4NR9A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with acetylated lysine
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr9A00
4E96A 2RNWA 3JVLA 4HXLA 4IORA 4YATA 5HELA 5D0CA 2RO1A 4TT2A 4YABA 5FE8A 5C8GA 5E3GA 5E9IA 5A5PA 5I7XA 4J1PA 4O78A 5E9KA 4NYXA 3SVGA 2DKWA 2LSPB 5EM3A 4Y03A 5IBNA 5EWHA 4FLPA 4YBTA 4MR3A 3O34A 2D9EA 5H1TA 2MJVB 3U5JA 4OGIA 4UYGA 4TZ8A 5D3TA 3MB3A 3QZSA 4ZC9A 2R0VA 5CFWA 5ENJA 5A5NA 5KTXA 5F1LA 5LKZA 5LJ2A 3UV2A 4MR5A 5DFCA 5FBXA 3HMFA 4LRGA 5HRXA 4YYGA 3D7CA 5F61A 5HRWA 4WIVA 5FE2A 5EISA 2YEKA 2E3KA 5HQ7A 3UVWA 5EWVA 4YY4A 2RFJA 5ENEA 4LR6A 5FFVA 2H60A 4CFKA 5A82A 3ONIA 4QYDA 5DYXA 4O75A 3JVMA 4YH4A 2WP2A 4J0RA 2I7KA 4QEVA 5EVAA 4QC1A 5CQTA 4YYKA 4UITA 5LKUA 4UYFA 5II1A 4QSQA 3Q2EA 5IGKA 3U5KA 5A83A 1X0JA 4LYSA 5KTUA 4NUCA 5F2PA 4QEWA 4QSWA 2OSSA 4HXOA 2RNXA 5CQAA 3NXBA 4NRAA 5A85A 5A5RA 5HRVA 5E9YA 3ZYUA 4A9EA 5G4SA 4RVRA 3LQHA 5TB6A 5EU1A 5C87A 2OUOA 4BW1A 4NRBA 4CUQA 4Z1SA 3LQJA 4A9LA 4BW2A 4UYEA 4A9IA 4NQNA 5IGNA 4BW4A 4MR4A 5HQ5A 3LXJA 5G4RA 5ACYA 5HQ6A 4IR3A 2YQDA 3MQMA 5FE3A 5I29A 4UYHA 5AMEA 4WHWA 2E7OA 1JSPB 5LVRA 4QY4A 3P1EA 5L97A 3UV5A 5JWMA 5FE4A 5A5QA 5CRMA 4NR7A 5IIDA 4ALGA 5A81A 4YYIA 5DKHA 4CL9A 4IOQA 5E0RA 2DVVA 5DFBA 5FG4A 4KV4A 4PY6A 5DYAA 2FSAA 5I86A 5EPBA 4Z93A 3O35A 5AD2A 4UIYA 5I1QA 2L84A 5EWCA 3MULA 4YADA 5LVQA 5ENIA 4TT4A 2DVQA 4YYMA 4HXRA 4NQMA 4CLBA 5F60A 3RCWA 5D3HA 5DLZA 2DVRA 5LKTA 4YYNA 4UYFB 4N4IA 5EWWA 5AD3A 4NYVA 5II2A 5KTWA 2R10A 4LC2A 5ENHA 4GPJA 3UVXA 5CQ5A 3QZTA 4X2IA 2D82A 2R0SA 5CRZA 4HXKA 4HBVA 4QB3A 3O37A 4QUUA 1E6IA 4A9MA 4QNSA 3UVYA 5KO4A 5EK9A 4BHWA 5L98A 3UW9A 3SVFA 4QEUA 4PS5A 5CP5A 5CY9A 5CU8A 4O7BA 5DYUA 5CUAA 3U5PA 5H1UA 2RS9B 5CQ3A 5CQ4A 4LDFA 4BJXA 4C66A 4UIVA 1WUGA 4MENA 3O36A 4CURA 5DW2A 4PCIA 5COIA 3SVHA 5CUEA 5HEMA 3Q2FA 2N9GA 5DLXA 5JI8A 5HLSA 4TT6A 3U5OA 5I88A 2YEMA 2F6NA 4LZRA 2F6JA 5E73A 4XY8A 5LJ1A 5IGLA 4TTEA 3LQIA 4NUEA 2L5EA 3IU5A 4OGJA 4UIUA 4MEPA 3UVDA 4UIXA 2YYNA 5AMFA 5EV9A 4NR8A 4QSSA 5L99A 5D24A 5I7YA 4BW3A 5F3AA 4UIZA 4CUTA 5CUDA 5D3JA 2WP1A 5EQ1A 5ETDA 5HFQA 5LJ0A 4MEQA 5I40A 3HMHA 4MR6A 4O76A 5EICA 4O7AA 3P1CA 5D26A 5CS8A 5CTLA 4N4GA 5C4QA 3DAIA 5EPSA 5CQ6A 5CQ8A 5EP7A 5FG5A 5DW1A 2DATA 4NR4A 5BT5A 4HXPA 3I3JA 3U5MA 4XUBA 5DBMA 5I80A 5A5OA 4IOOA 5DKCA 4QSTA 3LJWA 3S92A 4TU6A 5DKDA 5A7CA 4YK0A 5FE9A 4NRCA 5FFYA 3P1FA 3AADA 5EI4A 4HBXA 4HBYA 5LUUA 5F62A 5E7DA 5L8UA 4Z1QA 4UYDA 4O7EA 5CQ7A 5D3NA 5EPRA 5BT4A 4IR5A 5F36A 4YYHA 5D3SA 4IR4A 5EA1A 4O72A 4A9NA 5KU3A 3FKMX 2G4AA 4O7CA 5ENBA 4CUPA 5E9VA 1F68A 4YH3A 4TU4A 3MUKA 4O71A 4QUTA 4A9OA 1EQFA 5FH6A 2I8NA 4XYAA 5FH8A 4Z6HA 5ENGA 4QR4A 4QSVA 4QSRA 3QZVA 4QC3A 2E7NA 4Z6IA 4QSUA 4WHUA 2RNYA 3S91A 5F1HA 5FE6A 4XY9A 4ZW1A 4YY6A 4MEOA 4NUDA 5ENCA 4CUUA 3GG3A 1JM4B 5FE0A 3P5OA 5C89A 3P1DA 4YBSA 4CFLA 2DVSA 5HJCA 3UV4A 4PCEA 4YYDA 4UIWA 5C7NA 3G0LA 2OO1A 4Q0NA 4QSXA 2L85A 4A9FA 5FB1A 4N3WA 5TCMA 5FE7A 5A5SA 2R0YA 4O74A 5E74A 5HCLA 5L96A 4O70A 3JVJA 4PKLA 4QYLA 4CUSA 2KTBB 4C67A 4O77A 4IR6A 4HBWA 3K2JA 5D25A 4NXJA 5CZGA 4TS8A 4N4HA 4F3IA 4TQNA 4NR9A 5K29A 4XUAA 5HENA 5BT3A 2DWWA 4HXSA 5HM0A 5D3RA 3G0JA 2YELA 5FG6A 3HMEA 3AQAA 5F63A 4QR3A 5FB0A 4J0SA 5I83A 5FFWA 5CUBA 4YBMA 5DY7A 4KV1A 5DYCA 4LZ2A 5C85A 4A9JA 2YW5A 4TZ2A 4ZQLA 5L8TA 2GRCA 5ENFA 5E9MA 2NXBA 4NS5A 5I89A 4DONA 3MXFA 5E9LA 4OUFA 5IG6A 5CUCA 4YC9A 1N72A 4HXNA 4TYLA 4A9HA 3O33A 4LZSA 4NYWA 5CPEA 5F25A 5FDZA 3TLPA 4QZSA 5H85A 4NR6A 5CUGA 4N4FA 3U5LA 3MB4A 4QR5A 4AKNA 4LYIA 5FE1A 4YAXA 5LKXA 1WUMA 5CGPA 4A9KA 5FE5A 3U5NA 5ETBA 2YDWA 4O7FA 5D7XA 4J3IA 5D3LA 5E3DA 4ALHA 4Q0OA 4NR5A 4HXMA 5DX4A 4QBMA 2RI7A 5EWDA 3DWYA 5HFRA 5J0DA 4KCXA 5H1VA 4QSPA 5DFDA 5IGMA 3IU6A 5FH7A 4YYJA 1ZS5A 5D3PA 5EGUA 5F5ZA 4PTBA 4LYWA 3JVKA 5KHMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E96A 4AKGA 2RNWA 3JVLA 4HXLA 4IORA 4YATA 5HELA 5D0CA 2RO1A 4TT2A 2EJNA 4YABA 5C8GA 5FE8A 5E3GA 5E9IA 5A5PA 5I7XA 4J1PA 4O78A 5E9KA 4NYXA 3SVGA 2DKWA 2LSPB 5EM3A 4Y03A 5IBNA 5EWHA 4FLPA 4YBTA 4MR3A 3O34A 4AKHA 2D9EA 5H1TA 2MJVB 3U5JA 4OGIA 4UYGA 4TZ8A 5D3TA 3MB3A 3QZSA 4ZC9A 2R0VA 5CFWA 5ENJA 5A5NA 5KTXA 5F1LA 5LKZA 5LJ2A 3UV2A 4MR5A 5DFCA 5FBXA 3HMFA 4LRGA 5HRXA 4YYGA 3D7CA 5F61A 5HRWA 4WIVA 5FE2A 5EISA 2YEKA 2E3KA 5HQ7A 3UVWA 5EWVA 4YY4A 2RFJA 5ENEA 4LR6A 5FFVA 2H60A 4CFKA 5A82A 3ONIA 4QYDA 5DYXA 4O75A 3JVMA 4YH4A 2WP2A 4J0RA 2I7KA 4QEVA 5EVAA 4QC1A 5CQTA 4YYKA 4UITA 5LKUA 4UYFA 5II1A 4QSQA 3Q2EA 5IGKA 3U5KA 5A83A 1X0JA 4LYSA 5KTUA 4NUCA 5F2PA 4QEWA 4QSWA 2OSSA 4HXOA 2RNXA 5CQAA 3NXBA 4NRAA 5A85A 5A5RA 4AKIA 5HRVA 5E9YA 3ZYUA 4A9EA 5G4SA 4RVRA 3LQHA 5TB6A 5EU1A 5C87A 2OUOA 4BW1A 4NRBA 4CUQA 4Z1SA 3LQJA 4A9LA 4BW2A 4UYEA 4A9IA 4NQNA 5IGNA 4BW4A 4MR4A 5HQ5A 3LXJA 5G4RA 5ACYA 5HQ6A 4IR3A 2YQDA 3MQMA 5FE3A 5I29A 4UYHA 5AMEA 4WHWA 2E7OA 1JSPB 5LVRA 4QY4A 3P1EA 5L97A 3UV5A 5JWMA 5FE4A 5A5QA 5CRMA 4NR7A 5IIDA 4ALGA 5A81A 4YYIA 5DKHA 4CL9A 4IOQA 5E0RA 2DVVA 5DFBA 5FG4A 4KV4A 4PY6A 5DYAA 2FSAA 5I86A 5EPBA 3D1DA 4Z93A 3O35A 5AD2A 4UIYA 5I1QA 2L84A 5EWCA 3MULA 4YADA 5LVQA 5ENIA 4TT4A 2DVQA 4YYMA 4HXRA 4NQMA 4CLBA 5F60A 1ZKRA 3RCWA 5D3HA 5DLZA 2DVRA 5LKTA 4YYNA 4UYFB 4N4IA 5EWWA 5AD3A 4NYVA 5II2A 5KTWA 2R10A 4LC2A 5ENHA 4GPJA 3UVXA 5CQ5A 3QZTA 4X2IA 2D82A 2R0SA 5CRZA 4HXKA 4HBVA 4QB3A 3O37A 4QUUA 1E6IA 4A9MA 4QNSA 3UVYA 5KO4A 5EK9A 4BHWA 5L98A 3UW9A 3SVFA 4QEUA 4PS5A 5CP5A 5CY9A 5CU8A 4O7BA 5DYUA 5CUAA 3U5PA 5H1UA 2RS9B 5CQ3A 5CQ4A 4LDFA 4BJXA 4C66A 4UIVA 1WUGA 4MENA 3O36A 4CURA 5DW2A 4PCIA 5COIA 3SVHA 5CUEA 5HEMA 3Q2FA 2N9GA 5DLXA 5JI8A 5HLSA 4TT6A 3U5OA 5I88A 2YEMA 2F6NA 4LZRA 2F6JA 5E73A 4XY8A 5LJ1A 5IGLA 4TTEA 3LQIA 4NUEA 2L5EA 3IU5A 4OGJA 4UIUA 4MEPA 3UVDA 4UIXA 2YYNA 5AMFA 5EV9A 4NR8A 4QSSA 5L99A 5D24A 5I7YA 4BW3A 5F3AA 4UIZA 4CUTA 5CUDA 5D3JA 2WP1A 5EQ1A 5ETDA 5HFQA 5LJ0A 4MEQA 5I40A 3HMHA 4MR6A 4O76A 5EICA 4O7AA 3P1CA 5D26A 5CS8A 5CTLA 4N4GA 5C4QA 3DAIA 5EPSA 5CQ6A 5CQ8A 5EP7A 5FG5A 5DW1A 2DATA 4NR4A 5BT5A 4HXPA 3I3JA 3U5MA 4XUBA 5DBMA 5I80A 3VKGA 5A5OA 4IOOA 5DKCA 4QSTA 3LJWA 3S92A 4TU6A 5DKDA 5A7CA 4YK0A 5FE9A 4NRCA 5FFYA 3P1FA 3AADA 5EI4A 4HBXA 4HBYA 5LUUA 5F62A 5E7DA 3D1BA 5L8UA 4Z1QA 4UYDA 4O7EA 5CQ7A 5D3NA 5EPRA 5BT4A 4IR5A 5F36A 4YYHA 5D3SA 4IR4A 5EA1A 4O72A 4A9NA 5KU3A 3FKMX 2G4AA 4O7CA 5ENBA 4CUPA 5E9VA 1F68A 4YH3A 4TU4A 3MUKA 4O71A 4QUTA 4A9OA 1EQFA 5FH6A 2I8NA 4XYAA 5FH8A 4Z6HA 5ENGA 4QR4A 4QSVA 4QSRA 3QZVA 4QC3A 2E7NA 4Z6IA 4QSUA 4WHUA 2RNYA 3S91A 5F1HA 5FE6A 4XY9A 4ZW1A 4YY6A 4MEOA 4NUDA 5ENCA 4CUUA 3GG3A 1JM4B 5FE0A 3P5OA 5C89A 3P1DA 4YBSA 4CFLA 2DVSA 5HJCA 3UV4A 4PCEA 4YYDA 4UIWA 5C7NA 3G0LA 2OO1A 4Q0NA 4QSXA 2L85A 4A9FA 5FB1A 4N3WA 5TCMA 5FE7A 5A5SA 2R0YA 4O74A 5E74A 5HCLA 5L96A 3VKHA 4O70A 3JVJA 4PKLA 4QYLA 4CUSA 2KTBB 4C67A 4O77A 4IR6A 4HBWA 3K2JA 3ERRA 5D25A 4NXJA 5CZGA 4TS8A 4N4HA 4F3IA 4TQNA 4NR9A 5K29A 4XUAA 5HENA 5BT3A 2DWWA 4HXSA 5HM0A 5D3RA 3G0JA 2YELA 5FG6A 3HMEA 3AQAA 5F63A 4QR3A 5FB0A 4J0SA 4AI6A 5I83A 5FFWA 5CUBA 4YBMA 5DY7A 4KV1A 5DYCA 4LZ2A 5C85A 4A9JA 2YW5A 4TZ2A 4ZQLA 5L8TA 2GRCA 5ENFA 5E9MA 2NXBA 4NS5A 5I89A 4DONA 3MXFA 5E9LA 4OUFA 5IG6A 5CUCA 4YC9A 1N72A 4HXNA 4TYLA 4A9HA 3O33A 4LZSA 4NYWA 5CPEA 5F25A 5FDZA 1PUOA 3TLPA 4QZSA 5H85A 4NR6A 5CUGA 4N4FA 3U5LA 3MB4A 4QR5A 4AKNA 4LYIA 5FE1A 4YAXA 5LKXA 1WUMA 5CGPA 4A9KA 5FE5A 3U5NA 5ETBA 2YDWA 4O7FA 5D7XA 4J3IA 5D3LA 5E3DA 4ALHA 4Q0OA 4NR5A 4HXMA 5DX4A 4QBMA 2RI7A 5EWDA 3DWYA 5HFRA 5J0DA 4KCXA 5H1VA 4QSPA 5DFDA 5IGMA 3IU6A 5FH7A 4YYJA 1ZS5A 5D3PA 5EGUA 5F5ZA 4PTBA 4LYWA 3JVKA 5KHMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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