4QR4A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr4A01
4HXNA 5II1A 4NR4A 4LZRA 1WUMA 5A5SA 4QSTA 5EP7A 4QY4A 4YYGA 5AD3A 2RNYA 4MENA 5CQ3A 2OSSA 4O70A 4CL9A 5D3HA 3LQIA 4MEPA 3U5MA 4TQNA 2DVRA 3HMHA 5EPRA 2YYNA 4CFKA 5L99A 3NXBA 5CQ5A 5HJCA 4ALGA 3SVHA 4BHWA 5FH6A 3LXJA 4MEOA 4TU6A 5EISA 4MR5A 4NXJA 4TYLA 5A81A 3SVFA 5HQ5A 5DYCA 4XY8A 5LJ0A 5C87A 5FE2A 5AMEA 4BW4A 3QZTA 4E96A 4N3WA 4O7CA 4UITA 5LKUA 4QSXA 5EI4A 5EWVA 4O71A 5K29A 3RCWA 3O36A 2WP1A 4LR6A 4PY6A 4WHUA 5D24A 4MR6A 5FB0A 5FG6A 4BW3A 3AQAA 4IR6A 5CS8A 3LJWA 3U5PA 4NRAA 5F5ZA 4LRGA 4HXMA 4YBSA 4BW1A 4WIVA 5F36A 4TZ8A 4UIVA 5H1TA 3U5NA 4Q0NA 4BW2A 4NUEA 5CZGA 4FLPA 5D0CA 2DVVA 5II2A 5KTWA 5CRMA 2N9GA 5IBNA 3P1CA 5I83A 4QEVA 5CQTA 5DYAA 2F6JA 5EQ1A 4YC9A 4HBWA 4PCEA 2DWWA 4CUPA 4N4FA 5AD2A 5A5OA 4UYHA 3K2JA 5D3RA 5LVRA 3P5OA 5I1QA 3DAIA 4CUUA 4IR4A 4LZ2A 5D3TA 5DLXA 4IOQA 5KTXA 5C7NA 5IGLA 5A5QA 5FH8A 5L97A 4PKLA 5FDZA 4UIZA 4YH4A 4IOOA 3O34A 4YBTA 2YDWA 4O78A 5DBMA 4J0RA 4YH3A 5E74A 3ONIA 4UYDA 5LKZA 3P1FA 2I7KA 4O7FA 4A9NA 4ZQLA 5EGUA 4O75A 4YK0A 4A9JA 5FE9A 4J0SA 4HBXA 5HQ6A 5EWWA 2R0YA 5F60A 3UV4A 4TZ2A 3MUKA 5FH7A 5BT5A 3O37A 2GRCA 5I29A 2YW5A 4HXKA 5E3DA 5BT3A 4YY6A 2KTBB 4A9EA 2DVQA 5E9IA 2RNWA 5F1HA 2R0SA 5L8TA 4TT4A 3S91A 5E73A 4J3IA 4CFLA 3P1EA 5TB6A 5CPEA 5ENFA 3MB4A 4CUSA 1N72A 4LYSA 5CQ7A 3JVLA 5L8UA 2OO1A 1EQFA 3MB3A 5F2PA 1X0JA 4QZSA 5ENBA 4BJXA 4QUTA 5IGKA 5DKCA 4O7BA 5ENCA 5ETBA 5G4SA 4YYNA 4N4HA 5CGPA 4ZC9A 2YQDA 3GG3A 4YBMA 5LKXA 4OUFA 4UYEA 4CUQA 4ZW1A 5E3GA 5D3LA 1JM4B 4UIYA 5EA1A 4QR3A 2RNXA 5A83A 4A9OA 2E3KA 2R0VA 4PS5A 4Z6HA 4QSWA 4YYHA 4O72A 4YABA 5FG4A 5FE6A 4KCXA 5HLSA 2L5EA 5EICA 4O77A 2D9EA 3TLPA 4QC1A 4NYVA 5FBXA 5C85A 4TT6A 5D3JA 4NR9A 3LQHA 4QSRA 4RVRA 5FE4A 5E7DA 5FFWA 4O76A 5FE3A 3U5JA 4A9HA 2R10A 3Q2EA 4QNSA 5LUUA 5CQ6A 4NR8A 5L96A 2YEMA 4PCIA 4A9KA 4YADA 5HCLA 2L84A 4QEUA 5EM3A 4KV4A 4XUAA 4YYDA 4DONA 2FSAA 5EK9A 4N4IA 4TU4A 3FKMX 4PTBA 5D3NA 3UVDA 5E9LA 4UYFA 4Y03A 5CUDA 5HELA 5IG6A 2E7NA 5DFDA 4MR4A 5DFBA 5AMFA 5JI8A 4XYAA 5I7XA 4IORA 5DYUA 4TTEA 3G0LA 5EPSA 4NYXA 4KV1A 5COIA 5ETDA 2L85A 5FE8A 5H1UA 4QEWA 5FE1A 3UV5A 5DW2A 5HM0A 5EVAA 3UW9A 4A9IA 5D3SA 5EWCA 4QSSA 5HENA 4QYLA 5I40A 2F6NA 4TT2A 4A9LA 5I80A 4NR7A 5CRZA 5HRVA 5CY9A 4QC3A 3DWYA 5A5RA 4HBYA 5LVQA 3O35A 2DATA 5CQ4A 4QUUA 4HBVA 4HXRA 4ALHA 3UVXA 5FE0A 5DW1A 4O7EA 3I3JA 4LC2A 3JVJA 4J1PA 5DYXA 4UIUA 4MR3A 2RFJA 1JSPB 4WHWA 5EWDA 4UYFB 5DY7A 4NQMA 5H85A 4N4GA 5CUBA 3D7CA 4YAXA 5CQ8A 4HXSA 2LSPB 4LYWA 4UIXA 5FB1A 4UYGA 2MJVB 5D26A 4X2IA 5F25A 4HXLA 3JVMA 2G4AA 4QBMA 2WP2A 3AADA 5A7CA 5ENEA 5BT4A 4NUCA 5IIDA 5ENGA 4Z93A 4HXOA 5I86A 5LJ1A 4UIWA 4YYJA 5I88A 4CLBA 4YATA 2E7OA 4LZSA 5D25A 5E9VA 5CUEA 3S92A 5I7YA 5KU3A 4A9FA 5A82A 2OUOA 5FE5A 5CP5A 5FFYA 4Z6IA 5HEMA 4QSQA 5IGNA 2DKWA 3IU5A 5KTUA 5L98A 3LQJA 5HRXA 3IU6A 5TCMA 5ACYA 5HRWA 5A5PA 3QZVA 2YEKA 5CU8A 3MQMA 2D82A 4QSUA 5CUGA 5E0RA 3P1DA 2RI7A 4NRBA 4C67A 4XUBA 5FFVA 5HFRA 4YYKA 5LJ2A 3MXFA 5DX4A 4CUTA 4OGJA 4GPJA 4NYWA 4NS5A 4O74A 4NUDA 5D7XA 5CUAA 4Q0OA 5C89A 2RO1A 5EV9A 4QSVA 5A5NA 4QR5A 1F68A 5CQAA 4Z1QA 4HXPA 4TS8A 5C4QA 3JVKA 5ENIA 5D3PA 3QZSA 4O7AA 5CTLA 4C66A 2I8NA 5EU1A 5F62A 5FE7A 5A85A 4CURA 4LYIA 3HMEA 5J0DA 4YY4A 5IGMA 1WUGA 5E9MA 3G0JA 5F63A 3U5OA 5C8GA 4OGIA 4QB3A 4F3IA 5ENJA 5I89A 3UVWA 4XY9A 5HFQA 2YELA 3UV2A 3O33A 2RS9B 4QSPA 4NRCA 2NXBA 1E6IA 5F61A 5DKDA 5KO4A 4NQNA 4QYDA 4LDFA 4YYMA 4IR5A 3MULA 4QR4A 4NR5A 5H1VA 5FG5A 5CUCA 1ZS5A 3ZYUA 3Q2FA 5E9YA 3U5LA 5LKTA 3U5KA 2H60A 5DLZA 5CFWA 3UVYA 5DKHA 5JWMA 3SVGA 5HQ7A 4MEQA 5EPBA 5G4RA 5KHMA 5F1LA 4A9MA 4IR3A 5E9KA 5ENHA 4YYIA 4NR6A 5EWHA 3HMFA 4AKNA 5DFCA 5F3AA 2DVSA 4Z1SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXNA 5II1A 3ERRA 4NR4A 4LZRA 1WUMA 5A5SA 4QSTA 5EP7A 4QY4A 4YYGA 5AD3A 2RNYA 4MENA 5CQ3A 2OSSA 4O70A 4CL9A 5D3HA 3LQIA 4MEPA 3U5MA 4TQNA 2DVRA 3HMHA 5EPRA 2YYNA 4CFKA 5L99A 3NXBA 5CQ5A 5HJCA 4ALGA 3SVHA 4BHWA 5FH6A 3LXJA 4MEOA 4TU6A 5EISA 4MR5A 4NXJA 4TYLA 5A81A 3SVFA 5HQ5A 5DYCA 4XY8A 5LJ0A 5C87A 5FE2A 5AMEA 4BW4A 3QZTA 4E96A 4N3WA 4O7CA 4UITA 5LKUA 4QSXA 5EI4A 5EWVA 4O71A 5K29A 3RCWA 3O36A 2WP1A 4LR6A 4PY6A 4WHUA 3D1DA 5D24A 4MR6A 5FB0A 3D1BA 5FG6A 4BW3A 3AQAA 4IR6A 5CS8A 3LJWA 3U5PA 4NRAA 5F5ZA 4LRGA 4HXMA 4YBSA 4BW1A 4WIVA 5F36A 4TZ8A 4UIVA 5H1TA 3U5NA 4Q0NA 4BW2A 4NUEA 5CZGA 4FLPA 5D0CA 2DVVA 5II2A 4AKGA 5KTWA 5CRMA 2N9GA 5IBNA 3P1CA 5I83A 4QEVA 5CQTA 5DYAA 2F6JA 5EQ1A 4YC9A 4HBWA 4PCEA 2DWWA 4CUPA 4N4FA 5AD2A 5A5OA 4UYHA 3K2JA 5D3RA 5LVRA 3P5OA 5I1QA 3DAIA 4CUUA 4IR4A 4LZ2A 5D3TA 5DLXA 4IOQA 5KTXA 5C7NA 5IGLA 5A5QA 5FH8A 5L97A 4PKLA 5FDZA 4UIZA 4YH4A 4IOOA 3O34A 4YBTA 2YDWA 4O78A 5DBMA 4J0RA 4YH3A 5E74A 1ZKRA 3ONIA 4UYDA 5LKZA 3P1FA 2I7KA 4O7FA 4A9NA 4ZQLA 5EGUA 4O75A 4YK0A 4A9JA 5FE9A 4J0SA 4HBXA 5HQ6A 5EWWA 2R0YA 5F60A 3UV4A 4TZ2A 3MUKA 5FH7A 5BT5A 3O37A 2GRCA 5I29A 2YW5A 4HXKA 5E3DA 5BT3A 4YY6A 2KTBB 4A9EA 2DVQA 5E9IA 2RNWA 5F1HA 2R0SA 5L8TA 4TT4A 3S91A 5E73A 4J3IA 4CFLA 3P1EA 5TB6A 5CPEA 5ENFA 3MB4A 4CUSA 1N72A 4LYSA 5CQ7A 3JVLA 5L8UA 2OO1A 1EQFA 3MB3A 5F2PA 1X0JA 4QZSA 5ENBA 4BJXA 4QUTA 5IGKA 3VKHA 5DKCA 4O7BA 5ENCA 5ETBA 5G4SA 4YYNA 4N4HA 5CGPA 4ZC9A 2YQDA 3GG3A 4YBMA 5LKXA 4OUFA 4UYEA 4CUQA 4ZW1A 5E3GA 5D3LA 1JM4B 4UIYA 5EA1A 4QR3A 2RNXA 5A83A 4A9OA 2E3KA 2R0VA 4PS5A 4Z6HA 4QSWA 4YYHA 4O72A 4YABA 5FG4A 5FE6A 4KCXA 5HLSA 2L5EA 5EICA 4O77A 2D9EA 3TLPA 4QC1A 4NYVA 5FBXA 5C85A 4TT6A 5D3JA 4NR9A 3LQHA 4QSRA 4RVRA 5FE4A 5E7DA 5FFWA 4O76A 5FE3A 3U5JA 4A9HA 2R10A 3Q2EA 4QNSA 5LUUA 5CQ6A 4NR8A 5L96A 2YEMA 4AKHA 4PCIA 4A9KA 4YADA 5HCLA 2L84A 4QEUA 5EM3A 4KV4A 4XUAA 4YYDA 4DONA 2FSAA 5EK9A 4N4IA 4TU4A 3FKMX 4PTBA 5D3NA 3UVDA 5E9LA 4UYFA 5CUDA 4Y03A 5HELA 5IG6A 2E7NA 5DFDA 4MR4A 5DFBA 5AMFA 5JI8A 4XYAA 5I7XA 4IORA 5DYUA 4TTEA 3G0LA 5EPSA 4NYXA 4AI6A 4KV1A 5COIA 5ETDA 2L85A 5FE8A 5H1UA 4QEWA 5FE1A 3UV5A 5DW2A 5HM0A 5EVAA 3UW9A 4A9IA 5D3SA 5EWCA 4QSSA 5HENA 4QYLA 5I40A 2F6NA 4TT2A 4A9LA 5I80A 4NR7A 5CRZA 5HRVA 5CY9A 4QC3A 3DWYA 5A5RA 4HBYA 5LVQA 3O35A 2DATA 5CQ4A 4QUUA 4HBVA 4HXRA 4ALHA 3UVXA 5FE0A 5DW1A 4O7EA 3I3JA 4LC2A 3JVJA 4J1PA 5DYXA 4UIUA 4AKIA 4MR3A 2RFJA 1JSPB 4WHWA 5EWDA 4UYFB 5DY7A 4NQMA 5H85A 4N4GA 5CUBA 3D7CA 4YAXA 5CQ8A 4HXSA 2LSPB 4LYWA 2EJNA 4UIXA 5FB1A 4UYGA 2MJVB 5D26A 4X2IA 5F25A 4HXLA 3JVMA 2G4AA 4QBMA 2WP2A 3AADA 5A7CA 5ENEA 5BT4A 4NUCA 5IIDA 5ENGA 4Z93A 4HXOA 5I86A 5LJ1A 4UIWA 4YYJA 5I88A 4CLBA 4YATA 2E7OA 4LZSA 5D25A 5E9VA 5CUEA 3S92A 5I7YA 5KU3A 4A9FA 5A82A 2OUOA 5FE5A 5CP5A 5FFYA 4Z6IA 5HEMA 4QSQA 5IGNA 2DKWA 3IU5A 5KTUA 5L98A 3LQJA 5HRXA 3IU6A 3VKGA 5TCMA 5ACYA 5HRWA 5A5PA 3QZVA 2YEKA 5CU8A 3MQMA 2D82A 4QSUA 5CUGA 5E0RA 3P1DA 2RI7A 4NRBA 4C67A 4XUBA 5FFVA 5HFRA 4YYKA 5LJ2A 3MXFA 5DX4A 4CUTA 4OGJA 4GPJA 4NYWA 4NS5A 4O74A 4NUDA 5D7XA 5CUAA 4Q0OA 5C89A 2RO1A 5EV9A 4QSVA 5A5NA 4QR5A 1F68A 5CQAA 4Z1QA 1PUOA 4HXPA 4TS8A 5C4QA 3JVKA 5ENIA 5D3PA 3QZSA 4O7AA 5CTLA 4C66A 2I8NA 5EU1A 5F62A 5FE7A 5A85A 4CURA 4LYIA 3HMEA 5J0DA 4YY4A 5IGMA 1WUGA 5E9MA 3G0JA 5F63A 3U5OA 5C8GA 4OGIA 4QB3A 4F3IA 5ENJA 5I89A 3UVWA 4XY9A 5HFQA 2YELA 3UV2A 3O33A 2RS9B 4QSPA 4NRCA 2NXBA 1E6IA 5F61A 5DKDA 5KO4A 4NQNA 4QYDA 4LDFA 4YYMA 4IR5A 3MULA 4QR4A 4NR5A 5H1VA 5FG5A 5CUCA 1ZS5A 3ZYUA 3Q2FA 5E9YA 3U5LA 5LKTA 3U5KA 2H60A 5DLZA 5CFWA 3UVYA 5DKHA 5JWMA 3SVGA 5HQ7A 4MEQA 5EPBA 5G4RA 5KHMA 5F1LA 4A9MA 4IR3A 5E9KA 5ENHA 4YYIA 4NR6A 5EWHA 3HMFA 4AKNA 5DFCA 5F3AA 2DVSA 4Z1SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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