2OSSA

Crystal structure of the bromo domain 1 in human bromodomain containing protein 4 (brd4)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2ossA01
4CUTA 4TQNA 5I1QA 4LZ2A 5L8UA 3UV2A 3JVJA 5F36A 5EA1A 4YBTA 5DLXA 5ENBA 5L99A 5E9YA 5FH6A 2DVSA 1JSPB 5DY7A 4NS5A 4XY9A 5LKTA 3LJWA 3LQIA 2YEMA 4ALHA 4KV4A 3UVXA 4N4IA 5DFBA 4UIZA 4YATA 5H1VA 5FG4A 4C66A 4NQMA 5DFDA 3DWYA 4MR5A 2E7OA 5FDZA 5CUEA 3UV5A 5CP5A 4O72A 4YYNA 2RO1A 3MULA 5E9LA 5A82A 4HBYA 4WIVA 3SVFA 3UW9A 5CRMA 5A85A 4A9MA 5CU8A 5D3PA 5KHMA 5L8TA 5LKUA 2WP2A 2DVVA 2YELA 4HXRA 5I7XA 5DYAA 5EV9A 5HQ5A 5E74A 4UIXA 5ENEA 5BT4A 4NQNA 4YY6A 2L5EA 5FFVA 4ZC9A 4QBMA 2N9GA 3P1DA 4A9EA 4HXOA 2LSPB 1ZS5A 5E9KA 4QUUA 4HXMA 4NYWA 5FE7A 5IGNA 5LJ0A 4QEVA 5KU3A 2DVQA 4BW4A 4Z1QA 4IR6A 5II1A 5LVQA 5F60A 1E6IA 3S91A 4PKLA 3RCWA 2D9EA 5F63A 5JI8A 5HRXA 4N3WA 5A81A 2R10A 5DKHA 4UYHA 4YBMA 4QEUA 4Z1SA 3LQHA 5EICA 4IORA 3GG3A 5C4QA 4Y03A 4FLPA 3U5MA 5AD3A 2RS9B 2R0SA 2F6NA 4IR4A 5TCMA 5A7CA 5EPSA 4UYEA 5HLSA 2YEKA 5ETDA 5CGPA 4XUBA 1EQFA 5CQAA 4DONA 3QZVA 5EWDA 4BJXA 3AQAA 5CPEA 4NXJA 4MR3A 2NXBA 3JVMA 5D7XA 4NRBA 5KTUA 2D82A 2MJVB 3P1FA 2L85A 4LR6A 4QUTA 4HXPA 4YBSA 2F6JA 5CQ8A 4N4HA 5DX4A 5FE9A 2OSSA 3FKMX 4YYJA 4QSUA 4O75A 4UYGA 5J0DA 4A9NA 2OUOA 4PTBA 5A5OA 2I7KA 5DKCA 5L98A 4TT2A 4ALGA 4QZSA 4O7CA 4TTEA 5AMFA 5ENGA 4HBVA 5D3JA 4YAXA 4ZW1A 4RVRA 4TS8A 4MEOA 5EQ1A 4TT6A 4O74A 3QZSA 5FB1A 4J1PA 3HMFA 5EM3A 4Z93A 3P5OA 4CUQA 5DFCA 5D3SA 4X2IA 4NR9A 5JWMA 5EWHA 3NXBA 2I8NA 4MEQA 5EWWA 5TB6A 4Z6HA 3U5NA 5D24A 4LRGA 5IBNA 4UIYA 1JM4B 4ZQLA 5I80A 5FFYA 4O71A 4O78A 5KO4A 5LJ2A 5F62A 4YC9A 5C87A 4MEPA 5IG6A 4OGJA 3HMHA 4YADA 4QSVA 4XUAA 4BW2A 4CFLA 5ETBA 5FH7A 5FE0A 4TYLA 4F3IA 5K29A 4NUDA 5CUGA 5EVAA 4YABA 5FG6A 5HQ7A 5CQ3A 4NR6A 3IU5A 4YYDA 5CUDA 5C7NA 5E3DA 2DKWA 5LKZA 2RI7A 5LVRA 4NR8A 5A5PA 5CQ4A 4HXLA 5E9IA 2DWWA 5ENJA 5IGKA 5G4SA 4NR4A 4NR7A 4O7BA 5A83A 5BT5A 5D3HA 5D25A 4J0SA 4QC3A 5CUAA 5ENFA 3ONIA 5DKDA 2RNWA 4BW1A 5I40A 3UV4A 4TZ8A 4YK0A 4YYIA 3G0LA 4UIVA 4QYDA 4UITA 1N72A 4NYVA 5C85A 5FE4A 4LC2A 4NYXA 4A9IA 5HRWA 5A5RA 4HBXA 1WUMA 4CLBA 4A9JA 3O33A 5HFRA 5C89A 4UIWA 4QNSA 4J0RA 4PCEA 2R0YA 5H85A 5HEMA 4TU6A 5L97A 3U5LA 4A9FA 3K2JA 2DVRA 4QY4A 4BW3A 4Q0OA 5DYXA 5CQTA 4LZSA 4MR6A 5A5NA 5H1TA 4WHWA 4N4GA 3MQMA 4KCXA 5D3LA 5KTWA 4YYHA 5EK9A 4UYFA 3U5PA 5I88A 4CUUA 1WUGA 3S92A 4LYSA 5HFQA 4HBWA 4GPJA 4CFKA 5FE6A 4YH4A 4QR3A 2FSAA 2YW5A 2L84A 3U5OA 5FE1A 4QC1A 5I89A 5LJ1A 3U5KA 2H60A 4MR4A 4NRAA 3Q2EA 4OGIA 4IR5A 4PCIA 4NRCA 4YYKA 4A9LA 4O77A 3P1CA 3SVGA 4UYDA 5ACYA 5IGMA 3UVWA 3IU6A 4QSSA 5F25A 4TT4A 2YYNA 3DAIA 5FE2A 4IOQA 3I3JA 4O70A 4QB3A 5DW1A 5HELA 4CURA 5A5SA 5FE5A 4TZ2A 4NUEA 5I83A 3AADA 5DLZA 4HXSA 4UYFB 5LUUA 5BT3A 4MENA 2RFJA 4C67A 4QSWA 3MXFA 5DBMA 4XYAA 5FBXA 5EWVA 1F68A 5KTXA 5FB0A 5ENHA 3QZTA 3Q2FA 4CUPA 4Q0NA 2KTBB 5EP7A 5I7YA 5D3RA 5CQ6A 3MB3A 4QR4A 4YY4A 2YDWA 3UVDA 4BHWA 4TU4A 4OUFA 5C8GA 2YQDA 2RNYA 5CY9A 4LYIA 5F2PA 3ZYUA 5FH8A 5CS8A 5I86A 4Z6IA 4IOOA 3O35A 5ENCA 4YH3A 5EISA 5F1HA 5F3AA 2E3KA 3U5JA 5CFWA 5E7DA 4IR3A 4N4FA 4NR5A 4A9KA 4O76A 5DYUA 4WHUA 5F1LA 5COIA 5D0CA 5FFWA 5FE3A 5E9MA 5EPRA 5HQ6A 2OO1A 3D7CA 4NUCA 5CQ5A 4QSTA 5CRZA 4E96A 5L96A 5DYCA 4LDFA 4QEWA 2G4AA 4O7EA 5CUBA 4CUSA 4HXKA 4HXNA 4A9HA 5E9VA 4A9OA 4QSQA 5F5ZA 5EPBA 5D26A 2DATA 4QSXA 3TLPA 5G4RA 3UVYA 2RNXA 3MB4A 5F61A 3O36A 4O7FA 5A5QA 3O34A 4UIUA 5LKXA 3SVHA 5FG5A 2R0VA 4LYWA 5I29A 2GRCA 4QYLA 5AMEA 4QSRA 5HJCA 4XY8A 5E0RA 5AD2A 5CTLA 4AKNA 5HM0A 5H1UA 4QR5A 5EI4A 4YYGA 4LZRA 3LQJA 5ENIA 3P1EA 4J3IA 2E7NA 3G0JA 5IGLA 5CUCA 4CL9A 3JVKA 4KV1A 1X0JA 4QSPA 4O7AA 5D3NA 4PS5A 5II2A 3JVLA 5HRVA 5IIDA 5EGUA 5EWCA 5DW2A 5EU1A 5D3TA 4YYMA 5E3GA 5CQ7A 5HENA 5HCLA 3HMEA 5FE8A 3LXJA 2WP1A 3MUKA 3O37A 4PY6A 5CZGA 5E73A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CUTA 4TQNA 5I1QA 4LZ2A 5L8UA 3UV2A 3JVJA 5F36A 5EA1A 4YBTA 5DLXA 5ENBA 5L99A 5E9YA 5FH6A 2DVSA 1JSPB 5DY7A 4NS5A 4XY9A 5LKTA 3LJWA 3LQIA 2YEMA 4ALHA 4KV4A 3UVXA 4N4IA 5DFBA 4UIZA 4YATA 5H1VA 5FG4A 4C66A 4NQMA 5DFDA 3DWYA 4MR5A 2E7OA 5FDZA 5CUEA 3UV5A 5CP5A 4O72A 4YYNA 2RO1A 3MULA 5E9LA 5A82A 4HBYA 4WIVA 3SVFA 3UW9A 5CRMA 5A85A 4A9MA 5CU8A 5D3PA 5KHMA 5L8TA 5LKUA 2WP2A 2DVVA 2YELA 4HXRA 5I7XA 5DYAA 5EV9A 5HQ5A 5E74A 4UIXA 5ENEA 5BT4A 4NQNA 4YY6A 2L5EA 5FFVA 4ZC9A 4QBMA 2N9GA 3P1DA 4A9EA 4HXOA 2LSPB 1ZS5A 5E9KA 4QUUA 4HXMA 4NYWA 5FE7A 5IGNA 5LJ0A 4QEVA 5KU3A 2DVQA 4BW4A 4Z1QA 4IR6A 5II1A 5LVQA 5F60A 1E6IA 3S91A 4PKLA 3RCWA 2D9EA 5F63A 5JI8A 5HRXA 4N3WA 5A81A 2R10A 5DKHA 4UYHA 4YBMA 4QEUA 4Z1SA 3LQHA 5EICA 4IORA 3GG3A 5C4QA 4Y03A 4FLPA 3U5MA 5AD3A 2RS9B 2R0SA 2F6NA 4IR4A 5TCMA 5A7CA 5EPSA 4UYEA 3D1BA 5HLSA 2YEKA 5ETDA 5CGPA 4XUBA 1EQFA 5CQAA 4DONA 3QZVA 5EWDA 4BJXA 3AQAA 5CPEA 4NXJA 4MR3A 2NXBA 3JVMA 5D7XA 4NRBA 5KTUA 2D82A 2MJVB 3P1FA 2L85A 4LR6A 4QUTA 4HXPA 4YBSA 2F6JA 5CQ8A 4N4HA 5DX4A 5FE9A 2OSSA 3FKMX 4YYJA 4QSUA 4O75A 4UYGA 5J0DA 4A9NA 1PUOA 2OUOA 4PTBA 5A5OA 2I7KA 5DKCA 5L98A 4TT2A 4ALGA 4QZSA 4O7CA 4TTEA 5AMFA 5ENGA 4HBVA 5D3JA 4YAXA 4ZW1A 4RVRA 4TS8A 4MEOA 5EQ1A 4TT6A 4O74A 3QZSA 5FB1A 4J1PA 3HMFA 5EM3A 4Z93A 3P5OA 4CUQA 5DFCA 5D3SA 4X2IA 4NR9A 5JWMA 5EWHA 3NXBA 2I8NA 4MEQA 5EWWA 5TB6A 4Z6HA 3U5NA 5D24A 4LRGA 5IBNA 4UIYA 1JM4B 4ZQLA 5I80A 5FFYA 4O71A 4O78A 5KO4A 5LJ2A 5F62A 4YC9A 5C87A 4MEPA 5IG6A 4OGJA 3HMHA 4YADA 4QSVA 2EJNA 4XUAA 4BW2A 4CFLA 5ETBA 5FH7A 5FE0A 4TYLA 4F3IA 5K29A 4NUDA 5CUGA 5EVAA 4YABA 5FG6A 5HQ7A 5CQ3A 4NR6A 3IU5A 4YYDA 5CUDA 5C7NA 5E3DA 2DKWA 5LKZA 2RI7A 5LVRA 4NR8A 5A5PA 5CQ4A 4HXLA 5E9IA 2DWWA 5ENJA 5IGKA 5G4SA 4NR4A 4NR7A 4AKGA 4O7BA 5A83A 5BT5A 5D3HA 5D25A 4J0SA 4QC3A 5CUAA 5ENFA 3ONIA 5DKDA 2RNWA 4BW1A 5I40A 3UV4A 4TZ8A 4YK0A 4YYIA 3G0LA 4UIVA 4QYDA 4UITA 1N72A 4NYVA 5C85A 5FE4A 4LC2A 4NYXA 4A9IA 5HRWA 5A5RA 4HBXA 1WUMA 4CLBA 4A9JA 3O33A 5HFRA 5C89A 4UIWA 4QNSA 4J0RA 4PCEA 2R0YA 5H85A 5HEMA 4TU6A 5L97A 3U5LA 4A9FA 3K2JA 2DVRA 4QY4A 4BW3A 4Q0OA 5DYXA 5CQTA 4LZSA 4MR6A 5A5NA 5H1TA 4WHWA 4N4GA 3MQMA 4KCXA 5D3LA 5KTWA 4YYHA 5EK9A 4UYFA 3U5PA 5I88A 4CUUA 1WUGA 3S92A 4LYSA 5HFQA 4HBWA 4GPJA 4CFKA 5FE6A 4YH4A 4QR3A 2FSAA 2YW5A 2L84A 3U5OA 5FE1A 4QC1A 5I89A 5LJ1A 3U5KA 2H60A 4MR4A 4NRAA 3Q2EA 4OGIA 4IR5A 4PCIA 4NRCA 4YYKA 4A9LA 4O77A 3P1CA 3SVGA 4UYDA 5ACYA 5IGMA 3UVWA 3IU6A 4QSSA 5F25A 4TT4A 2YYNA 3DAIA 5FE2A 4IOQA 3I3JA 4O70A 4QB3A 5DW1A 5HELA 4CURA 5A5SA 5FE5A 4TZ2A 4NUEA 5I83A 3AADA 5DLZA 4HXSA 4UYFB 3VKHA 5LUUA 5BT3A 4MENA 2RFJA 4C67A 4QSWA 3VKGA 3ERRA 3MXFA 5DBMA 4XYAA 5FBXA 5EWVA 1F68A 5KTXA 5FB0A 5ENHA 3D1DA 3QZTA 3Q2FA 4CUPA 4AKIA 4Q0NA 2KTBB 5EP7A 5I7YA 5D3RA 5CQ6A 3MB3A 4QR4A 4YY4A 2YDWA 3UVDA 4BHWA 4TU4A 4OUFA 5C8GA 2YQDA 2RNYA 5CY9A 4LYIA 5F2PA 3ZYUA 5FH8A 5CS8A 5I86A 4Z6IA 4IOOA 3O35A 5ENCA 4YH3A 5EISA 5F1HA 5F3AA 2E3KA 3U5JA 5CFWA 4AI6A 5E7DA 4IR3A 4N4FA 4NR5A 4A9KA 4O76A 5DYUA 4WHUA 5F1LA 5COIA 5D0CA 5FFWA 5FE3A 5E9MA 5EPRA 5HQ6A 2OO1A 3D7CA 4NUCA 1ZKRA 5CQ5A 4QSTA 5CRZA 4E96A 5L96A 5DYCA 4LDFA 4QEWA 2G4AA 4O7EA 5CUBA 4CUSA 4HXKA 4HXNA 4A9HA 5E9VA 4A9OA 4QSQA 5F5ZA 5EPBA 5D26A 2DATA 4QSXA 3TLPA 5G4RA 4AKHA 3UVYA 2RNXA 3MB4A 5F61A 3O36A 4O7FA 5A5QA 3O34A 4UIUA 5LKXA 3SVHA 5FG5A 2R0VA 4LYWA 5I29A 2GRCA 4QYLA 5AMEA 4QSRA 5HJCA 4XY8A 5E0RA 5AD2A 5CTLA 4AKNA 5HM0A 5H1UA 4QR5A 5EI4A 4YYGA 4LZRA 3LQJA 5ENIA 3P1EA 4J3IA 2E7NA 3G0JA 5IGLA 5CUCA 4CL9A 3JVKA 4KV1A 1X0JA 4QSPA 4O7AA 5D3NA 4PS5A 5II2A 3JVLA 5HRVA 5IIDA 5EGUA 5EWCA 5DW2A 5EU1A 5D3TA 4YYMA 5E3GA 5CQ7A 5HENA 5HCLA 3HMEA 5FE8A 3LXJA 2WP1A 3MUKA 3O37A 4PY6A 5CZGA 5E73A
chains in the Genus database with same CATH topology
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