3UVXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k12ack16ac)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvxA01
3QZVA 4J3IA 5F61A 5L99A 5LJ0A 2R0SA 5HFRA 4YYKA 5CS8A 5EPSA 5G4RA 4YYMA 5J0DA 3ZYUA 5E7DA 4CUSA 3LJWA 3O36A 4MR3A 4QSRA 5D3SA 5II2A 5FE2A 5E9LA 4YC9A 4NUCA 5H85A 4HXMA 4ALHA 4E96A 5L97A 4ZC9A 4QSSA 2YQDA 4BW2A 4YATA 5HQ5A 2OUOA 4HBWA 5AMEA 5CUGA 2DVRA 5CUEA 4IOQA 4UYGA 4Q0OA 4LDFA 5F1HA 4FLPA 5I7XA 3MB3A 4O7AA 5EPBA 4MEQA 4YADA 5CY9A 5BT5A 4QUUA 4QC3A 3AADA 4QSQA 4YBSA 5I83A 4A9MA 4YYIA 5DLXA 4NRAA 2OO1A 3P1DA 5D26A 5CQTA 4QEUA 4J0SA 4HBYA 2YEMA 5A5SA 3Q2FA 5A85A 4OUFA 4A9JA 4PS5A 5DKHA 5DW2A 1JM4B 1WUMA 5ENJA 4YYHA 4PY6A 4QR4A 4AKNA 5ENBA 4YYDA 4NYWA 4CLBA 5JI8A 2DVSA 2GRCA 5E9MA 5IGNA 5ETDA 5FG4A 5CQ5A 5DFCA 5E74A 5LKXA 5L98A 4A9NA 3I3JA 4TT6A 2YYNA 5CRMA 5DYAA 5EWCA 2RO1A 3Q2EA 4IOOA 5ENGA 5EQ1A 4QC1A 3LQHA 4QY4A 3MXFA 5E73A 3JVMA 5H1VA 4IR4A 2RNXA 2F6JA 3ONIA 3U5NA 5D3NA 4O74A 3MULA 3O33A 4O76A 5A81A 4PCEA 5CZGA 4Z1SA 5I89A 4NR6A 5HELA 2NXBA 4A9FA 4O70A 4QSWA 4J1PA 4N4FA 5FH7A 4TT2A 5CRZA 5CUAA 5IGKA 3UVYA 4XYAA 4O7EA 5D3PA 4IR6A 4XY8A 5F62A 2D9EA 5EU1A 4NYXA 5D3HA 5FFYA 5EP7A 3JVJA 3U5PA 4CUUA 5EICA 4NS5A 2DKWA 1N72A 2R0YA 4UIYA 5ENFA 3JVKA 4O7FA 2L85A 3HMFA 5A5NA 3D7CA 4NR5A 4MR4A 5DFDA 5HRVA 5TCMA 5I1QA 5D25A 4C66A 2F6NA 5HENA 5ENHA 4HXLA 4Z6IA 4MR6A 4LYIA 2FSAA 5HM0A 5A83A 4KCXA 4YBMA 3LQIA 4LR6A 4XUAA 4O72A 4YK0A 3S91A 5D0CA 5BT3A 2RS9B 3JVLA 5ACYA 4XY9A 4IR3A 2DWWA 5CQ6A 3DWYA 4CUPA 2DVVA 3U5MA 5FE3A 4YH3A 1ZS5A 3MQMA 4YYGA 5HRXA 5EWHA 5HQ7A 4YAXA 5KU3A 5LVRA 5FH6A 3QZTA 5LKZA 4TTEA 4YY6A 5CQAA 4MENA 5A82A 5AD3A 5LUUA 4ZW1A 5F36A 2LSPB 4UIZA 4HXKA 4LZSA 5LJ1A 4OGJA 4A9HA 5EWVA 4NXJA 4O78A 4J0RA 5CUBA 4F3IA 2L5EA 4KV1A 2OSSA 4TU6A 4HXNA 5I29A 4LZRA 4UIWA 5CP5A 4CUTA 3P1CA 5FB0A 4NR8A 4QSTA 2D82A 5DBMA 5CQ7A 5CGPA 2RNYA 4YABA 4QYDA 5DW1A 3QZSA 3AQAA 5C89A 5D24A 2DVQA 4TZ2A 5DX4A 4LC2A 5AD2A 5C85A 1E6IA 4NYVA 4O7CA 5JWMA 5FG6A 4UYFA 5II1A 4TZ8A 3MB4A 3UVDA 4QSUA 3HMEA 5CFWA 3O34A 5F2PA 5EV9A 5L96A 5EISA 4UYEA 4PKLA 4Y03A 4A9LA 4CUQA 4UIVA 5EGUA 5CUDA 5IIDA 5A5RA 4WHWA 4NRBA 4QEWA 2YEKA 4TS8A 4BW1A 2YDWA 2YW5A 4YY4A 5FBXA 5DYXA 4BJXA 2RI7A 5C4QA 2RNWA 5IBNA 5I80A 5TB6A 5EI4A 5A5PA 4PTBA 3NXBA 4TU4A 2H60A 4YYJA 5D7XA 4CURA 4O75A 2I8NA 3U5JA 5I86A 3G0JA 3O37A 4N4HA 4UYFB 4Z1QA 4YH4A 3RCWA 5IGMA 5FE9A 4ZQLA 4QBMA 2L84A 3DAIA 3U5LA 5KTWA 5LVQA 5L8UA 3S92A 5DFBA 1JSPB 5E9KA 5C8GA 4CFLA 4MEOA 5FFWA 2R10A 4QSXA 4A9IA 5A5QA 5L8TA 2E3KA 4NQMA 4HBXA 5EVAA 5I40A 4N4IA 4NQNA 5EM3A 2E7OA 5HFQA 1EQFA 5CPEA 3MUKA 3SVGA 5FE5A 4QR5A 5E0RA 4DONA 5KO4A 4UITA 5DY7A 4ALGA 4WIVA 2G4AA 5E9VA 4LYWA 1WUGA 4QZSA 4BW3A 4O71A 4YYNA 4LRGA 2R0VA 5H1UA 4A9KA 5DKCA 4A9OA 4MEPA 5DYUA 3UV2A 4A9EA 4O7BA 5CTLA 4BW4A 2DATA 3UV5A 4TT4A 3K2JA 5F5ZA 5HRWA 5C87A 4UYHA 5F3AA 2E7NA 3U5OA 4QB3A 5C7NA 4LZ2A 5HCLA 5F1LA 2WP1A 4OGIA 5D3JA 5EPRA 5IG6A 4Z6HA 4UIUA 2MJVB 4N4GA 5KHMA 4N3WA 5D3TA 5EWDA 5ENEA 4NUEA 4UIXA 3HMHA 5I7YA 5KTUA 4HXPA 5LKTA 4NR7A 5A7CA 4NR9A 5CQ3A 4GPJA 5DKDA 5A5OA 5KTXA 4O77A 5E9YA 5HEMA 3SVFA 4HBVA 3P1EA 3LXJA 5EWWA 5CQ4A 5G4SA 5LJ2A 4NUDA 3LQJA 4QSVA 4PCIA 5DLZA 2KTBB 3UVWA 5CUCA 5AMFA 3SVHA 2I7KA 4IR5A 5E3DA 5FFVA 5FDZA 5H1TA 5FE6A 4NR4A 5FE0A 4TYLA 4HXOA 3O35A 3P1FA 3UVXA 2WP2A 4QNSA 5E9IA 4RVRA 3UV4A 4NRCA 4TQNA 3TLPA 5I88A 4QEVA 4HXRA 5ETBA 3UW9A 5E3GA 5ENCA 5FB1A 5LKUA 3GG3A 5F60A 4HXSA 4KV4A 4CL9A 5CU8A 4C67A 3G0LA 4X2IA 5HLSA 3IU6A 4QYLA 4LYSA 4WHUA 4Q0NA 5BT4A 5CQ8A 4Z93A 4MR5A 3IU5A 5D3RA 2RFJA 5FE1A 5F25A 1X0JA 4YBTA 2YELA 4QR3A 5FE7A 4IORA 4CFKA 5FG5A 1F68A 4QUTA 4BHWA 5EA1A 4QSPA 5HQ6A 5IGLA 5FE8A 5DYCA 5FH8A 5D3LA 3P5OA 5ENIA 5EK9A 5FE4A 5K29A 5COIA 5F63A 4XUBA 3U5KA 4UYDA 2N9GA 3FKMX 5HJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QZVA 4J3IA 5F61A 5L99A 3VKHA 5LJ0A 2R0SA 5HFRA 4YYKA 5CS8A 5EPSA 5G4RA 4YYMA 5J0DA 3ZYUA 5E7DA 4CUSA 3LJWA 3O36A 4MR3A 4QSRA 5D3SA 5II2A 5FE2A 5E9LA 4YC9A 4NUCA 5H85A 4HXMA 4ALHA 4E96A 5L97A 4ZC9A 4QSSA 2YQDA 4BW2A 4YATA 5HQ5A 2OUOA 4HBWA 5AMEA 5CUGA 2DVRA 5CUEA 4IOQA 4UYGA 4Q0OA 4LDFA 5F1HA 4FLPA 5I7XA 3MB3A 4O7AA 5EPBA 4MEQA 4YADA 5CY9A 5BT5A 4QUUA 4QC3A 3AADA 4QSQA 4YBSA 5I83A 4A9MA 4YYIA 5DLXA 4NRAA 2OO1A 3P1DA 5D26A 5CQTA 4QEUA 4J0SA 4HBYA 2YEMA 5A5SA 3Q2FA 5A85A 4OUFA 4A9JA 4PS5A 5DKHA 5DW2A 1JM4B 1WUMA 5ENJA 4YYHA 4PY6A 4QR4A 4AKNA 5ENBA 4YYDA 4NYWA 4CLBA 5JI8A 4AKHA 2DVSA 2GRCA 5E9MA 5IGNA 5ETDA 5FG4A 5CQ5A 5DFCA 5E74A 5LKXA 5L98A 4A9NA 3I3JA 4TT6A 2YYNA 5CRMA 5DYAA 5EWCA 2RO1A 3Q2EA 4IOOA 5ENGA 5EQ1A 4QC1A 3LQHA 4QY4A 3D1BA 3MXFA 5E73A 3JVMA 5H1VA 4IR4A 2RNXA 2F6JA 3ONIA 3U5NA 5D3NA 4O74A 3MULA 3O33A 4O76A 5A81A 4PCEA 5CZGA 4Z1SA 5I89A 4NR6A 5HELA 2NXBA 4A9FA 4O70A 4QSWA 4J1PA 4N4FA 5FH7A 4TT2A 5CRZA 5CUAA 5IGKA 3UVYA 4XYAA 4O7EA 5D3PA 4IR6A 4XY8A 5F62A 2D9EA 5EU1A 4NYXA 5D3HA 5FFYA 5EP7A 3JVJA 3U5PA 4CUUA 5EICA 4NS5A 2DKWA 1N72A 2R0YA 4UIYA 5ENFA 3JVKA 4O7FA 2L85A 3HMFA 5A5NA 3D7CA 4NR5A 4MR4A 5DFDA 5HRVA 5TCMA 5I1QA 5D25A 4C66A 2F6NA 5HENA 5ENHA 4HXLA 4Z6IA 4MR6A 4LYIA 2FSAA 5HM0A 5A83A 4KCXA 4YBMA 3LQIA 4LR6A 4XUAA 4O72A 4YK0A 3S91A 5D0CA 5BT3A 2RS9B 3JVLA 5ACYA 4XY9A 4IR3A 2DWWA 5CQ6A 3DWYA 4CUPA 2DVVA 3U5MA 5FE3A 4YH3A 1ZS5A 3MQMA 4YYGA 5HRXA 5EWHA 5HQ7A 4YAXA 5KU3A 5LVRA 5FH6A 3QZTA 5LKZA 4TTEA 4YY6A 5CQAA 4MENA 5A82A 5AD3A 5LUUA 4ZW1A 5F36A 2LSPB 4UIZA 4HXKA 4LZSA 3ERRA 5LJ1A 4OGJA 4A9HA 5EWVA 4AKGA 4NXJA 4O78A 4J0RA 5CUBA 4F3IA 2L5EA 4KV1A 2OSSA 4TU6A 4HXNA 5I29A 4LZRA 4UIWA 5CP5A 4CUTA 3P1CA 5FB0A 4NR8A 4QSTA 2D82A 5DBMA 5CQ7A 5CGPA 2RNYA 4YABA 4QYDA 5DW1A 3QZSA 3AQAA 5C89A 5D24A 2DVQA 4TZ2A 5DX4A 4LC2A 5AD2A 5C85A 1E6IA 4NYVA 4O7CA 5JWMA 5FG6A 4UYFA 5II1A 4TZ8A 3MB4A 3UVDA 4QSUA 3HMEA 2EJNA 5CFWA 3O34A 5F2PA 5EV9A 5L96A 5EISA 4UYEA 4PKLA 4Y03A 4A9LA 4CUQA 4UIVA 5EGUA 5CUDA 5IIDA 5A5RA 4WHWA 4NRBA 4QEWA 2YEKA 4TS8A 4BW1A 2YDWA 2YW5A 4YY4A 5FBXA 5DYXA 4BJXA 1ZKRA 2RI7A 5C4QA 2RNWA 5IBNA 5I80A 5TB6A 5EI4A 5A5PA 4PTBA 3NXBA 4TU4A 2H60A 4YYJA 5D7XA 4CURA 4O75A 2I8NA 3U5JA 5I86A 3G0JA 3O37A 4N4HA 4UYFB 4Z1QA 4YH4A 3RCWA 5IGMA 5FE9A 4ZQLA 4QBMA 2L84A 3DAIA 3U5LA 5KTWA 5LVQA 5L8UA 3S92A 5DFBA 1JSPB 5E9KA 5C8GA 4CFLA 4AI6A 4MEOA 5FFWA 2R10A 4QSXA 4A9IA 5A5QA 5L8TA 2E3KA 4NQMA 4HBXA 5EVAA 5I40A 4N4IA 4NQNA 5EM3A 2E7OA 5HFQA 1EQFA 5CPEA 3MUKA 3SVGA 5FE5A 4QR5A 5E0RA 1PUOA 4DONA 5KO4A 4UITA 5DY7A 4ALGA 4WIVA 2G4AA 5E9VA 4LYWA 1WUGA 4QZSA 4BW3A 4O71A 4YYNA 4LRGA 2R0VA 5H1UA 4A9KA 3D1DA 5DKCA 4A9OA 4MEPA 5DYUA 3UV2A 4A9EA 3VKGA 4O7BA 5CTLA 4BW4A 2DATA 3UV5A 4TT4A 3K2JA 5F5ZA 5HRWA 5C87A 4UYHA 5F3AA 2E7NA 3U5OA 4QB3A 5C7NA 4LZ2A 5HCLA 5F1LA 2WP1A 4OGIA 5D3JA 5EPRA 5IG6A 4Z6HA 4UIUA 2MJVB 4N4GA 5KHMA 4N3WA 5D3TA 5EWDA 5ENEA 4NUEA 4UIXA 3HMHA 5I7YA 5KTUA 4HXPA 5LKTA 4NR7A 5A7CA 4NR9A 5CQ3A 4GPJA 5DKDA 5A5OA 5KTXA 4O77A 5E9YA 5HEMA 3SVFA 4HBVA 3P1EA 3LXJA 5EWWA 5CQ4A 5G4SA 5LJ2A 4NUDA 3LQJA 4QSVA 4PCIA 5DLZA 2KTBB 3UVWA 5CUCA 5AMFA 3SVHA 2I7KA 4IR5A 5E3DA 5FFVA 5FDZA 5H1TA 5FE6A 4NR4A 5FE0A 4TYLA 4HXOA 3O35A 3P1FA 3UVXA 2WP2A 4QNSA 5E9IA 4RVRA 3UV4A 4NRCA 4TQNA 3TLPA 5I88A 4AKIA 4QEVA 4HXRA 5ETBA 3UW9A 5E3GA 5ENCA 5FB1A 5LKUA 3GG3A 5F60A 4HXSA 4KV4A 4CL9A 5CU8A 4C67A 3G0LA 4X2IA 5HLSA 3IU6A 4QYLA 4LYSA 4WHUA 4Q0NA 5BT4A 5CQ8A 4MR5A 3IU5A 4Z93A 5D3RA 2RFJA 5FE1A 5F25A 1X0JA 4YBTA 2YELA 4QR3A 5FE7A 4IORA 4CFKA 5FG5A 1F68A 4QUTA 4BHWA 5EA1A 4QSPA 5HQ6A 5IGLA 5FE8A 5DYCA 5FH8A 5D3LA 3P5OA 5ENIA 5EK9A 5FE4A 5K29A 5COIA 5F63A 4XUBA 3U5KA 4UYDA 2N9GA 3FKMX 5HJCA
chains in the Genus database with same CATH topology
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