2OSSA

Crystal structure of the bromo domain 1 in human bromodomain containing protein 4 (brd4)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2ossA01
4MENA 4TS8A 4NR5A 5CQ4A 5LVRA 4TTEA 4HBWA 2MJVB 4QB3A 4J1PA 5I7YA 4O77A 5C89A 5HLSA 3HMEA 2YEMA 2OSSA 5IG6A 3MXFA 4OGIA 3UV5A 5EQ1A 4YABA 5IGKA 4UIZA 5CTLA 4BJXA 4HXKA 4QZSA 5EPBA 3HMHA 5HRVA 5HM0A 4IR5A 5FE9A 4MR6A 5F2PA 4XUBA 1ZS5A 2L5EA 3MB3A 4Z6HA 5KO4A 5DFDA 5A5RA 4CL9A 1JSPB 5A5OA 2RNXA 3Q2EA 5CQ7A 5FB0A 3SVGA 4NUCA 4YAXA 5D3NA 5F3AA 4YYDA 5CQ8A 5L8TA 4HXNA 4NR7A 5L98A 5A83A 4ZW1A 4QSSA 4NR4A 4CURA 4O74A 5D24A 5FB1A 4LYSA 5DKCA 5L99A 1JM4B 3P1CA 3S91A 4ZC9A 4QUUA 4YADA 5CS8A 4Z6IA 5C85A 3O33A 4YC9A 5DLXA 4O7FA 5E0RA 5D3RA 4HXMA 3QZVA 5ENCA 5H85A 4IOQA 3S92A 5DKHA 5DYCA 2RS9B 4Q0NA 5ETDA 4A9EA 5ENHA 4TU6A 4QSTA 3JVLA 4NQMA 4CFKA 4YK0A 4XYAA 3LQJA 2E7NA 4O75A 5KHMA 4Y03A 5CUGA 5CFWA 2R10A 4X2IA 3UVYA 5D3JA 4UYDA 5HQ5A 4PY6A 4WHWA 5DYAA 2I8NA 4HXLA 2D82A 5FFVA 4A9KA 5HFQA 5AD2A 4NXJA 4HBXA 3DWYA 4XY8A 5I86A 3JVKA 4WHUA 2E3KA 2RO1A 2N9GA 5IBNA 4CUUA 5I29A 4O7AA 4ZQLA 2RNWA 4UIXA 2DWWA 5L96A 4UYHA 4YYMA 5IGLA 5DY7A 5E3DA 4BW3A 5BT4A 4O72A 5A5SA 5JWMA 5F1HA 3U5MA 5E9KA 5DFBA 3NXBA 4NUEA 4QC3A 4QSRA 5I83A 2R0SA 4J0RA 4NR8A 5EWDA 4YATA 5A81A 4N4IA 4NRAA 4YYGA 4NR9A 3FKMX 5LUUA 3MULA 2DVVA 4MEOA 5J0DA 5A7CA 4Q0OA 5FE8A 4OGJA 4YYNA 5FH8A 4A9FA 5DYXA 4TYLA 3P1FA 5LVQA 4Z1SA 5ENGA 4XY9A 5K29A 4A9NA 2DVRA 5D3LA 4C66A 4C67A 4TT6A 4BW1A 5II2A 4TU4A 5D3SA 4YYJA 5CRZA 5E7DA 5ACYA 2GRCA 2YQDA 5EWCA 4NRBA 5D3PA 4UIUA 4BHWA 2YEKA 5E9YA 5LJ1A 3D7CA 1WUMA 4RVRA 4QYLA 4IR4A 5E73A 3UV4A 4HBVA 3LQIA 4NRCA 5BT3A 1N72A 4KCXA 4NYVA 4PKLA 4HBYA 5EPSA 5EVAA 5KU3A 5CUCA 4ALGA 5IGNA 4CUSA 2YW5A 5D3HA 4O7EA 3RCWA 5EISA 5CQTA 4QNSA 5FE5A 4MEQA 5ENFA 4AKNA 5ENIA 4CUPA 3DAIA 5CUDA 4O76A 5LKZA 4LZ2A 3AADA 1E6IA 5FE3A 4MR3A 3MUKA 5EWWA 5FH7A 2OO1A 3U5LA 4HXRA 2L84A 2E7OA 5LJ0A 2DVSA 4YH4A 4O78A 3MQMA 3AQAA 3SVFA 3G0JA 2FSAA 2H60A 5TB6A 3UVXA 5F5ZA 5CUAA 5ENEA 5CQ3A 4HXOA 4QSPA 5CP5A 5C4QA 2OUOA 5I7XA 3U5PA 4YY6A 5D25A 4UIVA 4LDFA 5KTXA 5F25A 5AMEA 2F6NA 3U5NA 5EWHA 5D26A 5HCLA 4UIYA 4O7CA 5EV9A 5H1VA 4QR3A 5F1LA 5DFCA 3UV2A 5EA1A 5H1TA 3UW9A 5DW2A 5CGPA 4YYHA 4QEWA 4TT4A 4TT2A 4MR5A 4FLPA 5A5NA 3O36A 4J3IA 3HMFA 5C8GA 4NQNA 4IR6A 4UYGA 4QY4A 5CQ5A 4PCIA 4QYDA 5HRXA 4A9IA 5II1A 5IGMA 4LRGA 4Z93A 5CZGA 2R0YA 4TZ8A 2R0VA 5CQ6A 4KV1A 4NR6A 5A5PA 4UYEA 4PCEA 3O37A 5CUEA 4QSVA 5EM3A 2YYNA 4LC2A 2RI7A 5F36A 4QR5A 5EGUA 4ALHA 4QEUA 3TLPA 5F61A 4NS5A 5I89A 5AMFA 4YBSA 4N4FA 4UIWA 4UYFA 4LYIA 4YH3A 5L8UA 5A82A 5ETBA 5EWVA 5F63A 3U5JA 4UYFB 3JVJA 4HXPA 4BW4A 3K2JA 2DATA 4PS5A 2DVQA 5CQAA 4YBMA 4QC1A 5IIDA 3JVMA 4LZRA 4E96A 5ENBA 5JI8A 5EICA 4O70A 4YY4A 5I88A 3O34A 5D7XA 3IU5A 5CRMA 2LSPB 4YYKA 5FBXA 5KTUA 4O7BA 3QZSA 3I3JA 2DKWA 4HXSA 4DONA 4UITA 4BW2A 4YYIA 5LKTA 3U5OA 5E9LA 5LKXA 2YELA 4IOOA 4QR4A 2KTBB 5F62A 1F68A 4A9LA 3IU6A 5COIA 5FE6A 5HQ7A 4QSWA 5A85A 3GG3A 3P5OA 5I80A 4A9MA 5G4RA 4TQNA 5G4SA 3Q2FA 3ONIA 5F60A 4QSXA 5CUBA 4LR6A 1EQFA 4XUAA 3MB4A 5C87A 5D3TA 5DYUA 5E9IA 2F6JA 4TZ2A 3QZTA 2RFJA 5HJCA 4CUTA 4N4GA 5HQ6A 5I40A 3U5KA 2I7KA 5C7NA 5CY9A 4NYXA 5FE1A 4N3WA 4Z1QA 3O35A 2L85A 4N4HA 3ZYUA 2NXBA 2WP1A 2G4AA 5FH6A 2RNYA 4A9JA 5AD3A 5FG4A 5E3GA 3LQHA 4O71A 4F3IA 5I1QA 4GPJA 4CUQA 4LZSA 4A9OA 5LJ2A 4LYWA 4IR3A 5HENA 5EU1A 4J0SA 5DW1A 5LKUA 5HEMA 3G0LA 5KTWA 5EK9A 4MR4A 5ENJA 5E9MA 4WIVA 4QSQA 4NUDA 5TCMA 5FG5A 5H1UA 5CPEA 5FE0A 4YBTA 5BT5A 3SVHA 5DKDA 3LJWA 5EPRA 5DBMA 5D0CA 5E74A 5DLZA 5A5QA 4QBMA 5HELA 2D9EA 5FDZA 3UVWA 5E9VA 1X0JA 5HFRA 2WP2A 1WUGA 4QEVA 2YDWA 5HRWA 5L97A 5FFYA 5FG6A 5FE4A 5EI4A 3UVDA 4CLBA 4KV4A 5FE7A 4OUFA 3P1DA 5DX4A 5EP7A 4IORA 5CU8A 4PTBA 4CFLA 4MEPA 4NYWA 5FFWA 4QUTA 4QSUA 4A9HA 3P1EA 3LXJA 5FE2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MENA 4TS8A 4NR5A 5CQ4A 5LVRA 4TTEA 4HBWA 2MJVB 4QB3A 4J1PA 5I7YA 4O77A 5C89A 5HLSA 3HMEA 2YEMA 2OSSA 5IG6A 3MXFA 4OGIA 3UV5A 5EQ1A 4YABA 5IGKA 4UIZA 5CTLA 4BJXA 4HXKA 4QZSA 5EPBA 3HMHA 5HRVA 5HM0A 4IR5A 5FE9A 4MR6A 5F2PA 4XUBA 1ZS5A 2L5EA 3MB3A 4Z6HA 5KO4A 5DFDA 5A5RA 4CL9A 1JSPB 5A5OA 2RNXA 3Q2EA 5CQ7A 5FB0A 3SVGA 4NUCA 4YAXA 5D3NA 5F3AA 4YYDA 5CQ8A 5L8TA 4HXNA 4NR7A 5L98A 5A83A 4ZW1A 4QSSA 4NR4A 4CURA 4O74A 5D24A 5FB1A 4LYSA 5DKCA 5L99A 1JM4B 3P1CA 3S91A 4ZC9A 4QUUA 4YADA 5CS8A 4Z6IA 5C85A 3O33A 4YC9A 5DLXA 4O7FA 5E0RA 5D3RA 4HXMA 3QZVA 5ENCA 5H85A 4IOQA 3S92A 5DKHA 3D1BA 5DYCA 2RS9B 4Q0NA 5ETDA 4A9EA 5ENHA 4TU6A 4QSTA 3JVLA 4NQMA 4CFKA 4YK0A 4XYAA 3LQJA 2E7NA 4O75A 5KHMA 4Y03A 5CUGA 5CFWA 2R10A 4X2IA 3UVYA 5D3JA 4UYDA 5HQ5A 4PY6A 4WHWA 5DYAA 2I8NA 4HXLA 2D82A 5FFVA 4A9KA 5HFQA 5AD2A 4NXJA 4HBXA 3DWYA 4XY8A 5I86A 3JVKA 4WHUA 2E3KA 2RO1A 2N9GA 5IBNA 4CUUA 5I29A 4O7AA 4ZQLA 2RNWA 4UIXA 2DWWA 5L96A 4UYHA 4YYMA 5IGLA 5DY7A 5E3DA 4BW3A 5BT4A 4O72A 5A5SA 5JWMA 5F1HA 3U5MA 5E9KA 5DFBA 3NXBA 4NUEA 4QC3A 4QSRA 5I83A 2R0SA 4J0RA 4NR8A 5EWDA 4YATA 5A81A 4N4IA 4NRAA 4YYGA 4NR9A 3FKMX 5LUUA 3MULA 2DVVA 4MEOA 5J0DA 5A7CA 4Q0OA 5FE8A 4OGJA 4YYNA 5FH8A 4AI6A 4A9FA 5DYXA 4TYLA 3P1FA 5LVQA 4Z1SA 5ENGA 4XY9A 5K29A 4A9NA 2DVRA 5D3LA 4C66A 4C67A 4TT6A 4BW1A 5II2A 4TU4A 5D3SA 4YYJA 5CRZA 5E7DA 5ACYA 2GRCA 2YQDA 5EWCA 4NRBA 5D3PA 4UIUA 4BHWA 2YEKA 5E9YA 5LJ1A 3D7CA 1WUMA 4RVRA 4QYLA 4IR4A 5E73A 3UV4A 4HBVA 3LQIA 4NRCA 5BT3A 1N72A 4KCXA 4NYVA 4PKLA 4HBYA 5EPSA 5EVAA 5KU3A 5CUCA 4ALGA 5IGNA 4CUSA 2YW5A 5D3HA 4O7EA 3RCWA 5EISA 5CQTA 4QNSA 5FE5A 4MEQA 5ENFA 4AKNA 5ENIA 4CUPA 3DAIA 5CUDA 4O76A 5LKZA 4LZ2A 3AADA 1E6IA 5FE3A 4MR3A 3MUKA 5EWWA 4AKIA 5FH7A 2OO1A 3U5LA 4HXRA 2L84A 2E7OA 5LJ0A 2DVSA 4YH4A 4O78A 3MQMA 3AQAA 3SVFA 3G0JA 2FSAA 2H60A 5TB6A 3UVXA 5F5ZA 5CUAA 5ENEA 5CQ3A 4HXOA 4QSPA 5CP5A 5C4QA 2OUOA 5I7XA 3U5PA 4YY6A 5D25A 4UIVA 4LDFA 5KTXA 5F25A 5AMEA 2F6NA 3U5NA 5EWHA 5D26A 5HCLA 4UIYA 3VKHA 4O7CA 5EV9A 5H1VA 4QR3A 5F1LA 5DFCA 3UV2A 5EA1A 5H1TA 3UW9A 5DW2A 5CGPA 4YYHA 4QEWA 4TT4A 4TT2A 4MR5A 4FLPA 5A5NA 3O36A 4J3IA 3HMFA 5C8GA 4NQNA 4IR6A 4UYGA 4QY4A 5CQ5A 4PCIA 4QYDA 5HRXA 4A9IA 5II1A 5IGMA 1PUOA 4LRGA 4Z93A 5CZGA 2R0YA 4TZ8A 2R0VA 5CQ6A 4KV1A 4NR6A 5A5PA 4UYEA 4PCEA 3O37A 5CUEA 4QSVA 5EM3A 2YYNA 4LC2A 2RI7A 5F36A 4QR5A 5EGUA 4ALHA 4QEUA 3TLPA 5F61A 4NS5A 5I89A 5AMFA 4YBSA 4N4FA 4UIWA 4UYFA 4LYIA 4YH3A 5L8UA 5A82A 5ETBA 5EWVA 5F63A 3U5JA 4UYFB 3JVJA 4HXPA 4BW4A 3K2JA 2DATA 4PS5A 2DVQA 5CQAA 4YBMA 4QC1A 5IIDA 3JVMA 4LZRA 4E96A 5ENBA 5JI8A 5EICA 4O70A 4YY4A 5I88A 3O34A 5D7XA 3IU5A 5CRMA 2LSPB 4YYKA 5FBXA 5KTUA 4O7BA 3QZSA 3I3JA 2DKWA 4HXSA 4DONA 4UITA 4BW2A 4YYIA 5LKTA 3U5OA 5E9LA 5LKXA 2YELA 4IOOA 4QR4A 2KTBB 5F62A 1F68A 4A9LA 3IU6A 5COIA 5FE6A 5HQ7A 4QSWA 5A85A 3GG3A 3P5OA 5I80A 4A9MA 5G4RA 4TQNA 3D1DA 5G4SA 3Q2FA 3ONIA 5F60A 4QSXA 5CUBA 4LR6A 1EQFA 4XUAA 3MB4A 5C87A 5D3TA 5DYUA 5E9IA 2F6JA 4TZ2A 3QZTA 2RFJA 5HJCA 4CUTA 4N4GA 5HQ6A 5I40A 3U5KA 2I7KA 5C7NA 5CY9A 4NYXA 5FE1A 4AKGA 4N3WA 4Z1QA 3O35A 2L85A 4N4HA 3ZYUA 2NXBA 2WP1A 2G4AA 5FH6A 2RNYA 4A9JA 5AD3A 5FG4A 5E3GA 3LQHA 4O71A 4F3IA 5I1QA 4GPJA 4CUQA 2EJNA 4LZSA 4A9OA 5LJ2A 4LYWA 4IR3A 5HENA 5EU1A 4J0SA 5DW1A 5LKUA 5HEMA 3G0LA 5KTWA 5EK9A 4MR4A 5ENJA 5E9MA 4WIVA 4QSQA 4NUDA 5TCMA 5FG5A 5H1UA 4AKHA 5CPEA 5FE0A 4YBTA 5BT5A 3SVHA 5DKDA 3LJWA 5EPRA 5DBMA 3ERRA 3VKGA 5D0CA 5E74A 5DLZA 5A5QA 4QBMA 5HELA 2D9EA 5FDZA 3UVWA 5E9VA 1X0JA 5HFRA 2WP2A 1WUGA 4QEVA 2YDWA 5HRWA 5L97A 5FFYA 5FG6A 5FE4A 5EI4A 3UVDA 4CLBA 4KV4A 5FE7A 4OUFA 3P1DA 5DX4A 5EP7A 4IORA 5CU8A 4PTBA 4CFLA 4MEPA 4NYWA 5FFWA 4QUTA 4QSUA 4A9HA 3P1EA 3LXJA 5FE2A 1ZKRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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