4O74A

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with bi 2536
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o74A01
5DX4A 5I80A 5HQ5A 5FE5A 2RI7A 4Z6HA 5A5SA 3DWYA 1EQFA 5D24A 4NXJA 1N72A 4UYFB 5BT3A 5EPSA 4QSRA 4YABA 2L5EA 2YQDA 5IGNA 5E9MA 5ENIA 5LVRA 5ETDA 2R0SA 5D3LA 5HELA 1X0JA 2OUOA 5DW1A 5FDZA 4NR9A 4UITA 5KTUA 4ALHA 5KO4A 4TT6A 4TYLA 3AQAA 4CUUA 5F1HA 5CUAA 3UV4A 5EP7A 3FKMX 5F60A 3JVMA 3HMFA 5HRXA 5LKXA 3LQHA 4HXMA 4NUDA 3NXBA 5FE6A 5FFYA 3TLPA 1E6IA 4A9KA 5H85A 5EI4A 4N4HA 5DKDA 5HRVA 4O7EA 5II2A 5EK9A 5A81A 2DVRA 3U5KA 5HLSA 3U5PA 4MR6A 5KTWA 3UVXA 5L8TA 5D0CA 5G4SA 4UIWA 3O36A 2DATA 4RVRA 4A9FA 4CFKA 2F6JA 5F5ZA 4QUUA 4YYIA 4TQNA 5CZGA 5AD2A 2RS9B 4PS5A 5D3RA 4NR7A 3S92A 4CUTA 4XY9A 5E3DA 4YH3A 5FH8A 3MXFA 5D25A 4YBTA 4WHUA 5IGMA 2N9GA 3D7CA 4GPJA 5FG5A 4BJXA 4QSSA 4QYLA 5CY9A 4NR5A 5E73A 5HRWA 5E3GA 2YDWA 3G0LA 5EU1A 2L85A 4ALGA 3UVYA 4Q0NA 5CGPA 4IOOA 4YBSA 4LZRA 5F61A 4QNSA 5FG6A 2YEKA 5L8UA 4O7FA 4UYGA 5C8GA 4WIVA 5JI8A 4NR6A 5CQ8A 5HFRA 4A9HA 4LR6A 4HXPA 4N4GA 2OSSA 5CS8A 4O7AA 3P1EA 5EISA 4IR5A 4HBWA 5DKCA 4O72A 5A5QA 2H60A 4A9MA 5F36A 2RO1A 5I40A 2E7OA 2F6NA 5FE4A 4NYWA 4YY6A 4AKNA 5A83A 4CUQA 5BT5A 5CQ4A 4YYJA 4UIZA 5CQTA 4ZW1A 2R0YA 5BT4A 4Z1QA 4OGIA 3UVWA 5A5NA 5CUGA 4TU6A 5A82A 3P1DA 5TB6A 4HXOA 5IBNA 5CQAA 5EA1A 5J0DA 4IOQA 4QBMA 5F62A 5EGUA 5EWWA 5COIA 5FFWA 5D3SA 3P1FA 4QEVA 5F25A 3QZTA 5A85A 5HEMA 5IIDA 4HXKA 5L98A 3LQJA 4NRCA 4NS5A 3U5MA 4UYDA 3LQIA 4PCIA 4WHWA 3Q2EA 4NRAA 4YADA 5F63A 5L96A 5C4QA 2YEMA 3IU5A 4TU4A 4NRBA 5CQ7A 3K2JA 5DFCA 4A9OA 5LJ0A 5E9LA 4QSWA 4IR4A 5FFVA 4QR5A 4LZ2A 3UW9A 5FE8A 5I88A 5FB0A 2DVSA 5CQ5A 2R0VA 4CUPA 4BHWA 4CUSA 1WUGA 4TT2A 4MENA 5A5PA 3U5JA 5EWHA 5CUEA 5AMFA 5E9YA 3P1CA 3ONIA 3RCWA 3SVHA 5E7DA 5I7XA 4J0SA 3UV5A 5ENHA 5KTXA 4NUEA 3HMEA 3AADA 4A9JA 5EWCA 5LUUA 5FE1A 4TT4A 4X2IA 3IU6A 2RNXA 2KTBB 4QUTA 4MR3A 5D26A 4XY8A 4QEWA 2L84A 2FSAA 4CFLA 5CUCA 5ENCA 4UYFA 4PTBA 5HJCA 4Z1SA 3MB4A 3JVJA 5ENFA 4HBVA 4HBXA 3P5OA 5EWVA 5L97A 4ZC9A 3SVFA 2MJVB 4YYKA 5CRZA 4LRGA 4LZSA 4YYNA 5DFDA 4KV1A 5I83A 4O70A 4QC3A 1JM4B 3QZVA 5HENA 1F68A 4O76A 4Y03A 4YYMA 4LYWA 4O77A 2YW5A 1ZS5A 5I89A 4O78A 5D7XA 3UVDA 5HQ6A 5CUDA 3O33A 5ENBA 5II1A 4YK0A 5C87A 4BW3A 5CPEA 5IGLA 5D3HA 5K29A 4HXSA 4YYDA 3JVKA 4IORA 5FE3A 5IGKA 2WP1A 5DLXA 4OUFA 4XUBA 4C66A 4LYIA 5D3JA 5G4RA 4TTEA 4PCEA 5E0RA 5EPRA 4YYHA 3O34A 2DWWA 5LJ1A 4J1PA 5FG4A 2LSPB 3I3JA 4PKLA 5EVAA 5ENJA 5H1VA 3U5NA 4QZSA 4IR3A 5DYXA 4CURA 5E9KA 4QSVA 3QZSA 2OO1A 4QSUA 4Z6IA 5AD3A 5FE2A 5LJ2A 5DYAA 5E74A 4YH4A 5FBXA 4HXLA 4KV4A 4CLBA 5KU3A 4O7BA 4OGJA 5LKUA 5I86A 3U5OA 3HMHA 5E9IA 3DAIA 4MR4A 5ACYA 4QC1A 4QSXA 2D82A 4NR4A 5A5RA 4F3IA 3SVGA 3ZYUA 4A9NA 2RNWA 5A5OA 4IR6A 4LYSA 5ENGA 5EQ1A 2DKWA 5H1UA 4Z93A 4NQMA 5TCMA 3U5LA 5HCLA 4A9IA 5FH6A 5C89A 5HM0A 5DLZA 4YAXA 4Q0OA 4NR8A 4QEUA 4QB3A 3GG3A 5FB1A 3MQMA 5JWMA 4KCXA 5AMEA 5ETBA 4NQNA 4TZ2A 5CQ6A 3MULA 5I1QA 4ZQLA 1WUMA 2RNYA 4TS8A 4QYDA 4CL9A 3LXJA 4J3IA 2WP2A 4A9LA 4LDFA 5HFQA 1JSPB 4UYEA 4NYVA 4O71A 5DY7A 4NUCA 3LJWA 5DFBA 5L99A 3O35A 4O75A 5FE7A 2R10A 4YC9A 2YELA 4UIYA 4UIVA 2DVQA 2DVVA 5EWDA 4TZ8A 5F1LA 4N4FA 5CP5A 4E96A 2D9EA 4QSPA 2YYNA 3G0JA 5FE0A 2RFJA 5LKTA 3MB3A 5EPBA 3Q2FA 4HXRA 4N4IA 5I7YA 5EM3A 5CTLA 2GRCA 4PY6A 5DYUA 4HXNA 4QR4A 5D3NA 4N3WA 2I8NA 4BW1A 4QY4A 5E9VA 5CU8A 5CQ3A 2NXBA 4YATA 4MEQA 3MUKA 4UIXA 3JVLA 3O37A 4NYXA 5CRMA 4MEPA 5LVQA 5F3AA 5LKZA 4LC2A 5FH7A 5DBMA 5CFWA 5KHMA 4A9EA 4XUAA 2G4AA 4QSTA 4J0RA 5EV9A 5HQ7A 5H1TA 2I7KA 4UYHA 4C67A 4MR5A 3S91A 4XYAA 5FE9A 3UV2A 5C85A 4MEOA 5C7NA 4HBYA 4FLPA 4QSQA 5D3PA 5DYCA 5IG6A 4YYGA 5I29A 2E3KA 5ENEA 5CUBA 4O7CA 4UIUA 5D3TA 4BW2A 5DW2A 4O74A 4BW4A 2E7NA 4DONA 4YY4A 5F2PA 5DKHA 4YBMA 4QR3A 5EICA 5A7CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DX4A 5I80A 5HQ5A 5FE5A 2RI7A 4Z6HA 5A5SA 3DWYA 1EQFA 5D24A 4NXJA 1N72A 4UYFB 5BT3A 5EPSA 4QSRA 4YABA 2L5EA 2YQDA 5IGNA 5E9MA 5ENIA 5LVRA 5ETDA 2R0SA 5D3LA 5HELA 1X0JA 2OUOA 5DW1A 5FDZA 4NR9A 4UITA 5KTUA 4ALHA 5KO4A 4TT6A 4TYLA 3AQAA 4CUUA 5F1HA 5CUAA 3UV4A 5EP7A 3FKMX 5F60A 3JVMA 3HMFA 5HRXA 5LKXA 3LQHA 4HXMA 4NUDA 3NXBA 5FE6A 5FFYA 3TLPA 1E6IA 4A9KA 5H85A 5EI4A 4N4HA 5DKDA 5HRVA 4O7EA 5II2A 5EK9A 5A81A 2DVRA 3U5KA 5HLSA 3U5PA 4MR6A 5KTWA 3UVXA 5L8TA 5D0CA 5G4SA 4UIWA 3O36A 2DATA 4RVRA 4A9FA 4CFKA 2F6JA 5F5ZA 4QUUA 4YYIA 4TQNA 5CZGA 5AD2A 2RS9B 4PS5A 5D3RA 4NR7A 3S92A 4CUTA 4XY9A 5E3DA 4YH3A 5FH8A 3MXFA 5D25A 4YBTA 4WHUA 5IGMA 2N9GA 3D7CA 4GPJA 5FG5A 4BJXA 4QSSA 3VKGA 4QYLA 5CY9A 4NR5A 5E73A 5HRWA 5E3GA 2YDWA 3G0LA 5EU1A 2L85A 4ALGA 3UVYA 4Q0NA 5CGPA 4IOOA 4YBSA 4LZRA 5F61A 4QNSA 5FG6A 2YEKA 5L8UA 4O7FA 4UYGA 5C8GA 4WIVA 5JI8A 4NR6A 5CQ8A 5HFRA 4A9HA 4LR6A 4HXPA 4N4GA 2OSSA 5CS8A 4O7AA 3P1EA 5EISA 4IR5A 4HBWA 5DKCA 4O72A 5A5QA 2H60A 4A9MA 5F36A 2RO1A 5I40A 2E7OA 2F6NA 1ZKRA 5FE4A 4NYWA 4YY6A 4AKNA 5A83A 4CUQA 5BT5A 5CQ4A 4YYJA 4UIZA 5CQTA 4ZW1A 2R0YA 5BT4A 4Z1QA 4OGIA 3UVWA 5A5NA 5CUGA 4TU6A 5A82A 3P1DA 5TB6A 4HXOA 5IBNA 5CQAA 5EA1A 1PUOA 5J0DA 4IOQA 4QBMA 5F62A 5EGUA 5EWWA 5COIA 5FFWA 5D3SA 3P1FA 4QEVA 5F25A 3QZTA 5A85A 5HEMA 5IIDA 4HXKA 5L98A 3LQJA 4NRCA 4NS5A 3U5MA 4UYDA 3LQIA 4PCIA 4WHWA 3Q2EA 4NRAA 4YADA 5F63A 5L96A 5C4QA 2YEMA 3IU5A 4TU4A 4NRBA 5CQ7A 3K2JA 5DFCA 4A9OA 5LJ0A 5E9LA 4QSWA 4IR4A 5FFVA 4QR5A 4LZ2A 3UW9A 5FE8A 5I88A 5FB0A 2DVSA 5CQ5A 2R0VA 4CUPA 4BHWA 4CUSA 1WUGA 4TT2A 4MENA 5A5PA 3U5JA 5EWHA 5CUEA 5AMFA 5E9YA 3P1CA 3ONIA 3RCWA 3SVHA 5E7DA 5I7XA 4J0SA 3UV5A 5ENHA 5KTXA 4NUEA 3HMEA 3AADA 4A9JA 5EWCA 5LUUA 5FE1A 4TT4A 4X2IA 3IU6A 2RNXA 2KTBB 4QUTA 4MR3A 5D26A 4XY8A 4QEWA 2L84A 2FSAA 4CFLA 5CUCA 5ENCA 4UYFA 4PTBA 5HJCA 4Z1SA 3MB4A 3JVJA 5ENFA 4HBVA 4HBXA 3P5OA 5EWVA 5L97A 4ZC9A 3SVFA 2MJVB 4YYKA 5CRZA 4LRGA 2EJNA 4LZSA 4YYNA 5DFDA 4KV1A 5I83A 4O70A 4QC3A 1JM4B 3QZVA 5HENA 1F68A 4O76A 4Y03A 4YYMA 4LYWA 4O77A 2YW5A 1ZS5A 5I89A 4O78A 5D7XA 3UVDA 5HQ6A 5CUDA 3O33A 5ENBA 5II1A 4YK0A 4AI6A 5C87A 4BW3A 5CPEA 5IGLA 5D3HA 5K29A 4HXSA 4YYDA 3JVKA 4IORA 5FE3A 5IGKA 2WP1A 5DLXA 4OUFA 4XUBA 4C66A 4LYIA 5D3JA 5G4RA 4TTEA 4PCEA 5E0RA 3ERRA 5EPRA 4YYHA 3O34A 2DWWA 5LJ1A 4J1PA 5FG4A 2LSPB 3I3JA 4PKLA 5EVAA 5ENJA 5H1VA 3U5NA 4QZSA 4IR3A 5DYXA 4CURA 5E9KA 4QSVA 3QZSA 2OO1A 4QSUA 4Z6IA 5AD3A 5FE2A 5LJ2A 5DYAA 5E74A 4YH4A 5FBXA 4HXLA 4KV4A 4CLBA 5KU3A 4O7BA 4OGJA 5LKUA 5I86A 3U5OA 3HMHA 5E9IA 3DAIA 4MR4A 5ACYA 4QC1A 4QSXA 2D82A 4NR4A 5A5RA 4F3IA 3D1BA 3D1DA 3SVGA 3ZYUA 4A9NA 2RNWA 5A5OA 4IR6A 4LYSA 5ENGA 5EQ1A 2DKWA 5H1UA 4Z93A 4NQMA 5TCMA 3U5LA 5HCLA 4A9IA 5FH6A 5C89A 5HM0A 5DLZA 4YAXA 4Q0OA 4NR8A 4QEUA 4QB3A 3GG3A 5FB1A 3MQMA 5JWMA 4KCXA 5AMEA 5ETBA 4NQNA 4TZ2A 5CQ6A 3MULA 5I1QA 4ZQLA 1WUMA 2RNYA 4TS8A 4QYDA 4CL9A 3LXJA 4J3IA 2WP2A 4A9LA 4LDFA 5HFQA 1JSPB 4UYEA 4NYVA 4O71A 5DY7A 4NUCA 3LJWA 5DFBA 5L99A 3O35A 4AKGA 4O75A 5FE7A 2R10A 4YC9A 2YELA 4UIYA 4UIVA 2DVQA 2DVVA 5EWDA 4TZ8A 5F1LA 4N4FA 5CP5A 4E96A 2D9EA 4QSPA 2YYNA 3G0JA 5FE0A 2RFJA 4AKHA 5LKTA 3MB3A 5EPBA 3Q2FA 4HXRA 4N4IA 5I7YA 5EM3A 5CTLA 2GRCA 4PY6A 5DYUA 4HXNA 4QR4A 5D3NA 4N3WA 2I8NA 4BW1A 4QY4A 5E9VA 5CU8A 5CQ3A 2NXBA 4YATA 4MEQA 3MUKA 4UIXA 3JVLA 3O37A 4NYXA 5CRMA 4MEPA 5LVQA 4AKIA 5F3AA 5LKZA 4LC2A 5FH7A 5DBMA 5CFWA 5KHMA 4A9EA 4XUAA 2G4AA 4QSTA 4J0RA 5EV9A 5HQ7A 5H1TA 2I7KA 4UYHA 4C67A 4MR5A 3S91A 4XYAA 5FE9A 3UV2A 5C85A 4MEOA 5C7NA 4HBYA 4FLPA 4QSQA 5D3PA 5DYCA 5IG6A 4YYGA 5I29A 2E3KA 5ENEA 5CUBA 4O7CA 3VKHA 4UIUA 5D3TA 4BW2A 5DW2A 4O74A 4BW4A 2E7NA 4DONA 4YY4A 5F2PA 5DKHA 4YBMA 4QR3A 5EICA 5A7CA
chains in the Genus database with same CATH topology
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