4TT4A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with h3(1-21)k14ac peptide
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
molecule tags Gene regulation
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tt4A00
4CFLA 4LYIA 4QSRA 4NRAA 4HXNA 4N4IA 5LJ1A 4TU6A 4QSPA 4UIUA 3I3JA 4HXMA 4YH3A 5HCLA 4A9MA 5CP5A 5KTWA 5D0CA 5DYCA 3QZSA 5F1HA 4ALGA 4NRBA 3JVJA 4N4FA 5EPRA 5A5SA 5CRMA 5HFRA 5L97A 4LC2A 2MJVB 4QSVA 5KU3A 5CUEA 2I7KA 3S92A 5FH7A 5COIA 4TZ8A 4Z93A 5TB6A 5G4RA 5DFBA 4YYMA 5C89A 4A9LA 4TU4A 5CTLA 5HQ7A 4CUTA 4RVRA 1WUGA 4WHUA 5G4SA 5HLSA 4PCIA 5I40A 4QSXA 3UVYA 3HMEA 5HRWA 5EWCA 4YK0A 4A9IA 4OUFA 5E0RA 5EISA 4O75A 5CS8A 5KTUA 4NQNA 5DW1A 4QNSA 2RNWA 5DYAA 5DW2A 2RFJA 3LQIA 5DLXA 5DFCA 5FG4A 5DFDA 4XY8A 5KTXA 2F6NA 3P1FA 5AMEA 4KV4A 5FH8A 5F2PA 4MR3A 4UIZA 4XUAA 4HBYA 4Z1QA 5IIDA 4NRCA 5CQ5A 4O74A 5I7YA 5ENHA 2YYNA 5E9YA 4BHWA 5ENIA 4PKLA 4PCEA 4TT4A 4CFKA 4KV1A 5D3JA 4BJXA 4YY6A 4QC1A 2DVRA 5FE2A 4UYFA 5FE9A 3JVLA 3O37A 4O70A 4UYGA 4X2IA 4HBVA 2RI7A 4YABA 4N4HA 5DBMA 3O36A 3O34A 4QC3A 5A5NA 4QSSA 4ZQLA 3P1DA 3U5KA 5LKUA 1EQFA 2YW5A 5H1VA 5I29A 3MULA 5FE1A 5I89A 4KCXA 5L98A 1X0JA 2RNXA 4QSTA 5ENEA 4LZSA 5EK9A 4MR6A 4LDFA 5E74A 5IBNA 3ZYUA 2NXBA 2OUOA 3LQJA 5LJ0A 4NR7A 4O7CA 5KHMA 2OSSA 4ALHA 4BW3A 5LKTA 3MXFA 3UV2A 4ZW1A 5HEMA 3IU6A 5F25A 5FE3A 4OGJA 5F36A 4NYVA 4HXPA 4QUUA 5LVQA 3K2JA 4UYFB 5EV9A 5C87A 4NUDA 3U5NA 4O76A 5A5OA 3P1EA 3MUKA 2DVVA 5ENGA 4YYGA 5C8GA 4J0RA 5H85A 4XY9A 2E3KA 5CQ3A 5DX4A 4QR3A 4J1PA 4F3IA 3P1CA 2GRCA 5ACYA 4TS8A 4CUPA 2RS9B 5CQ4A 4YYDA 4O72A 4WHWA 4C66A 4QYLA 4BW2A 5D3LA 5FE4A 5CFWA 5DYUA 4YBSA 2L5EA 2R0VA 3AADA 4NR9A 5ENBA 2WP2A 2WP1A 5C4QA 4YC9A 5E9VA 5HM0A 4CUQA 5L96A 5F1LA 4MEPA 3UVWA 4WIVA 5HFQA 2R0SA 5E9LA 5HJCA 5D26A 5FG6A 1E6IA 4UYHA 5A5PA 3MQMA 3SVHA 3U5JA 4QZSA 4UIVA 5EICA 5A7CA 5FH6A 4NXJA 5LKXA 4HBWA 5EI4A 4QR4A 2F6JA 2L85A 5D25A 2DWWA 5C85A 4NQMA 5FBXA 5FDZA 3Q2EA 5E3GA 5EPBA 5FFWA 4LR6A 4Q0OA 4CUSA 4O71A 5CQAA 4NUEA 5ENFA 5FFVA 3SVGA 5A82A 3O35A 3LXJA 4PY6A 2YELA 4Q0NA 5A83A 4TYLA 2OO1A 4J3IA 4NYWA 5E9IA 5II1A 4NR6A 2LSPB 4IOQA 4YY4A 5LJ2A 4IORA 4MR4A 2RNYA 5E73A 1WUMA 3S91A 2RO1A 5EWVA 4QYDA 2E7NA 4QEVA 4O78A 5CQ7A 3D7CA 5DLZA 5ETBA 5H1TA 3RCWA 4YATA 5EWHA 4LZRA 5HQ5A 5L8TA 2YEMA 5ENCA 4O7AA 5FE5A 5I83A 4N4GA 5CU8A 4QR5A 5CRZA 5D3HA 4XYAA 4HBXA 4QBMA 4QSUA 5CUAA 4O7FA 4QEWA 1ZS5A 3UV5A 5EWWA 5A85A 4A9OA 4FLPA 4BW4A 2DVQA 5KO4A 5D24A 5I80A 5BT5A 5CPEA 2D9EA 5IG6A 5A5RA 4QSWA 4A9NA 4CLBA 4YH4A 2L84A 5F3AA 5F5ZA 5J0DA 5D7XA 2DATA 3DWYA 3O33A 4Z6HA 4YBMA 5C7NA 5DKDA 4AKNA 4HXOA 5HQ6A 5LVRA 4E96A 3LQHA 4Y03A 2E7OA 2DKWA 5FE7A 5E9KA 4NR4A 3U5OA 4A9JA 4O7EA 4UITA 4BW1A 1JM4B 5I7XA 5D3NA 5BT4A 4CURA 4ZC9A 4YAXA 4TT6A 5I1QA 4TT2A 5DYXA 5HELA 4TTEA 5IGMA 5D3SA 4A9HA 4O77A 4YYJA 3JVKA 4PS5A 5I88A 4HXSA 3DAIA 5H1UA 5CUGA 4UIWA 3LJWA 4J0SA 1F68A 4LRGA 4UIYA 4QB3A 3P5OA 5D3TA 5DKCA 2YQDA 3GG3A 5CZGA 5I86A 5DY7A 5CQ8A 5IGKA 5EGUA 4QSQA 2N9GA 4QY4A 4TQNA 4YBTA 5F61A 3NXBA 5AD2A 3QZVA 4O7BA 2DVSA 4NR8A 4UYDA 4CL9A 5EVAA 5D3PA 5LKZA 2H60A 5CQTA 4N3WA 3AQAA 3SVFA 5JWMA 5A81A 4A9KA 4CUUA 3ONIA 5EP7A 4Z6IA 5K29A 4YADA 5II2A 5E9MA 5FG5A 5F63A 4QUTA 3QZTA 3IU5A 4NYXA 4YYHA 4TZ2A 4MEQA 5BT3A 5EPSA 2R10A 3MB3A 4IOOA 5FB1A 5JI8A 2YDWA 5E7DA 3TLPA 4HXRA 4LYSA 3UVDA 4NUCA 5CY9A 5EA1A 5HRVA 5EQ1A 5FFYA 5FE8A 4UYEA 2R0YA 3G0JA 5F62A 4Z1SA 3U5LA 2YEKA 4MENA 1JSPB 4OGIA 5FE0A 4PTBA 4HXLA 4MR5A 5CUBA 5L8UA 5E3DA 4DONA 5IGLA 4IR5A 4LZ2A 2I8NA 5A5QA 5CQ6A 5CUCA 5DKHA 3UV4A 5FE6A 3UVXA 2KTBB 5HRXA 5F60A 5HENA 4C67A 5ENJA 4NR5A 3MB4A 4MEOA 5EU1A 2FSAA 3UW9A 4IR6A 5AD3A 5LUUA 3HMFA 4QEUA 3G0LA 4UIXA 4IR4A 5FB0A 5TCMA 4A9EA 4YYKA 3U5PA 4GPJA 2D82A 5EM3A 3U5MA 1N72A 3JVMA 4LYWA 5ETDA 3Q2FA 5EWDA 5L99A 4YYNA 3FKMX 5IGNA 5D3RA 4IR3A 4NS5A 4YYIA 2G4AA 5AMFA 5CUDA 5CGPA 4HXKA 4A9FA 3HMHA 4XUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CFLA 4LYIA 4QSRA 4NRAA 4HXNA 4N4IA 5LJ1A 4TU6A 4QSPA 4UIUA 3I3JA 4HXMA 4YH3A 5HCLA 4A9MA 5CP5A 5KTWA 5D0CA 5DYCA 3QZSA 5F1HA 4ALGA 1PUOA 4NRBA 3JVJA 4N4FA 5EPRA 5A5SA 5CRMA 5HFRA 5L97A 4LC2A 2MJVB 4QSVA 5KU3A 5CUEA 2I7KA 3S92A 5FH7A 5COIA 4AI6A 4TZ8A 4Z93A 1ZKRA 5TB6A 5G4RA 5DFBA 4YYMA 5C89A 4A9LA 4TU4A 5CTLA 5HQ7A 4CUTA 4RVRA 1WUGA 4WHUA 5G4SA 5HLSA 4PCIA 5I40A 4QSXA 3UVYA 3HMEA 5HRWA 5EWCA 4YK0A 4A9IA 4OUFA 5E0RA 5EISA 4O75A 5CS8A 5KTUA 4NQNA 5DW1A 4QNSA 2RNWA 5DYAA 5DW2A 2RFJA 3LQIA 5DLXA 5DFCA 5FG4A 4AKHA 5DFDA 4XY8A 5KTXA 2F6NA 3P1FA 5AMEA 4KV4A 5FH8A 5F2PA 4MR3A 4UIZA 4XUAA 4HBYA 4Z1QA 5IIDA 4NRCA 5CQ5A 4O74A 5I7YA 5ENHA 2YYNA 5E9YA 4BHWA 5ENIA 4PKLA 4PCEA 4TT4A 4CFKA 4KV1A 5D3JA 4BJXA 4YY6A 4QC1A 2DVRA 5FE2A 4UYFA 5FE9A 3JVLA 3O37A 4O70A 4UYGA 4X2IA 4HBVA 2RI7A 4YABA 4N4HA 5DBMA 3O36A 3O34A 4QC3A 5A5NA 4QSSA 4ZQLA 3P1DA 3U5KA 5LKUA 1EQFA 2YW5A 5H1VA 5I29A 3MULA 5FE1A 5I89A 4KCXA 5L98A 1X0JA 2RNXA 4QSTA 5ENEA 4LZSA 5EK9A 4MR6A 4LDFA 5E74A 5IBNA 3ZYUA 2NXBA 2OUOA 3LQJA 5LJ0A 4NR7A 4O7CA 3D1DA 5KHMA 2OSSA 4ALHA 4BW3A 5LKTA 3MXFA 3UV2A 4ZW1A 5HEMA 3IU6A 5F25A 5FE3A 4OGJA 5F36A 4NYVA 4HXPA 4QUUA 5LVQA 3K2JA 4UYFB 5EV9A 5C87A 4NUDA 3U5NA 4O76A 5A5OA 3P1EA 3MUKA 2DVVA 5ENGA 4YYGA 5C8GA 4J0RA 5H85A 4XY9A 2E3KA 5CQ3A 5DX4A 4QR3A 4J1PA 4F3IA 3P1CA 2GRCA 5ACYA 4TS8A 4CUPA 2RS9B 5CQ4A 4YYDA 4O72A 4WHWA 4C66A 4QYLA 4BW2A 5D3LA 5FE4A 5CFWA 5DYUA 4YBSA 2L5EA 2R0VA 3AADA 4NR9A 5ENBA 2WP2A 2WP1A 5C4QA 4YC9A 5E9VA 5HM0A 4CUQA 5L96A 5F1LA 4MEPA 3UVWA 4WIVA 5HFQA 2R0SA 5E9LA 5HJCA 5D26A 5FG6A 1E6IA 4UYHA 5A5PA 3MQMA 3SVHA 3U5JA 4QZSA 4UIVA 5EICA 5A7CA 5FH6A 4NXJA 5LKXA 4HBWA 5EI4A 4QR4A 3D1BA 2F6JA 2L85A 5D25A 2DWWA 5C85A 4NQMA 5FBXA 5FDZA 3Q2EA 5E3GA 5EPBA 5FFWA 4LR6A 4Q0OA 4CUSA 3ERRA 4O71A 5CQAA 4NUEA 5ENFA 5FFVA 3SVGA 5A82A 3O35A 3LXJA 4PY6A 2YELA 4Q0NA 5A83A 4TYLA 2OO1A 4J3IA 4NYWA 5E9IA 5II1A 4NR6A 2LSPB 4IOQA 4YY4A 5LJ2A 4IORA 4MR4A 2RNYA 5E73A 1WUMA 3S91A 2RO1A 5EWVA 4QYDA 2E7NA 4QEVA 4O78A 5CQ7A 3D7CA 5DLZA 5ETBA 5H1TA 3RCWA 4YATA 5EWHA 4LZRA 5HQ5A 5L8TA 2YEMA 5ENCA 4O7AA 5FE5A 5I83A 3VKGA 4N4GA 5CU8A 4QR5A 5CRZA 5D3HA 4XYAA 4HBXA 4QBMA 4QSUA 5CUAA 4O7FA 4QEWA 1ZS5A 3UV5A 5EWWA 5A85A 4A9OA 4FLPA 4BW4A 2DVQA 5KO4A 5D24A 5I80A 5BT5A 5CPEA 2D9EA 5IG6A 5A5RA 4QSWA 4A9NA 4CLBA 4YH4A 2L84A 5F3AA 5F5ZA 5J0DA 5D7XA 4AKGA 2DATA 3DWYA 3O33A 4Z6HA 4YBMA 5C7NA 5DKDA 4AKNA 4HXOA 5HQ6A 5LVRA 4E96A 3LQHA 4Y03A 2E7OA 2DKWA 3VKHA 5FE7A 5E9KA 4AKIA 4NR4A 3U5OA 4A9JA 4O7EA 4UITA 4BW1A 1JM4B 5I7XA 5D3NA 5BT4A 4CURA 4ZC9A 4YAXA 4TT6A 5I1QA 4TT2A 5DYXA 5HELA 4TTEA 5IGMA 5D3SA 4A9HA 4O77A 4YYJA 3JVKA 4PS5A 5I88A 4HXSA 3DAIA 5H1UA 5CUGA 4UIWA 3LJWA 4J0SA 1F68A 4LRGA 4UIYA 4QB3A 3P5OA 5D3TA 5DKCA 2YQDA 3GG3A 5CZGA 5I86A 5DY7A 5CQ8A 5IGKA 5EGUA 4QSQA 2N9GA 4QY4A 4TQNA 4YBTA 5F61A 3NXBA 5AD2A 3QZVA 4O7BA 2DVSA 4NR8A 4UYDA 4CL9A 5EVAA 5D3PA 5LKZA 2H60A 5CQTA 4N3WA 3AQAA 3SVFA 5JWMA 5A81A 4A9KA 4CUUA 3ONIA 5EP7A 4Z6IA 5K29A 4YADA 5II2A 5E9MA 5FG5A 5F63A 4QUTA 3QZTA 3IU5A 4NYXA 4YYHA 4TZ2A 4MEQA 5BT3A 5EPSA 2R10A 3MB3A 4IOOA 5FB1A 5JI8A 2YDWA 5E7DA 3TLPA 4HXRA 4LYSA 3UVDA 4NUCA 5CY9A 5EA1A 5HRVA 5EQ1A 5FFYA 5FE8A 4UYEA 2R0YA 3G0JA 5F62A 4Z1SA 3U5LA 2YEKA 4MENA 1JSPB 4OGIA 5FE0A 4PTBA 4HXLA 4MR5A 5CUBA 5L8UA 5E3DA 4DONA 5IGLA 4IR5A 4LZ2A 2I8NA 5A5QA 5CQ6A 5CUCA 5DKHA 3UV4A 5FE6A 3UVXA 2KTBB 5HRXA 5F60A 5HENA 4C67A 5ENJA 2EJNA 4NR5A 3MB4A 4MEOA 5EU1A 2FSAA 3UW9A 4IR6A 5AD3A 5LUUA 3HMFA 4QEUA 3G0LA 4UIXA 4IR4A 5FB0A 5TCMA 4A9EA 4YYKA 3U5PA 4GPJA 2D82A 5EM3A 3U5MA 1N72A 3JVMA 4LYWA 5ETDA 3Q2FA 5EWDA 5L99A 4YYNA 3FKMX 5IGNA 5D3RA 4IR3A 4NS5A 4YYIA 2G4AA 5AMFA 5CUDA 5CGPA 4HXKA 4A9FA 3HMHA 4XUBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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