4QC3A

Crystal structure of human baz2b bromodomain in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k8ack12ac)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SMDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qc3A00
5FDZA 3UVWA 4HXKA 5CQAA 3Q2EA 4GPJA 4TU6A 3DAIA 4LYWA 5BT5A 4HBVA 5A81A 4J0RA 5ACYA 3UVDA 4QBMA 3UV4A 4LDFA 4Y03A 4O78A 2F6NA 4J3IA 4WIVA 5EWCA 2YW5A 4RVRA 4YYGA 5I88A 4QSQA 4QYLA 4YBMA 2R0VA 4LYSA 4Z1SA 4NYVA 4NRBA 4IR4A 4YYNA 4YY4A 4NR8A 1X0JA 4OUFA 5DX4A 5CUBA 2G4AA 2YDWA 5FE9A 4IR5A 4TS8A 4QSVA 4CLBA 2YQDA 3UVXA 2I7KA 5FH6A 4UYEA 4Q0OA 5C7NA 5F25A 5H1TA 5AMFA 5FFVA 4CL9A 3G0LA 4ALHA 5J0DA 4UYHA 5EP7A 3MQMA 5CQ8A 4OGIA 3O37A 5FE6A 4TZ8A 3JVLA 4YYIA 1E6IA 5KHMA 5IGNA 5CS8A 4YC9A 4TT6A 4YBTA 5D25A 4QC1A 4PCEA 3Q2FA 5F62A 5CP5A 4BW3A 5E3GA 3IU6A 3HMEA 2WP2A 4NXJA 1WUGA 3SVGA 5ETDA 3SVFA 4HXPA 4PCIA 3LXJA 5CUCA 2DVSA 2WP1A 4QC3A 5F5ZA 4A9KA 2KTBB 5IG6A 5FG6A 4O74A 5TB6A 5FE1A 4KV4A 4CFKA 4UYDA 4MR5A 5DBMA 2DVVA 4NRCA 5IIDA 4UYGA 2DVQA 5L99A 5E9VA 4N4GA 5HFQA 5C4QA 3MB3A 3P1CA 5A5RA 4PS5A 5CUGA 5EU1A 4CURA 3S92A 4QUUA 4NR9A 5E7DA 5D3RA 5CFWA 5I80A 5EICA 5L98A 3U5NA 4LYIA 4UYFA 5D3SA 5DYUA 5EPRA 5HLSA 3D7CA 5CU8A 4YY6A 4A9FA 3U5MA 4HXNA 5G4SA 4CUUA 4TT4A 4YAXA 5E74A 4BW1A 3AADA 4IR6A 5EPSA 5FE2A 3LQJA 4PTBA 5HEMA 5LVQA 5A7CA 4QZSA 4O7EA 3SVHA 5IBNA 5CRZA 5ENEA 4YK0A 4QSSA 5A5PA 3RCWA 5JWMA 5I40A 4MEPA 5CUEA 3O36A 3O33A 4UITA 3MULA 3QZSA 5A83A 4NQMA 4NR5A 5LKZA 4QSRA 5FE8A 1F68A 3I3JA 5A5QA 5FE3A 5A5SA 4UIYA 4MEOA 5HQ7A 2DATA 4HBWA 2OUOA 5IGMA 4TQNA 5KO4A 5H1UA 5II2A 4XUAA 4Q0NA 4BW2A 5D3LA 4A9EA 2YYNA 5DKCA 3P1FA 5EK9A 5E9IA 4O75A 2R10A 5DKHA 4MENA 5L96A 5FE4A 3AQAA 5C89A 4LZSA 5TCMA 5F3AA 4O7BA 5KTXA 3O34A 5D0CA 5FE0A 5E3DA 5A5NA 3MXFA 5DY7A 2OSSA 5HRVA 4YYHA 4MR4A 4KCXA 5LVRA 5FBXA 4FLPA 4TZ2A 4NUEA 2R0SA 3P1EA 5EI4A 4O72A 2RS9B 1WUMA 4QNSA 5DLXA 5LKTA 1JM4B 4YADA 4N4FA 4QY4A 5ENIA 4QEVA 4A9IA 5CPEA 4CUTA 4O7AA 5CQ5A 4XYAA 3UV2A 4BHWA 4YYJA 4NYXA 4NR6A 1EQFA 4QB3A 3P1DA 4QSUA 4QYDA 4UIZA 3JVKA 2RNWA 5II1A 5I7XA 5ETBA 2FSAA 5IGLA 5F60A 5D3JA 4E96A 4PY6A 4YABA 5CY9A 5CTLA 5DKDA 5EWDA 2OO1A 5LJ2A 4UIWA 5E9MA 3UW9A 4O7FA 5HENA 4XY8A 4DONA 3U5OA 2E3KA 4LR6A 4NS5A 5E9KA 5H1VA 5HM0A 3HMFA 4NRAA 5DFDA 4C67A 5DYAA 4QSXA 4A9JA 5F61A 2D82A 4UIXA 2YEMA 4QUTA 5CZGA 5AMEA 3HMHA 5FG5A 5CQ4A 5CQ6A 5DYCA 5KTWA 4TT2A 4IOOA 3JVMA 5ENBA 5EVAA 3ONIA 4TYLA 3MUKA 2RI7A 4QR4A 5E9LA 5L8UA 5HQ5A 4NUCA 5HQ6A 5F1HA 4Z6IA 2RNYA 5L97A 5CGPA 3QZTA 5DFBA 5CQ3A 5LKXA 5D3PA 5C8GA 2H60A 4O77A 5FE5A 5K29A 5DW1A 4AKNA 5EISA 3QZVA 3K2JA 4IOQA 4QSTA 4ZC9A 4ALGA 4CFLA 5F1LA 3LJWA 4QR3A 4N4HA 5LJ1A 4UIVA 5FFYA 4MEQA 2DVRA 5KU3A 2DKWA 2RFJA 4HXSA 4MR6A 5EV9A 4J1PA 5IGKA 5EWWA 4LZ2A 5BT3A 2R0YA 5DFCA 5CUDA 4HBXA 3S91A 4YATA 5L8TA 5EPBA 5FG4A 5HELA 5E9YA 4YYDA 5I7YA 4NQNA 4HXRA 4LZRA 5I83A 4YYMA 5LJ0A 4YH4A 5ENCA 4F3IA 1N72A 2YEKA 4YBSA 5F63A 5FB0A 2MJVB 5ENFA 3ZYUA 2N9GA 3UV5A 2E7NA 4NUDA 5C85A 2RNXA 4QSPA 4C66A 4A9MA 1ZS5A 4HXLA 5F36A 2E7OA 4Z6HA 4TTEA 5DYXA 5EWHA 3LQHA 5E73A 4BW4A 5HRWA 4KV1A 4XUBA 4XY9A 4TU4A 4Z93A 2NXBA 4UIUA 4MR3A 3UVYA 3FKMX 4NR4A 5EWVA 5A85A 4HXMA 4A9NA 4Z1QA 5G4RA 4BJXA 5I86A 5FE7A 3GG3A 4O7CA 4IR3A 5FFWA 5D7XA 5FB1A 5HJCA 5HCLA 2GRCA 3MB4A 5COIA 3P5OA 5DLZA 4N3WA 2LSPB 5H85A 5BT4A 2I8NA 4NR7A 4LRGA 3U5JA 5A5OA 5D26A 5EGUA 5A82A 4IORA 5CQTA 4QEWA 3U5PA 5F2PA 5D3HA 5D24A 5I29A 5ENGA 4O70A 4NYWA 3U5KA 4N4IA 4QR5A 4X2IA 5EQ1A 3G0JA 5KTUA 4WHWA 4ZW1A 5LUUA 4CUQA 5I89A 4J0SA 3TLPA 4WHUA 2L5EA 4YH3A 5HRXA 2DWWA 3U5LA 5AD3A 5ENHA 5JI8A 4HBYA 2D9EA 5D3TA 5E0RA 1JSPB 4O71A 4CUPA 2RO1A 5C87A 3DWYA 5CQ7A 5FH8A 4CUSA 5EM3A 4HXOA 5I1QA 4A9OA 5CRMA 4UYFB 5DW2A 4A9LA 4O76A 2L84A 3NXBA 2F6JA 4OGJA 5ENJA 4LC2A 4QEUA 5LKUA 5EA1A 2L85A 4A9HA 3O35A 4QSWA 5FH7A 5HFRA 4PKLA 4YYKA 5CUAA 4ZQLA 3IU5A 5AD2A 2YELA 3LQIA 3JVJA 5D3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FDZA 3UVWA 4HXKA 5CQAA 3Q2EA 4GPJA 4TU6A 3DAIA 4LYWA 5BT5A 4HBVA 5A81A 4J0RA 5ACYA 3UVDA 4QBMA 3UV4A 4LDFA 4Y03A 4O78A 2F6NA 3VKGA 4J3IA 4WIVA 5EWCA 2YW5A 4RVRA 4YYGA 5I88A 4QSQA 4QYLA 4YBMA 2R0VA 4LYSA 4Z1SA 4NYVA 4AI6A 4NRBA 4IR4A 4AKIA 4YYNA 4YY4A 4NR8A 1X0JA 4OUFA 5DX4A 5CUBA 2G4AA 2YDWA 5FE9A 4IR5A 4TS8A 4QSVA 4CLBA 2YQDA 3UVXA 2I7KA 5FH6A 4UYEA 4Q0OA 5C7NA 5F25A 5H1TA 5AMFA 5FFVA 4CL9A 3G0LA 4ALHA 5J0DA 4UYHA 5EP7A 3MQMA 5CQ8A 4OGIA 3O37A 5FE6A 4TZ8A 3JVLA 4YYIA 1E6IA 5KHMA 5IGNA 5CS8A 4YC9A 4TT6A 4YBTA 5D25A 4QC1A 4PCEA 3Q2FA 5F62A 5CP5A 4BW3A 5E3GA 3IU6A 3HMEA 2WP2A 4NXJA 1WUGA 3SVGA 5ETDA 3SVFA 4HXPA 4PCIA 3LXJA 5CUCA 2DVSA 2WP1A 4QC3A 5F5ZA 4A9KA 2KTBB 5IG6A 5FG6A 4O74A 5TB6A 5FE1A 4KV4A 4CFKA 4UYDA 4MR5A 5DBMA 2DVVA 4NRCA 5IIDA 4UYGA 2DVQA 5L99A 5E9VA 4N4GA 5HFQA 5C4QA 3MB3A 3P1CA 5A5RA 4PS5A 5CUGA 5EU1A 4CURA 3S92A 4QUUA 4NR9A 5E7DA 5D3RA 5CFWA 5I80A 5EICA 5L98A 3U5NA 4LYIA 4UYFA 5D3SA 5DYUA 5EPRA 5HLSA 3D7CA 5CU8A 4YY6A 4A9FA 3U5MA 4HXNA 5G4SA 4CUUA 4TT4A 4YAXA 5E74A 4BW1A 3AADA 4IR6A 5EPSA 5FE2A 3LQJA 4PTBA 5HEMA 5LVQA 5A7CA 4QZSA 4O7EA 3SVHA 5IBNA 5CRZA 5ENEA 4YK0A 4QSSA 5A5PA 3RCWA 5JWMA 5I40A 4MEPA 4AKGA 5CUEA 3O36A 3O33A 4UITA 3MULA 3QZSA 5A83A 4NQMA 4NR5A 5LKZA 4QSRA 5FE8A 1F68A 3I3JA 5A5QA 5FE3A 5A5SA 4UIYA 4MEOA 5HQ7A 2DATA 4HBWA 2OUOA 5IGMA 4TQNA 5KO4A 5H1UA 5II2A 4XUAA 4Q0NA 4BW2A 5D3LA 4A9EA 2YYNA 5DKCA 3P1FA 5EK9A 5E9IA 4O75A 2R10A 5DKHA 4MENA 5L96A 5FE4A 3AQAA 5C89A 4LZSA 5TCMA 5F3AA 4O7BA 5KTXA 3O34A 5D0CA 5FE0A 5E3DA 5A5NA 3MXFA 3D1DA 5DY7A 2OSSA 5HRVA 4YYHA 4MR4A 4KCXA 5LVRA 5FBXA 4FLPA 4TZ2A 4NUEA 2R0SA 3P1EA 5EI4A 4O72A 2RS9B 1WUMA 4QNSA 5DLXA 5LKTA 1JM4B 4YADA 4N4FA 4QY4A 5ENIA 4QEVA 4A9IA 5CPEA 4CUTA 4O7AA 5CQ5A 4XYAA 2EJNA 3UV2A 4BHWA 4YYJA 4NYXA 4NR6A 1EQFA 4QB3A 3P1DA 4QSUA 4QYDA 4UIZA 3JVKA 2RNWA 5II1A 5I7XA 5ETBA 2FSAA 5IGLA 5F60A 5D3JA 4E96A 4PY6A 4YABA 5CY9A 5CTLA 5DKDA 5EWDA 2OO1A 5LJ2A 4UIWA 5E9MA 3UW9A 4O7FA 5HENA 4XY8A 4DONA 3U5OA 2E3KA 4LR6A 4NS5A 3D1BA 5E9KA 5H1VA 5HM0A 3HMFA 4AKHA 3VKHA 4NRAA 5DFDA 4C67A 5DYAA 4QSXA 4A9JA 5F61A 2D82A 4UIXA 2YEMA 4QUTA 5CZGA 5AMEA 3HMHA 5FG5A 5CQ4A 5CQ6A 5DYCA 5KTWA 4TT2A 4IOOA 3JVMA 5ENBA 5EVAA 3ONIA 4TYLA 3MUKA 2RI7A 4QR4A 5E9LA 5L8UA 5HQ5A 4NUCA 5HQ6A 5F1HA 4Z6IA 2RNYA 5L97A 5CGPA 3QZTA 5DFBA 5CQ3A 5LKXA 5D3PA 5C8GA 2H60A 4O77A 5FE5A 5K29A 5DW1A 4AKNA 5EISA 3QZVA 3K2JA 4IOQA 4QSTA 4ZC9A 4ALGA 4CFLA 5F1LA 3LJWA 4QR3A 4N4HA 5LJ1A 4UIVA 5FFYA 4MEQA 2DVRA 5KU3A 2DKWA 2RFJA 4HXSA 4MR6A 5EV9A 4J1PA 5IGKA 5EWWA 4LZ2A 5BT3A 2R0YA 5DFCA 5CUDA 4HBXA 3S91A 4YATA 5L8TA 5EPBA 5FG4A 5HELA 5E9YA 4YYDA 5I7YA 4NQNA 4HXRA 4LZRA 5I83A 4YYMA 5LJ0A 4YH4A 5ENCA 4F3IA 1N72A 2YEKA 4YBSA 5F63A 5FB0A 2MJVB 5ENFA 3ZYUA 2N9GA 3UV5A 2E7NA 4NUDA 3ERRA 5C85A 2RNXA 4QSPA 4C66A 4A9MA 1ZS5A 4HXLA 5F36A 2E7OA 4Z6HA 4TTEA 5DYXA 5EWHA 3LQHA 5E73A 4BW4A 5HRWA 4KV1A 4XUBA 4XY9A 4TU4A 1PUOA 4Z93A 2NXBA 4UIUA 4MR3A 3UVYA 3FKMX 4NR4A 5EWVA 5A85A 4HXMA 1ZKRA 4A9NA 4Z1QA 5G4RA 4BJXA 5I86A 5FE7A 3GG3A 4O7CA 4IR3A 5FFWA 5D7XA 5FB1A 5HJCA 5HCLA 2GRCA 3MB4A 5COIA 3P5OA 5DLZA 4N3WA 2LSPB 5H85A 5BT4A 2I8NA 4NR7A 4LRGA 3U5JA 5A5OA 5D26A 5EGUA 5A82A 4IORA 5CQTA 4QEWA 3U5PA 5F2PA 5D3HA 5D24A 5I29A 5ENGA 4O70A 4NYWA 3U5KA 4N4IA 4QR5A 4X2IA 5EQ1A 3G0JA 5KTUA 4WHWA 4ZW1A 5LUUA 4CUQA 5I89A 4J0SA 3TLPA 4WHUA 2L5EA 4YH3A 5HRXA 2DWWA 3U5LA 5AD3A 5ENHA 5JI8A 4HBYA 2D9EA 5D3TA 5E0RA 1JSPB 4O71A 4CUPA 2RO1A 5C87A 3DWYA 5CQ7A 5FH8A 4CUSA 5EM3A 4HXOA 5I1QA 4A9OA 5CRMA 4UYFB 5DW2A 4A9LA 4O76A 2L84A 3NXBA 2F6JA 4OGJA 5ENJA 4LC2A 4QEUA 5LKUA 5EA1A 2L85A 4A9HA 3O35A 4QSWA 5FH7A 5HFRA 4PKLA 4YYKA 5CUAA 4ZQLA 3IU5A 5AD2A 2YELA 3LQIA 3JVJA 5D3NA
chains in the Genus database with same CATH topology
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