3UVXA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (h4k12ack16ac)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3uvxA01
2OO1A 2OUOA 5ENCA 4CL9A 5EPSA 2I7KA 4IR5A 4YY4A 5EV9A 5DYCA 4O71A 2YQDA 4NRCA 5FFWA 4LYSA 5HRWA 4O78A 2RNYA 5CQ4A 4HXKA 4YBSA 5HENA 3DWYA 5CUBA 5II1A 5BT3A 2LSPB 5EWWA 4PY6A 2RS9B 1X0JA 3MB3A 4IOQA 5I1QA 5EK9A 3RCWA 5FE8A 5EWCA 5F25A 4F3IA 4BW3A 5FE7A 2E3KA 5CRMA 5CUEA 4CUSA 4NUCA 5EISA 5F60A 4A9FA 5CY9A 4NUDA 5TCMA 5FE4A 4DONA 5J0DA 3UVXA 4N4HA 4OGIA 5E3GA 4QSSA 5CQTA 3LQHA 4MEPA 4ALHA 4LYIA 4NR8A 4CUUA 5CQ7A 4YBTA 5FE3A 4J3IA 2D82A 2R0VA 4O70A 5D0CA 4A9EA 4TU4A 5CS8A 3UV4A 2WP1A 4O72A 2RI7A 4QUUA 4CFLA 4GPJA 5H1TA 4UYDA 4NRBA 5E3DA 5I7YA 4QSPA 1EQFA 5LKUA 5CRZA 5L8UA 4QYDA 5II2A 5HQ7A 4BW1A 4PTBA 5EP7A 2RO1A 4NR4A 5EPRA 4CUTA 2L85A 4O76A 4XUBA 5BT4A 4Z1QA 4QEWA 3MB4A 4J1PA 5E9MA 4NS5A 5F5ZA 5EGUA 3G0JA 5ENFA 3U5LA 4YH4A 4QSUA 5ENBA 4AKNA 5FB1A 5E9IA 5IGNA 5KTUA 4UITA 2DATA 4NYVA 5DKCA 4IR3A 1F68A 2R10A 4UYFA 5EWVA 4YK0A 5D3HA 2YW5A 4ZC9A 4A9OA 4NR6A 4X2IA 4YAXA 4LYWA 4WHUA 3O37A 5HRVA 5I7XA 4YYHA 5CQ6A 2YEMA 3U5NA 4HXPA 4YYIA 5A81A 5D3JA 5DLZA 4UIVA 4TS8A 4MR4A 4O7CA 2YEKA 5I80A 2F6NA 5L98A 4CURA 5LKTA 4CLBA 4LDFA 4QZSA 4YADA 4NR5A 3DAIA 3JVKA 4UIXA 4PCIA 5CQAA 4Z6HA 2NXBA 4IORA 5EA1A 5AMFA 5EWHA 2E7NA 4QSRA 4UIYA 3HMHA 3AADA 5F36A 5EVAA 5AD2A 5DYAA 3D7CA 5EU1A 1JSPB 5DFDA 4UYFB 3O33A 2DVVA 5ACYA 4HBWA 3U5MA 5CQ5A 4LZ2A 5L99A 5BT5A 4YBMA 5FFYA 5CQ3A 5F63A 5LJ2A 4MEOA 5FB0A 4QYLA 4A9MA 3I3JA 3UVYA 4UYGA 5DKHA 2OSSA 3QZVA 4QSTA 4TT2A 5D24A 4YYKA 3MXFA 3Q2FA 3P1CA 2GRCA 5D3LA 2E7OA 5DYXA 3P1DA 4NQNA 5FE0A 4C67A 5LUUA 4QR4A 5CP5A 3O35A 5ENJA 4O7BA 5FG4A 5DYUA 4NQMA 5HQ5A 3P5OA 4MR3A 5JWMA 4BW4A 5EWDA 4QSQA 4YYJA 5LJ0A 5CGPA 3ONIA 5E73A 4KV4A 5E0RA 3S92A 4BHWA 5CTLA 4UIWA 5L8TA 4NYXA 1ZS5A 2DVRA 4QC1A 3G0LA 4E96A 5D26A 4UIZA 5ETBA 2FSAA 3ZYUA 4J0SA 3P1EA 4HXLA 5ETDA 4J0RA 4OGJA 4QB3A 5E9YA 5F62A 5H85A 5I40A 3JVMA 5ENEA 3S91A 5H1VA 5E9KA 5C87A 4HBYA 4LRGA 3QZSA 5I86A 5CU8A 5E74A 4BJXA 2DVQA 4TU6A 5A5SA 5D3NA 4N4FA 5FH6A 5HCLA 3O34A 2WP2A 5A5PA 4UYHA 1E6IA 4MEQA 5FFVA 3P1FA 5FE5A 2YDWA 4HXNA 5LKZA 4TYLA 3Q2EA 5ENHA 4TQNA 5HQ6A 4C66A 5LJ1A 5CUAA 5DKDA 4Z6IA 4Q0NA 2KTBB 4Z93A 4XUAA 5D3PA 5ENIA 5HELA 5I88A 3IU6A 4O7EA 5EICA 5A5RA 5CFWA 5F2PA 5AD3A 4NYWA 4O7AA 5KO4A 3U5PA 2MJVB 4N3WA 3GG3A 4NR9A 5FE9A 4QBMA 5G4SA 5KHMA 5FBXA 1JM4B 3LQJA 5CUGA 3LXJA 3NXBA 4UIUA 4A9HA 5LVRA 5DBMA 3UV2A 1WUGA 3MQMA 4A9NA 2D9EA 5DFBA 5D3RA 5DW1A 5DW2A 4CUQA 4Z1SA 4BW2A 5FE6A 5L97A 4QC3A 5KTXA 5E9VA 4NR7A 4TT4A 5C7NA 2RFJA 5ENGA 4HBXA 4NXJA 5D25A 5A85A 4QEUA 2R0YA 5DLXA 5FE2A 4CUPA 4HXRA 4MR5A 4O74A 4O77A 3AQAA 2RNXA 3FKMX 4YYGA 4Y03A 5FH7A 4LZSA 4XY9A 4QNSA 1WUMA 5A7CA 5E9LA 3O36A 5CUCA 5JI8A 4O7FA 4Q0OA 3QZTA 5F61A 5C85A 3HMFA 5EI4A 2DKWA 4IOOA 4TT6A 3UV5A 5C89A 3HMEA 5D3TA 5G4RA 4ALGA 5I83A 4HBVA 4NRAA 3UW9A 5CZGA 5F1LA 4NUEA 4FLPA 4PCEA 5D3SA 3U5KA 5AMEA 5L96A 2N9GA 4TTEA 4QR5A 5DFCA 3U5OA 4YYDA 3JVJA 5D7XA 4N4GA 4MENA 3SVGA 4YYMA 5HJCA 5H1UA 2DVSA 4QEVA 2G4AA 5A5QA 4PS5A 3TLPA 4PKLA 4YATA 4KCXA 5A5NA 5FH8A 5LVQA 3UVDA 4OUFA 4YY6A 5KU3A 4XYAA 5C4QA 5A82A 2DWWA 5HRXA 3SVFA 5HLSA 4A9LA 3JVLA 4TZ8A 4LC2A 2R0SA 4YABA 4WIVA 4MR6A 4QSVA 4YC9A 5FDZA 4O75A 5A83A 4CFKA 5IGLA 5IG6A 5HFQA 5FG5A 4ZW1A 4YYNA 5IGKA 5IIDA 4QUTA 5C8GA 5KTWA 5CUDA 5IBNA 5EQ1A 2YELA 5IGMA 4IR6A 3UVWA 4LZRA 1N72A 2H60A 2I8NA 2RNWA 5CQ8A 3LQIA 4XY8A 5DX4A 5TB6A 5A5OA 3K2JA 4IR4A 3LJWA 4HXMA 4UYEA 4RVRA 3IU5A 5K29A 5EPBA 4TZ2A 5HFRA 4YH3A 5F3AA 4HXOA 5DY7A 5EM3A 4WHWA 5I29A 4QSWA 5F1HA 5HEMA 5I89A 3U5JA 4QSXA 5COIA 5FE1A 5FG6A 4A9JA 2F6JA 4KV1A 3SVHA 5LKXA 3MUKA 2YYNA 4ZQLA 2L84A 4A9KA 5CPEA 3MULA 4HXSA 4A9IA 4QY4A 5HM0A 4LR6A 4QR3A 5E7DA 2L5EA 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OO1A 3D1BA 2OUOA 5ENCA 4CL9A 5EPSA 2I7KA 4IR5A 4YY4A 5EV9A 5DYCA 4O71A 2YQDA 4NRCA 3VKHA 5FFWA 4LYSA 5HRWA 4O78A 2RNYA 5CQ4A 4HXKA 4YBSA 5HENA 3DWYA 5CUBA 5II1A 5BT3A 2LSPB 4AI6A 5EWWA 4PY6A 2RS9B 1X0JA 3MB3A 4IOQA 5I1QA 5EK9A 3RCWA 5FE8A 4AKGA 5EWCA 5F25A 4F3IA 4BW3A 5FE7A 2E3KA 5CRMA 5CUEA 4CUSA 4NUCA 5EISA 5F60A 4A9FA 5CY9A 4NUDA 5TCMA 5FE4A 4DONA 5J0DA 3UVXA 4N4HA 4OGIA 5E3GA 4QSSA 5CQTA 3LQHA 4MEPA 4ALHA 4LYIA 4NR8A 4CUUA 5CQ7A 4YBTA 5FE3A 4J3IA 2D82A 2R0VA 4O70A 5D0CA 4A9EA 4TU4A 5CS8A 3UV4A 2WP1A 4O72A 2RI7A 4QUUA 4CFLA 4GPJA 5H1TA 4UYDA 3VKGA 4NRBA 5E3DA 5I7YA 4QSPA 1EQFA 5LKUA 5CRZA 5L8UA 4QYDA 5II2A 5HQ7A 4BW1A 4PTBA 5EP7A 2RO1A 4NR4A 5EPRA 4CUTA 2L85A 4O76A 4XUBA 5BT4A 4Z1QA 4QEWA 3MB4A 4J1PA 5E9MA 4NS5A 5F5ZA 5EGUA 3G0JA 5ENFA 3U5LA 4YH4A 4QSUA 5ENBA 4AKNA 5FB1A 5E9IA 5IGNA 5KTUA 4UITA 2DATA 4NYVA 5DKCA 4IR3A 1F68A 2R10A 4UYFA 5EWVA 4YK0A 5D3HA 2YW5A 4ZC9A 4A9OA 4NR6A 4X2IA 4YAXA 4LYWA 4WHUA 3O37A 5HRVA 5I7XA 4YYHA 5CQ6A 2YEMA 3U5NA 4HXPA 4YYIA 5A81A 4AKIA 5D3JA 5DLZA 4UIVA 4TS8A 4MR4A 4O7CA 2YEKA 5I80A 2F6NA 5L98A 4CURA 5LKTA 4CLBA 4LDFA 4QZSA 4YADA 4NR5A 3DAIA 3JVKA 4UIXA 4PCIA 5CQAA 4Z6HA 2NXBA 4IORA 5EA1A 5AMFA 5EWHA 2E7NA 4QSRA 4UIYA 3HMHA 3AADA 5F36A 5EVAA 5AD2A 5DYAA 3D7CA 5EU1A 3D1DA 1JSPB 5DFDA 4UYFB 3O33A 2DVVA 5ACYA 4HBWA 3U5MA 5CQ5A 4LZ2A 5L99A 5BT5A 4YBMA 5FFYA 5CQ3A 5F63A 5LJ2A 4MEOA 5FB0A 4QYLA 4A9MA 3I3JA 3UVYA 1PUOA 4UYGA 5DKHA 2OSSA 3QZVA 4QSTA 4TT2A 5D24A 4YYKA 3MXFA 3Q2FA 3P1CA 2GRCA 5D3LA 2E7OA 5DYXA 3P1DA 4NQNA 5FE0A 4C67A 5LUUA 4QR4A 5CP5A 3O35A 5ENJA 4O7BA 5FG4A 5DYUA 4NQMA 5HQ5A 3P5OA 4MR3A 5JWMA 4BW4A 5EWDA 4QSQA 4YYJA 5LJ0A 5CGPA 3ONIA 5E73A 4KV4A 5E0RA 3S92A 4BHWA 5CTLA 4UIWA 5L8TA 4NYXA 1ZS5A 2DVRA 4QC1A 3G0LA 4E96A 5D26A 4UIZA 5ETBA 2FSAA 3ZYUA 4J0SA 3P1EA 4HXLA 5ETDA 4J0RA 4OGJA 4QB3A 5E9YA 5F62A 5H85A 5I40A 3JVMA 5ENEA 3S91A 5H1VA 5E9KA 5C87A 4HBYA 4LRGA 3QZSA 5I86A 5CU8A 5E74A 4BJXA 2DVQA 4TU6A 5A5SA 5D3NA 4N4FA 5FH6A 5HCLA 3O34A 2WP2A 5A5PA 4UYHA 1E6IA 4MEQA 5FFVA 3P1FA 5FE5A 2YDWA 4HXNA 5LKZA 4TYLA 3Q2EA 5ENHA 4TQNA 5HQ6A 4C66A 5LJ1A 5CUAA 5DKDA 4Z6IA 4Q0NA 2KTBB 4Z93A 4XUAA 5D3PA 5ENIA 5HELA 5I88A 3IU6A 4O7EA 5EICA 5A5RA 5CFWA 5F2PA 5AD3A 4NYWA 4O7AA 5KO4A 3U5PA 2MJVB 4N3WA 3GG3A 4AKHA 4NR9A 5FE9A 4QBMA 5G4SA 5KHMA 5FBXA 1JM4B 3LQJA 5CUGA 3LXJA 3NXBA 4UIUA 4A9HA 5LVRA 5DBMA 3UV2A 1WUGA 3MQMA 4A9NA 2D9EA 5DFBA 5D3RA 5DW1A 5DW2A 4CUQA 4Z1SA 4BW2A 5FE6A 5L97A 4QC3A 5KTXA 5E9VA 4NR7A 4TT4A 5C7NA 2RFJA 5ENGA 4HBXA 4NXJA 5D25A 5A85A 4QEUA 2R0YA 5DLXA 5FE2A 4CUPA 4HXRA 4MR5A 4O74A 4O77A 3AQAA 2RNXA 3FKMX 4YYGA 4Y03A 5FH7A 4LZSA 4XY9A 4QNSA 1WUMA 5A7CA 5E9LA 3O36A 5CUCA 5JI8A 4O7FA 4Q0OA 3QZTA 5F61A 5C85A 3HMFA 5EI4A 2DKWA 4IOOA 4TT6A 3UV5A 5C89A 3HMEA 5D3TA 5G4RA 4ALGA 5I83A 4HBVA 4NRAA 3UW9A 5CZGA 5F1LA 4NUEA 4FLPA 4PCEA 5D3SA 3U5KA 5AMEA 5L96A 2N9GA 4TTEA 4QR5A 2EJNA 5DFCA 3U5OA 4YYDA 3JVJA 5D7XA 3ERRA 4MENA 4N4GA 3SVGA 4YYMA 5HJCA 5H1UA 2DVSA 4QEVA 2G4AA 5A5QA 1ZKRA 4PS5A 3TLPA 4PKLA 4YATA 4KCXA 5A5NA 5FH8A 5LVQA 3UVDA 4OUFA 4YY6A 5KU3A 4XYAA 5C4QA 5A82A 2DWWA 5HRXA 3SVFA 5HLSA 4A9LA 3JVLA 4TZ8A 4LC2A 2R0SA 4YABA 4WIVA 4MR6A 4QSVA 4YC9A 5FDZA 4O75A 5A83A 4CFKA 5IGLA 5IG6A 5HFQA 5FG5A 4ZW1A 4YYNA 5IGKA 5IIDA 4QUTA 5C8GA 5KTWA 5CUDA 5IBNA 5EQ1A 2YELA 5IGMA 4IR6A 3UVWA 4LZRA 1N72A 2H60A 2I8NA 2RNWA 5CQ8A 3LQIA 4XY8A 5DX4A 5TB6A 5A5OA 3K2JA 4IR4A 3LJWA 4HXMA 4UYEA 4RVRA 3IU5A 5K29A 5EPBA 4TZ2A 5HFRA 4YH3A 5F3AA 4HXOA 5DY7A 5EM3A 4WHWA 5I29A 4QSWA 5F1HA 5HEMA 5I89A 3U5JA 4QSXA 5COIA 5FE1A 5FG6A 4A9JA 2F6JA 4KV1A 3SVHA 5LKXA 3MUKA 2YYNA 4ZQLA 2L84A 4A9KA 5CPEA 3MULA 4HXSA 4A9IA 4QY4A 5HM0A 4LR6A 4QR3A 5E7DA 2L5EA 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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