1EQFA

Crystal structure of the double bromodomain module from human tafii250
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
GTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR
publication title Structure and function of a human TAFII250 double bromodomain module.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 97
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2000-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA01
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA02
4CURA 5CUBA 3I3JA 5L99A 3P1EA 4A9OA 2GRCA 5CS8A 5DW2A 4QSRA 5E3DA 4O72A 4XY8A 5A5PA 4UIYA 4TT4A 5A5SA 4CUTA 2DWWA 5HQ6A 4YK0A 5FFWA 4YABA 5FE0A 5D7XA 5HELA 3SVGA 5HJCA 1JM4B 5A83A 4NR6A 5LVRA 5C7NA 4C66A 4PTBA 4TU6A 5J0DA 4PCEA 5IBNA 4NUEA 5CQ6A 5FB1A 3GG3A 4O7AA 4YYMA 3SVHA 4O7CA 5I7YA 3U5KA 5C89A 5L8TA 5D3RA 4UIZA 5CQAA 4O7BA 5K29A 4QSVA 2YYNA 5I1QA 4NYVA 2DVVA 4QSQA 4QSXA 5FE2A 3HMFA 5KU3A 4HBXA 4LC2A 4YC9A 4MEQA 5BT5A 4NYXA 5D3LA 3U5LA 4ZC9A 5EWVA 5E9IA 5D3NA 5AD2A 3IU5A 4NR9A 4RVRA 4GPJA 5DYXA 4J0SA 4TYLA 3UVDA 4ALGA 4PKLA 4PY6A 4HXPA 5CZGA 5I80A 4O71A 2NXBA 3JVLA 4CLBA 3S91A 2R0VA 4AKNA 3U5MA 4HXNA 4UYGA 5F25A 2I8NA 5CQ5A 4MEOA 5CQ7A 4J0RA 4A9LA 5C8GA 2MJVB 5IIDA 1F68A 5EWCA 4CL9A 5AMFA 3MB3A 4UIXA 5CUCA 5L98A 2DKWA 5DBMA 5HFQA 4Z6IA 5CUDA 5I40A 4HBWA 5JI8A 3U5OA 4XY9A 5F36A 5CRZA 4E96A 4XUAA 4A9JA 2RFJA 3MB4A 3P1CA 2DVQA 4Y03A 4O76A 4Z1QA 5F63A 5A5OA 5HEMA 5L8UA 5E9MA 4LDFA 5A5QA 5DKHA 3HMEA 4NYWA 3RCWA 4J3IA 5HRXA 1X0JA 3K2JA 5LKTA 3G0LA 3TLPA 2H60A 3JVMA 4MR3A 5FE5A 3ONIA 5D25A 4UYEA 5CUGA 5E74A 4YYIA 4IOQA 5TCMA 4A9HA 4ZW1A 5EU1A 5F60A 5FE1A 5EGUA 3NXBA 4YH4A 4MEPA 4QY4A 4QSPA 3MULA 4TZ8A 5E0RA 3UVXA 4UIVA 4A9NA 5H1UA 4UYHA 4NR4A 4TZ2A 5D26A 4Q0OA 5DKDA 5HFRA 5EICA 5DFDA 5F1LA 4YBTA 5CUAA 4TU4A 4HBYA 4BHWA 5FE9A 5HQ5A 4QNSA 5DX4A 4IORA 5FDZA 4LR6A 5DY7A 5ETDA 5F62A 4QC1A 5EA1A 2YQDA 5FH6A 5D24A 5IG6A 4ZQLA 5D3PA 5I83A 4O70A 4HXOA 4O77A 5A5NA 5E73A 5CPEA 5CP5A 5IGLA 5D3HA 4MR6A 4Z6HA 5LKZA 5H1VA 5EP7A 4YY6A 4XUBA 5LVQA 5F3AA 5HM0A 5D3SA 5H1TA 5F61A 4YYNA 4UIUA 5FE4A 4QR4A 5ENJA 4IR4A 5EISA 4QSWA 1JSPB 4NRBA 3QZSA 2R0YA 5IGMA 4YADA 4N4HA 3HMHA 4OGIA 4LZRA 4KV1A 3QZVA 2R0SA 5HRWA 4QSUA 4YH3A 4QBMA 4UYFB 5ENEA 5C85A 2YDWA 2L5EA 3JVJA 5I86A 4HXMA 3UVYA 5IGNA 4A9KA 2RNXA 4LRGA 5HENA 5CY9A 5AD3A 5EM3A 4YYDA 2OO1A 4C67A 4NR7A 5LKXA 5L97A 3U5PA 4O78A 4QSTA 5CUEA 4YBMA 2D9EA 4UIWA 5EPRA 4CUPA 5FH7A 3UV2A 2YEKA 4TQNA 5ENFA 3UVWA 1EQFA 4NUDA 4NXJA 5EWHA 2RS9B 4UITA 3DWYA 4QEWA 4CUSA 5DKCA 5F5ZA 5ACYA 5ETBA 1WUGA 3DAIA 3LQJA 4OGJA 4QYDA 5II2A 3U5NA 4PS5A 3UV4A 5I88A 4QZSA 4YYJA 5EVAA 2WP2A 4TS8A 3MQMA 5CQ4A 4HXKA 5D0CA 4BW3A 3AADA 3LJWA 5BT4A 5F1HA 5ENIA 4N3WA 4QYLA 4NRCA 5DLZA 4UYFA 5D3TA 3FKMX 5IGKA 5C4QA 5A81A 4LZ2A 2E3KA 1E6IA 4J1PA 4QSSA 4TT6A 4BJXA 5CQ8A 4O75A 2F6NA 5EI4A 3P1DA 2L85A 3D7CA 5DYAA 4HBVA 5BT3A 5FE3A 1ZS5A 4YYKA 4HXSA 4A9EA 2LSPB 5A82A 5DFBA 5LJ2A 5AMEA 4NR8A 4BW2A 4XYAA 5E9LA 4LYIA 4N4FA 5DYUA 5TB6A 2FSAA 5FB0A 5COIA 4NUCA 5FH8A 4NQNA 5DW1A 2YEMA 5FG4A 4NR5A 4N4GA 4IR3A 5EV9A 4FLPA 3IU6A 4QUUA 4KV4A 5KHMA 2E7OA 5ENCA 5E3GA 4LYSA 5D3JA 5LKUA 4YYGA 3O34A 3MUKA 5KTUA 5DLXA 5HRVA 3LXJA 3Q2EA 2RI7A 5F2PA 2G4AA 3G0JA 4Q0NA 5DYCA 2E7NA 5A5RA 2D82A 4QEUA 2RNWA 1N72A 5EWWA 5C87A 4YATA 5EPSA 4A9IA 3UV5A 5FFYA 4YY4A 4IOOA 5CQTA 4HXRA 5HLSA 4O74A 5EWDA 5EQ1A 5CU8A 3SVFA 5CFWA 5G4RA 4A9FA 5E9VA 4OUFA 2RO1A 4QUTA 5E9YA 5JWMA 2OUOA 3P1FA 5FE8A 4MENA 4ALHA 4QB3A 5A7CA 4Z1SA 2KTBB 4LYWA 4NQMA 5EPBA 5KTXA 3Q2FA 4CFLA 5EK9A 2YELA 5HQ7A 4MR4A 5HCLA 5FG6A 3O36A 1WUMA 2OSSA 3O35A 5A85A 4KCXA 2DVSA 5FG5A 3MXFA 5FE7A 5FE6A 3P5OA 5CQ3A 5LJ0A 5G4SA 5CTLA 5E9KA 5H85A 5L96A 5I29A 4BW1A 4CUUA 4YYHA 4NS5A 4O7FA 2RNYA 3O33A 4F3IA 4CUQA 3LQHA 4BW4A 5LUUA 2F6JA 5I89A 2L84A 5DFCA 4X2IA 5ENBA 4YAXA 2R10A 4LZSA 5LJ1A 4QEVA 3ZYUA 3LQIA 5I7XA 4NRAA 4QR3A 4QC3A 5KO4A 3JVKA 4N4IA 4UYDA 3UW9A 2DVRA 4WIVA 3QZTA 4TTEA 4WHWA 3U5JA 3AQAA 4O7EA 5CRMA 2WP1A 4HXLA 5FFVA 4CFKA 3S92A 4DONA 5E7DA 2I7KA 4QR5A 3O37A 4IR5A 4MR5A 4PCIA 4TT2A 5II1A 4IR6A 2YW5A 2N9GA 5ENHA 2DATA 5ENGA 4Z93A 5KTWA 4YBSA 4WHUA 5FBXA 4A9MA 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CURA 5CUBA 3D1BA 3I3JA 5L99A 3P1EA 4A9OA 2GRCA 5CS8A 5DW2A 4QSRA 5E3DA 4O72A 4XY8A 5A5PA 4UIYA 4TT4A 5A5SA 4CUTA 2DWWA 5HQ6A 4YK0A 5FFWA 4YABA 5FE0A 5D7XA 5HELA 3SVGA 5HJCA 1JM4B 5A83A 4NR6A 5LVRA 5C7NA 4C66A 4PTBA 4TU6A 5J0DA 4PCEA 5IBNA 4NUEA 5CQ6A 5FB1A 3GG3A 4O7AA 4YYMA 3SVHA 4O7CA 5I7YA 3U5KA 5C89A 5L8TA 5D3RA 4UIZA 5CQAA 4O7BA 5K29A 4QSVA 2YYNA 5I1QA 4NYVA 2DVVA 4QSQA 4QSXA 5FE2A 3HMFA 5KU3A 4HBXA 4LC2A 4YC9A 4MEQA 5BT5A 4NYXA 5D3LA 3U5LA 4ZC9A 5EWVA 5E9IA 5D3NA 5AD2A 3IU5A 4NR9A 4RVRA 4GPJA 5DYXA 4J0SA 4TYLA 3UVDA 4ALGA 4PKLA 4PY6A 4HXPA 5CZGA 5I80A 4O71A 2NXBA 3JVLA 4CLBA 3S91A 2R0VA 4AKNA 3U5MA 4HXNA 4UYGA 5F25A 2I8NA 5CQ5A 4MEOA 5CQ7A 3ERRA 4J0RA 4A9LA 5C8GA 2MJVB 5IIDA 1F68A 5EWCA 4CL9A 5AMFA 3MB3A 4UIXA 5CUCA 5L98A 2DKWA 5DBMA 5HFQA 4Z6IA 5CUDA 5I40A 4HBWA 5JI8A 3U5OA 4XY9A 5F36A 5CRZA 4E96A 4XUAA 4A9JA 2RFJA 3MB4A 3P1CA 2DVQA 4Y03A 4O76A 4Z1QA 5F63A 5A5OA 5HEMA 5L8UA 5E9MA 4LDFA 5A5QA 5DKHA 3HMEA 4NYWA 3RCWA 4J3IA 5HRXA 1X0JA 3K2JA 5LKTA 3G0LA 3TLPA 2H60A 3JVMA 3D1DA 4MR3A 5FE5A 3ONIA 5D25A 4UYEA 5CUGA 5E74A 4YYIA 4IOQA 5TCMA 4A9HA 4ZW1A 5EU1A 5F60A 5FE1A 5EGUA 3NXBA 4YH4A 4MEPA 4QY4A 4QSPA 3MULA 4TZ8A 5E0RA 3UVXA 4UIVA 4A9NA 5H1UA 4UYHA 4NR4A 4TZ2A 5D26A 4Q0OA 5DKDA 5HFRA 2EJNA 5EICA 5DFDA 5F1LA 4YBTA 5CUAA 4TU4A 4HBYA 4BHWA 5FE9A 5HQ5A 4QNSA 5DX4A 4IORA 5FDZA 4LR6A 5DY7A 5ETDA 5F62A 4QC1A 5EA1A 2YQDA 5FH6A 5D24A 5IG6A 4ZQLA 5D3PA 5I83A 4O70A 4HXOA 4AI6A 4O77A 5A5NA 5E73A 5CPEA 5CP5A 5IGLA 5D3HA 4MR6A 4Z6HA 5LKZA 5H1VA 5EP7A 4YY6A 4XUBA 5LVQA 5F3AA 5HM0A 5D3SA 5H1TA 5F61A 4YYNA 4UIUA 5FE4A 4QR4A 5ENJA 4IR4A 5EISA 4QSWA 1JSPB 4NRBA 3QZSA 2R0YA 5IGMA 4YADA 4N4HA 3HMHA 4AKIA 4OGIA 4LZRA 4KV1A 3QZVA 2R0SA 5HRWA 4QSUA 4YH3A 4QBMA 4UYFB 5ENEA 5C85A 2YDWA 2L5EA 3JVJA 5I86A 4HXMA 3UVYA 5IGNA 4A9KA 2RNXA 4LRGA 5HENA 5CY9A 5AD3A 5EM3A 4YYDA 2OO1A 4C67A 4NR7A 5LKXA 5L97A 3U5PA 4O78A 4QSTA 5CUEA 4YBMA 2D9EA 4UIWA 5EPRA 4CUPA 5FH7A 3UV2A 2YEKA 4TQNA 5ENFA 3UVWA 1EQFA 4NUDA 4NXJA 5EWHA 2RS9B 4UITA 1ZKRA 3DWYA 4QEWA 4CUSA 5DKCA 5F5ZA 5ACYA 5ETBA 1WUGA 3DAIA 3LQJA 4OGJA 4QYDA 5II2A 3U5NA 4PS5A 3UV4A 5I88A 4QZSA 4YYJA 5EVAA 2WP2A 4TS8A 3MQMA 1PUOA 5CQ4A 4HXKA 5D0CA 4BW3A 3AADA 3LJWA 5BT4A 5F1HA 5ENIA 4N3WA 4QYLA 4NRCA 5DLZA 4UYFA 5D3TA 3FKMX 5IGKA 5C4QA 5A81A 4LZ2A 2E3KA 1E6IA 4J1PA 4QSSA 4TT6A 4BJXA 5CQ8A 4O75A 2F6NA 5EI4A 3P1DA 2L85A 3D7CA 5DYAA 4HBVA 5BT3A 5FE3A 1ZS5A 4YYKA 4HXSA 4A9EA 2LSPB 5A82A 5DFBA 5LJ2A 5AMEA 4NR8A 4BW2A 4XYAA 5E9LA 4LYIA 4N4FA 5DYUA 5TB6A 2FSAA 5FB0A 5COIA 4NUCA 5FH8A 4NQNA 5DW1A 2YEMA 5FG4A 4NR5A 4N4GA 4IR3A 5EV9A 4AKGA 4FLPA 3IU6A 4QUUA 4KV4A 5KHMA 2E7OA 5ENCA 5E3GA 4LYSA 5D3JA 5LKUA 4YYGA 3O34A 3MUKA 5KTUA 5DLXA 3VKGA 5HRVA 3LXJA 3Q2EA 2RI7A 5F2PA 2G4AA 3G0JA 4Q0NA 5DYCA 2E7NA 5A5RA 2D82A 4QEUA 2RNWA 1N72A 5EWWA 5C87A 4YATA 5EPSA 4A9IA 3UV5A 5FFYA 4YY4A 4IOOA 5CQTA 4HXRA 5HLSA 4O74A 5EWDA 5EQ1A 5CU8A 3SVFA 5CFWA 5G4RA 4A9FA 5E9VA 4OUFA 2RO1A 4QUTA 5E9YA 5JWMA 2OUOA 3P1FA 5FE8A 4MENA 4ALHA 4QB3A 5A7CA 4Z1SA 2KTBB 4LYWA 4NQMA 5EPBA 5KTXA 3Q2FA 4CFLA 3VKHA 5EK9A 2YELA 5HQ7A 4MR4A 5HCLA 5FG6A 3O36A 1WUMA 2OSSA 3O35A 4AKHA 5A85A 4KCXA 2DVSA 5FG5A 3MXFA 5FE7A 5FE6A 3P5OA 5CQ3A 5LJ0A 5G4SA 5CTLA 5E9KA 5H85A 5L96A 5I29A 4BW1A 4CUUA 4YYHA 4NS5A 4O7FA 2RNYA 3O33A 4F3IA 4CUQA 3LQHA 4BW4A 5LUUA 2F6JA 5I89A 2L84A 5DFCA 4X2IA 5ENBA 4YAXA 2R10A 4LZSA 5LJ1A 4QEVA 3ZYUA 3LQIA 5I7XA 4NRAA 4QR3A 4QC3A 5KO4A 3JVKA 4N4IA 4UYDA 3UW9A 2DVRA 4WIVA 3QZTA 4TTEA 4WHWA 3U5JA 3AQAA 4O7EA 5CRMA 2WP1A 4HXLA 5FFVA 4CFKA 3S92A 4DONA 5E7DA 2I7KA 4QR5A 3O37A 4IR5A 4MR5A 4PCIA 4TT2A 5II1A 4IR6A 2YW5A 2N9GA 5ENHA 2DATA 5ENGA 4Z93A 5KTWA 4YBSA 4WHUA 5FBXA 4A9MA 5CGPA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CUR A;  5CUB A;  3I3J A;  5L99 A;  3P1E A;  4A9O A;  2GRC A;  5CS8 A;  5DW2 A;  4QSR A;  5E3D A;  4O72 A;  4XY8 A;  5A5P A;  4UIY A;  4TT4 A;  5A5S A;  4CUT A;  2DWW A;  5HQ6 A;  4YK0 A;  5FFW A;  4YAB A;  5FE0 A;  5D7X A;  5HEL A;  3SVG A;  5HJC A;  1JM4 B;  5A83 A;  4NR6 A;  5LVR A;  5C7N A;  4C66 A;  4PTB A;  4TU6 A;  5J0D A;  4PCE A;  5IBN A;  4NUE A;  5CQ6 A;  5FB1 A;  3GG3 A;  4O7A A;  4YYM A;  3SVH A;  4O7C A;  5I7Y A;  3U5K A;  5C89 A;  5L8T A;  5D3R A;  4UIZ A;  5CQA A;  4O7B A;  5K29 A;  4QSV A;  2YYN A;  5I1Q A;  4NYV A;  2DVV A;  4QSQ A;  4QSX A;  5FE2 A;  3HMF A;  5KU3 A;  4HBX A;  4LC2 A;  4YC9 A;  4MEQ A;  5BT5 A;  4NYX A;  5D3L A;  3U5L A;  4ZC9 A;  5EWV A;  5E9I A;  5D3N A;  5AD2 A;  3IU5 A;  4NR9 A;  4RVR A;  4GPJ A;  5DYX A;  4J0S A;  4TYL A;  3UVD A;  4ALG A;  4PKL A;  4PY6 A;  4HXP A;  5CZG A;  5I80 A;  4O71 A;  2NXB A;  3JVL A;  4CLB A;  3S91 A;  2R0V A;  4AKN A;  3U5M A;  4HXN A;  4UYG A;  5F25 A;  2I8N A;  5CQ5 A;  4MEO A;  5CQ7 A;  4J0R A;  4A9L A;  5C8G A;  2MJV B; 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