5I7XA

Brd9 in complex with cpd2 (n,n-dimethyl-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1h-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Rna binding protein
source organism Homo sapiens
publication title Diving into the Water: Inducible Binding Conformations for BRD4, TAF1(2), BRD9, and CECR2 Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
total genus 36
structure length 101
sequence length 101
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i7xA00
2R0SA 4X2IA 4QR3A 2DVRA 5CFWA 1EQFA 4MEQA 5EU1A 1X0JA 5HQ6A 3AQAA 4WIVA 3P1CA 3LQHA 5H85A 5DYCA 5BT5A 4LZSA 4O7AA 5IG6A 4CUUA 5F5ZA 2RNYA 3UW9A 5C4QA 5DFCA 4OUFA 5L97A 3U5PA 4KCXA 5ENIA 3GG3A 4YYIA 4PY6A 4QEWA 3SVGA 5A85A 4O71A 2KTBB 4A9LA 5AMFA 4A9OA 4Z93A 4C67A 3U5OA 4NR6A 5FG4A 4QB3A 5JWMA 5E3DA 4IOOA 2DKWA 5CQ6A 5D3TA 2RFJA 5FE9A 4QSUA 5ETDA 1F68A 5C7NA 4BW1A 2RNXA 4HXLA 3MB4A 5CTLA 5EGUA 5DYXA 4FLPA 5EICA 5FG5A 5IGKA 2L84A 5HRVA 4CUSA 5CU8A 5L96A 5EWDA 3HMHA 4WHUA 2E7OA 4LYSA 5G4SA 4O7BA 4ALGA 5CRZA 4N4FA 5CUBA 5FE1A 3UVYA 4UYEA 5E9LA 4HXKA 3Q2EA 5FFYA 4NYWA 4YC9A 4O70A 2E7NA 4N4HA 4UIUA 5FE2A 3UV2A 5HFRA 4ZC9A 2D82A 4NYVA 4YYNA 5FH8A 4QEUA 5HENA 5A82A 2RO1A 3U5KA 4QSRA 3LQIA 5HLSA 4A9KA 5ENBA 5F62A 5ENCA 4IR5A 5KHMA 4BW4A 5DFDA 5C89A 5EA1A 3IU6A 5F60A 4LZ2A 2GRCA 4LC2A 4A9MA 5HQ7A 3SVFA 4N4IA 5I40A 4YH3A 5KTXA 5FE0A 4PS5A 5F1HA 5HFQA 4NR9A 3U5JA 4QY4A 5D25A 5E9MA 3P1EA 4MEOA 5DYAA 4NUCA 5ENFA 2NXBA 4A9FA 4QR5A 5D3HA 4Y03A 5LKUA 5D7XA 4HBYA 5HQ5A 4TT4A 3TLPA 4BJXA 5CPEA 4TYLA 4YBMA 4TS8A 5CQ4A 4XUBA 5EK9A 5DKHA 5L98A 5II1A 5D24A 5LKTA 5DX4A 5HJCA 5H1VA 4NYXA 4QSXA 4Z6HA 2DWWA 5FE3A 4LYIA 4YY4A 4YYGA 4E96A 4QSTA 5L8TA 3DWYA 5FH6A 4YYDA 2YQDA 5E9YA 4A9HA 4O75A 1WUMA 4QSSA 4YADA 4BW2A 2DVVA 4XY8A 4QBMA 4NR8A 4O76A 1N72A 5EP7A 3U5MA 4NS5A 4A9IA 5K29A 2OO1A 2R0VA 4UITA 5DLXA 4OGIA 5EWWA 5CQ5A 5LKXA 2RS9B 5JI8A 2F6JA 4HBWA 5D26A 4TT6A 4XYAA 5CRMA 4MEPA 5IGMA 5CQAA 1JSPB 5CQ8A 5DKCA 5FDZA 4KV4A 5DKDA 5CGPA 4UIVA 3JVKA 3O37A 5F63A 3NXBA 3P1FA 4HBVA 5ACYA 5L8UA 4HXSA 4O7EA 5D3LA 4PCEA 3AADA 5C87A 3ZYUA 5DLZA 4O74A 5II2A 4WHWA 5HRXA 4J3IA 4IORA 4UIYA 3I3JA 3LQJA 4CLBA 4LDFA 2DATA 4LRGA 4QYDA 4Q0NA 5F36A 4QC1A 4UYFB 4RVRA 5AMEA 5CUEA 5FBXA 4ZW1A 4YBSA 5G4RA 4NR5A 5F3AA 4KV1A 2YDWA 4TT2A 2DVSA 5ENJA 3MXFA 5EISA 5HELA 2L5EA 3UVWA 5D3NA 5D3PA 5HRWA 5BT3A 5I88A 4YABA 4LR6A 3O34A 5A7CA 5ENEA 3D7CA 5EPRA 4N3WA 4NUEA 4QUUA 5FG6A 5H1UA 3U5LA 2YEKA 5A81A 4HXMA 5DW2A 4QSVA 2L85A 4TZ8A 2FSAA 5C85A 4CFKA 4UIZA 5TB6A 5LJ0A 2YELA 4J0SA 4QNSA 5A5NA 4UIWA 2I7KA 3MB3A 5KU3A 5I86A 4J0RA 4LYWA 5FE5A 4Z1QA 2LSPB 4CURA 5CQ3A 5A83A 4MR5A 5IGNA 4NR7A 5COIA 4QSWA 5CUGA 4O7FA 5FH7A 3JVLA 4QSQA 4TTEA 5CQ7A 5I1QA 5D0CA 3JVMA 5F2PA 4A9EA 3MUKA 2F6NA 4UIXA 4UYFA 5F61A 5I83A 4YYHA 4F3IA 5EPBA 5TCMA 4DONA 5CS8A 5C8GA 3MQMA 4IOQA 4PTBA 2RNWA 3QZSA 5BT4A 2WP1A 4MR4A 3HMFA 4YY6A 5HCLA 4ALHA 4QYLA 4MR3A 5E73A 3K2JA 3S91A 3ONIA 5I89A 4Q0OA 5CZGA 4C66A 4TZ2A 5KTUA 5E3GA 3LXJA 5EWHA 3S92A 3UVDA 5LJ1A 3LJWA 2I8NA 5F1LA 5LVQA 5A5OA 3O35A 4N4GA 5DW1A 4QEVA 5AD2A 5FFWA 5FB0A 5F25A 4XY9A 5D3JA 4QUTA 4HXPA 4TQNA 5IIDA 4A9NA 5A5SA 5D3SA 4UYHA 2OSSA 4YBTA 2N9GA 5LVRA 4ZQLA 5EV9A 4NUDA 4YAXA 4YYKA 5HM0A 5H1TA 5HEMA 5I80A 3QZTA 5E74A 5J0DA 5E7DA 3DAIA 5DBMA 5ETBA 2RI7A 3O36A 4QC3A 3SVHA 5LUUA 5EI4A 4NQNA 5DFBA 4YYMA 5A5PA 3QZVA 3MULA 5I7XA 5CUDA 4MENA 4MR6A 5E9KA 4HXOA 5FFVA 4NXJA 2D9EA 3G0JA 4YH4A 5AD3A 4YYJA 4HBXA 4BW3A 4LZRA 4TU6A 2G4AA 5EVAA 5A5QA 5LJ2A 5EPSA 3P5OA 5E9VA 5LKZA 4QR4A 4UYDA 5CUAA 2WP2A 4HXRA 2H60A 4NRAA 4O72A 4OGJA 5I7YA 5FB1A 2OUOA 3G0LA 5DY7A 3RCWA 4O78A 2YW5A 4NR4A 4UYGA 4CFLA 5DYUA 4CUQA 5ENHA 2E3KA 1E6IA 5IGLA 4TU4A 5ENGA 5CY9A 2R0YA 5CUCA 2MJVB 5FE7A 4CUPA 3UV4A 1JM4B 5EQ1A 2YEMA 4O7CA 4J1PA 5EWVA 5CP5A 4A9JA 3UVXA 4AKNA 2DVQA 3HMEA 5FE4A 3IU5A 4YATA 3U5NA 4IR3A 1ZS5A 3JVJA 4NRCA 3Q2FA 4QSPA 4YK0A 5KO4A 2YYNA 4CL9A 1WUGA 3FKMX 4XUAA 4PCIA 5EM3A 5I29A 3P1DA 4GPJA 4O77A 5CQTA 5FE6A 4CUTA 4NQMA 4BHWA 5E9IA 4PKLA 5L99A 4NRBA 3O33A 5FE8A 5EWCA 5E0RA 4Z6IA 4IR4A 4Z1SA 4HXNA 4QZSA 2R10A 3UV5A 5KTWA 5D3RA 5IBNA 4IR6A 5A5RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R0SA 4X2IA 4QR3A 2DVRA 5CFWA 1EQFA 4MEQA 5EU1A 1X0JA 5HQ6A 3AQAA 4WIVA 3P1CA 3LQHA 5H85A 5DYCA 5BT5A 4LZSA 4O7AA 5IG6A 4CUUA 5F5ZA 2RNYA 3UW9A 5C4QA 5DFCA 4OUFA 5L97A 3U5PA 4KCXA 5ENIA 3GG3A 4YYIA 4PY6A 4QEWA 3SVGA 5A85A 4O71A 2KTBB 4A9LA 5AMFA 4A9OA 4Z93A 4C67A 3U5OA 4NR6A 5FG4A 4QB3A 5JWMA 5E3DA 4IOOA 2DKWA 5CQ6A 5D3TA 2RFJA 5FE9A 4QSUA 5ETDA 1F68A 5C7NA 4BW1A 2RNXA 4HXLA 3MB4A 5CTLA 5EGUA 5DYXA 4FLPA 5EICA 5FG5A 5IGKA 2L84A 5HRVA 4CUSA 5CU8A 5L96A 5EWDA 3HMHA 4WHUA 2E7OA 4LYSA 5G4SA 4O7BA 4ALGA 5CRZA 4AI6A 4N4FA 5CUBA 5FE1A 3UVYA 4UYEA 5E9LA 4HXKA 3Q2EA 5FFYA 4NYWA 4YC9A 4O70A 2E7NA 4N4HA 4UIUA 5FE2A 3UV2A 5HFRA 4ZC9A 2D82A 4NYVA 4YYNA 1ZKRA 5FH8A 4QEUA 5HENA 5A82A 2RO1A 3U5KA 4QSRA 3LQIA 5HLSA 4A9KA 5ENBA 5F62A 5ENCA 4IR5A 5KHMA 4BW4A 5DFDA 5C89A 5EA1A 3IU6A 5F60A 4LZ2A 2GRCA 4LC2A 4A9MA 5HQ7A 3SVFA 4N4IA 5I40A 4YH3A 5KTXA 5FE0A 4PS5A 5F1HA 5HFQA 4NR9A 3U5JA 4QY4A 5D25A 5E9MA 3P1EA 4MEOA 5DYAA 4NUCA 5ENFA 2NXBA 4A9FA 4QR5A 5D3HA 4Y03A 5LKUA 5D7XA 4HBYA 5HQ5A 4TT4A 3TLPA 4BJXA 5CPEA 4TYLA 4YBMA 4TS8A 5CQ4A 4XUBA 5EK9A 5DKHA 5L98A 5II1A 5D24A 5LKTA 5DX4A 5HJCA 5H1VA 4NYXA 4QSXA 4Z6HA 2DWWA 5FE3A 4LYIA 4YY4A 4YYGA 4E96A 4QSTA 5L8TA 3DWYA 5FH6A 4YYDA 2YQDA 5E9YA 4AKIA 4A9HA 4O75A 1WUMA 4QSSA 4YADA 4BW2A 2DVVA 4XY8A 4QBMA 4NR8A 4O76A 1N72A 5EP7A 3U5MA 4NS5A 4A9IA 5K29A 2OO1A 2R0VA 4UITA 5DLXA 4OGIA 5EWWA 5CQ5A 5LKXA 2RS9B 5JI8A 2F6JA 4HBWA 5D26A 4TT6A 4XYAA 5CRMA 4MEPA 5IGMA 5CQAA 1JSPB 5CQ8A 5DKCA 5FDZA 4KV4A 5DKDA 5CGPA 4UIVA 3JVKA 3O37A 5F63A 3NXBA 3P1FA 4HBVA 5ACYA 5L8UA 4HXSA 4O7EA 5D3LA 4PCEA 3AADA 5C87A 3ZYUA 5DLZA 4O74A 5II2A 4WHWA 5HRXA 4J3IA 4IORA 4UIYA 3I3JA 3LQJA 4CLBA 4LDFA 2DATA 4LRGA 4QYDA 4Q0NA 5F36A 4QC1A 4UYFB 4RVRA 5AMEA 5CUEA 5FBXA 4ZW1A 4YBSA 5G4RA 4NR5A 5F3AA 4KV1A 2YDWA 4TT2A 2DVSA 5ENJA 3MXFA 5EISA 5HELA 2L5EA 1PUOA 3UVWA 5D3NA 5D3PA 5HRWA 5BT3A 5I88A 4YABA 4LR6A 3O34A 5A7CA 5ENEA 3D7CA 5EPRA 4N3WA 4NUEA 4QUUA 5FG6A 5H1UA 3U5LA 2YEKA 5A81A 4HXMA 5DW2A 4QSVA 2L85A 4TZ8A 2FSAA 5C85A 4CFKA 4UIZA 5TB6A 5LJ0A 2YELA 4J0SA 4QNSA 5A5NA 4UIWA 2I7KA 3MB3A 5KU3A 5I86A 4J0RA 4LYWA 5FE5A 4Z1QA 2LSPB 4CURA 5CQ3A 5A83A 4MR5A 5IGNA 4NR7A 5COIA 4QSWA 5CUGA 4O7FA 5FH7A 3JVLA 4QSQA 4TTEA 5CQ7A 5I1QA 5D0CA 3JVMA 5F2PA 4A9EA 3MUKA 2F6NA 4UIXA 3D1BA 4UYFA 5F61A 3VKHA 5I83A 4YYHA 4F3IA 5EPBA 5TCMA 4DONA 5CS8A 5C8GA 3MQMA 4IOQA 4PTBA 2RNWA 3QZSA 5BT4A 2WP1A 4MR4A 3HMFA 4YY6A 5HCLA 4ALHA 3VKGA 4QYLA 4MR3A 5E73A 3K2JA 3S91A 3ONIA 5I89A 4Q0OA 5CZGA 4C66A 4TZ2A 5KTUA 5E3GA 3LXJA 5EWHA 3S92A 3UVDA 5LJ1A 3LJWA 2I8NA 5F1LA 5LVQA 5A5OA 3O35A 4N4GA 5DW1A 4QEVA 5AD2A 5FFWA 5FB0A 5F25A 4XY9A 5D3JA 2EJNA 4QUTA 4HXPA 4TQNA 5IIDA 4A9NA 5A5SA 5D3SA 4UYHA 2OSSA 4YBTA 2N9GA 5LVRA 4ZQLA 5EV9A 4NUDA 4YAXA 4YYKA 5HM0A 5H1TA 5HEMA 5I80A 3QZTA 5E74A 5J0DA 5E7DA 3DAIA 4AKHA 5DBMA 5ETBA 2RI7A 3O36A 4QC3A 3SVHA 5LUUA 5EI4A 4NQNA 5DFBA 4YYMA 5A5PA 3QZVA 3MULA 5I7XA 3ERRA 5CUDA 4MENA 4MR6A 5E9KA 4HXOA 5FFVA 4NXJA 2D9EA 3G0JA 4YH4A 5AD3A 4YYJA 4HBXA 4BW3A 3D1DA 4LZRA 4TU6A 2G4AA 5EVAA 5A5QA 5LJ2A 5EPSA 3P5OA 5E9VA 5LKZA 4QR4A 4UYDA 5CUAA 2WP2A 4HXRA 2H60A 4NRAA 4O72A 4OGJA 5I7YA 4AKGA 5FB1A 2OUOA 3G0LA 5DY7A 3RCWA 4O78A 2YW5A 4NR4A 4UYGA 4CFLA 5DYUA 4CUQA 5ENHA 2E3KA 1E6IA 5IGLA 4TU4A 5ENGA 5CY9A 2R0YA 5CUCA 2MJVB 5FE7A 4CUPA 3UV4A 1JM4B 5EQ1A 2YEMA 4O7CA 4J1PA 5EWVA 5CP5A 4A9JA 3UVXA 4AKNA 2DVQA 3HMEA 5FE4A 3IU5A 4YATA 3U5NA 4IR3A 1ZS5A 3JVJA 4NRCA 3Q2FA 4QSPA 4YK0A 5KO4A 2YYNA 4CL9A 1WUGA 3FKMX 4XUAA 4PCIA 5EM3A 5I29A 3P1DA 4GPJA 4O77A 5CQTA 5FE6A 4CUTA 4NQMA 4BHWA 5E9IA 4PKLA 5L99A 4NRBA 3O33A 5FE8A 5EWCA 5E0RA 4Z6IA 4IR4A 4Z1SA 4HXNA 4QZSA 2R10A 3UV5A 5KTWA 5D3RA 5IBNA 4IR6A 5A5RA
chains in the Genus database with same CATH topology
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