4A9LA

N-terminal bromodomain of human brd4 with 1,3-dimethyl-6-(morpholine- 4-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-2-one
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9lA01
5CTLA 4QSRA 4PCIA 4YYGA 4AKNA 3P1DA 5FE7A 4HXRA 3DAIA 4XY8A 5D0CA 4YYHA 4TZ2A 4YH3A 4O7BA 4TS8A 5E7DA 5FE6A 3U5LA 5F36A 2I7KA 5COIA 3IU5A 5HM0A 3G0JA 4IOQA 4O71A 5KTWA 4MR5A 5E74A 4YADA 4QZSA 5ENIA 2RNXA 5KTUA 5FE2A 5ENCA 5TCMA 4WHWA 2YELA 3LQHA 5EWWA 3U5NA 4QUUA 5H1VA 3U5MA 3UVWA 4Z1QA 5FE9A 4XYAA 4ALGA 5DFDA 3U5KA 5HEMA 5HLSA 4YBTA 4CURA 5FH6A 4O78A 5E73A 4FLPA 4MR6A 4J1PA 3LQJA 5CQ3A 4BHWA 5DKCA 1WUGA 4F3IA 4LDFA 5D3SA 4HBXA 3LXJA 5EP7A 4XUAA 4Q0OA 5A82A 3UVXA 4QYLA 1E6IA 5DKDA 5ETDA 3P1CA 5D26A 4YC9A 5E3DA 5ENBA 5EI4A 5CRMA 5FB0A 5HRVA 4WHUA 4QEWA 3U5PA 3O33A 3GG3A 5LKTA 5CQ5A 3K2JA 4YAXA 3P1FA 5I29A 5FH8A 3U5OA 4UITA 4CLBA 5L99A 5CU8A 5EQ1A 5DBMA 5E9LA 5FE8A 2DKWA 3LJWA 5F2PA 4NXJA 4YYDA 4MEPA 4MENA 2RFJA 4IOOA 5EWHA 4NR6A 5A5QA 5FG5A 5EWCA 5CRZA 4PTBA 4UIYA 4YATA 4CUSA 3O34A 2OO1A 5FBXA 2DVQA 3UV5A 4IR4A 5EPSA 5LUUA 5I80A 4NR5A 4UIUA 5CQAA 5LKZA 3MULA 5CUAA 4PY6A 4MEOA 3Q2FA 5IGKA 4CUUA 4N4GA 5ENGA 3IU6A 5A85A 5DFBA 5IGNA 2R0VA 4NS5A 5LKXA 5F1LA 5A5OA 3MUKA 5KTXA 3NXBA 4YYNA 2RS9B 4O70A 3SVGA 5CQTA 4BW4A 4UIZA 5IIDA 3MB4A 5FH7A 5HRXA 5L98A 4HBYA 4OGIA 4X2IA 5FE5A 4QEUA 4YK0A 5ENFA 5DYCA 2WP1A 5EISA 4QSQA 5LKUA 4QSWA 5D3HA 3S92A 5ENHA 4UYDA 2E7OA 4O76A 4TTEA 5CY9A 5HQ5A 4LYIA 5A5NA 2L85A 1WUMA 4LRGA 5E9MA 2RO1A 5L96A 5KU3A 4MR4A 3RCWA 4J0SA 4O77A 1JSPB 2YEKA 4KV4A 5FG6A 5A5PA 4XY9A 4QSSA 4IR3A 4PS5A 4YBMA 2YEMA 4IORA 4TT6A 3HMEA 4N4FA 5CP5A 5FE0A 3HMFA 4TZ8A 2WP2A 4Z93A 5II2A 5D3PA 5C7NA 2E7NA 5I86A 4Z1SA 5IG6A 4ZQLA 3MB3A 3DWYA 2KTBB 5DYXA 2OUOA 3MQMA 3P1EA 1F68A 4GPJA 5D3NA 4MR3A 5F3AA 4CFKA 2DVSA 4TQNA 4XUBA 5DKHA 5JI8A 5CPEA 5DW2A 2G4AA 4LZSA 5F63A 4C66A 4O7AA 2F6JA 4A9IA 5I88A 4O72A 5H1UA 4YH4A 3O37A 4TT2A 5F62A 4QB3A 5CFWA 4NUCA 5DW1A 5E0RA 5BT4A 2R0YA 3U5JA 4O74A 5DFCA 2RNYA 5F5ZA 4YY4A 4CUTA 5LJ1A 3O35A 5EICA 4NYXA 5I1QA 5CUDA 4OUFA 4A9FA 4BW2A 5C87A 5CUGA 4QY4A 5FE4A 2N9GA 3D7CA 3JVJA 1N72A 5DY7A 5DLZA 4NRCA 3JVKA 4QBMA 4N4HA 5HQ6A 5HFRA 4HXLA 3SVFA 4CL9A 4NR8A 5JWMA 4Z6IA 5LJ2A 4HXOA 5HENA 5C8GA 5IGMA 5FE3A 2YYNA 4DONA 4NRBA 4O7EA 5CQ8A 4YYKA 5DLXA 4E96A 4WIVA 4YABA 3AQAA 5A83A 5CS8A 4A9LA 5A5RA 5LVRA 5CQ6A 1JM4B 4HBVA 2YQDA 4O7CA 3S91A 2NXBA 4J0RA 5F1HA 4RVRA 5H1TA 2F6NA 4HXNA 5I7YA 3LQIA 4BW3A 3FKMX 3SVHA 3QZSA 4A9KA 5AD3A 4QEVA 3HMHA 5ACYA 4IR5A 4NYVA 5ENJA 4OGJA 4UIXA 3UV4A 5CUCA 5FE1A 5E9IA 5FFVA 5E3GA 5EPBA 4HBWA 4A9NA 4QSUA 4UIWA 2YW5A 3G0LA 4J3IA 4HXSA 4A9OA 2RNWA 4ALHA 5D7XA 3UVDA 5I40A 4UYHA 5C89A 4LC2A 4QSTA 5EPRA 5C4QA 4NR9A 5C85A 5E9KA 2RI7A 5E9YA 1EQFA 4O7FA 5ETBA 2DWWA 4TYLA 4Z6HA 5FB1A 4QR3A 5E9VA 4YYIA 2OSSA 5EVAA 5EK9A 5FFYA 4YBSA 5HRWA 4N4IA 5D3RA 5EV9A 5FDZA 3UVYA 4Q0NA 3I3JA 2D9EA 4NYWA 5FFWA 5A7CA 5D3TA 5II1A 5CUBA 3JVLA 4BJXA 2DVVA 4N3WA 4YYMA 4CUQA 5I89A 5DYAA 5A81A 5TB6A 4UYFA 5EA1A 4A9JA 4CUPA 3UW9A 2LSPB 4IR6A 5FG4A 4QC1A 4UYEA 5HFQA 4LR6A 4TT4A 5AD2A 2GRCA 3QZTA 4QR4A 4QUTA 4QYDA 4KCXA 3AADA 4LZRA 3O36A 4QNSA 5CGPA 5K29A 5KO4A 4KV1A 2MJVB 2DATA 5BT3A 4HXMA 5J0DA 5KHMA 4HXKA 4TU6A 4YY6A 5BT5A 5LJ0A 2E3KA 4UYGA 5D3LA 4QSVA 3P5OA 4O75A 5ENEA 5I83A 5EU1A 5HQ7A 5AMFA 5I7XA 2H60A 4NQMA 5L8TA 2R0SA 4BW1A 5A5SA 2DVRA 5G4SA 4PKLA 4UYFB 5L97A 2L5EA 2D82A 4A9EA 4QSPA 1ZS5A 5EWDA 5F60A 3UV2A 4LZ2A 2YDWA 5D3JA 4Y03A 4ZC9A 5EWVA 5EM3A 4C67A 5IGLA 5CZGA 4CFLA 4PCEA 5CQ4A 4QC3A 3ZYUA 4NRAA 2R10A 5L8UA 4MEQA 5EGUA 4QR5A 4QSXA 3JVMA 3MXFA 4LYSA 5CUEA 5D25A 5LVQA 4A9HA 5HJCA 5F61A 5D24A 4HXPA 4TU4A 4ZW1A 4NUEA 5DX4A 3ONIA 5H85A 3Q2EA 1X0JA 2FSAA 4A9MA 4YYJA 3QZVA 5G4RA 4NUDA 5AMEA 5DYUA 4NQNA 5HCLA 5HELA 4NR4A 4LYWA 4NR7A 4UIVA 5IBNA 5F25A 3TLPA 5CQ7A 2I8NA 2L84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CTLA 4QSRA 4PCIA 4YYGA 4AKNA 3P1DA 5FE7A 4HXRA 3DAIA 4XY8A 5D0CA 4YYHA 4TZ2A 4YH3A 4O7BA 4TS8A 5E7DA 5FE6A 3U5LA 5F36A 2I7KA 5COIA 3IU5A 5HM0A 3G0JA 4IOQA 4O71A 5KTWA 4MR5A 5E74A 4YADA 4QZSA 5ENIA 2RNXA 5KTUA 5FE2A 5ENCA 5TCMA 4WHWA 2YELA 3LQHA 5EWWA 3U5NA 4QUUA 5H1VA 3U5MA 3UVWA 4Z1QA 5FE9A 4XYAA 4ALGA 4AI6A 5DFDA 3U5KA 5HEMA 5HLSA 4YBTA 4CURA 5FH6A 4O78A 5E73A 4FLPA 4MR6A 4J1PA 3LQJA 5CQ3A 4BHWA 5DKCA 1WUGA 4F3IA 4LDFA 5D3SA 4HBXA 3LXJA 5EP7A 4XUAA 4Q0OA 5A82A 3UVXA 4QYLA 1E6IA 5DKDA 5ETDA 3P1CA 5D26A 4YC9A 5E3DA 5ENBA 5EI4A 5CRMA 5FB0A 5HRVA 4WHUA 4QEWA 3U5PA 3O33A 3GG3A 5LKTA 5CQ5A 3K2JA 1PUOA 4YAXA 3P1FA 5I29A 5FH8A 3U5OA 4UITA 4CLBA 5L99A 5CU8A 3ERRA 5EQ1A 3VKGA 5DBMA 5E9LA 5FE8A 2DKWA 1ZKRA 3LJWA 5F2PA 4NXJA 4YYDA 4MEPA 4MENA 2RFJA 4IOOA 5EWHA 4NR6A 5A5QA 5FG5A 5EWCA 5CRZA 4PTBA 4UIYA 4YATA 4CUSA 3O34A 2OO1A 5FBXA 2DVQA 3UV5A 4IR4A 5EPSA 5LUUA 5I80A 4NR5A 4UIUA 5CQAA 5LKZA 3MULA 5CUAA 4PY6A 4MEOA 3Q2FA 5IGKA 4CUUA 4N4GA 5ENGA 3IU6A 2EJNA 5A85A 5DFBA 5IGNA 2R0VA 4NS5A 5LKXA 5F1LA 5A5OA 3MUKA 5KTXA 3NXBA 4YYNA 2RS9B 4O70A 3SVGA 5CQTA 4BW4A 4UIZA 5IIDA 3MB4A 5FH7A 5HRXA 5L98A 4HBYA 4OGIA 4X2IA 5FE5A 4QEUA 4YK0A 5ENFA 5DYCA 2WP1A 5EISA 4QSQA 5LKUA 4QSWA 5D3HA 3S92A 5ENHA 4UYDA 2E7OA 4O76A 4TTEA 5CY9A 5HQ5A 4LYIA 5A5NA 2L85A 1WUMA 4LRGA 5E9MA 2RO1A 5L96A 5KU3A 4MR4A 3RCWA 4J0SA 4O77A 1JSPB 2YEKA 4KV4A 5FG6A 5A5PA 4XY9A 4AKIA 4QSSA 4IR3A 4PS5A 4YBMA 2YEMA 4IORA 4TT6A 3HMEA 4N4FA 5CP5A 5FE0A 3HMFA 4TZ8A 2WP2A 4Z93A 5II2A 5D3PA 5C7NA 2E7NA 5I86A 4Z1SA 5IG6A 4ZQLA 3MB3A 3DWYA 2KTBB 5DYXA 2OUOA 3MQMA 3P1EA 1F68A 4GPJA 5D3NA 4MR3A 5F3AA 4CFKA 2DVSA 4TQNA 4XUBA 5DKHA 5JI8A 5CPEA 5DW2A 2G4AA 4LZSA 5F63A 4C66A 4O7AA 2F6JA 4A9IA 5I88A 4O72A 5H1UA 4YH4A 3O37A 4TT2A 5F62A 4QB3A 5CFWA 4NUCA 5DW1A 5E0RA 5BT4A 2R0YA 3U5JA 4O74A 5DFCA 2RNYA 5F5ZA 4YY4A 4CUTA 3VKHA 5LJ1A 3O35A 5EICA 4NYXA 5I1QA 5CUDA 4OUFA 4A9FA 4BW2A 5C87A 5CUGA 4QY4A 5FE4A 2N9GA 3D7CA 3JVJA 1N72A 5DY7A 5DLZA 4NRCA 3JVKA 4QBMA 4N4HA 5HQ6A 5HFRA 4HXLA 3SVFA 4CL9A 4NR8A 5JWMA 4Z6IA 5LJ2A 4HXOA 5HENA 5C8GA 5IGMA 5FE3A 2YYNA 4DONA 4NRBA 4O7EA 5CQ8A 4YYKA 5DLXA 4E96A 4WIVA 4YABA 3AQAA 5A83A 5CS8A 4A9LA 5A5RA 5LVRA 5CQ6A 1JM4B 4HBVA 2YQDA 4O7CA 3S91A 2NXBA 4J0RA 5F1HA 4RVRA 5H1TA 2F6NA 4HXNA 5I7YA 3LQIA 4BW3A 3FKMX 3SVHA 3QZSA 4A9KA 5AD3A 4QEVA 3HMHA 5ACYA 4IR5A 4NYVA 5ENJA 4OGJA 4UIXA 3UV4A 5CUCA 5FE1A 5E9IA 5FFVA 5E3GA 5EPBA 4HBWA 4A9NA 4QSUA 4UIWA 2YW5A 3G0LA 4J3IA 4HXSA 4A9OA 2RNWA 4ALHA 5D7XA 3UVDA 5I40A 4UYHA 5C89A 4LC2A 4QSTA 5EPRA 5C4QA 4NR9A 5C85A 5E9KA 2RI7A 5E9YA 1EQFA 4O7FA 5ETBA 2DWWA 4TYLA 4Z6HA 5FB1A 4QR3A 5E9VA 4YYIA 2OSSA 5EVAA 5EK9A 5FFYA 4YBSA 5HRWA 4N4IA 5D3RA 5EV9A 5FDZA 3UVYA 4Q0NA 3I3JA 2D9EA 4NYWA 5FFWA 5A7CA 5D3TA 5II1A 5CUBA 3JVLA 3D1BA 4BJXA 2DVVA 4N3WA 4YYMA 4CUQA 5I89A 5DYAA 5A81A 5TB6A 4UYFA 4AKGA 5EA1A 4A9JA 4CUPA 3UW9A 2LSPB 4IR6A 5FG4A 4QC1A 4UYEA 5HFQA 4LR6A 4TT4A 5AD2A 2GRCA 3QZTA 4QR4A 4QUTA 4QYDA 4KCXA 3AADA 4LZRA 3O36A 4QNSA 5CGPA 5K29A 5KO4A 4KV1A 2MJVB 2DATA 5BT3A 4HXMA 5J0DA 5KHMA 4HXKA 4TU6A 4YY6A 5BT5A 5LJ0A 2E3KA 4UYGA 5D3LA 4QSVA 3P5OA 4O75A 5ENEA 5I83A 3D1DA 5EU1A 5HQ7A 5AMFA 5I7XA 2H60A 4NQMA 5L8TA 2R0SA 4BW1A 5A5SA 2DVRA 5G4SA 4PKLA 4UYFB 5L97A 2L5EA 2D82A 4A9EA 4QSPA 1ZS5A 5EWDA 5F60A 3UV2A 4LZ2A 2YDWA 5D3JA 4Y03A 4ZC9A 5EWVA 5EM3A 4C67A 5IGLA 5CZGA 4CFLA 4PCEA 5CQ4A 4QC3A 3ZYUA 4NRAA 2R10A 5L8UA 4MEQA 5EGUA 4AKHA 4QR5A 4QSXA 3JVMA 3MXFA 4LYSA 5CUEA 5D25A 5LVQA 4A9HA 5HJCA 5F61A 5D24A 4HXPA 4TU4A 4ZW1A 4NUEA 5DX4A 3ONIA 5H85A 3Q2EA 1X0JA 2FSAA 4A9MA 4YYJA 3QZVA 5G4RA 4NUDA 5AMEA 5DYUA 4NQNA 5HCLA 5HELA 4NR4A 4LYWA 4NR7A 4UIVA 5IBNA 5F25A 3TLPA 5CQ7A 2I8NA 2L84A
chains in the Genus database with same CATH topology
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