4A 4X2IA 4ZQLA 5F62A 4HBYA 4XY8A 5CQ3A 5E9MA 2YDWA 5E9IA 2F6JA 3HMFA 4BW1A 2DWWA 5D3TA 3ERRA 5I88A 5HJCA 4HXPA 4MR4A 4WIVA 3U5LA 5L8TA 5A7CA 5FE9A 5KTWA 5CQ7A 5CUEA 5EISA 3IU6A 4Z1SA 4O7FA 2KTBB 4O78A 1WUGA 3UV5A 4NYWA 4YH4A 4QR3A 4YC9A 1F68A 3P1FA 5C8GA 5FH8A 5G4RA 4LYIA 4AKNA 5HRXA 5EP7A 5HCLA 4IR4A 4QBMA 4MEQA 5L96A 3JVMA 2LSPB 4YY6A 4OUFA 3O37A 5C85A 3LQJA 5DFDA 5LKTA 4NR7A 5ETDA 2DVVA 2R0YA 5DW1A 4UIVA 4QB3A 3LQIA 5EICA 5FE5A 4IOQA 2L85A 2EJNA 3UW9A 4FLPA 5DLZA 4F3IA 4LC2A 5HLSA 4NR5A 4E96A 4NRCA 3U5NA 4QEWA 5EQ1A 5IGNA 3VKHA 4O7BA 5DFBA 4IORA 5C7NA 2DVRA 5LKUA 4O74A 2DATA 5LJ1A 5HFRA 5A5PA 5I83A 5EGUA 5EWCA 4PY6A 4IR6A 5A5NA 5I40A 3SVGA 2DVQA 3UVXA 4TT2A 5DBMA 4PKLA 2YEMA 4PTBA 4A9NA 5E9VA 5DYCA 5JI8A 5IBNA 4HBWA 4Q0OA 5EWWA 4YYGA 4WHWA 5IGKA 1WUMA 4QSTA 5JWMA 3ONIA 5COIA 1ZS5A 4IR3A 5CP5A 5E3GA 5F36A 4CL9A 3LQHA 4OGJA 5FB0A 3RCWA 5H1UA 5BT4A 4QZSA 5D3RA 4LYSA 5ENCA 5CFWA 2R10A 5CTLA 5D0CA 3O34A 4LRGA 4YAXA 5LKZA 3SVHA 5EWVA 5CQAA 5FG5A 5IGMA 4CUUA 5A5QA 4NUDA 5D25A 4CUPA 4MR5A 4N4FA 5DY7A 5D3JA 5F25A 4CUSA 5D3NA 5LJ2A 5AD3A 5FE0A 4BHWA 5I7YA 3UVWA 4HXKA 4A9EA 4QSPA 4HBXA 5CPEA 5D26A 5K29A 5TCMA 4LR6A 5F2PA 5FG6A 3P1DA 2OUOA 5ENIA 5EPRA 4NR4A 3I3JA 5F60A 5H85A 5G4SA 4NQNA 3U5OA 4QUUA 4O7EA 4OGIA 4NS5A 4NR9A 4TTEA 5E9LA 5ENJA 4DONA 5A81A 4QYLA 3D7CA 3DWYA 4YBTA 5A5OA 2R0SA 2WP1A 4TZ8A 4UYFB 5I7XA 2E7OA 4NYXA 5EPSA 5CU8A 2E7NA 5KTXA 4TU4A 4WHUA 4HXOA 5DFCA 4RVRA 4ZC9A 2OSSA 4TU6A 5D3PA 3JVKA 5DKHA 5EVAA 5TB6A 4N4HA 5FFVA 4CLBA 3LJWA 4LZRA 3Q2EA 5FE1A 5AD2A 5EV9A 5LKXA 4KV4A 2F6NA 4LYWA 4QSVA 4YYJA 4PCEA 5E0RA 5EU1A 4C67A 5F1LA 5BT5A 5I86A 5KO4A 4QSQA 4A9HA 5II1A 4TZ2A 5I89A 4CUQA 4Z1QA 3K2JA 5HRWA 1EQFA 2YELA 1E6IA 5CRMA 4J0RA 4KCXA 4NXJA 2L5EA 5CS8A 4YADA 3D1BA 3NXBA 5EWDA 2DKWA 4TQNA 3UVYA 4UIUA 4AKGA 2WP2A 4TS8A 4XYAA 5EM3A 5EWHA 4LDFA 5HQ7A 5E73A 5A5RA 5CUBA 5D3SA 4NRAA 3VKGA 4NYVA
chains in the Genus database with same CATH topology
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