4HXNA

Brd4 bromodomain 1 complex with 4-(2-fluorophenyl)-1,3-thiazol-2(3h)-one inhibitor
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxnA01
5L8TA 3P1EA 4NYVA 4QYDA 4YH3A 4QSUA 4WIVA 4NR9A 2I8NA 5IGMA 4QR3A 3LJWA 4Z6IA 5FFVA 3LQIA 5CUGA 5A7CA 2YQDA 4LZ2A 4UYFA 4BW2A 5A5OA 4HBXA 5L99A 4OUFA 5DBMA 3O33A 5E0RA 2F6JA 5L97A 4HXRA 5FE3A 5CFWA 4QEVA 4NRCA 5F63A 5DY7A 5EWDA 5HM0A 3HMHA 5C87A 4IR3A 2DWWA 5LKTA 5D3JA 4HBVA 4UIUA 5CUBA 2YEMA 4YYJA 5D3LA 5ENBA 4QC3A 5IG6A 4LYSA 5II2A 5LKZA 4UIXA 4HXSA 4HXKA 4MR6A 2I7KA 5E73A 2WP1A 5CU8A 4PCIA 4O7CA 3JVKA 5K29A 5FE9A 3TLPA 1WUMA 5AMFA 5FG6A 2DATA 5CRMA 4LRGA 4YY4A 5DKDA 4O7FA 5IBNA 4Y03A 4GPJA 5I7XA 5E9LA 4MEQA 2MJVB 4C67A 3UV4A 4QR4A 4YYGA 2YELA 5TCMA 4QNSA 4NR8A 4YYIA 4TQNA 2F6NA 5E9VA 5EISA 5HFQA 2R0YA 4OGJA 4YY6A 4QY4A 4N4IA 4J0SA 5D3RA 5EPSA 4YABA 4CUSA 3SVGA 1X0JA 1EQFA 3G0LA 3ONIA 4PCEA 3JVMA 5ENHA 4O76A 4J0RA 4QSQA 4NR5A 5DYUA 5EICA 3Q2EA 3S92A 4YYHA 3O37A 2RNXA 2DVVA 4TU4A 5IIDA 2OSSA 3SVHA 4UIVA 4BW4A 5ENJA 5DYCA 4QSRA 4ALGA 3DAIA 5KTWA 5FB0A 4WHUA 4CUQA 5E74A 5E9KA 4LZSA 5CQTA 4O7AA 5HRVA 4KCXA 5DLZA 5EA1A 3HMFA 2RO1A 4UYDA 4XUAA 4ZW1A 4O70A 5H85A 3FKMX 4IOQA 5AD2A 4N4GA 5D3TA 5FH7A 5KHMA 4ZQLA 4O75A 5FH8A 4NRAA 5LJ0A 4IORA 4NUCA 5HRXA 5DW1A 5ETDA 3QZTA 5CUEA 4TZ8A 4KV4A 4NR4A 5F61A 1ZS5A 3JVJA 2D9EA 2E7NA 5FE8A 2RNWA 5EGUA 3AQAA 2L85A 5ENIA 5KTXA 4MEPA 5FFWA 3U5NA 5I83A 5DKCA 4TZ2A 4A9NA 3MULA 5EM3A 5CUCA 4NRBA 5I86A 5HQ7A 3UV5A 4NYXA 5E3DA 5I40A 4QSWA 4TT4A 5F1HA 2DKWA 5ENFA 5G4SA 5F2PA 4IR5A 5A81A 4O77A 4YBSA 3U5JA 5BT3A 5CUDA 5ENGA 5I89A 4QSPA 4UIZA 3U5KA 5BT4A 4BW3A 4O72A 3Q2FA 3LXJA 5L96A 4TTEA 4N3WA 3P5OA 5D24A 5DFDA 4YC9A 5F5ZA 4XY9A 4MENA 5EK9A 5CQ5A 3UW9A 5I80A 5CZGA 4O78A 5FDZA 5A83A 5ENEA 5CQ4A 3DWYA 4NR6A 4QB3A 5AD3A 4F3IA 2KTBB 3U5MA 5EP7A 1F68A 5LUUA 5IGLA 4IOOA 3AADA 5EI4A 5C7NA 4BW1A 4YYNA 2YW5A 4QUUA 4CFKA 5H1UA 5D7XA 4LC2A 4BJXA 5II1A 5A5NA 2YYNA 5I88A 4UIYA 5CY9A 4J1PA 4XUBA 3UVDA 5D0CA 2RI7A 5F1LA 4UYHA 4LYWA 4Z93A 4O71A 4TYLA 3JVLA 4NYWA 2RS9B 4J3IA 5HLSA 5J0DA 4NR7A 3GG3A 4HBWA 4QUTA 5G4RA 3O36A 3S91A 2R0SA 5FE4A 3D7CA 3P1CA 4YAXA 4CFLA 4CUUA 3MXFA 5IGKA 3P1DA 4QC1A 4YADA 4PKLA 3MB4A 5ENCA 4C66A 5KTUA 4TS8A 4LZRA 5LJ2A 5A5RA 2LSPB 5KU3A 5F60A 5A5SA 5C4QA 4QSXA 5KO4A 5F3AA 4KV1A 4HXPA 5FB1A 4O7BA 4HBYA 5CS8A 1E6IA 5DKHA 4QR5A 5HJCA 5L98A 4LDFA 4ZC9A 3MB3A 5ACYA 5D3SA 4X2IA 4NS5A 4HXMA 5EPRA 4LR6A 3HMEA 2R10A 4O7EA 5HENA 5FH6A 4UIWA 4HXNA 4CL9A 5CRZA 2NXBA 5HCLA 4UYEA 5HELA 3U5PA 5CQ8A 3LQJA 4YYDA 4YYKA 4TU6A 3UV2A 5CQAA 5CPEA 3UVYA 4NQMA 5EQ1A 5F25A 5H1VA 2R0VA 2RFJA 4PS5A 3U5LA 5EU1A 4NUDA 4BHWA 4A9OA 5E9MA 5E3GA 5LKUA 4CUTA 4UITA 4FLPA 4YK0A 5A85A 4TT6A 4MR3A 1WUGA 5JWMA 5LVRA 5HQ6A 3G0JA 4QSVA 2YEKA 4E96A 2RNYA 5CQ3A 4RVRA 3I3JA 5FFYA 4A9EA 2DVQA 3MQMA 5LJ1A 3NXBA 4NXJA 2GRCA 4DONA 3O35A 3QZSA 5CQ6A 4A9JA 5C8GA 3U5OA 4N4FA 4A9LA 5HFRA 5FE5A 4YH4A 5DYAA 5TB6A 4A9FA 5E9YA 5HQ5A 5CP5A 2H60A 4HXOA 2YDWA 3O34A 2G4AA 2E3KA 5HRWA 4LYIA 4WHWA 2OUOA 5C85A 5EVAA 4XYAA 5E7DA 4ALHA 5LKXA 2D82A 2N9GA 5BT5A 4PY6A 4QZSA 2E7OA 3UVWA 4PTBA 5FE7A 5JI8A 2DVSA 4Q0NA 4QEWA 3IU6A 2WP2A 3RCWA 5DX4A 5FG4A 5CUAA 5D3HA 5CTLA 5D3NA 4MR4A 5AMEA 5DW2A 5EWWA 5FBXA 5L8UA 5EWHA 4QYLA 4Z1QA 5DLXA 5I29A 5FE6A 5COIA 5FE0A 4QBMA 2DVRA 3UVXA 4A9KA 4NUEA 3P1FA 2L5EA 5EWVA 1JSPB 5CQ7A 5C89A 4AKNA 2FSAA 5E9IA 4IR4A 4HXLA 5FE1A 5EWCA 4NQNA 3K2JA 4QSTA 5F36A 2OO1A 4Q0OA 4O74A 4OGIA 4CURA 4XY8A 3SVFA 5A5PA 3LQHA 3QZVA 5DYXA 3ZYUA 5I1QA 4A9HA 4MR5A 4UYFB 4MEOA 5EV9A 5ETBA 3IU5A 5H1TA 5A5QA 4QSSA 4UYGA 5CGPA 4N4HA 5DFCA 4Z1SA 4Z6HA 3MUKA 5D25A 4YBTA 5DFBA 5I7YA 4CLBA 5IGNA 1N72A 5F62A 5LVQA 4YBMA 4CUPA 5FG5A 2L84A 4TT2A 4A9IA 4YATA 4A9MA 5A82A 5D3PA 5EPBA 5HEMA 5FE2A 5D26A 4YYMA 4IR6A 1JM4B 4QEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L8TA 3P1EA 4NYVA 3ERRA 4QYDA 4YH3A 4QSUA 4WIVA 4NR9A 2I8NA 5IGMA 4QR3A 3LJWA 4Z6IA 5FFVA 3LQIA 5CUGA 5A7CA 2YQDA 4LZ2A 4UYFA 4BW2A 5A5OA 4HBXA 5L99A 4OUFA 5DBMA 3O33A 5E0RA 2F6JA 5L97A 4HXRA 5FE3A 5CFWA 4QEVA 4NRCA 5F63A 5DY7A 5EWDA 5HM0A 3HMHA 5C87A 4IR3A 2DWWA 5LKTA 5D3JA 4HBVA 4AKHA 4UIUA 5CUBA 2YEMA 4YYJA 5D3LA 5ENBA 4QC3A 5IG6A 1PUOA 4LYSA 5II2A 5LKZA 4UIXA 4HXSA 4HXKA 4MR6A 2I7KA 5E73A 2WP1A 5CU8A 4PCIA 4O7CA 3JVKA 5K29A 5FE9A 3TLPA 1WUMA 5AMFA 5FG6A 2DATA 5CRMA 4LRGA 4YY4A 5DKDA 4O7FA 5IBNA 4Y03A 4GPJA 5I7XA 5E9LA 4MEQA 2MJVB 4C67A 3UV4A 4QR4A 4YYGA 2YELA 5TCMA 4QNSA 4NR8A 4YYIA 4TQNA 2F6NA 5E9VA 5EISA 5HFQA 2R0YA 4OGJA 4YY6A 4QY4A 4N4IA 4J0SA 5D3RA 5EPSA 4YABA 4CUSA 3SVGA 1X0JA 1EQFA 3G0LA 3ONIA 4PCEA 3JVMA 5ENHA 4O76A 4J0RA 4QSQA 4NR5A 5DYUA 5EICA 3Q2EA 3S92A 4YYHA 3O37A 2RNXA 2DVVA 4TU4A 5IIDA 2OSSA 3SVHA 4UIVA 4BW4A 5ENJA 5DYCA 4QSRA 4ALGA 3DAIA 5KTWA 5FB0A 4WHUA 4CUQA 5E74A 5E9KA 4LZSA 5CQTA 4O7AA 5HRVA 4KCXA 5DLZA 5EA1A 3HMFA 2RO1A 4UYDA 4XUAA 4ZW1A 4O70A 5H85A 3FKMX 4IOQA 5AD2A 4N4GA 5D3TA 5FH7A 5KHMA 4ZQLA 4O75A 5FH8A 4NRAA 5LJ0A 4IORA 4NUCA 5HRXA 5DW1A 5ETDA 3QZTA 5CUEA 4TZ8A 4KV4A 4NR4A 5F61A 1ZS5A 3JVJA 2D9EA 2E7NA 5FE8A 2RNWA 5EGUA 3AQAA 2L85A 5ENIA 5KTXA 4MEPA 5FFWA 3U5NA 5I83A 5DKCA 4TZ2A 4A9NA 3MULA 5EM3A 5CUCA 4NRBA 5I86A 5HQ7A 3UV5A 4NYXA 5E3DA 5I40A 4QSWA 4TT4A 5F1HA 2DKWA 5ENFA 5G4SA 5F2PA 4IR5A 5A81A 4O77A 4YBSA 3U5JA 5BT3A 5CUDA 5ENGA 5I89A 4QSPA 4UIZA 3U5KA 5BT4A 4BW3A 4O72A 3Q2FA 3LXJA 5L96A 4TTEA 4N3WA 3P5OA 5D24A 5DFDA 4YC9A 5F5ZA 4XY9A 4MENA 5EK9A 5CQ5A 3UW9A 5I80A 5CZGA 4O78A 5FDZA 5A83A 5ENEA 5CQ4A 3DWYA 4NR6A 4QB3A 5AD3A 4F3IA 2KTBB 3U5MA 5EP7A 1F68A 5LUUA 5IGLA 4IOOA 3AADA 5EI4A 5C7NA 4BW1A 4YYNA 2YW5A 4QUUA 4CFKA 5H1UA 5D7XA 4LC2A 4BJXA 5II1A 5A5NA 2YYNA 3D1BA 5I88A 4UIYA 5CY9A 4J1PA 4XUBA 3UVDA 5D0CA 2RI7A 5F1LA 4UYHA 4LYWA 4Z93A 4O71A 4TYLA 3JVLA 4NYWA 2RS9B 4J3IA 5HLSA 5J0DA 4NR7A 3GG3A 4HBWA 4QUTA 5G4RA 3O36A 3S91A 2R0SA 5FE4A 3D7CA 3P1CA 4YAXA 4CFLA 4CUUA 3MXFA 5IGKA 3P1DA 4QC1A 4YADA 4PKLA 3MB4A 5ENCA 4C66A 5KTUA 4TS8A 4LZRA 5LJ2A 5A5RA 2LSPB 5KU3A 5F60A 5A5SA 5C4QA 4QSXA 5KO4A 5F3AA 4KV1A 4HXPA 5FB1A 4O7BA 4HBYA 5CS8A 1E6IA 3D1DA 5DKHA 4QR5A 5HJCA 5L98A 4LDFA 4ZC9A 3MB3A 5ACYA 5D3SA 4X2IA 4NS5A 4HXMA 5EPRA 4LR6A 3HMEA 2R10A 4O7EA 5HENA 5FH6A 4UIWA 4HXNA 4CL9A 5CRZA 2NXBA 5HCLA 4UYEA 5HELA 3U5PA 5CQ8A 3LQJA 4YYDA 4YYKA 4TU6A 3UV2A 5CQAA 5CPEA 3UVYA 4NQMA 5EQ1A 5F25A 5H1VA 2R0VA 2RFJA 4PS5A 3U5LA 5EU1A 4NUDA 4BHWA 4A9OA 5E9MA 5E3GA 5LKUA 4CUTA 4UITA 4FLPA 4YK0A 5A85A 4TT6A 4MR3A 1WUGA 5JWMA 5LVRA 5HQ6A 3G0JA 4QSVA 2YEKA 4E96A 2EJNA 2RNYA 5CQ3A 4RVRA 3I3JA 5FFYA 4A9EA 2DVQA 3MQMA 5LJ1A 3NXBA 4NXJA 2GRCA 4DONA 3O35A 3QZSA 5CQ6A 4A9JA 5C8GA 3U5OA 4N4FA 4A9LA 5HFRA 5FE5A 4YH4A 5DYAA 5TB6A 4A9FA 5E9YA 1ZKRA 5HQ5A 5CP5A 2H60A 4HXOA 2YDWA 3O34A 2G4AA 2E3KA 5HRWA 4LYIA 4WHWA 2OUOA 5C85A 5EVAA 4XYAA 5E7DA 4ALHA 5LKXA 2D82A 2N9GA 5BT5A 4PY6A 4QZSA 4AKGA 2E7OA 3UVWA 4PTBA 5FE7A 5JI8A 2DVSA 4Q0NA 4QEWA 3IU6A 2WP2A 3RCWA 5DX4A 5FG4A 5CUAA 5D3HA 5CTLA 5D3NA 4MR4A 5AMEA 5DW2A 5EWWA 5FBXA 5L8UA 5EWHA 4QYLA 4Z1QA 5DLXA 5I29A 5FE6A 5COIA 5FE0A 4QBMA 3VKGA 2DVRA 3UVXA 4A9KA 4NUEA 3P1FA 2L5EA 5EWVA 1JSPB 5CQ7A 4AI6A 5C89A 4AKNA 2FSAA 5E9IA 4IR4A 4HXLA 5FE1A 5EWCA 4NQNA 3K2JA 4QSTA 5F36A 2OO1A 4Q0OA 4O74A 4OGIA 4CURA 4XY8A 3SVFA 5A5PA 3LQHA 3QZVA 5DYXA 3ZYUA 5I1QA 4A9HA 4MR5A 4UYFB 4MEOA 5EV9A 5ETBA 3IU5A 5H1TA 5A5QA 4QSSA 4UYGA 5CGPA 4N4HA 5DFCA 4Z1SA 4Z6HA 3MUKA 5D25A 4AKIA 4YBTA 5DFBA 5I7YA 4CLBA 5IGNA 1N72A 5F62A 5LVQA 4YBMA 4CUPA 5FG5A 3VKHA 2L84A 4TT2A 4A9IA 4YATA 4A9MA 5A82A 5D3PA 5EPBA 5HEMA 5FE2A 5D26A 4YYMA 4IR6A 1JM4B 4QEUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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