2OO1A

Crystal structure of the bromo domain 2 of human bromodomain containing protein 3 (brd3)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
KLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2oo1A00
5F1LA 4O7AA 5F25A 5FG5A 5LKXA 5I86A 4A9EA 2DWWA 4NS5A 5COIA 3JVLA 5EPRA 5ENGA 1JSPB 5TB6A 4A9HA 5EK9A 3HMHA 3K2JA 5DYCA 5E9LA 4TQNA 5DX4A 4YC9A 2DATA 4IR4A 4TT4A 5A5RA 4ZQLA 4BW1A 2L5EA 4LZSA 5ETDA 4MR6A 4HXPA 5I7YA 5IGLA 4MEOA 5LJ0A 5CQ7A 4PY6A 4TS8A 5DFBA 4Z1SA 3O37A 5A5OA 4YADA 3O35A 4YY6A 3Q2EA 4WIVA 5D25A 4O78A 4HBWA 5CQTA 4QSQA 4YYGA 3MB4A 3U5JA 4UYDA 2R10A 4XY8A 5H1TA 5HM0A 2YDWA 5DFCA 2N9GA 5F5ZA 4CURA 4HXNA 5ENIA 5CQ5A 4O77A 4Z6IA 4CUSA 3U5LA 4QY4A 5LJ1A 5IBNA 2E7OA 5FFWA 4A9JA 2E7NA 5D3PA 1JM4B 5L97A 5A5PA 4QZSA 5G4SA 4NRBA 4TU6A 4CL9A 5CUAA 5CQ3A 3QZVA 4C66A 2YQDA 4LRGA 5EU1A 4LZRA 4QB3A 3JVMA 3O33A 4QEVA 3LXJA 4OGJA 5FH7A 4UIVA 5HRWA 3ZYUA 2YYNA 4QSPA 5KHMA 5ENCA 5AMEA 5I80A 2WP2A 4O7EA 5FBXA 4HBYA 4O7CA 5DY7A 3MXFA 5CUCA 5E0RA 4TZ2A 5L99A 3UV2A 4YATA 4QSSA 4Z1QA 5E73A 4KV1A 4KV4A 3SVHA 5DYUA 5LVRA 4MEQA 5FE7A 5A83A 4CFKA 4CFLA 4A9KA 5FB0A 5HLSA 5A7CA 4UYGA 5A5QA 4GPJA 3TLPA 3U5OA 1WUMA 3ONIA 5FE6A 5A5SA 4YYMA 3RCWA 4MENA 5EGUA 5EISA 5AD2A 1E6IA 5A81A 4QSRA 5AD3A 5FE0A 4O75A 4NR4A 5HENA 5KTWA 4YH3A 5I88A 3FKMX 5CU8A 3HMEA 2DVQA 4O70A 5EM3A 4O72A 5AMFA 5IIDA 3DAIA 5ETBA 4F3IA 3UVYA 5CTLA 2RI7A 3D7CA 5KU3A 2DVSA 2D9EA 5HQ7A 4BW3A 3U5PA 4QSTA 5A85A 5E9MA 3IU6A 4MR5A 3G0JA 5DW2A 4A9OA 2R0YA 5E74A 3LQIA 4Y03A 4NUCA 5D3LA 5HEMA 5HFRA 3O36A 5E7DA 5BT5A 5CUDA 5D3TA 4XYAA 5FE4A 5D3NA 5E3GA 4HBXA 4C67A 5F1HA 5L8UA 4O71A 5D26A 4QNSA 4UIZA 5F36A 4BW2A 5I89A 5L96A 2F6NA 5HRXA 5EPBA 3AQAA 5CGPA 4J3IA 5F2PA 3S92A 4NR8A 2RNXA 2MJVB 5C4QA 4NYXA 4QUUA 4XY9A 4PTBA 5EV9A 5HCLA 4A9MA 2I8NA 4N4FA 4YBTA 5CQ8A 5JWMA 5FB1A 4HBVA 5IGMA 4NR6A 4TT2A 5I40A 4HXLA 5ENEA 1WUGA 2I7KA 4LYSA 3SVFA 3U5MA 5BT3A 3QZTA 5FFYA 4QR3A 2LSPB 4LYIA 4N4IA 4NRAA 4RVRA 3P1CA 4IOQA 4J0RA 4Z93A 5FE5A 5LJ2A 2L84A 3SVGA 5I83A 4MEPA 4FLPA 4PS5A 5ENBA 4IR5A 5FE9A 4O76A 4NRCA 5KTUA 4TYLA 4A9LA 4Z6HA 5C7NA 5LKTA 5KTXA 5HELA 2L85A 5FE3A 4MR3A 4NXJA 5EWVA 5I7XA 5LUUA 5HRVA 5K29A 5CP5A 5A82A 4YYNA 2D82A 5KO4A 4O7FA 4QUTA 4UIUA 4YBMA 5CQ6A 4YYIA 3MB3A 4HXSA 5CUEA 4CLBA 4QEUA 3G0LA 5E9IA 4NR7A 5CS8A 1X0JA 5F3AA 2YEKA 5ENJA 5TCMA 5F62A 3P5OA 5DKCA 4HXRA 4ZW1A 3P1FA 5C85A 3O34A 5IG6A 3U5NA 2R0SA 4UITA 4PKLA 4TU4A 5H1UA 5D24A 4UYEA 5DFDA 5EWHA 3P1DA 4N4HA 4CUUA 4ALGA 5IGNA 3JVJA 2RNWA 4YBSA 4QBMA 4WHWA 5CUBA 5II1A 5BT4A 2DKWA 4IR6A 5HJCA 5DKDA 5C87A 4OUFA 3UV5A 4XUBA 5CY9A 5FDZA 2FSAA 5FE2A 2E3KA 5EI4A 5ENHA 2G4AA 2OUOA 5EVAA 4O7BA 5E9KA 5EICA 5ACYA 5F61A 2YW5A 4NUDA 5HQ5A 5CUGA 3S91A 3UW9A 4YY4A 5H1VA 5HFQA 3U5KA 5FH8A 3QZSA 4NQNA 2GRCA 4LYWA 1EQFA 5G4RA 5D3JA 3UVDA 4DONA 5DKHA 4UIWA 4QR4A 4QSUA 5D0CA 3LQJA 4E96A 4NUEA 5F60A 4LR6A 5D7XA 3Q2FA 2DVRA 5FFVA 5FH6A 4NR9A 3GG3A 4ALHA 5I1QA 5ENFA 3NXBA 4QSXA 4N3WA 5CQAA 4YK0A 4O74A 4J1PA 3JVKA 4QYLA 5EQ1A 4BW4A 2OO1A 4HXOA 5F63A 2RNYA 5EA1A 4TTEA 5C89A 4QYDA 4QSVA 5CFWA 4BHWA 4HXMA 5CZGA 4WHUA 5CRMA 5CPEA 5A5NA 5LKUA 2WP1A 2DVVA 3I3JA 4UIYA 3UVXA 4UYFB 4QR5A 2H60A 4YYJA 5EWDA 4QEWA 4BJXA 1F68A 4PCIA 4XUAA 5FG6A 2RO1A 5CQ4A 3LJWA 4LZ2A 5H85A 4YYHA 5D3HA 5L8TA 5L98A 5EWCA 2RFJA 5CRZA 4J0SA 4A9IA 5LKZA 5IGKA 5DYXA 4QC3A 4TT6A 5II2A 3P1EA 3HMFA 5JI8A 5EPSA 3MULA 4YAXA 4CUQA 5C8GA 4UYHA 4OGIA 2KTBB 2YEMA 5FG4A 4UIXA 4A9FA 5HQ6A 4YYDA 4MR4A 5D3SA 4A9NA 4YYKA 2NXBA 5E3DA 4AKNA 5EWWA 4UYFA 2RS9B 4IOOA 4LC2A 5DLXA 5E9VA 5FE1A 5E9YA 4PCEA 4N4GA 3UVWA 4ZC9A 4NQMA 3LQHA 4YABA 3DWYA 2YELA 3MUKA 4IR3A 5FE8A 4TZ8A 3AADA 4NR5A 2R0VA 4NYWA 5DW1A 4CUTA 5D3RA 2F6JA 4KCXA 5DBMA 5LVQA 4Q0OA 4QC1A 5DLZA 4QSWA 4X2IA 3IU5A 4Q0NA 4LDFA 4NYVA 1ZS5A 5EP7A 4YH4A 4IORA 3MQMA 5J0DA 4CUPA 1N72A 2OSSA 4HXKA 5DYAA 5I29A 3UV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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