4QC3A

Crystal structure of human baz2b bromodomain in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k8ack12ac)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SMDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qc3A00
4N4HA 4O7EA 4BW1A 5HQ7A 4QEWA 4NYXA 5L97A 5LJ1A 4QSUA 3NXBA 2L84A 5EI4A 4A9KA 5ENGA 5EPRA 2N9GA 5H85A 4NYWA 2R0VA 4QSRA 5L96A 4O74A 3O35A 4YABA 3JVMA 5HJCA 5I40A 4CURA 5FG4A 5ENIA 4YC9A 4YH3A 5FH6A 5HRXA 4HXRA 4NRBA 5DYUA 4WHWA 5E74A 3P1DA 4CUTA 5CQAA 5F60A 3DWYA 4UYDA 5I83A 5F1HA 4UIYA 5FG6A 3O36A 4O70A 5DKDA 5KTWA 5E7DA 3JVLA 4HBYA 4O76A 4N3WA 5KTUA 4E96A 5CPEA 4HBWA 5HLSA 5F3AA 5G4RA 4QSPA 3SVFA 5EK9A 4UYHA 5FE4A 2WP1A 5EISA 3Q2EA 4NQMA 2YW5A 5EWDA 4A9HA 4NQNA 2E3KA 3LJWA 4O7FA 5D3RA 5IBNA 2RS9B 4PS5A 3UV5A 3IU5A 4YYNA 5CUGA 5LKXA 5EGUA 4IR3A 2DATA 5COIA 4O71A 3HMEA 4KV4A 4QYLA 3S91A 4QB3A 2R0YA 4QR3A 5F62A 1EQFA 2RI7A 5I86A 2RNWA 4UIUA 1WUMA 5CUBA 2D9EA 5I89A 4N4IA 4A9FA 5J0DA 4J1PA 4NR5A 3QZVA 5JWMA 5ETBA 3P1FA 5D24A 3O37A 4O78A 3MB4A 5EA1A 2R0SA 5DW2A 5IGKA 2R10A 4TQNA 4CLBA 4Q0NA 5LKTA 4QSVA 4PCEA 4NR8A 4YATA 5EICA 4YYDA 5HQ5A 2FSAA 2GRCA 4TT4A 5A82A 5E3GA 4FLPA 5FBXA 4YY4A 3P1CA 4QSXA 2OUOA 2YELA 5HRVA 3MB3A 4TT6A 4NRAA 2DKWA 3DAIA 4QC1A 4NRCA 2LSPB 4NUEA 4QSSA 4YK0A 5FB0A 3UV4A 4TZ8A 5FE7A 5LJ2A 2E7OA 4OGIA 3AQAA 4NR9A 4UYFB 5DKHA 4A9JA 2RNXA 5FFYA 3QZSA 4Z1SA 5FFWA 4LR6A 4QC3A 5IGMA 5DLZA 5DFBA 5CUDA 3P5OA 5EV9A 4MEOA 5A85A 5AMEA 5HRWA 4CUQA 4HXNA 5A5RA 4XY8A 1JM4B 2WP2A 4YYKA 5KHMA 4IOOA 5DY7A 5DYXA 4KCXA 3O34A 4J0RA 5D26A 5A5SA 5IIDA 2YYNA 4CL9A 4UIVA 4Z6IA 4YADA 4DONA 5FFVA 4HXMA 5D3LA 5D0CA 4AKNA 4QNSA 5H1TA 4O7CA 5EU1A 5IGLA 4QYDA 1WUGA 5DYAA 5E3DA 4A9OA 2OO1A 4HBVA 4TTEA 2RO1A 4HXKA 2OSSA 5AD3A 2DWWA 4YYMA 2RFJA 4O72A 3G0JA 2D82A 4IR5A 4LRGA 5CQTA 3FKMX 2YQDA 3AADA 4GPJA 5EM3A 5A5NA 5L99A 5CS8A 5LVQA 4MR5A 5FG5A 4NR6A 4UIWA 5E0RA 5F36A 5E9IA 4YBTA 4UYFA 5TCMA 5CQ3A 4QEUA 5DFCA 5CQ7A 2F6NA 5C87A 3U5NA 4PY6A 4LC2A 3U5PA 4WIVA 3SVGA 4HXOA 5FH8A 2H60A 5C8GA 4NR4A 2YEMA 5BT3A 4UYEA 3UVXA 5FE1A 5FE2A 2L5EA 4MENA 4ALGA 4TU4A 4QSTA 4KV1A 4O77A 4BW4A 4CUPA 4LZSA 4C66A 5ETDA 4IR4A 5EWWA 3LXJA 2I8NA 4YY6A 4ZW1A 5TB6A 5ENJA 4NUDA 3I3JA 5C89A 5CTLA 4NR7A 2E7NA 3MQMA 4HXLA 3UVDA 5F2PA 4HXSA 4TZ2A 3U5MA 3Q2FA 5CUCA 5FE9A 1X0JA 5H1VA 5CU8A 4UYGA 4A9MA 4QBMA 4YAXA 3UVWA 5D3JA 5HFQA 5D3PA 5HENA 4CUSA 4NS5A 2G4AA 5E9VA 3QZTA 3U5JA 5A7CA 4OUFA 3ZYUA 3U5OA 4IOQA 4X2IA 5EPSA 4F3IA 5CUAA 3JVJA 4Z93A 2L85A 2YEKA 5CZGA 2DVRA 4BJXA 3LQJA 4N4FA 3MULA 3RCWA 5E9YA 4TS8A 4CFKA 4MEQA 4TT2A 4YBMA 2DVSA 5ENHA 4PCIA 5IG6A 5FDZA 4YYJA 5A5QA 5A81A 4QSWA 5F63A 5I7XA 5C85A 3LQHA 5F1LA 5D7XA 5E9KA 5I1QA 5EWVA 5LKUA 4LDFA 4MR4A 4O7AA 3UV2A 4A9IA 5I88A 2DVQA 5EP7A 5A83A 4PKLA 4TU6A 4YH4A 4MEPA 4LZRA 5ACYA 5G4SA 4LYIA 3K2JA 5LKZA 5FE8A 2I7KA 3SVHA 3JVKA 4HBXA 4NUCA 4IORA 5FE0A 5LUUA 5CFWA 1JSPB 1ZS5A 5DKCA 4ZC9A 4A9EA 4QR5A 5HEMA 5AD2A 2YDWA 5EPBA 4A9LA 3D7CA 5EVAA 2KTBB 5ENFA 4QEVA 5ENCA 4Q0OA 4UIZA 4Z1QA 3MUKA 4UIXA 5F5ZA 5DBMA 5DLXA 5I29A 3IU6A 4NYVA 5L98A 3UVYA 5D3HA 5E9LA 4A9NA 5D3SA 4XYAA 4QY4A 4QUUA 5CGPA 4QSQA 4J0SA 5C7NA 3U5LA 5L8TA 5CRZA 5HELA 5CQ6A 5ENEA 4QUTA 4XUBA 3HMHA 4YYHA 1N72A 5E9MA 4RVRA 3G0LA 4OGJA 2RNYA 5FE3A 4MR6A 4LYSA 3U5KA 1E6IA 5KTXA 5FH7A 5FB1A 3ONIA 5JI8A 5CY9A 5CQ5A 5C4QA 3O33A 5CP5A 2MJVB 4QZSA 5DFDA 5CRMA 5HQ6A 5HM0A 4CFLA 5E73A 4PTBA 5LVRA 3P1EA 5EWHA 5I7YA 4O75A 4CUUA 5L8UA 5KU3A 4YBSA 5BT4A 4J3IA 4C67A 3S92A 5II1A 4HXPA 4QR4A 5CQ4A 5DW1A 3TLPA 4O7BA 4IR6A 4XY9A 5LJ0A 4BHWA 4BW2A 3MXFA 4XUAA 5EWCA 5A5OA 4NXJA 5IGNA 4Y03A 5F61A 5DYCA 5A5PA 5FE6A 5II2A 2NXBA 4WHUA 3GG3A 5FE5A 5K29A 5F25A 5D3NA 5D3TA 5BT5A 5CQ8A 5EQ1A 4ZQLA 5AMFA 5HCLA 5ENBA 2F6JA 4LZ2A 3HMFA 3LQIA 4N4GA 4YYGA 4LYWA 1F68A 4ALHA 4TYLA 5CUEA 5KO4A 4MR3A 3UW9A 5HFRA 4Z6HA 5D25A 5DX4A 4BW3A 5I80A 2DVVA 4UITA 4YYIA 5H1UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N4HA 4O7EA 4BW1A 5HQ7A 4QEWA 4NYXA 5L97A 5LJ1A 4QSUA 3NXBA 2L84A 5EI4A 4A9KA 5ENGA 5EPRA 2N9GA 5H85A 4NYWA 1ZKRA 2R0VA 4QSRA 5L96A 4O74A 3O35A 4YABA 3JVMA 5HJCA 5I40A 4CURA 5FG4A 5ENIA 4YC9A 4YH3A 5FH6A 5HRXA 4HXRA 4NRBA 5DYUA 4WHWA 5E74A 3P1DA 4CUTA 5CQAA 5F60A 3DWYA 4UYDA 5I83A 5F1HA 4UIYA 5FG6A 3O36A 4O70A 5DKDA 5KTWA 5E7DA 3JVLA 4HBYA 1PUOA 4O76A 4N3WA 5KTUA 4E96A 5CPEA 4HBWA 5HLSA 5F3AA 5G4RA 4QSPA 3SVFA 5EK9A 4UYHA 5FE4A 2WP1A 5EISA 3Q2EA 4NQMA 2YW5A 5EWDA 4A9HA 4NQNA 2E3KA 3LJWA 4O7FA 5D3RA 5IBNA 2RS9B 4PS5A 3UV5A 3IU5A 4YYNA 5CUGA 5LKXA 5EGUA 4IR3A 2DATA 5COIA 4O71A 3VKHA 3HMEA 4KV4A 4QYLA 3S91A 4QB3A 2R0YA 4QR3A 5F62A 1EQFA 2RI7A 5I86A 2RNWA 4UIUA 1WUMA 5CUBA 2D9EA 5I89A 4N4IA 4A9FA 5J0DA 4J1PA 4NR5A 3QZVA 5JWMA 5ETBA 3P1FA 5D24A 3O37A 4O78A 3MB4A 5EA1A 2R0SA 5DW2A 5IGKA 2R10A 4TQNA 4CLBA 4Q0NA 5LKTA 4QSVA 4PCEA 4NR8A 4YATA 5EICA 4YYDA 5HQ5A 2FSAA 2GRCA 4TT4A 5A82A 5E3GA 4FLPA 5FBXA 4YY4A 3P1CA 4QSXA 2OUOA 2YELA 5HRVA 3MB3A 4TT6A 4NRAA 2DKWA 3DAIA 4QC1A 4NRCA 2LSPB 4NUEA 4QSSA 4YK0A 5FB0A 3UV4A 4TZ8A 5FE7A 5LJ2A 2E7OA 4OGIA 3AQAA 4NR9A 4UYFB 5DKHA 4A9JA 2RNXA 5FFYA 3QZSA 4Z1SA 5FFWA 4LR6A 4QC3A 5IGMA 5DLZA 5DFBA 5CUDA 3P5OA 5EV9A 4MEOA 5A85A 5AMEA 5HRWA 4CUQA 4HXNA 5A5RA 4XY8A 1JM4B 2WP2A 4YYKA 5KHMA 4IOOA 5DY7A 5DYXA 4KCXA 3O34A 4J0RA 5D26A 5A5SA 5IIDA 2YYNA 4CL9A 4UIVA 4Z6IA 4YADA 4DONA 5FFVA 4HXMA 5D3LA 5D0CA 4AKNA 4QNSA 5H1TA 4O7CA 5EU1A 5IGLA 4QYDA 1WUGA 5DYAA 5E3DA 4A9OA 2OO1A 4HBVA 4TTEA 2RO1A 4HXKA 2OSSA 5AD3A 2DWWA 4YYMA 2RFJA 4O72A 3G0JA 2D82A 4IR5A 4LRGA 5CQTA 3FKMX 2YQDA 3AADA 4GPJA 5EM3A 5A5NA 5L99A 5CS8A 5LVQA 4MR5A 5FG5A 4NR6A 4UIWA 5E0RA 5F36A 5E9IA 4YBTA 4UYFA 5TCMA 5CQ3A 4QEUA 5DFCA 5CQ7A 2F6NA 5C87A 3U5NA 4PY6A 4LC2A 3U5PA 4WIVA 3SVGA 4HXOA 5FH8A 2H60A 5C8GA 4NR4A 2YEMA 5BT3A 4UYEA 3UVXA 5FE1A 5FE2A 4AI6A 2L5EA 4MENA 4ALGA 4TU4A 4QSTA 4KV1A 4O77A 4BW4A 4CUPA 4LZSA 4C66A 5ETDA 4IR4A 5EWWA 3LXJA 2I8NA 4YY6A 4ZW1A 5TB6A 5ENJA 4NUDA 3I3JA 5C89A 5CTLA 4NR7A 2E7NA 3MQMA 4HXLA 3UVDA 5F2PA 4HXSA 4TZ2A 3U5MA 3Q2FA 5CUCA 5FE9A 1X0JA 5H1VA 5CU8A 4UYGA 4A9MA 4QBMA 4YAXA 3UVWA 5D3JA 3ERRA 5HFQA 5D3PA 5HENA 4CUSA 4NS5A 2G4AA 5E9VA 3QZTA 3U5JA 5A7CA 4OUFA 3ZYUA 3U5OA 4IOQA 4X2IA 5EPSA 4F3IA 5CUAA 3JVJA 4Z93A 2L85A 2YEKA 5CZGA 2DVRA 4BJXA 3LQJA 4N4FA 3MULA 3RCWA 5E9YA 4TS8A 4CFKA 4MEQA 4TT2A 4YBMA 2DVSA 5ENHA 4PCIA 5IG6A 5FDZA 4YYJA 5A5QA 5A81A 4QSWA 5F63A 5I7XA 3VKGA 5C85A 3LQHA 5F1LA 5D7XA 5E9KA 5I1QA 5EWVA 5LKUA 4LDFA 4MR4A 4O7AA 3UV2A 4A9IA 5I88A 2DVQA 5EP7A 5A83A 4PKLA 4TU6A 4YH4A 4MEPA 4LZRA 5ACYA 5G4SA 4AKGA 4LYIA 3K2JA 5LKZA 5FE8A 2I7KA 3SVHA 3JVKA 4HBXA 4NUCA 4IORA 5FE0A 5LUUA 5CFWA 1JSPB 1ZS5A 5DKCA 4ZC9A 4A9EA 4QR5A 5HEMA 5AD2A 2YDWA 5EPBA 4A9LA 3D7CA 5EVAA 2KTBB 5ENFA 4QEVA 5ENCA 4Q0OA 4UIZA 4Z1QA 3MUKA 4UIXA 5F5ZA 5DBMA 5DLXA 5I29A 3IU6A 4NYVA 2EJNA 5L98A 3UVYA 5D3HA 5E9LA 4A9NA 5D3SA 3D1BA 4XYAA 4QY4A 4QUUA 5CGPA 4QSQA 4J0SA 5C7NA 3U5LA 5L8TA 5CRZA 5HELA 5CQ6A 5ENEA 4QUTA 4XUBA 3HMHA 4YYHA 1N72A 5E9MA 4RVRA 4AKHA 3G0LA 4OGJA 2RNYA 5FE3A 4MR6A 4LYSA 3U5KA 1E6IA 5KTXA 5FH7A 5FB1A 3ONIA 5JI8A 5CY9A 5CQ5A 5C4QA 3O33A 5CP5A 2MJVB 4QZSA 5DFDA 5CRMA 5HQ6A 4AKIA 5HM0A 4CFLA 5E73A 4PTBA 5LVRA 3P1EA 5EWHA 5I7YA 4O75A 4CUUA 5L8UA 5KU3A 4YBSA 5BT4A 4J3IA 4C67A 3S92A 5II1A 4HXPA 4QR4A 5CQ4A 5DW1A 3TLPA 4O7BA 4IR6A 4XY9A 5LJ0A 4BHWA 4BW2A 3MXFA 4XUAA 5EWCA 5A5OA 4NXJA 5IGNA 4Y03A 5F61A 5DYCA 5A5PA 5FE6A 5II2A 2NXBA 4WHUA 3GG3A 5FE5A 5K29A 5F25A 5D3NA 5D3TA 5BT5A 5CQ8A 5EQ1A 4ZQLA 5AMFA 5HCLA 5ENBA 2F6JA 4LZ2A 3HMFA 3LQIA 4N4GA 4YYGA 4LYWA 1F68A 4ALHA 4TYLA 5CUEA 5KO4A 4MR3A 3UW9A 3D1DA 5HFRA 4Z6HA 5D25A 5DX4A 4BW3A 5I80A 2DVVA 4UITA 4YYIA 5H1UA
chains in the Genus database with same CATH topology
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