4QR4A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr4A01
5ENHA 4QEVA 4QSSA 4X2IA 5FE2A 5E9IA 5D26A 3HMFA 5E3GA 4QEWA 5I1QA 1N72A 4IORA 4QSQA 2R0VA 2OSSA 4C66A 5C89A 5FH7A 4YYDA 2OUOA 3O35A 4LC2A 4QSTA 4CUPA 5HQ5A 2YELA 5JWMA 4TU4A 4CFKA 3P1CA 4QSXA 2YEKA 5DYXA 5CY9A 4NR7A 5A7CA 3JVMA 3P5OA 4TT2A 5CRMA 5BT5A 4Q0OA 5DLZA 5A5RA 2L85A 1WUGA 4IR5A 4A9OA 4YY4A 2H60A 5EA1A 5LKTA 4UIZA 4NS5A 4IOOA 4N4HA 2E3KA 5F1LA 2WP1A 3MQMA 4O7CA 4PCEA 3O34A 5LKUA 4QC3A 4BW1A 5FG6A 5CQ6A 2I8NA 5DYCA 2L84A 2DKWA 3AQAA 5HQ6A 4NR9A 4YAXA 5DKDA 4NYWA 4NUDA 5FDZA 4IR4A 2YDWA 5CQAA 4QR5A 5EICA 4UYDA 4YH3A 4IOQA 5E9VA 5I89A 5CQ3A 3LQJA 4QR4A 5EWCA 5FE4A 5KTXA 4Q0NA 5I88A 4PCIA 4UIWA 5D3TA 4XUBA 4QBMA 3O37A 5LJ0A 3SVHA 4BW3A 4HBWA 5JI8A 5FE6A 4O7AA 5LVQA 4HXMA 4TTEA 3HMHA 4NR5A 4A9JA 4QR3A 4O72A 4MENA 3IU6A 4LZ2A 4XYAA 4WHWA 4UYHA 4IR6A 4UYFB 5L98A 5EPBA 5EP7A 4KV4A 4YYMA 3P1DA 3UVYA 4A9LA 5I29A 4WIVA 5FE7A 5FH8A 5D3RA 5E74A 4Z6IA 5CUEA 4MEOA 5F2PA 5LKZA 5FFVA 4NR4A 4NRAA 5D3PA 3LQIA 4LYWA 5FE3A 2OO1A 3O33A 4QEUA 3S92A 2NXBA 3ONIA 4NRBA 5K29A 2RNWA 3MULA 4LDFA 4QSWA 4O7BA 4QY4A 5C4QA 5HELA 2FSAA 4YADA 4MR5A 5G4RA 5F62A 5HQ7A 3UW9A 5ENIA 3U5LA 3UV2A 5EV9A 5A5NA 5FB1A 3U5JA 5DKCA 5EWWA 5E9KA 5ENEA 4HXPA 5E3DA 5FE5A 3HMEA 4NYVA 5D24A 2D9EA 4HXRA 3LQHA 4Z1SA 5EPSA 2RFJA 5EPRA 5CQ4A 5D3LA 4FLPA 4A9MA 5CZGA 4IR3A 4XY9A 4QUUA 4HBYA 2DWWA 5CP5A 4A9KA 5DKHA 2YQDA 5F61A 4LR6A 3UVDA 2I7KA 5IGKA 4KV1A 3MB3A 5A5PA 5HRXA 5A5QA 4C67A 3QZTA 2F6NA 3JVKA 3RCWA 5IGMA 3SVGA 2F6JA 5H85A 5DFCA 4UIXA 5FFWA 4HXKA 4OUFA 4GPJA 1WUMA 4UIUA 4XUAA 5C7NA 5F60A 5IIDA 4QSRA 5L99A 2R0SA 4TU6A 2DVVA 2MJVB 5CRZA 3GG3A 5FG5A 5IBNA 5IG6A 4Z1QA 3DAIA 5H1VA 5CU8A 5I83A 5I7XA 5HLSA 5ENBA 5HRVA 4ALHA 5II1A 4NYXA 4NQMA 5LKXA 4YYNA 4NR8A 5LVRA 5FE0A 4LYIA 5DY7A 5CQ8A 5D3NA 4UYEA 4Z93A 5H1UA 3IU5A 4LZSA 2L5EA 3JVLA 3UV4A 5KO4A 4BW2A 5BT4A 4J0RA 2RS9B 4A9EA 5II2A 4DONA 4O7EA 2R0YA 4NQNA 3UV5A 5BT3A 5KTWA 5CQTA 4A9HA 5HFRA 4UYFA 5DW1A 4O7FA 3Q2EA 3NXBA 4RVRA 4HXNA 5F3AA 5FH6A 3UVWA 3DWYA 4QZSA 5D0CA 4WHUA 3G0JA 3K2JA 5KHMA 4BW4A 3JVJA 5HENA 4MEPA 5EI4A 5CUCA 5D3JA 3P1EA 3QZVA 3UVXA 3Q2FA 5DX4A 4CUQA 4PY6A 5C8GA 5A82A 4MR3A 5L8TA 4YH4A 1ZS5A 5L8UA 4N4IA 4PKLA 4O75A 2RNYA 1F68A 3O36A 4UIYA 2DVSA 5FE1A 5A5SA 5KU3A 2RNXA 4BHWA 3AADA 4CLBA 1EQFA 2DATA 4QYDA 4NUEA 5CGPA 4QSPA 5EM3A 3MXFA 5FE9A 5E73A 4MR4A 5DYUA 5F25A 4J3IA 5FBXA 5E9MA 5FG4A 2GRCA 4QSVA 3U5KA 5ENJA 3LJWA 4YBSA 3MB4A 4PS5A 5HJCA 4CURA 4A9FA 5FE8A 5EWDA 5EWVA 5E0RA 4HBVA 5AMFA 4OGIA 4PTBA 4TZ2A 5F1HA 3D7CA 5A81A 4O70A 4N3WA 1JSPB 2YEMA 3P1FA 4O71A 4QB3A 5DYAA 4ZQLA 4NUCA 4YYKA 2N9GA 5CTLA 4LRGA 5EU1A 4CUUA 4A9IA 5A85A 2WP2A 4O76A 5HEMA 3FKMX 4KCXA 4QNSA 5EGUA 5A83A 5DFBA 5IGLA 4YYGA 4XY8A 5CUBA 3SVFA 5AD2A 5F36A 4YABA 5CUDA 3U5OA 4QSUA 5EQ1A 5IGNA 5CFWA 4Z6HA 3ZYUA 4CUSA 5D7XA 1X0JA 3QZSA 4NXJA 5CUGA 4YY6A 4TYLA 4MR6A 1JM4B 2RO1A 4YC9A 4UYGA 4OGJA 4TS8A 4UITA 4O74A 2KTBB 4HXLA 4A9NA 5C87A 5TB6A 4F3IA 2YW5A 5I7YA 5I80A 5E9LA 4UIVA 5ENGA 4N4GA 5LJ2A 3I3JA 5A5OA 4YBMA 5CQ7A 5I86A 5D25A 5ENFA 5L97A 4YYJA 4O77A 2E7OA 5AD3A 5LUUA 3LXJA 3G0LA 3U5MA 4YYHA 4Y03A 2G4AA 3U5PA 5DLXA 5L96A 5CQ5A 4TT6A 4TT4A 5D3SA 4J1PA 4TZ8A 4BJXA 4YBTA 3U5NA 4YATA 4YYIA 5FFYA 5ACYA 5ETBA 5E7DA 5FB0A 4N4FA 5C85A 2YYNA 4NR6A 5DW2A 5HM0A 5DFDA 5TCMA 2R10A 4HBXA 2DVRA 5I40A 4QUTA 5HCLA 4HXOA 2D82A 5LJ1A 4CUTA 5CS8A 4ZC9A 4J0SA 4QC1A 2E7NA 2DVQA 5EK9A 5COIA 5H1TA 5CUAA 5HRWA 3S91A 5ETDA 4AKNA 2LSPB 4ZW1A 4LZRA 4ALGA 5AMEA 4TQNA 5F63A 3TLPA 4NRCA 5E9YA 4E96A 2RI7A 4CL9A 4LYSA 4MEQA 5EISA 5ENCA 5CPEA 5EVAA 5HFQA 4YK0A 5EWHA 5J0DA 1E6IA 4HXSA 3MUKA 4QYLA 5F5ZA 5G4SA 5DBMA 4O78A 5D3HA 4CFLA 5KTUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENHA 4QEVA 4QSSA 3VKHA 4X2IA 5FE2A 5E9IA 5D26A 3HMFA 5E3GA 4QEWA 5I1QA 1N72A 4IORA 4QSQA 2R0VA 2OSSA 4C66A 5C89A 5FH7A 4YYDA 2OUOA 3O35A 4LC2A 4QSTA 4CUPA 5HQ5A 2YELA 5JWMA 4TU4A 4CFKA 3P1CA 4QSXA 2YEKA 5DYXA 5CY9A 4NR7A 5A7CA 3JVMA 3P5OA 4TT2A 5CRMA 5BT5A 4Q0OA 5DLZA 5A5RA 2L85A 1WUGA 4IR5A 4A9OA 4YY4A 2H60A 5EA1A 5LKTA 4UIZA 4NS5A 4IOOA 4N4HA 2E3KA 5F1LA 2WP1A 3MQMA 4O7CA 4PCEA 3O34A 5LKUA 4QC3A 4BW1A 5FG6A 5CQ6A 2I8NA 5DYCA 2L84A 2DKWA 3AQAA 5HQ6A 4NR9A 4YAXA 5DKDA 4NYWA 4NUDA 5FDZA 4IR4A 2YDWA 5CQAA 4QR5A 5EICA 4UYDA 4YH3A 4IOQA 5E9VA 5I89A 5CQ3A 3LQJA 4QR4A 5EWCA 5FE4A 5KTXA 4Q0NA 5I88A 4PCIA 4UIWA 5D3TA 4XUBA 4QBMA 3O37A 5LJ0A 3SVHA 4BW3A 4HBWA 5JI8A 5FE6A 4O7AA 5LVQA 4HXMA 4TTEA 3HMHA 4NR5A 4A9JA 1ZKRA 4QR3A 4O72A 4MENA 3IU6A 4LZ2A 4XYAA 4WHWA 4UYHA 4IR6A 4UYFB 5L98A 5EPBA 5EP7A 4KV4A 4YYMA 3P1DA 3UVYA 4A9LA 5I29A 4WIVA 5FE7A 5FH8A 5D3RA 5E74A 4Z6IA 5CUEA 4MEOA 5F2PA 5LKZA 5FFVA 4NR4A 4NRAA 1PUOA 5D3PA 3ERRA 3LQIA 4LYWA 5FE3A 2OO1A 4AKIA 3O33A 4QEUA 3S92A 2NXBA 3ONIA 4NRBA 5K29A 2RNWA 3MULA 4LDFA 4QSWA 4O7BA 4QY4A 5C4QA 5HELA 2FSAA 4YADA 4MR5A 5G4RA 5F62A 5HQ7A 3UW9A 5ENIA 3U5LA 3UV2A 5EV9A 5A5NA 5FB1A 3U5JA 5DKCA 5EWWA 5E9KA 5ENEA 4HXPA 5E3DA 5FE5A 3HMEA 4NYVA 5D24A 2D9EA 4HXRA 3LQHA 4Z1SA 5EPSA 2RFJA 5EPRA 5CQ4A 5D3LA 4FLPA 4A9MA 5CZGA 4IR3A 4XY9A 4QUUA 4HBYA 2DWWA 5CP5A 4A9KA 5DKHA 2YQDA 5F61A 4LR6A 3UVDA 2I7KA 5IGKA 4KV1A 3MB3A 5A5PA 5HRXA 5A5QA 4C67A 3QZTA 2F6NA 3JVKA 3RCWA 5IGMA 3SVGA 2F6JA 5H85A 5DFCA 4UIXA 5FFWA 4HXKA 4OUFA 4GPJA 1WUMA 4UIUA 4XUAA 5C7NA 5F60A 5IIDA 4QSRA 5L99A 2R0SA 4TU6A 2DVVA 2MJVB 5CRZA 3GG3A 5FG5A 5IBNA 5IG6A 4Z1QA 3DAIA 5H1VA 5CU8A 5I83A 5I7XA 5HLSA 5ENBA 5HRVA 3VKGA 4ALHA 5II1A 4NYXA 4NQMA 5LKXA 4YYNA 4AI6A 4NR8A 5LVRA 5FE0A 4LYIA 5DY7A 5CQ8A 5D3NA 4UYEA 4Z93A 5H1UA 3IU5A 4LZSA 2L5EA 3JVLA 3UV4A 5KO4A 4BW2A 5BT4A 4J0RA 2RS9B 4A9EA 5II2A 4DONA 4O7EA 2R0YA 4NQNA 3UV5A 5BT3A 5KTWA 5CQTA 4A9HA 5HFRA 4UYFA 5DW1A 4O7FA 3Q2EA 3NXBA 4RVRA 4HXNA 5F3AA 5FH6A 3UVWA 3DWYA 2EJNA 4QZSA 5D0CA 4WHUA 3G0JA 3K2JA 5KHMA 4BW4A 3JVJA 5HENA 4MEPA 5EI4A 5CUCA 5D3JA 3P1EA 3QZVA 3UVXA 3Q2FA 5DX4A 4CUQA 4PY6A 5C8GA 5A82A 4MR3A 5L8TA 4YH4A 1ZS5A 5L8UA 4N4IA 4PKLA 4AKHA 4O75A 2RNYA 1F68A 3O36A 4UIYA 2DVSA 5FE1A 5A5SA 5KU3A 2RNXA 4BHWA 3AADA 4CLBA 1EQFA 2DATA 4QYDA 4NUEA 5CGPA 4QSPA 5EM3A 3MXFA 5FE9A 5E73A 4MR4A 5DYUA 5F25A 4J3IA 5FBXA 5E9MA 5FG4A 2GRCA 4QSVA 3U5KA 5ENJA 3LJWA 4YBSA 3MB4A 4PS5A 5HJCA 4CURA 4A9FA 5FE8A 5EWDA 5EWVA 5E0RA 4HBVA 5AMFA 3D1BA 4OGIA 4PTBA 4TZ2A 5F1HA 3D7CA 5A81A 4O70A 4N3WA 1JSPB 2YEMA 3P1FA 4O71A 4QB3A 5DYAA 4ZQLA 4NUCA 4YYKA 2N9GA 5CTLA 4LRGA 5EU1A 4CUUA 4A9IA 5A85A 2WP2A 4O76A 5HEMA 3FKMX 4KCXA 4QNSA 5EGUA 5A83A 5DFBA 5IGLA 4YYGA 4XY8A 5CUBA 3SVFA 5AD2A 5F36A 4YABA 5CUDA 3U5OA 4QSUA 5EQ1A 5IGNA 5CFWA 4Z6HA 3ZYUA 4CUSA 5D7XA 1X0JA 3QZSA 4NXJA 5CUGA 4YY6A 4TYLA 4AKGA 4MR6A 1JM4B 2RO1A 4YC9A 4UYGA 4OGJA 4TS8A 4UITA 4O74A 2KTBB 4HXLA 4A9NA 5C87A 5TB6A 4F3IA 2YW5A 5I7YA 5I80A 5E9LA 4UIVA 5ENGA 4N4GA 5LJ2A 3I3JA 5A5OA 4YBMA 5CQ7A 5I86A 5D25A 5ENFA 5L97A 4YYJA 4O77A 3D1DA 2E7OA 5AD3A 5LUUA 3LXJA 3G0LA 3U5MA 4YYHA 4Y03A 2G4AA 3U5PA 5DLXA 5L96A 5CQ5A 4TT6A 4TT4A 5D3SA 4J1PA 4TZ8A 4BJXA 4YBTA 3U5NA 4YATA 4YYIA 5FFYA 5ACYA 5ETBA 5E7DA 5FB0A 4N4FA 5C85A 2YYNA 4NR6A 5DW2A 5HM0A 5DFDA 5TCMA 2R10A 4HBXA 2DVRA 5I40A 4QUTA 5HCLA 4HXOA 2D82A 5LJ1A 4CUTA 5CS8A 4ZC9A 4J0SA 4QC1A 2E7NA 2DVQA 5EK9A 5COIA 5H1TA 5CUAA 5HRWA 3S91A 5ETDA 4AKNA 2LSPB 4ZW1A 4LZRA 4ALGA 5AMEA 4TQNA 5F63A 3TLPA 4NRCA 5E9YA 4E96A 2RI7A 4CL9A 4LYSA 4MEQA 5EISA 5ENCA 5CPEA 5EVAA 5HFQA 4YK0A 5EWHA 5J0DA 1E6IA 4HXSA 3MUKA 4QYLA 5F5ZA 5G4SA 5DBMA 4O78A 5D3HA 4CFLA 5KTUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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