4LDFA

Crystal structure of cpbrd2 from cryptosporidium, cgd3_3190
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
KVDLSMNDQIWQLLDTLSRHENAWPFRKPVSIGEASDYYEIIKEPTDIQTMKRKAKNKEYKTLSEFSSELKRMFDNCRFYNAKNTIYTKYANQLEAFIWPMLQTIQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords GCN5 like acetylase + bromodomain
publication title Crystal Structure of CpBRD2 from cryptosporidium, cgd3_3190
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 42
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ldfA00
2YQDA 2DVQA 4N4GA 5L97A 5AD2A 4O70A 3HMEA 4J1PA 5ENEA 5CQ6A 4YH4A 5ENHA 5H1UA 5E9VA 2DVRA 5EPBA 5KTXA 5HQ7A 5DYAA 4NXJA 3MB4A 4UIZA 3LQJA 4QSUA 4TT2A 5FE8A 4HXKA 4NR8A 5BT3A 3U5NA 5HELA 5I40A 4UIYA 5CQ4A 5C85A 4LZ2A 5CS8A 5E7DA 5DW2A 4CLBA 5I1QA 4HXPA 4YADA 3JVMA 3I3JA 4LC2A 5DLZA 5KU3A 3P1CA 5D3RA 4PKLA 2R0VA 4HXOA 4O7CA 4QSWA 5DLXA 5DYCA 3ONIA 5EICA 2LSPB 4IR3A 4YBSA 3O36A 5FE0A 4QSSA 3U5JA 4XY9A 2E3KA 5FB1A 5F62A 4Y03A 2YYNA 3DAIA 4XYAA 5CZGA 1JM4B 4PCEA 4O7BA 3O33A 5EISA 5F1LA 5D25A 5CGPA 5J0DA 5D26A 5HLSA 3JVJA 5AD3A 1F68A 5EQ1A 4HXRA 4PY6A 4ZC9A 4NUCA 2RNYA 4KV4A 5CQAA 2WP2A 4YATA 4LRGA 5DBMA 5EGUA 3LJWA 4HBXA 4HBWA 3G0LA 3RCWA 4CUPA 5HQ5A 4CL9A 4C67A 4MEQA 4NYXA 5CRZA 4NR5A 2I7KA 4QYDA 5HFQA 5AMFA 5I80A 2GRCA 4TTEA 4NR7A 4IORA 4QEWA 2R0YA 4Q0NA 5CP5A 3UW9A 3QZVA 5HRVA 4XUAA 5LJ0A 4BW2A 4NS5A 4MR6A 4PS5A 4TU4A 2H60A 4OGIA 2RS9B 5ENCA 4YY4A 5LUUA 2DATA 4A9JA 4N4FA 3DWYA 4AKNA 5CY9A 5E73A 3HMFA 4NUDA 4CUQA 5EPRA 4HXLA 5E3DA 4KV1A 3LQHA 5KHMA 3UVDA 4LYSA 2F6JA 4QSPA 4O7AA 5H85A 3AADA 4CUSA 4YC9A 4A9EA 5D3SA 3P1EA 3JVKA 4LDFA 5IGNA 4WHUA 5EWHA 5FG6A 2WP1A 5F60A 3QZSA 2DWWA 2RNXA 4GPJA 3O37A 2R10A 5ENBA 4LZRA 5HEMA 2YEKA 4OUFA 5EK9A 4UITA 2DVVA 5LJ1A 4QNSA 5KO4A 4IR6A 4BW1A 4X2IA 4LYIA 2D9EA 2OSSA 4QUTA 4LR6A 5CRMA 3MUKA 4HXNA 4MR3A 4YAXA 5F5ZA 5A7CA 2OUOA 4UYFB 5F1HA 4UYHA 5DFDA 5D3PA 5E3GA 4YYNA 5F25A 2DKWA 4ALHA 4UYFA 3K2JA 4UYEA 5DYXA 3MB3A 3U5OA 5D0CA 5I7YA 5E74A 4TS8A 5ENIA 4NR4A 5FBXA 4TQNA 4UIVA 4UIXA 5DY7A 5EWVA 3MXFA 5E9IA 5FH7A 4BW3A 4QSXA 5A5OA 5D3TA 4YYKA 4YBTA 5LKTA 5KTWA 5ACYA 5LVQA 5E0RA 5D3LA 5FFVA 1ZS5A 5FFWA 5D7XA 4YYGA 4YBMA 4UIWA 5EU1A 4NYWA 1X0JA 4NRAA 4IR4A 4O7EA 5FE4A 3U5PA 4NQNA 4QC1A 4F3IA 2MJVB 4C66A 3U5MA 4QR4A 2NXBA 5TCMA 4YYJA 3MULA 5FE2A 5LKZA 4CFLA 4O72A 5EM3A 1JSPB 4PTBA 4YH3A 3UVWA 5LKXA 3G0JA 4J0RA 5D3NA 4MR4A 5DYUA 5CPEA 5EA1A 4YYIA 4Z1SA 3O34A 5II2A 3SVGA 3AQAA 2L85A 5CUEA 5FE5A 5KTUA 4IOQA 5FDZA 4TZ2A 5FE1A 3TLPA 5L8UA 3FKMX 4XUBA 5LVRA 3QZTA 3Q2EA 4NR6A 4UYGA 4YY6A 4HXSA 4DONA 2YEMA 4OGJA 5CQTA 2FSAA 5BT5A 4N3WA 5EWDA 5C89A 5A5SA 3ZYUA 4QUUA 4O71A 3GG3A 5JWMA 5A81A 4QEUA 4BJXA 5A5QA 5E9LA 4A9FA 1E6IA 4NRBA 3JVLA 1N72A 4YYDA 5D24A 5I88A 3P1DA 4NYVA 4MR5A 4O76A 5IIDA 5DKDA 4HBVA 4IOOA 5FE9A 4WHWA 4FLPA 5D3HA 5EVAA 2RI7A 5FE6A 4CURA 4XY8A 5HCLA 4QBMA 4CUUA 2RNWA 4HBYA 3SVFA 4NRCA 5IGLA 5ENFA 4NR9A 5F61A 2RFJA 4O7FA 4O75A 4YYMA 4UYDA 5HQ6A 1EQFA 5FB0A 4YABA 2G4AA 4ZQLA 3P5OA 2I8NA 2YDWA 5C8GA 4YK0A 5E9YA 3UV5A 5I29A 5L96A 2YW5A 3LXJA 5CQ7A 5EWWA 3UV2A 2R0SA 5IG6A 4ALGA 5LJ2A 4QSQA 4QY4A 2E7OA 4IR5A 5G4SA 4ZW1A 5FH6A 5EP7A 1WUGA 3P1FA 5CQ3A 4TYLA 4QR5A 3D7CA 5EI4A 5CU8A 5IBNA 5CUDA 5H1TA 4A9OA 4A9HA 5BT4A 3UVXA 5I86A 4O77A 2F6NA 5COIA 4Z6HA 5EPSA 5A5NA 4PCIA 5DFBA 4YYHA 5CTLA 2DVSA 2YELA 5CQ5A 5F2PA 5CFWA 4RVRA 4KCXA 3S91A 4TU6A 5CUAA 5ETDA 4BW4A 5HENA 5FE7A 4A9MA 4Z6IA 5A83A 4J3IA 4QSTA 3IU6A 5C4QA 5HFRA 4CUTA 4CFKA 2D82A 4N4IA 3U5KA 4QYLA 5DX4A 4MEOA 5FG4A 4Z1QA 5CQ8A 4A9LA 5EV9A 5A5PA 5E9MA 3SVHA 5I83A 5ENJA 3IU5A 5L8TA 4MENA 4O78A 5ENGA 5H1VA 3LQIA 4QEVA 5EWCA 5CUGA 5A85A 5IGMA 4MEPA 5FE3A 5ETBA 5JI8A 5D3JA 5II1A 4A9NA 5HM0A 4LZSA 4WIVA 4BHWA 5AMEA 5CUCA 5DKCA 2N9GA 3U5LA 5F3AA 5DFCA 3O35A 4QC3A 5IGKA 4UIUA 5HJCA 5A82A 5DW1A 5DKHA 5FFYA 5E9KA 5TB6A 5L99A 5C87A 4A9KA 3Q2FA 3HMHA 5F36A 3MQMA 5I7XA 4QSRA 2L84A 4QB3A 3UV4A 1WUMA 4TZ8A 2RO1A 4O74A 2L5EA 5A5RA 5G4RA 4QSVA 2KTBB 4E96A 4NQMA 4Q0OA 3S92A 5CUBA 4TT6A 5F63A 4TT4A 3UVYA 5HRWA 5HRXA 4NUEA 2E7NA 4N4HA 4HXMA 5L98A 4A9IA 2OO1A 5C7NA 4J0SA 4LYWA 4Z93A 5FH8A 5I89A 4QR3A 3NXBA 4QZSA 5K29A 5FG5A 5LKUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YQDA 2DVQA 4N4GA 5L97A 5AD2A 4O70A 3HMEA 4J1PA 5ENEA 5CQ6A 4YH4A 5ENHA 5H1UA 5E9VA 2DVRA 5EPBA 5KTXA 5HQ7A 5DYAA 4NXJA 3MB4A 4UIZA 3LQJA 4QSUA 4TT2A 5FE8A 4HXKA 4NR8A 5BT3A 3U5NA 5HELA 5I40A 4UIYA 5CQ4A 5C85A 4LZ2A 5CS8A 5E7DA 5DW2A 4CLBA 5I1QA 4HXPA 4YADA 3JVMA 3I3JA 4LC2A 5DLZA 5KU3A 3P1CA 5D3RA 4PKLA 2R0VA 4HXOA 4O7CA 4QSWA 5DLXA 5DYCA 3ONIA 5EICA 3D1BA 2LSPB 4IR3A 4YBSA 3O36A 5FE0A 4QSSA 3U5JA 4XY9A 2E3KA 5FB1A 5F62A 4Y03A 2YYNA 3DAIA 4XYAA 5CZGA 1JM4B 4PCEA 4O7BA 3O33A 5EISA 5F1LA 5D25A 5CGPA 5J0DA 5D26A 5HLSA 3JVJA 5AD3A 1F68A 5EQ1A 4HXRA 4PY6A 4ZC9A 4NUCA 3VKHA 2RNYA 4KV4A 5CQAA 2WP2A 4YATA 4LRGA 5DBMA 5EGUA 3LJWA 4HBXA 4HBWA 3G0LA 3RCWA 4CUPA 5HQ5A 4CL9A 4C67A 4MEQA 4NYXA 5CRZA 4NR5A 2I7KA 4QYDA 5HFQA 5AMFA 5I80A 2GRCA 4TTEA 4NR7A 4IORA 4QEWA 2R0YA 4Q0NA 5CP5A 3UW9A 2EJNA 3QZVA 5HRVA 4XUAA 5LJ0A 4BW2A 4NS5A 4MR6A 4PS5A 4TU4A 2H60A 4OGIA 2RS9B 5ENCA 4YY4A 5LUUA 2DATA 4A9JA 4N4FA 3DWYA 4AKNA 5CY9A 5E73A 3HMFA 4NUDA 4CUQA 5EPRA 4HXLA 5E3DA 4KV1A 3LQHA 5KHMA 3UVDA 4LYSA 2F6JA 4AKGA 4QSPA 4O7AA 5H85A 3AADA 4CUSA 4YC9A 4A9EA 5D3SA 3P1EA 3JVKA 4LDFA 5IGNA 4WHUA 5EWHA 5FG6A 2WP1A 5F60A 3QZSA 2DWWA 2RNXA 4GPJA 3O37A 2R10A 5ENBA 4LZRA 5HEMA 2YEKA 4OUFA 5EK9A 4UITA 2DVVA 5LJ1A 4QNSA 5KO4A 4IR6A 4BW1A 4X2IA 4LYIA 2D9EA 2OSSA 4QUTA 4LR6A 5CRMA 3MUKA 4HXNA 4MR3A 4YAXA 5F5ZA 5A7CA 2OUOA 4UYFB 5F1HA 4UYHA 5DFDA 5D3PA 5E3GA 4YYNA 5F25A 2DKWA 4ALHA 4UYFA 3K2JA 4UYEA 5DYXA 3MB3A 3U5OA 5D0CA 5I7YA 5E74A 4TS8A 5ENIA 4NR4A 5FBXA 4TQNA 4UIVA 4UIXA 5DY7A 5EWVA 3MXFA 5E9IA 5FH7A 4BW3A 4QSXA 5A5OA 5D3TA 4YYKA 4YBTA 5LKTA 5KTWA 5ACYA 5LVQA 5E0RA 5D3LA 5FFVA 1ZS5A 5FFWA 5D7XA 4YYGA 4YBMA 4UIWA 5EU1A 4NYWA 1X0JA 1PUOA 4NRAA 4IR4A 4O7EA 5FE4A 3U5PA 4NQNA 4QC1A 4F3IA 2MJVB 4C66A 3U5MA 4QR4A 2NXBA 5TCMA 4YYJA 3MULA 5FE2A 5LKZA 4AI6A 4CFLA 4O72A 5EM3A 1JSPB 4PTBA 4YH3A 3UVWA 5LKXA 3G0JA 4J0RA 5D3NA 4MR4A 5DYUA 5CPEA 5EA1A 4YYIA 4Z1SA 3O34A 5II2A 3SVGA 3AQAA 2L85A 5CUEA 5FE5A 5KTUA 4IOQA 5FDZA 4TZ2A 5FE1A 3TLPA 5L8UA 3FKMX 4XUBA 5LVRA 3QZTA 3Q2EA 4NR6A 4UYGA 4YY6A 4HXSA 4DONA 2YEMA 4OGJA 5CQTA 2FSAA 5BT5A 4N3WA 5EWDA 5C89A 5A5SA 3ZYUA 4QUUA 4O71A 3ERRA 3GG3A 5JWMA 5A81A 4QEUA 4BJXA 5A5QA 5E9LA 4A9FA 1E6IA 4NRBA 3JVLA 1N72A 4YYDA 5D24A 5I88A 3P1DA 4NYVA 4MR5A 4O76A 5IIDA 5DKDA 4HBVA 4IOOA 5FE9A 4WHWA 4FLPA 5D3HA 5EVAA 2RI7A 5FE6A 4CURA 4XY8A 5HCLA 4QBMA 4CUUA 2RNWA 4HBYA 3SVFA 4NRCA 5IGLA 5ENFA 4NR9A 5F61A 2RFJA 4O7FA 4O75A 4YYMA 4UYDA 5HQ6A 1EQFA 5FB0A 4YABA 2G4AA 4ZQLA 3P5OA 2I8NA 2YDWA 5C8GA 4YK0A 5E9YA 3UV5A 5I29A 5L96A 2YW5A 3LXJA 5CQ7A 5EWWA 3UV2A 2R0SA 5IG6A 4ALGA 5LJ2A 4QSQA 4QY4A 2E7OA 4IR5A 5G4SA 4ZW1A 5FH6A 5EP7A 1WUGA 3P1FA 3D1DA 5CQ3A 4TYLA 4QR5A 3D7CA 5EI4A 5CU8A 5IBNA 5CUDA 5H1TA 4A9OA 4A9HA 5BT4A 3UVXA 5I86A 4O77A 2F6NA 5COIA 4Z6HA 5EPSA 5A5NA 4PCIA 5DFBA 4YYHA 5CTLA 2DVSA 2YELA 5CQ5A 5F2PA 5CFWA 4RVRA 4KCXA 1ZKRA 3S91A 4TU6A 5CUAA 5ETDA 4BW4A 5HENA 5FE7A 4A9MA 4Z6IA 5A83A 4J3IA 4QSTA 3IU6A 5C4QA 5HFRA 4CUTA 4CFKA 2D82A 4N4IA 3U5KA 4QYLA 5DX4A 4MEOA 5FG4A 4Z1QA 5CQ8A 4A9LA 5EV9A 5A5PA 5E9MA 3SVHA 5I83A 5ENJA 3IU5A 5L8TA 4MENA 4O78A 5ENGA 5H1VA 3LQIA 4QEVA 5EWCA 5CUGA 5A85A 5IGMA 4MEPA 5FE3A 5ETBA 5JI8A 5D3JA 5II1A 4A9NA 5HM0A 4LZSA 4WIVA 4BHWA 5AMEA 5CUCA 5DKCA 2N9GA 3U5LA 5F3AA 5DFCA 3O35A 4QC3A 5IGKA 4UIUA 5HJCA 5A82A 5DW1A 5DKHA 5FFYA 5E9KA 5TB6A 5L99A 5C87A 4A9KA 3Q2FA 3HMHA 5F36A 3MQMA 5I7XA 4QSRA 2L84A 4QB3A 3UV4A 1WUMA 4TZ8A 2RO1A 4O74A 2L5EA 5A5RA 5G4RA 4QSVA 4AKHA 2KTBB 4E96A 4NQMA 4Q0OA 3S92A 5CUBA 4TT6A 5F63A 4TT4A 3UVYA 5HRWA 5HRXA 4NUEA 2E7NA 4N4HA 4HXMA 5L98A 4A9IA 2OO1A 3VKGA 5C7NA 4J0SA 4LYWA 4Z93A 4AKIA 5FH8A 5I89A 4QR3A 3NXBA 4QZSA 5K29A 5FG5A 5LKUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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