4NR9A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with acetylated lysine
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Targeting low-druggability bromodomains: fragment based screening and inhibitor design against the BAZ2B bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr9A00
5G4SA 4QC1A 5CS8A 5E9LA 3MB3A 4NUCA 4QR5A 4IORA 4YY6A 5EPSA 2R10A 4UYGA 5A5PA 5D3TA 5J0DA 2L85A 4QY4A 3U5OA 4MEQA 3Q2FA 4UYFA 3IU6A 5E0RA 5D3SA 5A5QA 3QZSA 3MXFA 4A9EA 4YYGA 2I7KA 4WIVA 5H1VA 4NR6A 4HXOA 5CQ6A 3UVXA 3NXBA 4N4HA 4MENA 4UYDA 4YBTA 3O33A 2L5EA 4KCXA 5DBMA 3MUKA 5DFBA 4LYSA 4QSVA 4HBVA 5E3GA 5IIDA 3HMHA 5ENBA 4OUFA 4XUBA 2RI7A 2RO1A 5D25A 4OGIA 4TT2A 3DAIA 4X2IA 5E9YA 5ENGA 4XY9A 1ZS5A 2YW5A 5AD2A 4ZW1A 5LKZA 5I83A 2DVSA 4N4IA 4GPJA 4NYWA 4MR6A 4O75A 5EI4A 4NUEA 5LVRA 4YABA 5EVAA 3QZVA 4Z6HA 3FKMX 5HFQA 5FG4A 5A83A 4F3IA 4BW4A 4XY8A 4QSSA 5LUUA 5A85A 1F68A 5DYCA 4O70A 4TU6A 2OSSA 2KTBB 4QEUA 5E3DA 3U5PA 2YEMA 5EA1A 3RCWA 5LVQA 2FSAA 2DVVA 5FB1A 5L8TA 5C89A 3LQIA 4NQNA 5CUEA 5CGPA 5ENJA 5ACYA 4LC2A 5KO4A 5E9MA 4PTBA 4MEPA 1EQFA 5EV9A 2WP1A 4YYMA 4A9FA 4CL9A 5FH8A 3HMEA 4NR9A 5E73A 5EPRA 4NQMA 4O7BA 5TB6A 4UYEA 4UIXA 4WHUA 4AKNA 4CFLA 5C85A 5H1UA 4A9MA 2DWWA 4O71A 5HRWA 3LXJA 2OUOA 4QYLA 5I29A 2D82A 3SVHA 4KV4A 4Y03A 5II1A 5LKXA 2G4AA 1JSPB 4HXLA 5FE2A 4QZSA 5EWWA 5A5SA 2DATA 5D26A 4MR3A 5II2A 4TU4A 3UVYA 4QNSA 3GG3A 5EWDA 5JWMA 4ZC9A 4YC9A 4CUTA 4PKLA 5D3PA 5BT5A 3DWYA 5DKDA 4UYHA 4WHWA 3P1EA 5FFVA 5DLXA 5LJ0A 2LSPB 3U5LA 5I7YA 4PCIA 4YAXA 4E96A 4LZ2A 4YYIA 4N4GA 5EISA 4Z1QA 4PY6A 3O36A 5ENIA 5EU1A 3MULA 5CY9A 4YBSA 5DW1A 4OGJA 3P1CA 4HBYA 4C67A 4CFKA 5F1HA 3UV4A 5F5ZA 4YADA 4Z6IA 4KV1A 5ENHA 4HXKA 4NYVA 4RVRA 5ENFA 5JI8A 4LR6A 3JVLA 4TZ8A 4NRAA 2N9GA 4A9IA 5CUDA 5CQ7A 2D9EA 3AQAA 5ETBA 2E7NA 5D7XA 4QSQA 4LYWA 4O76A 3P5OA 3QZTA 3O35A 5FH7A 3S91A 5CQ8A 2MJVB 4NUDA 4A9JA 4YYNA 5HCLA 2YDWA 4YBMA 5DKHA 4XYAA 5L96A 5A5RA 5C7NA 4HXNA 1E6IA 5KTUA 2I8NA 3G0LA 5LJ2A 3UV5A 4DONA 5F1LA 5E9KA 3JVJA 2R0YA 4QEVA 5CUCA 4CUQA 5I7XA 3P1DA 2E3KA 2OO1A 3SVGA 4TT6A 1JM4B 4UIWA 5FFWA 5FE4A 5LKUA 4J1PA 4O7AA 4UITA 4ALHA 5I80A 4HXRA 2H60A 5F25A 4A9HA 5F62A 5FBXA 3I3JA 4QSUA 4HXMA 4YH4A 4YYKA 5ENEA 3ZYUA 4XUAA 5DW2A 4C66A 3SVFA 5I40A 5G4RA 5KTWA 5FE8A 4QBMA 2RNXA 3O34A 5IBNA 4MEOA 5HFRA 2RS9B 3ONIA 4HXPA 4A9OA 5FE6A 5H1TA 3AADA 5F3AA 5L97A 5CQ5A 3S92A 4QB3A 5C87A 4QEWA 5FDZA 5BT3A 4QSPA 4NR7A 4TT4A 5CU8A 5DX4A 4LYIA 4MR5A 2RNWA 5FE0A 2YQDA 3D7CA 4MR4A 4NR4A 4YH3A 5C8GA 3U5JA 4ALGA 4O7EA 2WP2A 5CQAA 5A82A 5IG6A 5DYAA 2NXBA 3LQJA 5DYUA 4YK0A 4QC3A 4Q0OA 3LJWA 3LQHA 5D3LA 4HBXA 5CP5A 5D3JA 5A81A 5LKTA 4NR8A 4NRBA 4J0RA 4QSTA 3O37A 4UIYA 4QUTA 5CRZA 5EWCA 5AMFA 5HQ6A 2DVRA 5DKCA 5IGMA 5FE3A 5E74A 5KU3A 4YYJA 3MB4A 5I89A 5L8UA 3P1FA 3MQMA 4LRGA 4TZ2A 5ETDA 3JVKA 5DLZA 4CUPA 5I86A 5FFYA 5F61A 3UVDA 4IOQA 3Q2EA 4QSXA 5H85A 5IGLA 5F2PA 4IR4A 5E9VA 4NYXA 2YYNA 5FG5A 4NXJA 5CUBA 5D3NA 5TCMA 4NR5A 5COIA 4UIUA 5HM0A 5ENCA 4QR3A 5EQ1A 5F36A 1N72A 2F6JA 4QUUA 2F6NA 5HQ7A 4QSRA 4IOOA 5FE1A 3HMFA 4TYLA 5CZGA 4O78A 2YEKA 5LJ1A 5CUGA 2RFJA 1WUMA 4A9NA 2R0VA 5CQ4A 5DFCA 5DYXA 4UIZA 3U5NA 4Z1SA 5AMEA 3G0JA 3K2JA 4IR6A 4QR4A 4LDFA 4HXSA 4O77A 5FB0A 3JVMA 4O72A 4CLBA 4BW2A 4YYHA 5HELA 4QSWA 5DY7A 3UV2A 4A9KA 5L99A 4N3WA 2L84A 5E7DA 4IR5A 5HEMA 5FE7A 3U5KA 5EPBA 5HENA 4Q0NA 5EGUA 4YY4A 5HLSA 5CUAA 4HBWA 3TLPA 5CTLA 4CUUA 4CUSA 4TQNA 4BW3A 4O7CA 5CQ3A 4BHWA 5F60A 5L98A 5AD3A 5HQ5A 5FE9A 5I1QA 5FE5A 5IGKA 5EICA 5BT4A 5EK9A 2DVQA 2E7OA 2YELA 4BJXA 4TS8A 4LZSA 5DFDA 4ZQLA 5HRXA 5A7CA 4BW1A 5D0CA 4PS5A 2GRCA 4PCEA 5E9IA 2R0SA 5C4QA 4CURA 1WUGA 5HJCA 4J0SA 5CQTA 4N4FA 4NS5A 5FH6A 4UYFB 2RNYA 5D3HA 5EP7A 3UVWA 4UIVA 5I88A 1X0JA 5CRMA 2DKWA 5D24A 5CFWA 4IR3A 5KHMA 4Z93A 4YATA 5CPEA 3U5MA 5A5NA 4J3IA 4O74A 5EWVA 5K29A 4O7FA 5EM3A 4YYDA 5D3RA 5KTXA 4LZRA 3IU5A 5F63A 4QYDA 5FG6A 4A9LA 5IGNA 5HRVA 3UW9A 4TTEA 4FLPA 4NRCA 5EWHA 5A5OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5G4SA 4QC1A 5CS8A 5E9LA 3MB3A 3ERRA 4NUCA 4QR5A 4IORA 4YY6A 5EPSA 2R10A 4UYGA 5A5PA 5D3TA 5J0DA 2L85A 4QY4A 3U5OA 4MEQA 3Q2FA 4UYFA 3IU6A 5E0RA 5D3SA 5A5QA 3QZSA 3VKHA 3MXFA 4A9EA 4YYGA 2I7KA 4WIVA 5H1VA 4NR6A 4HXOA 5CQ6A 3UVXA 3NXBA 4N4HA 4MENA 4UYDA 4YBTA 3O33A 2L5EA 4KCXA 5DBMA 3MUKA 5DFBA 4LYSA 4QSVA 4HBVA 5E3GA 5IIDA 3HMHA 5ENBA 4OUFA 4AI6A 4XUBA 2RI7A 2RO1A 5D25A 4OGIA 4TT2A 3DAIA 4X2IA 5E9YA 5ENGA 4XY9A 1ZS5A 2YW5A 1PUOA 5AD2A 4ZW1A 5LKZA 5I83A 2DVSA 4N4IA 4GPJA 4NYWA 4MR6A 4O75A 5EI4A 4NUEA 5LVRA 4YABA 5EVAA 3QZVA 4Z6HA 3FKMX 5HFQA 5FG4A 5A83A 4F3IA 4BW4A 4XY8A 4QSSA 5LUUA 5A85A 1F68A 5DYCA 4O70A 4TU6A 2OSSA 2KTBB 4QEUA 5E3DA 3U5PA 2YEMA 5EA1A 3RCWA 5LVQA 2FSAA 2DVVA 5FB1A 5L8TA 5C89A 3LQIA 4NQNA 5CUEA 5CGPA 5ENJA 5ACYA 4LC2A 5KO4A 5E9MA 4PTBA 4MEPA 1EQFA 5EV9A 2WP1A 4YYMA 4A9FA 4CL9A 5FH8A 3HMEA 4NR9A 5E73A 5EPRA 4NQMA 4O7BA 5TB6A 4UYEA 4UIXA 4WHUA 4AKNA 4CFLA 5C85A 5H1UA 4A9MA 2DWWA 4O71A 5HRWA 3LXJA 2OUOA 4QYLA 5I29A 2D82A 3SVHA 4KV4A 4Y03A 5II1A 5LKXA 2G4AA 1JSPB 4HXLA 5FE2A 4QZSA 5EWWA 5A5SA 2DATA 5D26A 4MR3A 5II2A 4TU4A 3UVYA 4QNSA 3GG3A 5EWDA 5JWMA 4ZC9A 4YC9A 4CUTA 4PKLA 3D1BA 5D3PA 5BT5A 3DWYA 5DKDA 4UYHA 4WHWA 3P1EA 5FFVA 5DLXA 5LJ0A 2LSPB 3U5LA 5I7YA 4PCIA 4YAXA 4E96A 4LZ2A 4YYIA 4N4GA 5EISA 4Z1QA 4PY6A 3O36A 5ENIA 5EU1A 3MULA 5CY9A 4YBSA 5DW1A 4OGJA 3P1CA 4HBYA 4C67A 4CFKA 5F1HA 3UV4A 5F5ZA 4YADA 4Z6IA 4KV1A 5ENHA 4HXKA 4NYVA 4RVRA 5ENFA 5JI8A 4LR6A 3JVLA 4TZ8A 4NRAA 2N9GA 4A9IA 5CUDA 5CQ7A 2D9EA 3AQAA 5ETBA 2E7NA 5D7XA 4QSQA 4LYWA 4O76A 3P5OA 3QZTA 3O35A 5FH7A 3S91A 5CQ8A 2MJVB 4NUDA 4A9JA 4YYNA 5HCLA 2YDWA 4YBMA 5DKHA 4XYAA 5L96A 5A5RA 5C7NA 4HXNA 1E6IA 5KTUA 2I8NA 3G0LA 5LJ2A 3UV5A 4DONA 5F1LA 5E9KA 3JVJA 2R0YA 4QEVA 5CUCA 4CUQA 3D1DA 5I7XA 3P1DA 2E3KA 2OO1A 3SVGA 4TT6A 1JM4B 4UIWA 5FFWA 5FE4A 5LKUA 4J1PA 4O7AA 4UITA 4ALHA 5I80A 4HXRA 2H60A 5F25A 4A9HA 5F62A 5FBXA 3I3JA 4QSUA 4HXMA 4YH4A 4YYKA 5ENEA 3ZYUA 4XUAA 5DW2A 4C66A 3SVFA 5I40A 5G4RA 5KTWA 5FE8A 4QBMA 2EJNA 2RNXA 3O34A 5IBNA 4MEOA 5HFRA 2RS9B 3ONIA 4HXPA 4A9OA 5FE6A 5H1TA 3AADA 5F3AA 5L97A 5CQ5A 3VKGA 3S92A 4QB3A 5C87A 4QEWA 5FDZA 5BT3A 4QSPA 4NR7A 4TT4A 5CU8A 5DX4A 4LYIA 4MR5A 2RNWA 5FE0A 2YQDA 3D7CA 4MR4A 4NR4A 4YH3A 5C8GA 3U5JA 4ALGA 4O7EA 2WP2A 5CQAA 5A82A 5IG6A 5DYAA 2NXBA 3LQJA 5DYUA 4YK0A 4QC3A 4Q0OA 3LJWA 3LQHA 4AKGA 5D3LA 4HBXA 5CP5A 5D3JA 5A81A 5LKTA 4NR8A 4NRBA 4J0RA 4QSTA 3O37A 4UIYA 4QUTA 5CRZA 5EWCA 5AMFA 5HQ6A 2DVRA 5DKCA 5IGMA 5FE3A 5E74A 5KU3A 4YYJA 3MB4A 5I89A 5L8UA 3P1FA 3MQMA 4LRGA 4TZ2A 4AKIA 5ETDA 3JVKA 5DLZA 4CUPA 5I86A 5FFYA 5F61A 3UVDA 4IOQA 3Q2EA 4QSXA 5H85A 5IGLA 5F2PA 4IR4A 5E9VA 4NYXA 2YYNA 5FG5A 4NXJA 5CUBA 5D3NA 5TCMA 4NR5A 5COIA 4UIUA 5HM0A 5ENCA 4QR3A 5EQ1A 5F36A 1N72A 2F6JA 1ZKRA 4QUUA 2F6NA 5HQ7A 4QSRA 4IOOA 5FE1A 3HMFA 4TYLA 5CZGA 4O78A 2YEKA 5LJ1A 5CUGA 2RFJA 1WUMA 4A9NA 2R0VA 5CQ4A 5DFCA 5DYXA 4UIZA 3U5NA 4Z1SA 5AMEA 3G0JA 3K2JA 4IR6A 4QR4A 4LDFA 4HXSA 4O77A 5FB0A 3JVMA 4O72A 4CLBA 4BW2A 4YYHA 5HELA 4QSWA 5DY7A 3UV2A 4A9KA 5L99A 4N3WA 2L84A 5E7DA 4IR5A 5HEMA 5FE7A 3U5KA 5EPBA 5HENA 4Q0NA 5EGUA 4YY4A 5HLSA 5CUAA 4HBWA 3TLPA 5CTLA 4CUUA 4CUSA 4TQNA 4BW3A 4O7CA 5CQ3A 4BHWA 5F60A 5L98A 5AD3A 5HQ5A 5FE9A 5I1QA 5FE5A 5IGKA 5EICA 5BT4A 5EK9A 2DVQA 2E7OA 2YELA 4BJXA 4TS8A 4LZSA 5DFDA 4ZQLA 5HRXA 5A7CA 4BW1A 5D0CA 4PS5A 2GRCA 4PCEA 5E9IA 2R0SA 5C4QA 4CURA 1WUGA 5HJCA 4J0SA 5CQTA 4N4FA 4NS5A 5FH6A 4UYFB 2RNYA 5D3HA 5EP7A 3UVWA 4UIVA 5I88A 1X0JA 5CRMA 2DKWA 5D24A 5CFWA 4IR3A 5KHMA 4Z93A 4AKHA 4YATA 5CPEA 3U5MA 5A5NA 4J3IA 4O74A 5EWVA 5K29A 4O7FA 5EM3A 4YYDA 5D3RA 5KTXA 4LZRA 3IU5A 5F63A 4QYDA 5FG6A 4A9LA 5IGNA 5HRVA 3UW9A 4TTEA 4FLPA 4NRCA 5EWHA 5A5OA
chains in the Genus database with same CATH topology
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