4O74A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with bi 2536
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o74A01
5EP7A 5ENCA 4TS8A 5FE2A 5IGMA 5A5QA 5AMEA 4QC1A 5FE0A 4Q0NA 4IR5A 5FE7A 3O33A 4Z6IA 4O7EA 5CQ4A 5EU1A 3AQAA 4TU6A 3U5LA 4CUQA 2MJVB 4ZW1A 4UIVA 2KTBB 3UV4A 3IU6A 2OUOA 4MENA 5CUBA 4YAXA 5E7DA 4NR6A 2OO1A 2N9GA 4NR8A 3QZSA 2L84A 5HFQA 5CQ6A 5EWHA 4XY9A 5FB0A 4C66A 4UIYA 2DVSA 5F1LA 5F62A 5IGNA 5E3DA 5LKXA 4NS5A 4J3IA 5DFBA 5A5OA 4N4HA 3UVWA 4QSRA 5EISA 4NUDA 4QZSA 1E6IA 4NRBA 5IG6A 5CRMA 4NQMA 4NR7A 4Z6HA 4BHWA 4UYFB 5HEMA 5FE8A 4YYIA 4IOQA 4QEVA 3NXBA 4BW4A 4QSXA 4CFLA 4UYHA 5L98A 4A9NA 3MUKA 5EVAA 5D7XA 4NUCA 4YYDA 3GG3A 4YYHA 5H1UA 4UYEA 5FH6A 5J0DA 5CUDA 4O74A 4O7FA 2NXBA 4O7CA 5HQ6A 4UIZA 5F36A 5CPEA 3DAIA 4Q0OA 3SVGA 4CFKA 5ENHA 5FFYA 3LXJA 2I7KA 5E9KA 5LJ2A 4KV1A 1WUGA 4BW1A 2RO1A 3LJWA 3G0LA 4PCEA 5DLXA 4QEUA 4A9LA 4LYWA 3K2JA 3MB3A 3MULA 5CQ5A 2FSAA 4LZSA 5E73A 4Z93A 4UYFA 5EPSA 2E3KA 5E9IA 5ENIA 5D3JA 5CQTA 5HJCA 4UIUA 4LYIA 3P1CA 4Z1QA 5L99A 3UW9A 5FE1A 4IR4A 5A85A 4HXNA 5H1TA 3U5NA 3P1FA 5CFWA 5JI8A 5K29A 4UYGA 4PS5A 5C7NA 5KTXA 3RCWA 4QSTA 4CL9A 4A9JA 5F25A 4CUSA 5LJ0A 4OGJA 3ONIA 5CGPA 2RNWA 5F63A 5A82A 3JVJA 2F6NA 4QYLA 5F2PA 5BT5A 4WHWA 5D3NA 4TQNA 5EWCA 2DKWA 5HELA 4E96A 2L5EA 4PTBA 5CQAA 5HRXA 4YH3A 2R0YA 4O70A 5L96A 5CTLA 5A5NA 5I88A 4HXPA 4TT2A 2YELA 4UITA 3SVFA 2RS9B 5DYCA 5A81A 4NR9A 4YBTA 4J0SA 5IGKA 2DVQA 5DKDA 5HRVA 4J1PA 3LQHA 4NYXA 4CLBA 5LKUA 5KU3A 5KTWA 4QUUA 5IGLA 2RFJA 3FKMX 5BT3A 5D3TA 4TT6A 5DFCA 2R0SA 4XUAA 4ZC9A 4XUBA 5I83A 4QBMA 2R10A 4NQNA 5CUEA 5DFDA 5D25A 5ETBA 5I80A 3S91A 5II1A 5E9MA 5DYXA 4A9FA 5EK9A 5BT4A 5HCLA 2RNYA 4MEPA 5I40A 3JVMA 3U5OA 5H85A 4XYAA 4NR5A 5C89A 4A9EA 5EI4A 5I89A 5E9LA 5LKTA 4LC2A 4PKLA 4TTEA 4TYLA 5C87A 4O78A 5FH8A 5DW1A 5F60A 4YYJA 5HM0A 1JM4B 5DLZA 4HXRA 4LDFA 5DX4A 5F5ZA 5EPBA 5I1QA 4KV4A 4TZ2A 4MEQA 5CUAA 5FH7A 4O72A 4ZQLA 5A7CA 5I29A 3D7CA 3MB4A 4YADA 3JVKA 5EV9A 4RVRA 4N3WA 5IBNA 4HBYA 4HBXA 5D26A 3UVXA 2DVRA 5FDZA 2H60A 4MEOA 5FE3A 4QSUA 4A9KA 2DATA 3P1DA 5CQ3A 5I7YA 3ZYUA 4LYSA 5KHMA 3U5JA 4GPJA 4IR3A 4QEWA 1WUMA 2D82A 2L85A 4MR3A 4CUPA 5CQ8A 3MXFA 5LVRA 3Q2FA 2I8NA 5DYAA 5F1HA 5LJ1A 4BW3A 4NYVA 5KO4A 4O71A 5DW2A 3U5PA 4MR5A 5FFVA 4QSSA 4QSQA 5A5PA 4YY6A 4YBMA 4FLPA 4A9HA 5A5SA 4UIXA 4LR6A 5FG5A 2LSPB 4TU4A 5EWDA 5AD3A 5ETDA 4LZRA 4YBSA 3Q2EA 5CU8A 5CP5A 5II2A 4O77A 4YY4A 4XY8A 4QYDA 4N4IA 5COIA 2R0VA 1EQFA 5ENBA 4QR4A 4KCXA 5I86A 5ENJA 5FE6A 4YATA 3P1EA 5G4SA 4UYDA 1F68A 4NYWA 4Y03A 5L8UA 2E7NA 2DVVA 4QSWA 5E3GA 4QC3A 5FB1A 5DY7A 4HXOA 4BW2A 5D3SA 2YYNA 4NXJA 5CZGA 4HXSA 2OSSA 4CUUA 4IOOA 5DKCA 4TT4A 5L8TA 4QB3A 3IU5A 5D0CA 4QSVA 5EA1A 5IIDA 3O36A 1ZS5A 5D24A 4O76A 3LQIA 4F3IA 5EM3A 5A5RA 5FBXA 4YYGA 5EWWA 3UV2A 4MR4A 3P5OA 4QNSA 5JWMA 2GRCA 2YDWA 5EQ1A 5ACYA 4O75A 5F61A 5H1VA 3SVHA 4YABA 4NRCA 4LZ2A 4QR3A 2E7OA 3QZTA 4HXLA 4HBWA 4UIWA 5I7XA 2RI7A 5DKHA 5CQ7A 2RNXA 5AMFA 5FE5A 3O37A 4QR5A 5ENFA 4HXMA 5KTUA 5FE9A 3UV5A 4WHUA 5G4RA 4IORA 5ENGA 3S92A 4IR6A 4A9OA 5EGUA 2YW5A 5TB6A 4YYNA 5FG6A 2WP2A 5EWVA 3JVLA 5FG4A 4YYKA 5ENEA 4WIVA 4A9MA 5A83A 5HLSA 5D3PA 4QUTA 5L97A 3DWYA 3G0JA 3I3JA 3O35A 5F3AA 4HXKA 4DONA 3HMHA 5D3RA 4O7AA 5TCMA 3U5MA 5CUGA 5LUUA 1JSPB 2YEMA 3QZVA 5EICA 4ALGA 5E74A 5HFRA 5D3HA 4Z1SA 4O7BA 5AD2A 5C4QA 5DBMA 5LKZA 5CUCA 4N4FA 4NUEA 3AADA 4YK0A 2YQDA 5HQ7A 3UVYA 1N72A 5HENA 3O34A 4J0RA 4YYMA 5E9VA 4OGIA 3HMFA 4YC9A 4N4GA 5E0RA 1X0JA 5DYUA 4PCIA 2D9EA 4C67A 5CY9A 3U5KA 3LQJA 5C85A 4QSPA 4CUTA 4QY4A 5FE4A 5FFWA 4PY6A 4MR6A 2WP1A 3TLPA 4BJXA 4LRGA 2G4AA 4ALHA 5C8GA 3MQMA 5LVQA 4YH4A 5E9YA 4OUFA 3HMEA 4TZ8A 2YEKA 5CRZA 5HQ5A 4X2IA 2DWWA 4HBVA 4NRAA 4CURA 2F6JA 4A9IA 4AKNA 5CS8A 5HRWA 3UVDA 4NR4A 5EPRA 5D3LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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