2OSSA

Crystal structure of the bromo domain 1 in human bromodomain containing protein 4 (brd4)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2ossA01
5D26A 2YDWA 4HXMA 4O7BA 4O78A 4HXOA 5DW1A 5DYXA 5CY9A 5L97A 5EA1A 5FDZA 5CU8A 4QC3A 5AMFA 5C89A 3U5KA 2D9EA 5I7XA 4NR6A 4QYDA 3JVKA 5CP5A 5ENCA 5FFVA 4LC2A 4TU4A 4LDFA 5E9IA 5EWCA 5F25A 4IR5A 4QSSA 5HM0A 5L98A 4A9KA 3RCWA 4ALGA 1F68A 2NXBA 4N4HA 4NS5A 4YYMA 5LKUA 5ACYA 4LYSA 4NUEA 4WHWA 5I1QA 5EI4A 4TTEA 5A5OA 2R0YA 4MEOA 4Z6IA 3UV4A 5EQ1A 2H60A 3O33A 5TB6A 4XUAA 4XYAA 5HCLA 4A9IA 4PCEA 4Z1QA 5ENEA 3DAIA 4YYKA 4PS5A 3U5PA 4YAXA 5L8TA 4KV4A 5FFYA 4IOOA 4NRCA 4CUSA 5DFBA 3TLPA 5D3HA 4QBMA 3U5OA 5A7CA 5KTUA 5FE8A 4UIWA 4PKLA 5FE6A 5LVQA 5LVRA 2R0SA 3G0LA 4HXPA 5II2A 4NXJA 5CS8A 4TT2A 5A82A 5IIDA 5I88A 4NYXA 2R10A 5KTWA 3SVGA 5EISA 5COIA 3QZVA 4Z1SA 4OGIA 4QUUA 4LZRA 5KHMA 3HMHA 3G0JA 5ETDA 5EPSA 4UIXA 4Q0NA 3MXFA 4KCXA 5E74A 4DONA 4YYHA 5FE9A 2RFJA 4IORA 5F36A 5K29A 5H1UA 5I83A 5KO4A 4O75A 4QNSA 5ENFA 5HRXA 4UYFA 4UIZA 4J0RA 5CUEA 5ENHA 4CFLA 4MR3A 4O71A 2I8NA 4QB3A 4TU6A 4CFKA 2DVRA 2RO1A 5J0DA 3AQAA 4QSQA 5TCMA 4F3IA 1JSPB 4UYGA 4YBSA 3UVXA 4NR8A 4A9FA 5F60A 5I80A 3GG3A 5A5SA 3FKMX 5HQ7A 1WUMA 3NXBA 4O77A 5ENIA 5CQ3A 5CUBA 4CURA 3JVLA 2I7KA 5CUGA 3P5OA 5DBMA 4YABA 4BW1A 5LUUA 3MULA 4MEPA 5HJCA 3U5JA 4CLBA 2MJVB 5ENBA 4QEWA 5F3AA 4A9MA 3DWYA 5KU3A 5E9VA 4ZQLA 5BT5A 2OO1A 5F5ZA 5BT3A 5CQ8A 3P1CA 5FE0A 5CPEA 4BHWA 3Q2EA 3LXJA 4LZ2A 4YH3A 5IGNA 4RVRA 1EQFA 4O7CA 4BW4A 3QZTA 3U5MA 4LYWA 5D3SA 3U5NA 2KTBB 4UYFB 4BW2A 4ZW1A 5IGLA 5ETBA 5IG6A 2YEMA 5EPRA 5D25A 3MB4A 4NUCA 5EP7A 4N4GA 5CQ6A 4X2IA 5IGMA 2RNXA 5L99A 5A81A 4HBYA 4ALHA 5LKZA 4Q0OA 4OUFA 3ZYUA 3LQHA 4Y03A 4YK0A 4J0SA 5C4QA 3IU6A 5FE4A 4IR6A 5FE1A 5AD3A 5CFWA 5LJ2A 4TQNA 5CZGA 5H1VA 5E3DA 5HFQA 4CUUA 5C8GA 2YQDA 5E9MA 4QR5A 3LQIA 5FFWA 4YYIA 4UYHA 3O34A 4A9HA 4HXKA 4HXLA 5G4SA 5E9KA 4FLPA 3AADA 3P1DA 3O35A 5HRVA 4A9OA 4NYVA 5LKTA 1JM4B 4MENA 2RNYA 3UVDA 2DKWA 4HXRA 5DFCA 2D82A 4OGJA 4TT6A 5F1HA 2R0VA 5FH6A 5DYUA 4A9JA 4NRBA 4WHUA 5EWHA 5DLZA 4QSVA 4TZ8A 5C87A 5FE5A 3LJWA 5DKHA 3P1EA 4NQMA 4C66A 4QSUA 4QSWA 2OUOA 5DW2A 3HMFA 5C7NA 2N9GA 2YYNA 3MQMA 4NR5A 5HENA 3O36A 5HELA 2RNWA 4NQNA 5HFRA 5EU1A 4HBVA 5CRZA 5L96A 5CQ5A 3O37A 3P1FA 4HBXA 4HXSA 5A5RA 5DY7A 1ZS5A 5DX4A 2DVSA 5D3NA 5DKCA 4YADA 4J1PA 5II1A 4MR4A 4YYJA 5FG6A 5D3TA 4QSRA 4A9NA 4UITA 5CQ4A 3SVHA 4YATA 3S91A 1N72A 4N4IA 4LYIA 5IBNA 4CL9A 3JVMA 4MEQA 3QZSA 3D7CA 4TZ2A 4HBWA 5FH7A 2YW5A 2G4AA 5E9LA 4UIUA 5F1LA 4IOQA 2FSAA 3U5LA 5DYAA 4LR6A 4C67A 4TYLA 4YBTA 5I7YA 4NUDA 2L5EA 4LRGA 4YYNA 3UV5A 3JVJA 5F61A 4XUBA 4NYWA 3I3JA 4QR3A 5ENJA 4BJXA 2DWWA 5CTLA 4HXNA 2YELA 5FB1A 5EWVA 2WP2A 4O72A 4NR7A 5ENGA 5F62A 5I29A 5D7XA 3S92A 4UYEA 4CUTA 5AD2A 5EV9A 4MR6A 4QC1A 4QSXA 2OSSA 4Z6HA 5HLSA 5CQAA 4QR4A 1E6IA 5DFDA 5DLXA 4YH4A 4PCIA 5A85A 2GRCA 5FG4A 5CQ7A 4YC9A 5HEMA 4UYDA 3K2JA 3HMEA 4Z93A 5CRMA 4O7EA 5EGUA 4TT4A 4A9EA 5CUDA 5CGPA 5G4RA 2RI7A 4GPJA 4LZSA 5E0RA 5E9YA 5D3LA 5CUAA 2E7NA 5F63A 5AMEA 5CUCA 2F6NA 4BW3A 5DKDA 4IR3A 5D3JA 2LSPB 3UW9A 5E73A 2RS9B 4UIVA 2WP1A 4QEVA 5EK9A 5EWDA 4MR5A 5D3RA 4NR4A 4XY9A 4QSTA 5FE7A 4O74A 5EICA 4O76A 4PY6A 2L84A 4A9LA 5FBXA 5I40A 4J3IA 4WIVA 4YY4A 5LJ1A 5L8UA 3MUKA 2F6JA 5C85A 4IR4A 3IU5A 5BT4A 4QZSA 5CQTA 2DVVA 1WUGA 4YYGA 4PTBA 3LQJA 4YBMA 4QUTA 4XY8A 5HRWA 5IGKA 4UIYA 5FH8A 5A5NA 5A83A 4NRAA 3MB3A 5E3GA 4O7FA 5LJ0A 4N4FA 5I86A 5FG5A 4E96A 5JWMA 4TS8A 5FE3A 5D24A 5FE2A 3ONIA 4QY4A 5A5PA 5HQ5A 5D0CA 4CUQA 4KV1A 4QSPA 3UVYA 5H1TA 2DVQA 4N3WA 5JI8A 5EPBA 5LKXA 5FB0A 2E7OA 4NR9A 4O70A 5DYCA 2DATA 5E7DA 3SVFA 1X0JA 3UVWA 4AKNA 3UV2A 5A5QA 5EM3A 4YYDA 2E3KA 4QYLA 4YY6A 4O7AA 5EVAA 3Q2FA 5I89A 5KTXA 5HQ6A 5F2PA 5H85A 4ZC9A 5EWWA 4CUPA 4QEUA 2L85A 2YEKA 5D3PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D26A 2YDWA 4HXMA 4O7BA 4O78A 4HXOA 5DW1A 5DYXA 5CY9A 5L97A 5EA1A 5FDZA 5CU8A 4QC3A 5AMFA 5C89A 3U5KA 2D9EA 5I7XA 4NR6A 4QYDA 3JVKA 5CP5A 5ENCA 5FFVA 4LC2A 4TU4A 4LDFA 5E9IA 5EWCA 5F25A 4IR5A 4QSSA 5HM0A 5L98A 4A9KA 3RCWA 4ALGA 1F68A 2NXBA 4N4HA 4NS5A 4YYMA 5LKUA 5ACYA 4LYSA 4NUEA 4WHWA 5I1QA 5EI4A 4TTEA 5A5OA 2R0YA 4MEOA 4Z6IA 3UV4A 5EQ1A 2H60A 3O33A 5TB6A 4XUAA 4XYAA 5HCLA 4A9IA 4PCEA 4Z1QA 5ENEA 3DAIA 4YYKA 4PS5A 3U5PA 4YAXA 5L8TA 4KV4A 5FFYA 4IOOA 4NRCA 4CUSA 5DFBA 3TLPA 5D3HA 4QBMA 3U5OA 5A7CA 5KTUA 5FE8A 4UIWA 4PKLA 5FE6A 5LVQA 5LVRA 2R0SA 3G0LA 4HXPA 5II2A 4NXJA 5CS8A 4TT2A 5A82A 4AKIA 5IIDA 5I88A 4NYXA 2R10A 5KTWA 3SVGA 5EISA 5COIA 3QZVA 4Z1SA 4OGIA 4QUUA 4LZRA 5KHMA 3HMHA 3G0JA 5ETDA 5EPSA 4UIXA 4Q0NA 3MXFA 4KCXA 5E74A 4DONA 4YYHA 5FE9A 2RFJA 4IORA 5F36A 5K29A 5H1UA 5I83A 5KO4A 4O75A 4QNSA 5ENFA 5HRXA 4UYFA 4UIZA 4J0RA 5CUEA 5ENHA 3D1BA 4CFLA 4MR3A 4O71A 2I8NA 4QB3A 4TU6A 4CFKA 2DVRA 2RO1A 5J0DA 3AQAA 4QSQA 5TCMA 4F3IA 1JSPB 4UYGA 4YBSA 3UVXA 4NR8A 4A9FA 5F60A 5I80A 3GG3A 5A5SA 3FKMX 5HQ7A 1WUMA 3NXBA 4O77A 5ENIA 5CQ3A 5CUBA 4CURA 3JVLA 2I7KA 5CUGA 3P5OA 5DBMA 4YABA 4BW1A 5LUUA 3MULA 4MEPA 5HJCA 3U5JA 4CLBA 2MJVB 5ENBA 4QEWA 5F3AA 4A9MA 3DWYA 5KU3A 5E9VA 4ZQLA 5BT5A 2OO1A 5F5ZA 5BT3A 5CQ8A 3P1CA 5FE0A 5CPEA 4BHWA 3Q2EA 3LXJA 4LZ2A 4YH3A 5IGNA 4RVRA 1EQFA 4O7CA 4BW4A 3QZTA 2EJNA 3U5MA 4LYWA 5D3SA 3U5NA 2KTBB 4UYFB 4BW2A 4ZW1A 5IGLA 5ETBA 5IG6A 2YEMA 1ZKRA 5EPRA 5D25A 3MB4A 4AI6A 4NUCA 5EP7A 4N4GA 5CQ6A 4X2IA 5IGMA 2RNXA 5L99A 5A81A 4HBYA 4ALHA 5LKZA 4Q0OA 4OUFA 3ZYUA 3LQHA 4Y03A 4YK0A 4J0SA 5C4QA 3IU6A 5FE4A 4IR6A 5FE1A 5AD3A 5CFWA 5LJ2A 4TQNA 5CZGA 3VKHA 5H1VA 5E3DA 5HFQA 4CUUA 5C8GA 2YQDA 5E9MA 4QR5A 3LQIA 5FFWA 4YYIA 4UYHA 3O34A 4A9HA 4HXKA 4HXLA 5G4SA 5E9KA 4FLPA 3AADA 3P1DA 3O35A 5HRVA 4A9OA 4NYVA 5LKTA 1JM4B 4MENA 2RNYA 3UVDA 2DKWA 4HXRA 5DFCA 2D82A 4OGJA 4TT6A 5F1HA 2R0VA 5FH6A 5DYUA 4A9JA 4NRBA 4WHUA 5EWHA 5DLZA 4QSVA 4TZ8A 5C87A 5FE5A 3LJWA 5DKHA 3P1EA 4NQMA 4C66A 4QSUA 4QSWA 2OUOA 5DW2A 3HMFA 4AKHA 5C7NA 2N9GA 2YYNA 3MQMA 4NR5A 5HENA 3ERRA 3O36A 5HELA 2RNWA 4NQNA 5HFRA 5EU1A 4HBVA 5CRZA 5L96A 5CQ5A 3O37A 3P1FA 4HBXA 4HXSA 5A5RA 5DY7A 1ZS5A 5DX4A 2DVSA 5D3NA 5DKCA 4YADA 4J1PA 5II1A 4MR4A 4YYJA 5FG6A 5D3TA 4QSRA 4A9NA 4UITA 5CQ4A 3SVHA 4YATA 3S91A 1N72A 4N4IA 4LYIA 5IBNA 4CL9A 3JVMA 4MEQA 3QZSA 3D7CA 4TZ2A 4HBWA 5FH7A 2YW5A 2G4AA 5E9LA 4UIUA 5F1LA 4IOQA 2FSAA 3U5LA 5DYAA 4LR6A 4C67A 4TYLA 4YBTA 5I7YA 4NUDA 2L5EA 4LRGA 4YYNA 3UV5A 3JVJA 5F61A 4XUBA 4NYWA 3I3JA 4QR3A 5ENJA 4BJXA 2DWWA 5CTLA 4HXNA 2YELA 5FB1A 5EWVA 2WP2A 4O72A 4NR7A 5ENGA 5F62A 5I29A 5D7XA 3S92A 3D1DA 4UYEA 4CUTA 5AD2A 5EV9A 4MR6A 4QC1A 4QSXA 2OSSA 4Z6HA 5HLSA 5CQAA 4QR4A 1E6IA 5DFDA 5DLXA 4YH4A 4PCIA 5A85A 2GRCA 5FG4A 5CQ7A 4YC9A 5HEMA 4UYDA 3K2JA 3HMEA 4Z93A 5CRMA 4O7EA 5EGUA 4TT4A 4A9EA 5CUDA 5CGPA 5G4RA 4AKGA 2RI7A 4GPJA 4LZSA 5E0RA 5E9YA 5D3LA 5CUAA 2E7NA 5F63A 5AMEA 5CUCA 2F6NA 4BW3A 5DKDA 4IR3A 5D3JA 2LSPB 3UW9A 5E73A 2RS9B 4UIVA 2WP1A 4QEVA 5EK9A 5EWDA 4MR5A 5D3RA 4NR4A 4XY9A 4QSTA 5FE7A 4O74A 5EICA 4O76A 4PY6A 2L84A 4A9LA 5FBXA 5I40A 4J3IA 4WIVA 4YY4A 5LJ1A 5L8UA 3MUKA 2F6JA 5C85A 4IR4A 5BT4A 4QZSA 1PUOA 5CQTA 2DVVA 1WUGA 4YYGA 4PTBA 3LQJA 4YBMA 4QUTA 4XY8A 5HRWA 5IGKA 4UIYA 5FH8A 5A5NA 5A83A 4NRAA 2YEKA 3MB3A 5E3GA 4O7FA 5LJ0A 4N4FA 5I86A 5FG5A 4E96A 5JWMA 4TS8A 5FE3A 5D24A 5FE2A 3VKGA 3ONIA 4QY4A 5A5PA 5HQ5A 5D0CA 4CUQA 4KV1A 4QSPA 3UVYA 5H1TA 2DVQA 4N3WA 5JI8A 5EPBA 5LKXA 5FB0A 2E7OA 4NR9A 4O70A 5DYCA 2DATA 5E7DA 3SVFA 1X0JA 3UVWA 4AKNA 3UV2A 5A5QA 5EM3A 4YYDA 2E3KA 4QYLA 4YY6A 4O7AA 5EVAA 3Q2FA 5I89A 5KTXA 5HQ6A 5F2PA 5H85A 4ZC9A 5EWWA 4CUPA 4QEUA 2L85A 3IU5A 5D3PA
chains in the Genus database with same CATH topology
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