4QC3A

Crystal structure of human baz2b bromodomain in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k8ack12ac)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SMDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qc3A00
5A82A 5IG6A 3G0LA 4MR4A 2I7KA 3SVFA 5FDZA 2DVVA 4QUTA 3U5KA 4IR3A 3S92A 5F1LA 2R0YA 3NXBA 1ZS5A 5ETBA 3UVDA 5E3GA 5K29A 5CZGA 5FH7A 5FH6A 3O36A 5FE4A 4XY9A 5JI8A 3JVMA 4CL9A 4UYGA 4YYGA 4MR5A 3LQJA 5CUBA 5EPBA 5AD3A 3I3JA 4NRAA 5EI4A 5HELA 4C66A 4ZW1A 2R0SA 5EV9A 5H1TA 4C67A 5EVAA 4YAXA 4TQNA 4QSPA 4UIYA 5FFWA 5IIDA 5LKXA 4QR4A 2YW5A 4O77A 5TB6A 5DKCA 4NR5A 5A81A 2RNYA 5F2PA 3HMFA 4QSSA 2DWWA 4N3WA 4NRCA 5DY7A 5HFRA 5CQ3A 5ETDA 5ENCA 4O71A 4IOOA 5A5PA 4YYDA 4A9HA 5L96A 5KU3A 5CUEA 4XYAA 4IORA 4PCEA 4QEVA 2L5EA 4UIUA 4Z1SA 2YELA 4QZSA 5A5RA 4LYSA 4KV4A 4NR4A 4O7BA 4KV1A 2RI7A 5I83A 5DLZA 5CUDA 4O7AA 3IU5A 4J1PA 3AADA 3HMEA 4NUCA 2F6NA 3UVWA 4BW4A 4N4IA 5JWMA 2E7NA 4QEUA 4A9EA 5C7NA 5F1HA 5L99A 5FBXA 5D25A 5CUAA 5EWDA 5HQ7A 5ENGA 3U5NA 4UIVA 5CU8A 5DFDA 5EP7A 5D3LA 5HCLA 5LVRA 4ZC9A 5F60A 5LKZA 5L8UA 5ENJA 4UIXA 3UVXA 5H1UA 5ENEA 4TU6A 4A9LA 5L97A 5LKTA 4QBMA 4HXMA 4HBXA 4HBYA 5FFVA 5I40A 2LSPB 4J3IA 4XY8A 5II1A 4F3IA 4UYHA 5D0CA 4QSWA 4GPJA 4LR6A 4TU4A 5F62A 4N4GA 5F5ZA 4UIWA 5AMEA 4Z1QA 5I80A 5EA1A 5BT5A 4CUQA 5FE1A 5COIA 4NR6A 2YEMA 1JM4B 1X0JA 5E9LA 5D3HA 2G4AA 5FE5A 2R0VA 4OGIA 1N72A 4QY4A 5DKHA 2L85A 5FE3A 4UYDA 5IBNA 2YQDA 4NYWA 5DBMA 4YYHA 3QZSA 5D3JA 4QR3A 5FG6A 5ENFA 5I29A 4LRGA 4O74A 4O7FA 4OUFA 4LZ2A 5F63A 2WP1A 4TT4A 5FE7A 4A9IA 5ENIA 5FE9A 3P1EA 4LZRA 1F68A 4HXNA 5CP5A 5LVQA 4KCXA 4YYMA 4IR6A 4UYFA 2D9EA 5D3NA 4TT6A 3JVKA 4NQNA 4YY6A 2RFJA 5J0DA 5CGPA 4LYIA 5HJCA 5CFWA 5E7DA 3MB3A 5FE2A 4O78A 5D26A 5BT4A 3UV4A 4LDFA 4LC2A 5ENBA 4YYIA 5FE0A 4QSXA 4PCIA 5C89A 4BW2A 3HMHA 4QC3A 3FKMX 3Q2EA 5ENHA 5LKUA 4O7EA 5KO4A 4J0SA 2OSSA 3P5OA 4TYLA 5IGNA 4A9KA 5CRZA 4OGJA 5EWVA 4YYNA 5CUCA 5D3SA 5FG4A 2D82A 4HXLA 5HRXA 5EU1A 5I88A 4WIVA 3TLPA 5F36A 4YBMA 4ALHA 4BW1A 3RCWA 5BT3A 4TS8A 5I7YA 2E3KA 3D7CA 4A9OA 2FSAA 5C87A 3MULA 5D3PA 5A5SA 5DLXA 4MR3A 4CUSA 4YK0A 4A9MA 5FE8A 4MEPA 4UIZA 2GRCA 1EQFA 3DAIA 5C85A 4A9FA 5CTLA 1JSPB 4YC9A 5D3RA 5CQ6A 4O70A 5E9IA 4HXPA 5C8GA 5CS8A 3MXFA 3JVJA 2DATA 5CQAA 5I86A 5HM0A 4Z6IA 4QSVA 5D3TA 4NUEA 5EQ1A 4FLPA 3G0JA 4YY4A 5FG5A 5H1VA 4CFKA 5IGLA 3MQMA 4ZQLA 5DW2A 1WUMA 5G4SA 5EWHA 4Z6HA 4QR5A 3UW9A 3MUKA 4QSUA 4N4FA 2RNWA 4YADA 4Z93A 3UVYA 4YBSA 4TZ8A 4NQMA 5E73A 4CUPA 5H85A 5LJ1A 4PS5A 5LJ2A 4NYVA 4RVRA 5HQ5A 4HXOA 4O7CA 5HENA 5DFBA 3U5LA 5IGKA 5II2A 5A83A 3AQAA 5AMFA 5EGUA 4MR6A 5FH8A 3O33A 2RNXA 4O76A 5E9MA 2RO1A 5KTXA 5CQTA 5DW1A 4QB3A 4WHUA 5L98A 3SVGA 2NXBA 4MENA 4LYWA 4YH4A 2H60A 5EICA 5A5QA 4NXJA 3P1CA 5D24A 5I89A 4YYKA 3U5JA 4QSRA 4NRBA 5EPSA 5LJ0A 5E9YA 5HLSA 4MEQA 4NYXA 3UV2A 5DX4A 5CPEA 4UITA 3LQIA 5DKDA 2DKWA 4QYDA 5HRVA 5E74A 4NR9A 4Y03A 4HBVA 4YABA 3DWYA 5G4RA 5D7XA 5CY9A 4NS5A 2DVQA 4X2IA 4XUBA 4A9JA 5A7CA 2OO1A 4TTEA 4O75A 4HXRA 4TT2A 4J0RA 4E96A 5I1QA 5F61A 5HEMA 5EWWA 5EISA 4CFLA 4CURA 3SVHA 3P1DA 3K2JA 5KHMA 3O37A 4MEOA 5EPRA 3ONIA 2N9GA 5TCMA 2DVRA 5E0RA 2YYNA 2KTBB 5F25A 2WP2A 5DYCA 5EK9A 4IR4A 5KTUA 5L8TA 3U5PA 5CQ4A 5LUUA 4IOQA 5E9VA 5E9KA 2E7OA 5FE6A 4PY6A 4YATA 3GG3A 4HBWA 4HXKA 4YYJA 5ACYA 2L84A 5C4QA 4UYFB 2YDWA 4UYEA 1WUGA 5E3DA 3QZTA 4PKLA 4QC1A 2I8NA 4Q0NA 3U5MA 4CLBA 4ALGA 5DYXA 3IU6A 3ZYUA 5HFQA 3Q2FA 2RS9B 5I7XA 5A85A 2R10A 5HQ6A 4A9NA 4QYLA 5FFYA 3P1FA 5KTWA 4CUUA 4QSTA 4N4HA 4DONA 4TZ2A 1E6IA 4PTBA 4IR5A 2OUOA 5CQ5A 4BJXA 3UV5A 4NR8A 4YBTA 5EWCA 4QNSA 5IGMA 4O72A 3LQHA 2MJVB 5DYUA 5CRMA 3LXJA 3O35A 4LZSA 4QSQA 5EM3A 3O34A 5DYAA 4NUDA 5CUGA 3JVLA 4QUUA 5AD2A 5HRWA 4XUAA 5CQ7A 4BHWA 4QEWA 4NR7A 5DFCA 2DVSA 5FB0A 4YH3A 2F6JA 3U5OA 5A5OA 4AKNA 2YEKA 5A5NA 5CQ8A 3S91A 5FB1A 4Q0OA 3QZVA 4CUTA 3LJWA 3MB4A 4WHWA 4HXSA 4BW3A 5F3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A82A 5IG6A 3G0LA 4MR4A 2I7KA 3SVFA 5FDZA 2DVVA 4QUTA 3U5KA 4IR3A 3S92A 5F1LA 2R0YA 3NXBA 1ZS5A 5ETBA 3UVDA 5E3GA 5K29A 5CZGA 5FH7A 5FH6A 3O36A 5FE4A 4XY9A 5JI8A 3JVMA 4CL9A 4UYGA 4YYGA 4MR5A 3LQJA 5CUBA 5EPBA 5AD3A 3VKHA 3I3JA 4NRAA 5EI4A 5HELA 4C66A 4ZW1A 2R0SA 5EV9A 5H1TA 4C67A 5EVAA 4YAXA 4TQNA 4QSPA 4UIYA 5FFWA 5IIDA 5LKXA 4QR4A 2YW5A 4O77A 5TB6A 5DKCA 4NR5A 5A81A 2RNYA 5F2PA 3HMFA 4QSSA 2DWWA 4N3WA 4NRCA 5DY7A 5HFRA 5CQ3A 5ETDA 5ENCA 4O71A 4IOOA 5A5PA 4YYDA 4A9HA 5L96A 5KU3A 5CUEA 4XYAA 4IORA 4PCEA 4QEVA 2L5EA 4UIUA 4Z1SA 2YELA 4QZSA 5A5RA 4LYSA 4KV4A 4NR4A 4O7BA 3D1DA 4KV1A 2RI7A 5I83A 5DLZA 5CUDA 4O7AA 3IU5A 4J1PA 3AADA 3HMEA 4NUCA 2F6NA 3UVWA 4BW4A 4N4IA 5JWMA 2E7NA 4QEUA 4A9EA 5C7NA 5F1HA 5L99A 5FBXA 5D25A 5CUAA 5EWDA 5HQ7A 5ENGA 3U5NA 4UIVA 5CU8A 5DFDA 5EP7A 5D3LA 5HCLA 5LVRA 4ZC9A 5F60A 5LKZA 4AKGA 5L8UA 5ENJA 4UIXA 3UVXA 5H1UA 5ENEA 4TU6A 4A9LA 5L97A 5LKTA 4QBMA 4HXMA 4HBXA 4HBYA 5FFVA 5I40A 2LSPB 4J3IA 4XY8A 5II1A 4F3IA 4UYHA 5D0CA 4QSWA 4GPJA 4LR6A 4TU4A 5F62A 4N4GA 5F5ZA 4UIWA 5AMEA 4Z1QA 5I80A 5EA1A 5BT5A 4CUQA 5FE1A 5COIA 4NR6A 2YEMA 1JM4B 1X0JA 5E9LA 5D3HA 2G4AA 5FE5A 2R0VA 4OGIA 1N72A 4QY4A 5DKHA 2L85A 3D1BA 5FE3A 4UYDA 5IBNA 2YQDA 4NYWA 5DBMA 4YYHA 3QZSA 5D3JA 3VKGA 4AKIA 4QR3A 5FG6A 5ENFA 5I29A 4LRGA 4O74A 4O7FA 4OUFA 4LZ2A 5F63A 2WP1A 4TT4A 5FE7A 4A9IA 5ENIA 5FE9A 3P1EA 4LZRA 1F68A 4HXNA 5CP5A 5LVQA 4KCXA 4YYMA 4IR6A 4UYFA 2D9EA 5D3NA 4TT6A 3JVKA 4AKHA 4NQNA 4YY6A 2RFJA 5J0DA 5CGPA 4LYIA 5HJCA 5CFWA 5E7DA 3MB3A 5FE2A 4O78A 5D26A 5BT4A 3UV4A 4LDFA 4LC2A 5ENBA 4YYIA 5FE0A 4QSXA 4PCIA 5C89A 4BW2A 3HMHA 4QC3A 3FKMX 3Q2EA 5ENHA 5LKUA 4O7EA 5KO4A 4J0SA 2OSSA 3P5OA 4TYLA 5IGNA 4A9KA 5CRZA 4OGJA 5EWVA 4YYNA 5CUCA 5D3SA 5FG4A 2D82A 4HXLA 5HRXA 5EU1A 5I88A 4WIVA 3TLPA 5F36A 4YBMA 4ALHA 4BW1A 3RCWA 5BT3A 4TS8A 5I7YA 2E3KA 3D7CA 4A9OA 2FSAA 5C87A 3MULA 5D3PA 5A5SA 4AI6A 5DLXA 4MR3A 4CUSA 4YK0A 4A9MA 5FE8A 4MEPA 4UIZA 2GRCA 1EQFA 3DAIA 5C85A 4A9FA 5CTLA 1JSPB 4YC9A 5D3RA 5CQ6A 4O70A 5E9IA 4HXPA 5C8GA 5CS8A 3MXFA 3JVJA 2DATA 5CQAA 5I86A 5HM0A 4Z6IA 4QSVA 5D3TA 4NUEA 5EQ1A 4FLPA 3G0JA 4YY4A 5FG5A 5H1VA 4CFKA 5IGLA 3MQMA 4ZQLA 5DW2A 1WUMA 5G4SA 5EWHA 4Z6HA 4QR5A 3UW9A 3MUKA 4QSUA 4N4FA 2RNWA 4YADA 4Z93A 3UVYA 4YBSA 4TZ8A 4NQMA 5E73A 4CUPA 5H85A 5LJ1A 4PS5A 5LJ2A 4NYVA 4RVRA 5HQ5A 2EJNA 4HXOA 4O7CA 5HENA 5DFBA 3U5LA 5IGKA 5II2A 5A83A 3AQAA 5AMFA 5EGUA 4MR6A 5FH8A 3O33A 2RNXA 4O76A 5E9MA 2RO1A 5KTXA 5CQTA 5DW1A 4QB3A 4WHUA 5L98A 3SVGA 2NXBA 4MENA 4LYWA 4YH4A 2H60A 3ERRA 5EICA 5A5QA 4NXJA 3P1CA 5D24A 5I89A 4YYKA 3U5JA 4QSRA 4NRBA 5EPSA 5LJ0A 5E9YA 5HLSA 4MEQA 4NYXA 3UV2A 5DX4A 5CPEA 4UITA 3LQIA 5DKDA 2DKWA 4QYDA 5HRVA 5E74A 4NR9A 4Y03A 4HBVA 4YABA 3DWYA 5G4RA 5D7XA 5CY9A 4NS5A 2DVQA 4X2IA 4XUBA 4A9JA 5A7CA 2OO1A 4TTEA 4O75A 4HXRA 4TT2A 4J0RA 4E96A 5I1QA 5F61A 5HEMA 5EWWA 5EISA 4CFLA 4CURA 3SVHA 3P1DA 3K2JA 5KHMA 3O37A 4MEOA 5EPRA 3ONIA 2N9GA 5TCMA 2DVRA 5E0RA 2YYNA 2KTBB 5F25A 2WP2A 5DYCA 5EK9A 4IR4A 5KTUA 5L8TA 3U5PA 5CQ4A 5LUUA 4IOQA 5E9VA 5E9KA 2E7OA 5FE6A 4PY6A 4YATA 3GG3A 4HBWA 4HXKA 4YYJA 5ACYA 2L84A 5C4QA 4UYFB 2YDWA 4UYEA 1WUGA 5E3DA 3QZTA 4PKLA 4QC1A 2I8NA 4Q0NA 3U5MA 4CLBA 4ALGA 5DYXA 3IU6A 3ZYUA 5HFQA 3Q2FA 2RS9B 5I7XA 5A85A 2R10A 5HQ6A 4A9NA 4QYLA 5FFYA 3P1FA 5KTWA 4CUUA 4QSTA 4N4HA 4DONA 4TZ2A 1E6IA 4PTBA 4IR5A 2OUOA 5CQ5A 4BJXA 3UV5A 4NR8A 4YBTA 5EWCA 4QNSA 5IGMA 4O72A 3LQHA 2MJVB 5DYUA 5CRMA 3LXJA 3O35A 4LZSA 4QSQA 5EM3A 3O34A 5DYAA 4NUDA 5CUGA 3JVLA 4QUUA 5AD2A 5HRWA 4XUAA 5CQ7A 4BHWA 4QEWA 4NR7A 5DFCA 2DVSA 5FB0A 4YH3A 1ZKRA 2F6JA 3U5OA 5A5OA 4AKNA 1PUOA 2YEKA 5A5NA 5CQ8A 3S91A 5FB1A 4Q0OA 3QZVA 4CUTA 3LJWA 3MB4A 4WHWA 4HXSA 4BW3A 5F3AA
chains in the Genus database with same CATH topology
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