4QR4A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr4A01
2L5EA 2DVSA 5IIDA 2DVVA 4TYLA 5DX4A 5HCLA 5F1HA 5L8TA 1WUGA 5FE0A 5CRMA 5JI8A 4A9JA 2OO1A 5L98A 3P1DA 5FDZA 4XY9A 4YATA 3U5LA 4A9HA 4O7BA 4YC9A 4XY8A 5I40A 5A81A 5EI4A 5FE6A 4CUTA 2E7OA 5CFWA 4PCEA 4BW3A 4O7AA 3UV2A 4CUQA 1X0JA 2L85A 5CQ4A 4IORA 4NR5A 5FH6A 5HLSA 3U5MA 3UVWA 5LJ0A 2E7NA 4QSXA 2RNXA 5CZGA 4IOQA 5I1QA 5F5ZA 5L96A 5E9IA 5F63A 4NYWA 4N4FA 4A9KA 4TQNA 5DLZA 5F62A 4YH3A 5TB6A 3O36A 4QR5A 4CL9A 4UIUA 5I89A 3TLPA 4QUTA 5DYUA 5II2A 3UVDA 4QNSA 5CPEA 5CP5A 2G4AA 3O33A 4QBMA 1F68A 5A5RA 4QSVA 5E0RA 2RO1A 2I7KA 4NQMA 4LZ2A 4C67A 4NR4A 5EV9A 5ENBA 3ONIA 5FB1A 4X2IA 4HBYA 3U5JA 4TS8A 3ZYUA 4YABA 1JSPB 5BT5A 4BW2A 3MXFA 4KV1A 5DFBA 5EWHA 5HRVA 4LC2A 4A9IA 5TCMA 3HMEA 4XYAA 2DKWA 5HRXA 5EP7A 5EPRA 4NR7A 4XUAA 4CLBA 5CQ7A 4N4GA 5EGUA 5DKCA 4A9MA 4J1PA 5D3JA 4QSRA 5LJ2A 5HELA 4QB3A 4HXSA 4O7FA 3LQJA 5F60A 5FE3A 5COIA 5H1UA 4QY4A 4UYGA 3P1EA 5I86A 4HXOA 4YYIA 5ENGA 5EU1A 5EVAA 4UYFB 5E9YA 4BJXA 4QSTA 4YH4A 5D3PA 5IGNA 2D82A 4NRAA 3O34A 4LDFA 4YYHA 3Q2FA 5FE1A 4QSWA 5CQ5A 3S91A 2YDWA 5EWWA 2YELA 4MR5A 3Q2EA 4IR6A 5CQAA 4A9FA 4HXMA 4TU6A 5HQ6A 2R10A 5C85A 5HJCA 5DYXA 4O75A 4YBTA 3G0JA 4UYEA 5KO4A 5A5NA 5EISA 4YBSA 4YY4A 4NR6A 4QEVA 4NRCA 3MB4A 5I29A 5CQTA 3UVYA 5FG6A 4FLPA 5FFWA 5FE2A 5DBMA 4WHUA 3K2JA 5AD3A 5I7YA 3MULA 5IGKA 3G0LA 4UYHA 2YW5A 4J0SA 5HQ7A 3O37A 5CTLA 2NXBA 4QEUA 3U5KA 2RS9B 4NYXA 3JVKA 4OGIA 5D3SA 5H1TA 4HBXA 5D3LA 2YQDA 4ZQLA 5KTXA 5LVRA 3MQMA 3HMHA 5A85A 4PS5A 3I3JA 4HBVA 4TZ8A 5E9VA 4NYVA 5DW2A 5EPSA 4Z1QA 5EA1A 2E3KA 4NQNA 5LKUA 4LRGA 5C4QA 5K29A 5ENCA 3JVJA 5E74A 4HXNA 5II1A 5FB0A 5CUCA 5KTUA 5E7DA 5HEMA 5CUEA 3U5OA 4Y03A 3IU5A 4QR4A 4NUCA 5ENIA 5FE9A 3DWYA 4YYGA 5FE4A 4YADA 3P1FA 5DY7A 4CFKA 4QYLA 5DFCA 4O76A 3U5PA 4PY6A 4LR6A 3SVGA 4Z1SA 4TTEA 2R0YA 4O77A 4O7EA 5FH7A 4MR3A 3MUKA 4LYIA 4N4HA 4WHWA 5A5SA 5D0CA 5AD2A 4WIVA 2RI7A 3P1CA 4O74A 5A5PA 5FG4A 1N72A 4QC3A 5CQ6A 4QSSA 5FBXA 5ENFA 5E9MA 5DYAA 3U5NA 4O7CA 3LQHA 4TT4A 4YBMA 5C7NA 4Q0NA 5CY9A 5E9KA 5D3NA 5ETDA 5I80A 3SVFA 5EWDA 4YYJA 3QZVA 4QR3A 4NR9A 3SVHA 2H60A 4HXPA 5FFYA 5F2PA 4UIYA 4MEQA 5EQ1A 5EM3A 4LYWA 5D3TA 4A9OA 4O70A 3HMFA 2OSSA 5A5QA 4C66A 5HRWA 4UITA 5ACYA 4O78A 5HFRA 5CUBA 4MR6A 4CURA 5DFDA 4DONA 5FE5A 5L8UA 4HBWA 5L97A 5LUUA 5I83A 4J3IA 4BW1A 2LSPB 5G4SA 3QZTA 4MEPA 5HM0A 5ENJA 5D24A 4QC1A 2FSAA 4E96A 5CRZA 3UW9A 5C87A 4QYDA 4Z93A 5D3HA 5C89A 4QSQA 4TZ2A 5ENEA 5AMFA 5F1LA 5CQ8A 4YYNA 4IR4A 4Q0OA 5HQ5A 4A9NA 3AQAA 4O71A 4YYKA 4NUEA 5BT4A 4ALHA 5EWCA 4IOOA 5IGLA 2MJVB 5DLXA 4NRBA 3FKMX 4NUDA 5IBNA 5HENA 5DKHA 3NXBA 5D7XA 2L84A 5H85A 2DATA 4TU4A 4AKNA 5FE7A 5LVQA 4NXJA 5F61A 5EWVA 5DW1A 5I88A 5EICA 4YYDA 4PCIA 2R0SA 3O35A 4J0RA 5IGMA 3MB3A 5DYCA 5LKTA 4TT2A 5D3RA 5BT3A 2RNYA 4PKLA 4YAXA 4UIVA 3UV5A 4MENA 1EQFA 5CU8A 4UYDA 4OGJA 5FH8A 5FG5A 5LJ1A 4LZSA 4HXKA 4QUUA 5E9LA 2GRCA 4KCXA 2YEMA 4IR3A 4UIXA 5EPBA 4QZSA 3AADA 4TT6A 4N3WA 4Z6IA 4ZW1A 4ALGA 4O72A 4BW4A 2YEKA 2DVQA 4ZC9A 4YK0A 4CUSA 5FFVA 2RFJA 2DWWA 5CUGA 5KHMA 5F3AA 5CGPA 5F36A 5CUDA 5C8GA 1WUMA 3P5OA 4KV4A 5CQ3A 2F6JA 5KU3A 5ETBA 3D7CA 2F6NA 3LXJA 4YY6A 5CS8A 4F3IA 4CUPA 5L99A 4CFLA 4HXLA 4QSUA 5LKZA 4A9EA 2R0VA 5F25A 5HFQA 5LKXA 4HXRA 2KTBB 5DKDA 2D9EA 5AMEA 4A9LA 4OUFA 5E3DA 5FE8A 4UIWA 5G4RA 4PTBA 5EK9A 4LYSA 4QEWA 5A82A 4XUBA 3UV4A 4GPJA 3DAIA 5I7XA 2RNWA 4IR5A 3UVXA 5ENHA 2YYNA 3RCWA 3QZSA 5E73A 1ZS5A 2N9GA 5KTWA 5A7CA 4CUUA 3JVMA 4UYFA 5CUAA 3IU6A 2I8NA 2WP2A 5JWMA 5H1VA 3LQIA 1E6IA 4MEOA 5A83A 5D25A 3GG3A 4RVRA 4BHWA 2OUOA 2WP1A 3LJWA 5J0DA 4N4IA 5D26A 4MR4A 4YYMA 5IG6A 1JM4B 4NR8A 3JVLA 4NS5A 4LZRA 3S92A 5A5OA 4QSPA 5E3GA 4Z6HA 4UIZA 2DVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2L5EA 2DVSA 5IIDA 2DVVA 4TYLA 5DX4A 5HCLA 5F1HA 5L8TA 1WUGA 5FE0A 5CRMA 5JI8A 4A9JA 2OO1A 5L98A 3P1DA 5FDZA 4XY9A 4YATA 3U5LA 4A9HA 4O7BA 4YC9A 4XY8A 5I40A 5A81A 5EI4A 5FE6A 3ERRA 4CUTA 2E7OA 5CFWA 4PCEA 4BW3A 4O7AA 3UV2A 4CUQA 1X0JA 3D1DA 2L85A 5CQ4A 4IORA 4NR5A 5FH6A 5HLSA 2EJNA 3U5MA 3UVWA 5LJ0A 3VKHA 2E7NA 4QSXA 2RNXA 5CZGA 4IOQA 5I1QA 5F5ZA 5L96A 5E9IA 5F63A 4NYWA 4N4FA 4A9KA 4TQNA 5DLZA 5F62A 4YH3A 5TB6A 3O36A 4QR5A 4CL9A 4UIUA 5I89A 3TLPA 4QUTA 5DYUA 5II2A 3UVDA 4QNSA 5CPEA 5CP5A 2G4AA 3O33A 4QBMA 1F68A 5A5RA 4QSVA 5E0RA 2RO1A 2I7KA 4NQMA 4LZ2A 4C67A 4NR4A 5EV9A 5ENBA 3ONIA 5FB1A 4X2IA 4HBYA 4AKGA 3U5JA 4TS8A 3ZYUA 4YABA 1JSPB 5BT5A 4BW2A 3MXFA 4KV1A 5DFBA 5EWHA 5HRVA 4LC2A 4A9IA 5TCMA 3HMEA 4XYAA 2DKWA 5HRXA 5EP7A 5EPRA 4NR7A 4XUAA 4CLBA 5CQ7A 4N4GA 5EGUA 5DKCA 4A9MA 3VKGA 4J1PA 5D3JA 4QSRA 5LJ2A 5HELA 4QB3A 4HXSA 4O7FA 3LQJA 5F60A 5FE3A 5COIA 5H1UA 4QY4A 4UYGA 3P1EA 5I86A 4HXOA 4YYIA 5ENGA 5EU1A 5EVAA 4UYFB 5E9YA 4BJXA 4QSTA 4YH4A 5D3PA 5IGNA 2D82A 4NRAA 3O34A 4LDFA 4YYHA 3Q2FA 5FE1A 4QSWA 5CQ5A 3S91A 2YDWA 5EWWA 2YELA 4MR5A 3Q2EA 4IR6A 5CQAA 4A9FA 4HXMA 4TU6A 5HQ6A 2R10A 5C85A 5HJCA 5DYXA 4O75A 4YBTA 3G0JA 4UYEA 5KO4A 5A5NA 5EISA 4YBSA 4YY4A 4NR6A 4QEVA 4NRCA 3MB4A 5I29A 5CQTA 3UVYA 5FG6A 4FLPA 5FFWA 5FE2A 5DBMA 4WHUA 3K2JA 5AD3A 5I7YA 3MULA 5IGKA 3G0LA 4UYHA 2YW5A 4J0SA 5HQ7A 3O37A 5CTLA 2NXBA 4QEUA 3U5KA 2RS9B 4NYXA 3JVKA 4OGIA 5D3SA 5H1TA 4HBXA 5D3LA 2YQDA 4ZQLA 5KTXA 5LVRA 3MQMA 3HMHA 5A85A 4PS5A 3I3JA 4HBVA 4TZ8A 5E9VA 4NYVA 5DW2A 5EPSA 4Z1QA 5EA1A 2E3KA 4NQNA 5LKUA 4LRGA 4AKIA 5C4QA 5K29A 5ENCA 3JVJA 5E74A 4HXNA 5II1A 5FB0A 5CUCA 5KTUA 5E7DA 5HEMA 5CUEA 4AI6A 3U5OA 4Y03A 3IU5A 4QR4A 4NUCA 5ENIA 5FE9A 3DWYA 4YYGA 5FE4A 4YADA 3P1FA 5DY7A 4CFKA 4QYLA 5DFCA 4O76A 3U5PA 4PY6A 4LR6A 3SVGA 4Z1SA 4TTEA 2R0YA 4O77A 4O7EA 5FH7A 4MR3A 3MUKA 4LYIA 4N4HA 4WHWA 5A5SA 5D0CA 5AD2A 4WIVA 2RI7A 3P1CA 4O74A 5A5PA 5FG4A 1N72A 4QC3A 5CQ6A 4QSSA 5FBXA 5ENFA 5E9MA 5DYAA 3U5NA 4O7CA 3LQHA 4TT4A 4YBMA 5C7NA 4Q0NA 5CY9A 5E9KA 5D3NA 5ETDA 5I80A 3SVFA 5EWDA 4YYJA 3QZVA 4QR3A 4NR9A 3SVHA 2H60A 4HXPA 5FFYA 5F2PA 4UIYA 4MEQA 5EQ1A 5EM3A 4LYWA 5D3TA 4A9OA 4O70A 3HMFA 2OSSA 5A5QA 4C66A 5HRWA 4UITA 5ACYA 4O78A 5HFRA 5CUBA 4MR6A 4CURA 5DFDA 4DONA 5FE5A 5L8UA 4HBWA 5L97A 5LUUA 5I83A 4J3IA 4BW1A 2LSPB 5G4SA 3QZTA 4MEPA 5HM0A 5ENJA 5D24A 4QC1A 2FSAA 4E96A 5CRZA 3UW9A 5C87A 4QYDA 4Z93A 5D3HA 5C89A 4QSQA 4TZ2A 5ENEA 5AMFA 5F1LA 5CQ8A 4YYNA 4IR4A 4Q0OA 5HQ5A 4A9NA 3AQAA 4O71A 4YYKA 4NUEA 5BT4A 4ALHA 5EWCA 4IOOA 5IGLA 2MJVB 5DLXA 4NRBA 3FKMX 4NUDA 5IBNA 5HENA 5DKHA 3NXBA 5D7XA 2L84A 5H85A 2DATA 4TU4A 4AKNA 5FE7A 5LVQA 4NXJA 5F61A 5EWVA 4AKHA 5DW1A 5I88A 5EICA 4YYDA 4PCIA 2R0SA 3O35A 4J0RA 5IGMA 3MB3A 5DYCA 5LKTA 4TT2A 5D3RA 5BT3A 2RNYA 4PKLA 4YAXA 4UIVA 3UV5A 4MENA 1EQFA 5CU8A 4UYDA 4OGJA 5FH8A 5FG5A 5LJ1A 4LZSA 4HXKA 4QUUA 5E9LA 2GRCA 4KCXA 2YEMA 4IR3A 4UIXA 5EPBA 4QZSA 3AADA 4TT6A 4N3WA 4Z6IA 4ZW1A 4ALGA 4O72A 4BW4A 2YEKA 2DVQA 4ZC9A 4YK0A 4CUSA 5FFVA 2RFJA 2DWWA 5CUGA 5KHMA 5F3AA 5CGPA 5F36A 5CUDA 5C8GA 1WUMA 3P5OA 4KV4A 5CQ3A 2F6JA 5KU3A 5ETBA 3D7CA 1ZKRA 2F6NA 3LXJA 4YY6A 5CS8A 4F3IA 4CUPA 5L99A 4CFLA 4HXLA 4QSUA 5LKZA 4A9EA 2R0VA 5F25A 5HFQA 5LKXA 3D1BA 4HXRA 2KTBB 5DKDA 2D9EA 5AMEA 4A9LA 4OUFA 5E3DA 5FE8A 4UIWA 5G4RA 4PTBA 5EK9A 4LYSA 4QEWA 5A82A 4XUBA 3UV4A 4GPJA 3DAIA 5I7XA 2RNWA 4IR5A 3UVXA 5ENHA 2YYNA 3RCWA 3QZSA 5E73A 1ZS5A 2N9GA 5KTWA 5A7CA 4CUUA 3JVMA 4UYFA 5CUAA 3IU6A 2I8NA 2WP2A 5JWMA 5H1VA 3LQIA 1E6IA 4MEOA 5A83A 5D25A 3GG3A 4RVRA 4BHWA 2OUOA 2WP1A 3LJWA 5J0DA 4N4IA 5D26A 4MR4A 4YYMA 5IG6A 1JM4B 4NR8A 3JVLA 4NS5A 4LZRA 3S92A 5A5OA 4QSPA 1PUOA 5E3GA 4Z6HA 4UIZA 2DVRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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