4A9LA

N-terminal bromodomain of human brd4 with 1,3-dimethyl-6-(morpholine- 4-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-2-one
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9lA01
4NUDA 5CUCA 5CZGA 5L8TA 4IOQA 5FE2A 5CY9A 2L85A 4O7BA 5I40A 2L84A 4HXRA 4XY8A 4UYEA 4Z6IA 5J0DA 4NRAA 1X0JA 5LKTA 5L99A 4YBMA 4C67A 5F5ZA 5EV9A 5D3PA 2DKWA 5FE1A 4QY4A 4QSPA 4CUPA 4YYIA 4YY6A 4NQMA 3D7CA 5ENIA 4A9EA 4YYHA 5DFCA 5I83A 5HENA 4Y03A 5LJ1A 4TZ8A 5HFQA 4HBYA 4A9OA 5HJCA 4QC3A 5LVRA 3I3JA 4HBWA 5KHMA 3UVWA 5ENEA 4TT6A 2G4AA 5CP5A 5BT3A 5FG4A 5ENHA 5CTLA 5L96A 4TTEA 5F63A 2WP1A 4HXKA 2FSAA 3UVYA 4J3IA 3ONIA 2YEKA 4MEPA 5FE4A 5IGLA 5FE7A 4QBMA 4LZ2A 5LJ2A 4A9LA 5I7YA 4XYAA 5HEMA 5CUGA 4QSWA 3U5MA 5E9YA 5DKCA 4CFLA 5DKDA 4WIVA 4TYLA 4NR4A 4KCXA 3RCWA 5EK9A 5G4SA 5CRMA 3U5JA 5D7XA 4YABA 4NYWA 4UYGA 4YYDA 5A7CA 5CPEA 4E96A 4Z1QA 5HM0A 5DFBA 5D3RA 5CU8A 5C85A 2D82A 4OGJA 3JVLA 5DW2A 4BW3A 5ENFA 3S92A 1EQFA 2H60A 2E3KA 5FE0A 1F68A 4ZQLA 4DONA 4UYDA 5II2A 4Q0OA 5E9VA 2RFJA 3DAIA 4QB3A 5DW1A 5EA1A 4PTBA 4LYIA 5A5PA 5CQAA 2E7OA 5DLXA 2WP2A 5A82A 4A9IA 4CUUA 3MB3A 5L98A 5EPRA 4YYJA 2DVRA 2DWWA 5EWDA 5A81A 5D0CA 3U5NA 4N4HA 3UVXA 4QYDA 4LYWA 5E7DA 2YELA 3FKMX 5COIA 5LKZA 5KTXA 5D3NA 5IG6A 4IR3A 4TU6A 4PKLA 4PS5A 3P1FA 3O33A 5AD2A 3P1EA 5F62A 4YADA 4FLPA 3G0JA 5I1QA 4J0RA 4CURA 5I80A 5LJ0A 5EVAA 4GPJA 5FBXA 5CUAA 5TB6A 5E73A 4Z1SA 5EU1A 4QSVA 4WHUA 5ENCA 5LUUA 5FE9A 4ALGA 4BW2A 5FG6A 5A83A 4CUQA 3SVGA 4OUFA 4O7FA 4NYXA 2OO1A 1ZS5A 4IR5A 4RVRA 3GG3A 4CUSA 5H1VA 2YQDA 5DYCA 4MR5A 5E9IA 5CS8A 5CQ5A 2F6NA 4YYMA 5F1LA 4UYFA 4QEUA 5CQ3A 5D3HA 4O74A 4NXJA 5EGUA 5FH6A 4Q0NA 5A5RA 5EWWA 2F6JA 1N72A 4A9FA 5FFYA 5CFWA 3TLPA 5C8GA 5EI4A 5HLSA 4QSQA 5HELA 5II1A 5JWMA 1E6IA 4TT4A 4C66A 4IOOA 5D3JA 2RNXA 4NS5A 5CUEA 5F61A 4NR9A 2R0SA 2L5EA 5D25A 5FE5A 5DBMA 5HRVA 3JVMA 3MB4A 4YH4A 5HQ7A 5E74A 5HQ5A 5FFWA 5TCMA 5AMEA 3P1CA 3Q2FA 4HBXA 5CQ4A 3SVFA 4NQNA 5KO4A 4NR6A 4UITA 4QZSA 5FDZA 5H1TA 4QR5A 5L97A 4YAXA 5DYAA 5CQ7A 2OUOA 2MJVB 5F2PA 4NR8A 4CUTA 2I8NA 5LKXA 2RI7A 5EWVA 5IGMA 4N4FA 4TS8A 5IBNA 4UYHA 4BW1A 5A5QA 3HMHA 5ACYA 5JI8A 1JSPB 4O71A 2RO1A 5ENGA 2DATA 4N4GA 3P1DA 4LZRA 4LR6A 5EWCA 3QZTA 3IU5A 5IGNA 2YEMA 5L8UA 4QUTA 3U5PA 5F1HA 5FG5A 5IIDA 3MQMA 4HBVA 4NR7A 4XY9A 4BW4A 1WUMA 3NXBA 4HXNA 4MR6A 2OSSA 5DYXA 4AKNA 5EICA 5I89A 4O72A 5AD3A 5D24A 4UIUA 3LQJA 4LRGA 5BT4A 5KTUA 4IORA 4NUEA 4QYLA 4YBSA 4QEVA 3O34A 4X2IA 5FH7A 5E3GA 5CQ6A 4XUAA 5E9MA 5FE8A 5I29A 3O36A 5C87A 1WUGA 5I7XA 3SVHA 2GRCA 5CUDA 4J0SA 4TQNA 3P5OA 4O7CA 5EPSA 2RNWA 5ENBA 5D3SA 5A85A 4ZC9A 3Q2EA 4O76A 5H1UA 5EISA 2I7KA 5FFVA 4LDFA 3UW9A 3MUKA 5A5SA 5ETDA 4QUUA 4CL9A 4ZW1A 5I88A 4N4IA 2R0YA 5ENJA 5BT5A 5C4QA 4O70A 3IU6A 4YC9A 5HQ6A 4HXOA 4QSSA 4HXSA 4HXMA 3HMEA 3DWYA 5G4RA 3U5LA 4YH3A 4HXLA 4N3WA 4NYVA 5DFDA 5I86A 5F60A 2DVQA 3U5OA 4LC2A 4NR5A 2RNYA 3S91A 1JM4B 4CFKA 4UIWA 4CLBA 4MEQA 5H85A 4O78A 2NXBA 5CGPA 4A9MA 3MXFA 5A5NA 5C7NA 4ALHA 3O37A 4MENA 4UIYA 2YDWA 4A9NA 4YATA 5KTWA 3QZVA 5D3LA 4QEWA 5CQ8A 5DYUA 3LQHA 4YK0A 3AADA 4TZ2A 4A9JA 5FE3A 3HMFA 5E3DA 4A9HA 5F36A 5HRXA 5DX4A 4YYKA 4F3IA 4UYFB 5KU3A 2LSPB 3MULA 5FB1A 5CRZA 4UIVA 3UV4A 4O77A 3JVKA 4XUBA 5D3TA 4YYNA 5EP7A 4PY6A 5E0RA 4HXPA 5HFRA 5LKUA 3G0LA 4QC1A 4Z93A 5CUBA 4A9KA 5DY7A 4YYGA 4PCEA 3LQIA 4LZSA 4IR6A 4MR3A 2N9GA 4Z6HA 2RS9B 2D9EA 5D26A 3U5KA 5E9KA 5FB0A 3UV2A 5HCLA 4YBTA 3O35A 3LJWA 5A5OA 2R10A 3JVJA 5EWHA 4J1PA 5ETBA 2KTBB 5K29A 4QSUA 3UVDA 2DVSA 2YW5A 3QZSA 4KV4A 4MEOA 3UV5A 2E7NA 4LYSA 4BJXA 5E9LA 3ZYUA 4O7AA 4NUCA 4O7EA 5EQ1A 4UIZA 5LVQA 5IGKA 2R0VA 4NRBA 4KV1A 3AQAA 4PCIA 4NRCA 4QR4A 4QSTA 4OGIA 4O75A 5HRWA 4MR4A 5AMFA 5F25A 4TT2A 4UIXA 5CQTA 5EPBA 4YY4A 4WHWA 4QSRA 5C89A 5FH8A 5DKHA 2DVVA 4QSXA 4IR4A 4QNSA 4QR3A 4TU4A 5FE6A 4BHWA 2YYNA 3LXJA 5F3AA 5EM3A 3K2JA 5DLZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NUDA 5CUCA 5CZGA 5L8TA 4IOQA 5FE2A 5CY9A 2L85A 4O7BA 5I40A 2L84A 4HXRA 4XY8A 4UYEA 4Z6IA 5J0DA 4NRAA 1X0JA 5LKTA 5L99A 4YBMA 4C67A 5F5ZA 5EV9A 5D3PA 2DKWA 5FE1A 4QY4A 4QSPA 4CUPA 4YYIA 4YY6A 4NQMA 3D7CA 5ENIA 4A9EA 4YYHA 5DFCA 5I83A 5HENA 4Y03A 5LJ1A 4TZ8A 5HFQA 4HBYA 4A9OA 5HJCA 4QC3A 5LVRA 3I3JA 4HBWA 5KHMA 3UVWA 5ENEA 4TT6A 2G4AA 5CP5A 5BT3A 5FG4A 5ENHA 5CTLA 5L96A 4TTEA 5F63A 2WP1A 4HXKA 2FSAA 3UVYA 4J3IA 3ONIA 2YEKA 1PUOA 4MEPA 5FE4A 5IGLA 5FE7A 4QBMA 4LZ2A 5LJ2A 4A9LA 5I7YA 4XYAA 5HEMA 5CUGA 4QSWA 3U5MA 5E9YA 5DKCA 4CFLA 5DKDA 4WIVA 4TYLA 4NR4A 4KCXA 3RCWA 5EK9A 5G4SA 5CRMA 3U5JA 5D7XA 4YABA 4NYWA 4UYGA 4YYDA 5A7CA 5CPEA 4E96A 4Z1QA 5HM0A 5DFBA 5D3RA 5CU8A 5C85A 2D82A 4OGJA 3JVLA 5DW2A 4BW3A 5ENFA 3S92A 1EQFA 2H60A 2E3KA 5FE0A 2EJNA 1F68A 4ZQLA 4DONA 4UYDA 5II2A 4Q0OA 5E9VA 2RFJA 3DAIA 4QB3A 5DW1A 5EA1A 4PTBA 4LYIA 5A5PA 5CQAA 2E7OA 5DLXA 2WP2A 5A82A 4A9IA 4CUUA 3MB3A 5L98A 5EPRA 4YYJA 2DVRA 2DWWA 5EWDA 5A81A 5D0CA 3U5NA 4N4HA 3UVXA 4QYDA 4LYWA 5E7DA 2YELA 3FKMX 5COIA 5LKZA 5KTXA 5D3NA 5IG6A 4IR3A 4TU6A 4PKLA 4PS5A 3P1FA 3O33A 5AD2A 3P1EA 3D1BA 5F62A 4YADA 4FLPA 3G0JA 5I1QA 4J0RA 4CURA 5I80A 5LJ0A 5EVAA 4GPJA 5FBXA 5CUAA 5TB6A 5E73A 4Z1SA 3D1DA 5EU1A 4QSVA 4WHUA 5ENCA 5LUUA 5FE9A 4ALGA 4BW2A 5FG6A 5A83A 4CUQA 3SVGA 4OUFA 4O7FA 4NYXA 2OO1A 1ZS5A 4IR5A 4RVRA 3GG3A 4CUSA 5H1VA 2YQDA 5DYCA 4MR5A 5E9IA 5CS8A 5CQ5A 2F6NA 4YYMA 5F1LA 4UYFA 4QEUA 5CQ3A 5D3HA 3VKHA 4O74A 4NXJA 5EGUA 5FH6A 4Q0NA 5A5RA 5EWWA 2F6JA 1N72A 4A9FA 5FFYA 5CFWA 3TLPA 5C8GA 5EI4A 5HLSA 4QSQA 5HELA 5II1A 5JWMA 1E6IA 4TT4A 4C66A 4IOOA 5D3JA 2RNXA 4NS5A 5CUEA 5F61A 4NR9A 2R0SA 2L5EA 5D25A 5FE5A 5DBMA 5HRVA 3JVMA 3MB4A 4YH4A 5HQ7A 5E74A 5HQ5A 5FFWA 5TCMA 5AMEA 3P1CA 3Q2FA 4HBXA 5CQ4A 3SVFA 4NQNA 5KO4A 4NR6A 4UITA 4QZSA 5FDZA 5H1TA 4QR5A 5L97A 4YAXA 5DYAA 5CQ7A 2OUOA 4AI6A 2MJVB 5F2PA 4NR8A 4CUTA 2I8NA 5LKXA 2RI7A 5EWVA 5IGMA 4N4FA 4TS8A 5IBNA 4UYHA 4BW1A 5A5QA 3HMHA 5ACYA 5JI8A 1JSPB 4O71A 2RO1A 5ENGA 2DATA 4N4GA 3P1DA 4LZRA 4LR6A 5EWCA 3QZTA 3IU5A 5IGNA 2YEMA 5L8UA 4QUTA 3U5PA 5F1HA 5FG5A 5IIDA 3ERRA 3MQMA 4HBVA 4NR7A 4XY9A 4BW4A 1WUMA 3NXBA 4HXNA 4MR6A 2OSSA 5DYXA 4AKNA 5EICA 5I89A 4O72A 5AD3A 5D24A 4UIUA 3LQJA 4LRGA 5BT4A 5KTUA 4IORA 4NUEA 4QYLA 4YBSA 4QEVA 3O34A 4X2IA 5FH7A 5E3GA 5CQ6A 4XUAA 5E9MA 5FE8A 5I29A 3O36A 5C87A 1WUGA 5I7XA 3SVHA 2GRCA 5CUDA 4J0SA 4TQNA 1ZKRA 3P5OA 4O7CA 5EPSA 2RNWA 5ENBA 5D3SA 5A85A 4ZC9A 3Q2EA 4O76A 5H1UA 5EISA 2I7KA 5FFVA 4LDFA 3UW9A 3MUKA 5A5SA 5ETDA 4QUUA 4CL9A 4AKGA 4ZW1A 5I88A 4N4IA 2R0YA 5ENJA 5BT5A 5C4QA 4O70A 3IU6A 4YC9A 5HQ6A 4HXOA 4QSSA 4HXSA 4HXMA 3HMEA 3DWYA 5G4RA 3U5LA 4YH3A 4HXLA 4N3WA 4NYVA 5DFDA 4AKIA 5I86A 5F60A 2DVQA 3U5OA 4LC2A 4NR5A 2RNYA 3S91A 1JM4B 4CFKA 4UIWA 4CLBA 4MEQA 5H85A 4O78A 2NXBA 5CGPA 4A9MA 3MXFA 5A5NA 5C7NA 3VKGA 4ALHA 3O37A 4MENA 4UIYA 2YDWA 4A9NA 4YATA 5KTWA 3QZVA 5D3LA 4QEWA 5CQ8A 5DYUA 3LQHA 4YK0A 3AADA 4TZ2A 4A9JA 5FE3A 3HMFA 5E3DA 4A9HA 5F36A 5HRXA 5DX4A 4YYKA 4F3IA 4UYFB 5KU3A 2LSPB 3MULA 5FB1A 5CRZA 4UIVA 3UV4A 4O77A 3JVKA 4XUBA 5D3TA 4YYNA 5EP7A 4PY6A 5E0RA 4HXPA 5HFRA 5LKUA 3G0LA 4QC1A 4Z93A 5CUBA 4A9KA 5DY7A 4YYGA 4PCEA 3LQIA 4LZSA 4IR6A 4MR3A 2N9GA 4Z6HA 2RS9B 2D9EA 5D26A 3U5KA 5E9KA 5FB0A 3UV2A 5HCLA 4YBTA 3O35A 3LJWA 5A5OA 2R10A 3JVJA 5EWHA 4J1PA 5ETBA 2KTBB 5K29A 4QSUA 3UVDA 2DVSA 2YW5A 3QZSA 4KV4A 4MEOA 3UV5A 2E7NA 4LYSA 4BJXA 5E9LA 3ZYUA 4O7AA 4NUCA 4O7EA 5EQ1A 4UIZA 5LVQA 5IGKA 2R0VA 4NRBA 4KV1A 3AQAA 4PCIA 4NRCA 4QR4A 4QSTA 4OGIA 4O75A 5HRWA 4MR4A 5AMFA 5F25A 4TT2A 4UIXA 5CQTA 5EPBA 4YY4A 4AKHA 4WHWA 4QSRA 5C89A 5FH8A 5DKHA 2DVVA 4QSXA 4IR4A 4QNSA 4QR3A 4TU4A 5FE6A 4BHWA 2YYNA 3LXJA 5F3AA 5EM3A 3K2JA 5DLZA
chains in the Genus database with same CATH topology
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