4QR4A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr4A01
2I8NA 4NR7A 2R0VA 4QBMA 4QSSA 4TQNA 2RNYA 4LRGA 4UIZA 4WIVA 5BT5A 3HMHA 4IR6A 4O72A 4QUUA 2L85A 3UV2A 3UV4A 5KTXA 4J1PA 5ENGA 5L8UA 3LQIA 4O78A 5I7XA 2MJVB 5IG6A 4NUEA 4PCIA 5I88A 4DONA 5EU1A 4KV4A 5F63A 5IGLA 5EM3A 4BHWA 2YEMA 5FE3A 3ZYUA 5D3JA 4O74A 5CQ8A 5E9VA 4TS8A 5E3DA 5KU3A 5LJ1A 4BW1A 4HBXA 2RI7A 4NYWA 4XY8A 4ZQLA 3P5OA 4QC1A 4QR3A 3MB3A 4Q0OA 4TT4A 4CUPA 4CUTA 5D3PA 3UW9A 4YBSA 4CUSA 4NS5A 5CQ6A 4QY4A 5ENEA 5DYCA 5D3TA 5A82A 5J0DA 4UYGA 3ONIA 4HXRA 5C89A 4UYHA 4YAXA 2WP1A 5DYXA 2GRCA 4BW4A 3K2JA 4YBTA 4QSRA 5EWHA 4QSTA 5CUDA 4O7CA 4YC9A 2DKWA 4YYHA 4NR5A 5FE4A 5CGPA 5LJ2A 4O7EA 3LQJA 3UV5A 1F68A 5EPSA 5EPRA 4HXKA 4QSXA 5DKCA 4NYXA 4Z93A 2E7NA 4J0RA 5CZGA 5C8GA 4MR6A 2I7KA 3U5JA 5HQ7A 5A5NA 3AQAA 3JVLA 5I86A 4QEWA 5D7XA 5HLSA 5A5QA 4QEVA 5FE6A 5CQ4A 4YATA 5EWVA 1EQFA 5IGNA 2R0YA 3D7CA 5FE2A 3Q2FA 5CUAA 5E73A 5KTWA 3UVWA 5II2A 5E0RA 5LVRA 4QSPA 5H1UA 4MENA 4KCXA 2DVVA 5G4SA 5HEMA 4UYEA 5DKDA 3QZVA 5E7DA 4O7FA 3UVDA 5A5PA 4CL9A 2FSAA 5D24A 3O33A 3P1CA 5AD2A 3G0JA 4NUCA 5C7NA 5AMEA 4J0SA 5DX4A 4QR5A 5F5ZA 5CRZA 3TLPA 2N9GA 3NXBA 5LKUA 1ZS5A 5FB1A 5KHMA 2YDWA 3Q2EA 4IR4A 3MQMA 3P1FA 4NR9A 5KO4A 4MR4A 4QSVA 4YYIA 5CQAA 5H1VA 3JVJA 4LDFA 4UITA 4HXSA 5E74A 3U5KA 5E9MA 3P1EA 5EWCA 4IR3A 4MR3A 5D25A 4CFLA 4YYMA 5IIDA 4E96A 5I40A 4A9KA 4UIUA 3QZSA 5C85A 4CLBA 1JSPB 3O36A 5A85A 2L5EA 5DLXA 4YYJA 5LKTA 4C67A 4WHWA 4IOQA 5A5SA 4TZ2A 3LJWA 4LR6A 5EISA 5I80A 4Y03A 2D82A 5L96A 5F2PA 4A9MA 5EICA 4TU6A 5D26A 5HFQA 5DKHA 4QEUA 5I7YA 3DAIA 4ALHA 4QYLA 4TTEA 5CUEA 4QSUA 1N72A 2E7OA 4YYGA 3JVKA 5ACYA 3MULA 4O70A 5F60A 1X0JA 5ENHA 4UYFA 4O7AA 4OGIA 5I89A 1E6IA 5C87A 5CPEA 4UYFB 5E9YA 5HENA 2RO1A 3O34A 1WUMA 4UIVA 4N4IA 5DBMA 3U5MA 4F3IA 3LXJA 4LYWA 4N4FA 3U5LA 4NRCA 2YYNA 2D9EA 3GG3A 5ENJA 5CP5A 4BJXA 4IR5A 4TU4A 5DFBA 5TB6A 4YADA 3S91A 4NR4A 5LKZA 4XUBA 4NRBA 2OUOA 3LQHA 5E9LA 5I83A 5FG5A 4CFKA 5LVQA 4X2IA 5FDZA 5LUUA 4QUTA 5F1HA 5FFYA 3G0LA 2YELA 4FLPA 4TT6A 5COIA 4MEQA 5F25A 4NQNA 3U5PA 4O77A 4NXJA 5EQ1A 5CRMA 5A5OA 5HRXA 4LC2A 4Q0NA 3JVMA 2RNWA 4YYKA 4IOOA 4Z6IA 4Z6HA 4LZSA 5EK9A 5DYAA 4YYNA 4NR6A 2DATA 4HXPA 4NR8A 4QC3A 4QNSA 4YY6A 4YK0A 5H1TA 4PKLA 5ETBA 5FH7A 5L98A 5FG6A 4PS5A 5FE5A 4YYDA 4YY4A 5EP7A 5FH8A 3SVFA 4XUAA 3UVXA 2E3KA 3IU5A 4O76A 5EWWA 5CQ3A 2DVQA 5DFCA 5E9IA 3I3JA 4A9LA 5CQ5A 3SVHA 4NUDA 3MB4A 4YBMA 5HRVA 3S92A 4KV1A 2DVRA 2OSSA 5HELA 4CUQA 3P1DA 5D0CA 3SVGA 5A5RA 4BW3A 4ZC9A 4ZW1A 3RCWA 4CUUA 5JWMA 5HQ5A 4A9NA 4LZRA 4IORA 4HBVA 5AD3A 4TYLA 4YABA 4GPJA 5FE7A 4C66A 5EV9A 5FE1A 3IU6A 5DW1A 2WP2A 4HXNA 4HXOA 4MR5A 2L84A 4TZ8A 4UIXA 5ENIA 5HRWA 5LKXA 3AADA 5I29A 5TCMA 4HBWA 4BW2A 3UVYA 3FKMX 4OGJA 5CU8A 4LYSA 5K29A 4WHUA 5DY7A 4O71A 5FE8A 5DLZA 5E3GA 3O37A 4UIYA 4ALGA 4QSWA 4XYAA 5CUGA 4Z1SA 5EI4A 5A7CA 5CY9A 4MEOA 3DWYA 5G4RA 5FE9A 5IBNA 4YH4A 5FBXA 5E9KA 5H85A 2F6JA 4NRAA 5ENFA 4HXLA 5CQTA 4O7BA 5EWDA 5D3SA 2RNXA 5DFDA 5LJ0A 5A83A 5A81A 3U5OA 2YQDA 5L97A 4HBYA 2G4AA 5HQ6A 5D3LA 4UYDA 4QSQA 5L99A 5ENBA 5F1LA 4YH3A 4OUFA 5FFVA 5KTUA 2DVSA 4NQMA 4A9OA 5DW2A 4XY9A 4A9JA 5EGUA 5CUCA 4PY6A 2H60A 5CFWA 3MUKA 2YEKA 4QZSA 4TT2A 2NXBA 4A9IA 5EVAA 4Z1QA 4QYDA 5IGMA 4N3WA 2KTBB 2RS9B 5EPBA 4PTBA 2OO1A 2R0SA 5C4QA 5FG4A 2DWWA 4A9FA 4NYVA 5FB0A 4O75A 4RVRA 4QB3A 5CQ7A 5CTLA 1JM4B 4PCEA 5F36A 2LSPB 3HMEA 3MXFA 5AMFA 5BT3A 4UIWA 5F61A 4A9HA 5FE0A 4AKNA 4N4HA 5CUBA 5ENCA 5HM0A 5HJCA 4HXMA 5IGKA 5D3NA 5II1A 5HCLA 4N4GA 5DYUA 5FH6A 5D3RA 5EA1A 3U5NA 3HMFA 5HFRA 1WUGA 5L8TA 4LZ2A 2RFJA 4CURA 5FFWA 5D3HA 5ETDA 3QZTA 2R10A 5F3AA 2YW5A 4LYIA 5JI8A 4MEPA 5F62A 5I1QA 5CS8A 5BT4A 2F6NA 3O35A 4A9EA 4QR4A 4J3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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