4IR4A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-[7-(morpholin-4-yl)-1-(pyridin-2-yl)indolizin-3-yl]ethanone (gsk2834113a)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir4A00
2D9EA 2R0YA 4TU6A 5D26A 5DY7A 4CUSA 4N4IA 4YH3A 4NYXA 5HQ5A 3TLPA 5FG6A 2YEKA 4A9EA 3MUKA 5L98A 5ENEA 4NR8A 5DW1A 4LZRA 4ZQLA 3O36A 4Z1SA 4HXKA 4CUUA 5FE7A 3UVWA 4GPJA 5IBNA 2E7NA 2OO1A 5CUAA 3RCWA 5A5NA 2YELA 4RVRA 5KO4A 5A83A 4O74A 4QYDA 4J0SA 5I40A 5DLZA 3O34A 3DWYA 4BW4A 3GG3A 5CP5A 4TTEA 2DVSA 5G4SA 4UIWA 3HMFA 2R0SA 2RFJA 5A5OA 2MJVB 3IU5A 4CLBA 5FH6A 4NUDA 2G4AA 5FB1A 4NUCA 4NQNA 4MENA 4NYVA 3U5PA 4F3IA 3IU6A 5CUCA 2OUOA 5COIA 3G0LA 5A5RA 3ZYUA 4N4GA 5E9VA 5ETDA 5F62A 5DKHA 4MEOA 5EV9A 2DVRA 2YEMA 4J3IA 4YC9A 3U5MA 3AQAA 4KV1A 4A9IA 5HM0A 5F60A 2RNWA 5KHMA 4QEVA 2L84A 4QSUA 5IGNA 1JSPB 5DW2A 4UIVA 3U5OA 5AMEA 4LZSA 5F3AA 5FBXA 4YK0A 5ENJA 4ZW1A 4WIVA 5DFCA 5II2A 4YAXA 5DX4A 4LC2A 4O72A 4YYNA 4QSRA 5I83A 5CQ4A 4AKNA 5FG5A 5D25A 3Q2EA 5D3PA 3U5LA 5BT3A 3DAIA 5EVAA 4LYSA 3MB4A 3QZSA 5CS8A 5HQ6A 4A9MA 5TB6A 2H60A 4UYHA 4YYGA 4YABA 2D82A 4HXNA 5EWDA 3QZTA 4QR3A 5EWCA 5HENA 4HBWA 4IR3A 4TT2A 4QEUA 2DVVA 5EWWA 5F1HA 3MXFA 4NRAA 3U5KA 2RI7A 5E3DA 5HLSA 4YYDA 4UYFB 5KTUA 5DBMA 4YYHA 5FFYA 3O37A 4HBVA 5DFDA 4TYLA 2RNYA 3JVKA 5F36A 5A5PA 4OGJA 5JWMA 5EPBA 5FH7A 4YBSA 5G4RA 4PS5A 4YBMA 2E3KA 4PKLA 5E9IA 4NRBA 4ALGA 5LVRA 4OUFA 5I80A 5DLXA 5CTLA 4UIXA 3LJWA 5F61A 5TCMA 5H85A 2I7KA 4J0RA 3O35A 4CUQA 5EP7A 2R10A 5E74A 3ONIA 5CUGA 5ACYA 4TT4A 4NUEA 5D3RA 4LYIA 4O7AA 1WUGA 2I8NA 4QEWA 5CQ3A 4Y03A 4MR4A 2DVQA 4QSWA 5CU8A 5J0DA 5FE4A 4YYJA 4Z6HA 4NR7A 4QUTA 3Q2FA 5A81A 5IG6A 4Z1QA 5DFBA 4A9KA 4PCEA 2YQDA 5F1LA 4BW3A 4Z6IA 2YW5A 4Q0OA 4QUUA 5D0CA 3AADA 4MR6A 4NR5A 5LKZA 5HQ7A 5CQ7A 5EGUA 4UIYA 5CQ5A 4C67A 3JVJA 5ENBA 5IGMA 4CUPA 4QR4A 4QZSA 4QYLA 4TT6A 4LR6A 4KCXA 5H1TA 3P1EA 4IR6A 3U5JA 3UVXA 4O78A 4YY6A 5HJCA 4YATA 4ALHA 5FE6A 5EQ1A 5EPRA 5CQAA 5CUBA 3P1DA 3S92A 4UYGA 5EISA 4QY4A 5K29A 5A82A 4LZ2A 4LYWA 4TS8A 5HCLA 3FKMX 4O75A 5I29A 4QR5A 4O7FA 4NR4A 4C66A 5DKDA 4Z93A 4HXOA 5ENCA 4UIUA 3HMEA 4HBYA 4A9OA 1X0JA 4BJXA 3I3JA 4QSQA 4A9FA 5EICA 4A9JA 2LSPB 5ETBA 3U5NA 5AMFA 5F25A 1E6IA 5HRXA 5EWHA 5E9KA 4HXPA 5HRWA 2YDWA 4N3WA 4N4HA 5BT4A 5EU1A 5CY9A 4HXSA 5CRZA 5CQTA 2DWWA 4NR9A 1N72A 3NXBA 5C4QA 3JVMA 4HXMA 5I88A 2KTBB 2YYNA 3LQHA 5L99A 5DYAA 4IOQA 2OSSA 4WHWA 5EA1A 4FLPA 5L8UA 4A9LA 5II1A 4X2IA 5C8GA 3MB3A 5ENHA 5D24A 4QSPA 4QB3A 5D3HA 5E73A 4ZC9A 4E96A 5A85A 4TQNA 5CZGA 4XUBA 5HEMA 3SVHA 4QC1A 4QSXA 4O7BA 5C89A 5L8TA 2L85A 5F5ZA 5LKTA 4PCIA 5KTXA 4IR4A 5FDZA 4J1PA 4YBTA 5CUEA 4YY4A 3HMHA 3LQJA 5E9MA 3P5OA 4XYAA 5FE2A 5I1QA 2R0VA 5FB0A 5FFVA 2WP1A 4KV4A 2RNXA 5ENGA 5H1UA 4O7CA 4YYKA 5FE1A 4QSSA 5FG4A 4CUTA 5C85A 5LKXA 5FE9A 5CQ8A 4QSVA 4LRGA 4XY8A 4MEQA 4YYIA 5LVQA 5D3JA 5DKCA 5HFRA 4O70A 2GRCA 4XY9A 3UV2A 3LQIA 4BHWA 4LDFA 4NR6A 3MULA 5DYUA 5EK9A 4NRCA 4IOOA 3O33A 5F63A 5FFWA 5E3GA 3MQMA 5LJ1A 2DKWA 5E7DA 5C7NA 4DONA 5FE8A 4WHUA 5EI4A 4UYEA 4TU4A 4O7EA 1F68A 4OGIA 3P1CA 3D7CA 5I7XA 2FSAA 4CFKA 3UV5A 2DATA 5LJ0A 4MR5A 4QNSA 4A9HA 4CFLA 4O71A 1EQFA 4QBMA 5KU3A 5KTWA 5BT5A 4NYWA 4NQMA 4BW1A 1JM4B 4Q0NA 5AD3A 4O77A 5CQ6A 5H1VA 2RS9B 4CURA 4QC3A 5FE0A 5HELA 5DYXA 5EPSA 5I86A 2F6NA 3G0JA 4XUAA 5A5QA 5LKUA 3UV4A 2NXBA 5CUDA 2N9GA 5IIDA 3UVDA 4UIZA 5C87A 4N4FA 4YH4A 3LXJA 3P1FA 5E9YA 5D3SA 4YADA 5D3TA 5CFWA 4NXJA 3UW9A 4UYDA 3K2JA 3SVGA 5EWVA 5L96A 5JI8A 4TZ2A 4UYFA 5LUUA 5CGPA 2F6JA 5I89A 4PTBA 4CL9A 2E7OA 5CRMA 3JVLA 5CPEA 3S91A 5IGKA 4HXLA 4HBXA 4MR3A 5D3LA 4PY6A 5E0RA 2WP2A 2RO1A 5HRVA 5ENIA 4YYMA 5L97A 5IGLA 5EM3A 5ENFA 5A7CA 4A9NA 4TZ8A 4NS5A 1WUMA 4IORA 5FE5A 4MEPA 5D3NA 1ZS5A 4O76A 3SVFA 4UITA 3UVYA 3QZVA 5DYCA 5A5SA 5D7XA 5HFQA 5FH8A 5AD2A 5FE3A 2L5EA 4QSTA 4IR5A 4HXRA 5F2PA 4BW2A 5I7YA 5E9LA 5LJ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D9EA 2R0YA 4TU6A 5D26A 5DY7A 4CUSA 4N4IA 4YH3A 4NYXA 5HQ5A 3TLPA 5FG6A 2YEKA 4A9EA 3MUKA 5L98A 5ENEA 4NR8A 5DW1A 4LZRA 4ZQLA 3O36A 4Z1SA 4HXKA 4CUUA 5FE7A 3UVWA 4GPJA 5IBNA 2E7NA 2OO1A 5CUAA 3RCWA 5A5NA 2YELA 4RVRA 5KO4A 5A83A 4O74A 4QYDA 4J0SA 5I40A 5DLZA 3O34A 3DWYA 4BW4A 3GG3A 5CP5A 4TTEA 2DVSA 5G4SA 4UIWA 3HMFA 2R0SA 2RFJA 5A5OA 2MJVB 3IU5A 4CLBA 5FH6A 4AKGA 4NUDA 2G4AA 5FB1A 4NUCA 4NQNA 4MENA 4NYVA 3U5PA 4F3IA 3IU6A 5CUCA 2OUOA 5COIA 3G0LA 5A5RA 3ZYUA 4N4GA 5E9VA 5ETDA 5F62A 5DKHA 4MEOA 5EV9A 2DVRA 2YEMA 4J3IA 4YC9A 3U5MA 3AQAA 4KV1A 4A9IA 5HM0A 5F60A 2RNWA 5KHMA 4QEVA 2L84A 4QSUA 5IGNA 1JSPB 5DW2A 4UIVA 3U5OA 5AMEA 4LZSA 5F3AA 5FBXA 4YK0A 5ENJA 4ZW1A 4WIVA 5DFCA 5II2A 4YAXA 5DX4A 4LC2A 4O72A 4YYNA 4QSRA 5I83A 5CQ4A 4AKNA 5FG5A 5D25A 3Q2EA 5D3PA 3U5LA 5BT3A 3DAIA 5EVAA 4LYSA 3MB4A 3QZSA 5CS8A 5HQ6A 4A9MA 5TB6A 2H60A 4UYHA 4YYGA 4YABA 2D82A 4HXNA 5EWDA 3QZTA 4QR3A 5EWCA 5HENA 4HBWA 4IR3A 4TT2A 4QEUA 2DVVA 5EWWA 5F1HA 3MXFA 4NRAA 3U5KA 2RI7A 5E3DA 5HLSA 4YYDA 4UYFB 5KTUA 5DBMA 4YYHA 5FFYA 3O37A 4HBVA 5DFDA 4TYLA 2RNYA 3JVKA 5F36A 5A5PA 4OGJA 5JWMA 3ERRA 5EPBA 5FH7A 4YBSA 5G4RA 4PS5A 4YBMA 2E3KA 4PKLA 5E9IA 4NRBA 4ALGA 5LVRA 4OUFA 5I80A 5DLXA 3VKHA 5CTLA 4UIXA 3LJWA 5F61A 5TCMA 5H85A 2I7KA 4J0RA 3O35A 4CUQA 5EP7A 2R10A 5E74A 3ONIA 5CUGA 5ACYA 4TT4A 4NUEA 5D3RA 4AKHA 4LYIA 4O7AA 1WUGA 2I8NA 4QEWA 5CQ3A 4Y03A 4MR4A 2DVQA 4QSWA 4AI6A 5CU8A 3D1BA 5J0DA 5FE4A 4YYJA 4Z6HA 4NR7A 4QUTA 1ZKRA 3Q2FA 5A81A 5IG6A 4Z1QA 5DFBA 4A9KA 4PCEA 2YQDA 5F1LA 4BW3A 4Z6IA 2YW5A 4Q0OA 4QUUA 5D0CA 3AADA 4MR6A 4NR5A 5LKZA 5HQ7A 5CQ7A 5EGUA 4UIYA 5CQ5A 4C67A 3JVJA 5ENBA 5IGMA 4CUPA 4QR4A 4QZSA 4QYLA 4TT6A 4LR6A 4KCXA 5H1TA 3P1EA 4IR6A 3U5JA 3UVXA 4O78A 4YY6A 5HJCA 4YATA 4ALHA 5FE6A 5EQ1A 5EPRA 5CQAA 5CUBA 3P1DA 3S92A 4UYGA 5EISA 4QY4A 5K29A 5A82A 4LZ2A 4LYWA 4TS8A 5HCLA 3FKMX 4O75A 5I29A 4QR5A 4O7FA 4NR4A 4C66A 5DKDA 4Z93A 4HXOA 5ENCA 4UIUA 3HMEA 4HBYA 4A9OA 1X0JA 4BJXA 3I3JA 4QSQA 4A9FA 5EICA 4A9JA 2LSPB 5ETBA 3U5NA 5AMFA 5F25A 1E6IA 5HRXA 5EWHA 5E9KA 2EJNA 4HXPA 5HRWA 2YDWA 4N3WA 4N4HA 5BT4A 5EU1A 5CY9A 4HXSA 5CRZA 5CQTA 2DWWA 4NR9A 1N72A 1PUOA 3NXBA 5C4QA 3JVMA 4HXMA 5I88A 2KTBB 2YYNA 3LQHA 5L99A 3D1DA 5DYAA 4IOQA 2OSSA 4WHWA 5EA1A 4FLPA 5L8UA 4A9LA 5II1A 4X2IA 5C8GA 3MB3A 5ENHA 5D24A 4QSPA 4QB3A 5D3HA 5E73A 4ZC9A 4E96A 5A85A 4TQNA 5CZGA 4XUBA 5HEMA 3SVHA 4QC1A 4QSXA 4O7BA 5C89A 5L8TA 2L85A 5F5ZA 5LKTA 4PCIA 5KTXA 4IR4A 5FDZA 4J1PA 4YBTA 5CUEA 4YY4A 3HMHA 3LQJA 5E9MA 3P5OA 4XYAA 5FE2A 5I1QA 2R0VA 5FB0A 5FFVA 2WP1A 4KV4A 2RNXA 5ENGA 5H1UA 4O7CA 4YYKA 5FE1A 4QSSA 5FG4A 4CUTA 5C85A 5LKXA 5FE9A 5CQ8A 4QSVA 4LRGA 4XY8A 4MEQA 4YYIA 5LVQA 5D3JA 5DKCA 5HFRA 4O70A 2GRCA 4XY9A 3UV2A 3LQIA 4BHWA 4LDFA 4NR6A 3MULA 5DYUA 5EK9A 4NRCA 4IOOA 3O33A 5F63A 5FFWA 5E3GA 3MQMA 5LJ1A 2DKWA 5E7DA 5C7NA 4DONA 5FE8A 4WHUA 5EI4A 4UYEA 4TU4A 4O7EA 1F68A 4OGIA 3P1CA 3D7CA 5I7XA 2FSAA 4CFKA 3UV5A 2DATA 5LJ0A 4MR5A 4QNSA 4A9HA 4CFLA 4O71A 1EQFA 4QBMA 5KU3A 5KTWA 5BT5A 4NYWA 4NQMA 4BW1A 1JM4B 4Q0NA 5AD3A 4O77A 5CQ6A 5H1VA 2RS9B 4CURA 4QC3A 5FE0A 5HELA 5DYXA 5EPSA 5I86A 2F6NA 3G0JA 4XUAA 5A5QA 5LKUA 3UV4A 2NXBA 5CUDA 2N9GA 5IIDA 3UVDA 4UIZA 5C87A 4N4FA 4YH4A 3LXJA 3P1FA 5E9YA 5D3SA 4YADA 5D3TA 5CFWA 4NXJA 3UW9A 4UYDA 3K2JA 3SVGA 5EWVA 5L96A 5JI8A 4TZ2A 4UYFA 5LUUA 5CGPA 2F6JA 5I89A 4PTBA 4CL9A 2E7OA 5CRMA 3JVLA 5CPEA 3S91A 5IGKA 4HXLA 4HBXA 4MR3A 5D3LA 4PY6A 5E0RA 4AKIA 2WP2A 2RO1A 5HRVA 5ENIA 4YYMA 5L97A 5IGLA 5EM3A 3VKGA 5ENFA 5A7CA 4A9NA 4TZ8A 4NS5A 1WUMA 4IORA 5FE5A 4MEPA 5D3NA 1ZS5A 4O76A 3SVFA 4UITA 3UVYA 3QZVA 5DYCA 5A5SA 5D7XA 5HFQA 5FH8A 5AD2A 5FE3A 2L5EA 4QSTA 4IR5A 4HXRA 5F2PA 4BW2A 5I7YA 5E9LA 5LJ2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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