4O74A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with bi 2536
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 37
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o74A01
5FE2A 5DW2A 4HXSA 4MR5A 4J0SA 4N4HA 4PTBA 2OSSA 4UIWA 5KTWA 4N4FA 3SVGA 5A5QA 4UYFB 4WHWA 4UYDA 4MEQA 4A9LA 5HENA 4TT6A 4UYHA 5H1TA 5JWMA 5HLSA 5F62A 3HMFA 5I7XA 5HRVA 4HXPA 3I3JA 3S92A 3TLPA 4PY6A 4NRCA 4YADA 4NYVA 2LSPB 5CQ8A 4TT4A 5DX4A 2E3KA 3DAIA 4J3IA 3UVDA 5DYUA 5CTLA 3O37A 4PCIA 4RVRA 5E9MA 3G0JA 4QEWA 4BHWA 5CQ4A 5D3RA 4LYIA 4UYEA 5ENFA 5FE4A 2I8NA 4HXKA 4IR4A 2D9EA 4QSQA 5CS8A 4YYIA 4FLPA 4QSPA 4LYSA 4O7BA 5L8TA 3UVXA 5KHMA 5DY7A 5D26A 2DATA 4O7FA 4UITA 4TZ2A 2D82A 5E74A 2DWWA 4HXOA 3P1CA 5DFDA 4YBTA 4Z1SA 5EV9A 5ENBA 4YYJA 2DKWA 4O7AA 5HEMA 5DFBA 4A9NA 3JVLA 5F25A 5F63A 3P5OA 3HMEA 4CFKA 3MULA 4A9IA 4XUAA 3ZYUA 3GG3A 2YEKA 5CUCA 4CL9A 4UIYA 2I7KA 3MB4A 4HXRA 5ETBA 4TS8A 5EICA 5H1VA 4XYAA 5E9LA 4HBVA 4HXMA 4WIVA 5DW1A 5BT4A 4QSSA 5FE9A 4QEVA 5D24A 4NR6A 4MENA 2DVVA 4O75A 5FH7A 4HXLA 5E7DA 4IR6A 3U5LA 5FE8A 5LJ0A 5HQ5A 5LUUA 5CRZA 5I89A 5J0DA 5D3TA 5HELA 5FE3A 5EVAA 2R0SA 5CGPA 4QYDA 4YH4A 5D3LA 4A9MA 4KCXA 3JVMA 4YABA 5CPEA 5A83A 4QSUA 4LR6A 5CQ6A 4QR4A 5C4QA 5DYXA 5IGMA 5L99A 5IGLA 5DYAA 5FH8A 5HQ6A 2RFJA 5D0CA 5I86A 5EWDA 2RS9B 2N9GA 4YY4A 5A5NA 5EA1A 5FG5A 5LKTA 4QEUA 3DWYA 4CUQA 2DVSA 5D3PA 5EISA 4YAXA 5C85A 3MUKA 4LRGA 4NQMA 5EPRA 2YEMA 5HQ7A 3D7CA 3AQAA 2E7NA 5C89A 5FFVA 4NUDA 2RO1A 5FE7A 5D7XA 4CFLA 3UV2A 5DKHA 5CQ3A 5AD3A 4MR3A 4GPJA 4Z1QA 3SVHA 5TB6A 4BW1A 4A9HA 4A9EA 4ZW1A 5C87A 3NXBA 4NUEA 5CZGA 4HBWA 4LDFA 2KTBB 2E7OA 5ENCA 5A5SA 5LJ2A 4QSXA 5KTXA 1X0JA 4TT2A 2RNYA 4Q0OA 4NRAA 5FG4A 4A9FA 4TQNA 5EPSA 4YC9A 5LKZA 2L85A 2YELA 1JM4B 5CUBA 4QSVA 5C7NA 4NYWA 3LQHA 3S91A 3Q2EA 5I80A 5A5OA 4UYFA 4F3IA 2RNWA 4QUTA 4CUUA 4LZ2A 5IGNA 3Q2FA 4QB3A 3FKMX 5G4SA 5AMEA 2L84A 4KV4A 5HRWA 5ENJA 4J0RA 5IGKA 2L5EA 1F68A 4UIZA 4YYKA 4YYHA 4Z93A 5E0RA 5L97A 5LKXA 2RI7A 5CUAA 4PKLA 5DLXA 2G4AA 2YYNA 4QZSA 4QR3A 3HMHA 4TZ8A 4A9OA 4CURA 4QBMA 4IORA 4LC2A 4NR4A 5EWVA 3U5OA 2YW5A 4N4GA 4QUUA 2R0YA 5FE6A 5LVRA 5II1A 4O7CA 2OUOA 4QC1A 5CRMA 3QZTA 5I1QA 3LQIA 4DONA 5ENGA 5D3JA 1EQFA 3O35A 5FBXA 4MEOA 4UIVA 4MEPA 5CUGA 4IOQA 2WP2A 3U5PA 5IG6A 5HRXA 3K2JA 5CY9A 4C66A 5H1UA 4XY9A 3UVWA 5L98A 4CUSA 3U5NA 3SVFA 4NXJA 5EWCA 5EWHA 5CUDA 3RCWA 4NR9A 4X2IA 5COIA 3U5KA 3P1EA 5KO4A 4C67A 5ETDA 4PCEA 5E3GA 5IIDA 4Q0NA 4O70A 5TCMA 4O72A 2DVQA 4N3WA 3UVYA 5FDZA 4NRBA 4YH3A 4XY8A 5F60A 5BT3A 4YYGA 4HXNA 1WUMA 1ZS5A 3LXJA 3IU5A 5ENHA 4NS5A 3U5JA 5DBMA 4QNSA 3LQJA 5D3SA 4O77A 5EP7A 5FFYA 4CUPA 4XUBA 1JSPB 5FE5A 3ONIA 2H60A 5A81A 4IR3A 5FB1A 4OGJA 5A82A 5CP5A 4QYLA 4A9JA 4QR5A 5CQTA 3O33A 3U5MA 4LZRA 5A5RA 5F5ZA 5D3NA 5D3HA 1E6IA 4IR5A 5FE1A 4NR8A 5E9VA 5KTUA 5A85A 5ACYA 2F6JA 2WP1A 4NYXA 5F61A 5HCLA 4YATA 3MQMA 5DKCA 5CQ5A 4CLBA 5K29A 4UYGA 5CQAA 5ENIA 4E96A 3O34A 4BW2A 4YBMA 5EQ1A 2OO1A 4NR7A 4YYMA 4O74A 3MXFA 3UW9A 5FE0A 3P1FA 4QSWA 4ZC9A 4Z6IA 5A5PA 4KV1A 4ALGA 5IBNA 2RNXA 4QSRA 2R10A 3MB3A 4BW4A 4HBYA 5LKUA 4PS5A 5LVQA 4QY4A 4TU4A 5FB0A 2DVRA 2MJVB 4UIUA 4YYDA 5I29A 5CUEA 5JI8A 4A9KA 4AKNA 2GRCA 5G4RA 5F3AA 4O76A 5HFQA 4TU6A 5I88A 5E73A 5LJ1A 4NQNA 3JVJA 4ZQLA 4BW3A 5HJCA 5AMFA 4TYLA 4O7EA 4O78A 3JVKA 4YY6A 5HM0A 4MR4A 5A7CA 5DYCA 5E9KA 4HBXA 2R0VA 4MR6A 5EK9A 5FFWA 4WHUA 5DFCA 5EWWA 5E9YA 5EPBA 5FH6A 3QZSA 3IU6A 5E3DA 4LYWA 4Y03A 4IOOA 4N4IA 4LZSA 4QSTA 2NXBA 5ENEA 5F2PA 4Z6HA 4BJXA 3QZVA 5L8UA 5F36A 4YYNA 3P1DA 5D25A 4J1PA 5HFRA 5EI4A 5H85A 4YBSA 5F1HA 5C8GA 5I83A 5E9IA 5I40A 1WUGA 5FG6A 5EM3A 4QC3A 5DKDA 5II2A 4ALHA 4OUFA 4CUTA 3UV4A 5KU3A 3LJWA 5F1LA 5CFWA 4O71A 2YQDA 5L96A 4NR5A 4TTEA 3UV5A 5AD2A 5CQ7A 5EU1A 5BT5A 4OGIA 3AADA 4YK0A 3G0LA 1N72A 4NUCA 5EGUA 5CU8A 2F6NA 5I7YA 4UIXA 3O36A 2YDWA 2FSAA 5DLZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE2A 5DW2A 4HXSA 4MR5A 4J0SA 4N4HA 4PTBA 2OSSA 4UIWA 5KTWA 4N4FA 3SVGA 5A5QA 4UYFB 4WHWA 4UYDA 4MEQA 4A9LA 5HENA 4TT6A 4UYHA 5H1TA 5JWMA 5HLSA 5F62A 3HMFA 3D1BA 5I7XA 5HRVA 4HXPA 3I3JA 3S92A 3TLPA 4PY6A 4NRCA 4YADA 4NYVA 2LSPB 5CQ8A 4TT4A 5DX4A 2E3KA 3DAIA 4J3IA 3UVDA 5DYUA 5CTLA 3O37A 4PCIA 4RVRA 5E9MA 3G0JA 4QEWA 4BHWA 5CQ4A 5D3RA 4LYIA 4UYEA 5ENFA 5FE4A 2I8NA 4HXKA 4IR4A 2D9EA 4QSQA 5CS8A 4YYIA 4FLPA 4QSPA 4LYSA 4O7BA 5L8TA 3UVXA 5KHMA 5DY7A 5D26A 2DATA 4O7FA 4UITA 4TZ2A 2D82A 5E74A 2DWWA 4HXOA 3P1CA 5DFDA 4YBTA 4Z1SA 4AKHA 5EV9A 5ENBA 4YYJA 2DKWA 4O7AA 5HEMA 5DFBA 4A9NA 3JVLA 5F25A 5F63A 3P5OA 3HMEA 4CFKA 3MULA 4A9IA 4XUAA 3ZYUA 3GG3A 2YEKA 5CUCA 4CL9A 4UIYA 2I7KA 3MB4A 4HXRA 5ETBA 4TS8A 5EICA 5H1VA 4XYAA 5E9LA 4HBVA 4HXMA 4WIVA 5DW1A 5BT4A 4QSSA 5FE9A 4QEVA 5D24A 4NR6A 4MENA 2DVVA 4O75A 5FH7A 4HXLA 5E7DA 4IR6A 3U5LA 5FE8A 5LJ0A 5HQ5A 5LUUA 5CRZA 5I89A 5J0DA 5D3TA 5HELA 5FE3A 5EVAA 2R0SA 5CGPA 4QYDA 4YH4A 5D3LA 4A9MA 4KCXA 3JVMA 4YABA 5CPEA 5A83A 4QSUA 4LR6A 5CQ6A 4QR4A 5C4QA 5DYXA 5IGMA 5L99A 5IGLA 5DYAA 5FH8A 5HQ6A 2RFJA 5D0CA 5I86A 5EWDA 2RS9B 2N9GA 4YY4A 3D1DA 5A5NA 5EA1A 5FG5A 5LKTA 4QEUA 3DWYA 4CUQA 2DVSA 5D3PA 5EISA 4YAXA 5C85A 3MUKA 4LRGA 4NQMA 5EPRA 2YEMA 5HQ7A 3D7CA 3AQAA 2E7NA 5C89A 5FFVA 4NUDA 2RO1A 5FE7A 5D7XA 4CFLA 3UV2A 5DKHA 5CQ3A 5AD3A 4MR3A 4GPJA 4Z1QA 3SVHA 5TB6A 3VKGA 4BW1A 4A9HA 4A9EA 4ZW1A 5C87A 3NXBA 4NUEA 5CZGA 4HBWA 4LDFA 2KTBB 2E7OA 5ENCA 5A5SA 5LJ2A 2EJNA 1ZKRA 4QSXA 5KTXA 1X0JA 4TT2A 2RNYA 4Q0OA 4NRAA 5FG4A 4A9FA 4AI6A 4TQNA 5EPSA 4YC9A 5LKZA 2L85A 2YELA 1JM4B 5CUBA 4QSVA 5C7NA 4NYWA 3LQHA 3S91A 3Q2EA 5I80A 5A5OA 4UYFA 4F3IA 2RNWA 4QUTA 4CUUA 4LZ2A 5IGNA 3Q2FA 4QB3A 3FKMX 5G4SA 5AMEA 2L84A 4KV4A 5HRWA 5ENJA 4J0RA 5IGKA 4AKGA 2L5EA 1F68A 4UIZA 4YYKA 4YYHA 4Z93A 5E0RA 5L97A 5LKXA 2RI7A 5CUAA 4PKLA 5DLXA 2G4AA 2YYNA 4QZSA 4QR3A 3HMHA 4TZ8A 4A9OA 4CURA 4QBMA 4IORA 4LC2A 4NR4A 5EWVA 3U5OA 2YW5A 4N4GA 4QUUA 2R0YA 5FE6A 5LVRA 5II1A 4O7CA 2OUOA 4QC1A 5CRMA 3QZTA 5I1QA 3LQIA 4DONA 5ENGA 5D3JA 1EQFA 3O35A 5FBXA 4MEOA 4UIVA 4MEPA 1PUOA 5CUGA 4AKIA 4IOQA 2WP2A 3U5PA 5IG6A 5HRXA 3K2JA 5CY9A 4C66A 5H1UA 4XY9A 3UVWA 5L98A 4CUSA 3U5NA 3SVFA 4NXJA 5EWCA 5EWHA 5CUDA 3RCWA 4NR9A 4X2IA 5COIA 3U5KA 3P1EA 5KO4A 4C67A 5ETDA 4PCEA 5E3GA 5IIDA 4Q0NA 4O70A 5TCMA 4O72A 2DVQA 4N3WA 3UVYA 5FDZA 4NRBA 4YH3A 4XY8A 5F60A 5BT3A 4YYGA 4HXNA 1WUMA 1ZS5A 3LXJA 3IU5A 5ENHA 4NS5A 3U5JA 5DBMA 4QNSA 3LQJA 5D3SA 4O77A 5EP7A 5FFYA 4CUPA 4XUBA 1JSPB 5FE5A 3ONIA 2H60A 5A81A 4IR3A 5FB1A 4OGJA 5A82A 5CP5A 4QYLA 4A9JA 4QR5A 5CQTA 3O33A 3U5MA 4LZRA 5A5RA 5F5ZA 5D3NA 5D3HA 1E6IA 4IR5A 5FE1A 4NR8A 5E9VA 5KTUA 5A85A 5ACYA 2F6JA 2WP1A 4NYXA 5F61A 5HCLA 4YATA 3MQMA 5DKCA 5CQ5A 4CLBA 5K29A 4UYGA 5CQAA 5ENIA 4E96A 3O34A 4BW2A 4YBMA 5EQ1A 2OO1A 4NR7A 4YYMA 4O74A 3MXFA 3UW9A 5FE0A 3P1FA 4QSWA 4ZC9A 4Z6IA 5A5PA 4KV1A 4ALGA 5IBNA 2RNXA 4QSRA 2R10A 3MB3A 4BW4A 4HBYA 5LKUA 4PS5A 5LVQA 4QY4A 4TU4A 5FB0A 2DVRA 2MJVB 4UIUA 4YYDA 5I29A 5CUEA 5JI8A 4A9KA 4AKNA 2GRCA 5G4RA 5F3AA 4O76A 5HFQA 4TU6A 5I88A 5E73A 5LJ1A 4NQNA 3JVJA 4ZQLA 4BW3A 5HJCA 5AMFA 4TYLA 4O7EA 4O78A 3JVKA 4YY6A 5HM0A 4MR4A 5A7CA 5DYCA 5E9KA 4HBXA 2R0VA 4MR6A 5EK9A 5FFWA 4WHUA 5DFCA 5EWWA 5E9YA 5EPBA 5FH6A 3QZSA 3IU6A 5E3DA 4LYWA 4Y03A 4IOOA 4N4IA 4LZSA 4QSTA 2NXBA 5ENEA 5F2PA 4Z6HA 4BJXA 3QZVA 5L8UA 5F36A 4YYNA 3P1DA 5D25A 4J1PA 5HFRA 5EI4A 5H85A 4YBSA 5F1HA 5C8GA 5I83A 5E9IA 5I40A 1WUGA 5FG6A 5EM3A 4QC3A 5DKDA 5II2A 4ALHA 4OUFA 4CUTA 3UV4A 5KU3A 3LJWA 5F1LA 5CFWA 4O71A 2YQDA 5L96A 4NR5A 4TTEA 3UV5A 5AD2A 5CQ7A 3VKHA 5EU1A 3ERRA 5BT5A 4OGIA 3AADA 4YK0A 3G0LA 1N72A 4NUCA 5EGUA 5CU8A 2F6NA 5I7YA 4UIXA 3O36A 2YDWA 2FSAA 5DLZA
chains in the Genus database with same CATH topology
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