5F1HA

Crystal structure of the brd9 bromodamian in complex with bi-9564.
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKERLLALKRSMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
publication title Structure-Based Design of an in Vivo Active Selective BRD9 Inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 43
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f1hA00
2H60A 4HXMA 4TZ8A 5IBNA 5HQ7A 4NS5A 4MR6A 5L8UA 2R10A 4TT2A 5F60A 4Z6HA 5LVQA 3P1CA 5G4SA 5I86A 5DW2A 4O71A 5A5RA 5EV9A 3LQHA 2YEMA 4QSWA 2G4AA 4J1PA 4HXLA 3AQAA 4MEQA 5D3LA 5F1HA 4YK0A 4ALGA 3U5LA 4O7BA 2L84A 4A9FA 2WP2A 2LSPB 4YYIA 4YBSA 3MXFA 4YH3A 4TU6A 5ENIA 4NR9A 2DVVA 4NR7A 4O78A 4GPJA 5KU3A 4XYAA 3I3JA 5HRVA 4O70A 4BW2A 4TYLA 4IOOA 4TU4A 4E96A 5CUAA 4ZQLA 5CQ3A 4HXRA 5A5QA 3MB4A 2R0VA 4Q0OA 5D3NA 5EU1A 4CUTA 4PS5A 5I89A 5CGPA 4YYHA 5E9LA 4J0SA 5EPBA 2DVQA 4A9MA 4CUPA 5CP5A 5A83A 5FE6A 4ALHA 3D7CA 5DYCA 4Z93A 5EWCA 4YYMA 4QEUA 1ZS5A 5EICA 3SVGA 5D0CA 5A5NA 5I7YA 4O77A 4NYXA 4O74A 4A9KA 4NR5A 3IU5A 4HXOA 3U5KA 5FE2A 4A9NA 5L96A 4NR8A 4PTBA 4QSTA 5HFRA 4NQNA 2L85A 2RFJA 5E73A 4QUUA 5EA1A 4A9HA 4RVRA 4NRAA 5TB6A 1EQFA 4QSXA 2RI7A 4TZ2A 3UVWA 5C8GA 2D9EA 2DATA 3O33A 3JVLA 2D82A 5HELA 4UIWA 4MR3A 5IGKA 3LXJA 5CRZA 3U5OA 4OUFA 5EGUA 4CUQA 4HXKA 2RNXA 5E9IA 5FBXA 5HRWA 5FE4A 4YY4A 4UYEA 5EK9A 5CZGA 3P1DA 5I80A 3G0LA 5DYAA 4DONA 5FE3A 4NYVA 3MUKA 5DBMA 5CQ5A 5ENEA 5F1LA 4BHWA 2GRCA 4NRBA 4IOQA 4O7FA 4WHWA 3HMHA 5I1QA 5CQ8A 5IG6A 5CY9A 5EWDA 2E7OA 3LQIA 5FE8A 2DVSA 5FE1A 4HXPA 5I29A 3ZYUA 4NRCA 5DKDA 5FG4A 4UIXA 4YYDA 4HBVA 4YBMA 2YELA 5EM3A 4YH4A 5D3JA 4OGJA 5FG5A 5COIA 5IGNA 4QR4A 5A5SA 2YW5A 3SVFA 5FDZA 5HLSA 4WIVA 3IU6A 2I7KA 4QEWA 4IR4A 5FE7A 4YADA 2MJVB 2OUOA 5CRMA 4NQMA 3UVDA 3HMFA 5EI4A 4O7CA 3GG3A 4IR5A 5EP7A 2WP1A 5DFCA 3TLPA 4XY8A 5CQAA 5I88A 5TCMA 4BJXA 2FSAA 4YC9A 4YABA 2E7NA 1JSPB 3MB3A 3JVMA 5CS8A 5D3RA 5C4QA 4O76A 4Z6IA 5LJ1A 4YATA 1WUGA 5E9VA 5JWMA 4FLPA 4LZRA 5D25A 5D3TA 5CQTA 4NUDA 4CUSA 4HBYA 3NXBA 5E9KA 5ENFA 4LYWA 5A81A 4IR6A 4LZ2A 4WHUA 5E3GA 2DVRA 5BT4A 5DFBA 4CURA 5KTUA 5FG6A 5H1VA 4TS8A 5K29A 4BW1A 5F61A 4QSRA 4YYGA 5LKUA 5F3AA 4CFLA 4IR3A 4MEOA 4ZC9A 5CFWA 5AD2A 2KTBB 4QZSA 4O75A 5IIDA 4QC3A 5FH6A 5II1A 5KHMA 2DKWA 5HJCA 4YY6A 4OGIA 4PCEA 4MENA 5A82A 5F5ZA 1E6IA 4Y03A 5HRXA 3JVKA 4YYJA 1X0JA 4YAXA 5D7XA 4KCXA 4QBMA 3UVYA 2OSSA 4YBTA 5C87A 5LKXA 5C85A 3RCWA 4QB3A 3P1FA 5D26A 5C89A 5G4RA 5ENHA 4C67A 3UW9A 5EWVA 5C7NA 4UIYA 5DW1A 4HBXA 5D3HA 4A9OA 1N72A 5ACYA 5DLXA 5L98A 5FE0A 3S91A 4PY6A 4O7EA 4PCIA 3Q2EA 5II2A 3FKMX 5I83A 5E9MA 5JI8A 2RS9B 4NUEA 5ETBA 2YEKA 5E3DA 4QEVA 3MQMA 5L97A 3MULA 4QYLA 4N4FA 1JM4B 4MR5A 5DLZA 3P1EA 3S92A 5E9YA 4TTEA 5DY7A 4N4HA 5LJ0A 4UIZA 5FB0A 3UVXA 4LYSA 4TT4A 5ETDA 4QNSA 3U5NA 4LR6A 5EVAA 4CUUA 5ENBA 2RNYA 2NXBA 5DKCA 5EWWA 5AMEA 5CUBA 4NR6A 4UIVA 5DX4A 5F2PA 5ENJA 5FH7A 5HFQA 4QYDA 4CLBA 4MEPA 4LYIA 4UYDA 3K2JA 4A9IA 4BW4A 5F62A 2DWWA 5DFDA 5EWHA 5KTWA 5HENA 5D24A 4BW3A 5IGLA 4O7AA 4XUAA 5D3SA 4UIUA 4Z1SA 5IGMA 5CPEA 4YYKA 5LKZA 4AKNA 5D3PA 3SVHA 3UV5A 5J0DA 4XY9A 4C66A 5HQ6A 5HM0A 4J3IA 3HMEA 5CUEA 3O34A 5EQ1A 4QSVA 3O35A 4O72A 4TQNA 5CUCA 4UYFB 4LZSA 4QSSA 1F68A 5FE9A 3JVJA 5F36A 3G0JA 3LJWA 3LQJA 4QUTA 3Q2FA 4UYHA 4HXNA 5ENCA 2RO1A 5H1TA 5CQ4A 5DYXA 5KO4A 4NYWA 5I7XA 2YDWA 4LDFA 4HBWA 5EISA 5LKTA 4Z1QA 5F25A 3U5PA 3QZSA 4LRGA 2I8NA 4QSPA 5A5PA 5FFWA 5BT5A 2YQDA 4QSQA 3UV4A 5FE5A 4N3WA 4TT6A 2YYNA 4CFKA 2RNWA 4UYGA 5KTXA 3AADA 4YYNA 3O36A 3ONIA 5HCLA 5E0RA 3QZVA 5CUDA 4N4IA 3U5MA 2F6NA 4QC1A 4QR5A 5I40A 5AD3A 4F3IA 5E74A 4IORA 3QZTA 4Q0NA 2N9GA 2OO1A 4KV1A 5DKHA 5CQ7A 5A85A 4A9LA 5HQ5A 5L8TA 5F63A 5FFYA 5EPRA 5DYUA 4MR4A 4QSUA 5L99A 4CL9A 4KV4A 4A9EA 3DWYA 4NR4A 3DAIA 3U5JA 3P5OA 4J0RA 4QY4A 5H1UA 2E3KA 5FFVA 5A5OA 5LVRA 5EPSA 5BT3A 5LUUA 4XUBA 4NUCA 5CU8A 2R0YA 4PKLA 3O37A 2L5EA 5ENGA 5E7DA 5CUGA 4A9JA 5CTLA 5FB1A 4NXJA 4LC2A 5CQ6A 4N4GA 4UYFA 2F6JA 4HXSA 5H85A 4UITA 3UV2A 5LJ2A 4ZW1A 4QR3A 4X2IA 2R0SA 5A7CA 5AMFA 5FH8A 1WUMA 5HEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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