4LDFA

Crystal structure of cpbrd2 from cryptosporidium, cgd3_3190
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'KVDLSMNDQIWQLLDTLSRHENAWPFRKPVSIGEASDYYEIIKEPTDIQTMKRKAKNKEYKTLSEFSSELKRMFDNCRFYNAKNTIYTKYANQLEAFIWPMLQTIQE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of CpBRD2 from cryptosporidium, cgd3_3190
rcsb
molecule keywords GCN5 like acetylase + bromodomain
source organism Cryptosporidium parvum
molecule tags Transferase
total genus 42
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ldfA00
4QR3A 5I1QA 5EGUA 2YQDA 4TT6A 4CUQA 2OSSA 5E3GA 4J0SA 4Q0NA 5D3HA 2G4AA 4TS8A 3MB4A 3UVWA 4MR3A 4YAXA 4Z93A 5CFWA 4A9EA 5CUDA 5F63A 2LSPB 4LR6A 5F3AA 5LKZA 3JVLA 5FE6A 4NYVA 5ENBA 4HXOA 3UV4A 5DFBA 3U5KA 4HXLA 4IOQA 5EWCA 4MEOA 4YH3A 3U5OA 3JVJA 5DFDA 2RS9B 4KV4A 5E74A 5CZGA 5L8UA 3D7CA 4UYFB 4QEWA 4KCXA 3Q2FA 4BW4A 4YATA 4TU6A 5COIA 2D9EA 4HBYA 4QSXA 4MENA 5F36A 5EI4A 3S92A 5F1HA 4QSPA 5IIDA 4CUPA 2DVRA 4CL9A 2OUOA 4NUEA 5E9VA 5ENHA 5II2A 4QSUA 4HXPA 4OGJA 4E96A 4PS5A 4PTBA 3IU5A 5DFCA 4QSTA 4OUFA 4TT2A 5D24A 5HQ7A 4QC3A 5J0DA 2YDWA 5EV9A 4A9KA 5I29A 5A82A 5FE9A 5DYAA 3O35A 5G4SA 5FE2A 5DLZA 5HFRA 4BW3A 4TU4A 1JM4B 4J3IA 4O76A 4CURA 4J0RA 4O7CA 3HMEA 4LC2A 5F61A 4HXMA 4YC9A 5HRXA 2DVQA 4N4IA 5E0RA 5BT5A 5CQ6A 4WIVA 4LDFA 2H60A 4A9HA 4YY6A 3LQIA 4ZQLA 4YYIA 3MULA 4QYDA 5FB0A 5DW2A 4PY6A 5IGLA 2MJVB 4NUDA 5HENA 2YEKA 4O71A 4Z1SA 2YYNA 5HRWA 1JSPB 4QB3A 5DLXA 5CQ4A 4QSQA 5EPSA 4N3WA 4UYDA 5HELA 5DW1A 4TZ8A 5KHMA 2FSAA 4NQMA 4YK0A 5EM3A 4HBXA 4QR4A 4CUSA 4Z6IA 4CFLA 4A9MA 4CUUA 3RCWA 4NRCA 4QY4A 5CUGA 5ETBA 5L8TA 5E9KA 3SVHA 3SVFA 5KO4A 4MR6A 4TQNA 2R0YA 5FH8A 4MR5A 5AMFA 4QSSA 4XUAA 4PCEA 5F25A 5FFYA 4YABA 5TB6A 5CS8A 3U5NA 4YBTA 2DVVA 5I86A 2L84A 2DWWA 5CUAA 3UV5A 4RVRA 5CRZA 4C66A 5A5RA 5CRMA 5CUCA 2I8NA 4NR6A 4HXNA 5DX4A 4QUTA 5CQTA 3UVXA 5EICA 3UW9A 5CP5A 5LKXA 5DYUA 5HCLA 4IOOA 4IR4A 4QC1A 5IGKA 5FH7A 4QSVA 1WUMA 2E7OA 4TYLA 5C4QA 4NR8A 3MUKA 3P1CA 4LZSA 3QZSA 5L96A 4UIUA 5D26A 4QBMA 5F1LA 4O72A 5IG6A 4YYHA 4QZSA 2R0SA 5DBMA 5CUEA 4XUBA 4A9FA 5EVAA 2RFJA 3DWYA 4YYKA 4CUTA 5HM0A 5E7DA 5HQ6A 3ONIA 4OGIA 5EISA 2R0VA 5E9YA 4NR9A 3FKMX 4O7FA 4UIVA 5G4RA 5A85A 5E9MA 4QSWA 5FDZA 4YYJA 3P1DA 4NUCA 4KV1A 5D25A 2E3KA 4X2IA 3IU6A 5EU1A 4UYFA 4O7BA 2YELA 3G0JA 3HMHA 5FG5A 4PKLA 3QZTA 3U5MA 5D7XA 2RNYA 3NXBA 4NR4A 4QR5A 4IR3A 4LYIA 5ENEA 4LZ2A 5F2PA 5LKUA 3U5PA 4O74A 4F3IA 4YBSA 4FLPA 5EK9A 5DYCA 5L99A 5C85A 5I40A 4UYEA 1ZS5A 5ENFA 5A83A 5AD3A 4MEQA 4QSRA 5FG6A 3UVYA 3UVDA 3JVKA 4C67A 1N72A 2DKWA 4A9OA 5HEMA 5HJCA 4NYWA 5FFVA 4LYWA 5I89A 2E7NA 5F62A 5EWDA 4ZW1A 5DYXA 5II1A 4BJXA 4PCIA 4BW1A 2WP2A 4A9LA 5D3RA 5ENIA 1E6IA 5E3DA 4TZ2A 4UIWA 5C87A 4N4FA 5CQAA 4IR5A 3U5LA 5CTLA 4YADA 4YH4A 5C8GA 5EPRA 2F6NA 5H1UA 4UYGA 3LQJA 4YBMA 2NXBA 4BHWA 3O33A 4NR7A 4DONA 2RNWA 2DATA 4NS5A 2OO1A 4YYNA 2L5EA 3O37A 5H1TA 5I7XA 4TTEA 5EWHA 2L85A 3S91A 4AKNA 5ENCA 3P1EA 5AMEA 2N9GA 3MQMA 5D3PA 2RNXA 5EP7A 5LUUA 5D3TA 3ZYUA 2YEMA 4LZRA 5I88A 4MEPA 5TCMA 3O34A 5CY9A 5CQ3A 3P1FA 3P5OA 4A9NA 5L98A 5KU3A 5FE1A 4IR6A 4Z1QA 5D3NA 3LQHA 5I80A 5KTXA 4GPJA 5CQ5A 5D3JA 5IGMA 5DKHA 5JWMA 5H85A 4HBWA 2R10A 3TLPA 5HLSA 4NXJA 4O7AA 5F60A 4ALGA 1F68A 5DKCA 4XY8A 5EA1A 4NYXA 4WHWA 4O77A 3U5JA 5KTUA 3G0LA 4Y03A 5JI8A 4ALHA 5E9IA 2GRCA 5D3LA 3DAIA 4YYDA 5FFWA 5AD2A 4YYGA 4MR4A 4UIXA 5FH6A 4XY9A 4HBVA 2RO1A 3QZVA 5EWVA 4Q0OA 4BW2A 5FE8A 2F6JA 5C89A 4N4GA 5IGNA 5LVRA 5CUBA 4O70A 4UYHA 5HQ5A 4UIZA 5H1VA 3JVMA 4NR5A 4Z6HA 5D3SA 5A5SA 2I7KA 3O36A 4HXKA 5HFQA 3GG3A 5CQ8A 3SVGA 5DY7A 1WUGA 4O78A 5ENGA 5A5NA 2D82A 5FG4A 5E73A 5LVQA 4A9IA 5EQ1A 4UITA 5FE5A 4QNSA 5CPEA 3K2JA 2YW5A 1EQFA 5A5OA 5KTWA 4QEVA 5FE3A 5BT3A 4YY4A 5FBXA 4A9JA 4N4HA 3AADA 5C7NA 5CU8A 4HXRA 2RI7A 5CGPA 5FE4A 4QEUA 2WP1A 4WHUA 5L97A 5E9LA 4TT4A 5K29A 3I3JA 3LXJA 5IBNA 5ETDA 5ACYA 2KTBB 3MXFA 5CQ7A 5EPBA 5BT4A 4O75A 4UIYA 4J1PA 5A7CA 4QUUA 5A5QA 1X0JA 4CFKA 4YYMA 4NRBA 5FE0A 3Q2EA 4CLBA 5EWWA 4QYLA 4ZC9A 5LJ2A 3MB3A 5A5PA 5D0CA 5A81A 4XYAA 4O7EA 5LJ0A 4LRGA 5I7YA 5LKTA 5I83A 4IORA 4NQNA 5FB1A 2DVSA 4LYSA 4NRAA 5ENJA 3AQAA 3HMFA 5F5ZA 3LJWA 5DKDA 5LJ1A 5HRVA 4HXSA 5FE7A 3UV2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QR3A 5I1QA 5EGUA 2YQDA 4TT6A 4CUQA 2OSSA 5E3GA 4J0SA 4Q0NA 5D3HA 2G4AA 4TS8A 3MB4A 3UVWA 4MR3A 4YAXA 4Z93A 5CFWA 4A9EA 5CUDA 5F63A 2LSPB 4LR6A 5F3AA 5LKZA 3JVLA 5FE6A 4NYVA 5ENBA 4HXOA 3UV4A 5DFBA 3U5KA 4HXLA 4IOQA 5EWCA 4MEOA 4YH3A 3U5OA 3JVJA 5DFDA 2RS9B 4KV4A 5E74A 5CZGA 5L8UA 3D7CA 4UYFB 4QEWA 4KCXA 3Q2FA 4BW4A 4YATA 4TU6A 5COIA 2D9EA 4HBYA 4QSXA 4MENA 5F36A 5EI4A 3S92A 5F1HA 4QSPA 5IIDA 4CUPA 2DVRA 4CL9A 2OUOA 4NUEA 5E9VA 5ENHA 5II2A 4QSUA 4HXPA 4OGJA 4E96A 4PS5A 4PTBA 3IU5A 5DFCA 4QSTA 4OUFA 4TT2A 5D24A 5HQ7A 4QC3A 5J0DA 2YDWA 5EV9A 4A9KA 5I29A 5A82A 5FE9A 5DYAA 3O35A 5G4SA 5FE2A 5DLZA 5HFRA 4BW3A 4TU4A 4AKHA 1JM4B 4AI6A 4J3IA 4O76A 4CURA 4J0RA 4O7CA 3HMEA 4LC2A 5F61A 4HXMA 4YC9A 5HRXA 2DVQA 4N4IA 5E0RA 5BT5A 5CQ6A 4WIVA 4LDFA 2H60A 4A9HA 4YY6A 3LQIA 4ZQLA 4YYIA 3MULA 4QYDA 5FB0A 5DW2A 4PY6A 5IGLA 2MJVB 4NUDA 5HENA 2YEKA 4O71A 4Z1SA 2YYNA 5HRWA 1JSPB 4QB3A 5DLXA 5CQ4A 4QSQA 5EPSA 4N3WA 4UYDA 5HELA 5DW1A 4TZ8A 5KHMA 2FSAA 4AKIA 4NQMA 4YK0A 5EM3A 4HBXA 4QR4A 4CUSA 4Z6IA 4CFLA 4A9MA 1PUOA 4CUUA 3RCWA 4NRCA 4QY4A 5CUGA 5ETBA 5L8TA 5E9KA 3SVHA 3SVFA 5KO4A 4MR6A 4TQNA 2R0YA 5FH8A 4MR5A 5AMFA 4QSSA 4XUAA 2EJNA 4AKGA 4PCEA 5F25A 5FFYA 4YABA 5TB6A 5CS8A 3U5NA 4YBTA 2DVVA 5I86A 2L84A 2DWWA 5CUAA 3UV5A 4RVRA 5CRZA 4C66A 5A5RA 5CRMA 5CUCA 2I8NA 4NR6A 4HXNA 5DX4A 4QUTA 5CQTA 3UVXA 5EICA 3UW9A 5CP5A 5LKXA 5DYUA 5HCLA 4IOOA 4IR4A 4QC1A 5IGKA 5FH7A 4QSVA 1WUMA 2E7OA 4TYLA 5C4QA 4NR8A 3MUKA 3P1CA 4LZSA 3QZSA 5L96A 4UIUA 5D26A 4QBMA 5F1LA 4O72A 5IG6A 4YYHA 4QZSA 2R0SA 5DBMA 5CUEA 4XUBA 4A9FA 5EVAA 2RFJA 3DWYA 4YYKA 4CUTA 5HM0A 5E7DA 5HQ6A 3ONIA 4OGIA 5EISA 2R0VA 5E9YA 4NR9A 3FKMX 4O7FA 4UIVA 5G4RA 5A85A 5E9MA 4QSWA 5FDZA 4YYJA 3P1DA 4NUCA 4KV1A 5D25A 2E3KA 4X2IA 3IU6A 5EU1A 4UYFA 4O7BA 2YELA 3G0JA 3HMHA 5FG5A 4PKLA 3QZTA 3U5MA 5D7XA 2RNYA 3NXBA 4NR4A 4QR5A 4IR3A 4LYIA 5ENEA 4LZ2A 5F2PA 5LKUA 3U5PA 4O74A 4F3IA 4YBSA 4FLPA 5EK9A 5DYCA 5L99A 5C85A 5I40A 4UYEA 1ZS5A 5ENFA 5A83A 5AD3A 4MEQA 4QSRA 5FG6A 3UVYA 3UVDA 3JVKA 4C67A 1N72A 2DKWA 4A9OA 5HEMA 5HJCA 4NYWA 5FFVA 4LYWA 5I89A 2E7NA 5F62A 5EWDA 4ZW1A 5DYXA 5II1A 4BJXA 4PCIA 4BW1A 2WP2A 4A9LA 5D3RA 5ENIA 1E6IA 5E3DA 4TZ2A 4UIWA 5C87A 4N4FA 5CQAA 4IR5A 3U5LA 5CTLA 4YADA 4YH4A 5C8GA 5EPRA 2F6NA 5H1UA 4UYGA 3LQJA 4YBMA 2NXBA 4BHWA 3D1BA 3O33A 4NR7A 4DONA 2RNWA 2DATA 4NS5A 2OO1A 4YYNA 2L5EA 3O37A 5H1TA 5I7XA 4TTEA 5EWHA 2L85A 3S91A 4AKNA 5ENCA 3P1EA 5AMEA 2N9GA 3MQMA 5D3PA 2RNXA 5EP7A 5LUUA 5D3TA 3ZYUA 2YEMA 4LZRA 5I88A 4MEPA 5TCMA 3O34A 5CY9A 5CQ3A 3P1FA 3P5OA 4A9NA 5L98A 5KU3A 5FE1A 4IR6A 4Z1QA 5D3NA 3LQHA 5I80A 5KTXA 4GPJA 5CQ5A 5D3JA 5IGMA 5DKHA 5JWMA 5H85A 4HBWA 2R10A 3TLPA 5HLSA 4NXJA 4O7AA 5F60A 4ALGA 1F68A 5DKCA 4XY8A 5EA1A 4NYXA 4WHWA 4O77A 3U5JA 5KTUA 3G0LA 4Y03A 5JI8A 4ALHA 5E9IA 2GRCA 5D3LA 3DAIA 4YYDA 5FFWA 5AD2A 4YYGA 4MR4A 4UIXA 5FH6A 4XY9A 4HBVA 3VKGA 2RO1A 3QZVA 5EWVA 4Q0OA 4BW2A 5FE8A 2F6JA 5C89A 4N4GA 5IGNA 5LVRA 5CUBA 4O70A 3VKHA 4UYHA 5HQ5A 4UIZA 5H1VA 3JVMA 4NR5A 4Z6HA 5D3SA 5A5SA 2I7KA 3O36A 4HXKA 5HFQA 3GG3A 5CQ8A 3SVGA 5DY7A 1WUGA 4O78A 5ENGA 5A5NA 2D82A 5FG4A 5E73A 5LVQA 4A9IA 5EQ1A 4UITA 5FE5A 4QNSA 5CPEA 1ZKRA 3K2JA 2YW5A 1EQFA 5A5OA 5KTWA 4QEVA 5FE3A 5BT3A 4YY4A 5FBXA 4A9JA 4N4HA 3AADA 5C7NA 5CU8A 4HXRA 2RI7A 5CGPA 5FE4A 4QEUA 2WP1A 4WHUA 5L97A 5E9LA 4TT4A 5K29A 3I3JA 3LXJA 5IBNA 5ETDA 5ACYA 2KTBB 3MXFA 5CQ7A 5EPBA 5BT4A 4O75A 4UIYA 4J1PA 5A7CA 4QUUA 5A5QA 1X0JA 4CFKA 4YYMA 4NRBA 3ERRA 5FE0A 3Q2EA 4CLBA 5EWWA 4QYLA 4ZC9A 5LJ2A 3MB3A 5A5PA 5D0CA 5A81A 4XYAA 4O7EA 5LJ0A 4LRGA 5I7YA 5LKTA 5I83A 4IORA 4NQNA 5FB1A 2DVSA 4LYSA 4NRAA 5ENJA 3AQAA 3D1DA 3HMFA 5F5ZA 3LJWA 5DKDA 5LJ1A 5HRVA 4HXSA 5FE7A 3UV2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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