2OSSA

Crystal structure of the bromo domain 1 in human bromodomain containing protein 4 (brd4)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2ossA01
5F5ZA 4BW3A 5F2PA 3SVHA 5LJ0A 5FG4A 5E9VA 4NS5A 3LQHA 2RFJA 2E7OA 3IU6A 4KV1A 5CUGA 5FE3A 5DKDA 4WHWA 4AKNA 5IGLA 1F68A 2E7NA 5FE5A 4Y03A 4C67A 5FFWA 5LJ2A 4XY8A 5D3TA 4QSVA 5C8GA 5ENFA 5FE8A 2DVSA 2OSSA 5CUAA 5II1A 5FE1A 4HXMA 5AD3A 4WIVA 5CQ5A 3P1FA 5F36A 5HFRA 5CQ4A 4O71A 2N9GA 4MR4A 4UIYA 5D3PA 3GG3A 4QZSA 5A5OA 5A5RA 4NYWA 4YBMA 5E9MA 4YC9A 5EWCA 3UVDA 5EU1A 5DFCA 5F63A 4YBTA 3O37A 4YATA 5FG6A 4MENA 4CUSA 5LKTA 5I86A 4CFLA 3UV5A 4QSRA 3DWYA 5JWMA 5E74A 5LKUA 1EQFA 5EK9A 5CQ3A 4YH3A 4NYVA 4TS8A 5E7DA 4N4FA 4LDFA 5D24A 5EWWA 5D3NA 3NXBA 4QSWA 5EPSA 5EVAA 4CUPA 3D7CA 4NR7A 4QEUA 5E73A 3FKMX 5LKXA 4HXKA 4YYHA 4A9OA 5DYCA 5CUDA 5EWHA 4F3IA 5AD2A 5FE9A 5KO4A 4NUEA 5CS8A 5I89A 4C66A 2I8NA 3U5MA 4XY9A 4OUFA 4TU6A 5AMEA 5DY7A 4HXRA 4HXNA 2L85A 4A9MA 4QSTA 5HLSA 4J0SA 2D82A 4PKLA 5CZGA 4A9LA 5ENHA 3UW9A 5DLXA 3HMFA 5F1HA 5DYUA 2DATA 5EQ1A 4MEOA 5E9KA 5F3AA 3I3JA 4HXSA 4BW4A 1ZS5A 4DONA 3O35A 4QUTA 5ENEA 3UVYA 4KCXA 3TLPA 3MB3A 2WP1A 4Z93A 1WUGA 5CQ6A 5A5NA 4KV4A 1E6IA 4LYWA 2NXBA 4O76A 4CLBA 5F60A 5DYAA 4QR4A 4MEQA 5CU8A 5DW2A 5F25A 5CQTA 4PCIA 5D3LA 3MQMA 4QYDA 5C87A 1N72A 4ZQLA 4YAXA 4O75A 3U5NA 4O77A 4YADA 2R10A 5DFBA 5KHMA 5A82A 5K29A 4Z1SA 5D25A 4A9KA 5FG5A 5BT4A 2DWWA 5CTLA 4YYMA 4X2IA 4BW1A 4A9NA 5ENJA 4O7EA 2RNXA 5EPBA 4YYIA 5II2A 5D3RA 2YDWA 5FH8A 5ACYA 3P1EA 5FE6A 4Z6HA 4NUCA 4J1PA 4NRBA 4YY6A 4RVRA 2R0YA 4CL9A 4YK0A 3QZSA 3MUKA 2L84A 4MR6A 4A9IA 5H1TA 4NR6A 4BJXA 5HELA 5C89A 4HXOA 4Z1QA 5LVQA 4QY4A 3LQIA 4NR9A 4NRAA 4A9EA 2WP2A 4O74A 5FB0A 5CUEA 5FFYA 5G4RA 5E9LA 5FE7A 5LKZA 4PS5A 4UITA 3JVMA 5I88A 5I29A 3G0LA 4A9JA 5TB6A 5JI8A 4QUUA 4ALHA 5L96A 4HXPA 4QSPA 4HBWA 1WUMA 4ZW1A 4ALGA 4NQMA 5ENIA 4YABA 5CPEA 3UVXA 4TT6A 5ETDA 2RNYA 2YYNA 4LZ2A 5EISA 5DBMA 5E3GA 4YYJA 3QZTA 4IORA 4Z6IA 3Q2FA 5CUBA 5C85A 4UIWA 2OUOA 5A5QA 5IG6A 3ZYUA 5FH6A 3UV4A 5COIA 3IU5A 4TZ8A 5ENGA 2R0VA 4QBMA 5IGKA 5D26A 5FBXA 4TT2A 2RNWA 2I7KA 4PTBA 4UIVA 5D3SA 5EGUA 5A5PA 2R0SA 5L8UA 4YYDA 5KTXA 4YYNA 5FE4A 4Q0NA 5J0DA 4CUQA 5H1VA 3JVLA 5LUUA 2YEKA 4UYEA 5CQAA 3QZVA 4HXLA 5CQ7A 5D0CA 4NR4A 5BT5A 3SVGA 2YW5A 2OO1A 4NYXA 5DYXA 4LYSA 4YYKA 4TTEA 4CUUA 4CUTA 4IR6A 2FSAA 4NRCA 3SVFA 2F6JA 5I7XA 4YYGA 5FH7A 4O78A 5H85A 5D7XA 5EM3A 3P5OA 4TQNA 3U5JA 2YQDA 3S91A 3U5LA 4IOQA 5EP7A 3LJWA 4TU4A 5HM0A 1JM4B 5F62A 5KTWA 4LZRA 3RCWA 5DW1A 5A7CA 5H1UA 4QNSA 4O70A 3Q2EA 3MULA 4NXJA 2DVQA 4HBXA 4QSQA 5CUCA 5LVRA 4QR5A 4CFKA 5HQ6A 3AADA 4QYLA 4QC3A 5I80A 5TCMA 4XUBA 4UYFA 5A5SA 4IR4A 5IGMA 5HRXA 4NQNA 4WHUA 1X0JA 3U5KA 2D9EA 4J3IA 5L97A 4A9FA 3P1CA 5EA1A 5HRVA 4CURA 5CGPA 2YEMA 4NR8A 5DX4A 5I7YA 4UYFB 4N3WA 4QSXA 5DKHA 2MJVB 5DFDA 5ETBA 3U5PA 4N4GA 3DAIA 5LJ1A 5HENA 2DVRA 5HRWA 3O33A 5EWDA 5HQ5A 5EPRA 4LZSA 5F1LA 4TT4A 3P1DA 4IR3A 4LYIA 5E9YA 4YH4A 4N4IA 4NR5A 5EICA 3UV2A 5G4SA 5I83A 4PY6A 4HBYA 4YBSA 4UIXA 5E0RA 3HMHA 2YELA 2DVVA 5FB1A 5HQ7A 5KTUA 5D3HA 4O72A 3U5OA 4IOOA 5HFQA 4LR6A 4QR3A 4UYGA 5FFVA 3HMEA 2LSPB 5F61A 4FLPA 3G0JA 4O7FA 3O36A 5L8TA 5HJCA 5AMFA 3MB4A 4UYHA 5CP5A 3LXJA 5L99A 5EV9A 5CFWA 5E9IA 5ENBA 3AQAA 4NUDA 2GRCA 4O7AA 4TYLA 4TZ2A 4E96A 3ONIA 4LC2A 4Q0OA 4LRGA 5IBNA 4BHWA 1JSPB 2RO1A 5FE0A 5CQ8A 2E3KA 4QC1A 2G4AA 3JVJA 4QSSA 2KTBB 4QSUA 4OGIA 4PCEA 4J0RA 5EWVA 5FDZA 4ZC9A 5E3DA 4YY4A 5FE2A 3S92A 4MEPA 4IR5A 4O7BA 5BT3A 5I1QA 5DLZA 5EI4A 4N4HA 2RS9B 5IIDA 4QB3A 2RI7A 4UIUA 5DKCA 3MXFA 5A81A 4O7CA 5HEMA 5CRZA 4GPJA 3O34A 4XUAA 5I40A 3UVWA 4UYDA 5CRMA 5A83A 4MR3A 5HCLA 4HBVA 4QEVA 5D3JA 5KU3A 5IGNA 5L98A 3JVKA 4QEWA 3K2JA 4OGJA 2L5EA 3LQJA 4BW2A 5CY9A 5ENCA 4A9HA 2F6NA 5A85A 5C4QA 2H60A 5C7NA 4XYAA 4UIZA 2DKWA 4MR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F5ZA 4BW3A 5F2PA 3SVHA 5LJ0A 5FG4A 4AKIA 5E9VA 4NS5A 3LQHA 4AI6A 2RFJA 2E7OA 3IU6A 4KV1A 5CUGA 5FE3A 5DKDA 4WHWA 4AKNA 5IGLA 1F68A 2E7NA 5FE5A 4Y03A 4C67A 5FFWA 5LJ2A 4XY8A 5D3TA 4QSVA 5C8GA 5ENFA 5FE8A 2DVSA 2OSSA 5CUAA 5II1A 5FE1A 4HXMA 5AD3A 4WIVA 5CQ5A 3P1FA 5F36A 5HFRA 5CQ4A 4O71A 2N9GA 4MR4A 4UIYA 5D3PA 3GG3A 4QZSA 5A5OA 5A5RA 4NYWA 4YBMA 5E9MA 4YC9A 5EWCA 3UVDA 5EU1A 3D1DA 5DFCA 5F63A 4YBTA 3O37A 4YATA 5FG6A 4MENA 4CUSA 5LKTA 3VKGA 5I86A 4CFLA 3UV5A 4QSRA 3DWYA 5JWMA 5E74A 5LKUA 1EQFA 5EK9A 5CQ3A 4YH3A 4NYVA 4TS8A 5E7DA 4N4FA 4LDFA 5D24A 5EWWA 5D3NA 3NXBA 4QSWA 5EPSA 5EVAA 4CUPA 1ZKRA 3D7CA 4NR7A 4QEUA 5E73A 3FKMX 5LKXA 4HXKA 4YYHA 4A9OA 5DYCA 5CUDA 5EWHA 4F3IA 5AD2A 5FE9A 5KO4A 4NUEA 5CS8A 5I89A 4C66A 2I8NA 3U5MA 4XY9A 4OUFA 4TU6A 5AMEA 5DY7A 4HXRA 4HXNA 2L85A 4A9MA 4QSTA 5HLSA 4J0SA 2D82A 4PKLA 5CZGA 4A9LA 5ENHA 3UW9A 5DLXA 3HMFA 5F1HA 5DYUA 2DATA 5EQ1A 4MEOA 5E9KA 5F3AA 3I3JA 4HXSA 4BW4A 1ZS5A 4DONA 3O35A 4QUTA 5ENEA 3UVYA 4KCXA 3TLPA 3MB3A 2WP1A 4Z93A 1WUGA 5CQ6A 5A5NA 4KV4A 1E6IA 4LYWA 2NXBA 4O76A 4CLBA 5F60A 5DYAA 4QR4A 4MEQA 5CU8A 5DW2A 5F25A 5CQTA 4PCIA 5D3LA 3MQMA 4QYDA 5C87A 1N72A 3D1BA 4ZQLA 4YAXA 4O75A 3U5NA 4O77A 4YADA 2R10A 5DFBA 5KHMA 5A82A 5K29A 4Z1SA 5D25A 4A9KA 5FG5A 5BT4A 2DWWA 5CTLA 4YYMA 4X2IA 4BW1A 4A9NA 5ENJA 4O7EA 2RNXA 5EPBA 4YYIA 5II2A 5D3RA 2YDWA 5FH8A 5ACYA 3P1EA 5FE6A 4Z6HA 4NUCA 4J1PA 4NRBA 4YY6A 4RVRA 2R0YA 4CL9A 4YK0A 3QZSA 3MUKA 2L84A 4MR6A 4A9IA 5H1TA 4NR6A 4BJXA 5HELA 5C89A 4HXOA 4Z1QA 5LVQA 4QY4A 3LQIA 4NR9A 4NRAA 4A9EA 2WP2A 4O74A 5FB0A 5CUEA 5FFYA 5G4RA 5E9LA 5FE7A 5LKZA 4PS5A 4UITA 3JVMA 5I88A 5I29A 3G0LA 4A9JA 5TB6A 5JI8A 4QUUA 4ALHA 5L96A 4HXPA 4QSPA 4HBWA 1WUMA 4ZW1A 4ALGA 4NQMA 5ENIA 4YABA 5CPEA 3UVXA 4TT6A 5ETDA 2RNYA 2YYNA 4LZ2A 5EISA 5DBMA 5E3GA 4YYJA 3QZTA 3VKHA 4IORA 4Z6IA 3Q2FA 5CUBA 5C85A 4UIWA 2OUOA 5A5QA 5IG6A 3ZYUA 5FH6A 3UV4A 5COIA 3IU5A 4TZ8A 5ENGA 2R0VA 4QBMA 5IGKA 5D26A 5FBXA 4TT2A 2RNWA 2I7KA 4PTBA 4UIVA 5D3SA 5EGUA 5A5PA 2R0SA 5L8UA 4YYDA 5KTXA 4YYNA 5FE4A 4Q0NA 4AKHA 5J0DA 4CUQA 5H1VA 3JVLA 5LUUA 2YEKA 4UYEA 5CQAA 3QZVA 4HXLA 5CQ7A 5D0CA 4NR4A 5BT5A 3SVGA 2YW5A 2OO1A 4NYXA 5DYXA 4LYSA 4YYKA 4TTEA 4CUUA 4CUTA 4IR6A 2FSAA 4NRCA 3SVFA 2F6JA 5I7XA 4YYGA 5FH7A 4O78A 5H85A 5D7XA 5EM3A 3P5OA 4TQNA 3U5JA 2YQDA 3S91A 3U5LA 4IOQA 5EP7A 3LJWA 4TU4A 5HM0A 1JM4B 5F62A 5KTWA 4LZRA 3RCWA 5DW1A 5A7CA 5H1UA 4QNSA 4O70A 3Q2EA 3MULA 4NXJA 2DVQA 4HBXA 4QSQA 5CUCA 5LVRA 4QR5A 4CFKA 5HQ6A 3AADA 4QYLA 4QC3A 5I80A 5TCMA 4XUBA 4UYFA 5A5SA 4IR4A 5IGMA 5HRXA 4NQNA 4WHUA 1X0JA 3U5KA 2D9EA 4J3IA 5L97A 4A9FA 3P1CA 5EA1A 5HRVA 4CURA 5CGPA 2YEMA 4NR8A 5DX4A 5I7YA 4UYFB 4N3WA 4QSXA 5DKHA 2MJVB 5DFDA 5ETBA 3U5PA 4N4GA 3DAIA 5LJ1A 5HENA 2DVRA 5HRWA 3O33A 5EWDA 5HQ5A 5EPRA 4LZSA 5F1LA 4TT4A 3P1DA 4IR3A 4LYIA 5E9YA 4YH4A 4N4IA 4NR5A 5EICA 3UV2A 5G4SA 5I83A 4PY6A 4HBYA 4YBSA 4UIXA 5E0RA 3HMHA 2YELA 2DVVA 5FB1A 5HQ7A 5KTUA 5D3HA 4O72A 3U5OA 4IOOA 5HFQA 4LR6A 4QR3A 4UYGA 5FFVA 3HMEA 2LSPB 5F61A 4FLPA 3G0JA 4O7FA 3O36A 1PUOA 5L8TA 5HJCA 5AMFA 3MB4A 4UYHA 5CP5A 3LXJA 5L99A 5EV9A 5CFWA 5E9IA 5ENBA 3AQAA 4NUDA 2GRCA 4O7AA 4TYLA 4TZ2A 4E96A 3ONIA 4LC2A 4Q0OA 4LRGA 5IBNA 4BHWA 1JSPB 2RO1A 5FE0A 4AKGA 5CQ8A 2E3KA 4QC1A 2G4AA 3JVJA 4QSSA 2KTBB 4QSUA 4OGIA 4PCEA 4J0RA 5EWVA 5FDZA 4ZC9A 5E3DA 4YY4A 5FE2A 3S92A 4MEPA 4IR5A 4O7BA 5BT3A 5I1QA 5DLZA 5EI4A 4N4HA 2RS9B 5IIDA 4QB3A 2RI7A 4UIUA 5DKCA 3MXFA 5A81A 4O7CA 5HEMA 5CRZA 4GPJA 3O34A 4XUAA 5I40A 3UVWA 4UYDA 5CRMA 5A83A 4MR3A 5HCLA 4HBVA 4QEVA 2EJNA 5D3JA 5KU3A 5IGNA 5L98A 3JVKA 4QEWA 3K2JA 4OGJA 2L5EA 3LQJA 4BW2A 5CY9A 5ENCA 4A9HA 2F6NA 5A85A 5C4QA 2H60A 5C7NA 4XYAA 3ERRA 4UIZA 2DKWA 4MR5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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