4QEUA

Crystal structure of brd2(bd2) mutant in free form
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
GKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGAHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
publication title Chemical biology. A bump-and-hole approach to engineer controlled selectivity of BET bromodomain chemical probes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qeuA00
5II2A 5HFRA 4YBMA 4Z6HA 5KTXA 5BT4A 2DVQA 5HQ7A 5ENJA 5BT3A 5KTUA 4BW1A 5ENEA 5HFQA 1ZS5A 5FE8A 3I3JA 5I1QA 4MEOA 4UIZA 4MEQA 4LDFA 3P5OA 3ZYUA 5F1LA 5IIDA 5DW1A 4YY6A 4CFLA 5I7XA 4C66A 5FE4A 4IR6A 2R0SA 3LQJA 3UVDA 5FH6A 5J0DA 4X2IA 4HBVA 1WUGA 4TZ8A 4C67A 4O7FA 4J0RA 3IU5A 4LZRA 2MJVB 5FG6A 5F62A 4UIUA 2D9EA 5HCLA 4O76A 1X0JA 4YC9A 4YH4A 5LJ2A 5C7NA 4NUEA 2L5EA 4CUQA 3HMEA 4O75A 5DYUA 4N3WA 5ENCA 4IR3A 5D25A 4QSPA 4QSSA 5EGUA 4MR6A 2D82A 4O7BA 5I29A 5KHMA 2YDWA 3P1FA 4PY6A 5DY7A 4MENA 5HEMA 1N72A 2YEKA 5L98A 5CRMA 4Y03A 4J0SA 5D3JA 5D0CA 5FE5A 4UITA 4TT4A 4YYMA 3K2JA 4MEPA 4ALGA 5FE2A 4CLBA 4UYEA 5FG5A 5JWMA 2OO1A 5A83A 4NR5A 5CZGA 3S92A 4LRGA 5C4QA 4HXLA 4OGIA 4PS5A 4IOOA 5HRWA 4TU4A 2RI7A 4UYGA 4QSTA 5CQ8A 2DWWA 2OUOA 5CU8A 4LYIA 5LKXA 4NR7A 4QYLA 5E9MA 5A5PA 3HMHA 5DFDA 3TLPA 5EVAA 2YW5A 4ZC9A 2RNWA 5ENFA 4MR3A 4FLPA 3JVMA 5EP7A 3MULA 4YYGA 1JM4B 4A9MA 5C85A 5H1TA 4TT2A 2H60A 5F36A 1JSPB 4UIVA 5H85A 4A9JA 4HXNA 3P1DA 5CPEA 4YYDA 2YELA 4CUTA 5IG6A 3LQIA 5I86A 5E9VA 2F6JA 5I40A 3O37A 5D3TA 3U5NA 5FFYA 4YYHA 3U5PA 3DWYA 5DKHA 5IGLA 3IU6A 3JVKA 4TTEA 5E0RA 5EWHA 3MB3A 4LYSA 5TCMA 4HXMA 4Z1QA 5D3LA 4XY9A 4A9LA 5A5OA 3MXFA 4NR8A 4RVRA 2WP2A 4J1PA 3JVLA 4NR4A 4O72A 2L84A 4YBSA 4KCXA 3O33A 5A5NA 5EK9A 5FE1A 4HXOA 4QEWA 5FDZA 4O71A 5LKUA 4TS8A 5ENIA 5C87A 2F6NA 2R0YA 5I89A 4QR5A 5CS8A 5FE9A 3O35A 3Q2EA 3Q2FA 5TB6A 2L85A 4QSVA 5EPRA 4Z1SA 5CQ4A 4LC2A 4QEUA 2GRCA 4LYWA 4QR3A 5E9LA 5HENA 4O7EA 5F5ZA 5ENHA 5LVRA 5EI4A 4WHUA 4CUPA 5DYCA 5FE7A 5ACYA 3SVHA 5G4SA 5FH7A 4QSWA 5CY9A 4HBXA 4NXJA 5CUEA 5A82A 4GPJA 5HQ6A 5EISA 4ALHA 4XYAA 5CTLA 3U5MA 5LVQA 2I7KA 4XUAA 4QSXA 5D3SA 4O7CA 5CQ5A 4Z93A 5I88A 2E7NA 3QZSA 5H1UA 4PCEA 2DATA 4IORA 4YADA 5KO4A 4TQNA 5HLSA 1E6IA 5E9KA 5H1VA 3U5OA 4YYNA 3U5JA 2YEMA 4UYFB 3SVGA 5CGPA 5LUUA 4QUUA 5DLZA 4OUFA 3RCWA 4A9FA 5I7YA 5E7DA 5CUCA 5IGKA 5IGMA 5AMEA 2WP1A 4WIVA 1EQFA 5FB0A 4NS5A 5E3DA 4ZW1A 3FKMX 5EM3A 4CL9A 4NYWA 4J3IA 5IBNA 1WUMA 3MB4A 3UV5A 5L97A 5L8TA 5HRVA 5I83A 3QZTA 4CFKA 4NUDA 4KV4A 5I80A 4TYLA 4LZSA 3LQHA 4HXRA 5DFBA 5KU3A 5EPSA 5FE6A 4O74A 5FFVA 4UIYA 5FH8A 5EWVA 5HJCA 4QSRA 5F61A 3UV2A 5CUDA 3AQAA 2E3KA 5II1A 4Z6IA 5HELA 4YYJA 5E73A 5A5QA 3G0LA 4UYDA 3AADA 2DVVA 2R10A 5BT5A 3UVXA 4E96A 4BW4A 4NQNA 4QYDA 5D3NA 4BJXA 5LKZA 2DVSA 4QZSA 4Q0NA 5EU1A 5A7CA 2YQDA 4NQMA 5CQ3A 5F63A 4UYFA 5LJ1A 5CQAA 4N4FA 5A85A 5L99A 3LXJA 5LKTA 4NR6A 4PTBA 5ETDA 3DAIA 4LZ2A 4A9OA 3ONIA 4A9NA 4MR4A 3UW9A 4A9KA 4N4HA 5CP5A 2RFJA 5CQTA 5C89A 5F25A 4O70A 5FE3A 5D26A 3S91A 5EWCA 5E3GA 4QB3A 5F2PA 5FBXA 4HXPA 2RO1A 5D7XA 4ZQLA 5A5SA 4HXSA 2RS9B 5FG4A 5FE0A 1F68A 5ENGA 4CUSA 4Q0OA 5F60A 3O36A 5EWWA 5C8GA 4XY8A 4UYHA 2G4AA 5DW2A 4HXKA 3QZVA 4NR9A 2DKWA 3MUKA 4O7AA 2KTBB 5D3RA 5L96A 5E74A 4AKNA 5CQ7A 4QSQA 4YBTA 5AMFA 4A9IA 2RNYA 5DX4A 4QR4A 4XUBA 5EQ1A 3O34A 4YAXA 3P1CA 3GG3A 4NYXA 5D24A 4TZ2A 4BW2A 3LJWA 4YH3A 5CUGA 2FSAA 4PCIA 5AD2A 4PKLA 3HMFA 3JVJA 4TU6A 4QC3A 5HM0A 4UIWA 4IR5A 5JI8A 2YYNA 4N4GA 3G0JA 3UVYA 4BHWA 3U5KA 5G4RA 4YATA 5DYAA 4NUCA 4YY4A 5DKCA 5L8UA 3D7CA 5F1HA 5F3AA 4A9EA 2I8NA 4LR6A 5CQ6A 2NXBA 5DFCA 5KTWA 4IR4A 4HBYA 5EPBA 3UV4A 5EWDA 4CURA 2RNXA 5CUBA 5AD3A 5HRXA 5K29A 4YYKA 3MQMA 5E9YA 4QC1A 5DLXA 3U5LA 4QBMA 4QY4A 4DONA 5FFWA 5HQ5A 2DVRA 3P1EA 4YYIA 5A81A 3UVWA 4QEVA 4IOQA 5CRZA 5EICA 5D3PA 5COIA 3NXBA 2LSPB 5ENBA 4O78A 5EV9A 3SVFA 5DYXA 4QNSA 4QUTA 4F3IA 5E9IA 5D3HA 4QSUA 4WHWA 4NRCA 5DBMA 4TT6A 4UIXA 4NYVA 5CUAA 4KV1A 4YK0A 2OSSA 5EA1A 4A9HA 4CUUA 5IGNA 4OGJA 4MR5A 4BW3A 5A5RA 4NRAA 4YABA 5CFWA 5FB1A 5DKDA 4N4IA 4HBWA 4NRBA 2N9GA 2E7OA 5LJ0A 5ETBA 2R0VA 4O77A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5II2A 5HFRA 4YBMA 4Z6HA 5KTXA 5BT4A 2DVQA 5HQ7A 5ENJA 5BT3A 5KTUA 4BW1A 5ENEA 5HFQA 1ZS5A 5FE8A 3I3JA 5I1QA 4MEOA 4UIZA 4MEQA 4LDFA 3P5OA 3ZYUA 5F1LA 5IIDA 5DW1A 4YY6A 4CFLA 5I7XA 4C66A 5FE4A 4IR6A 2R0SA 3LQJA 3UVDA 5FH6A 5J0DA 4X2IA 4HBVA 1WUGA 4TZ8A 4C67A 4O7FA 4J0RA 3IU5A 4LZRA 2MJVB 5FG6A 5F62A 4UIUA 2D9EA 5HCLA 4O76A 1X0JA 4YC9A 4YH4A 5LJ2A 5C7NA 4NUEA 2L5EA 4CUQA 3HMEA 4O75A 5DYUA 4N3WA 5ENCA 4IR3A 5D25A 4QSPA 4QSSA 5EGUA 4MR6A 2D82A 4O7BA 5I29A 5KHMA 2YDWA 3P1FA 4PY6A 5DY7A 4MENA 5HEMA 1N72A 2YEKA 5L98A 5CRMA 4Y03A 4J0SA 5D3JA 5D0CA 5FE5A 4UITA 4TT4A 4YYMA 3K2JA 4MEPA 4ALGA 5FE2A 4CLBA 4UYEA 5FG5A 5JWMA 2OO1A 5A83A 4NR5A 5CZGA 3S92A 4LRGA 5C4QA 4HXLA 4AKGA 4OGIA 4PS5A 4IOOA 5HRWA 4TU4A 3D1BA 1ZKRA 2RI7A 4UYGA 4QSTA 5CQ8A 2DWWA 2OUOA 5CU8A 4LYIA 5LKXA 4NR7A 4QYLA 5E9MA 5A5PA 3HMHA 5DFDA 3TLPA 5EVAA 2YW5A 4ZC9A 2RNWA 5ENFA 4MR3A 4FLPA 3JVMA 5EP7A 3MULA 4YYGA 1JM4B 4A9MA 5C85A 5H1TA 4TT2A 2H60A 5F36A 1JSPB 4UIVA 5H85A 4A9JA 4HXNA 3P1DA 5CPEA 4YYDA 2YELA 4CUTA 5IG6A 3LQIA 5I86A 5E9VA 2F6JA 5I40A 3O37A 5D3TA 3U5NA 5FFYA 4YYHA 3U5PA 3DWYA 5DKHA 5IGLA 3IU6A 3JVKA 4TTEA 5E0RA 5EWHA 3MB3A 3D1DA 4LYSA 5TCMA 4HXMA 4AKHA 4Z1QA 5D3LA 4XY9A 4A9LA 5A5OA 3MXFA 4NR8A 4RVRA 2WP2A 4J1PA 3JVLA 4NR4A 4O72A 2L84A 4YBSA 4KCXA 3O33A 5A5NA 5EK9A 3VKGA 5FE1A 4HXOA 4QEWA 5FDZA 1PUOA 4O71A 5LKUA 4TS8A 5ENIA 5C87A 2F6NA 2R0YA 5I89A 4QR5A 5CS8A 5FE9A 3O35A 3Q2EA 3Q2FA 5TB6A 2L85A 4QSVA 5EPRA 4Z1SA 5CQ4A 4AKIA 4LC2A 4QEUA 2GRCA 4LYWA 4QR3A 5E9LA 5HENA 4O7EA 5F5ZA 5ENHA 5LVRA 5EI4A 4WHUA 4CUPA 5DYCA 5FE7A 5ACYA 3SVHA 5G4SA 5FH7A 4QSWA 5CY9A 4HBXA 4NXJA 5CUEA 5A82A 4GPJA 5HQ6A 5EISA 4ALHA 4XYAA 5CTLA 3U5MA 5LVQA 2I7KA 4XUAA 4QSXA 5D3SA 4O7CA 5CQ5A 4Z93A 5I88A 2E7NA 3QZSA 5H1UA 4PCEA 2DATA 4IORA 4YADA 5KO4A 4TQNA 5HLSA 1E6IA 5E9KA 5H1VA 3U5OA 4YYNA 3U5JA 2YEMA 4UYFB 3SVGA 5CGPA 5LUUA 4QUUA 5DLZA 4OUFA 3RCWA 4A9FA 5I7YA 5E7DA 5CUCA 5IGKA 5IGMA 5AMEA 2WP1A 4WIVA 1EQFA 5FB0A 4NS5A 5E3DA 4ZW1A 3FKMX 5EM3A 4CL9A 4NYWA 4J3IA 5IBNA 1WUMA 3MB4A 3ERRA 3UV5A 5L97A 5L8TA 5HRVA 5I83A 3QZTA 4CFKA 4NUDA 4KV4A 5I80A 4TYLA 4LZSA 3LQHA 4HXRA 5DFBA 5KU3A 5EPSA 5FE6A 4O74A 5FFVA 3VKHA 4UIYA 5FH8A 5EWVA 5HJCA 4QSRA 5F61A 3UV2A 5CUDA 3AQAA 2E3KA 5II1A 4Z6IA 5HELA 4YYJA 5E73A 5A5QA 3G0LA 4UYDA 3AADA 2DVVA 2R10A 5BT5A 3UVXA 4E96A 4BW4A 4NQNA 4QYDA 5D3NA 4BJXA 5LKZA 2DVSA 4QZSA 4Q0NA 5EU1A 5A7CA 2YQDA 4NQMA 5CQ3A 5F63A 4UYFA 5LJ1A 5CQAA 4N4FA 5A85A 5L99A 3LXJA 5LKTA 4NR6A 4PTBA 5ETDA 3DAIA 4LZ2A 4A9OA 3ONIA 4A9NA 4MR4A 3UW9A 4A9KA 4N4HA 5CP5A 2RFJA 5CQTA 5C89A 5F25A 4O70A 5FE3A 5D26A 3S91A 5EWCA 5E3GA 4QB3A 5F2PA 5FBXA 4HXPA 2RO1A 5D7XA 4ZQLA 5A5SA 4HXSA 2RS9B 5FG4A 5FE0A 1F68A 5ENGA 4CUSA 4Q0OA 5F60A 3O36A 5EWWA 5C8GA 4XY8A 4UYHA 2G4AA 5DW2A 4HXKA 3QZVA 4NR9A 2DKWA 3MUKA 4O7AA 2KTBB 5D3RA 5L96A 5E74A 4AKNA 5CQ7A 4QSQA 4YBTA 5AMFA 4A9IA 2RNYA 5DX4A 4QR4A 4XUBA 5EQ1A 3O34A 4YAXA 3P1CA 3GG3A 4NYXA 5D24A 4TZ2A 4BW2A 3LJWA 4YH3A 5CUGA 2FSAA 4PCIA 5AD2A 4PKLA 3HMFA 3JVJA 4TU6A 4QC3A 5HM0A 4UIWA 4IR5A 5JI8A 2YYNA 4N4GA 3G0JA 3UVYA 4BHWA 3U5KA 5G4RA 4YATA 5DYAA 4NUCA 4YY4A 5DKCA 5L8UA 3D7CA 5F1HA 5F3AA 4A9EA 2I8NA 4LR6A 2EJNA 5CQ6A 2NXBA 5DFCA 5KTWA 4AI6A 4IR4A 4HBYA 5EPBA 3UV4A 5EWDA 4CURA 2RNXA 5CUBA 5AD3A 5HRXA 5K29A 4YYKA 3MQMA 5E9YA 4QC1A 5DLXA 3U5LA 4QBMA 4QY4A 4DONA 5FFWA 5HQ5A 2DVRA 3P1EA 4YYIA 5A81A 3UVWA 4QEVA 4IOQA 5CRZA 5EICA 5D3PA 5COIA 3NXBA 2LSPB 5ENBA 4O78A 5EV9A 3SVFA 5DYXA 4QNSA 4QUTA 4F3IA 5E9IA 5D3HA 4QSUA 4WHWA 4NRCA 5DBMA 4TT6A 4UIXA 4NYVA 5CUAA 4KV1A 4YK0A 2OSSA 5EA1A 4A9HA 4CUUA 5IGNA 4OGJA 4MR5A 4BW3A 5A5RA 4NRAA 4YABA 5CFWA 5FB1A 5DKDA 4N4IA 4HBWA 4NRBA 2N9GA 2E7OA 5LJ0A 5ETBA 2R0VA 4O77A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5II2 A;  5HFR A;  4YBM A;  4Z6H A;  5KTX A;  5BT4 A;  2DVQ A;  5HQ7 A;  5ENJ A;  5BT3 A;  5KTU A;  4BW1 A;  5ENE A;  5HFQ A;  1ZS5 A;  5FE8 A;  3I3J A;  5I1Q A;  4MEO A;  4UIZ A;  4MEQ A;  4LDF A;  3P5O A;  3ZYU A;  5F1L A;  5IID A;  5DW1 A;  4YY6 A;  4CFL A;  5I7X A;  4C66 A;  5FE4 A;  4IR6 A;  2R0S A;  3LQJ A;  3UVD A;  5FH6 A;  5J0D A;  4X2I A;  4HBV A;  1WUG A;  4TZ8 A;  4C67 A;  4O7F A;  4J0R A;  3IU5 A;  4LZR A;  2MJV B;  5FG6 A;  5F62 A;  4UIU A;  2D9E A;  5HCL A;  4O76 A;  1X0J A;  4YC9 A;  4YH4 A;  5LJ2 A;  5C7N A;  4NUE A;  2L5E A;  4CUQ A;  3HME A;  4O75 A;  5DYU A;  4N3W A;  5ENC A;  4IR3 A;  5D25 A;  4QSP A;  4QSS A;  5EGU A;  4MR6 A;  2D82 A;  4O7B A;  5I29 A;  5KHM A;  2YDW A;  3P1F A;  4PY6 A;  5DY7 A;  4MEN A;  5HEM A;  1N72 A;  2YEK A;  5L98 A;  5CRM A;  4Y03 A;  4J0S A;  5D3J A;  5D0C A;  5FE5 A;  4UIT A;  4TT4 A;  4YYM A;  3K2J A;  4MEP A;  4ALG A;  5FE2 A;  4CLB A;  4UYE A;  5FG5 A;  5JWM A;  2OO1 A;  5A83 A;  4NR5 A;  5CZG A;  3S92 A;  4LRG A;  5C4Q A;  4HXL A;  4OGI A; 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