4O74A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with bi 2536
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 37
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o74A01
4NRBA 4YYGA 5D0CA 2DVSA 5EWDA 2GRCA 4LDFA 4LZRA 4QSSA 5L98A 3U5PA 5EISA 5L97A 5F61A 4LYIA 5DKDA 4NR4A 4YYKA 5LVRA 4YBTA 3DAIA 2R10A 5BT5A 5HENA 5HELA 5DFCA 5C87A 4OUFA 4IR3A 5CUBA 4N3WA 4YC9A 5CUAA 4HBYA 5A5PA 4QZSA 4NYVA 4LYSA 5E73A 5IBNA 5FH8A 2YEMA 4BW2A 4YYJA 3U5JA 4FLPA 2G4AA 4AKNA 3U5NA 3DWYA 5DYUA 4A9NA 3P5OA 4QC1A 2DATA 5COIA 3QZSA 5I83A 5G4RA 4A9OA 4CL9A 5DW1A 5E9MA 4N4HA 5DYCA 5E9LA 5HFQA 5CQAA 4QSWA 4UIVA 4LC2A 4C66A 2DKWA 4J3IA 4PKLA 2OUOA 4BW4A 5I86A 4HXLA 5LVQA 4HXPA 2DVQA 4O7AA 4O78A 3FKMX 5D3JA 3UVYA 3LJWA 3JVLA 4NUEA 4TU4A 4PCIA 3SVGA 4LZ2A 3AADA 4XY9A 4UYGA 5D25A 5I80A 3ZYUA 3AQAA 4Q0OA 4NUDA 4IOOA 4O74A 5EPRA 3O37A 5JI8A 5A81A 5DYAA 4Y03A 5ENBA 5A85A 3I3JA 2RNWA 3Q2FA 5EPSA 5I7YA 4QSTA 4O76A 3SVFA 4PY6A 4UIZA 4E96A 4BJXA 1JSPB 5C7NA 2D82A 4NS5A 4PS5A 4YH4A 4IOQA 4XUBA 5DKHA 5D7XA 4YYDA 5DX4A 5FB0A 5II1A 2I8NA 4N4IA 5D3NA 4UIUA 2RS9B 3NXBA 5ETDA 5LJ1A 4TT4A 3UV4A 5ENEA 4YBSA 5CP5A 4A9JA 5HJCA 2OSSA 5CUGA 5C8GA 5H85A 4YABA 5H1TA 3LQIA 4CUSA 5IG6A 3IU6A 4NXJA 5HQ7A 5E3GA 4QB3A 5A83A 4A9HA 5LKUA 3U5KA 4A9FA 4KV1A 5FE3A 5BT3A 4NR6A 4YYMA 5LKTA 5FG6A 5F1LA 4NYWA 3MQMA 5LKZA 3GG3A 4YK0A 3RCWA 2RNYA 4NR8A 5II2A 5CUDA 5CUCA 4MR5A 5KHMA 4GPJA 5I40A 3O33A 4HBVA 3LQJA 4TT2A 5D24A 4YYIA 3UW9A 5KO4A 5FE7A 4J0RA 4NQMA 5HRWA 4CLBA 5DLZA 5HM0A 2R0SA 4Z1QA 3O35A 1WUMA 4J0SA 4LR6A 5CQ3A 4UITA 5FE0A 3HMEA 4QEVA 5DFDA 5FE4A 5C85A 5CRZA 5A7CA 2L85A 4QR5A 5FB1A 3QZTA 3UV5A 4QY4A 4CUQA 4OGJA 5E3DA 5EWCA 4WIVA 4HXKA 4A9MA 4XYAA 5F1HA 2DVVA 5AD3A 4Z93A 5ENJA 4Z6IA 4O72A 4ZC9A 5C4QA 4PCEA 5FFYA 5F5ZA 4O70A 4YY6A 4BW3A 3Q2EA 5E74A 1F68A 3D7CA 2F6JA 5A5SA 5IGLA 3U5LA 2RO1A 5HLSA 5EK9A 4QUTA 2LSPB 4Z1SA 3MULA 2R0VA 4CUUA 3G0LA 3JVKA 5ENIA 4BHWA 5LJ2A 1JM4B 4PTBA 5DBMA 5E0RA 5F63A 4CFKA 4A9IA 4QC3A 4TQNA 3UVXA 5I1QA 5C89A 2DVRA 5EM3A 4QSUA 5FBXA 4O75A 4HXNA 4TZ8A 4Q0NA 5TB6A 4A9EA 4O7CA 5KTWA 5DFBA 5A5QA 4NUCA 5FE2A 4BW1A 5LJ0A 5FE8A 5E9KA 3ONIA 4HXRA 5KTXA 3P1EA 4QR3A 4F3IA 3MB4A 5ETBA 4O71A 2NXBA 5CQTA 4MENA 4UYFB 5ACYA 5F2PA 5CRMA 5FE1A 2RNXA 5CPEA 2L5EA 4ALHA 3UV2A 4YATA 4OGIA 5H1UA 5FFWA 4QNSA 2L84A 5DW2A 5DKCA 2KTBB 4QEUA 4IR5A 5CY9A 5L8UA 3K2JA 4TS8A 5L99A 5E9YA 4WHUA 5HQ5A 5IGNA 5HQ6A 4UIWA 4ZW1A 3UVDA 4C67A 3P1DA 4LYWA 5FFVA 2DWWA 4KCXA 3S91A 5HFRA 1WUGA 4N4GA 5J0DA 4ALGA 4Z6HA 5TCMA 5KU3A 4ZQLA 2WP2A 4NR9A 4IR6A 4QEWA 2RI7A 3QZVA 5A82A 5IGMA 4HXOA 4O7EA 5D3SA 4NQNA 5E9IA 5FG5A 5F25A 4HXMA 4HBXA 3MUKA 4UYEA 5CQ4A 5ENGA 5K29A 4QYLA 5CQ6A 2OO1A 2FSAA 5EV9A 3MXFA 4QSQA 3HMHA 3O36A 5EGUA 4A9LA 5CQ8A 4NR5A 5EU1A 5LKXA 5FE6A 5HEMA 4NR7A 5BT4A 5AD2A 5EWWA 5EP7A 1X0JA 5FH7A 5EICA 5D3TA 5A5NA 5DLXA 5ENFA 4QSPA 4LZSA 5IIDA 5EWHA 4MR4A 4HBWA 4QBMA 2YELA 4KV4A 4QYDA 5F3AA 2E7NA 5IGKA 4YADA 5D3LA 2YYNA 2R0YA 3LXJA 4YYHA 5FE5A 4O7FA 5CTLA 2RFJA 3UVWA 5I29A 5L8TA 5A5RA 5I88A 4CUTA 5HRXA 1E6IA 5EWVA 2YQDA 4TU6A 5D3PA 4CFLA 5AMFA 4TYLA 3U5OA 4UYDA 4IR4A 2E3KA 3S92A 2WP1A 1EQFA 4TTEA 3P1FA 5F60A 2E7OA 4IORA 3IU5A 5I89A 4UIXA 4YBMA 1N72A 2I7KA 4MEQA 4MR6A 4YY4A 5F36A 5E9VA 2YDWA 5AMEA 5FG4A 5KTUA 4A9KA 4XUAA 4QSXA 1ZS5A 5H1VA 2N9GA 4TT6A 4QUUA 5DYXA 4J1PA 5CZGA 4UIYA 5D26A 2H60A 3U5MA 3JVJA 3O34A 5ENCA 5G4SA 4MEOA 5I7XA 5FE9A 2MJVB 5ENHA 5EI4A 5FH6A 5L96A 5CUEA 3MB3A 5EQ1A 4TZ2A 4YAXA 5FDZA 4YYNA 5CU8A 5HCLA 4MR3A 5D3HA 4QR4A 4WHWA 5A5OA 4HXSA 4O77A 4DONA 4YH3A 4NRCA 4O7BA 4UYHA 5JWMA 4UYFA 2D9EA 5CFWA 5CQ5A 3G0JA 4LRGA 4QSRA 4X2IA 3JVMA 4RVRA 4XY8A 4CUPA 5CGPA 5D3RA 2YEKA 4N4FA 5EVAA 5EPBA 4NRAA 3TLPA 3LQHA 5EA1A 5DY7A 2YW5A 3P1CA 5E7DA 5HRVA 2F6NA 5CQ7A 3SVHA 4MEPA 4CURA 3HMFA 5F62A 5LUUA 4QSVA 4NYXA 5CS8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NRBA 4YYGA 5D0CA 2DVSA 5EWDA 2GRCA 4LDFA 4LZRA 4QSSA 5L98A 3U5PA 5EISA 5L97A 5F61A 4LYIA 5DKDA 4NR4A 4YYKA 5LVRA 4YBTA 3DAIA 2R10A 5BT5A 5HENA 5HELA 5DFCA 5C87A 4OUFA 4IR3A 5CUBA 4N3WA 4YC9A 5CUAA 4HBYA 5A5PA 4QZSA 4NYVA 4LYSA 5E73A 5IBNA 5FH8A 2YEMA 4BW2A 4YYJA 3U5JA 4FLPA 2G4AA 4AKNA 3U5NA 3DWYA 5DYUA 4A9NA 3P5OA 4QC1A 2DATA 5COIA 3QZSA 5I83A 5G4RA 4A9OA 4CL9A 5DW1A 5E9MA 4N4HA 5DYCA 5E9LA 5HFQA 5CQAA 4QSWA 4UIVA 4LC2A 4C66A 2DKWA 4J3IA 4PKLA 2OUOA 4BW4A 5I86A 4HXLA 5LVQA 4HXPA 2DVQA 4O7AA 4O78A 3FKMX 5D3JA 3UVYA 3LJWA 3JVLA 4NUEA 4TU4A 4PCIA 3SVGA 4LZ2A 3D1DA 3AADA 4XY9A 4UYGA 5D25A 5I80A 3ZYUA 3AQAA 4Q0OA 4NUDA 4IOOA 4O74A 5EPRA 3O37A 5JI8A 5A81A 5DYAA 4Y03A 5ENBA 5A85A 3I3JA 2RNWA 3Q2FA 5EPSA 5I7YA 4QSTA 4O76A 3SVFA 1ZKRA 4PY6A 4UIZA 4E96A 4BJXA 1JSPB 5C7NA 2D82A 4NS5A 4PS5A 4YH4A 4IOQA 4XUBA 5DKHA 5D7XA 4YYDA 5DX4A 5FB0A 5II1A 2I8NA 4N4IA 5D3NA 4UIUA 2RS9B 3NXBA 5ETDA 5LJ1A 4TT4A 3UV4A 5ENEA 3VKGA 4YBSA 5CP5A 4A9JA 5HJCA 2OSSA 5CUGA 5C8GA 5H85A 4YABA 5H1TA 3LQIA 4CUSA 5IG6A 3IU6A 4NXJA 5HQ7A 5E3GA 4QB3A 5A83A 4A9HA 5LKUA 3U5KA 4A9FA 4KV1A 5FE3A 5BT3A 4NR6A 4YYMA 5LKTA 5FG6A 5F1LA 4NYWA 3MQMA 5LKZA 3GG3A 4YK0A 3RCWA 2RNYA 4NR8A 5II2A 3ERRA 5CUDA 5CUCA 4MR5A 5KHMA 4GPJA 5I40A 3O33A 4HBVA 3LQJA 4TT2A 5D24A 4YYIA 3UW9A 5KO4A 5FE7A 4J0RA 4NQMA 5HRWA 4CLBA 5DLZA 5HM0A 2R0SA 4Z1QA 3O35A 1WUMA 4J0SA 4LR6A 5CQ3A 4UITA 5FE0A 3HMEA 4QEVA 5DFDA 5FE4A 5C85A 5CRZA 5A7CA 2L85A 4QR5A 5FB1A 3QZTA 3UV5A 4QY4A 4CUQA 4OGJA 5E3DA 5EWCA 4WIVA 4HXKA 4A9MA 4XYAA 5F1HA 2DVVA 5AD3A 4Z93A 5ENJA 4Z6IA 4O72A 4ZC9A 5C4QA 4PCEA 5FFYA 5F5ZA 4O70A 4YY6A 4BW3A 3Q2EA 5E74A 1F68A 3D7CA 2F6JA 5A5SA 5IGLA 3U5LA 2RO1A 5HLSA 5EK9A 4QUTA 2LSPB 4Z1SA 3MULA 2R0VA 4CUUA 3G0LA 3JVKA 5ENIA 4BHWA 5LJ2A 1JM4B 4PTBA 5DBMA 5E0RA 5F63A 4CFKA 4A9IA 4QC3A 4TQNA 3UVXA 5I1QA 5C89A 2DVRA 5EM3A 4QSUA 5FBXA 4O75A 4HXNA 4TZ8A 4Q0NA 5TB6A 4A9EA 4O7CA 5KTWA 5DFBA 5A5QA 4NUCA 5FE2A 4BW1A 5LJ0A 5FE8A 5E9KA 4AI6A 3ONIA 4HXRA 5KTXA 3P1EA 4QR3A 4F3IA 3MB4A 5ETBA 4O71A 2NXBA 5CQTA 4MENA 4UYFB 5ACYA 5F2PA 5CRMA 5FE1A 2RNXA 5CPEA 2L5EA 4ALHA 3UV2A 4YATA 4OGIA 5H1UA 5FFWA 4QNSA 3D1BA 2L84A 5DW2A 3VKHA 5DKCA 2KTBB 4QEUA 4IR5A 5CY9A 5L8UA 3K2JA 4TS8A 5L99A 5E9YA 4WHUA 5HQ5A 5IGNA 5HQ6A 4UIWA 4ZW1A 3UVDA 4C67A 3P1DA 4LYWA 5FFVA 2DWWA 4KCXA 3S91A 5HFRA 1WUGA 4N4GA 5J0DA 4ALGA 4Z6HA 5TCMA 5KU3A 4ZQLA 2WP2A 4NR9A 4IR6A 4QEWA 2RI7A 3QZVA 5A82A 5IGMA 4HXOA 4O7EA 5D3SA 4NQNA 5E9IA 5FG5A 4AKIA 5F25A 4HXMA 4HBXA 3MUKA 4UYEA 5CQ4A 5ENGA 5K29A 4QYLA 1PUOA 5CQ6A 2OO1A 2FSAA 5EV9A 3MXFA 4QSQA 3HMHA 3O36A 5EGUA 4A9LA 5CQ8A 4NR5A 5EU1A 5LKXA 5FE6A 5HEMA 4NR7A 5BT4A 5AD2A 5EWWA 5EP7A 1X0JA 5FH7A 5EICA 5D3TA 5A5NA 5DLXA 5ENFA 4QSPA 4LZSA 5IIDA 5EWHA 4MR4A 4HBWA 4QBMA 2YELA 4KV4A 4QYDA 5F3AA 2E7NA 5IGKA 4YADA 5D3LA 2YYNA 2R0YA 3LXJA 4YYHA 5FE5A 4O7FA 5CTLA 2RFJA 3UVWA 5I29A 5L8TA 5A5RA 5I88A 4CUTA 5HRXA 1E6IA 5EWVA 2YQDA 4TU6A 5D3PA 4CFLA 5AMFA 4TYLA 3U5OA 4UYDA 4IR4A 2E3KA 3S92A 2WP1A 1EQFA 4TTEA 3P1FA 5F60A 2E7OA 4IORA 3IU5A 5I89A 4UIXA 4YBMA 1N72A 2I7KA 4MEQA 4MR6A 4YY4A 5F36A 5E9VA 2YDWA 5AMEA 5FG4A 5KTUA 4A9KA 4XUAA 4QSXA 1ZS5A 5H1VA 2N9GA 4TT6A 4QUUA 5DYXA 4J1PA 5CZGA 4UIYA 5D26A 2H60A 3U5MA 3JVJA 3O34A 5ENCA 5G4SA 4AKGA 4MEOA 4AKHA 5I7XA 5FE9A 2MJVB 5ENHA 5EI4A 5FH6A 5L96A 5CUEA 3MB3A 5EQ1A 4TZ2A 4YAXA 5FDZA 4YYNA 5CU8A 5HCLA 5D3HA 4MR3A 4QR4A 4WHWA 5A5OA 2EJNA 4HXSA 4O77A 4DONA 4YH3A 4NRCA 4O7BA 4UYHA 5JWMA 4UYFA 2D9EA 5CFWA 5CQ5A 3G0JA 4LRGA 4X2IA 4QSRA 3JVMA 4RVRA 4XY8A 4CUPA 5CGPA 5D3RA 2YEKA 4N4FA 5EVAA 5EPBA 4NRAA 3TLPA 3LQHA 5EA1A 5DY7A 2YW5A 3P1CA 5E7DA 5HRVA 2F6NA 5CQ7A 3SVHA 4MEPA 4CURA 3HMFA 5F62A 5LUUA 4QSVA 4NYXA 5CS8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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