1EQFA

Crystal structure of the double bromodomain module from human tafii250
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
GTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR
publication title Structure and function of a human TAFII250 double bromodomain module.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2000-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA01
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA02
1X0JA 5CU8A 4LYSA 3JVMA 4OGJA 4AKNA 5FE8A 5L8UA 5CQ8A 5CPEA 4YAXA 4FLPA 5E9KA 5L98A 5FE3A 4YY6A 4HXRA 4O7EA 5CRZA 3ZYUA 5HM0A 4PCEA 4QBMA 5AD3A 5CGPA 2RNYA 3UV2A 5HELA 5CUGA 5LKXA 5FE2A 5LVRA 3UV5A 4QC3A 3HMFA 4LRGA 3SVGA 1JSPB 4UIUA 5FFYA 4A9LA 5DKCA 4O72A 5C4QA 4IR6A 5FB0A 4Q0NA 4WHWA 4YBSA 4NRCA 4C66A 2YELA 4MEOA 1N72A 4QSVA 4QR4A 4QYLA 3JVJA 5DKHA 4NRBA 5KTWA 5FE9A 4Z6HA 4HBXA 3HMHA 4A9EA 5H1UA 3LQHA 4BW3A 5KTUA 4NUCA 5I88A 5DBMA 5CFWA 4HXLA 1WUMA 4YYIA 5EPSA 4CUTA 5FG6A 3NXBA 3O34A 5IIDA 5ENIA 5HQ7A 4YH3A 5K29A 4UYHA 2D82A 4YYDA 2WP1A 4ZQLA 5DLXA 5CQ4A 4BW4A 2R0SA 3UVDA 2DVVA 5DY7A 5EWCA 2G4AA 3TLPA 4QNSA 5E9LA 4NR9A 5F61A 5A5NA 4E96A 4CLBA 5KU3A 5CUAA 4UYFA 5ENCA 5DW2A 5F5ZA 5FE5A 3LJWA 4NR8A 3O35A 4NR6A 5EISA 5ENGA 3S91A 2I7KA 4MEQA 4O7CA 4YADA 5EP7A 5II2A 3LXJA 5A5PA 5D3HA 5FFVA 5I80A 3GG3A 3UV4A 4YBMA 1ZS5A 3U5KA 4QYDA 4A9OA 5FE7A 5D3LA 4O76A 4A9FA 5A5OA 4XY9A 4QSTA 5CZGA 5C7NA 4WIVA 5F63A 4O7FA 5CP5A 5EM3A 4QZSA 4LR6A 5E9IA 5I83A 3MXFA 4N4FA 4UIWA 5A5QA 4LZSA 4CFKA 4A9MA 4QEVA 5A5SA 4YY4A 5LJ2A 5ETDA 4QY4A 5DFBA 4HBVA 4NYWA 5FH7A 5C87A 5CUEA 3I3JA 5EWVA 3S92A 2YW5A 4KV1A 1EQFA 3UW9A 5IGMA 4NQNA 4QUUA 5ENEA 4LZRA 4PS5A 5EI4A 4CL9A 5COIA 5A7CA 3DAIA 4MENA 2DATA 4BHWA 3K2JA 5CS8A 5FE0A 5A5RA 4ALHA 4HXMA 4UIYA 2OO1A 4YYKA 5LKZA 4O75A 4YYJA 2D9EA 3O33A 2L85A 5E9VA 2LSPB 5I7XA 4MR4A 4UIXA 5IBNA 5HRWA 5HFRA 4QSPA 5F36A 5EWWA 4TZ8A 3MQMA 4UIZA 4TYLA 5FG4A 5A81A 4N4GA 5I40A 3MUKA 4MR6A 3JVKA 4YH4A 4HXPA 5LKTA 4QSQA 3Q2EA 5FE4A 2YEKA 3AQAA 4QSXA 5E3GA 4XUAA 4NQMA 4TS8A 4UYGA 5G4SA 2RFJA 2RS9B 4UYDA 5C8GA 4NUDA 5FBXA 2F6NA 5TB6A 5FH6A 3MULA 3QZVA 3QZTA 5I89A 4HBWA 5HENA 4LC2A 3LQJA 2GRCA 4NR5A 5HRVA 4ALGA 5DFCA 3HMEA 5E9YA 3G0LA 4BW1A 5CQAA 5TCMA 5F1HA 5ENJA 5E74A 5L8TA 5D3JA 3UVXA 4TT6A 5F25A 4X2IA 5EVAA 4GPJA 4YBTA 5AD2A 2DWWA 2MJVB 4N4HA 4TQNA 4TZ2A 3U5NA 5A83A 4N3WA 3QZSA 4A9KA 2DVRA 4O70A 5AMEA 5EV9A 4YYGA 2DVSA 5EA1A 4O7AA 5DKDA 1E6IA 5CQ3A 2RNXA 5E0RA 4PY6A 4MR5A 5CY9A 4UYEA 2YYNA 4A9NA 4Z6IA 4NS5A 4BJXA 3UVWA 4UITA 5IGLA 4OGIA 4O71A 5KO4A 5EWDA 5FE1A 5I1QA 3U5PA 5LKUA 2RI7A 3MB3A 3MB4A 4DONA 4LDFA 5ACYA 5CQTA 3U5OA 4NRAA 4Z1QA 5IGNA 4Q0OA 2R0YA 4QR5A 5ENHA 5ENBA 4TT4A 2R0VA 5EICA 4O78A 5C85A 5F60A 5HEMA 3IU6A 4TU6A 5EK9A 5EWHA 5H1TA 5EPBA 4NR4A 5FH8A 4CUSA 5EU1A 4O74A 5FB1A 5I29A 2E3KA 5I86A 2WP2A 2RNWA 4YABA 5FFWA 5J0DA 5CUBA 2NXBA 5ENFA 4PCIA 4KCXA 4NYXA 5D3SA 4TT2A 4YK0A 5CUCA 2H60A 4N4IA 2DKWA 5EQ1A 5BT5A 4J0RA 4CUQA 2L5EA 2KTBB 5L97A 5CQ7A 2F6JA 4LYIA 3P1DA 5CUDA 5H1VA 3Q2FA 4YATA 4Z1SA 2YDWA 3AADA 4YYHA 4IORA 5F62A 5IGKA 4IR4A 5BT4A 3U5JA 5E73A 4IR3A 5C89A 4QR3A 2OSSA 4QB3A 5E9MA 4LYWA 5F2PA 5II1A 4KV4A 2E7NA 4QSUA 4O7BA 4YC9A 5G4RA 1JM4B 5F1LA 4ZC9A 4YYNA 4UIVA 4QEUA 4HXSA 2YEMA 4A9HA 4C67A 5IG6A 5JWMA 5D3NA 4QSRA 1F68A 4WHUA 2R10A 5L96A 4LZ2A 4O77A 2N9GA 5HLSA 5D25A 5KHMA 5HQ5A 1WUGA 5HRXA 5FE6A 5A82A 4NUEA 4IOQA 3O36A 5AMFA 4A9JA 5DYXA 3JVLA 4ZW1A 3ONIA 5EPRA 3SVHA 4MEPA 5HFQA 2I8NA 4PKLA 3RCWA 3UVYA 4TTEA 2DVQA 5BT3A 4HBYA 5KTXA 5LUUA 3D7CA 5I7YA 4HXNA 5HJCA 5CTLA 4CUUA 4NXJA 5DW1A 4QEWA 4HXKA 4QSWA 4CURA 5HCLA 5LJ1A 5DX4A 2E7OA 5CQ5A 5DYCA 4NYVA 3U5MA 3P1EA 4QSSA 3LQIA 5D3RA 5CRMA 5D3TA 5FDZA 4CUPA 5D0CA 4CFLA 4TU4A 5D26A 5H85A 4J3IA 4XYAA 4Z93A 5FG5A 4IR5A 5E3DA 4NR7A 5L99A 5ETBA 3DWYA 5EGUA 2YQDA 4OUFA 5CQ6A 5D24A 5LJ0A 3P5OA 4BW2A 4XUBA 4J1PA 5DLZA 5D7XA 5HQ6A 5D3PA 5DYAA 2RO1A 3P1CA 3G0JA 4J0SA 4Y03A 5DFDA 2FSAA 5E7DA 2OUOA 5F3AA 4IOOA 3IU5A 4PTBA 4QUTA 4RVRA 3SVFA 4XY8A 4HXOA 4MR3A 3P1FA 2L84A 4QC1A 5LVQA 3FKMX 3O37A 5JI8A 5DYUA 4UYFB 3U5LA 4F3IA 4A9IA 4YYMA 5A85A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1X0JA 5CU8A 4LYSA 3JVMA 4OGJA 4AKNA 5FE8A 5L8UA 5CQ8A 5CPEA 4YAXA 4FLPA 5E9KA 5L98A 5FE3A 4YY6A 4HXRA 4O7EA 5CRZA 3ZYUA 5HM0A 4PCEA 4QBMA 5AD3A 5CGPA 2RNYA 3UV2A 5HELA 5CUGA 5LKXA 5FE2A 5LVRA 3UV5A 4QC3A 3HMFA 4LRGA 3SVGA 1JSPB 4UIUA 5FFYA 4A9LA 5DKCA 4O72A 5C4QA 4IR6A 5FB0A 4Q0NA 4WHWA 4YBSA 4NRCA 4C66A 2YELA 4MEOA 1N72A 4QSVA 4QR4A 4QYLA 3JVJA 5DKHA 4NRBA 5KTWA 3VKHA 5FE9A 4Z6HA 4HBXA 3HMHA 4A9EA 5H1UA 3LQHA 4BW3A 5KTUA 4NUCA 5I88A 5DBMA 5CFWA 4HXLA 1WUMA 4YYIA 5EPSA 4CUTA 5FG6A 3NXBA 2EJNA 3O34A 5IIDA 5ENIA 5HQ7A 4YH3A 5K29A 4UYHA 2D82A 4YYDA 2WP1A 4ZQLA 5DLXA 5CQ4A 4BW4A 2R0SA 3UVDA 2DVVA 5DY7A 5EWCA 2G4AA 3TLPA 4QNSA 5E9LA 4NR9A 5F61A 5A5NA 4E96A 4CLBA 5KU3A 5CUAA 4UYFA 5ENCA 5DW2A 5F5ZA 5FE5A 3LJWA 4NR8A 3O35A 4NR6A 5EISA 5ENGA 3S91A 2I7KA 4MEQA 4O7CA 4YADA 5EP7A 5II2A 3LXJA 5A5PA 5D3HA 5FFVA 5I80A 3GG3A 3UV4A 4YBMA 1ZS5A 3U5KA 4QYDA 4A9OA 5FE7A 5D3LA 4O76A 4A9FA 5A5OA 4XY9A 4QSTA 5CZGA 5C7NA 4WIVA 5F63A 4O7FA 5CP5A 5EM3A 4QZSA 4LR6A 5E9IA 5I83A 3MXFA 4N4FA 4UIWA 5A5QA 4LZSA 4CFKA 4A9MA 4QEVA 5A5SA 4YY4A 5LJ2A 5ETDA 4QY4A 5DFBA 4HBVA 4NYWA 5FH7A 5C87A 5CUEA 3I3JA 5EWVA 3S92A 2YW5A 4KV1A 1EQFA 3UW9A 5IGMA 4NQNA 4QUUA 5ENEA 4LZRA 4PS5A 5EI4A 4CL9A 5COIA 5A7CA 3DAIA 4MENA 2DATA 4BHWA 3K2JA 5CS8A 5FE0A 5A5RA 4ALHA 4HXMA 4UIYA 2OO1A 4YYKA 5LKZA 4O75A 4YYJA 2D9EA 3O33A 2L85A 5E9VA 2LSPB 5I7XA 4MR4A 4UIXA 5IBNA 5HRWA 5HFRA 4QSPA 5F36A 5EWWA 4TZ8A 3MQMA 4UIZA 4TYLA 5FG4A 3ERRA 5A81A 4N4GA 5I40A 3MUKA 4MR6A 3JVKA 4YH4A 4HXPA 5LKTA 4QSQA 3Q2EA 5FE4A 2YEKA 3AQAA 4QSXA 5E3GA 4XUAA 4NQMA 4TS8A 4UYGA 5G4SA 2RFJA 2RS9B 4UYDA 5C8GA 4NUDA 5FBXA 2F6NA 5TB6A 5FH6A 3MULA 1PUOA 3QZVA 3QZTA 5I89A 4HBWA 5HENA 4LC2A 3LQJA 2GRCA 4NR5A 5HRVA 4ALGA 5DFCA 3HMEA 5E9YA 3G0LA 4BW1A 5CQAA 5TCMA 5F1HA 5ENJA 5E74A 5L8TA 5D3JA 3UVXA 4TT6A 5F25A 4X2IA 5EVAA 4GPJA 4YBTA 5AD2A 2DWWA 2MJVB 4N4HA 4TQNA 4TZ2A 3U5NA 5A83A 4N3WA 3QZSA 4A9KA 2DVRA 4O70A 5AMEA 5EV9A 4YYGA 2DVSA 5EA1A 4O7AA 5DKDA 1E6IA 5CQ3A 2RNXA 5E0RA 4PY6A 4MR5A 5CY9A 4UYEA 2YYNA 4AKHA 4A9NA 4AI6A 4Z6IA 4NS5A 4BJXA 3UVWA 4UITA 5IGLA 4OGIA 4O71A 5KO4A 5EWDA 5FE1A 5I1QA 3U5PA 5LKUA 2RI7A 3MB3A 3MB4A 4DONA 4LDFA 5ACYA 5CQTA 3U5OA 4NRAA 4Z1QA 5IGNA 4Q0OA 2R0YA 4QR5A 5ENHA 5ENBA 4TT4A 2R0VA 5EICA 4O78A 5C85A 5F60A 5HEMA 3IU6A 4TU6A 5EK9A 5EWHA 5H1TA 5EPBA 4NR4A 5FH8A 4CUSA 5EU1A 4O74A 5FB1A 5I29A 2E3KA 5I86A 2WP2A 2RNWA 4YABA 5FFWA 5J0DA 5CUBA 2NXBA 5ENFA 4PCIA 4KCXA 4NYXA 5D3SA 4TT2A 4YK0A 5CUCA 2H60A 4N4IA 2DKWA 5EQ1A 5BT5A 4J0RA 4CUQA 2L5EA 2KTBB 5L97A 5CQ7A 2F6JA 4LYIA 3P1DA 5CUDA 5H1VA 3Q2FA 4YATA 4Z1SA 2YDWA 3AADA 4YYHA 4IORA 5F62A 5IGKA 4AKIA 4IR4A 5BT4A 3U5JA 5E73A 4IR3A 5C89A 4QR3A 2OSSA 4QB3A 5E9MA 4LYWA 5F2PA 5II1A 4KV4A 2E7NA 4QSUA 4O7BA 4YC9A 5G4RA 1JM4B 5F1LA 4ZC9A 4YYNA 3VKGA 4UIVA 4QEUA 4HXSA 2YEMA 4A9HA 4C67A 5IG6A 5JWMA 5D3NA 4QSRA 1F68A 4WHUA 2R10A 5L96A 4LZ2A 4O77A 2N9GA 5HLSA 5D25A 5KHMA 5HQ5A 1WUGA 5HRXA 5FE6A 5A82A 4NUEA 4IOQA 3O36A 5AMFA 4A9JA 5DYXA 3JVLA 4ZW1A 3ONIA 5EPRA 3SVHA 4MEPA 5HFQA 2I8NA 4PKLA 3RCWA 3UVYA 4TTEA 2DVQA 5BT3A 4HBYA 5KTXA 5LUUA 3D7CA 5I7YA 4HXNA 5HJCA 5CTLA 4CUUA 4NXJA 5DW1A 4QEWA 4AKGA 4HXKA 4QSWA 4CURA 5HCLA 5LJ1A 5DX4A 2E7OA 5CQ5A 5DYCA 4NYVA 3U5MA 3P1EA 4QSSA 3LQIA 5D3RA 5CRMA 5D3TA 5FDZA 4CUPA 5D0CA 4CFLA 4TU4A 5D26A 5H85A 4J3IA 4XYAA 4Z93A 5FG5A 4IR5A 5E3DA 4NR7A 5L99A 5ETBA 3DWYA 5EGUA 2YQDA 4OUFA 5CQ6A 5D24A 5LJ0A 3P5OA 4BW2A 4XUBA 4J1PA 5DLZA 5D7XA 5HQ6A 5D3PA 5DYAA 2RO1A 3P1CA 3G0JA 4J0SA 3D1DA 4Y03A 5DFDA 2FSAA 5E7DA 2OUOA 5F3AA 4IOOA 3IU5A 4PTBA 1ZKRA 4QUTA 4RVRA 3SVFA 4XY8A 4HXOA 4MR3A 3P1FA 2L84A 4QC1A 5LVQA 3FKMX 3O37A 5JI8A 5DYUA 4UYFB 3U5LA 3D1BA 4F3IA 4A9IA 4YYMA 5A85A
chains in the Genus database with same CATH topology
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