5J0DA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with a benzoxazepine compound
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
RKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Development of Selective CBP/P300 Benzoxazepine Bromodomain Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 41
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5j0dA00
5AD2A 5FH8A 5H85A 5E0RA 4TU6A 4A9FA 4YK0A 5DYUA 3LQHA 2YELA 5DKCA 5EV9A 5L8UA 4GPJA 5K29A 4XY8A 5F5ZA 4TYLA 4IR3A 4X2IA 4MR6A 4QSRA 2E7OA 3S91A 4CUTA 2FSAA 2DVSA 4UYDA 3Q2EA 2DVRA 4TTEA 5D3JA 2R0VA 5DFBA 4QSTA 5E73A 4QY4A 5LJ2A 2DWWA 3O35A 4KV1A 4Z1QA 4QR3A 5II2A 5KTXA 4HXLA 1N72A 4CUPA 4C66A 4NR9A 5A5OA 5FE8A 4IOQA 4BW2A 3G0LA 4TT4A 4YYHA 2D82A 4O7FA 4J0RA 4A9MA 4NUDA 5C7NA 4A9NA 4A9KA 5CQ7A 4NR6A 5CGPA 5CS8A 3P5OA 5CP5A 5D3TA 5ENJA 3S92A 2RNYA 3UV4A 4Z93A 5HELA 4O71A 4Z6HA 5HENA 2YYNA 2L85A 2WP1A 4YH3A 4UIXA 4QSUA 4QYDA 4J0SA 3K2JA 4TZ8A 4MEQA 2RFJA 5ENIA 5FH7A 5F25A 3JVKA 4QSSA 5DX4A 3UVDA 4O77A 4RVRA 2OUOA 5HFRA 4UYFA 5DFCA 5BT5A 4HXRA 3O37A 1ZS5A 5CTLA 5ENGA 5CUEA 5AMEA 5EWWA 4NQNA 4MR3A 3LQJA 5ENEA 3P1EA 4HBWA 5DKDA 5TCMA 4O7CA 3MB4A 5FE5A 4QB3A 5L99A 3AADA 3MXFA 4OGJA 4LDFA 5E9VA 3I3JA 5L96A 3ZYUA 2E3KA 4E96A 5EWDA 4TU4A 3U5LA 5CUDA 2RI7A 2DVQA 4O7BA 5LKTA 4QBMA 5EM3A 2YDWA 5CRMA 4O75A 5I89A 5IGLA 4UITA 5CQ8A 5C89A 5I40A 4ZC9A 5EQ1A 5LVRA 5FE6A 4J1PA 5E9YA 5G4SA 5FE9A 4UIYA 5HM0A 5I86A 4KV4A 5IBNA 3HMEA 4HXNA 5CQTA 5EWHA 5A5SA 4QEUA 5D3RA 4XUAA 5IGKA 4CFLA 4YY6A 5DFDA 5KU3A 4O72A 2L5EA 4OGIA 5IG6A 3GG3A 5L98A 3RCWA 5EWVA 2RS9B 1E6IA 4N4GA 3QZTA 5F60A 5EISA 4O70A 5CZGA 5DLZA 4QYLA 5ENCA 3TLPA 5I7YA 4HBYA 5L8TA 4HXOA 4WHUA 4NR4A 4A9LA 2F6NA 4IR5A 2DATA 5FB1A 5E7DA 3JVMA 5CU8A 5COIA 4A9OA 5LJ1A 5HQ7A 3UVYA 2GRCA 3P1CA 4UYHA 3U5MA 4PS5A 5LVQA 4LZ2A 4UYEA 5DKHA 4TT6A 5I29A 2F6JA 5A5QA 4IR4A 4YYJA 5A5RA 4N3WA 1WUGA 3NXBA 5KTUA 5I7XA 4N4IA 5HRWA 5CQ3A 2L84A 4NYWA 4CLBA 4F3IA 4QSXA 5F2PA 5A83A 4Y03A 3MULA 5LUUA 5HEMA 4QSQA 4LC2A 5DYXA 5EWCA 3SVGA 4NRBA 3O34A 4C67A 5F1LA 5JWMA 4A9JA 4QNSA 3Q2FA 4HBVA 4HXKA 5BT4A 3ONIA 5FE2A 5ENBA 4QR4A 5I80A 5D7XA 3U5KA 4NS5A 4CFKA 5EPSA 5H1UA 5LKXA 4NRCA 4LYIA 5D3PA 5EU1A 5FG4A 4HXMA 5LKZA 5HJCA 2R10A 4TZ2A 5FDZA 5CUAA 2E7NA 5ETDA 4OUFA 4QEVA 4XUBA 5FE3A 5CFWA 5ENHA 3DWYA 4MR5A 4NYXA 3IU5A 5D26A 3O33A 3UV2A 4BJXA 4NRAA 4YC9A 4Z1SA 4TS8A 4ALHA 2WP2A 4UIWA 4O7EA 5C8GA 2YW5A 4Q0NA 4HXSA 4IR6A 1F68A 4N4FA 5D25A 5FBXA 4BW4A 4YY4A 4MR4A 2OSSA 5D3SA 3UVXA 4O78A 5HLSA 5TB6A 5HQ5A 5CUCA 3G0JA 4YYDA 4YH4A 3JVJA 4XYAA 5EVAA 5LKUA 4A9EA 5FE4A 2YEKA 4Q0OA 5CQAA 4DONA 4N4HA 4QC3A 4YBMA 5A5NA 4BHWA 4O76A 4LYSA 5II1A 5FFVA 4A9HA 4YYIA 3UVWA 3IU6A 4CUQA 5L97A 5KHMA 5AD3A 4O74A 4KCXA 4WHWA 5IGMA 4QC1A 2I7KA 4YYGA 5D0CA 3MB3A 1JSPB 5KTWA 3UV5A 3HMFA 4YYKA 5DLXA 3MUKA 2RNXA 3U5JA 3P1DA 5CUGA 3P1FA 5DW1A 5ENFA 5EK9A 5C85A 5FFWA 4TT2A 4QR5A 5I88A 5F63A 5FG5A 5A85A 4UIUA 5JI8A 4UIVA 5FE0A 3HMHA 5FE1A 4QZSA 5E9MA 5E3DA 4YABA 2I8NA 5FFYA 4NXJA 5F1HA 2YQDA 2YEMA 5F3AA 5CPEA 4YATA 5CQ5A 4PKLA 5DW2A 4QUTA 4UIZA 4YBTA 3UW9A 3AQAA 4CUSA 5C87A 3U5OA 4NQMA 4PTBA 4J3IA 5EICA 5E3GA 5AMFA 3QZSA 2DVVA 4FLPA 5D3NA 5BT3A 5FE7A 5A5PA 5F62A 5HRVA 1EQFA 5EA1A 4CUUA 5CY9A 2DKWA 1JM4B 4PCIA 3U5NA 5D24A 2KTBB 5E9IA 4MEOA 4YBSA 5HQ6A 4CL9A 5C4QA 3SVFA 5HCLA 2RNWA 4QUUA 4AKNA 4UYGA 1X0JA 5LJ0A 4IORA 4QSPA 5I1QA 4NUCA 4QSVA 5D3HA 5DYAA 5A81A 5FG6A 4HBXA 4TQNA 4ZQLA 5FB0A 5I83A 4QSWA 5E74A 4A9IA 5IGNA 5EGUA 4MENA 2NXBA 4UYFB 3JVLA 3QZVA 5E9LA 4HXPA 2N9GA 2R0YA 5ETBA 4BW3A 3LJWA 3DAIA 4Z6IA 4PCEA 2G4AA 5CUBA 4LYWA 4YADA 3U5PA 4NYVA 5H1TA 5F61A 2MJVB 4NR5A 5HRXA 3SVHA 5H1VA 4QEWA 4LZSA 4LZRA 2H60A 5E9KA 5HFQA 2D9EA 4LR6A 4LRGA 3MQMA 4BW1A 3D7CA 5CQ6A 3O36A 3LQIA 5EPRA 5J0DA 5D3LA 5CQ4A 4NR7A 5EP7A 4ZW1A 4ALGA 2LSPB 5EPBA 5F36A 4XY9A 5G4RA 5FH6A 2OO1A 4YYNA 2RO1A 1WUMA 4WIVA 4PY6A 5IIDA 5CRZA 4CURA 5DBMA 5KO4A 4NUEA 5DY7A 2R0SA 4O7AA 5EI4A 5A82A 4YYMA 5DYCA 3LXJA 5ACYA 4IOOA 3FKMX 4MEPA 4YAXA 4NR8A 5A7CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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