4A9LA

N-terminal bromodomain of human brd4 with 1,3-dimethyl-6-(morpholine- 4-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-2-one
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9lA01
3UVDA 3MB4A 3IU6A 5EPRA 4CL9A 4Y03A 4BW2A 5FH6A 5DYCA 2DATA 5DKCA 4Z6IA 4PKLA 5AD2A 4NUDA 3LJWA 3O34A 5AMEA 4OUFA 3U5JA 5CQ3A 4YYDA 4TU4A 3JVMA 5CQ7A 4PS5A 4UYHA 5D26A 4O76A 4CFKA 4CUTA 5D3JA 4YABA 4YYKA 4QSPA 5COIA 2L85A 4J0SA 3G0JA 4HXOA 5I29A 5D24A 4CUPA 5L96A 4Z1SA 4UYFA 5FB1A 2DKWA 3LQJA 4TT6A 4YH4A 4QB3A 5D3RA 3QZSA 5A5SA 4LC2A 5EA1A 5II2A 4YY4A 4MR5A 5CU8A 5FE2A 5F3AA 2WP1A 4O74A 4YYMA 5EGUA 5FE4A 4QEVA 3SVFA 4QUTA 4BW4A 4YATA 5JI8A 5ETBA 1WUMA 4A9HA 3AADA 5ENGA 5FG4A 5D25A 5DX4A 4F3IA 5F63A 4IR5A 4QR3A 4IR4A 5DYAA 4LZRA 5IG6A 3UVXA 4XYAA 3K2JA 5CQ4A 4YAXA 5F36A 4HBYA 5EISA 4TTEA 5KO4A 2YYNA 5I80A 5EI4A 5D3LA 5EWVA 5FFVA 5D3PA 4PCEA 5AD3A 5HEMA 5CTLA 4QSSA 5HM0A 5HFQA 4QYLA 5DFDA 2RNXA 4QBMA 2D82A 5A85A 2OSSA 4NR5A 4KV1A 5FE7A 4WHUA 3UV5A 4DONA 2DWWA 5DKDA 5F60A 2MJVB 4YBSA 5IIDA 5D3SA 4YC9A 5E73A 2L5EA 4O7BA 5IGMA 5DW1A 4J1PA 3O36A 5LKXA 4YBTA 5I1QA 5DY7A 2KTBB 5F5ZA 4ZW1A 5E9LA 4A9OA 2I7KA 4TZ8A 2DVQA 4QUUA 5EM3A 5JWMA 3ONIA 5I7YA 5F62A 3HMFA 5IGNA 4QR4A 4A9FA 5IGLA 5A83A 3HMEA 4PY6A 2L84A 5J0DA 2NXBA 4IOOA 5F2PA 4UIWA 5HLSA 4GPJA 4N4HA 5CUBA 4CFLA 2F6JA 4LRGA 1JSPB 4UYEA 5E9YA 4LR6A 3MUKA 3DWYA 5ETDA 5H1VA 4CLBA 4ZQLA 5A5NA 5HCLA 5HRXA 5I83A 4PCIA 5FBXA 5CPEA 4J3IA 4KV4A 4BW1A 5CQ6A 5F1LA 5L98A 4TQNA 5LJ1A 5HENA 5ENCA 2DVSA 4IOQA 4O77A 4TS8A 4C66A 3I3JA 5LUUA 5KTXA 2F6NA 5CUGA 4UYDA 4LYWA 4NYWA 5EWWA 5FDZA 5D3NA 4LYIA 5A82A 4PTBA 5DYXA 3MQMA 4QYDA 3FKMX 5LVQA 5TCMA 3U5PA 5C87A 5IGKA 5E9KA 3GG3A 5ENIA 5BT3A 4QZSA 4CURA 4XUBA 4CUSA 5A5OA 3MULA 2FSAA 4O72A 3JVLA 4HXMA 2YDWA 4BHWA 2WP2A 5CUAA 2OUOA 4N4IA 5E7DA 5ENHA 5L8TA 5KU3A 4HXPA 4NRAA 4RVRA 5HRWA 3U5OA 4HBWA 5FE5A 5I86A 5KHMA 5FB0A 3LQIA 3NXBA 4MEQA 4Z93A 4XY9A 5FFWA 5LJ2A 4A9LA 4YYJA 5EV9A 3G0LA 3ZYUA 3SVGA 5C8GA 4YYGA 4TT4A 5ENJA 5E9VA 5CS8A 2E3KA 5C4QA 4O7AA 4MEOA 5FE0A 4MENA 1WUGA 4QSRA 5BT5A 5LKTA 5D3TA 4UYGA 5FG5A 5C89A 5LJ0A 4NYVA 4QR5A 5EWCA 4XY8A 3UVYA 5F25A 2E7OA 5FE9A 5EP7A 4CUUA 5EWHA 5II1A 2YEKA 2RNYA 4QNSA 4BJXA 4NS5A 5E9IA 1E6IA 3P1DA 3UW9A 4ZC9A 5CZGA 4A9JA 5CUEA 1X0JA 4UIZA 5H1UA 2LSPB 5FE3A 4HXKA 2R10A 5FFYA 4NR4A 5G4SA 3SVHA 2RNWA 3MXFA 4UIYA 4CUQA 5A81A 4TZ2A 4NQMA 3UV2A 3QZTA 2OO1A 4A9NA 4LYSA 5EPBA 3LXJA 4LZSA 5EWDA 3D7CA 5CRZA 5L8UA 5KTUA 5CQ5A 3UVWA 4BW3A 4QSVA 4QC1A 5C85A 4ALGA 4N4FA 4E96A 5DKHA 5HJCA 4FLPA 5D3HA 4UITA 5E9MA 5LKUA 4KCXA 5CGPA 5FG6A 5EU1A 5ENBA 3U5MA 4YBMA 3O33A 2G4AA 1ZS5A 5K29A 2YELA 5CFWA 2H60A 4HXNA 4A9KA 4N4GA 3UV4A 5I40A 2RO1A 4UYFB 3MB3A 4TYLA 5DFBA 3HMHA 3S91A 5ACYA 4QSXA 5BT4A 4TU6A 5DLXA 4QC3A 4Z1QA 4NR7A 3P5OA 4QSTA 5HRVA 5HQ6A 4NRBA 5EVAA 4NR8A 4HXRA 4MEPA 4NR6A 5L99A 3JVKA 4NQNA 5E0RA 2RS9B 4QSWA 4MR4A 4UIUA 4NUEA 5EQ1A 5FE8A 5I88A 3QZVA 5L97A 3U5LA 2I8NA 5I89A 2RFJA 2R0YA 2YW5A 3U5NA 4O7EA 4UIVA 5EK9A 2YEMA 4X2IA 4A9MA 4QEUA 5A5QA 5TB6A 4O78A 2R0SA 1JM4B 5IBNA 5EPSA 3Q2EA 5CQTA 4O75A 3U5KA 5EICA 1N72A 5A7CA 4NRCA 4Q0NA 2D9EA 5LKZA 4HBXA 4UIXA 4MR6A 4YH3A 4O7FA 3P1EA 5CQ8A 5ENFA 5FE1A 5HQ5A 4Z6HA 4NR9A 3AQAA 3LQHA 4ALHA 5DLZA 5C7NA 4QY4A 5AMFA 5F61A 4LZ2A 3O35A 4NUCA 4QSUA 5I7XA 5D0CA 4NXJA 5A5PA 4IR3A 5DBMA 4IORA 4QSQA 5CUCA 5G4RA 5DW2A 5H85A 3IU5A 2YQDA 5DYUA 4YADA 4HXLA 5HQ7A 5KTWA 1EQFA 1F68A 4Q0OA 3DAIA 5E3DA 2DVVA 2RI7A 4YY6A 5LVRA 3Q2FA 3P1FA 4HBVA 2DVRA 4HXSA 5D7XA 4WIVA 4MR3A 3RCWA 5HELA 5FH7A 2GRCA 3TLPA 2R0VA 3O37A 4A9EA 4C67A 4XUAA 4IR6A 2N9GA 5CQAA 4TT2A 2E7NA 5H1TA 5E3GA 5FH8A 4OGJA 4NYXA 4O70A 4YYNA 4WHWA 4QEWA 5F1HA 4YYIA 5FE6A 4N3WA 5ENEA 3JVJA 4LDFA 4A9IA 4O7CA 5CP5A 5CUDA 5E74A 5A5RA 4J0RA 5HFRA 4YYHA 5DFCA 3P1CA 4OGIA 3S92A 4AKNA 4O71A 5CY9A 5CRMA 4YK0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UVDA 3MB4A 3IU6A 5EPRA 4CL9A 4Y03A 4BW2A 5FH6A 5DYCA 2DATA 5DKCA 4Z6IA 4PKLA 3D1BA 5AD2A 4NUDA 3LJWA 3O34A 5AMEA 4OUFA 3U5JA 5CQ3A 4YYDA 4TU4A 3JVMA 5CQ7A 4PS5A 4UYHA 5D26A 4O76A 4CFKA 4CUTA 5D3JA 4YABA 4YYKA 4QSPA 5COIA 2L85A 4J0SA 3G0JA 4HXOA 5I29A 5D24A 4CUPA 1ZKRA 5L96A 4Z1SA 4UYFA 5FB1A 2DKWA 3LQJA 4TT6A 4YH4A 4QB3A 5D3RA 3QZSA 5A5SA 4LC2A 5EA1A 5II2A 4YY4A 4MR5A 5CU8A 5FE2A 5F3AA 2WP1A 4O74A 4YYMA 5EGUA 5FE4A 4QEVA 3SVFA 4QUTA 3VKHA 4BW4A 4YATA 5JI8A 5ETBA 1WUMA 4A9HA 3AADA 5ENGA 5FG4A 5D25A 5DX4A 4F3IA 5F63A 4IR5A 4QR3A 4IR4A 5DYAA 4LZRA 5IG6A 3UVXA 4XYAA 3K2JA 5CQ4A 4YAXA 5F36A 4HBYA 5EISA 4TTEA 5KO4A 2YYNA 5I80A 5EI4A 5D3LA 1PUOA 5EWVA 5FFVA 5D3PA 4PCEA 5AD3A 5HEMA 5CTLA 4QSSA 5HM0A 5HFQA 4QYLA 5DFDA 2RNXA 4QBMA 2D82A 5A85A 2OSSA 4NR5A 4KV1A 5FE7A 4WHUA 3UV5A 4DONA 2DWWA 5DKDA 5F60A 2MJVB 4YBSA 5IIDA 5D3SA 4YC9A 5E73A 2L5EA 4O7BA 5IGMA 5DW1A 4J1PA 3O36A 5LKXA 4YBTA 5I1QA 5DY7A 2KTBB 5F5ZA 4ZW1A 5E9LA 4A9OA 2I7KA 4TZ8A 2DVQA 4QUUA 5EM3A 5JWMA 3ONIA 5I7YA 5F62A 3HMFA 5IGNA 4QR4A 4A9FA 5IGLA 5A83A 3HMEA 4PY6A 2L84A 5J0DA 2NXBA 4IOOA 5F2PA 4UIWA 5HLSA 4GPJA 4N4HA 5CUBA 4CFLA 2F6JA 4LRGA 1JSPB 4UYEA 5E9YA 4LR6A 3MUKA 3DWYA 5ETDA 5H1VA 4CLBA 4ZQLA 5A5NA 5HCLA 5HRXA 3ERRA 5I83A 4PCIA 5FBXA 5CPEA 4J3IA 4KV4A 4BW1A 5CQ6A 5F1LA 5L98A 4TQNA 5LJ1A 5HENA 5ENCA 2DVSA 4IOQA 4O77A 4TS8A 4C66A 3I3JA 5LUUA 5KTXA 2F6NA 5CUGA 4UYDA 4LYWA 4NYWA 5EWWA 5FDZA 5D3NA 4LYIA 5A82A 4PTBA 5DYXA 3MQMA 4QYDA 3FKMX 5LVQA 5TCMA 3U5PA 5C87A 5IGKA 5E9KA 3GG3A 5ENIA 5BT3A 4QZSA 4CURA 4XUBA 4CUSA 5A5OA 3MULA 2FSAA 4O72A 3JVLA 4HXMA 2YDWA 4BHWA 2WP2A 5CUAA 2OUOA 4N4IA 5E7DA 5ENHA 5L8TA 5KU3A 4HXPA 4NRAA 4RVRA 5HRWA 3U5OA 4HBWA 5FE5A 5I86A 5KHMA 5FB0A 3LQIA 3NXBA 4MEQA 4Z93A 4XY9A 5FFWA 5LJ2A 4A9LA 4YYJA 5EV9A 3G0LA 3ZYUA 3SVGA 5C8GA 4YYGA 4TT4A 5ENJA 5E9VA 5CS8A 2E3KA 5C4QA 4O7AA 4MEOA 5FE0A 4MENA 1WUGA 4QSRA 5BT5A 5LKTA 5D3TA 4UYGA 5FG5A 5C89A 5LJ0A 4NYVA 4QR5A 5EWCA 4XY8A 3UVYA 5F25A 2E7OA 5FE9A 3VKGA 5EP7A 4CUUA 5EWHA 5II1A 2YEKA 2RNYA 4QNSA 4BJXA 4NS5A 5E9IA 1E6IA 3P1DA 3UW9A 4ZC9A 2EJNA 5CZGA 4A9JA 5CUEA 1X0JA 4UIZA 5H1UA 2LSPB 5FE3A 4HXKA 2R10A 5FFYA 4NR4A 5G4SA 3D1DA 3SVHA 2RNWA 3MXFA 4UIYA 4CUQA 5A81A 4TZ2A 4NQMA 3UV2A 3QZTA 2OO1A 4A9NA 4LYSA 5EPBA 3LXJA 4LZSA 5EWDA 3D7CA 5CRZA 5L8UA 5KTUA 5CQ5A 3UVWA 4BW3A 4QSVA 4QC1A 5C85A 4ALGA 4N4FA 4E96A 5DKHA 5HJCA 4FLPA 5D3HA 4UITA 5E9MA 5LKUA 4KCXA 5CGPA 5FG6A 5EU1A 5ENBA 3U5MA 4YBMA 3O33A 2G4AA 1ZS5A 5K29A 2YELA 5CFWA 2H60A 4HXNA 4A9KA 4N4GA 3UV4A 5I40A 2RO1A 4UYFB 3MB3A 4TYLA 5DFBA 3HMHA 3S91A 5ACYA 4QSXA 5BT4A 4TU6A 5DLXA 4QC3A 4Z1QA 4NR7A 3P5OA 4QSTA 5HRVA 5HQ6A 4NRBA 5EVAA 4NR8A 4HXRA 4MEPA 4NR6A 5L99A 4AKGA 3JVKA 4NQNA 5E0RA 2RS9B 4QSWA 4MR4A 4UIUA 4NUEA 5EQ1A 5FE8A 5I88A 3QZVA 5L97A 3U5LA 2I8NA 5I89A 2RFJA 2R0YA 2YW5A 3U5NA 4O7EA 4UIVA 5EK9A 2YEMA 4X2IA 4A9MA 4QEUA 5A5QA 5TB6A 4O78A 2R0SA 1JM4B 5IBNA 5EPSA 3Q2EA 5CQTA 4O75A 3U5KA 5EICA 1N72A 5A7CA 4NRCA 4Q0NA 2D9EA 5LKZA 4HBXA 4UIXA 4MR6A 4YH3A 4O7FA 3P1EA 5CQ8A 5ENFA 5FE1A 5HQ5A 4Z6HA 4NR9A 3AQAA 3LQHA 4AKIA 4ALHA 5DLZA 5C7NA 4QY4A 5AMFA 5F61A 4LZ2A 3O35A 4NUCA 4QSUA 5I7XA 5D0CA 4NXJA 5A5PA 4IR3A 5DBMA 4IORA 4QSQA 5CUCA 5G4RA 5DW2A 5H85A 3IU5A 2YQDA 5DYUA 4YADA 4HXLA 5HQ7A 5KTWA 1EQFA 1F68A 4Q0OA 3DAIA 5E3DA 2DVVA 2RI7A 4YY6A 5LVRA 3Q2FA 3P1FA 4HBVA 2DVRA 4HXSA 5D7XA 4WIVA 4MR3A 3RCWA 5HELA 5FH7A 2GRCA 3TLPA 2R0VA 3O37A 4A9EA 4C67A 4XUAA 4IR6A 2N9GA 5CQAA 4TT2A 2E7NA 5H1TA 5E3GA 5FH8A 4OGJA 4NYXA 4O70A 4AKHA 4YYNA 4WHWA 4QEWA 5F1HA 4YYIA 4AI6A 5FE6A 4N3WA 5ENEA 3JVJA 4LDFA 4A9IA 4O7CA 5CP5A 5CUDA 5E74A 5A5RA 4J0RA 5HFRA 4YYHA 5DFCA 3P1CA 4OGIA 3S92A 4AKNA 4O71A 5CY9A 5CRMA 4YK0A
chains in the Genus database with same CATH topology
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