4QC3A

Crystal structure of human baz2b bromodomain in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k8ack12ac)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SMDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qc3A00
4O71A 4N4GA 4PS5A 4BW1A 4YADA 5CP5A 2DVSA 2L85A 4YBSA 5IGNA 2RS9B 5IG6A 5HQ7A 4QSXA 5CPEA 5DFDA 4ALHA 4QSUA 2RNYA 4LDFA 1WUMA 2L5EA 5FE5A 4TTEA 5HQ5A 5F2PA 5E9MA 4QEUA 4A9NA 4WHUA 5ENGA 3P1DA 4IR6A 5FE6A 5C7NA 5CS8A 5HEMA 4YBTA 1F68A 5ENCA 5HRVA 5AMEA 5DKDA 5TCMA 4TQNA 4Z1QA 5CRMA 3LXJA 5LJ1A 4WIVA 4F3IA 5HELA 5D25A 5ENEA 5DW1A 3LQHA 5FH6A 4XUBA 2GRCA 3JVKA 5HJCA 4LZ2A 5FFVA 5F61A 5EPSA 4N4HA 5E9VA 5FBXA 2I8NA 4O7EA 4LC2A 5F5ZA 4CUSA 4YYNA 3UV5A 2DWWA 5EI4A 2OO1A 5L96A 5E7DA 3HMHA 4MENA 4NRBA 5ETBA 5HFRA 4ZW1A 5HENA 5CGPA 4HBXA 4YK0A 5CY9A 2YEMA 5ENFA 3DAIA 5KTUA 4UYGA 5CUAA 4O7BA 2YW5A 5I1QA 5FDZA 5LKTA 5L97A 2I7KA 5TB6A 3P1FA 4TT2A 4Z1SA 4A9HA 4QUTA 4N3WA 4QSPA 5DW2A 5HFQA 5HQ6A 3O35A 3Q2EA 4MR5A 5D3HA 3GG3A 4O7CA 4A9IA 5D3LA 4MR3A 3LQIA 4IR3A 5LKXA 3DWYA 4UYHA 5C8GA 5HM0A 5LJ2A 5E0RA 4NYVA 2N9GA 4IORA 4QZSA 5L8TA 4UIVA 3O33A 4HXRA 4C67A 4CLBA 2NXBA 4UYDA 4QC3A 4YAXA 5D3SA 2L84A 4NUDA 5EV9A 5C87A 3RCWA 5BT4A 1ZS5A 3UVXA 4YYDA 4O7AA 4YYHA 4YC9A 4ALGA 4PCIA 5CQ5A 4QSWA 4Q0NA 5FB0A 3I3JA 5KO4A 2D9EA 5CFWA 4CFLA 5D0CA 5D7XA 2R0SA 4FLPA 1X0JA 4XY9A 3P1EA 5IGLA 4HXNA 4TU6A 5I29A 2F6JA 3IU5A 4O74A 4O7FA 5EPBA 4TT6A 4NR5A 5CUDA 2DKWA 4BW3A 5KHMA 4QSTA 3UV4A 4A9FA 2WP2A 5ENHA 5AD3A 5F36A 4PCEA 5LUUA 4TYLA 4UYEA 5CTLA 4OGJA 3U5MA 3MUKA 5CUEA 5I7XA 5FE1A 5FH8A 4QYLA 3P5OA 5EA1A 4CURA 5LJ0A 4CUTA 5FG6A 4QR5A 5COIA 3MXFA 4IR5A 5FE0A 4NQMA 3K2JA 2RNXA 3JVJA 3AQAA 4GPJA 5I40A 4NS5A 5I86A 4QNSA 4LZSA 4UYFA 5I89A 3LJWA 3NXBA 4YYMA 5A5QA 5D3PA 5E74A 2E7NA 4Z6IA 3O34A 4UIZA 4YATA 4KCXA 5FG5A 5F63A 5EWVA 4IOQA 5BT3A 4LYWA 5A83A 4NRAA 4HXKA 5EQ1A 5C85A 4HBYA 4HXOA 5DYXA 5FH7A 5CQAA 4YY4A 2DVRA 4X2IA 5ENBA 4E96A 5DFCA 5AD2A 4MEPA 3JVLA 2FSAA 5EM3A 4HXLA 4ZQLA 2MJVB 5ETDA 5K29A 2KTBB 3QZTA 4KV4A 4YYJA 3QZVA 2R0VA 5JI8A 2YEKA 5CQ3A 4TT4A 4ZC9A 5EISA 4MEOA 5F25A 4MR4A 5D3NA 5A5OA 5I83A 4UYFB 5DKCA 5KTXA 3TLPA 5BT5A 4QUUA 5LVQA 4MEQA 3MULA 5FFWA 1EQFA 4Z93A 5A5RA 4QC1A 5CQ8A 5F1HA 4TS8A 5EWWA 5H1TA 5D3RA 2DATA 3U5PA 5EWDA 5FE4A 5A81A 5A85A 4J3IA 4O70A 4LZRA 3UW9A 4N4FA 5CQTA 5DY7A 4BW4A 3JVMA 5FE3A 5A5NA 5CRZA 3MB3A 5DX4A 3ZYUA 4LRGA 3S92A 3HMFA 5JWMA 5L99A 5C89A 4NR7A 5EU1A 2RNWA 2OUOA 4TZ8A 2WP1A 5CQ7A 3G0LA 5E9KA 5FE7A 4YH4A 4LR6A 4QR4A 4HBWA 5HRWA 3AADA 5E3GA 4J0RA 4UITA 4TZ2A 5LKUA 5II1A 4BJXA 5DYUA 2H60A 3P1CA 4NR9A 4O77A 4CFKA 4PKLA 5EWHA 5KTWA 2F6NA 1JSPB 5DYCA 4RVRA 2YDWA 4A9EA 2R10A 5A82A 5DLZA 4QR3A 5DLXA 4NXJA 4J1PA 4YY6A 3O36A 4LYSA 4NR4A 5CUGA 4Z6HA 5C4QA 3D7CA 5EWCA 5DFBA 4YYIA 4A9MA 4YYGA 2D82A 4J0SA 3UV2A 4A9OA 2RO1A 5E9IA 4UIXA 5CZGA 5F3AA 5HLSA 4QSRA 5EVAA 2YELA 4PY6A 5CUCA 2RFJA 3FKMX 3SVGA 2E7OA 3HMEA 4XUAA 5A5SA 4TU4A 5D24A 5I80A 4UIWA 4N4IA 2OSSA 4WHWA 4QB3A 3SVFA 4PTBA 4XYAA 5FFYA 4C66A 4CUPA 5E9LA 4AKNA 2YYNA 4QSVA 5D3TA 3O37A 4DONA 4NUCA 4QSSA 5EGUA 5E73A 4Q0OA 4QBMA 4BW2A 4QSQA 4NQNA 4NRCA 4O72A 4BHWA 4YABA 4OUFA 5IBNA 5KU3A 2G4AA 5H1VA 4NYWA 4HBVA 5II2A 4HXSA 5FE9A 5H1UA 4CL9A 4OGIA 4CUUA 4YH3A 3SVHA 4LYIA 5CUBA 3MQMA 4KV1A 3S91A 3U5NA 5H85A 5I7YA 5G4RA 5G4SA 4IR4A 3UVWA 5E9YA 4YYKA 5F1LA 5LVRA 5IGMA 4MR6A 5I88A 5IGKA 2LSPB 4O78A 3LQJA 4QEVA 5L8UA 4Y03A 3ONIA 4A9KA 2E3KA 5HRXA 4O76A 5HCLA 5A7CA 5D3JA 5CQ6A 5EP7A 4IOOA 4NYXA 5CQ4A 4HXMA 5DYAA 5ENJA 3QZSA 3G0JA 3U5LA 3U5OA 4UIYA 1WUGA 5DBMA 5CU8A 3UVDA 5F62A 4YBMA 5J0DA 4NR6A 1E6IA 2YQDA 4O75A 4QEWA 3MB4A 4QY4A 3U5KA 4UIUA 5IIDA 1JM4B 4A9LA 3Q2FA 2RI7A 1N72A 5LKZA 5FG4A 5E3DA 4NR8A 5AMFA 5FB1A 5L98A 3U5JA 4NUEA 5A5PA 3UVYA 5FE2A 2DVVA 5F60A 5EICA 4HXPA 5ENIA 3IU6A 4QYDA 5ACYA 5EPRA 2DVQA 5FE8A 2R0YA 4CUQA 5EK9A 5D26A 5DKHA 4A9JA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O71A 4N4GA 4PS5A 4BW1A 4YADA 5CP5A 2DVSA 2L85A 4YBSA 5IGNA 2RS9B 5IG6A 5HQ7A 4QSXA 5CPEA 5DFDA 4ALHA 4QSUA 2RNYA 4LDFA 1WUMA 2L5EA 5FE5A 4TTEA 5HQ5A 5F2PA 5E9MA 4QEUA 4A9NA 4WHUA 5ENGA 3P1DA 4IR6A 5FE6A 5C7NA 5CS8A 5HEMA 4YBTA 1F68A 5ENCA 5HRVA 5AMEA 5DKDA 5TCMA 4TQNA 4Z1QA 5CRMA 3LXJA 5LJ1A 4WIVA 4F3IA 5HELA 5D25A 5ENEA 5DW1A 3LQHA 5FH6A 4XUBA 2GRCA 3JVKA 5HJCA 4LZ2A 5FFVA 5F61A 5EPSA 4N4HA 5E9VA 5FBXA 3VKGA 2I8NA 4O7EA 4LC2A 5F5ZA 4CUSA 4YYNA 3UV5A 2DWWA 5EI4A 2OO1A 5L96A 5E7DA 3HMHA 4MENA 4NRBA 5ETBA 5HFRA 4ZW1A 5HENA 5CGPA 4HBXA 4YK0A 5CY9A 2YEMA 5ENFA 3DAIA 5KTUA 4UYGA 5CUAA 4O7BA 2YW5A 5I1QA 5FDZA 5LKTA 1ZKRA 2I7KA 5L97A 5TB6A 3P1FA 4TT2A 4Z1SA 4A9HA 4QUTA 4N3WA 4QSPA 5DW2A 5HFQA 5HQ6A 3O35A 3Q2EA 4MR5A 5D3HA 3GG3A 4O7CA 4A9IA 5D3LA 4MR3A 3LQIA 4IR3A 5LKXA 3DWYA 4UYHA 5C8GA 5HM0A 5LJ2A 5E0RA 4NYVA 2N9GA 4IORA 4QZSA 5L8TA 4UIVA 3O33A 4HXRA 4C67A 4CLBA 2NXBA 4UYDA 4QC3A 4YAXA 5D3SA 2L84A 4NUDA 5EV9A 5C87A 3RCWA 5BT4A 1ZS5A 3UVXA 4YYDA 4O7AA 4YYHA 4YC9A 4ALGA 4PCIA 5CQ5A 4QSWA 4Q0NA 5FB0A 3I3JA 5KO4A 2D9EA 5CFWA 4CFLA 5D0CA 5D7XA 2R0SA 4FLPA 1X0JA 4XY9A 3P1EA 5IGLA 4HXNA 4TU6A 5I29A 2F6JA 3IU5A 4O74A 4O7FA 5EPBA 4TT6A 4NR5A 5CUDA 2DKWA 4BW3A 5KHMA 4QSTA 3UV4A 4A9FA 2WP2A 5ENHA 5AD3A 5F36A 4PCEA 5LUUA 4TYLA 4UYEA 5CTLA 4OGJA 3U5MA 3MUKA 5CUEA 5I7XA 5FE1A 5FH8A 4QYLA 3P5OA 5EA1A 4CURA 5LJ0A 4CUTA 5FG6A 4QR5A 5COIA 3MXFA 4IR5A 5FE0A 4NQMA 3K2JA 2RNXA 3JVJA 3AQAA 4GPJA 5I40A 4NS5A 5I86A 4QNSA 4LZSA 4UYFA 5I89A 3LJWA 3NXBA 4YYMA 5A5QA 5D3PA 5E74A 2E7NA 4Z6IA 3O34A 4UIZA 4YATA 4KCXA 5FG5A 5F63A 5EWVA 4IOQA 5BT3A 4LYWA 5A83A 4AI6A 4NRAA 4HXKA 5EQ1A 5C85A 4HBYA 4HXOA 5DYXA 5FH7A 5CQAA 4YY4A 2DVRA 4X2IA 5ENBA 4E96A 5DFCA 5AD2A 4MEPA 3JVLA 2FSAA 5EM3A 4HXLA 4ZQLA 2MJVB 5ETDA 5K29A 2KTBB 3QZTA 4KV4A 4YYJA 3QZVA 2R0VA 5JI8A 2YEKA 5CQ3A 4AKGA 3VKHA 4TT4A 4ZC9A 5EISA 4MEOA 5F25A 4MR4A 5D3NA 5A5OA 5I83A 4UYFB 5DKCA 5KTXA 3TLPA 5BT5A 4QUUA 5LVQA 4MEQA 3MULA 5FFWA 1EQFA 4Z93A 5A5RA 4QC1A 5CQ8A 5F1HA 4TS8A 5EWWA 5H1TA 5D3RA 3D1BA 2DATA 3U5PA 5EWDA 5FE4A 5A81A 5A85A 4J3IA 4O70A 4LZRA 3UW9A 4N4FA 5CQTA 5DY7A 4BW4A 3JVMA 5FE3A 5A5NA 5CRZA 3MB3A 5DX4A 3ZYUA 4LRGA 3S92A 3HMFA 5JWMA 5L99A 5C89A 4NR7A 5EU1A 2RNWA 2OUOA 4TZ8A 2WP1A 5CQ7A 3G0LA 5E9KA 5FE7A 4AKIA 4YH4A 4LR6A 4QR4A 4HBWA 5HRWA 3AADA 5E3GA 3ERRA 4J0RA 4UITA 4TZ2A 5LKUA 5II1A 4BJXA 5DYUA 2H60A 3P1CA 4NR9A 4O77A 4CFKA 4PKLA 5EWHA 5KTWA 2F6NA 1JSPB 5DYCA 4RVRA 2YDWA 4A9EA 2R10A 5A82A 5DLZA 4QR3A 5DLXA 4NXJA 4J1PA 4YY6A 3O36A 4LYSA 4NR4A 5CUGA 4Z6HA 5C4QA 3D7CA 5EWCA 5DFBA 4YYIA 4A9MA 4YYGA 2D82A 4J0SA 3UV2A 4A9OA 2RO1A 5E9IA 4UIXA 5CZGA 5F3AA 5HLSA 4QSRA 5EVAA 2YELA 4PY6A 5CUCA 2RFJA 3FKMX 3SVGA 2E7OA 3HMEA 4XUAA 5A5SA 4TU4A 5D24A 5I80A 4UIWA 4N4IA 2OSSA 4WHWA 1PUOA 4QB3A 3SVFA 4PTBA 4XYAA 5FFYA 4C66A 4CUPA 5E9LA 4AKNA 2YYNA 4QSVA 5D3TA 3O37A 4DONA 4NUCA 4QSSA 5EGUA 5E73A 4Q0OA 4QBMA 4BW2A 4QSQA 4NQNA 4NRCA 4O72A 4BHWA 4YABA 4OUFA 5IBNA 5KU3A 2G4AA 5H1VA 4NYWA 4HBVA 5II2A 4HXSA 5FE9A 5H1UA 4CL9A 4OGIA 4CUUA 4YH3A 3SVHA 4LYIA 5CUBA 3MQMA 4KV1A 3S91A 3U5NA 3D1DA 5H85A 5I7YA 5G4RA 5G4SA 4IR4A 3UVWA 5E9YA 4YYKA 5F1LA 5LVRA 5IGMA 4MR6A 5I88A 5IGKA 2LSPB 4O78A 3LQJA 4QEVA 5L8UA 4Y03A 3ONIA 4A9KA 2E3KA 5HRXA 4O76A 5HCLA 5A7CA 5D3JA 5CQ6A 5EP7A 4IOOA 4NYXA 5CQ4A 4HXMA 5DYAA 5ENJA 3QZSA 3G0JA 3U5LA 3U5OA 4UIYA 1WUGA 5DBMA 5CU8A 3UVDA 4AKHA 5F62A 4YBMA 5J0DA 4NR6A 1E6IA 2YQDA 4O75A 4QEWA 3MB4A 4QY4A 3U5KA 4UIUA 5IIDA 1JM4B 4A9LA 3Q2FA 2RI7A 1N72A 5LKZA 5FG4A 5E3DA 4NR8A 5AMFA 5FB1A 5L98A 3U5JA 4NUEA 5A5PA 3UVYA 5FE2A 2DVVA 5F60A 5EICA 2EJNA 4HXPA 5ENIA 3IU6A 4QYDA 5ACYA 5EPRA 2DVQA 5FE8A 2R0YA 4CUQA 5EK9A 5D26A 5DKHA 4A9JA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4O71 A;  4N4G A;  4PS5 A;  4BW1 A;  4YAD A;  5CP5 A;  2DVS A;  2L85 A;  4YBS A;  5IGN A;  2RS9 B;  5IG6 A;  5HQ7 A;  4QSX A;  5CPE A;  5DFD A;  4ALH A;  4QSU A;  2RNY A;  4LDF A;  1WUM A;  2L5E A;  5FE5 A;  4TTE A;  5HQ5 A;  5F2P A;  5E9M A;  4QEU A;  4A9N A;  4WHU A;  5ENG A;  3P1D A;  4IR6 A;  5FE6 A;  5C7N A;  5CS8 A;  5HEM A;  4YBT A;  1F68 A;  5ENC A;  5HRV A;  5AME A;  5DKD A;  5TCM A;  4TQN A;  4Z1Q A;  5CRM A;  3LXJ A;  5LJ1 A;  4WIV A;  4F3I A;  5HEL A;  5D25 A;  5ENE A;  5DW1 A;  3LQH A;  5FH6 A;  4XUB A;  2GRC A;  3JVK A;  5HJC A;  4LZ2 A;  5FFV A;  5F61 A;  5EPS A;  4N4H A;  5E9V A;  5FBX A;  2I8N A;  4O7E A;  4LC2 A;  5F5Z A;  4CUS A;  4YYN A;  3UV5 A;  2DWW A;  5EI4 A;  2OO1 A;  5L96 A;  5E7D A;  3HMH A;  4MEN A;  4NRB A;  5ETB A;  5HFR A;  4ZW1 A;  5HEN A;  5CGP A;  4HBX A;  4YK0 A;  5CY9 A;  2YEM A;  5ENF A;  3DAI A;  5KTU A;  4UYG A;  5CUA A;  4O7B A;  2YW5 A;  5I1Q A;  5FDZ A;  5LKT A;  5L97 A;  2I7K A;  5TB6 A;  3P1F A;  4TT2 A;  4Z1S A;  4A9H A;  4QUT A;  4N3W A;  4QSP A; 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