5F1HA

Crystal structure of the brd9 bromodamian in complex with bi-9564.
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKERLLALKRSMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Design of an in Vivo Active Selective BRD9 Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
total genus 43
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f1hA00
3UV4A 5L8TA 4QYLA 4TYLA 5EWDA 5ETBA 5D3NA 5LKXA 3JVJA 4UIZA 2YEKA 1WUMA 5CRMA 4PS5A 4F3IA 4UIWA 4QR5A 4O7CA 4Z1SA 5I89A 5BT5A 3GG3A 1WUGA 5EWWA 2H60A 4LZ2A 5ENBA 4YY4A 1X0JA 4C67A 4QNSA 4QSWA 4YBSA 4MR5A 5CUBA 4A9EA 3SVGA 3Q2EA 4O75A 2G4AA 5F36A 5HQ6A 5EPRA 3G0LA 5ENHA 4CFLA 4HBYA 3UVYA 5CQTA 5F2PA 3AQAA 4IORA 4O7FA 4ZC9A 4NUDA 4QSTA 4QY4A 5CPEA 4YYKA 4TTEA 2RS9B 2E7OA 4UYHA 3O34A 5C89A 5E7DA 5EVAA 5JI8A 5LUUA 4NR8A 5IG6A 5AMFA 5DX4A 5DW2A 3QZSA 2NXBA 5D3LA 2D82A 5I29A 5KTWA 4YABA 5II1A 4MEOA 2DVQA 3Q2FA 1ZS5A 3HMEA 4GPJA 4UYFA 4LYIA 3TLPA 5I1QA 5ACYA 4N4FA 5CS8A 5ENEA 5TB6A 5L99A 4J0SA 2FSAA 5FE9A 5C8GA 1N72A 5CQ4A 5F62A 3K2JA 5D3SA 5DY7A 5LVQA 5D3HA 4QR3A 5F1LA 4IR5A 4XUAA 5C4QA 3LQHA 4YK0A 4OUFA 4AKNA 4YYJA 4MEQA 5C7NA 4A9IA 4DONA 5L96A 3SVHA 2RNXA 4YYDA 4TT4A 3U5OA 3UV2A 5DLZA 4E96A 4HXNA 5D3TA 4YH3A 4X2IA 4YAXA 4LC2A 3RCWA 5AD2A 5A5PA 5F60A 4NQMA 5AMEA 2R0YA 5E9LA 5HRWA 5A5QA 5E9YA 2OUOA 3D7CA 5FG4A 4O70A 5LVRA 5FFVA 3NXBA 4YYHA 4BHWA 4A9FA 5A83A 4Z6HA 3O35A 3P5OA 5HM0A 2RO1A 4QSXA 5I88A 4HBWA 5E9MA 4J0RA 4LR6A 4QUTA 5J0DA 5IGMA 5H1TA 3P1FA 5CQ7A 5D7XA 5EICA 5F1HA 5E9IA 4A9OA 5HLSA 4QC1A 4PKLA 3O36A 5A7CA 4J1PA 2MJVB 4NYXA 4QUUA 4CUQA 2YELA 5L98A 4TT6A 5D26A 5FB0A 2LSPB 4QSPA 4TU6A 5H85A 5EI4A 5LKUA 2WP1A 5I83A 2DVRA 4HXRA 5I40A 5HRVA 5EGUA 2F6JA 2L85A 4HBVA 3ZYUA 2R0VA 4IOQA 4QBMA 4Z1QA 3O33A 2DVVA 5LJ1A 4CUUA 4WHWA 4UITA 5DFCA 3IU6A 5LJ0A 5HCLA 5FE5A 5L8UA 4NYVA 4QEWA 5E74A 4QB3A 5CUDA 5FH6A 4UYGA 4TU4A 1JSPB 5A81A 5A85A 5ENCA 5CTLA 5FE7A 5LJ2A 5E0RA 5II2A 5EK9A 4XUBA 4BW4A 2I7KA 5EPBA 5KHMA 4NR5A 5H1VA 3I3JA 5FDZA 4O72A 4LYWA 4CUTA 1JM4B 4N3WA 4FLPA 4CURA 5KTUA 2YYNA 1F68A 5E9KA 2OSSA 4HXKA 3UVXA 4A9MA 5CQ3A 5BT4A 5FB1A 2E7NA 5DYXA 4YYNA 5F3AA 5IBNA 4A9KA 5E3GA 3P1CA 4OGIA 4UIVA 4NR6A 3UV5A 4CL9A 3MUKA 4NRCA 5HFRA 5HJCA 5CUCA 4A9NA 5LKZA 3U5MA 5A5OA 2L5EA 3U5JA 4PCEA 5HQ7A 5E3DA 4NR9A 3LXJA 5H1UA 4WHUA 2E3KA 5DYCA 5C87A 4NUEA 3U5KA 4KCXA 4C66A 4O76A 2KTBB 2L84A 5AD3A 3DWYA 4YY6A 2RNYA 5EWHA 5KO4A 5FE4A 5CQ8A 3MQMA 1E6IA 3G0JA 4LZSA 4OGJA 5CQ6A 5EV9A 5DYAA 5HRXA 2DWWA 5FE0A 4O78A 3O37A 4MR3A 4MR4A 5D3RA 5DFDA 4O74A 5C85A 4TT2A 4ALHA 3S92A 4UYDA 5IGKA 4Q0NA 4YYGA 4YBMA 5HEMA 4O7AA 5FE8A 3UVWA 5IGLA 5DYUA 4YBTA 4QSQA 5CRZA 5CUAA 4TZ2A 4NXJA 4MR6A 5DLXA 4NYWA 4Z6IA 4QSUA 4YADA 4CFKA 4IR6A 3LJWA 3LQJA 4QC3A 4IR3A 4LZRA 2N9GA 4QEVA 4UIXA 4CLBA 5D3JA 5CUEA 3DAIA 5D0CA 5ETDA 5A5RA 5E9VA 5LKTA 4IOOA 4NS5A 4HXLA 5KU3A 3S91A 5I7YA 5TCMA 4O7BA 2DKWA 5E73A 5BT3A 4QSSA 5EA1A 4QR4A 5FH7A 5I80A 5HELA 4TS8A 2DATA 4YYMA 5DFBA 5F5ZA 5F63A 4TZ8A 5FE3A 5L97A 4NUCA 5HFQA 5ENIA 4MENA 5FFYA 4UIUA 5I86A 4HXPA 5KTXA 3IU5A 3SVFA 2YEMA 5EQ1A 4A9LA 4Y03A 5FE2A 4O77A 1EQFA 5FBXA 2GRCA 4Q0OA 2R10A 2YQDA 2D9EA 4UYEA 4A9HA 2OO1A 3HMHA 4ZQLA 5ENFA 4LRGA 3U5NA 4J3IA 3MB3A 4YC9A 2RI7A 5HENA 3P1EA 3JVLA 3AADA 3UVDA 5EP7A 4IR4A 3JVKA 5EWCA 4XYAA 4LDFA 2R0SA 4N4GA 5FE6A 5JWMA 5EM3A 5CQ5A 5EWVA 4BW1A 2RFJA 4QSRA 5EPSA 5I7XA 4A9JA 4MEPA 4QSVA 4HBXA 3HMFA 2DVSA 4ALGA 3JVMA 3UW9A 5K29A 5ENGA 3QZTA 5EU1A 4YYIA 4HXOA 5D25A 4RVRA 5FH8A 4BW3A 4BW2A 4XY8A 4HXMA 4UYFB 4QEUA 2I8NA 5CFWA 5D3PA 4O7EA 4HXSA 3U5PA 5FG6A 4PY6A 5FE1A 5G4SA 5DW1A 5HQ5A 5F61A 5G4RA 2YDWA 4N4HA 3P1DA 4NRBA 5CP5A 5CU8A 5IGNA 4NRAA 3U5LA 4PTBA 4Z93A 3ONIA 5DKCA 4ZW1A 4N4IA 5EISA 4KV4A 4NR7A 4LYSA 4YATA 4CUSA 5FG5A 4WIVA 5CQAA 5A5NA 4XY9A 5CY9A 5IIDA 5CZGA 4QYDA 5D24A 4QZSA 5A5SA 4KV1A 5ENJA 4UIYA 3QZVA 5FFWA 4PCIA 4YH4A 5CUGA 4O71A 3MXFA 2WP2A 4BJXA 2RNWA 4TQNA 3MB4A 3MULA 5F25A 5DKHA 5DBMA 2F6NA 3FKMX 3LQIA 4CUPA 2YW5A 4NR4A 5A82A 5COIA 5DKDA 4NQNA 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UV4A 5L8TA 4QYLA 4TYLA 5EWDA 5ETBA 5D3NA 5LKXA 3JVJA 4UIZA 2YEKA 1WUMA 5CRMA 4PS5A 4F3IA 4UIWA 4QR5A 4O7CA 4Z1SA 5I89A 5BT5A 3GG3A 1WUGA 5EWWA 2H60A 4LZ2A 5ENBA 4YY4A 1X0JA 4C67A 4QNSA 4QSWA 4YBSA 4MR5A 5CUBA 4A9EA 3SVGA 3Q2EA 4O75A 2G4AA 5F36A 5HQ6A 3D1BA 5EPRA 3G0LA 5ENHA 4CFLA 4HBYA 3UVYA 5CQTA 5F2PA 3AQAA 4IORA 4O7FA 4ZC9A 4NUDA 4QSTA 4QY4A 5CPEA 4YYKA 4TTEA 2RS9B 2E7OA 4UYHA 3O34A 5C89A 5E7DA 5EVAA 5JI8A 5LUUA 4NR8A 5IG6A 5AMFA 5DX4A 5DW2A 3QZSA 2NXBA 5D3LA 2D82A 5I29A 5KTWA 4YABA 5II1A 4MEOA 2DVQA 3Q2FA 1ZS5A 3HMEA 4GPJA 4UYFA 4LYIA 3TLPA 5I1QA 5ACYA 4N4FA 5CS8A 5ENEA 5TB6A 5L99A 4J0SA 2FSAA 5FE9A 5C8GA 1N72A 5CQ4A 5F62A 3K2JA 5D3SA 5DY7A 5LVQA 5D3HA 4QR3A 1ZKRA 4IR5A 5F1LA 4AKGA 4XUAA 5C4QA 3LQHA 4YK0A 4OUFA 4AKNA 4YYJA 4MEQA 5C7NA 4A9IA 4DONA 5L96A 3SVHA 2RNXA 4YYDA 4TT4A 3U5OA 3UV2A 5DLZA 4E96A 4HXNA 5D3TA 4YH3A 4X2IA 4YAXA 4LC2A 3RCWA 5AD2A 5A5PA 5F60A 4NQMA 5AMEA 2R0YA 5E9LA 5HRWA 5A5QA 5E9YA 2OUOA 3D7CA 5FG4A 4O70A 5LVRA 5FFVA 3NXBA 4YYHA 4BHWA 4A9FA 5A83A 4Z6HA 3O35A 3P5OA 5HM0A 2RO1A 4QSXA 5I88A 4HBWA 5E9MA 4J0RA 4LR6A 4QUTA 5J0DA 5IGMA 5H1TA 3P1FA 5CQ7A 5D7XA 5EICA 5F1HA 5E9IA 4A9OA 5HLSA 4QC1A 4PKLA 3O36A 5A7CA 4J1PA 2MJVB 4NYXA 4QUUA 4CUQA 2YELA 5L98A 4AKHA 4TT6A 3VKGA 5D26A 5FB0A 2EJNA 2LSPB 4QSPA 4TU6A 5H85A 5EI4A 5LKUA 2WP1A 5I83A 2DVRA 4HXRA 5I40A 5HRVA 5EGUA 2F6JA 2L85A 4HBVA 3ZYUA 2R0VA 4IOQA 4QBMA 4Z1QA 3O33A 2DVVA 5LJ1A 4CUUA 4WHWA 4UITA 5DFCA 3IU6A 5LJ0A 5HCLA 5FE5A 5L8UA 4NYVA 4QEWA 5E74A 4AI6A 4QB3A 5CUDA 5FH6A 4UYGA 4TU4A 1JSPB 5A81A 5A85A 5ENCA 5CTLA 5FE7A 5LJ2A 5E0RA 5II2A 5EK9A 4XUBA 4BW4A 2I7KA 5EPBA 5KHMA 4NR5A 5H1VA 3I3JA 5FDZA 4O72A 4LYWA 4CUTA 1JM4B 4N3WA 4FLPA 4CURA 5KTUA 2YYNA 1F68A 5E9KA 2OSSA 4HXKA 3UVXA 4A9MA 5CQ3A 5BT4A 5FB1A 2E7NA 5DYXA 4YYNA 5F3AA 5IBNA 4A9KA 5E3GA 3P1CA 4OGIA 4UIVA 4NR6A 3UV5A 4CL9A 3MUKA 4NRCA 5HFRA 5HJCA 5CUCA 4A9NA 5LKZA 3U5MA 5A5OA 2L5EA 3U5JA 4PCEA 5HQ7A 5E3DA 4NR9A 3LXJA 5H1UA 4WHUA 2E3KA 3ERRA 5DYCA 5C87A 4NUEA 3U5KA 4KCXA 4C66A 4O76A 2KTBB 2L84A 5AD3A 3DWYA 4YY6A 2RNYA 5EWHA 5KO4A 5FE4A 5CQ8A 3MQMA 1E6IA 3G0JA 4LZSA 4OGJA 5CQ6A 5EV9A 5DYAA 5HRXA 2DWWA 5FE0A 4O78A 3O37A 4MR3A 4MR4A 5D3RA 5DFDA 4O74A 5C85A 4TT2A 4ALHA 3S92A 4UYDA 5IGKA 4Q0NA 4YYGA 4YBMA 5HEMA 4O7AA 5FE8A 3UVWA 5IGLA 5DYUA 4YBTA 4QSQA 5CRZA 5CUAA 4TZ2A 4NXJA 4MR6A 5DLXA 4NYWA 4Z6IA 4QSUA 4YADA 4CFKA 4IR6A 3LJWA 3LQJA 4QC3A 4IR3A 4LZRA 2N9GA 4QEVA 4UIXA 4CLBA 5D3JA 5CUEA 3DAIA 5D0CA 5ETDA 5A5RA 5E9VA 5LKTA 4IOOA 4NS5A 4HXLA 5KU3A 3S91A 5I7YA 5TCMA 4O7BA 2DKWA 5E73A 4AKIA 5BT3A 4QSSA 5EA1A 4QR4A 5FH7A 5I80A 3VKHA 5HELA 4TS8A 2DATA 4YYMA 5DFBA 5F5ZA 5F63A 4TZ8A 5FE3A 5L97A 4NUCA 5HFQA 5ENIA 4MENA 5FFYA 4UIUA 5I86A 4HXPA 5KTXA 3IU5A 3SVFA 2YEMA 5EQ1A 4A9LA 4Y03A 5FE2A 4O77A 1EQFA 5FBXA 2GRCA 4Q0OA 2R10A 2YQDA 2D9EA 4UYEA 4A9HA 2OO1A 3HMHA 4ZQLA 5ENFA 4LRGA 3U5NA 4J3IA 3MB3A 4YC9A 2RI7A 5HENA 3P1EA 3JVLA 3AADA 3UVDA 5EP7A 4IR4A 3JVKA 5EWCA 4XYAA 4LDFA 1PUOA 2R0SA 4N4GA 5FE6A 5JWMA 5EM3A 5CQ5A 5EWVA 4BW1A 2RFJA 4QSRA 5EPSA 5I7XA 4A9JA 4MEPA 4QSVA 4HBXA 3HMFA 2DVSA 4ALGA 3JVMA 3UW9A 5K29A 5ENGA 3QZTA 5EU1A 4YYIA 4HXOA 5D25A 4RVRA 5FH8A 4BW3A 4BW2A 4XY8A 4HXMA 4UYFB 4QEUA 2I8NA 5CFWA 5D3PA 4O7EA 4HXSA 3U5PA 5FG6A 4PY6A 5FE1A 5G4SA 5DW1A 5HQ5A 5F61A 5G4RA 2YDWA 4N4HA 3P1DA 4NRBA 5CP5A 5CU8A 5IGNA 4NRAA 3U5LA 4PTBA 4Z93A 3ONIA 5DKCA 4ZW1A 4N4IA 5EISA 4KV4A 4NR7A 4LYSA 4YATA 4CUSA 5FG5A 4WIVA 5CQAA 5A5NA 3D1DA 4XY9A 5CY9A 5IIDA 5CZGA 4QYDA 5D24A 4QZSA 5A5SA 4KV1A 5ENJA 4UIYA 3QZVA 5FFWA 4PCIA 4YH4A 5CUGA 4O71A 3MXFA 2WP2A 4BJXA 2RNWA 4TQNA 3MB4A 3MULA 5F25A 5DKHA 5DBMA 2F6NA 3FKMX 3LQIA 4CUPA 2YW5A 4NR4A 5A82A 5COIA 5DKDA 4NQNA 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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